Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
VEGETAL
Istoricul tiin eiIG
Conf.dr.CoierViorica
Istoriculapari ieiIngineriei
geneticecatiin
Datanateriitiin eiADNeste25aprilie1953
James Watson,
Maurice Wilkins
iFrancisCrick
anun au
descoperirea
structurii dublu
helix a ADN
(Nature, 1953,
171: 737-738 )
codon-AA
PREMISELEAPARI IEI
Inginerieigeneticecatiin
1. Descifrareaorganiz riigenomuluinucleariextranuclearla
procarioteilaeucariote
2. Descifrareastructuriigenelorlaeucarioteiprocariote
3. Descoperirea instrumentelor moleculare enzimele de
restric ie
4. Dezvoltarea tehnicilor de amplificare in vitro a unui
fragment de ADN tehnica PCR
5. Dezvoltarea tehnicilor de hibridare a acizilor nucleici
6.Dezvoltareatehnicilordesecven iere
7. Sintezaartificial agenelor,etc
Descifrareaorganiz riigenomuluinuclear
iextranuclear la procariote
Descifrareaorganiz riigenomuluinucleari
extranuclear la eucariote
Structur liniar
Num rdemoleculeADNdc2n
Descifrarea
structuriigenelorlaeucarioteiprocariote
Structura
discontinu la
eucariote (exoni,
introni)
Structuracontinu la
procariote(f r
introni; mai multe
gene - operon)
Descoperireaenzimelorderestric ie
Secven iereaADN(Sanger)
Condi iilecetrebuiendeplinitepentrucaorice
metod sautehnic s poat fiinclus n
domeniul ingineriei genetice:
Elemente:
(1) pasagerul
(2) vectorul
(3) Gazda
ienzime:de
restric ie,ligaze,
revestranscriptaze,
ADN polimeraze,
terminaltransferaze
- fertilizarea in vitro;
- procese naturale cum sunt: conjugarea,
transduc ia,infec iaviral ,transformarea;
- inducerea poliploidiei;
- transferul de embrioni;
- regenerarea unei plante ntregi pornind de
laocelul diferen iat saudintr-un esut
nediferen iat(calus)etc.
INGINERIE GENETIC
VEGETAL
CapIElementedegenetic molecular
I.1 Structuri celulare cu rol genetic.
A.Organizareagenomuluinucleari
extranuclear la eucariotele vegetale
B. Organizarea genomului nucleoidal i
extranucleoidal la bacterii
Deinterespentrugenetic esteireticulul
endoplasmaticrugosiribozomiidatorit
coninutuluinARNiroluluiacestora n sinteza
de proteine.
Seconsider c ndeplinescrolgenetic
acele structuri celulare care au
capacitate de autoreproducere n
momentuldiviziuniicelularei
continuitate fizic de la o generaie
la alta de celule.
Structurafizic
Structuramolecular a
cromozomilor
Substanafundamental
Cromatina:
- ADN complexat cu proteine histonice
- Ioni de Mg, Ca
- ARN
- Proteine nonhistonice
Cromatinapoateexistandou st ri
funcionale:eucromatinaiheterocromatina
(constitutiv ifacultativ )
Compactarea cromatinei
ADN dublu-helix
8 proteine histonice
2x(H2A,H2B,H3i
H4)formeaz un
octamer,nf urat
de 1,75 x cu fibra de
ADN
ntre 2 nucleozomi
ADN linker +histona
H1- fibra
nucleozomal
(m rgelepenur)
2. Nucleolii
sesintetizeaz peanumiicromozomi,n
regiuneacaredeineinformaiagenetic
pentru sinteza ARN ribozomal (ARNr) numit
zona organizatorului nucleolar.
Num rulnucleolilorvariaz nfunciede
specie putnd ajunge la 100 n cazul unor
speciidepeti
Genomul mitocondrial: Mitocondria cel mai larg organit celular. Are rol
esenial n producerea de energie.
- proteinecurolfuncionallocali
enzimemitocondrialepentrureplicareaADNpropriuipentrusinteza
speciilorpropriideARNriARNt,
Conine ribozomi proprii la nivelul crora se sintetizeaz proteinele mt
Are capacitatedereplicareautonom . de cretere, de stocare i transmitere a
informaiei genetice specifice, comportndu-se ca nite organite
semiautonome, cu continuitate citologic i genetic.
2. Genomul plastidial
Plastidele sunt organite citoplasmatice proprii
celulelorvegetale,curolesenialnprocesulde
sintez istocareasubstanelororganice.
Plastidele pot fi colorate (cloroplastele,
cromoplastele)iincolore(amiloplastele,
proteoplasteleioleopalstele).
