Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Dogma centrala a biologiei moleculare: ADN codifica pentru sinteza ARN (Transcriere), iar ARN
codifica pentru sinteza proteinelor (Traducere)
TRANSCRIEREA
Procesul de transcriere se refer la sinteza, catalizat de ARN polimeraz, a tuturor tipurilor de
ARN: ARNm, ARNr, ARNt etc, dintre care doar ARNm este tradus la proteine. ARN polimeraza are
capacitatea de a iniia sinteza de novo a unei catene ARN, fr a fi necesar existena unui primer; ea
alege catena din ADN purttoare de informaie, recunoate nceputul i sfritul mesajului genetic i
rspunde la aciunea unor factori de reglare pozitiv sau negativ.
Dpdv chimic si enzimatic transcrierea este similara replicarii ADN.
Ambele
procese
implica
sinteza
unei
noi
catene
polinucleotidice
transcrierea genetic se realizeaz numai n celule, existnd diferene n ceea ce privete locul
transcrierii genetice la procariote i eucariote, impuse de specificul organizrii celulare.
La procariote transcrierea se realizeaz pe matria ADN la nivelul nucleoidului, dar
molecula de ARN poate fi folosit de mainria de traducere a mesajului genetic nainte ca
sinteza lui s fie terminat.
La eucariote - transcrierea se desfoara n nucleu iar traducerea s se produc n citoplasm,
dup ce moleculele de ARN au suferit procesul de maturare i au trecut prin porii membranei
nucleare.
In celule, indiferent c sunt procariote sau eucariote, exist mai multe tipuri de ARN care sunt
implicate n procesul de biosintez proteic.
Acizii ribonucleici sunt compui sintetizai prin polimerizarea a patru tipuri de ribonucleotide
(AMP, GMP, UMP i CMP), reacia fiind catalizat de transcriptaz sau ARN-polimeraza
dependent de ADN.
ARN polimeraza este un complex enzimatic si catalizeaza aceeasi reactie in toate celulele
de la atat la PK cat si la EK.
Toate ARN polimerazele au anumite functii comune.
La bacterii se afla o singura ARN polimeraza
La EK sunt 3 ARN polimeraze : I, II si III
Structura primar a ARN este reprezentat de ordinea ribonucleotidelor din monocatena sa.
Alctuirea unei ribonucleotide:
Riboz
Baz azotat (A, U, G, C). In unele tipuri de ARN au fost evideniate baze azotate
speciale, cum ar fi:acid inozinic, derivai metilai ai unor purine sau pirimidine (acid
metilinozinic, acid metilguanilic); acid pseudouridilic; acid dehidrouridilic; acid
ribotimidilic.
Radical fosfat
Lungimea diferitelor tipuri de ARN variaz ntre 75 la 10.000 nucleotide. Cele mai mici
molecule de ARN sunt reprezentate de ARN de transfer (ARNt - 80 nucleotide).
La bacterii, ARNm copiaz mai multe gene alturate (ce formeaz un operon) fiind
policistronic, n timp ce la eucariote el copiaz o singur gen, fiind monocistronic.
De regul acest produs primar este instabil, att la procariote ct i la eucariote, el
suferind unele prelucrri post-transcripionale.
In cazul procariotelor, produsul primar este fie degradat rapid, dup ce i-a ndeplinit
funcia (ARNm), fie este clivat pentru a forma produi funcionali (ARNr sau ARNt).
La eucariote, produsul primar ce a copiat o gen discontinu este prelucrat prin eliminarea
secvenelor non-informaionale (intronii) sau prin adugarea unor secvene specifice de
nucleotide la extremitile moleculei.
TRANSCRIEREA LA PROCARIOTE
Cel mai studiat sistem bacterian de transcriere este cel de la E.coli i, cu toate c exist
particulariti n cazul anumitor bacterii, el a cptat un caracter de aplicabilitate general
n grupul bacteriilor.
Initierea transcrierii
Terminarea transcrierii
Initierea transcrierii
Are loc la nivelul unei secvene specifice de ADN numit promotor care interacioneaz cu
enzima ARN-polimeraza.
Examinarea unui numr mare de secvene promotor de la mai multe gene de la procariote a
evideniat :
Secventa promotor cuprinde 2 secvente de la regiunea -10 la regiunea -35
Astfel, exist o secven TATAAT, denumit cutia Pribnow sau regiunea 10 (centrat pe
nucleotida din poziia 10, raportat la punctul de start al transcrierii), ea fiind conservat la
toate secvenele promotor de la procariote.
