Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
a) Metode de precipitare
Precipitarea proteinelor reprezintǎ trecerea din stare dizolvatǎ în stare insolubilă
(precipitat). Precipitǎrile pot fi reversibile sau ireversibile.
Ionii anorganici în concentraţie mare precipitǎ proteinele prin spargerea sferei de
hidratare ce înconjoarǎ şi stabilizeazǎ molecula proteicǎ dizolvatǎ, pentru a se dizolva ei
înşişi în apa extrasǎ.
Fenomenul acesta se numeşte salifiere. Concentraţia salinǎ de precipitare variazǎ
de la o proteinǎ la alta, ceea ce permite fracţionarea proteinelor dintr-un amestec
neomogen. Sǎrurile de sulfat de amoniu, sulfat de magneziu şi sulfat de sodiu, precipitǎ
în mod reversibil proteinele, cu pǎstrarea activitǎţii biologice.
Metoda de fracţionare cu ajutorul sǎrurilor constǎ într-o precipitare fracţionatǎ a
proteinelor, adǎugând treptat la extractul proteic total cantitǎţi din ce în ce mai mari de
sǎruri neutre (de obicei sulfat de amoniu, sulfat de sodiu, amestecuri de fosfaţi primari şi
secundari de potasiu, dar uneori şi citrat sau fosfat de amoniu), fie sub formǎ de cristale,
fie sub formǎ de soluţii saturate.
Sarea se adaugǎ în porţiuni mici şi dupǎ fiecare adaos precipitatul obţinut se
separǎ prin centrifugare. În concentraţii mari, sǎrurile neutre scad solubilitatea proteinelor
determinând precipitarea lor. Întrucât fiecare proteinǎ precipitǎ la o anumitǎ concentraţie
a unei sǎri neutre, teoretic este posibilǎ precipitarea fracţionatǎ treptatǎ a proteinelor
prezente într-un extract tisular şi / sau celular dintr-un amestec.
Precipitarea fracţionatǎ a proteinelor cu ajutorul sǎrurilor neutre se bazeazǎ pe
faptul cǎ la concentraţii mari ionii sǎrii prin numǎrul şi afinitatea lor pentru apǎ
îndepǎrteazǎ o mare parte a moleculelor de apǎ care în mod obişnuit hidrateazǎ suprafaţa
proteinelor, determinând astfel precipiarea lor din soluţie. Precipitarea proteinelor este un
fenomen reversibil: introducerea în sistem a unei cantitǎţi suficiente de apǎ provoacǎ
dizolvarea precipitatului ceea ce denotǎ cǎ structura terţiarǎ a proteinelor nu a fost
modificatǎ. Procedeul este folosit şi la scarǎ industrialǎ pentru prepararea unor proteine
biologic active.
Precipitarea fracţionatǎ a proteinelor din soluţie prin adǎugarea treptatǎ de sulfat
de amoniu este o metodǎ cu largi utilizǎri pentru separarea proteinelor din medii
biologice complexe.
Albuminele şi globulinele se deosebesc dupǎ uşurinţa cu care sunt precipitate de
cǎtre sulfatul de amoniu. Globulinele precipitǎ când soluţiile care le cuprind sunt
aproximativ semisaturate în sulfat de amoniu, (NH 4)2SO4, pe când albuminele precipitǎ la
concentraţii mai mari de 75% saturaţie.
Solubilitatea proteinelor este influenţatǎ de pH prin efectul de ionizare produs
asupra moleculelor proteice. Existǎ o valoare a pH-ului la care proporţia sarcinilor
electopozitive ale moleculei de proteinǎ este egalǎ cu cea a sarcinilor electronegative, caz
în care sarcina electricǎ netǎ a proteinei devine nulǎ. pH-ul cu o asemenea valoare poartǎ
denumirea de punct izoelectric al proteinei. Solubilitatea unei proteine este minimǎ la
punctul izoelectric, iar la variaţii mici ale concentraţiei solventului, se poate produce o
creştere a solubilitǎţii cu menţinerea unui minim la punctul izoelectric. La punctul
izoelectric, solubilitatea proteinelor este minimǎ, datoritǎ atracţiilor electrostatice ce se
exercitǎ între moleculele ionizate a cǎror sarcinǎ electricǎ netǎ este nulǎ. Solubilitatea
proteinelor creşte în domeniile de valori de pH acid sau bazic care delimitează valoarea
punctului izoelectric. La concentraţii saline scǎzute, solubilitatea multor proteine creşte
odatǎ cu forţa ionicǎ a solventului datoritǎ mǎririi polaritǎţii acestuia. La concentraţii
saline mari, solubilitatea proteinelor este diminuatǎ pânǎ la precipitare datoritǎ
competiţiei dintre proteine şi ionii minerali ai solventului pentru moleculele de apǎ.
Influenţa pH-ului la punctul izoelectric relevǎ o repulsie minimǎ între moleculele
proteice, moleculele având tendinţa de a forma agregate care precipitǎ.
