Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
OBIECTIVELE:
1.
2.
3.
4.
5.
6.
NOIUNE DE ENZIM
ENZIM
de la grecescul
EN ZYME- n drojdii
Enzime biocatalizatori de natur
proteic
Mresc V reaciilor chimice,
termodinamic posibile
Enzimologietiina,
ce se ocup
cu studierea E
Enzimodiagnostica
- este determinarea
Enzimoterapia
- este utilizarea E,
activittii E,
care se pot modifica n
diverse patologii cu
scop diagnostic.
Natura chimic a E
1.
2.
3.
4.
5.
6.
Asemnrile E cu
catalizatorii neorganici
1.
2.
3.
4.
Deosebirile E de
catalizatorii neorganici
1.
2.
3.
Deosebirile E de
catalizatorii neorganici
4. E catalizeaz reaciile fr formarea
produselor intermediare
randamentul este de 100%
5. Activitatea E, de aici i reaciile
enzimatice se regleaz.
6. Viteza reaciilor este direct
proporional cu cantitatea E.
Structura enzimelor
Masa molecular a E e de mii de ori mai mare
dect masa molecular a substratului (S)
S sau ligandul, substana asupra creia
acioneaz E
E acioneaz nu cu toat molecula dar cu un
anumit sector denumit centrul activ (CA)
CA - locul care asigur interaciunea E cu S i
transformarea ulterioar a acestuia n P
Particularitile CA
1. este o structur tridimensional unical,
Particularitile CA
3. Are form de adncitur sau cavitate, cptuit
cu AA hidrofobi,unde nu-i acces de ap (ex.
cnd apa este un reagent al reaciei). CA
conine AA polari.
4. Ocup o parte relativ mic din volumul E i
majoritatea resturilor de AA n molecula E nu
contacteaz cu S
5. S relativ slab se leag cu E
6. CA este alctuit din 2 sectoare:
Sectorul catalitic
Organizarea funcional a
enzimelor
1.
2.
3.
4.
5.
Centrul alosteric
Este centrul reglator
Fixeaz modulatorul alosteric
Adiionarea modulatorului modific
conformaia enzimei i secundar
activitatea ei
Modulatorul pozitiv activator
Modulatorul negativ - inhibitor
Reglarea alosteric a
activitii enzimatice
Enzime alosterice
Structura enzimelor
Din punct de vedere structural deosebim:
1. E simple alctuite numai din AA
(proteazele, lipazele, ribonucleaza)
2. E conjugate - formate din:
a. partea proteic apoenzim
b. partea neproteic
HOLOENZIM partea neproteic
+apoenzima cu activitate catalitic
PARTEA NEPROTEIC A E
A:
PARTEA NEPROTEIC A E
B:
Coenzimele
Coenzima
1.
2.
3.
EXEMPLE DE
METALOENZIME
- Fe-enzime: hem (citocromi, catalaze,
peroxidaze);
- Cu-enzime: citocromoxidaza, superoxiddismutaza, tiroxin-hidroxilaza;
- Mn-enzime: peptidaza, arginaza, izocitratdehidrogenaza;
- Co-enzime: cobalamin-enzime;
- Se-enzime: glutationperoxidaza
Coenzimele (CoE)
1. Sunt parte component a centrului activ
2. Contribuie la stabilizarea conformaiei
enzimei
3. Contribuie la fixarea substratului
4. Particip nemijlocit la actul catalitic
Clasificarea CoE
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
CoE vitaminice
Tiaminice
Flavinice
Nicotinamidice
Piridoxinice
Folice
Cobamidice
Biotinice
lipoice
CoE nevitaminice
1. hemurile de divers natur
2. Nucleotidele
3. Fosfaii monozaharidelor
Coenzimele tiaminice
Derivaii vitaminei
B1
Rolul:
1. Decarboxilarea
oxidativ a
piruvatului
2. Decarboxilarea
oxidativ a
cetoglutaratului
3. Reacii de
transcetolare
Reacia sumar a
decarboxilrii oxidative a
piruvatului cu participarea
TPP (deriv. Vit. B1)
Coenzimele flavinice
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
Derivai ai vitaminei B2
FMN i FAD
Rolul:
Particip n reaciile de oxido-reducere:
Dezaminarea AA
Degradarea aldehidelor (aldehidDH)
Degradarea purinelor (xantinoxidaza)
Ciclul Krebs (succinatDH)
Oxidarea AG
DOP (dihidrolipoilDH)
Vitamina B2:
riboflavina
Coenzimele flavinice
Reacia de dehidrogenare a
succinatului cu participarea FAD
derivatul vit. B2
Coenzimele
nicotinamidice
Vitamina PP:
nicotinamida
Coenzimele nicotinamidice
Coenzimele nicotinamidice
Reacia de dehidrogenare a
malatului cu participarea
NAD derivatul vit. PP
Coenzimele piridoxinice
1.