O a doua secven, denumit regiunea 35, este comun procariotelor i este localizat la
aproximativ 35 pb n faa (n direcia de transcriere) situsului de start al transcrierii (este centrat
pe nucleotida din poziia 35).
7
Se consider c ambele regiuni, -10 (TATAAT) i 35 (TTGACA) reprezint secvene consens, adic
se regsesc la majoritatea promotorilor bacterieni.
Mai mult, se apreciaz c punctul de start al transcrierii este de obicei o purin, localizat la
mijlocul tripletei CAT.
Holoenzima (enzima complet format din cele cinci subuniti: 2 ) poate fi separat n dou
componente:
miezul enzimatic sau apoenzima (2 ) i
factorul (polipeptidul ).
Pentru realizarea corect a transcrierii (mai ales a iniierii procesului) este necesar
asamblarea tuturor componentelor.
miezul enzimatic al ARN-polimerazei poate realiza sinteza de ARN dar nu poate iniia n
mod corect procesul de transcriere pentru care este obligatorie asamblarea i a factorului .
Deci factorul mediaza legarea enzimei la promotor
Dup iniierea transcrierii, dupa ce lungimea catenei de ARN a ajuns la 8-9 ribonucleotide,
factorul se desprinde de holoenzim, apoenzima (2 ) continund singur sinteza
ARN.
Iniial, ARN-polimeraza recunoate i se leag la nivelul regiunii 35, considerat de unii
autori ca fiind situsul R ("recognition"),
dup care contactul cu ADN se extinde i la regiunea 10 (situsul B, de legare strns).
Initierea
Enzima ARN Pol se leaga la regiunea numita promotor de pe ADN. Complexul promotor
polimeraza este supus unor modificari structurale. Catena ADN din punctul de start se desface
producand o bucla de transcriere.Transcrierea are loc numai in directia 5 -3. Numai una dintre
catenele AND are rol de matrita
9
Alungirea ARN
Incepe Odata ce s-a sintetizat primul segment de ARN
Sinteza catenei ARN, adic transcrierea genetic se realizeaz n direcia 5'3', aceasta
fiind direcia de elongaie, matria de ADN fiind citit totdeauna n direcia 3'5', astfel c
matria i produsul de transcriere sunt antiparalele.
Spre deosebire de ADN-polimeraz care are numai specificitate de direcie, ARN-polimeraza
are i specificitate de secven recunoscnd promotorul genei care trebuie s funcioneze la
un moment dat.
Terminarea transcrierii
Incheierea procesului de transcriere se poate realiza la bacterii prin dou mecanisme:
unul care este determinat doar de secvena de ADN i
10
11
TRANSCRIEREA LA EUCARIOTE
Din punct de vedere chimic, sinteza ARNm la eucariote este realizat n acelai mod ca i la
procariote:
cele patru categorii de ribonucleozid-trifosfai sunt asamblate de ctre ARN-polimeraz
utilizndu-se o caten de ADN drept matri.
Cele mai importante diferene provin din structura diferit a genelor de la eucariote, acestea
avnd de regul o structur discontinu (sunt alctuite din secvene informaionale numite
exoni ce alterneaz cu secvene noninformaionale numite introni).
In esen, etapele procesului de transcriere sunt aceleai ca i la procariote:
iniiere, alungire i terminare, aspecte deosebite aprnd doar n procesul de iniiere.
Analizele efectuate asupra unor promotori tipici au evideniat faptul c acetia conin trei
secvene specifice de nucleotide, centrate la nivelul nucleotidelor din poziiile 30, -75 i 90,
toate fiind necesare pentru iniierea optim a procesului de transcriere
In afar de promotor, n iniierea procesului de transcriere mai sunt implicate i alte
secvene de ADN ce stimuleaz declanarea transcrierii dar acestea sunt localizate la o
distan considerabil n raport cu punctul de start (fie spre captul 5 fie 3 al regiunii de
ADN luat n discuie).
Aceste secvente au primit denumirea de elemente activatoare sau secvene de tip enhancer
Prelucrri postranscripionale:
-
eliminarea
intronilor
i asamblarea
exonilor
Procesul de
transcriere
de la eucariote
prezint unele particulariti: exist mai multe
tipuri de ARN-polimeraze ce asigur, n mod specifici, sinteza diverselor tipuri de
ARN celular (inclusiv din organitele celulare); ARN-polimerazele interacioneaz cu
promotorul doar dup ce intervin factori de transcriere; transcrierea anumitor gene
este stimulat de o serie de elemente activatoare; produsul primar de transcriere este
supus unor prelucrri transcripionale de tipul: adugrii de secvene caracteristice
la ambele extremiti ale moleculei, modificarea unor baze azotate, eliminarea
13
ETAPELE TRANSCRIERII
CATEGORII DE ARN CELULAR
Att n celulele bacteriene ct i n cele eucariote exist mai multe categorii de ARN:
ARN mesager (ARNm);
ARN solubil sau de transfer (ARNt) i
ARN ribosomal (ARNr).