Valoarea pI este o caracteristicǎ a fiecǎrei proteine, cunoaşterea lui având o
importanţǎ atât analiticǎ, cât şi preparativǎ. Combinarea eletroforezei cu precipitarea la
punctul izoelectric (“isoelectric focussing”) constituie o metodǎ modernǎ şi extrem de
sensibilǎ pentru separarea şi izolarea diverselor proteine din amestecuri.
Aplicatie practica:
Precipitarea la punct izoelectric a ovalbuminei din albusul de ou
b) Metode de cromatografie
Toate tipurile de cromatografie au la bază principiul, separării de molecule dintr-o
probă, în urma interacţiunii acestora cu două faze distincte din punct de vedere fizic: o
fază mobilă şi o fază staţionară sau fixă.
Faza mobilă poate fi un gaz sau un lichid şi are rolul de a desprinde proba de pe
faza staţionară lichidă sau solidă. O anumită probă biologică poate conţine unul sau mai
mulţi componenţi moleculari care se distribuie între faza mobilă şi cea staţionară.
Moleculele cu afinitate redusă pentru faza staţionară sunt rapid desprinse şi eluate
din sistem de către faza mobilă.
Faza mobilă va fi colectată la diferite intervale de timp diferite fracţiuni
conţinând compuşi diferiţî din proba biologică. Astfel biomoleculele se separă ca urmare
a distribuţiei lor distincte între cele două faze: faza mobilă şi faza staţionară.
TIPURI DE CROMATOGRAFIE
Tehnicile de cromatografie după scopul urmărit sunt analitice şi preparative.
Tehnicile analitice de cromatografie determină puritatea unei probe biologice.
Tehnicile preparative de cromatografie urmăresc purificarea a unor cantităţi mari
de produs biologic.
În funcţie de mecanismul de separare, cromatografia se împarte în:
- cromatografie de partiţie;
- cromatografie de adsorbţie;
- cromatografie de afinitate;
- cromatografie de excludere moleculară.
Nu există o distincţie clară între aceste tipuri de cromatografii.
Astfel toate tipurile de separări cromatografice sunt într-o anumită măsură procese
adsorbtive. Totuşi în anumite cazuri efectele adsorbtive sunt minore faţă de factorii
nespecifici de solubilitate care determină separarea diferitelor tipuri de molecule
biologice.
Cromatografia de partiţie se bazează pe distribuţia solutului între cele două faze
lichide. Distribuţia solutului se bazează în primul rând pe diferenţa de solubilitate între
cele două faze. Distribuţia se poate determina prin utilizarea coeficientului de repartiţie,
Kp, unde:
Concentraţia substanţelor dizolvate în faza staţionară
Kd =
Concentraţia substanţelor dizolvate în faza mobilă
Faza staţionară constă într-un lichid imobilizat pe un suport solid. În această
categorie intră următoarele tipuri de cromatografie:
- cromatografia pe hârtie,
- cromatografia în strat subţire,
- gaz- lichid cromatografia.
Cromatografia de adsorbţie se referă la utilizarea unor schimbători de ioni ca
fază staţionară sau suport, care prezintă interacţiuni specifice între moleculele de solut şi
situsurile de legare de la suprafaţa fazei staţionare.
Aceste interacţiuni sunt reversibile şi pot fi de natură ionică, legături de hidrogen
sau interacţiuni hidrofobe.
Tehnicile de cromatografie de adsorbţie sunt reprezentate de cromatografia
schimbătoare de ioni.
Tehnicile de cromatografie de adsorbţie sunt utilizate pentru separarea în special a
macromoleculelor de tipul proteinelor şi acizilor nucleici.
Tehnicile de cromatografie de partiţie sunt utilizate mai ales pentru separarea
moleculelor mici de tipul aminoacizilor, monozaharidelor, acizilor graşi.
Cromatografia de afinitate constă în separarea unui component dintr-un amestec
pe baza reţinerii selective pe un suport insolubil pentru care manifestă un anumit grad de
afinitate.
Cromatografia de excludere moleculară constă în separarea componentelor
dintr-un amestec cuprinzând mai multe specii moleculare pe baza mărimii lor moleculare.
1. Cromatografia de partiţie
a) Cromatografia pe hârtie
În acest caz, distribuţia moleculelor de solut are loc între faza staţionară
reprezentată de hârtie de filtru care este puternic hidratată şi faza mobilă reprezentată de
un solvent. Această hârtie de filtru posedă anumite caracterisitici, fiind destinată special
analizei cromatografice.Între cele două faze, pe măsura deplasării solventului, de-a lungul
hârtiei, are loc o redistribuire continuă a acestor componente din amestecul ce urmează a
fi supus separării. Viteza de deplasare a acestor componente pe suportul de hârtie este
diferită datorită faptului că fiecare component prezintă un anumit coeficient de repartiţie
între cele două lichide
Pentru a reflecta repartiţia diverselor molecule între cele două faze lichide, cât şi
pentru a aprecia deplasarea sau “migrarea” pe hârtie a fiecărui component separat, s-a
introdus noţiunea de coeficient Rf , ce reprezintă raportul dintre distanţa (d) parcursă de
către fiecare component separat dintr-un amestec şi distanţa (D) parcursă de solvent.
Rf= d/ D.
