Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
DE GENETIC MOLECULAR
I INGINERIE GENETIC
ENGLEZ ROMN
Aurel Popescu
DICIONAR
DE GENETIC MOLECULAR
I INGINERIE GENETIC
ENGLEZ - ROMN
AcademicPres
2012
4
A
(alfa) Simbol pentru prima liter a alfabetului grec
AAA Codon n structura ADN sau ARNm, ce codific aminoacidul lizin
(Lys).
AAC Codon n structura ADN sau ARNm, ce codific aminoacidul
asparagin (Asn).
AAG Codon n structura ADN sau ARNm, ce codific aminoacidul lizin
(Lys).
AAT Codon n structura ADN sau ARNm, ce codific aminoacidul
asparagin (Asn).
AAU Codon n structura ADN sau ARNm, ce codific aminoacidul
asparagin (Asn).
AAV Abreviere pentru adeno-associated virus. Vezi adeno-associated
virus.
Ab Abreviere pentru antibody. Vezi antibody.
ABC Acronim pentru Association of Biotechnology Companies. Vezi
Association of Biotechnology Companies.
aberrant recombination (recombinare aberant)
Sin. illegitimate
recombination, non-homologous recombination, non-homologous end
joining. Vezi illegitimate recombination.
aberrant RNA (abRNA) (ARN aberant) O molecul ipotetic de ARN,
produs direct dintr-o transgen, dublu catenar (aberant), servind ca
matri pentru sinteza unor molecule scurte de ARN complementar (cRNA)
de ctre ARN-polimeraze celulare ARN-dependente (RdRPs). Aceste ARNc
(cRNA) se pot mperechea cu moleculele de ARNm formate ca produi de
transcripie ai transgenei, formnd molecule de ARNs dublu-catenare. Vezi
de asemenea ribonucleic acid.
abortive transduction (transducie abortiv) ADN bacterian este injectat
de ctre un fag ntr-o bacterie, dar este incapabil s se replice.
abortive transformation (transformare abortiv) Procesul de transformare
instabil, temporar, a unei celule de ctre un virus care nu reuete s se
integreze n genomul celulei gazd. Dup cteva generaii celulele
transformate revin la normal.
abRNA Abreviere pentru aberrant RNA. Vezi aberrant RNA.
5
amplified antisense RNA (ARN antisens amplificat) Sin. copy RNA. Vezi
copy RNA.
amplified fragment length polymorphism (AFLP) (polimorfismul
lungimii fragmentelor amplificate) Tip de marker ADN, generat prin
digestia ADN genomic cu dou enzime de restricie pentru a crea multe
fragmente de ADN, legarea unor secvene specifice de ADN (denumite
adaptori) de capetele acestor fragmente, amplificarea fragmentelor via PCR
(folosind un set de primeri cu secvene corespondente adaptorilor, plus
combinaii diferite i ntmpltoare de trei baze adiionale la capt) i
vizualizarea fragmentelor prin electroforez n gel de agaroz. PCR va
amplifica orice fragment a crui secven ncepe ntmpltor cu oricare din
secvenele de trei baze din setul de primeri. AFLP are avantajul important
de a genera muli markeri cu efort relativ mic. Acetia reprezint
instrumente foarte utile pentru cuantificarea nivelului (extinderii) variaiei
genetice n cadrul unei populaii i interpopulaional. Dezavantajul lor major
este acela c nu sunt specifici unui locus particular i, deoarece ei sunt
investigai pentru prezena sau absena unei benzi, heterozigoii nu pot fi
deosebii de homozigoi (consecin a dominanei).
amplify (verb: a amplifica) A crete numrul de copii ale unei secvene de
ADN, fie in vivo prin inseria ntr-un vector de clonare care se replic ntr-o
celul gazd, fie in vitro prin reacia de polimerizare n lan (polymerase
chain reaction, PCR).
amplifying plasmid (plasmid amplificabil) O plasmid care continu s
se replice dup ce multiplicarea celulei gazd este blocat. Vezi de asemenea
plasmid.
amplimer (amplimer) Vezi primer, amplicon.