La acestea, n cazul eucariotelor, se mai adaug:
ARN cromosomal i
Majoritatea moleculelor de ARN rezultate n urma transcrierii sunt supuse unor modificri
specifice n urma crora, moleculele respective devin biologic active. Formarea moleculelor de ARN
matur implic adiia, deleia sau modificarea unor nucleotide.
ARN mesager (ARNm)
ARNm este singurul tip de ARN celular tradus n structura proteinelor, el reprezentnd circa 5% din ARN
total.
ARNm este n acelai timp singura categorie de ARN celular care prezint o structur integral
monocatenar, cel puin n momentul traducerii mesajului genetic la nivelul ribosomilor.
Fiind purttoare de mesaj genetic, moleculele de ARNm au lungimi variabile deoarece i mrimea
genelor de la care preiau informaia sunt variate ca dimensiune.
De aceea, constanta de sedimentare a diferitelor molecule de ARNm variaz foarte mult, de la 8S
la 54S
La procariote
ARNm este utilizat direct in sinteza polipeptidelor
Moleculele de ARNm contin informatia pentru secventele de aminoacizi ale mai multor
catene polipeptidice diferite.
La procariote, ARNm este policistronic pentru c el copiaz informaia genetic (genele) necesar
sintezei mai multor catene polipeptidice implicate, de obicei, n aceeai cale metabolic. Utilizarea ARNm
policistronic la procariote reprezint o cale economic de a regla sinteza unor proteine n mod coordonat, cu
ajutorul unui singur semnal de reglare.
La eucariote de regul ARNm este monocistronic, el este sintetizat sub forma unui precursor
numit pre-ARNm sau ARN premesager care este supus prelucrrilor posttranscripionale n urma crora
se obine ARNm matur. Acesta trece n citoplasm unde se asociaz cu ribosomii cu care formeaz
polisomi sau poliribosomi. Lungimea ARN matur nu corespunde secvenei genelor numai pre-ARNm este
corespunztor cu aceasta, deoarece n cadrul prelucrrilor posttranscripionale, anumite poriuni
necodificatoare sunt eliminate (introni) fiind pstrate numai regiunile informaionale (exoni) care vor fi
traduse. Rezult c ARNm matur este reasamblat prin unirea exonilor.
Durata de via a unei molecule de ARNm variaz n funcie de tipul ce celul n care se
gsete. Stabilitatea moleculelor de ARNm presupune rezistena acestora fa de aciunea nucleazelor
citoplasmatice. Degradarea ARNm se datoreaz fie aciunii unor exonucleaze (care acioneaz asupra
moleculelor ncepnd cu extremitatea 3) sau a unor endonucleaze care recunosc i cliveaz anumite
secvene specifice de ribonucleotide localizate n interiorul moleculei de ARNm.
La procariote moleculele de ARNm sunt meninute funcionale doar 2-4 minute deoarece, dup ce au
fost utilizate pentru traducere, ele sunt degradate de ctre RN-aze. Se evit n acest fel alterrile structurale i
implicit ale mesajului coninut de ele, fenomenul fiind o consecin a adaptrii rapide a metabolismului
bacterian la condiiile de mediu. De asemenea, se permite activarea i represia unui mare numr de gene ntr-un
15
timp foarte scurt. Fenomenul de degradare rapid a ARNm explic proporia foarte mic de ARNm din celule
fa de alte categorii de ARN (de exemplu, ARNr) dei numrul genelor transcrise la ARNm este aproximativ
de 1000 de ori mai mare dect al celor ribosomale.
La eucariote durata de via a unei celule este mai mare dect la procariote i deci ARNm este
mai stabil. Aceasta se datoreaz faptului c, la organismele pluricelulare celulele se gsesc ntr-un mediu
intern mult mai stabil n privina parametrilor si.
Din punct de vedere structural, ARNm prezint trei regiuni distincte:
secvena codificatoare i
regiunea 3 terminal.
Regiunea leader este important pentru iniierea traducerii dar aceast secven nu este tradus.
Secvena codificatoare determin structura primar a unei catene polipeptidice, constituind matria
pentru sinteza unei catene polipeptidice, n timp ce regiunea terminal conine nucleotide care nu vor fi
traduse, rolul su fiind legat de asigurarea stabilitii moleculei de ARNm.