2.
3.
Derivai a vitaminei
B6
Co piridoxalfosfat
i piridoxaminfosfat
Rolul:
Transaminarea AA
Decarboxilarea AA
Transsulfurarea
Vitamina
B6 :
Piridoxina
Piridoxal
Piridoxamina
Coenzimele:
Piridoxal fosfat
Piridoxamin fosfatul
Reacia de transaminare a
aminoacizilor cu participarea PALP
i PAMP derivaii vit. B6
biosinteza AG
2. biosinteza Col
3. sinteza corpilor cetonici
4. Oxidarea AG
5. Ciclul Krebs
6. Sinteza aminolevulinatului
7. DOP
8. DO a alfa cetoglutaratului
Transferul grupelor acil
1.
Co biotinice vitamina H
Gluconeogenez (I cale piruvatdecarboxilaza)
Sinteza AG (formarea lui malonil CoA)
Transformarea propionil-CoA n succinil CoA
(oxidarea AG cu numr impar)
Intervine n catabolismul Leu
Co cobamidice B12
-ciancobalamina
1.
2.
folic
Forma activ- acidul tetrahidrofolic
Rol: transferul gruprilor cu un C: metil
(CH3), metilen(-CH2), formil (COH),
formimino (CH=NH)
Mecanismul de aciune al E
Pentru
Mecanismul de aciune al E
E
S + E E-S E + P
Energie
Progresul reactiei
Enzimele reduc energia de activare fara sa afecteze energia libera a
reactiei (G). Astfel, enzimele cresc viteza de reactie.
Enzymes
Lower a
Reactions
Activation
Energy
Etapele aciunii
enzimatice
E + S <> ES <> ES* <> EP <> E + P
I et.
III et.
II et.
I et. formarea complexului enzim-substrat (E-S)
II et. cataliza transformarea S n produsul reaciei
(P) de ctre enzim
III et. - eliberarea P de la E
Prima etap:
Difuzia S spre E i legarea cu CA al E formarea complexului ES
1. de scurt durat
2. depinde de concentraia substratului i de
viteza lui de difuzie spre centrul activ al
enzimei.
Mecanismul de aciune al
E
Transformarea complexului primar ES n unul
sau cteva complexe activate - ES*, ES** (este
cea mai lent). Are loc dereglarea legturilor S,
ruperea lor sau formarea noilor legturi n urma
interaciunii grupelor catalitice ale E.
3. Desprirea produselor reaciei de CA al E i
difuzia lor n mediul ambiant (complexul EP
disociaz n E i P).
2.
Teoria coincidenei
induse - Koshland
Concept ul
coencidenei inductive
coincidena forat
(Kochland)
Mecanismul de aciune al E
1.
2.
3.
4.
Clasificarea actual a
enzimelor.
5.
6.
Clasificarea enzimelor.
- catalizeaz reaciii de oxidoreducere;
-catalizeaz transferuri
grupelor funcionale de la un S
la altul (metil, amino, acil,);
-catalizeaz scindri de
legturi covalente cu
adiionarea apei ;
-catalizeaz ruperea leg. C-C,
C-S i C-N; fr adiionarea
apei, adiia la legturi duble
i reaciile inverse.
6 clase de Enzime
1. Oxidoreductaze
catalizeaz reaciii de oxido-reducere
Dehidrogenaze
Oxidaze, Peroxidaze, Catalaze Hidroxilaze,
Reductaze
-
2. Transferaze
1.
Transaldolaze si transcetolaze
-Acil-, metal-,glicozil- si aminotransferaze
-Kinaze
3. Hidrolaze
catalizeaz scindri de legturi covalente cu
adiionarea apei
4. Liaze
catalizeaz ruperea leg. C-C, C-S i C-N; fr
adiionarea apei, adiia la legturi duble i reaciile
inverse.
