Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Acizii Nucleici 1a
Acizii Nucleici 1a
nucleici
Obiectivele:
1.
2.
3.
4.
5.
6.
Acizi nucleici
1.
2.
ADN
a.
b.
Localizarea:
97-99% - concentrat n nucleu
1-3% - situat n mitocondrii.
Rolul: pstreaz i transmite
informaia genetic de la ADN
parental la ADN fiic sau ARN.
ARN
1.
2.
3.
Localizarea:
11% - n nucleu
15% -n mitocondrii
50% - n ribosomi
24% - n hialoplasm
Deosebim:i:
ARN mesager
ARN ribozomal
ARN de transport
ARN cromosomial
ARN nuclear
Structura chimic a AN
La hidroliz AN degradeaz n
mononucleotide, care la rndul lor, la
hidroliza complet degradeaz n BA,
pentoze i acid fosforic.
ADN----A; G; C; T+dR+H2PO3
ARN----A; G; C; U+ R+H2PO3
Bazele azotate
a. BA se clasific n :
1.
majore: purinice: A, G i pirimidinice: C,T,U
2.
minore:purinice (2metil A; 1 metilG) i
pirimidinice (5 metil C;5 hidroximetil C)
b. Sunt slab solubile n H2O
c. Prezint fenomenul de tautomerie (forme lactimlactam)
d. Sunt responsabile de informaia genetic
e. BA purinice- au structur plan; cele pirimidiniceaproape plan, puin plat
j. Max capacitii de absorbie n ultraviolet este
ntre 260-280 nm
Bazele purinice
Bazele pirimidinice
Molecular Biology
Bases
Bicyclic
Purines
:
Monocyclic
pyrimidine:
Structura BA minore
Molecular Biology
Nucleosides
Nucleozidul
const dintr-o BA ( purinic sau
Pirimidinic) +
o pentoz (riboza sau dezoxiriboza)
atomul C-1 al pentozei este unit cu N9 al purinei sau N-1 al pirimidinei - leg.
N glicozidic.
Nucleozidele
Proprietile:
Mai solubile n H2O dect
BA
Mai stabile n soluii
alcaline
Uor se hidrolizeaz la
nclzire cu acid
Rest al
acidului
Nucleozid
Nucleotide - Rolul
1.
2.
3.
4.
5.
Element structural al AN
Intermediari energetici
(ATP- purttorul energiei
chimice n organism)
Intr n componena Co
Servesc ca activatori ai
unor molecule (UDP-Gl;
CDP-colina)
Servesc ca mesageri
secunzi intracelulari ai
hormonilor (AMPc; GMPc)
Molecular Biology
Nucleotides
A nucleotide is a nucleoside with one or more phosphate groups
bound covalently to the 3-, 5, or ( in ribonucleotides only) the 2position. In the case of 5-position, up to three phosphates may be
attached.
Phosphate ester bonds
Deoxyribonucleotides
(containing deoxyribose)
Ribonucleotides
(containing ribose)
Structura chimic
Structura primar a AN
Reprezint secvena
mononucleotidelor n lanul
polinucleotidic liniar, legate ntre ele
prin legturile 3' - 5' fosfodiesterice
Catenele au dou capete:
5 nucleozid tri fosfatul;
3 gr. OH liber
1.
2.
Cilindrul ce ncadreaz
dublul helix are d=2nm
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
forma A:
conine 11 resturi la o spir,
este rsucit spre dreapta.
forma clasica B:
conine 10 mononucleotide la o spir.
este rsucit spre dreapta.
- 10 nucleotide ocup 34 A (3,4 nm).
- o nucleotid cuprinde 3,4A (0,34 nm).
Structura teriar
Compactizarea
cromatinei
DNA
Firul de
cromatin?
~ 1,000
30 nm Solenoid ~40 / 50
Nucleosoma
= ctamer de
histone
H2a, H2b, H3, H4
146 / 200 bp DNA
Compactizare
~10 ori
Cromosoma metafazic/
cromatina interfazic
~ 10,000
1.
2.
3.
4.
Are forma L
Include 2 segmente de dublu helix
situate perpendicular (fiecare helix10 perechi de baze)
n afara spiralei bazele formeaz
legturi de hidrogen. Interaciuni
apar ntre bazele necomplementare
(A-A; A-C).Multe baze sunt aranjate
n stive (hidrofobe)
Are forma L
Include 2 segmente de dublu helix
situate perpendicular (fiecare helix10 perechi de baze)
n afara spiralei bazele formeaz
legturi de hidrogen. Interaciuni
apar ntre bazele necomplementare
(A-A; A-C).Multe baze sunt aranjate
n stive (hidrofobe)
ARNr
Denaturarea i renaturarea
Hibridizarea AN
1.
2.
3.
Obiectivele:
DNA
RNA
Protein
1.