La nivelul ARNm de la procariote exist o secven particular de baze numit situs de legare la
ribosom sau secven Shine-Dalgarno care prezint complementaritate cu o secven de la captul 3 al
ARNr 16S din subunitatea mic a ribosomilor.
De asemenea, la nivelul ARNm policistronic se gsesc, de obicei, secvene spaiatoare lungi de 10 pb, care
delimiteaz secvenele codificatoare pentru fiecare polipeptid.
La procariote, cu excepia arhebacteriilor, ARNm matur corespunde ca lungime secvenei genice pe care a
transcris-o, fenomen denumit colinearitate.
ARN ribosomal (ARNr) reprezint aproximativ 80-85% din cantitatea total de ARN celular,
intrnd n structura ribosomilor.
Ribosomii sunt particule nucleoproteice citoplasmatice implicate n sinteza proteinelor, respectiv
n traducerea mesajului genetic dintr-o secven de ribonucleotide, din ARNm, ntr-o secven de
aminoacizi din catena polipeptidic. In cadrul acestui proces se realizeaz al treilea transfer informaional
la nivel molecular, de la ARNm la proteine.
Ribosomii conin 40-60% ARN, restul fiind reprezentat de proteine bazice ribosomale. In
ribosomii bacteriilor exist aproximativ 55 tipuri de proteine n timp ce ribosomii de la eucariote conin
75-80 tipuri de proteine ribosomale.
16
Ribosomii procariotelor prezint o constant de sedimentare de 70S, ei fiind formai din dou
subuniti: subunitatea mic de 30S i subunitatea mare de 50S. La eucariote, ribosomii au o constant de
sedimentare de 80S, cu o subunitate mic de 40S i o subunitate mare de 60S, n timp ce n organitele
celulelor eucariote (mitocondrii i cloroplaste) exist ribosomi de tip procariot.
In structura ribosomilor intr mai multe tipuri de ARNr.
Astfel, la procariote, n subunitatea ribosomal mic intr o molecul de ARNr de tip 16S
asociat cu 21 de tipuri de proteine ribosomale caracteristice subunitii mici, n timp ce subunitatea
mare conine o molecul de ARNr 23S i 34 tipuri diferite de proteine ribosomale.
pentru diferitele tipuri de ARNr sunt grupate la nivelul unor regiuni cromosomale cunoscute ca ADN
ribosomal (ADNr), ele fiind prezente n mai multe copii funcionale (sunt amplificate). De exemplu, la
eucariote genele pentru sinteza ARNr sunt localizate n regiunea organizatorului nucleolar (NOR) de la
nivelul constriciilor secundare ale unor cromosomi ai complementului cromosomal, denumii cromosomi
organizatori nucleolari. La majoritatea speciilor exist cte un cromosom organizator nucleolar/set
haploid de cromosomi dar exist i specii cu mai muli asemenea cromosomi: de exemplu, la om n
organizarea nucleolului sunt implicate cinci perechi de cromosomi.
Proteinele ribosomale sunt sintetizate n citoplasm i apoi transportate n nucleu, unde sunt
asamblate n subunitile ribosomale prin ataarea lor la precursorii ARNr. Dup asamblare la nivelul
nucleolului, subunitile ribosomale sunt transferate n citoplasm. Procesul de transport bidirecional este
extrem de complicat, n realizarea sa putnd fi implicate proteine ribosomale suplimentare, coninute de
ribosomii de la eucariote (spre deosebire de cei de la procariote).
O celul de E. coli conine aproximativ 15.000 ribosomi, pe cnd n celulele eucariote numrul de
ribosomi este mult mai mare. n celule se remarc un ciclu ordonat al asamblrii celor dou subuniti ale
ribosomilor atunci cnd ARNm trebuie tradus, i de dezasamblare a lor cnd nu se face traducere.
ARNr reprezint cel mai abundent tip de ARN celular, el fiind legat de formarea
ribosomilor. Exist mai multe tipuri de ARNr care intr n alctuirea celor dou
subuniti ribosomale alturi de proteinele ribosomale. Moleculele de ARNr sunt
monocatenare cu poriuni bicatenare datorit complementaritii unor secvene de
la nivelului aceleiai molecule. Genele ce codific moleculele de ARNr sunt
eseniale pentru supravieuirea celular; ele sunt grupate, amplificate i localizate
ARN de transfer (ARNt) ARNt reprezint aproximativ 10-20% din totalul de ARN celular i
constituie un component celular stabil att la procariote ct i la eucariote.
