Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Fig 1.
mamografia (radiografie a sânului) – sânul este presat
între două plăci, iar razele X trec prin țesut nedeviate;
dacă se descoperă o zonă densă, în care nu se întâmplă
acest lucru, atunci acolo se presupune a exista o tumoră;
o revizuire Cochrane din 2013 a constatat că nu este clar
dacă screeningul mamografic face mai mult rău decât
bine, în condițiile în care o mare parte dintre femeile Fi
[39]
Fig 3.
Fig 4.
biopsie: îndepărtarea celulelor (în special din nodul dacă
se depistează) astfel încât acestea să poată fi analizate
la microscop;
există mai multe tipuri de biopsii: excizională
(îndepărtarea unei întregi bucăți de țesut), incizională
(îndepărtarea unei părți dintr-un lot sau a unui eșantion
de țesut), de bază îndepărtarea țesutului
Fig 5.
În urma testelor se obțin informații precum cât de repede poate crește tumora, cât de
probabil este să se răspândească în corp (stadiul în care se află), ce metode de tratament ar
funcționa cel mai bine, etc. Astfel, se ajunge la diagnosticul final și la selectarea celor mai
eficiente metode de tratament (chirurgie, radioterapie, chimioterapie, terapie hormonală și
terapie vizată – cu anticorpi). [4]
Astăzi, metodele clinice precum core-biopsia, mamografia cu raze X, ultrasunetele
(US), imagistica prin rezonanță magnetică (RMN), tomografia computerizată (CT), precum și
diverși indicatori de oncodiagnostic de laborator (markeri tumorali) sunt frecvente; cu toate
acestea, se recurge la ele când boala a început să progreseze. Din aceste motive, echipele de
cercetare din întreaga lume sunt nedumerite de căutarea unor metode noi, suplimentare,
pentru diagnosticarea cancerului de sân. Metoda spectroscopiei IR – o metodă analitică
sensibilă, nedistructivă și destul de ieftină – are șanse mari să fie una dintre ele.
Cele mai multe studii privind diagnosticarea bolilor folosind spectroscopie IR sunt
concentrate în regiunea infraroșu mijlociu a spectrului (de la 4000 la 400 cm-1), deoarece
această zonă conține multe vârfuri intense rezolvate și poate oferi informații chimice
valoroase [5]. Spectroscopia IR în studiile biomedicale și de diagnostic este utilizată pe scară
largă pentru analiza țesuturilor tumorale, celulelor, oaselor, salivei, urinei, părului, lichidului
sinovial etc. [6]. Majoritatea cercetărilor care vizează obținerea de informații despre
potențialul de diagnostic al spectroscopiei IR utilizează material de țesut tumoral ca probă de
țesut analizat [7]. De exemplu, țesutul tumoral al cancerului de sân (carcinom ductal
infiltrativ, carcinom lobular și adenom mamar) a fost analizat folosind spectroscopie FTIR și
principalele diferențe dintre țesutul normal și tumoral în „zona amprentei” pentru proteine,
acizi nucleici și lipide. au fost raportate [8]. S-au observat diferențe semnificative în special la
frecvențele de 1543 cm-1 și 1653 cm-1, corespunzătoare benzilor de absorbție ale amidei II și I,
respectiv. În cazul unui tip rar de tumoră a carcinomului mucos (mucinos), benzile nou
apărute la 3400 și 1300 cm-1 au fost observate datorită formării unui complex de muco-
glicoproteine [9]. Întreruperea structurii secundare a celulelor tumorale a fost găsită în
regiunea amidă I după procedura de selecție a curbei. Analiza cantitativă a arătat un raport
diferit de elice α, foi de β, ture β și structuri aleatoare nedirecționate. Au fost observate
diferențe semnificative între țesuturile normale și țesuturile de fibroadenom/carcinom în
regiunile de acid nucleic și proteine de colagen, cu o bandă de 970 cm-1 (νPO32 - ADN și
ARN riboză) fiind mai intensă pentru țesuturile carcinomului și mai puțin intensă pentru
țesuturile neoplasmului benign. probe comparativ cu probele normale [10].
În Ref. [11], autorii au dezvoltat un model de calcul fizic care utilizează constante
fizice pentru a evalua eficacitatea chimioterapiei, realizată prin detectarea diferențelor între
spectrele infraroșu ale țesutului mamar sănătos, canceros și post-chimioterapic.
