Bradford Recapitularea principiilor de spectrofotometrie LP2 Recapitularea principiilor de spectrofotometrie
Multe experimente biochimice implică măsurarea unui compus prezent într-un
amestec complex. Cele mai utilizate metode utilizate pentru cuantificarea concentrației compușilor biochimici se bazează pe metode spectrofotometrice. Testele de dozare a proteinelor utilizeaza în general metode spectrofotometrice bazate pe diverse caracteristici spectrale ale aminoacizilor care fac parte din structura proteinelor. Alegerea metodei depinde de nevoile și caracteristicile căutate: fiabilitate, sensibilitate, viteză, dimensiunea eșantionului, capacitatea de a recupera eșantionul după dozare, prezența substanțelor care interfera cu eșantionul, etc. Recapitularea principiilor de spectrofotometrie
Fotometria înseamnă măsurarea luminii. Culoarea pe care o percepem de la o
sursă de lumină este asociată cu o anumită lungime de undă, λ. Lungimea de undă (λ) este perioada spațială a unei unde periodice - distanța pe care se repetă forma undei, caracteristică unei unde monocromatice într-un mediu omogen, definită ca distanța dintre două maxime consecutive de amplitudine. Este egală cu viteza (c) a unei unde într-un mediu împărțit la frecvența sa (f): λ = c / f. λ = lungimea de undă c = viteza luminii (m / s) f = frecvență (MHz) Recapitularea principiilor de spectrofotometrie Lungimea de undă depinde de viteza cu care unda se propagă prin mediul prin care trece. Când unda se deplasează de la un mediu la altul, frecvența sa rămâne neschimbată, dar lungimea ei de undă variază. Spectrul vizibil pentu om este parte a spectrului electromagnetic și are o lungime de undă cuprinsă între 400 și 700 nanometri (nm). Când lungimea de undă se schimbă în spectrul vizibil, se detectează o modificare a culorii. Recapitularea principiilor de spectrofotometrie
Lumina soarelui și toate lungimile de undă vizibile apar ca lumină albă.
Culoarea majorității obiectelor depinde de interacțiunea dintre lumina albă și electronii atomilor sau moleculelor care alcătuiesc obiectul. Culoarea percepută a unui obiect are o relație directă cu culoarea luminii vizibile absorbite. Dacă o soluție pare albastră, aceasta lasă lumina albastra a soarelui să treacă prin ea. Recapitularea principiilor de spectrofotometrie Când lumina albă trece printr-o soluție colorată, o parte din lumină este absorbită și o parte din lumină este transmisă. Lumina absorbită este măsurată în densitate optică (DO) sau absorbanță (A). Această lumină absorbită este captata de o celula fotoelectrică, care transformă energia luminii în energie electrică măsurată de un galvanometru. Mulți compuși incolori pot fi colorați cu reactivi corespunzători. Intensitatea culorii compusului necunoscut este comparată cu un standard (cu concentrație cunoscută). Absorbanța este proporțională cu concentrația substanței și poate fi determinată cu un instrument optic numit colorimetru sau spectrofotometru. Recapitularea principiilor de spectrofotometrie Măsurarea intensității culorii unei soluții colorate prin fotometrie este guvernată de legea Beer-Lambert: cantitatea de lumină absorbită de o soluție colorată este proporțională cu concentrația soluției și lungimea căii parcurse de lumina din soluție.
A = absorbanță (fără unitate)
ε = coeficientul de absorbție molară, caracteristic speciei absorbante la o lungime de undă dată și reflectă probabilitatea sa de absorbție a unei cuante de lumină (L / mol / cm). l = lungimea căii parcurse de lumină în soluție, exprimată în centimetri (cm) C = concentrația speciei absorbante în soluție, exprimată în moli pe litru (mol / L) Recapitularea principiilor de spectrofotometrie O aplicație a legii lui Beer-Lambert este determinarea concentrației unei soluții folosind tehnica curbei de calibrare. Pentru a cunoaște concentrația unei soluții / probe, se efectuează mai întâi o curbă de calibrare folosind dilutii ale unei soluții standard (soluție cu concentrație cunoscută). Dozarea proteinelor prin metoda Bradford Cele mai frecvente metode spectrofotometrice pentru determinarea concentrației proteice sunt: metoda Bradford, metoda Biuret, metoda Lowry, metoda Amido Black, metoda BCA. Metoda Bradford este mai simpla, mai rapidă și mai sensibilă decât metoda Biuret și Lowry. Reactivul „Bradford” conține colorantul Coomassie G250 Bright Blue. În soluție, colorantul Coomassie are o formă roșie cationică, care se absoarbe la 470 nm. Dozarea proteinelor prin metoda Bradford În mediu metanoic acid Coomassie G250 formează un complex cu proteinele. Legarea sa la proteine duce modificarea structurii avand o formă anionică, albastră, care se absoarbe la 595 nm. Intensitatea culorii măsurate la 595 nm este direct proporțională cu cantitatea de proteine din probă: cu cât este mai mare concentrația de proteine, cu atât culoarea este mai albastră. Coomassie G250 Bright Blue se leagă de proteine prin interacțiuni non-covalente. Este adsorbit pe proteine în principal prin interacțiuni ionice care implică grupările sulfonice acide ale colorantului și aminoacizii bazici (arginină, histidină și lizină) ai proteinei, dar și prin interacțiuni hidrofobe (aminoacizi hidrofobi), forța Van der Waals și legături de hidrogen. Dozarea proteinelor prin metoda Bradford Reactivi • Reactiv Bradford: 100 mg de colorant Coomassie G250 se dizolvă în 50 ml de etanol 95%; soluția alcoolică se amestecă cu 100 ml acid fosforic 85% și se ajustează la un litru cu apă distilată. • Albumină serică bovină (BSA): soluție standard la 2 mg / ml preparat extemporaneu în același mediu cu extracția proteinelor. • Ser sau extract proteic total: țesutul (aproximativ 30 mg) este omogenizat în 300 µL de tampon PBS 1X pentru a rupe membranele celulare; extractul este centrifugat timp de 20 minute la 12.000 g (11.300 rpm) și 4 ° C; supernatantul este pastrat la 4 ° C. Dozarea proteinelor prin metoda Bradford • Modul de lucru Microtub 1 2 3 4 5 6 7
Solutie standard BSA (μL) 0 25 50 75 100 125 150
Solutie tampon PBS (μL) 200 175 150 125 100 75 50
Concentratie Standard (mg/mL) 0 0,25 0,50 0,75 1,00 1,25 1,50
Reactiv Bradford (µl) 250 250 250 250 250 250 250
Se amestecă, se incubează 15 minute și se citește absorbanța la 595 nm la spectrofotometru