Acest tip de ARN (numit iniial ARN solubil deoarece a fost identificat n fracia solubil a
lizatului celular) este o molecul specializat pentru acceptarea n citoplasm a aminoacizilor
i transferul lor la ribosomi, ndeplinind n felul acesta rolul de molecul adaptoare ntre ARNm
i catena polipeptidic n curs de sintez.
Se poate spune c ARNt mediaz cel de-al treilea tip de transfer informaional: de la ARNm la
proteine.
Din punct de vedere al compoziiei chimice, moleculele de ARNt conin, pe lng bazele azotate
obinuite (AUCG) i o serie de baze neobinuite: acid inozinic, derivai metilai ai unor purine
sau pirimidine (acid metilinozinic, acid metilguanilic); acid pseudouridilic; acid dehidrouridilic;
acid ribotimidilic.
Moleculele de ARNt sunt de dimensiuni mici, fiind alctuite din 73-93 ribonucleotide.
18
Plierea ARNt determin realizarea unor legturi de hidrogen intracatenare ntre ribonucleotidele
complementare, rezultnd molecule cu o structur secundar care are forma unei frunze de
trifoi, cu brae bicatenare i bucle monocatenare.
prima dinspre captul 3 fiind bucla timinei (sau TGC) format din 7 baze (ntre care i timina
i pseudouridina).
Bucla cea mai important este bucla anticodonului i n sfrit bucla D (a dihidrouracilului)
format din 8 12 baze semi - mperecheate.
Buclei variabile i se atribuie rolul de fixare a ARNt la ribosom, iar bucla D se pare c este
implicat n recunoaterea de ctre enzimele aminoacil ARNt ligaze a ARNt corespunztor
aminoacidului pe care aceste enzime l-au activat.
Teoretic, n natur ar trebui s existe 61 de tipuri de molecule de ARNt, corespunztor codonilor
din codul genetic.
Cu toate acestea, pn acum, au fost identificate doar aproximativ 40 tipuri de molecule de ARNt.
De asemenea, s-a evideniat faptul c genele ce codific ARNt sunt, de obicei, grupate pe
cromosomi.
ARNt este sintetizat sub forma unei monocatene de preARNt, iar secvena sa nucleotidic este cu
3040 ribonucleotide mai mare dect n ARNt matur.
n urma unor prelucrri post-transcripionale are loc excizia unor ribonucleotide i modificarea
chimic a altora (acidul inosinic, metilguanina, dimetilguanina, acidul pseudouridilic, timina sub
form de acid ribotimidilic).
De asemenea, dup transcriere, la captul 3 al ARNt este adugat secvena CCA la nivelul creia
se va ataa aminoacidul activat n vederea transferului su la ribosom.
20
ARN nuclear heterogen i ARN cromosomal sunt ntlnite numai n celulele eucariotelor. Se
consider c ARNnh sintetizat n afara nucleolului este supus unor prelucrri posttranscripionale i va
forma ARNm matur. ARN cromosomal este un tip de ARN ce reprezint, cel puin parial, molecule
precursoare pentru celelalte tipuri de ARN. Pe de alt parte, se consider c ARNcr ar fi o categorie de
ARN legat de reglarea funciilor genice avnd rol de activator al genelor.
In plus, n nucleul i citoplasma celulelor eucariote au fost identificate molecule de ARN de
dimensiuni mici (n medie de 100-300 ribonucleotide), care au fost denumite, n funcie de localizare,
ARNsn (small nuclear) sau ARNsc (small cytoplasmic). In starea lor natural, aceste molecule de
ARN se gsesc la nivelul unor particule ribonucleoproteice. Mai mult, a fost identificat nc un tip de
ARN de dimensiuni mici, localizat la nivelul nucleolului (notat ARNsno) implicat, se pare n prelucrarea
precursorilor de ARNr.
In general, moleculele de ARNsn mpreun cu unele molecule proteice (aproximativ 40 tipuri de
proteine) realizeaz procesul de prelucrare a moleculelor de ARNm precursor ce presupune eliminarea
intronilor i asamblarea exonilor (fenomenul de splicing). Au fost identificate mai multe molecule de
ARNsn implicate n prelucrrile postranscripionale ale moleculelor de ARN, ele fiind notate: U1, U2,
U5, U4/U6. Moleculele de ARN care i controleaz propria prelucrare au fost denumite ribozime.
In afara tipurilor clasice de ARN, la eucariote au mai fost identificate i alte tipuri
de ARN cu funcii specifice: ARNnh, ARNcr, ARNsn, ARNsc, ribozime.
21