4. Liaze
-Decarboxilaze
-Aldolaze
-Hidrataze
5. Izomeraze
Racemaze
-Epimeraze
-Izomeraze
-Mutaze
5. Izomeraze
5. Izomeraze
6. Ligaze (sintetaze)
catalizeaz formarea de legturi ntre carbon i O,
S, N, cuplate cu hidroliza legturilor
macroergice (utilizarea ATP).
Sintetaze
-Carboxilaze
Specificitatea
este capacitatea unei enzime de a selecta dintr-un
numr mare de S unul particular,
-
S1
S4
S2
Specificitatea:
1.Specificitatea
de reacie:
enzimele catalizeaz un anumit tip de
reacie ce st la baza clasificrii lor: o
reacie redox, un transfer a unei grupe
funcionale, formarea unei legturi, etc.
2. Specificitatea de substrat a
enzimelor
I. Specificitatea absolut de substrat
enzima catalizeaz transformarea
doar a unui singur substrat
Specificitatea de substrat
a enzimelor
II. Specificitatea relativ de substrat
enzima catalizeaz transformarea
unei grup numeros de substane cu
diferit structur chimic n acelai
mod
Ex. citocromul P450 hidrolizeaz
cteva mii de substane
Specificitatea de substrat
a enzimelor
specificitate
relativa de substrat
- asigura transformarea unui grup de
substante inrudite chimic i se
intlnete n diferite ipostaze:
Specificitatea de substrat
a enzimelor
III. Specificitatea absolut de grup
E catalizeaz transformarea unui grup de
substrate analogice structural (ADH - unui
grup de alcooli monohidroxilici, recunoscind
gruparea OH
Specificitatea de substrat
a enzimelor
IV. Specificitatea
relativ de grup
enzima catalizeaz transformarea unei
anumite grupe sau legturi chimice din
diverse substane chimice
Ex. pepsina hidrolizeaz legturile peptidice
formate de gruprile carboxilice ale
aminoacizilor aromatici Phe, Tir i Trp
Specificitatea relativ de
grup
V.Specificitate
stereochimic
-
PROPRIETILE
ENZIMELOR
Obiectivele:
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
10.
S
Concentraia E
electroliii
Termolabilitatea (t)
E
sunt termolabile
t optim a E din organism
- 35 - 40 C
odat cu creterea t cu
10C (dac lum punctul
de plecare 0 ) - V
reaciei enzimatice
sporete de 1,5 ori,
atingnd max la t 40C.
Majorarea de mai departe
duce la micorarea
activitii enzimatice denaturarea proteinei.
Termolabilitatea (t)
Unele
Ea
microorganismelor
termofile sunt active la t
de 80C
La t joase E se
inactiveaz (excepii:
catalaza: activitate max la
t=0 C)
Termolabilitatea (t)
v
reaciei odat cu
t este nterpretat prin
prisma "energiei de
activare".
Pentru fiecare E se
poate stabili o t optim
la care V atinge
valoarea max, mai
departe V scade din
cauza denaturrii.
Fiecare E are pH
optim propriu
(manifest activitate
max).
Majoritatea E celulare
au pH-ul optim- 6-8
(7,4)
excepii: hidrolazele
acide lizozomale pH=
5;
MAO din membrana
MC externa pH= 10.
1.
2.
3.
La E digestive pH
optim este cel al
sediului lor de
aciune:
Pepsina pH 1,5
2,
Amilaza
pancreatic - pH
7,2,
Tripsina - pH 7,88,0
Aciunea pH asupra
activitii enzimatice
Aciunea pH asupra
activitii enzimatice
1.
2.
3.
pH optim e dependent
de:
gradul de ionizare a
grupelor funcionale,
afinitii E fa de S,
stabilitii E.
In CA al E se afl grupri
ionizabile, acide sau bazice.
Acestea interacioneaz
direct cu ionii H+ si OH-,
rezultatul fiind creterea
sau scderea gradului lor
de disociere, acionnd ca
adevrai inhibitori ai E
(amilaza n sucul gastric).
Ionii H+ si OH- au un efect
denaturant asupra E - rup
legturile, ce determin
structura teriar.
Aciunea pH asupra
activitii enzimatice
Deci mrind sau
micornd pH-ul
mediului, se poate
regla activitatea
catalitic a E.
Dependena activitii
E de variaia pH-ului curb n forma de
clopot.