Cloroplastele rolfotosintetizantipropriulaparat
genetic (ADNcl)
Conintoateelementeleunuisistemgeneticavnd
astfel rol ereditar
Importanaeredit ii
extracromozomale
Palade
A.Organizareagenomuluinucleoidali
extranucleoidal la procariote bacterii
Genomul nucleoidal
procariot:
1 cromozom circular
Osingur molecul de
ADN dc 1100m
Pliere (40-50bucle)i
superpliere(r suciri
secundare, cte
400/bucl );
ARN linker
Absente histonele, ns
sunt prezente alte
proteinecareseasociaz
la ADN bacterian
denumite histone-like
Organizarea genomului
extranucleoidal al bacteriilor
Plasmidele bacteriene
molecule mici de ADN dublu catenar, circular nchis,
In IG plasmidele recombinate genetic pot fi introduse n
celulele bacteriene determinnd transformareagenetic
Printratarecuclorur decalciu,octermicsauprin
electroporare, bacteriile de tipul E. coli devin permeabile
pentru ADN.
Plasmidele au capacitatedereplicareautonom , fiind
prezente la majoritatea speciilor, dar nu la toate tulpinile
de bacterii.
Plasmidelenusuntcomponenteesenialealebacteriilor,
daracesteapringenelecareledein,confer avantaje
selective celulelorpurt toare.
Tipuri de plasmide
bacteriene
Clasificareaplasmidelordup genelece
ledeinifunciilendeplinitencelule:
Ribozomii la procariote
INGINERIE GENETIC
VEGETAL
ACIZII NUCLEICI ADN iARN
Aciziinucleici:ADNiARN
ADN
Compoziia chimic i
structura acizilor nucleici
ADN(aciduldezoxiribonucleic)iARN(acidul
ribonucleic) sunt acizii nucleici n care
informa iagenetic estecodificat subform
de codoni.
Ambele sunt molecule polinucleotidice
rezultate prin polimerizarea monomerilor
(nucleotidele)prinintermediulleg turilor
fosfodiester.
Ocaten polinucleotidic estealc tuit din
unit imaisimplenumitenucleotide.
Nucleotidele preiau denumirea acizilor
nucleicincompozi iac roraintr
Nucleotida-monomerul acizilor
nucleici
Nucleotidele(monomerii)dincompozi ia
ADN se numesc dezoxiribonucleotide iar
cele din ARN ribonucleotide.
Fiecarenucleotid const dintr-o
pentoz (zahar),obaz azotat io
grupare fosfat.
(1) Pentoza
(2)Bazaazotat
Leg turilentre
acestea sunt
covalenteise
realizeaz ntre
carbonul C1 din
pentoz iazotul N9
dintr-opurin sau
N1 dintr-o
pirimidin .
Radicalul fosforic +
nucleosid Nucleotida
Prin intermediul
radicalului fosforic are
loc polimerizarea ADN.
Leg turilesestabilesc
ntre carbonii 3 i5 din
pentoze.
Compozi iaacizilornucleici
Structura primar a ADN istructura
ARNestemonocatenar
Notarea
monocatenei prin
niruirea
abrevierilor bazelor
azotateiadirec iei
catenei :
Catena3-5estecatena
ascendent iarcealalt ,
cudirec ia5-3este
descendent .
La eucariote n procesul
dereplicarecatena3-5
senumeteprogresiv (i
conduc toarela
procariote) deoarece
sinteza ei se face continuu
iarcatena5-3este
denumit retrograd (i
decalat laprocariote)
deoarece sinteza ei se
face discontinuu, pe
fragmente scurte Okazaki.
Func iileADN
1.func iaautocatalitic prin care are loc replicarea ADN
ntimpulfazeisinteticeSdininterfaz .Cantitateade
materialgeneticsedubleaz ninterfaz cndareloc
replicareasemiconservativ aADNiarnum rulde
cromozomisedubleaz nmetafazamitozeicndare
loc duplicarea cromozomilor.
subform decodonilanivelADNestetranscris n
ARNmitradus lanivelulribozomilorntr-o protein .
LaARNnusemairespect regulilelui
Cargaff deoarece ARN-ul este monocatenar
DeitoatetipuriledeARNdincelul sunt
monocatenareuneleprezint numeroase
por iunifalsbicatenarerealizatenurma
unor plieri ale catenei cnd apar regiuni
complementare ntre care se stabilesc
leg turidehidrogen.
Aceast conforma ielaARNestedenumit
structurasecundar .
LaprocarioteARNmcon ineinforma ia
copiat depeungrupdegeneadiacente
(operon) ARNm policistronic. Cu
excep iaregiunilorreglatoarealegenei
laprocariote,ARNmcon inecopiatedoar
unit iinforma ionale.
Duratadevia aARNmesterelativscurt
fiinddegradatdup sintezaproteinei
ntimpcelaprocarioteexist osingur ARN
polimeraz caresintetizeaz ARNmla
eucariotesintezaserealizeaz cuajutorulARN
polimerazei II.
