Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
2.1.
Introducere n biofizic
2.2.
Structura atomului
2.2.1. Proprieti
Atomul are dimensiuni de ordinul 10-10m (10-10m = 1 ngstom). Masa se exprim
n uniti atomice de mas sau daltoni (1u.a.m = 1u = 1Da = 1,66 10-27kg). Masa
relativ a atomului este numrul care arat de cte ori este mai greu atomul respectiv
fa de u.a.m., de ex: masa relativ a atomului de carbon 12C este 12.
Atomul este neutru din punct de vedere electric.
Atomul este format din nucleu i nor electronic.
aproximativ 1u; neutronii sunt particule elementare neutre electric, cu masa aproximativ
1u.
Nucleul este caracterizat prin dou numere:
- numrul de ordine Z (sau numr atomic), care reprezint numrul de protoni din
nucleu i determin poziia atomului n tabelul periodic al elementelor. Sarcina
nucleului este +Ze, unde "e" este sarcina electric elementar (1e = 1,6 10 -19C, C =
coulomb)
- numrul de mas A, care reprezint numrul total de protoni i neutroni din
nucleu. Cum att masa protonului ct i a neutronului sunt apropiate de 1u, numrul de
mas reprezint aproximativ masa nucleului exprimat n u.
A
Enun: ntr-un atom nu pot exista mai muli electroni cu aceleai valori pentru cele
4 numere cuantice.
Consecin: pe un orbital pot exista maxim 2 electroni, cu spin opus
2.3.
Atomul de carbon
2.3.2. Hibridizarea
A. Diferena de energie ntre subnivelul 2s i 2p este foarte mic, astfel nct un
electron de pe 2s sare pe orbitalul liber 2p z, avnd acum 4 orbitali cu cte un electron
fiecare, cu acelai spin (conform regulii lui Hund). Se explic astfel caracterul uzual
tetravalent al atomului de carbon.
Saltul electronului de pe 2s pe 2pz se numete hibridizare.
B. Hibridizarea este nsoit de o reorientare n spaiu a orbitalilor. Aceasta se
poate realiza n trei feluri:
a) Hibridizare sp3: toi orbitalii se reorienteaz simetric n spaiu, cu densitate
maxim orientat spre vrfurile unui tetraedru i toi au aceeai energie, caz n care
atomul de carbon are cele 4 valene echivalente i le poate angaja n diferite legturi
chimice.
n acest caz poate s apar i o a doua legtur ntre doi atomi, prin
ntreptrunderea intersecia norului electronic ai orbitalilor care nu erau orientai de-a
lungul axei dintre atomi ci ntr-un plan perpendicular. Evident, cele dou legturi nu
sunt echivalente; prima, generat la intersecia orbitalilor de-a lungul axei este puternic
i se numete legtur , iar a doua este mai slab i se numete legtur .
(Comparativ, pentru legtura simpl C-C, energia legturii este 347 kJ/mol, iar a
legturii din legtura dubl este 263kJ/mol).
Important de remarcat c ceilali orbitali se orienteaz simetric fa de norul format.
c) hibridizarea sp. n cazul n care ambii electroni de pe 2p sunt angajai n
legturi chimice, reorientarea se face ntre orbitalul s i orbitalul 2pz rmas gol.
ntr-o astfel de situaie apare i legtura tripl, n care apare o legtur
legturi , (mai slabe n medie dect cnd era doar una).
i dou
2.4.
2.5.
Fore intermoleculare
Moleculele din structuri interacioneaz ntre ele. Aceste interaciuni sunt mai slabe
dect legturile chimice, ns existena forelor intermoleculare determin o serie de
proprieti importante ale moleculelor, ex.: solubilitatea.
10
2.6.
Molecula de ap
11
B. Structura molecular a apei este bine cunoscut, HO. Norul electronic este
deplasat ctre oxigen, care devine centru de sarcini negative, centrul sarcinilor pozitive
fiind la semidistana ntre atomii de hidrogen. Datorit respingerii electrostatice dintre
nucleele de hidrogen, unghiul ntre valene crete de la 90o la 105o, iar orbitalii cu
electroni neparticipani ai oxigenului se reorienteaz spre vrfurile unui tetraedru
(neregulat, nu identic cu norul carbonului, dar asemntor). n figura 2.6.1. sunt
prezentate schematic ideile redate aici, formarea legturilor covalente O-H, unghiul
ntre valenele O-H, tetraedrul cu poziia atomilor de hidrogen i densitile maxime ale
norului electronilor neparticipani.
12
2.7.
Soluii
13
C. Cel mai adesea considerm cele dou faze ca fiind reprezentate de starea de
agregare lichid. Totui, la modul general, putem defini sisteme disperse cu toate
combinaiile posibile pentru solvent i solut.