[E]
[S]
Grafic se reprezint sub
form de o curb de tip
hiperbolic.
n perioada iniial a
reaciei V crete pe
msur ce crete [S]. La
un moment dat cnd CA al
E se ocup de S V nu
mai crete. Ea rmne
constant i corespunde
V max a reaciei.
n cazul E alosterice
curba reprezint un
aspect sigmoid
[S]
Analiza curbei
hiperbolice arat c ea
reprezint 3 zone:
a. V de reacie crete
proporional cu c% S
b. Creterea este mai
ncet
c. V de reacie nu mai
crete
Aceast curb este numit curba lui MichaelisMenten i se exprim prin ecuaia:
[S]
V=Vmax x
_________
Km +[S]
curba lui
Michaelis Menten nu
poate fi determinat V
max (deoarece nu se
pot atinge c% infinite
ale substratului).
Se procedeaz la
linearizarea ecuaiei,
obinndu-se ecuaia
lui LineweawerBurk:
1
Km
1
V0 Vmax[S] Vmax
Mecanismele de activare
aE
Sunt : 1. nespecifice: temperatura , iradierea
2. specifice
Se activeaz la:
1. majorarea concentraiei S cnd este
insuficient
2. majorarea cantitii E
3. introducerea Co cnd sunt insuficiente
4. Introducerea ionilor metalelor Fe, Cu
Mecanismele de activare a E
Deosebim urmtoarele tipuri de reglare a
activitii enzimatice:
1. Reglare covalent - proteoliza limitata
2. Reglare covalent fosforilare/
defosforilare
3. Autostructurarea cuaternar
4. Alosteric
5. Reactivare
-
Reglarea covalent
- Proteoliz limitat
Unele enzime (proteine) se sintetizeaz n forma
neactiv de precursor proenzime (zimogeni)
Exemplu:
1) enzimele digestiei: pepsinogenul,
chimotripsinogenul, tripsinogenul, proelastaza,
procarboxipeptidaza - scindeaza proteinele in
stomac i duoden.
2) coagularea singelui e determinat de cascada de
reacii cu activitate proteolitic;
3) hormonii proteici (insulina);
4) proteinele fibrilare (colagenul).
Proteoliz limitat
-este
Importana biologic a
prezenei formelor neactive
Zimogenii sunt produse la locurile de sintez
(mucoasa gastric pentru pepsinogen,
pancreasul pentru toate celelalte), activrile se
produc la locul de aciune (stomac, intestin
subire)
1. Protejaz de proteoliz proteinele celulelor
productoare de E.
2. Este o forma de rezerv a E, care rapid pot fi
activate i intervin n reacie.
Autostructurarea cuaternar
Este caracteristic E ce posed structur
cuaternar
Fiecare protomer n parte nu e activ
La asamblarea lor se modific conformaia
fiecrui protomer i corespunztor se modific i
conformaia CA, devenind astfel favorabil pentru
fixarea i transformarea S
CA
EE
s
AlloM
Deosebim:
1. inhibiie
inhibiiia ireversibil
I covalent se fixeaz de E cu formarea EI
nedisociabil.
Exemple: Diizopropilfluorfosfatul (toxina
neuroparalitica) se fixeaz de OH-serinei n CA a
acetilholinesterazei (scindeaz acetilcolina) cu
formarea E neactive.
n rezultat se menine efectul acetilcolinei n
permanen ce duce la paralici muscular i
moarte.
- ionii metalelor grele (Hg, Pb) inhib gruparea SH
a multor E; acidul iodacetic- inhib ribonucleaza
Inhibiie ireversibil
Tipuri de inhibitie
Deosebim:
1. Inhibiie
competitiv
2. Inhibiie necompetitiv
3. Inhibiie prin exces de S
4. Inhibiie alosteric
Inhibiia competitiv
I
Inhibiia competitiv
Inhibiia competitiv
Inhibiia
competitiv
diminueaz v
catalizei:
nu modific V max,
dar crete mult Km,
micornd
afinitatea E pentru
S.
Lineweawer- Burk
Inhibiia competitiv
Exemplu:
inhibiia
Inhibiia necompetitiv
Inhibitorul
nu se aseamn ca structur cu S
I i S se leag simultan cu E dar locusurile sint
diferite (I nu se leag n CA)
E+S+I--------- ESI
Acest tip de inhibiie nu se nltur prin exces
de substrat.