Mecanismul
interferenei
siARN i
miARN
Aplica iipracticealeARNi
Iningineriagenetic ARNiesteutilizat n
strategia antisens
- Presupuneintroducereanceluledesecven e
scurte de ARN antisens 3-5(miARN, siARN)
complementare unei molecule sens 5-3de
ARNm.Acesteapotficomplementarefiecap tului
5fiecap tului 3alARNm iaucaefect
inactivareasauscoatereadinfunc ieaARNm
- Aplica iilaplante:creterearezisten eilavirusuri,
fortificareaplantelorprincretereasintezeide
antioxidan i,producereadetomaterezistentela
nmuiere, flori variabil colorate la petunii etc
INGINERIE GENETIC
VEGETAL
CapIElementedegenetic molecular
II Structura iexpresiagenelor la
procariote i la eucariote
Structuraiexpresiagenelorla
procariote
Modelulfuncionalalgenelorlaprocariote
cuprindeattgenelestructurale,cti
secvenelecuroldereglaj:promotorul,
Terminatorul
Sfritulmesajuluigeneticestemarcat
de unul din cei trei codoni STOP iar
eliberarea ARN polimerazei de pe
matriaADNeste marcata dec tre
terminator
Operonul
La bacterii, un grup
de gene adiacente,
asociate cu regiunile
cu rol de reglaj, se
transcriumpreun
iformeaz un
operon.
Operonul lactozei
Transcripiaitranslaia
(expresia genelor) la bacterii
Laprocariotetranscripia(ADN-ARNm)i
translaia(ARNm- proteine) nu sunt separate n
timpispaiudeoarecenuexist membran
nuclear ,spredeosebiredeeucarioteunde
prelucrareainformaieigeneticencepennucleu
isetermin ncitoplasm .
Genele de la procariote nu sunt divizate n exoni
iintroni.
LanivelulARNmdelaprocarioteseg sescmai
multe situsuri de legare la ribozomi, astfel nct
sepotsintetizadirectdepeomolecul deARNm
mai multe proteine ARNm policistronic.
Translaiancepelanivelulsitusuluidelegarela
ribozom,reprezentatnARNdesecvenaShineDalgarno(SD)adiacent codonuluiAUG,
secven denucleotidecomplementare
cap tului3alARNr
STRUCTURA GENELOR LA
EUCARIOTE I ELEMENTELE DE
REGLAJ
Laeucariotegenele(carecodific
proteine) sunt formate din:
segmentul structural (START---STOP)isecvenele cu rol de
reglaj situatenainteidup gena
structural (promotor,secvenede
conducere, trailer).
Structura genei este discontinu :
Discontinuitatea genelor de la
eucarioteconst nalternarea
segmentelorinformaionaledenumite
exoni, cecodific aminoacizi,cu
segmentedeADNnoninformaionale
denumite introni icarenucodific
aminoacizi,
Promotorul eucariot
-30iesteprecedat dealtedou
secvenelocalizatecu-75pb(CAT)i
respectiv -90pb anterior nceputului
transcripiei(ARNm).
Rolul promotorului este de a semnaliza
ARN polimerazei II loculundes
nceap transcripia.
La eucariote exist mai multe ARN
polimeraza ns ptr transcripiagenelor
structuraleesteutilizat ARN
polimeraza II.
SintezaARNr18S,5,8Si28Seste
realizat deARN polimeraza I iar a
ARNr5SiARNtdec treARN
polimeraza III. Aceste gene se
transcriu dar nu se traduc
ARNmesteprelucratprinadiialacap tul5al
moleculei a unor nucleotide metilate: 5
metilguanozin nprimaetap cuajutorulenzimei
guaniltransferazainfinal
7-metilguanozin, cu enzima
guanilmetiltransferaza, aranjate ntr-oconformaie
special numit cap.
Lacap tul3arelocsintezauneiformaiuninumit
coad (princopiereainformaieidinsecvenapentru
trailersaucoad ),format dinaproximativ150-200
nucleotidececoninadenin (complexul poli-A)
Eliminareaintronilori
asamblarea exonilor
Dup modificareacapetelorARNm,
denumit precursor, acesta este supus
procesului de (splicing) eliminare n
etape a intronilor ( ARNm
intermediar iapoi ARNm matur)
caretrecencitoplasm laribozomi,
locul sintezei proteice.
ARNmeucariotaretranscris
informaiadepeosingur gen
INGINERIE GENETIC
VEGETAL
CAP.2
MARKERII MOLECULARI
Delageneticaclasic la
geneticamodern
ngeneticaclasic studiultransmiterii
caracterelor,structuragenetic aunei
popula iiistudiulcaracterelor
cantitativepornetedelafenotip.
nacestscopsuntutilizatediferen e
genetice specifice care se transmit la
descenden iipotfiurm riten
descenden .
Suntnnum rnelimitat
Nusuntinfluen a idecondi iiledemediu
Potfieviden ia inoriceetap adezvolt rii
plantei,nusuntlimita idesex
Potfiurm ri indescenden datorit transmiterii
codominanteicuajutorultehnicilormolecularede
laborator
Potfiob inu idincantit iinfimede esutidin
oricare parte a plantei
Potfisitua ilanivelulADNnuclearsau
citoplasmmatic
Markerii ideali:
A) au un polimorfism nalt (mai multe alele la
acelailocus)
B)setransmitcodominantipotfiuorde
urm ritndescenden
C) au reproductibilitate mare
D)neutrifa decondi iiledemediu
E)costuriieftineitehnic minim disponibil
Acestecondi iisuntndeplinitedemarkerii RFLP
iSTR(microsateli i)
Clasificarenfunc iedetehnica
deeviden iereamarkerilor
Tehnica PCR
Etape
complementarecumatri a,imediat
dup secven eleprimeri.Temperatura
optim ptractivitateaTaqpolimerazei
este de 72oC. ADN polimeraza este o
enzim carecatalizeaz sintezanoilor
catenendirec ia5-3
Cele3etapeformeaz unciclucarese
reia de 30-40 ori.