Anterior, spectroscopia FTIR a fost aplicată pentru analiza ADN-ului probe izolate din
țesuturile sânului feminin [12]. Hârtia a raportat posibilitatea ca spectroscopie FTIR să fie
utilizată în distingerea probelor oncologice de cele sănătoase condiționat, pe baza diferențelor
în proprietățile chimice interne ale ADN-ului. Regiunea spectrului IR asociată cu tranzițiile
vibraționale ale substituenților structurali ai bazelor nucleotidice, grupărilor dezoxiriboze și
fosfodiester, determină cele mai semnificative diferențe între grupele „cancer” și „non-
cancer”. Sa constatat că regiunea de 1200 1100 cm-1 are cea mai semnificativă diferență
statistic între spectrele grupurilor „cancer” și „non-cancer”. Autorii ajung la concluzii
promițătoare că modificările structurale progresive ale ADN-ului unui sân feminin normal,
care conduc la un fenotip precanceros sau canceros la o proporție semnificativă de femei, sunt
baza pentru o nouă paradigmă pentru înțelegerea etiologiei cancerului de sân și prezicerea
apariţiei sale în stadiile incipiente ale carcinogenezei.
Microspectroscopia FPA-FTIR este propusă în Ref. [13] pentru a monitoriza
eficacitatea chimioterapiei pentru cancerul de sân triplu negativ. Autorii au evidențiat semne
discriminatorii care corespundeau reacțiilor patologice și clinice la chimioterapie. Cele mai
influente benzi care au condus la modelul de discriminare a țesutului cancerului de sân înainte
și după chimioterapie au fost asociate cu benzi de amidă I și II.. Prin urmare, pentru a
minimiza procedurile invazive, un număr de autori au luat în considerare spectroscopia FTIR
pentru analiza serului [14].
Pentru metoda de predicție, la utilizarea rețelelor neuronale artificiale, cele mai bune
rezultate au fost obținute la frecvențele de 2925, 2910 și 2853 cm-1, care sunt oscilații
fosfolipide ale CH3 și CH2; 1035 cm-1, oscilaţie C-riboză; 930 cm-1, vibrații scheletice C–C–N;
910 cm-1, oscilatie riboza; iar 855 865 cm-1 este oscilația legăturii P–O. Serul sanguin al
donatorilor sănătoși și al pacienților cu cancer de sân a fost analizat folosind spectroscopie
FTIR în modul de transmisie și metode PCA LDA [15]. S-a subliniat că intervalul de 3090
3700 cm-1 a fost cel mai relevant criteriu pentru separarea probelor de ser ale cancerului de
sân de cele sănătoase, ceea ce, potrivit autorilor, ar putea fi explicat prin modificările proteice.
Autorii au descoperit, de asemenea, că partea proteică a spectrului a fost factorul cel mai
discriminant atât pentru zonele de control, cât și pentru serul canceros, în care colagenul ar
putea servi ca un potențial biomarker care ar putea fi utilizat pentru a distinge pacienții cu
cancer de sân de donatorii sănătoși [16]. Această combinație va permite obținerea unei
combinații eficiente de cel puțin 4 factori: disponibilitate, ușurință în pregătirea probei,
acuratețe și utilizare non-invazivă.
Materiale și metode
Probele și pregătirea probelor Probele de ser au fost furnizate de Instituția de Sănătate
de Stat din Sankt Petersburg „Dispensarul de Oncologie Clinică Orașului”. Tuburile „VACUE
TTE® Z Serum Sep Clot Activator” au fost folosite pentru probele de ser. Un strat special pe
peretele interior al tubului, care conține particule microscopice de silice, activează coagularea.
Aceste tuburi conțin gel separator inert, care formează o barieră stabilă între ser și cheag de
sânge după centrifugare. Serul a fost centrifugat timp de 10 minute la 3000 rpm. Probele de
ser au fost congelate la 20⸰ C imediat după îndepărtare. Au fost păstrate la această
temperatură și decongelate imediat înainte de analiză. Probele de ser de 1 ml au fost colectate
de la femei cu un diagnostic clinic și histopatologic confirmat de cancer de sân. Serul de la
donatori de sânge, inclusiv de la persoane sănătoase care nu au avut un diagnostic clinic de
cancer de sân, a fost folosit ca grup de control. Toți participanții au fost pe deplin informați și
toți au semnat formulare de consimțământ pentru acest studiu. Serul a fost obținut de la 66 de
paciente diagnosticate cu cancer de sân și 80 de donatori sănătoși; toate probele au fost de la
femei (Tabelul 2). Vârsta medie a pacientelor cu cancer de sân a fost de 58,53 ani, vârsta
minimă de 35 de ani, iar cea maximă de 80 de ani. Vârsta medie a donatorilor sănătoși a fost
de 40,76 ani, cel mai tânăr participant avea 20 de ani varsta; cel mai în vârstă avea 72 de ani.