AmpliTaq DNA polymerase (ADN polimeraza AmpliTaq) O protein
(enzim) recombinant produs n E. coli, folosit n reacia de polimerizare
n lan (PCR). Aceast protein de 94 kDa cu activitate de polimerizare
53 are eficien maxim la temperaturi de 70-80C i este incredibil de
termostabil, durata de njumtire a activitii la 95C fiind de 35-40
minute. In termenii termociclrii, durata de njumtire a activitii este de
circa 100 cicluri. Produii PCR rezultai din reaciile de polimerizare
utiliznd aceast enzim au o extensie (overhang) de o baz la capetele 3
ale fiecrei catene polimerizate (un avantaj exploatat n lucrrile de clonare).
amylase inhibitors (inhibitori amilazici) Compui ce se leag chimic la o
amilaz (o enzim produs n cadrul sistemului digestiv al anumitor insecte
20
i de o transforma ntr-una nevtmtoare. Molecula de baz a unei imunoglobuline const n dou lanuri identice grele i dou lanuri identice
uoare. Vezi de asemenea monoclonal antibodies, polyclonal antibodies.
antibody-directed enzyme pro-drug therapy (ADEPT) (terapia cu promedicamente direcionate de complexe enzim-anticorp) O cale de a
direciona un medicament ntr-un anumit esut. Medicamentul este
administrat ca un pro-medicament inactiv i convertit apoi ntr-un
medicament activ cu ajutorul unei enzime administrate printr-o a doua
injecie. Enzima se cupleaz cu un anticorp ce se concentreaz n esutul
vizat. Cnd enzima ajunge n esutul int, are loc activarea promedicamentului i formarea medicamentului activ, n timp ce oriunde n alt
parte el rmne inactiv. In prezent, ADEPT este folosit ca un nou tip de
tratament mpotriva cancerului numai n ncercrile clinice. Vezi de
asemenea drug delivery, targeted drug delivery.
anticipation (anticipare) Procesul prin care, datorit creterii numrului de
repetiii (cel mai adesea) trinucleotidice, unele boli genetice devin tot mai
severe i se manifest tot mai devreme n generaiile succesive.
anticoding strand (catena anticodant) Catena unui dublu helix de ADN
care este n fapt transcris. Este cunoscut de asemenea sub denumirea de
catena antisens sau catena matri.
anticodon (anticodon) O triplet de nucleotide dintr-o molecul de ARNt
care se mperecheaz cu o triplet complementar de nucleotide, sau codon,
dintr-o molecul de ARNm n cursul translaiei (traducerii informaiei
genetice). Vezi codon, mRNA, RNA, tRNA.
anticodon deaminase (anticodon deaminaza) Enzima care, prin convertirea
gruprii 6-amino ntr-o grupare ceto, este implicat n procesul de formare a
inozinei din adenozin (post-transcripional, dac adenozina apare n acea
poziie). Prezena inozinei (nucleozid modificat) n poziia 5 a
anticodonului este responsabil de capacitatea lui de a interaciona cu mai
mult de un singur codon. Vezi de asemenea codon.
antifreeze proteins (AFPs) (proteine antinghe; proteine anticongelare)
O clas de proteine/ glicoproteine (prezente la unele organisme) care inhib
formarea cristalelor de ghea n interiorul celulelor organismelor respective
atunci cnd sunt expuse temperaturilor sub 0C. De exemplu, anumite
molecule de glucanaz produse de secar (Secale cereale) sunt implicate n
mecanismul de rezisten la ger, inhibnd formarea cristalelor de ghea i
implicit nghearea celulelor la aceast specie. In condiiile n care
24
aroA (*) Se refer la transgena (caseta), izolat iniial din genomul speciei
Agrobacterium tumefaciens (tulpina CP4), care a fost introdus prin
tehnicile de inginerie genetic n plante (de exemplu, n soia), cu scopul de a
face plantele tolerante la erbicidele pe baz de glifosat.