Procesulesteexponen ial,dup 32
cicluriseob in1,7x109 copii ale
fragmentuluiini ial
VizualizareaproduilorPCR
Prinelectroforez ngeldeagaroz
Gelurile deagaroz sunt medii poroase n care
porii au dimensiuni apropiate cu ale
particulelorsupusesepar rii,caracteriznduseprinefectuldesit molecular .
Electroforezangeldeagaroz esteometod
simpl ,rapid isensibil pentrusepararea,
identificareaipurificareafragmentelorde
ADN.
nsolu ietampon,ADNaresarcin
electric negativ decisevandreptaspre
anod.
Geluriledeagaroz au o putere de
rezolu iemaimic dectcelede
poliacrilamid ns au ogam deseparare
multmailarg , fiind utilizate pentru
separarea fragmentelor de ADN cu
m rimedela200pbpn laaproximativ
50 kb, nfunc iedeconcentra iaagarozei.
APARATURA PENTRU
ELECTOFOREZA
Cuva de migrare
Si sursa electrica
camera obscura
unilocus
multilocus
sau genomica (RAPD, AFLP)
Principiul tehnicii
- ADN izolat de la un anumit individ este supus
uneireac iiPCRutilizndun singur primer de
secven arbitrar caresevaataalasecven e
complementaredinmatri aADN,ncazuln
careacesteaexist .
ADNpolimerazaalungeteprimeriicarei-au
g sitsecven acomplementar is-auataatla
matri .Dac dinntmplaredoiprimeri
consecutiviafla invecin tate(deobiceilamai
pu inde3000bp),seataeaz lamatri n
sensuriopuse,fiecarepeunadinceledou
catene, fragmentul delimitat de ele va fi
amplificat.
Aplica iipractice
Studiereavariabilit iigeneticeintrai
interpopula ionalelaplante
Construirea arborilor filogenetici
Avantaje /dezavantaje
CuajutorultehniciiRAPDsestudiaz polimorfismulla
nivelul ntregului genom-AMPRENT GENOMIC
tehnica nunecesit cunotin eanterioaredespre
genomul studiat
- estesimpl ,rapid iieftin
- fiindometod rapid poatefiutilizat ndeterminarea
diversit iigeneticelaplante,animaleiom(ntocmirea
dendrogrameloricalculareadistan elorgenetice);n
descoperirea markerilor sex-linka i,
esteieftin ncompara iecualtetehnici.
MarkeriiRAPDpotfitransforma inmarkerispecifici
SCAR
Marele dezavantaj altehniciiconst nfaptulc tehnica
arereproductibilitatefoartemic , iar markerii nu pot fi
urm ri indescenden .
TehnicaSCARpornetedelabenzilepolimorfice
ob inutenreac iaRAPD(Benzispecificeunui
individ)
Benzileseexcizeaz dingeliseextrageADN-ul
ADN-ulestesecven iat(isedescifreaz secven a
n nucleotide)
Pebazasecven eiseconstruiesc2primerispecifici
delocuscarevorfifolosi ilaamplificareaspecific
PCR a unui locus
Enzimelederestric ie
nurmat ieriiproduc:
capete drepte sau boante (blunt ends).
sau coezive (cohesive/sticky ends)
Pentrupreparareauneimatri eAFLP,ADN
genomicesteizolatidigeratsimultancu2
enzimederestric ieEcoRIiMseI.
Utilizatempreun ,acesteenzimegenereaz
fragmentedem rimi cuprinse ntre 25-1000 pb.
Fragmenteleob inuteprinrestric iepotfi
grupate n 3 clase:
- mareamajoritate(90%)prezint dou situsuri
MseIlaextremit ilelor;
- aprox.10%prezint unsitusEcoRIiunsitus
MseI;
- ctevafragmenteprezint 2situsuriEcoRI.
2. Legarea adaptorilor
3. Designul primerilor
n structura primerilor
PCRvomreg sisecven a
situsului enzimei de
restric ie(opartedin
secven aadaptorilor,o
partedincap tulADN
genomic)+onucleotid
selectiv .Num rul
nucleotidelor selective
poate varia de la 0-3 pe
primer.
4.Reac iadepreamplificare
PCR (a)
Dup digestiaADNgenomicilegarea
adaptorilor, fragmentele de ADN vor fi
amplificate prin PCR
Dac selucreaz cugenoamecomplexe(plante
sauanimale),PCResterealizatndou etape
consecutive.
nprimareac ie,numit preamplificare,ADN
genomic este amplificat cu doi primeri AFLP
ce au cte o singur nucleotid selectiv.