Valoarea lui Rf este subunitară şi este caracteristică pentru un anumit component,
în condiţii identice de efectuare a cromatografiei. Cu cât un component are un R f mai
mare , cu atât el va migra mai rapid pe hârtia cromatografică.
Aplicaţii: separarea aminoacizilor liberi sau proveniţi din hidroliza proteinelor
izolate dintr-un material biologic.
Documentul analitic obţinut după separarea, colorarea şi identificarea
aminoacizilor se numeşte cromatogramă.
Acest tip de cromatografie, oferă posibilitatea determinării cantitative a unei
anumite fracţiuni izolate chiar dacă aceasta este în cantitate foarte mică. De asemenea
spoturile care apar pe cromatogramă pot fi tăiate, iar substanţele sunt extrase cu solvenţi
corespunzători.
Tipuri de cromatografie pe hârtie: în funcţie de direcţia de migrare a
solventului şi, respectiv, de separare a aminoacizilor, cromatografia pe hârtie prezintă mai
multe variante: cromatografie descendentă; cromatografie ascendentă; cromatografie
bidimensională;cromatografie circulară.
b) Cromatografia în strat subţire
Acest tip de cromatografie implică separarea pe un suport de material adsorbant –
dispus într-un strat subţire şi uniform- a unor componente dintr-un amestec supus
analizei. Stratul adsorbant poate fi constituit din următoarele tipuri de materiale: celuloză,
alumină, silicagel.
Separarea se realizează în prezenţa unei faze mobile (solvent) adecvate care irigă
stratul subţire, determinând repartizarea diferită şi respectiv individualizarea
componentelor sub formă de spoturi. Acest tip de cromatografie se bazează atât pe
fenomene de partiţie cât şi de adsorbţie. Componentele supuse analizei cromatografice se
separă pe suportul care formează stratul subţire de adsorbant datorită competiţiei dintre
aceste componente şi solventul de irigare pentru centrii activi ai adsorbantului. Pe baza
afinităţii diferite a componentelor din amestecul de analizat pentru adsorbant, a gradului
de solubilitate în faza lichidă mobilă care irigă stratul subţire, precum şi a puterii de
adsorbţie selectivă a stratului, aceste componente se vor repartiza diferenţiat pe stratul
subţire deplasându-se pe distanţe diferite. Adsorbantul, substanţele de separat, lichidul de
irigare şi forţa capilară care pune în mişcare lichidul de irigare imprimă fiecărei substanţe
din amestecul de analizat o viteză caracteristică de migrare şi îi determină o anumită
poziţie pe stratul subţire. Ca şi în cromatografia pe hârtie, poziţia unui component separat
prin acest tip de cromatografie este definită tot prin valoarea Rf.
Avantajul cromatografiei în strat subţire este viteza ridicată comparativ cu cea a
cromatografiei pe hârtie. Permite identificarea unor substanţe necunoscute dintr-un
amestec.
Cromatogramele obţinute prin ambele tehnici (cromatografie pe hârtie şi
cromatografie în strat subţire) trebuie repetate, deoarece orice schimbare a condiţiilor de
mediu (temperatură, umiditate) poate afecta standardele.
2. Cromatografia de adsorbţie
a) Cromatografia pe schimbători de ioni implică trecerea pe o coloană
încărcată cu un anumit schimbător de ioni, a unui amestec de obicei, proteic; aceste
proteine sunt separate, respectiv fracţionate, pe baza procesului de schimb ionic.
Mecanismul separării (fracţionării) cromatografice se bazează pe stabilirea unor
multiple legături de natură electrostatică între sarcinile electrice ale macromoleculelor
analizate (proteine, acizi nucleici) şi sarcinile electrice de semn contrar ale
schimbătorului de ioni.
Sub acţiunea unui eluent care conţine un ion cu o afinitate mai mare pentru
schimbătorul de ioni, aceste legături electrostatice pot fi desfăcute; macromoleculele sunt
eliberate de pe schimbătorul de ioni şi astfel sunt eluate din coloană. Între ionul
eluentului şi macromoleculele legate electrostatic la suprafaţa schimbătorului de ioni,
există o competiţie, aceste macromolecule fiind înlocuite de ionul competitiv. Există o
corelaţie între numărul de legături electrostatice realizate de proteine cu răşina
schimbătoare de ioni şi concentraţia ionilor competitivi. Astfel, existenţa unui număr
mare de legături electrostatice reclamă concentraţii mai mari ale ionilor competitivi,
necesare pentru desfacerea acestor legături şi, implicit, pentru eliberarea şi ieşirea de pe
coloană (eluţia) proteinei respective. Aşadar separarea sau fracţionarea diferitelor tipuri
de proteine, care diferă între ele prin încărcătura lor electrică sau prin distribuţia diferită a
sarcinilor în molecula lor necesită concentraţii diferite ale ionului competitiv cu care se
face eluţia.