I necompetitivi scad V max dar nu afecteaz
Km
Inhibiia necompetitiv
Inhibiia necompetitiv
Lineweawer- Burk
Inhibiia necompetitiv
Ex:
cianurile, CO se fixeaz cu Fe 3+
din citocromoxidaz ---se ntrerupe
LR
I poate fi nlturat de substane care l
leag numite reactivatori
Cei
Inhibiia
uncompetetiv
se leag la
complexul ES,
E+S----ES +I----ESI
Micoreaz i Km
i Vmax
Inhibiia uncompetitiv
Lineweawer- Burk
Inhibiie
E
S CA
CA E
M
Allos
Retroinhibiie
Izoenzimele- izoE
1.
2.
3.
STRUCTURA IZOE
Sunt E oligomere, cu structur cuaternar,
alctuite din cel puin 2 protomeri diferii
Ex. LDH (lactat piruvat)
Prezint un tetramer, alctuit din 2 tipuri de
subuniti (H inim; M- muchi) n
diferite raporturi; codificate de gene
diferite.
HHHH inim; HHHM;HHMM; HMMM;
MMMM muchi
ROLUL izoenzimelor
n controlul metabolic ( faciliteaza adaptarea
metabolismului in diferite esuturi.)
Ex: in miocard predomina H4 (inhibat de piruvat) orienteaz oxidarea piruvatului pe cale aeroba.
M4 este activat de catre piruvat i orienteaz
transformarea piruvatului pe cale anaerob spre lactat.
2. n diagnosticul unelor stri patologice (variaia diferitor
forme de izoE)
1.
LDH
1.
2.
Norma- 100-190U/L
Creterea de LDH 1 i LDH2:
infarctul miocardic
anemia hemolitic/ megaloblastic
LDH5 crescut - afeciuni hepatice,
necroza hepatic
Exemple de izoenzime:
1. Creatinfosfokinaza
-2 tipuri de monomeri:
M-Muscle i B brain
2. LDH
3. MDH
4. Aldolaza
5. Fosfataza alcalin
6. Fosfataza acid
Creatinfosfokinaza (CPK)
CPK M2
Muchi
scheltic
Miodistrofii
CPK MB
Muchi
cardiac
Miocardiop
atii
Creier
Ischemii
cerebrale
CPK B2
Sistemele
polienzimatice
Tipurile de organizare a
sistemelor polienzimatice
Se cunosc urmatoarele tipuri de
organizare a sistemelor
polienzimatice:
1. - funcional,
2. - structural-funcional
3. - mixt.
Organizarea funcional
enzimele sunt asociate n sistemul polienzimatic
cu ajutorul metaboliilor, care difuzeaz de la o
enzim la alta.
produsul reaciei primei E servete drept S
pentru E urmtoare etc.
Ex.: glicoliza. Toate enzimele participante la
glicoliza sunt n stare solubil, legtura se face
doar prin intermediarii metabolici.
E1
E2
E3
E4
A---------------- B------------- C---------- D---------- P
Organizarea structuralfuncional
E sunt fixate prin legturi slabe pe o protein
central, care poate fi chiar una din E.
Proteina central dispune de un bra care
fixeaz S i l duce la E1, care l transform n
P1;
P1devine S2 , braul l preia i l duce la E2, care
l transform n P2.
Avantajul este c braul duce de fiecare dat S la
E corespunztoare, potrivindu-l cu mare
exactitate pe CA, ceea ce asigur n ansamblu o
vitez mai mare dect cea corespunztoare
aciunii E neasociate.
Organizarea structuralfuncional
Ex.-
complexul polienzimatic
piruvatdehidrogenazic, constituit din 3 E
i 5 Co
sintetaza acizilor grai constituit din 7
E legate structural de PPA, care n
ansamblu ndeplinesc funcia de sinteza a
AG.
E se pot aranja n lan, fixndu-se de MB.
Ex.enzimele LR, care particip la transferul
de H+ i e.
1 cat = 6 107 UI
1 UI = 16.67 10-9 cat
specific reprezint
numrul de uniti enzimatice per mg
de protein-enzim
AS= Nr UI/mg protein
Este expresia puritii unei enzime
Metodele de separare i
purificare ale E
1. Dializ
2. Salifiere
3. Cromatografie
4. Gel-filtrare
5. Electroforez
Metodele de determinare a
activitii E
Viteza reaciei este proporional
cu
1.Viteza consumului substratului
2.Viteza formrii produsului
3.Viteza transformrii coenzimei
Utilizarea E n practica
medical
Preparatele farmaceutice contemporane sunt
asociate i conin ca regul urmtoarele enzime:
tripsin,
chimotripsin,
lipaz,
amilaz,
pancreatin,
bromelain,
papain,
rutin (vit. P).
Terapia cu enzime