5. Amplificareaselectiv PCR 2
(b)
ProdusulPCRalpreamplific riiestediluati
utilizatcamatri pentruadouaamplificarePCR
numit selectiv .
nadouareac iePCRvomutilizadoiprimeri
AFLP cu trei nucleotide selective.
Num ruldefragmentedetectateintr-o amprent
genetic scadecndnum rulnucleotidelor
selectivecrete
Primerii sunt n prealabil marcati astfelncts
poat fivizualizatefragmenteleamplificate(prin
autoradiografiageluluidepoliacrilamid ).
Aceast strategiedeamplificarendou
etape permite ob inereauneiamprente
genomice foarte clare;
Primerii sunt universali;
Se poate adapta la orice specie;
Seob ineimagineapolimorfismelor
ntregului genom;
Are reproductibilitate foarte mare;
esteutil cuprec derelaplantepentru
determinareaunorsoiuri,variet isau
cultivare
Aplica ii
Studiidediversitategenetic ,m surarea
variabilit iiinter- sauintrapopula ionale,a
distan elorgeneticesaupentrurealizarea
clasific rilorntaxonomie.
Stabilireah r ilorgeneticelaspeciilepu in
cunoscutesauacoloundesondeleimarkerii
PCRnuaufostnc dezvolta i.
Marcarea STR(microsateliii)
STR ShortTandemRepeats/secvene
simplenaltrepetateitandemizate,cu
monomerul format din (1-6pb)n.
Noninformaionale(nusetranscriu/traduc)
Polimorfismuldatdenum rulrepetiiilorn
tandem la nivel alelic
Polimorfism mult mai ridicat dect cel al
minisateli ilor
Utilizare/ amprente genetice n scop de
Profilul electroforetic al
polimorfismelor STR si mostenirea
acestora in descendenta
Avantaje
molecularesteutilizatpentruselec ia
indirect auneigenecaredetermin un
carcater de interes economic (produc ii,
Markeriimolecularistrnslinka icuogen
deinteresagronomicsuntfolosi ica
instrumentemolecularepentruselec ia
asistat demarkerinameliorarea
plantelor.
Dup stabilireatransmiteriinl n uitea
markerului cu gena de interes nu mai este
necesarurm rireacaracteruluicidoara
markerului.Pentruaceastadistan adintre
markerigenadeinterestrebuies fie
maimic , de 5cM, pentrucamarkeruls
poat fiutilizatnselec ieadic s se
transmit completnl n uitcugena
Markeriiidealiautransmiterecodominant ,sunt
insensisbililamediuirelev unpolimorfism
foarteridicat.Acestecondi iisuntndeplinitede
markeriiRFLPimicrosateli i
definitie
Prin tehnologia ADN recombinat se transfer
ogen provenit delaospeciedonor
denumit PASAGER (I) ntr-ocelul
receptoaredenumit GAZD (III). Pentru a
fiprotejat deaciuneaenzimelorcelulei
gazd , genapasageresteinclus ntr-un
vector sau VEHICUL (II). Gena pasager
mpreun cuvectorulformeaz omolecul
de ADN recombinat.
Transformareagenetic la
procariote
Transformareagenetic esteunprocesdemodificareauneiceluleprinncorporarea de
materialgeneticstr in(ADN)carep trundenceluleprinmembranacelular .Starea
celuleincareaceastapoateacceptamaterialgeneticstr insenumetestarede
competen .
Procesul poate avea loc natural la unele specii bacteriene (Streptococcus pneunomie)
ns laaltespecii_E.coli procesul de transformare poate fi indus prin diferite
metode:
- Tratarea bacteriilor cu CaCl2
- Electroporare
- oc termic de scurt durat (42oC), procese prin care membrana bacteriei devine
permeabil pentrumoleculestr inedeADN
nurmatransferuluidegeneseobinmicroorganisme recombinate genetic (MOMG).
Acesteasemultiplic ninteriorulceluleiodat cumaterialulgeneticalgazdeiproces
denumit clonaremolecular .
Clonarea genelor pasager n celule procariote se face n scopul:
- Producerii de biomolecule de interes economic, farmaceutic, sau pentru
bioremediereahabitatelorpoluate,etcaceast tehnologiefiindbazabiotehnologiilor
moderne.
- Multiplic riisauclon riigenelor nvedereaalc tuiriih rilorfizicesauacelorde
restricie.