În general, separarea diferenţiată a proteinelor dintr-un amestec prin
cromatografie schimbătoare de ioni, respectiv stabilirea eterogenităţii proteinelor, se
realizează pe două căi:
- prin desfacerea legăturilor dintre proteină şi schimbătorul de ioni şi schimbătorul
de ioni, proces determinat de creşterea concentraţiei ionilor competitivi (respectiv
a sărurilor din eluent);
- prin reducerea numărului de sarcini electrice ale moleculelor proteice, proces
determinat de modificări ale valorilor de pH.
Schimbătorii de ioni se clasifică în funcţie de compartarea lor în procesele de
schimb ionic în:
- cationiţi sau schimbători de ioni cu proprietăţi acide;
- anioniţi sau schimbători de ioni cu proprietăţi bazice;
Ca şi schimbători de ioni se utilizează: derivaţi de celuloză (DEAE (dietil- amino-
etil)- celuloza- anionit puternic bazic; carboximetil celuloza- cationit moderat sau slab
acid; sulfoetil celuloza- cationit puternic acid). Există anumite răşini schimbătoare de
ioni obţinute prin copolimerizarea stirenului sau a acidului acrilic cu divinil benzenul
(agent de introducere în moleculă a unor legături încrucişate).
Aplicaţii: Schimbătorii de ioni prezintă o importanţă deosebită în biochimia
analitică şi preparativă modernă, fiind utilizaţi pentru separarea, izolarea, purificarea
şi caracterizarea unor componente biochimice ca : proteine, peptide, enzime, acizi
nucleici, poliglucide, etc.
3. Cromatografia de afinitate
Acest tip de cromatografie se bazează pe abilitatea multor proteine de a se lega
specific (necovalent) de anumiţi liganzi. Astfel prin această tehnică se pot purifica aceste
proteine. O moleculă numită ligand, se leagă covalent de o matrice poroasă, inertă. Când
o soluţie proteică impurificată este trecută prin coloana cu matricea respectivă de care
este ataşat ligandul specific pentru proteina de interes, are rol legarea proteinei respective,
iar celelalte componente ale amestecului sunt eluate cu tampon din sistem. Proteina
legată este eliberată prin schimbarea condiţiilor de eluare cu un compus care are o
afinitate mai mare pentru ligand decât proteina respectivă.
Matricea cromatografică trebuie sa fie inertă din punct de vedere chimic, foarte
poroasă şi să aibă un număr mare de grupări funcţionale capabile de legarea covalentă a
ligandului. O astfel de matrice este cea de agaroză care are ca şi grupări funcţionale un
număr mare de grupări hidroxil. Dacă ligandul are o grupare aminică primară care nu este
esenţială pentru legarea proteinei de interes, ligandul se ataşează covalent la agaroză în
două etape:
1) agaroza reacţionează cu bromura cianogenă devenind “activată”;
2) ligandul reacţionează cu agaroza activată pentru a se lega covalent de aceasta.
O variantă a cromatografiei de afinitate este cromatografia de imunoafinitate
care utilizează anticorpi monoclonali care prezintă afinitate doar de pentru proteina de
interes.
4. Cromatografia de excludere moleculară
Principiul acestei metode cromatografice constă în separarea compuşilor organici
dintr-un amestec prin trecerea prin“sita moleculară” creată de reţeaua unui gel hidrofil.
Anumite substanţe hidrofile de tipul dextranului (cu denumirea comercială
Sephadex) sau poliacrilamidei (Biogel-P) prezintă proprietatea ca în contact cu apa sau
soluţii saline să se imbibe rapid, formând geluri de diferite porozităţi. Gelurile obţinute
sunt insolubile în mediu apos şi sunt stabile într-un interval larg de pH (2-9). Asemenea
geluri împachetate sub formă de coloane cromatografice sunt folosite pentru fracţionarea
diferitelor amestecuri de componente biochimice pe baza mărimii moleculelor, respectiv
a taliei lor moleculare.
Filtrarea în gel reprezintă o metodă de separare cromatografică a diferitelor
substanţe dintr-un amestec pe baza diferenţelor de mărime moleculară. Gelul are
proprietatea unei site moleculare (“ molecular sieving”) al cărui efect se manifestă prin
deplasarea diferenţiată a moleculelor ce parcurg coloana de gel, în funcţie de
dimensiunile acestora. În lichidul care filtrează din coloană apar mai întâi molecule cu
dimensiuni mari (nereţinute), apoi cele cu dimensiuni mici (reţinute). De aceea acest
proces de separare a componentelor pe baza diferenţei de dimensiune a moleculelor
poartă denumirea de cromatografie de excludere moleculară sau gel-filtrare.
Teoria gel-filtrării
Moleculele cu dimensiuni mici pot difuza în lichidul din interiorul particulelor
care compun gelul, si astfel eluţia lor din coloană este încetinită. Moleculele cu
dimensiuni mari nu pot penetra particulele de gel şi, în consecinţă, trec în faza lichidă
exterioară care înconjoară aceste particule, înaintând astfel liber prin coloană odată cu
lichidul care curge prin stratul de gel. Aceste molecule sunt eluate primele din coloană,
deoarece viteza lor de curgere este mai mare decât a moleculelor mici care difuzează în
interiorul particulelor de gel.