În grup, 98% din probe aparțin grupului de tipizare histologică fără tip special (carcinom
invaziv, carcinom ductal infiltrativ, carcinom ductal invaziv, carcinom lobular invaziv și
carcinom lobular infiltrant).
Spectroscopie ATR-FTIR
Corecția de bază și normalizarea datelor au fost efectuate pentru toate spectrele prin
software-ul OPUS. Corecția liniei de bază a fost efectuată folosind metoda benzii de cauciuc,
normalizarea, prin metoda vectorială. Analiza datelor a fost efectuată folosind software-ul The
Unscrambler 9.7 (Camo Software AS, Oslo, Norvegia). Din spectrele originale ale probelor de
cancer și ale probelor de control, s-a format spectrul mediu și a fost calculată abaterea
standard. Pentru a evidenția benzile, pentru a reduce zgomotul de fond și pentru a dezvălui
adevăratele caracteristici biochimice ale fiecărui ser specific, au fost calculate derivate
secunde din spectrul serului sanguin la pacienții cu cancer de sân și la donatori sănătoși. A
doua derivată este o operație matematică obișnuită pe spectrele IR, care detectează benzi
compuse din benzi principale de absorbție largi. Fiecare bandă din spectrele de absorbție este
reprezentată ca minime mai clare și mai pronunțate în derivata a doua. După preprocesarea
spectrelor și calcularea a doua lor derivată, datele spectrale au fost analizate folosind metode
de analiză multivariată (PCA și PCR). [17].
Fig. 8. Derivatele secunde ale spectrelor FTIR ale serului sanguin al unui grup de donatori
sănătoși și al unui grup de pacienți cu cancer de sân, precum și derivata secundă medie a
spectrului unui grup de donatori sănătoși (1) și pacienți (2).
Fig. 9. Derivatele secunde medii ale spectrelor FTIR ale serului sanguin al donatorilor
sănătoși (1) și pacienților cu cancer de sân (2), precum și diferența dintre derivații medii ai
celor două grupuri (3). Dreptunghiurile cu puncte verzi reprezintă vârfurile selectate pentru
comparație între probele obținute de la donatori sănătoși și pacienți.
Fig. 10. Rezultatele analizei PCA în regiunea proteică de 1700–1450 cm-1. Diagrama de
dispersie a scorurilor analizei PCA (a) și diagrama de încărcare (b) a derivatelor secunde ale
spectrelor din regiunea proteică de 1700–1450 cm-1 : 1 – donatori sanatosi, 2 – pacienti cu
cancer de san.
Fig. 11. Rezultatele analizei PCA în regiunea 1305–1250 cm-1. Diagrama de dispersie
a scorurilor analizei PCA atunci când sunt testate împotriva modelului optimizat utilizând
procesul de validare încrucișată (a); graficul celor mai semnificative încărcări (b) pentru PC1
și PC2. Principalele diferențe între grupuri sunt reprezentate de vârfuri cu intensitate mai mare
Fig. 12. Diagrama de dispersie a scorurilor analizei PCA atunci când sunt testate pe modelul
optimizat folosind procesul de validare încrucișată: 1 – donatori sănătoși, 2 – pacienți cu
cancer de sân, 3 – grupuri nr. 1 și 4 (a), grupa nr. 2 (b), grupa nr. 3 (c), și grupul nr. 5 (d) din
tabelul 2.
Fig. 13. Regresia componentei principale rezultă în regiunea de 1306 1240 cm-1 pentru
predicția grupului normal (albastru) și a grupului cancer (roșu). (A) Graficul punctajelor PC 1
și PC 2. (B) Încărcările componentei principale 1. (C) Varianta explicată. (D) Predict vs
referință.
Concluzie
Obiectivul principal al spectroscopiei clinice FTIR este de a oferi metode noi și
îmbunătățite pentru diagnosticarea bolilor care sunt în prezent dificil sau costisitor de
diagnosticat folosind metodele existente. Diagnosticarea bolilor folosind spectroscopie poate
fi realizată prin analiza spectrului de probe pentru markeri spectrale specifici sau prin căutarea
modificărilor globale ale spectrelor care pot fi asociate cu boala, dar care nu au neapărat o
origine cunoscută.
Modelul PCR, dezvoltat în studiul de față, se bazează pe derivatele secunde ale
spectrelor IR în intervalul 1306 1250 cm 1, face posibilă dezvăluirea spectrelor pacienților cu
cancer de sân cu o sensibilitate de 92,3% și o specificitate de 87,1% . Acest interval, într-o
măsură mai mare, caracterizează modificările calitative și cantitative ale ADN și ARN, care
reflectă destul de exact înțelegerea actuală a rolului factorului genetic în carcinogeneză și
oncopatologie.