artificial gene synthesis (sinteza artificial de gene) O metod utilizat
pentru crearea de gene artificiale n laborator, bazat pe sinteza de ADN n
faz solid. Aceast metod difer de clonarea molecular i de reacia de
polimerizare n lan (PCR) prin aceea c nu trebuie s nceap cu secvene
de ADN preexistente. Astfel, este posibil producerea de molecule dublucatenare de ADN complet sintetice, aparent fr limite sub aspectul
secvenei de nucleotide sau mrimii. Metoda este folosit n mod curent
pentru a genera cromozomi bacterieni funcionali coninnd aproximativ un
milion de perechi de baze. Sinteza primei gene a fost realizat de Khorana i
colaboratorii si n anul 1972. In prezent, sinteza de novo de gene, fr
utilizarea de matrie de ADN precursor, este realizat n scop comercial de
numeroase companii din ntreaga lume, printr-o combinaie de tehnici de
chimie organic i biologie molecular. Sinteza de gene a devenit un
instrument important n multe domenii ale tehnologiei ADN recombinat,
incluznd exprimarea genelor heterologe, crearea de vaccinuri, terapia
genic i ingineria molecular. Vezi de asemenea (compar cu) molecular
cloning, polymerase chain reaction.
ASA Abreviere pentru allele-specific amplification. Vezi allele-specific
amplification.
A-site Abreviere pentru aminoacyl site. Vezi aminoacyl site.
AS-PCR Abreviere pentru allele-specific PCR. Vezi allele-specific PCR.
assay (test, evaluare) 1. A testa sau evalua; 2. Procedeul de msurare a
cantitii unei substane date ntr-o prob (pe cale chimic sau pe alte ci); 3.
Substana ce trebuie analizat.
assembly PCR (PCR de asamblare) Sinteza artificial de secvene lungi de
ADN prin realizarea PCR la o mas de oligonucleotide lungi cu scurte
segmente (secvene de nucleotide) suprapuse. Oligonuceotidele alterneaz
ntre direciile sens i antisens, i segmentele suprapuse determin ordinea
fragmentelor PCR, producnd astfel n mod selectiv produsul ADN lung
final. Vezi de asemenea polymerase chain reaction.
Association of Biotechnology Companies (ABC) (Asociaia Companiilor
de Biotehnologie) O asociaie a companiilor americane implicate n
biotehnologie i servicii pentru companiile de biotehnologie (de exemplu,
30
33
B
(beta) Simbol pentru a doua liter a alfabetului grec.
BAC Abreviere pentru bacterial artificial chromosome. Vezi bacterial
artificial chromosome.
BAC Acronim pentru Biotechnology Action Council. Vezi Biotechnology
Action Council.
BAC array (matrice de cromozomi bacterieni artificiali, array de
cromozomi bacterieni artificiali) Vezi BAC DNA microarray.
BAC clone array (matrice de clone ale cromozomilor bacterieni artificiali,
array de clone ale cromozomilor bacterieni artificiali) Vezi BAC DNA
microarray.
BAC DNA microarray (matrice ADN a cromozomilor bacterieni artificiali,
microarray ADN al cromozomilor bacterieni artificiali) Aranjament
ordonat al clonelor diferiilor cromozomi bacterieni artificiali (BAC),
imobilizate pe suporturi de dimensiuni minuscule (de exemplu membrane de
nylon, cip-uri de silicon, sticl sau quartz). Fiecare colonie adpostete
fragmente de ADN de 100-150 kb. Astfel de microarray-uri sunt utilizate
pentru izolarea de ADN genomic ce conine o gen sau genele de interes,
detectate prin hibridizarea probelor genice marcate radioactiv sau
fluorescent la nivelul micromatricei (microarray-ului). Micromatricele
(microarray-urile) de acest fel pot s conin clone ce reprezint ntregul
genom al unui organism, sau ale fiecruia din cromozomii si, pentru
hibridizarea genomic comparativ.
bacillus (bacil) O bacterie din genul Bacillus, a crei lungime depete de
dou sau mai multe ori limea, adesea cu form de cilindru cu capetele
rotunjite (bastona). La unii bacili, extremitile pot fi tiate drept sau
fusiforme.