În funcţie de dimensiunea moleculelor, fiecare substanţă prezintă μn anumit
coeficient specific de distribuţie (Kd) între faza interioară (volumul lichidului din
interiorul particulelor de gel) şi faza exterioară (volumul lichidului din afara acestor
particule). Coefientul de distribuţie are o valoare cuprinsă între 0 şi 1.
Substanţele cu Kd =0, sunt complet excluse din lichidul existent în interiorul
reţelei de gel, fiind nevoie de un anumit volum de eluent V0 pentru îndepărtarea lor.
Substanţele cu Kd =1 vor fi excluse din coloană după irigarea acesteia cu un
volum suplimentar de eluent (Vi).
În funcţie de aceste volume, volumul necesar de eluent (Ve)pentru îndepărtarea
tuturor compuşilor organici dintr-un amestec introdus în coloana, este dat de formula:
Ve= V0+ Kd Vi.
Aplicaţii:
- izolarea şi fracţionarea macromoleculelor (proteine, enzime etc);
- concentrarea substantelor cu masă moleculară mare, în vederea analizei lor
ulterioare;
- desalifierea moleculelor proteice.
Aplicatie practica:
Definiţii
Fotometria se ocupă cu studiul şi măsurarea mărimilor caracteristice radiaţiilor luminoase, mai
exact cu studiul absorbţiei energiei luminoase la trecerea prin soluţii.
Colorimetria se ocupă cu studiul şi măsurarea intensităţii culorii unor compuşi coloraţi generaţi
prin reacţii chimice prin compararea directă cu o soluţie etalon
Spectrofotometria se ocupă cu studiul şi măsurarea absorbţiei energiei luminoase în funcţie de
concentraţia soluţiei unor compuşilor chimici incolori.
Lumina naturală contine toate lungimile de undă, începând cu domeniul ultraviolet (UV),
continuând cu cel vizibil (VIS) şi terminând cu infraroşu (IR).
Când lumina trece printr-o soluţie a unei substanţe , ea suferă o serie de modificări dependente
de natura substanţei. O radiaţie de o anumită lungime de undă şi energie parcurgând un mediu,
poate fi absorbită parţial sau total. În cazul în care nu există nici o absorbţie, mediul este transparent
iar energia radiaţiei care străbate mediul rămâne practic nemodificată, dar poate scădea în mod
apreciabil viteza radiaţiei. Când o parte din energia radiantă este absorbită, în dreptul lungimii de
undă absorbite, apar în spectru, linii sau benzi întunecate. În acest caz se vorbeste de spectrul de
absorbţie al compusului respectiv.
Diferitele lungimi de undă ale radiaţiei luminoase sunt absorbite în mod diferit în funcţie de
particularităţile energetice ale moleculelor străbătute. Absorbţia radiaţiei este echivalentă cu un
transfer de energie către mediul parcurs, depinzând de energia radiaţiei şi de natura moleculelor din
mediul parcurs.
Starea de excitaţie a unei molecule care a absorbit o cuantă luminoasă este de foarte scurtă
durată (10-12 sec.). De obicei această energie se pierde foarte repede sub formă de caldură.
Măsurarea absorbţiei radiaţiei în funcţie de energia ei respectiv de lungimea ei de undă, ca şi de
particularităţile mediului parcurs, constituie domeniul spectrofotometriei de absorbţie.
Principiu
Dacă un mediu absorbant, având o anumită grosime, este parcurs de o radiatie luminoasă
monocromatică de intensitate I0, o parte a acestei radiaţii este absorbită (I a), iar o parte este
transmisă (It). În acest caz, I0 = Ia+ It. De aici rezultă că transmisia (T) este egală cu raportul .
Atât coeficientul de absorbtivitate (k) cât şi coeficientul de absorbanta molară (ε) depind de
lungimea de undă a radiaţiei luminoase şi de proprietăţile absorbante ale substanţei.
Coeficientul de absorbanta molară reprezintă absorbanţa unei soluţii de concentraţie 1M,
având grosimea stratului de 1 cm.
Transmisia scade logaritmic cu concentraţia şi grosimea stratului de soluţie străbătut.
Logaritmul zecimal cu semn schimbat al transmisiei (-lgT sau lg1/T) este direct proporţional
cu concentraţia şi grosimea stratului. De obicei, grosimea stratului soluţiei este constantă şi
reprezintă lăţimea cuvei de spectrofotometru, care în condiţii standard, este de 1 cm. Logaritmul
cu semn schimbat al transmisiei procentuale se numeste absorbanţă (A) sau densitate optică
(DO).
După legea Lambert – Beer, absorbanta este direct proportională cu concentraţia soluţie (A=
ε c d ).
Pornind de la valoarea absorbantei A= 2- lgT şi dând diferite valori transmisiei, obţinem
următoarea corespondenţă între absorbanta (A) şi transmisie (T):
A ∞________________________________________________0
2 1
1 10
T 0_________________________________________________100%
Această corespondenţă între A şi T se poate observa cu uşurinţă pe scala instrumentului
de măsură: galvanometrul spectrofotometrului SPEKOL- Zeiss Jena sau a altor fotometre.