Schemageneral derealizare
nscopulclon riigenelornbacteriisuntnecesare
3elementeiseparcurgmaimulteetape:
Elementele tehnologiei ADN recombinat (clonarea
molecular agenelor)
- PASAGER
- VECTOR
- GAZD
n procesul de clonare intervin mai multe enzime:
- Enzimelederestricie
- Ligazele
- Terminal transferazele
- ADN polimerazele
- Reverstranscriptazele
Etape:
1. Obinerea vectorului
2. Izolarea pasagerului
3. Integrarea pasagerului n vector i formarea ADN
recombinat
4. Introducerea ADN recombinat n celula gazd
5. Selecia celulelor care poart ADN recombinat
6. Clonarea propriu-zis a genei
7 Detecia genei clonate sau a produsului de sintez
1. Izolarea vectorului
Exemple de vectori
Dup m rimeainsertuluipecarelpotprimi
vectorii sunt de mai multe tipuri:
Vectorul de clonare
Mrimea insertului
Vectori plasmidiali standard
10 kb
Vectori derivai din bacteriofagul
23 kb
Vectori hibrizi cosmide
44 kb
Vectorii BAC
Mai mult de 300 kb
(cromozom artificial bacterian)
Vectorii YAC
2.0 Mb
(cromozom artificial de drojdie)
Markerii de selecie
Situsuri de restricie
EcoRI
pBR
Multiple - n markeri i
nafara lor.
La clonare se utilizeaz
situsul unic EcoRI ntre
cele 2 gene
pUC
pGE
M-T
easy
ele ia lo elor re o
plajelor de liz
i ate se fa e la ivelul
Vectori de i serie
derivai di fagul
Tot din genomul fagului a fost o struit o alt ategorie de
ve tori pe tru lo area i expresia u or ge e de di e siu i
mici (6kb de u ii vectori de inserie. Di a east ategorie
fa parte fagii gt.
Fagul gt derivat din genomul bacteriofagului sl ati , este
un alt tip de fag care poate deter i a tra sdu ia
ge eralizat (gt-generalized transduction), iar fagul gt WES
are a eeai origi e u a fagului gt, s ge o ul su au
fost i troduse utaiile amber (codonul stop UAG),
mpiedicndu-i astfel s supravieuias afara o diiilor de
laborator.
o se i , a eti ve tori pot fi propagai o ve io al pri
ultur liti sau lizoge i u ai pe gazda a teria de
laborator, avnd situsuri numai pentru enzima EcoRI. Sele ia
lo elor re o i ate se fa e la ivelul plajelor de liz
Clonarea n cosmide
Vectorii de expresie
Suntocategoriefuncional devectoricareau
fostconstruiipentruaplicaiipracticen
biotehnologii.Spredeosebiredeceilalisunt
dotaicupromotori puternici (intensificatori) care
permitotranscripieintens iexpresiagenei
pasager.
Pentrucagenapasagers seexprimencelula
gazd eatrebuieplasat subcontrolulunui
promotordenatur procariot inpoziie
corect fa deelmenteledereglaj
Promotor-Operator-Loc de legare la ribozomgenastructural _terminator
2. PASAGERUL
Gena pasager n clonarea molecular n
gazde bacterii este orice gen de interes
care se dorete s fie tranferat n
bacterii n scopul
- multiplicrii genei
- expresiei genei
-studierii funciilor genei prin metodele
mutagenezei
RT PCR
3. Si teza hi i a ge ei pasager
Ge a are ur eaz s fie lo at tr-un
ve tor poate fi si tetizat artifi ial por i d de
la structura ei n nucleotide.
Deoarece sintetizatoarele de gene produc
se ve e oligo u leotidi e de ir a 8-12
nucleotide, asamblarea acestora se face
enzimatic cu ajutorul ADN ligazei.
Gazdele (3)
Pentru a putea fi utilizate ca i gazde n tehnologia ADN
recombinat anumite specii bacteriene au fost modificate
genetic in vitro pentru a rspunde cerinelor de evitare a
biohazardului.
n acest scop au fost acceptate ca s fie utilizate ca i
gazde
(1) tulpina K12 a bacteriei E.coli care nu poate coloniza
intestinul animalelor cu snge cald (LPZ-)
(2) tulpinii EcoliK12 i s-au indus anumite mutaii care i
permit supravieuirea doar n condiii de laborator (gazde
EK1, EK2). Alte bacterii acceptate a fi gazde in
tehnologia ADN recombinat sunt Bacilus subtillis
- -gal-pe tru s ree i gul olo iilor tra sfor ate dup
uloare al /al astru e a ept ve toriii di seria pUC de
exe plu, tulpi a DH5 .
Electroporarea
Suspe sia elular este plasat preu u
molecula de ADN recombinat n cuvete de
uar are su t i troduse ele troporator
dup e au fost setai para etrii aparatului.
Ur eaz i du erea o urilor de s urt durat
p la ptru derea ADN elule. Dup
electroporare suspensiile celulare sunt trecute
pe edii de ultur u de ADN re o i at se
va ultipli a preu u gazda.
Echipamente/schema de realizare
Definiie
Transferul de gene n celule gazd eucariote
vegetale duce la obinerea de Organisme
Modificate Genetic (OMG) sau plante
transgenice.
Transferul de gene se poate realiza n
scopul adugrii unei gene, nlocuirii unei
gene sau inactivrii unei gene din genom.
Este un proces integrativ.