D. Clasificarea sistemelor disperse dup diametrul particulelor solutului.
a) soluii moleculare, cu 10A acum de obicei masa molecular este proporional
cu volumul, deci cu puterea a treia a diametrului, uzual se consider n categoria soluii
moleculare, soluiile care au pentru substana dizolvat masa molecular M 1000
b) soluii coloidale, cu diametrul ntre 10 i 1000 A i masa molecular peste, dar
sub 10
c) dispersii medii cu particule cu diametrul 1000 A sau M 10
E. O alt clasificare posibil ia n considerare procesul de disociere astfel soluiile
pot fi
a) electrolii n cazul n care moleculele disociaz s specificm aici c
electroliii pot fi la rndul lor:
i.
electrolii tari, cnd disocierea este total este cazul tuturor srurilor, dar i
acizii i bazele tari
ii. electrolii slabi, cnd disocierea este parial, acizi sau baze slabe n aceste
situaii trebuie definit i o constant de disociere, ca raportul ntre
numrul moleculelor disociate i numrul total de molecule dizolvate
b) ne-electrolii cnd substanele dizolvate sunt formate din molecule care nu
disociaz, ex.: glucoza, uree etc.
2.7.2. Concentraii
A. O caracteristic esenial a soluiilor este concentraia acestora, exprimat ca
msur a proporiei moleculelor substanei dizolvate n soluie.
Exist mai multe modaliti de a exprima concentraia unei soluii:
a) Concentraia procentual exprim cantitatea de substan dizolvat,
exprimat n grame, la 100 ml soluie
b) Concentraia molar exprim numrul de moli de substan dizolvat n 1l
soluie (1M = 1 mol = cantitatea de substan, exprimat n grame, numeric egal cu
masa molecular exprimat n u.a.m.; 1 mol are NA molecule, NA este numrul lui
Avogadro NA = 6, 023.1023 molecule/mol)
c) Concentraia normal exprim numrul de echivaleni gram de substan
dizolvai n 1l de soluie (1 echivalent-gram = l mol/z, unde z este numrul de sarcini
electrice de un semn, ce se obine la disocierea unei molecule).
B. Relaii
C(M/l) = m(g).V(l)/M
(2.7.2)
2.8.
Scara pH
14
Substanele care prin disociere pun n libertate protoni ioni H+ se numesc acizi.
Acizii tari disociaz total, acizii slabi disociaz parial. Ex.: HCl, H2CO3
ka = [A ].[H ]/[AH]
(2.8.1.a")
C. Baze
Substanele care prin disociere pun n libertate ioni OH se numesc baze (substane
alcaline). Bazele tari disociaz total, bazele slabe disociaz parial. Ex.: NaOH, NH4OH.
BOH B+ + OH- (baze tari), sau BOH B+ + OH- (baze slabe) (2.8.1.b)
D. Disocierea apei
Molecula de ap disociaz parial n soluie elibernd un proton de H+ i un ion
oxidril (hidroxil) OH-.
H2O H+ + OH-
(2.8.1.c)
E. Constanta de echilibru
n cazul disocierii pariale, putem explica legea aciunii maselor constanta de
echilibru se numete constant de disociere. Iat, pentru acizii slabi i bazele slabe.
AH A- + H+
+
BOH B + OH
F.
ka = [A ].[H ]/[AH]
-
kb = [B ].[ OH ]/[BOH]
(2.8.1.d)
(2.8.1.e)
(2.8.1.f)
(2.8.2.a)
(2.8.2.b)
15
(2.8.2.d)
E. Relaia pH pOH
Prin logaritmarea formulei 2.8.2.a se obine relaia:
pH + pOH = 14
(2.8.2.e)
Din acest motiv, nu este necesar a lucra cu ambele mrimi, fiind suficient una. n
practic se folosete doar scara pH.
F.
Scara pH
Caracterul acid, neutru sau alcalin al unei soluii se poate recunoate dup valoarea
pH-ului. Scara pH, stabilit de Sorensen are valori ntre 0 i 14 i este ilustrat n figura
2.8.2, n care sunt redate i cteva exemple de valori de pH ale unor soluii mai des
ntlnite.
(2.8.2.f)
Cnd n soluie se adaug un acid deci apare o abunden de ioni H+, echilibrul
primei reacii se mut la stnga, n soluie existnd suficieni ioni A provenii din sare.
n consecin se formeaz noi molecule neutre AH i nu crete concentraia ionilor H+.
n cazul n care se adaug o baz, procesul este invers, ionii H+ neutralizai de ionii
OH din baz, genernd molecule de ap, sunt refcui prin disocierea altor molecule de
AH, echilibrul mutndu-se la dreapta. pH-ul unei soluii tampon se calculeaz cu o
relaie generic Henderson-Hasselbach:
-
16
(2.8.2.g)
unde [f. deprot.] reprezint concentraia formei deprotonate, iar [f. protonata] reprezint
concentraia formei protonat.
n exemplul de mai sus, forma protonat este AH iar forma deprotonat este A- sau
AMe (srurile disociaz total).
2.9.
Termodinamica biologic
Unul dintre capitolele importante din biofizica celular este cel referitor la
termodinamica biologic. Vom urmri n continuare cteva deosebiri eseniale ntre
materia nevie i materia vie din punct de vedere termodinamic. S revedem ns cteva
noiuni introductive de termodinamic.
17
18
19
Fora
p
T
E
C
Param. intensiv
gradient de presiune
gradient de temperatur
gradient de potenial electric
gradient de concentraie (fiecare subst. i)
gradient de presiune osmotic
gradient de potenial chimic
Flux conjugat
flux de volum (curgere)
flux de cldur
curent electric
difuziune
osmoz
rata reaciei chimice
Flux
JV
JQ
I
Ji
Jw
v
20
21