Cursul 11 Genetica 20.05.

201
3

Reglajul genetic al operonului ARA

- arabinoza - un zahar
- operonul ARA contine:
 6 gene structurale: araB, araA, araD, araE, araF si araG
araB, A, D codifica pentru enzime care reduc arabinoza la D-xilulozo-
5-fosfat
araE, F, G – codifica pentru proteine implicate in transportul
activ/pasiv al arabinozeo de la exterior(din mediu) in interior;
 genele sunt transcrise pornind de la acelasi promotor PBAD
 o gena reglatoare araC – codifica proteina reglatoare AraC (reprezinta
prototipul unei familii de proteine reglatoare la bacterii numita familia
AraC-like); AraC – nu este nici un represor, nu este nici un activator, ci
este o proteina reglator-dual - in anumite conditii are functie de
represor al transcrierii lui PBAD; - in alte conditii are functie de activare a
transcrierii pornind de la promotorul PBAD.
 Cursul 11 Genetica 20.05.201
3

Reglarea:

1. in mediu nu exista arabinoza; in mediu exista glucoza

- operatorul ARA este represat iar represia se realizeaza prin 2 mecanisme
simultane:
a. exista glucoza in mediu => exista glucoza in celula => concentratia de
ATP creste si concentratia de cAMP scade => concentratia ed CAP~cAMP
este mica;
b. functionarea proteinei AraC pe post de represor: un dimer se ataseaza la
araO2 si un al doilea dimer se ataseaza la arai1 si cei doi dimeri se atrag
=> un tetramer si se inchide o bucla de represie:

a.+b. => rata de transcriere de la PBAD este foarte scazuta.

2. in mediu nu exista glucoza dar exista arabinoza

Si in cazul operonului ARA ca si in marea majoritate a operonilor bacterieni,

genele structurale sunt exprimate chiar si in stare represata => represia nu este
totala, dar are o rata de transcriere scazuta –la un nivel bazal

Expresia la nivelul bazal asigura totusi cateva molecule de proteine AraB, E,F,G

Arabinoza are o afinitate deosebita pentru dimerul AraC => sparge tetramerul
AraC => produce o schimbare conformationala a dimerului de AraC astfel incat se
 Cursul 11 Genetica 20.05.201
3

aseaza un dimer de AraC cu arabinoza la arai1 si un al doilea la arai2 si activeaza

astfel transcrierea.

a. Vezi reglajul de la operonul LAC

b. CAP trage pe ADN dimerul α-CTD al ARN polimerazei pentru ca secventa UP
a operonului nu este perfecta pentru legarea α-CTD-ului => exista un punct
de interactiune proteica intre CAP si α-CTD.
AraC trage si ea subunitatea σ similar CAP-ului.
Intre AraC si α-CTD apare de asemenea o interactiune proteica.

Operonul TRP
- Cuprinde gene implicate in biosinteza de triptofan deci in anabolism
- Cuprinde gene implicate in biosinteza de triptofan pornind de la acidul
chorismic-> si ducand la Triptofan
 Cursul 11 Genetica 20.05.201
3

- trpE +trpD codifica pentru ezima antranilat sintetaza(transforma acidul

chorismic in antranilat)
- trpC codifica pentru ezima indol-glicero-fosfat sintetaza(transforma
antranilatul in indol-glicero-fosfat)
- trpB +trpA codifica pentru ezima triptofan sintetaza(transforma indol-
glicero-fosfatul in triptofan)
- gena reglatoare este mult mai in amonte fata de genele structurale si are
propriul sau promotor PtrpR
- TrpR isi autoregleaza rata de transcriere; represeaza propriul promotor si
activat de o molecula de triptofan se ataseaza la o secventa de tip operator
Otrp
 Cursul 11 Genetica 20.05.201
3

- operonul TRP nu are secvente de activare (verzi)=> mecanismul de reglaj

este doar represia => secventele de nucleotide sunt perfecte pentru
atasarea ARNpolimerazei
- TrpR este un represor multiplu pentru ca isi autoregleaza rata de
transcriere; regleaza rata de transcrierea celor 5 gene structurale si se
aseaza la promotorul genei aroH

Toti represorii implicati in biosinteza aminoacizilor aromatici sunt represori

multipli.

Terminatori de transcriere

a) - legaturile dintre A si U sunt destul de instabile...

- structura hair-pin intra intr-o fanta a ARNpolimerazei si o face sa

stationeze putin(milisecunde) timp suficient ca molecua de transcript sa se
desprinda in zona bogata in U.
 Cursul 11 Genetica 20.05.201
3

b) – proteina rho are rol in formarea structurii hair-pin => o stabilizeaza atunci
cand complementaritatea intracatenara nu este perfecta => terminator t’ –
rho-dependenti si terminator t – rho-independenti.

Reglajul operonului TRP

- Cand in celula(!!! nu in mediu) nu exista suficient triptofan

Activarea operonului se realizeaza prin 2 mecanisme simultane:
a) Represorul TrpR este inactiv
b) Ateuare transcriptionala in regiunea Leader care are aproximativ 160
nucleotide;
In ARNtranscript apare o regiune extrem de bogata in secvente de tipul
UGG UGG UGG UGG ...codoni care codifica pentru triptofan

Viteza de deplasare a ribozomului pe regiunea Leader depinde de

concentratia de triptofan in citoplasma.
1. Daca nu are suficient triptofan in citoplasma viteza este redusa =>
structura hair-pin apare intre regiunile 2 si 3 dar ARNpolimeraza este
deja in zona 4; secventa politrp va fi sectionata de Lon in molecule
separate de triptofan.
 Cursul 11 Genetica 20.05.201
3

2. Daca in citoplasma exista o concentratie suficienta de triptofan =>

ribozomul se deplaseaza mai rapid
 Cursul 11 Genetica 20.05.201
3

Reglajul genetic bazat pe represorul TrpR – detecteaza concentratii mari ale

triptofanului in timp ce reglajul bazat pe atenuare detecteaza variatii mici ale
concentratiei triptofanului in citoplasma.

Mecanismele de reglaj genetic prin atenuare transcriptionala se bazeaza pe faptul

ca la procariote, procesele de traducere a informatiei genetice se realizeaza
cvasisimultan cu transcrierea genetica.