2.
Replicarea
Replicarea transmiterea informaiei genetice de la ADN parental
la ADN fiic.
Caracteristicile:
1.
Se petrece n nucleu
2.
Proces semiconservativ
3.
se desfoar n trei etape : iniiere, elongare, terminare
4.
prezena praimerului este obligatorie
5.
replicarea este cuplat cu desfurarea DNA parental (necesit
energie)
6.
replicarea decurge n ambele direcii cu aceeai vitez.
7.
Pe catena ntrziat se sintetizeaz fragmentele Okazaki.
8.
Este bazat pe mpachetarea complementar a BA
9.
Catena-fiic este antiparalel cu catena parental dar nu
identic dup secvena nucleotidic
10.
Fora motrice a procesului este hidroliza pirofosfatului
11.
angajeaza simultan intregul cromozom .
1.
2.
3.
4.
a.
b.
c.
Matri -Componentele
ADN bicatenar
necesare replicrii:
Mecanismul replicrii
a.
Elongarea
Terminarea
Replicarea la eucariote
Particulariti:
ADN polimerazele:
Telomer Telomeraza
cromozoma
GGGTTAG 3
AUCCCAAUC 5
Fixarea telomerei TTAGGG
elongarea
GGGTTAGGGTTAG
5
AUCCCAAUC
translocarea
GGGTTAGGGTTAG
5
AUCCCAAUC
Inhibitorii telomerazei
oligonucleotidele modificate,
complementare regiunii matrice a RNA
telomerazice. Aa nucleotide specific se
fixeaz de matria RNA telo a omului,
inhibnd activitatea telomerazic in vitro.
In vivo apare problema transportului
inhibitorilor prin membrana celular i
micarea dirijat n nucleul celular.
Ca inhibitori au fost testai i inhibitorii
reverstranscriptazelor azidotimidina,
didezoxiguanozina.
Reparaia ADN
1.
2.
3.
4.
Reparaia ADN
Incizia dimerului
sub aciunea
endonucleazelor
Peticirea sub
aciunea ADN
polimerazei I
Excizia
fragmentului lezat
sub aciunea
exonucleazei
Sudarea sub
aciunea ADN ligazei
Reparaia prin
excizia dimerului
Transcripia
ARN polimeraza
este o holoenzim
2.
la procariote - este oligomer din 5 protomeri
(2, , 1 i sigma ).
- fixeaz substratul;
1 se leag de ADN,
3.
4.
5.
Etapele transcripiei
Sinteza decurge n 3 etape: iniierea, elongarea, terminarea.
Iniierea ncepe n anumite secvene de ADN numite
promotor (P 40 nucleotide).
Pe P deosebim 2 locusuri: de recunoatere (depistat cu
ajutorul sigmei) i locusul de legare lax a ARN
polimerazei. Locusul de recunoatere e situat la o distan
de 25 nucleotide de locusul de legare i 10 nucleotide de la
punctul de iniiere (+1)
Toi P bacterieni au 2 secvene consens situate pe catena
codifictoare:
Caseta Pribnow (-10) 5 TATAAT 3 responsabil de iniierea
denaturrii locale a ADN
Caseta -35
5 TTGACA 3 - la care are loc asocierea
primar a ARN polimerazei
subunitatea recunoate caseta -35 i se leag la ea. E.
alunec de-a lungul ADN i n jurul casetei -10 (Pribnow)
deschide dublul helix formnd complexul deschis de iniiere
ARN p catalizeaz formarea primei leg. fosfodiesterice ntre
nucleotidul +1 i +2 - disociaz, iar E-cor continu sinteza.
Fig. 5.4
Etapele transcripiei
Elongarea i Terminarea
Transcripia la eucariote
RNA p alctuit din 9-11 subuniti
2.
Folosesc mai multe tipuri de ARN p:
a.
ARN polimeraza I ARNr (18S, 28S, 5,8S; 45S) n nucleoli;
b.
ARN polimeraza II ARNm;
c.
ARN polimeraza III ARNt i ARNr (5S)
d.
ARN polimeraza IV (mitocondrial)- toate tipurile de ARN
mitocondrial
P la eucariote:
Procesingul
Toi precursorii de ARN n nucleu trec etapa de
maturizare posttranscripional. Pe parcursul
procesingului - pre-ARN se transform n ARN
matur.
Procesingul nclude:
1. Modificarea fragmentelor terminale 5 i 3
ale ARN:
a. Cap-area: la captul 5 -este adiionat
guanozina metilat (5- 5 trifosfat - protejarea
mARN de atacul 5-exonucleazelor i pentru
recunoaterea de ctre ribosomi ca semnal de
iniiere);
b. la captul 3 se adaug o secven mare de
poli A (200 A -coad). Ea servete la exportul
moleculelor de ARN din nucleu n citoplasm.