Din relaţia : A= ε x c x d se poate calcula concentraţia (c):
200 50 000
300 33 333
400 25 000
500 20 000
600 16 666
700 14 286
800 12 500
900 11 111
1000 10 000
Dispozitivul cuvelor cuprinde lăcaşurile pentru una sau mai multe cuve care conţin
soluţiile de cercetat. Cuva martor conţine numai solventul, în general apă distilată, în timp ce
cuva de măsurat conţine soluţia de analizat. Cuvele pot fi din sticlă sau masă plastică pentru
soluţii care absorb energia luminoasă în domeniul vizibil al spectrului sau din cuarţ pentru
domeniul ultraviolet. Grosimea standard a stratului de soluţie din cuva de reacţie este de 1 cm.
Sistemul portcuvă poate fi termostatat sau netermostatat, după caz.
Se utilizează termostatarea cuvelor când se urmăreşte activitatea enzimatică.
Dispozitivul fototraductor reprezintă instrumentul care permite transformarea energiei
luminoase transmise de soluţie în energie electrică. Fototraductoarele utilizate sunt diferite din
punct de vedere al sensibilităţii lor şi al domeniului spectral utilizat.
Acestea pot fi: fotodiode, fotocelule sau fotomultiplicatoare.
Tehnica de lucru:
Într-o eprubetă de 10 ml se pipetează 0.05 ml ser şi 0.45 ml apă distilată, apoi se adaugă 2
ml reactiv Gornall şi se agită. După 15 minute, se citeşte absorbanta la 546 nm, în cuve de
d=1cm. Paralel cu proba de ser se lucrează proba martor şi probele etalon. Se lucrează conform
tabelului următor:
Principiul metodei:
Peptidele şi proteinele (legaturile peptidice din componenta lor) formează cu reactivul
cupru -tartrat în mediu alcalin un complex proteină-cupru care ulterior va reduce reactivul
fosfomolibdeno-fosfowolframic la un compus de culoare albastră, care se fotometrează la 660
nm.
Avantajul metodei: permite determinarea unei cantităţi de proteină în probă de minim 5
μg, spre deosebire de metoda Gornall care permite dozarea unei cantităţi de proteină de minim 1
mg.
Reactivi necesari:
1. Carbonat de sodiu anhidru- 2% (masă/ volum) în Na OH 0.1N- 25 ml= reactiv A;
2. CuSO4·5H2O-0.5% în tartrat de sodiu -1% (ambele masa/ volum)- 100 ml= reactiv B;
3. Reactiv cupro- tartric alcalin= reactiv C, preparat prin amestecarea a 1 ml reactiv B cu
50 ml reactiv A; se prepară înaintea utilizării şi nu se păstrează;
4. Reactiv Folin-Cicâlteu = reactiv D: 100 g Na2WoO4·2H2O+ 25 g NaMoO4·2H2O+700
ml apă bidistilată+ 500 ml soluţie 80% (volum/volum) de acid ortofosforic+ 100 ml HCl
concentrat se introduc într-un balon de 2 l prevăzut cu refrigerent vertical şi se fierb 10 ore pe
becul de gaz. După fierbere se adaugă 150 g Li2SO4 şi 50 ml apă bidistilată+ 2-3 picături de
brom. Amestecul se fierbe încă 15 minute pentru îndepărtarea excesului de brom. După răcire
se completează volumul la 1000 ml cu apă bidistilată. Această soluţie are o concentraţie de
2N. La determinare, această soluţie se diluează 1:1 (volum/volum) cu apă bidistilată. Reactivul
concentrat se poate păstra timp îndelungat în sticlă brună.
5. Soluţie etalon de albumină serică bovină (BSA) – se dizolvă 20 mg în 100 ml apă
bidistilată şi se păstrează la congelator.
Tehnica de lucru:
Într-un balon cotat de 100 ml se pipetează 0.1 ml ser (plasmă sau sânge) cu
micropipeta. Se aduce la 100 ml cu apă bidistilată şi se amestecă pentru a se realiza o
diluţie de1:1000. Pentru determinare se utilizează 0.1 ml ser diluat. Se pipetează conform
tabelului următor:
Nr. ml H2O ml etalon ml ser ml ml μg.
eprubetei distilată diluat reactiv C reactiv proteină
D
0 0.500 - - 2 Agitare 0.25 -
E1 0.450 0.050 - 2 şi 0.25 10
E2 0.400 0.100 - 2 repaus 0.25 20
E3 0.350 0.150 - 2 10 0.25 30
E4 0.300 0.200 - 2 minute 0.25 40
P 0.400 - 0.100 2 0.25 ?
După 20 minute, se citeşte absorbanta la 660 nm, în cuve de d=1cm.
Calculul concentraţiei de proteină se face pe baza curbei de etalonare şi a factorului de
pantă, ţinând cont de cantitatea de ser luată în determinare şi de diluţia efectuată.
ANALIZA CALITATIVǍ A OVALBUMINEI PURIFICATE PRIN
ELECTOFOREZA ÎN GEL DE POLIACRILAMIDǍ
Echipamente necesare:
- plăci de sticlă pentru solidificarea gelului;
- pieptene;
- camera de electroforeză formată din două compartimente: central sau de sus (-)şi
compartimentul lateral sau de jos (+);
- redresor;
- baie de apă pentru denaturarea probelor proteice.