Bibliografie:
1 - Bray, F., et al., Global cancer statistics 2018: GLOBOCAN estimates of incidence and
mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries. CA Cancer J Clin, 2018. 68(6): p. 394-
424.
2 - Ashikari, R., et al., Paget's disease of the breast. Cancer, 1970. 26(3): p. 680-5
3 - Begg, C.B., et al., Variation of breast cancer risk among BRCA1/2 carriers. Jama, 2008.
299(2): p. 194-201.
4 - Kösters, J.P. and P.C. Gøtzsche, Regular self-examination or clinical examination for early
detection of breast cancer. The Cochrane database of systematic reviews, 2003(2): p.
CD003373.
5 - D. Ellis, R. Goodacre, Metabolic fingerprinting in disease diagnosis: biomedical
applications of infrared and Raman spectroscopy, Analyst 131 (8) (2006) 875–885
6 - G. Bellisola, C. Sorio, Infrared spectroscopy and microscopy in cancer research and
diagnosis, Am. J. Cancer Res. 2 (1) (2012) 1–21
7 - Depciuch, E. Kaznowska, A. Koziorowska, J. Cebulski, Verification of the effec- tiveness
of the fourier transform infrared spectroscopy computational model for colorectal cancer, J.
Pharmaceut. Biomed. Anal. 145 (2017) 611–615
8 - R. Mehrotra, A. Gupta, A. Kaushik, N. Prakash, H. Kandpal, Infrared spectroscopic
analysis of tumor pathology, Indian J. Exp. Biol. 45 (2007) 71–76
9 - M. Dimitrova, D. Ivanova, I. Karamancheva, A. Milev, I. Dobrev, Application of ftir-
spectroscopy for diagnosis of breast cancer tumors, J. Univ. Chem. Technol. Metal. 44 (3)
(2009) 297–300
10 - Y.X. Ci, T.Y. Gao, J. Feng, Z.Q. Guo, Fourier transform infrared spectroscopic
characterization of human breast tissue: implications for breast cancer diagnosis, Appl.
Spectrosc. 53 (3) (1999) 312–315
11 - Depciuch, E. Kaznowska, S. Golowski, A. Koziorowska, I. Zawlik, M. Cholewa, K.
Szmuc, J. Cebulski, Monitoring breast cancer treatment using a fourier transform infrared
spectroscopy-based computational model, J. Pharmaceut. Biomed. Anal. 143 (2017) 261–268
12 - D. Malins, N. Polissar, K. Nishikida, E. Holmes, H. Gardner, S. Gunselman, The etiology
and prediction of breast cancer. fourier transform–infrared spectroscopy reveals progressive
alterations in breast dna leading to a cancer–like phenotype in a high proportion of normal
women, Cancer 75 (2) (1995) 503–517
13 - I. Zawlik, E. Kaznowska, J. Cebulski, M. Kolodziej, J. Depciuch, J. Vongsvivut,M.
Cholewa, Fpa-ftir microspectroscopy for monitoring chemotherapy efficacy in triple-negative
breast cancer, Sci. Rep. 6 (2016)
14 - Backhaus, R. Mueller, N. Formanski, N. Szlama, H.-G. Meerpohl, M. Eidt,P. Bugert,
Diagnosis of breast cancer with infrared spectroscopy from serum sam- ples, Vib. Spectrosc.
52 (2) (2010) 173–177
15 - F. Elmi, A. Movaghar, M. Elmi, H. Alinezhad, N. Nikbakhsh, Application of ft-ir
spectroscopy on breast cancer serum analysis, Spectrochim. Acta Mol. Biomol. Spectrosc.
187 (2017) 87–91
16 - K. Gajjar, J. Trevisan, G. Owens, P. Keating, N. Wood, H. Stringfellow, P. Martin-
Hirsch, F. Martin, Fourier-transform infrared spectroscopy coupled with a classifi- cation
machine for the analysis of blood plasma or serum: a novel diagnostic ap- proach for ovarian
cancer, Analyst 138 (14) (2013) 3917–3926
17 - I.T. Jolliffe, Principal Component Analysis, Springer-Verlag, New York, 2002
18 - Z. Movasaghi, S. Rehman, I. Rehman, Fourier transform infrared (ftir) spectroscopy of
biological tissues, Appl. Spectrosc. Rev. 43 (2008) 134–179