Gena pasager
este o gen strin genomului celulei
gazd a crei izolare se realizeaz similar
cu cea pentru tranfer n celule bacteriene
(izolare dintr-un alt genom cu enzime de
restricie, producerea genei prin
reverstranscripie, sau sinteza chimic a
genei pasager)
Plasmidele native Ti de la A.
tumefaciens
Producerea plasmidelor Ti
recombinate- vectorii binari
Pe tru tra sfor are se utilizeaz vectori binari de tip avet are ge ele vir sunt
situate pe o plas id A.tumefaciens) iar constructul genic cu gena pasager purtat de
gena ADN-T pe alt plas id E.coli).
Procesul presupune o hi ridare tripare tal: tre E. oli are o i e ge a pasager
interiorul regiunii ADN-T, o bacterie A.tumefaciens (gazda final, are o i e pe o
plas id dezar at ge ele vir i o a terie helper E. oli are i iiaz o jugarea
tre pri ele dou.
Etape:
A) Producerea plas idei re o i ate are poart ge a pasager: gena pasager se
i trodu e i teriorul se ve ei ADN-T de la are se pstreaz doar apetele att L i R
order i se adaug arkerii de sele ie. A easta este i trodus tr-un plasmid al
bacteriei E.coli i lo at n bacteria E.coli (I).
O alt plas id este e hipat u regiunea vir s este dezar at. A easta este
tra sferat A. tumefaciens. Astfel ele dou regiu i vir i ADN-T sunt pe plasmide
diferite i gazde diferite. Tra sferul plas idului re o i at di E.coli gazda fi al
Agrobacterium tumefaciens se realizeaz adrul u ui pro es de o jugare
a teria .
Pe tru i iierea pro esului de o jugare se utilizeaz al treilea pri te o bacterie
E.coli helper are poart se ve a operon tra respo sa il u o jugarea di tre E. oli i
A.tumefaciens.
Introducerea plasmidului recombinat n A.tumefaciens poate avea loc i dire t pri
electroporare.
Alte realizri
De la ghiocel (Galantus nivalis) a fost transferat gena
gna ce codific lectinele glicoproteine cu rol nociv
asupra insectelor la orez i la porumb (la noi n ar la
salat) dar care nu sunt duntoare ptr om i animale
Genele ce codific proteinele PIP (Protease inhibiting
polipeptides) i AIP (amilase Inhibiting proteins) de la
Vigna unguiculata care inhib proteazele i amilazele
insectelor duntoare care nu mai pot asimila
proteine/amidon i mor prin inaniie. Acestea sunt ns
toxice ptr om i animale iar ptr obinerea de plante
furajere netoxice gena a fost transferat sub controlul
promotorului tob care se exprim numai n rdcin
(lucern transgenic rezistent la nematoul Globera
pallida)
IV Ameliorarea rezistenei la
erbicide neselective
Erbicidele neselective (totale) distrug att
buruienile ct i plantele de cultur.
Spre deosebire de cele selective au
avantajul c sunt biodegradabile.
Prin transferul unor gene de la unele bacterii
(care asigur rezistena la aceste erbicide) la
plante au fost obinute plante rezistente la
erbicide selective dar biodegradabile
Mecanismul de aciune:
a) Supraproducia enzimei int afectat
de erbicid
b) Supraproducia enzimei ce degradeaz
produii secundari toxici
c) Detoxifierea organismului plantei
Realizri.
Rezistena la Glyphosate (erbicidul
Roundup) prin transferul unei gene de la
bacteria Salmonella typhimurium
responsabil de supraproducia enzimei
int.
La soia s-au obinut plante transgenice
rezistente la erbicidul Roundup Ready, prin
supraproducia enzimei, gena find preluat
de la Agrobacterium tumefaciens.
V. Ameliorarea calitii
Ameliorarea compoziiei n compui
vizeaz (1) mbogirea compoziiei n
aminoacizi eseniali (lizin, triptofan etc,) i
aminoacizi cu sulf (cistein, cistamin) n care
unele plante utilizate ca furaje sunt srace
Realizri exemple: transferul unei gene de la
nuca brazilian (Bertholletia excelsa) care
produce o protein foarte bogat n AA cu S la
plante de cultur
Realizri
Alte strategii ptr obinerea de vaccinuri orale - deoarece anticorpii sunt structuri proteice care conin 4
lanuri (2 grele i 2 usoare) asamblarea lor are loc natural n
reticolul endoplasmatic al celulei animale dar i vegetale. Unii
cercettori propun ca strategii:
- dubla transformare a plantelor cu genele ce codific cele
dou lanuri urmnd apoi hibridarea plantelor ptr ca cele dou
secvene s ajung mpreun. Astfel s-au obinut plante de
tutun care produc anticorpi mpotriva bacteriei Streptococcus
mutans
Alte realizri - n seminele de la mazrea furajer s-a reuit
exprimarea genelor ptr producia de anticorpi BA11 - anti
tuplina enterotoxic a E.coli care este folosit n alimentaia
porcinelor pentru protecia tubului digestiv mpotriva infeciei
iar anticorpul nu a fost detectat n snge sau n organele
animalului
Clasa
I ducia
CaroRx
Anticorp
Lipaza gastri
E zi terapeuti
Fi roza isti ,
Pa reatit
porumb transgenic
Antigenul virusului
hepatitei B
Vaccin
Hepatita B
Lactoferina
alimentar
I fe ii
gastrintestinale
porumb transgenic
Capsida virusului
Norwalk ()
Vaccin
Glicoproteina de la
virusul rabiei
Vaccin
turbare
Cultura
i artof
Spanac transgenic
as ule
D) utilizarea androsterilitii
Androsterilitatea poate fi:
Nuclear deter i at de ge e u leare re esive. Pla tele
fertile tre uie ar ate ge eti do i a t ptr a fi eli i ate di ir.