Tehnica de lucru
ATENŢIE! Acrilamida (Aa) are efecte neurotoxice grave. Trebuie utilizate mănuşi
pentru prepararea gelului de migrare cât şi a gelului de concentrare.
- se prepară câte 10 ml gel de migrare 10% poliacrilamidă pentru 2 plăci după
următoarea reţetă:
3.5 ml Aa + BisAa (29 %)
3.85 ml H2O ditilată
2.5 ml tampon Tris pH = 8,8
100 l dodecil sulfat de sodiu (SDS ) 10 %
50 l persulfat de amoniu (PA)10 % (agent de polimerizare).
- se degazează la vid circa 1 min.
- se adaugă 7.5 l TEMED pentru declanşarea polimerizării gelului.
Notă: Acest tip de gel serveşte la separarea proteinelor în benzi distincte în funcţie de
greutatea lor moleculară.
- se pipetează repede amestecul între plăcile de sticlă pentru a evita polimerizarea în
vârful pipetei.
- se pune deasupra câte 1 ml de apă distilată pentru ca gelul să polimerizeze fără ondulări
sau menisc ridicat.
- se lasă să polimerizeze cel puţin o oră;
- se prepară câte 6 ml gel de concentrare (5 % Aa; 0,1 % SDS) pentru 2 plăci de
electroforeză;
- se prepară gelul de concentrare după următoarea reţetă:
1 ml (29,2 Aa + 0,8 % BisAa) 5 %
1.5 ml tampon Tris HCl 0,5 M pH = 6,8
60 l SDS 10 %
40 l PA 10 %
3.4 ml H2O distilată.
- se adaugă 5 l TEMED pentru declanşarea polimerizării gelului de concentrare.
Notă: Acest tip de gel serveşte la concentrarea sau alinierea proteinelor dispuse în
godeuri înainte de intrarea în gelul de migrare.
- se îndepârtează apa de la suprafaţa gelului de migrare şi se toarnă gelul de concentrare.
- se pune pieptenele pentru formarea godeurilor;
- se lasă cel puţin 1 oră pentru polimerizare.
- se pregătesc probele proteice pentru electroforeză.
-se determină concentraţia proteinelor în amestecul proteic care va fi supus electroforezei.
ATENTIE!!!
- proteinele mai diluate de 1 mg/ml se concentrează prin precipitare cu acid tricloracetic
10 % (conc. finală). (De obicei se iau 200 l proteină+ 200 l TCA 20 % STOC).
- se prepară un volum final de proteină de 200 l 200 g proteină.
- volumul de tampon pentru prepararea probelor (TP) reprezintă 1/4 din volumul final.
- se calculează volumul de probă proteică (în funcţie de concentraţia proteică
determinată), pentru a se ajunge la 200 μg proteină în 200 μl volum final.
- se completează cu apă la 200μl după adăugarea volumului corespunzător de TP.
- proteina diluată se ţine 3 – 5 min. pe baie de apă la 100 oC.
Concentraţia soluţiei proteice optime pentru separare electroforetică este de
1g/μl.
Concentraţia proteinei pe godeu trebuie să fie cuprinsă între 5 g - 30 g într-un
volum 5 l - 50 l.
Observaţie: - pentru un amestec proteic cu o singură fracţiune se introduc câte 5 –
10 g proteină / godeu;
- pentru un amestec proteic cu mai multe fracţiuni se introduc până la 30
g proteină / godeu.
- se prepară concentraţia corespunzătoare pentru proteinele marker de greutate
moleculară
Notă : proteinele marker de greutate moleculară sunt proteine a căror greutate moleculară
este cunoscută. Aceste proteine se separă prin electroforeză în benzi distincte permiţând
aflarea prin comparaţie a greutăţii moleculare a proteinelor din probă.
Observaţie: - optim pentru markeri este o cantitate de 2 - 5 g proteină, pentru a avea o
bandă foarte îngustă.(pentru calcularea GM).
- pentru alte proteine a căror puritate se testează, se iau 10 - 20 g proteină
(10 pentru stabilirea GM; 20 pentru stabilirea altor impurităţi).
- se fixează plăcile în camera de electroforeză.
- se scoate pieptenele.
- proteinele marker de greutate moleculara se pun în godeurile marginale 5 -10 l (5 – 10
g proteină);
- se pun probele în restul godeurilor.
- se pune tamponul de migrare în compartimentul central, respectiv în compartimentul
periferic.
Notă:Tamponul de migrare se foloseşte cca. 30 ore. Tamponul de la anod (jos)se
acidulează în timp (după 20 h de funcţionare). Se poate neutraliza cu NAOH până la pH
= 8,6 – 9 şi se mai poate utiliza o dată, apoi se aruncă. Se trece tamponul de la catod (sus)
la anod şi se mai poate utiliza cca. 20 ore; la anod se pune un tampon nou.