Fig. 5.11
Fig. 5.13
Transcripia invers
sinteza ADN pe catena de ARN
Matria ARN
Substrat dRNTP:dATP, dGTP, dCTP, TTP
Enzima revers transcriptaza
Caracteristic viruilor oncogeni
Mecanismul:
a. Revers transcriptaza sintetizeaz pe ARN viral
catena de ADN- hibrid: ADN_ARN
b. Scindarea ARN viral de o nucleaz
c. Autoreplicarea ADN cu formarea unui duplex de
ADN
Codul genetic
Translaia
Reglarea sintezei
proteinei
Obiectivele:
Codul genetic
1.
2.
3.
4.
5.
6.
Ribozomii
Reprezint sediul de traducere a ARNm i sinteza
proteinelor.
Structura- complexe ribonucleoproteice i sunt formai din
dou subuniti de mrime inegal (mare i mic)
Structura ribozomilor procariotici:
subunitatea 30 S conine ARNr 16S i 21 proteine.
subunitatea 50S ARN r 5S, 23S i 31 proteine.
Sinteza ARNr i formarea subunitilor are loc n citoplasm.
Structura ribosomilor eucariotici:
subunitatea 40S ARNr 18S i 33 proteine.
subunitatea 60S ARN r 5S, 5,8S, 28S i 49 proteine. ARNr
se formeaz n nucleol.
Ribozomul va avea constanta de sedimentare 70S la
procariote si 80S la eucariote.
S este coeficientul de sedimentare Svedberg, care
depinde de forma, densitatea i dimensiunea particulelor.
Translaia
1.
2.
3.
4.
5.
6.
Etapele
se realizeaza in 5 etape:
Activarea AA.
Iniierea lanului polipeptidic.
Elongarea lanului polipeptidic.
Terminarea lanului polipeptidic si
eliberarea acestuia.
Prelucrri post traducere ale
proteinei sintetizate.
Activarea AA
1.
2.
3.
4.
a.
b.
c.
d.
e.
Activarea AA
1. NH2-CH-COOH
ATP
PPi
NH2-CH-CO O-AMP
I
R
2. NH2-CH-CO O-AMP+ARNt
I
R
Aminoiacil ARNt
sintetaza
Aminoacil Adenilat
R
Aminoacil RNAt
Activarea AA
Parcurge n 2 etape:
Activarea AA
Activarea AA
Iniierea
1.
2.
3.
4.
5.
Necesar:
ARNm (AUG)
Ribosomul cu subunitile
disociate
ARNt f-met (Met)
GTP, Mg
IF1, IF2, IF3
Scopul: formarea
complexului de iniiere
FI2
FI3
30S
P
FI1
50S
Elongarea
1.
2.
3.
4.
1.
2.
3.
Necesar:
ARNm cu urmtorul codon
ARNt cu urmtorul AA
GTP
FE: Tu, Ts, G
Elongarea translaiei include trei etape:
Legarea aminoacil ARNt;
Transpeptidarea- formarea legturii peptidice,
Translocarea (deplasarea ARNm cu un codon).
1. Adaptarea (legarea)AA
2. Transpeptidarea
3. Translocarea
Elongarea
translocaia
ribozomul se deplaseaz la
urmtorul codon de pe ARNm i
peptidilARNt trece de pe situsul
A pe P
FE-G
30S
P
50S
A
FE-T
E-PT
FE-T
Terminarea
Prelucrrile posttraducere
1.
2.
3.
4.
5.
1.
2.
la nivelul replicrii:
Mitomicina mpiedica separarea
catenelor de ADN
Acid nalidixic inhiba ADN giraza
la nivelul transcriptiei:
la nivelul translatiei:
Streptomicina inhiba legarea ARNt initiator la
subunitatea 30S
Cloramfenicol -inhiba peptidil transferaza
Tetraciclina - inhiba legarea ARNt la ribozomi
Eritromicina,Azitromicina blocheaza subunitatea
50S
Puromicina blocheaza elongarea inhibnd
competitiv ARNt
Streptomicina - interfer cu legarea formil-MetARNt la locul de iniiere.
Neomicina, Kanamicin - erori n reproducerea
codului genetic
Toxina difteric - inhib translocaza
1.
2.
3.
Teoria lac-operonului
n prezena lactozei:
Inductorul (n acest caz lactoza) se leag specific la R, ca
urmare are loc desprinderea acestuia de la operator. n
aceast situaie, ARN p se leag la promotor, iniiind
transcrierea GS, adc a ARNm care codific E implicate n
catabolismul lactozei.
REZUMM:
Ingineria genetic
3.Clonarea
Mutaiile.
Anticorpii sunt
i dou uoare (L-214AA),
varabil V".
i una
constant C"
Sinteza Anticorpilor