U astfel de arker exist la floarea soarelui are deter i
apariia ulorii roii a pla telor si teza de a to ia i li kat u
ge a de fertilitate . Astfel de pe r durile a se eli i toate
pla tele roii fertile.
Citoplas atic- deter i at de ge e ito o driale are se
tra s it do i a t, pe li ie ater . Pri pole izarea u or pla te
a a drosterile u pole de la pla te tat a drofertile F
ge eraia F1 rezult u ai pla te a drosterile S , suire
tra s is pri itoplas a ga etului fe el.Se utilizeaz la pla te
la are i tereseaz asa vegetativ i u produ ia de se i e
aa u este eapa.
Ma ipularea sterilitii
as ule IGV
Dou strategii:
I. Se poate realiza pri tra sferul ge ei e odifi
enzima Barnase de la Bacillus ampholiquefaciens la
li ia ater apa il s distrug ARN-ul elular i s
o oare elula. Ge a se expri doar esutul
ge erator de pole i astfel se o i pla te a e
nu pot produce polen androsterile
For a tat este de ase e ea tra sfor at u o ge
Barstar are i hi e zi a Bar ase o i du-se
pla te tat fertile
CAP.IV
HIBRIDAREA ICIBRIDAREA
CELULAR
HIBRIDAREA CELULAR
HIBRIDAREA elular so ati sau parasexuat
o st fuziu ea a dou elule so ati e, diferite
geneti , ur a reia rezult u hi rid so ati e
u uleaz aterialul ge eti de la ele dou for e
parentale
Etape:
1. o i erea protoplastelor
2. fuziunea protoplastelor
3. izolarea celulelor hibride
4. regenerarea plantelor hibride
5. confirmarea naturii hibride
1. IZOLAREA PROTOPLASTELOR
Se realizeaz prin digestia peretelui celular cu celulaz i pectinaz
n condiii de plasmoliz uoar -cu manitol sau sorbitol
Cultivarea protoplastelor pe mediu MS (Murashige-Skoog), la care se
adaug diferii compui ca surse de carbon (glucoz, zaharoz,
maltoz), auxine, citochinine, etc., antibiotice etc.
2. FUZIUNEA PROTOPLASTELOR- se poate realiza natural sau indus
pe cale fizic sau chimic
n mod natural in timpul izolrii protoplastelor acestea pot s fuzioneze
spontan rezultnd homocarioni (celule hibride care nglobeaz
materialul genetic de la dou sau mai multe celule de acelai fel)
Pentru obinerea de heterocarioni se utilizeaz metode de inducere:
a) Inducerea fuziunii chimic
cu PEG (polietilenglicol)
- Concentraii ridicate de ioni de calciu la 37oC, 30-40 minute
b) inducerea fuziunii celulelor somatice fizic prin electrofuziune sub
aciunea unui curent continuu, pulsatoriu de mare intensitate (100kVm1). Aceasta este i cea mai eficient metod de obinere a
heterocarionilor
b)pebazacomplementarit iimetabolicesau
genetice
Complementaritateametabolic - presupune
ncazulcomplementarit iigenetice- se
utilizeaz markerigeneticicomplementariiunanumit
mediudeselecie.
Unastfeldeexempluestecumarkeriiderezisten la
antimetaboliii- 5MT(metiltriptofan)iAEC(amino-etilcisteina).Unadinformeleparentaleeste5MT(R)iAEC(S)iar
cealalt 5MT(S)iAEC(R)iarnmediulcuceidoi
antimetaboliisupravieuiescnumaicelulelehibride.
Importanahibrid riicelulare
Esteimportant pentruobinereadehibrizi
ntrespeciindep rtatesauchiargenuri
ndep rtate,nenrudite,carenupotfi
obinuipecalesexuat .
Exemple- hibrizi ntre Nicotiana tabacum i
N. rustica. Acetia se pot nmuli doar
vegetativ, sunt sterili
Hibrizii asimetrici importani deoarece n
genomul lor se pot introduce gene de
rezisten de la specii slbatice
Cap. V
HAPLOIDIA PRIN ANDROGENE) I
GINOGENE)
mutageneza in vitro.
Muta iile
Mutageneza in vitro
A. Metodele mutagenezei
ntmpltoare
greit a nucleotidelor
B. Mutageneza dirijat
Mutageneza dirijat permite introducerea unei muta ii ntr-o
pozi ie dorit, la nivelul unei gene. Aceasta se poate realiza
prin dou metode:
Muta ia dirijat
prin utilizarea
oligonucleotidelor