- se conectează electrozii;
- se setează redresorul la un voltaj constant de 15V/ placă sau 30 V / 2 plăci , pentru
străbaterea gelului de concentrare şi respectiv 20 – 25 v / placă sau 40 – 50 v / 2 plăci,
pentru deplasarea în gelul de migrare.
- migrarea probelor proteice are o durată de circa 4 ore: 1 oră pentru a intra probele din
gelul de concentrare în gelul de migrare şi circa 3 ore pentru deplasarea probelor proteice
în gelul de migrare
- migrarea durează până când frontul (cu albastru de bromfenol ) ajunge la 1,5 cm de
marginea inferioară a gelului.
- se depărtează plăcile de sticlă şi se desprinde gelul de migrare.
- se ţine gelul la colorat 2 – 12 ore în soluţie de Coomasie Blue - optim – colorarea se
face sub agitare orizontală.
- se decolorează gelul utilizănd următoarea soluţie de decolorare:
10 % acid acetic
2,5 % metanol
- se poate efectua o decolorare rapidă – 1 – 2 ore la cald ţinând tava 15 – 20 min. pe baie
de apă la cald, cu uşoare agitări orizontale. Atenţie să nu se lipească gelul. Se întoarce
gelul de pe o parte pe alta.
-se poate efectua o decolorare lentă (optimă) ţinând gelul la decolorat la temperatura
camerei timp de 24 – 48 h. Decolorarea se face lent prin difuzie.
NOŢIUNI GENERALE DE SPECTROFLUORIMETRIE
Definiţii:
Fluorescenţa este fenomenul emisiei de lumină sub acţiunea unei radiaţii
absorbite, emisie care are loc atâta timp căt durează şi absorbţia. Pentru anumite structuri
moleculare foarte rigide, o parte din energia radiaţiei emise este eliberată lent, fenomen
numit fotoluminiscenţă şi este măsurat prin spectrofotometrie de emisie.
Principiul fluorescenţei:
Sub acţiunea radiaţiei luminoase, o substanţă minerală sau organică aflată în soluţie
absoarbe o parte din energia luminii incidente. Interacţiunea fotonilor cu moleculele de
substanţă determină trecerea electronilor de valenţă de pe orbitalul de bază (nivel
fundamental) pe un orbital cu un nivel energetic superior. În acest mod, moleculele ajung
în stare de excitaţie.
Moleculele nu rămân mult timp (10-12 secunde) în starea de excitaţie şi se relaxează
trecând pe un nivel energetic mai scăzut. Pentru majoritatea moleculelor, starea de
relaxare se datorează unui proces colizional, de transfer de energie cu moleculele
solventului precum şi cu alte molecule din soluţie. Unele dintre moleculele excitate emit
excesul de energie sub formă de lumină (fluorescenţă), revenind la nivelul fundamental.
(Fig. 1).
În Fig. 1, săgeata continuă indică absorbţia fotonilor de către moleculele de
substanţă ai căror electroni trec de pe orbitalul fundamantal pe un orbital cu un nivel
energetic superior.
În urma pierderii prin coliziune cu moleculele solventului a energiei vibraţionale,
moleculele excitate se relaxează foarte rapid ajungând la un nivel vibraţional mai redus.
Săgeata punctată indică revenirea la nivelul energetic iniţial prin eliberarea energiei
sub forma de lumină (fluorescenţă).
Lumina emisă prezintă două caracteristici importante:
- are o lungime de undă mai mare, adică o energie mai mică decât lumina de
excitaţie. O parte din energia de excitaţie se pierde sub formă de căldură. Energia
eliberată prin emisie este suficientă doar pentru a întoarce molecula excitată la un
nivel vibraţional mai ridicat din starea fundamentală (Fig. 1);
- lumina emisă este compusă din numeroase lungimi de undă care formează un
spectru de emisie. Acest spectru apare deoarece fluorescenţa fiecărei molecule
presupune reîntoarcerea în mod particular a moleculei la unul dintre nivelele
vibraţionale ale stării fundamentale. Spectrul prezintă totuşi un maxim de emisie
la o anumită lungime de undă.
Stare excitată
Nivele vibraţionale
Intensitatea fluorescenţei este definită sub forma unui randament cuantic (φ) ce
reprezintă un raport între numărul de fotoni emişi şi numărul de fotoni absorbiţi.
Din punct de vedere analitic este importantă relaţia dintre concentraţia soluţiei şi
intensitatea fluorescenţei. Intensitatea radiaţiei de fluorescenţă emisă în toate direcţiile
este egală cu intensitatea radiaţiei absorbite (dată de legea Lambert –Beer, vezi referatul:
Noţiuni generale de fotometrie) multiplicată cu randamentul cuantic al fluorescenţei:
Monocromator
de excitaţie Sistem optic Cuva cu proba
de examinat
sursa de lumină
fante
monocromator
de emisie
Inregistrator
Fototraductor
Fig. 2 Schema generală de funcţionare a unui spectrofluorimetru
Proba de ovalbuminǎ nativǎ se împarte în douǎ pǎrţi egale, o parte se foloseşte pentru
obţinerea formei S a ovalbuminei, iar cealaltǎ pentru prepararea izoformei I a
ovalbuminei.