Bacillus (*) Un gen de bacterii Gram-pozitive, din care fac parte specii
obligat aerobe sau facultativ anaerobe. Unele specii triesc liber n natur,
iar altele sunt patogene. In condiii de mediu nefavorabil (stres) aceste
bacterii produc endospori ovali ce pot sta n stare dormind perioade foarte
lungi de timp. Multe specii de Bacillus sunt capabile s secrete cantiti mari
de enzime. Bacillus amyloliquefaciens este sursa unui antibiotic natural, a
proteinei cu activitate enzimatic barnaza (o ribonucleaz), a alfa amilazei
34
afectat de mutaia iniial, dar care compenseaz efectul mutaiei din primul
situs. Vezi de asemenea mutation, forward mutation.
BAC microarray (micromatrice de cromozomi bacterieni artificiali,
microarray de cromozomi bacterieni artificiali) Vezi BAC DNA microarray.
bacteria (bacterii) Pluralul pentru bacterie. Vezi bacterium.
bacterial artificial chromosome (BAC) (cromozom bacterian
artificial) Un vector de clonare construit din factorii bacterieni de fertilitate
(F); ca i vectorii YAC (yeast artificial chromosome), ei accept segmente
de inserie mari, cu mrimea de 200 pn la 500 kb. Cromozomii bacterieni
artificiali sunt vectorii cei mai indicai pentru construirea bibliotecilor de
ADN genomic. Ei s-au dovedit de asemenea adecvai pentru generarea pe
scar larg de hri fizice, clonarea poziional i secvenierea unor
genomuri. In ultimii ani au fost dezvoltate mai multe metode pentru
modificarea ADN din cromozomii bacterieni artificiali (prin inserie, deleie,
substituie), ceea ce i-a fcut i mai utili pentru cercetarea n domeniul
genomicii funcionale. Vezi de asemenea cloning vector, YAC.
bacterial expressed sequence tags (secvene etichet exprimate n bacterii)
Secvene etichet exprimate (EST) bazate pe gene bacteriene secvenate sau
cartate, n locul genelor (EST tradiionale) nematodului Caenorhabditis
elegans. Acestea sunt utilizate pentru etichetarea unei gene date (n ceea
ce privete funcia acelei gene sau proteina codificat). Vezi de asemenea
expressed sequence tags (EST), sequencing (of DNA molecules), sequence
(of a DNA molecule), mapping.
bacterial toxin (toxin bacterian) O toxin produs de o bacterie, cum
este toxina Bt produs de Bacillus thuringiensis.
bacterial two-hybrid system (dublu sistem hibrid bacterian) Vezi twohybrid system.
bacteriophage (bacteriofag) Un virus care infecteaz bacteriile. Este de
asemenea denumit n mod simplu fag. Formele alterate sunt folosite n
lucrrile de clonare a ADN, pentru care sunt considerate ca fiind vectori
convenabili. Cei mai folosii bacteriofagi sunt derivai din doi fagi
slbatici, denumii M13 i lambda (). Fagii lambda sunt folosii pentru
clonarea segmentelor de ADN de circa 10-20 kb. Ei sunt fagi litici, adic se
replic prin lizarea celulei gazd, elibernd un numr mai mare de fagi. Pe o
plac bacteriologic, liza este indicat de formarea unei zone clare mici o plac. Unii vectori lambda sunt folosii ca vectori de expresie. Sistemul
M13 poate crete n interiorul unei bacterii, astfel c el nu distruge celula pe
36
care clima este prea rece pentru creterea orezului), iar testarea lor n
condiii de cmp s-a efectuat n Arizona (stat american n care clima este
prea uscat). Restricionarea biologic poate s implice de asemenea
utilizarea unor molecule vector i organisme gazd care au fost modificate
prin inginerie genetic pentru a fi capabile s supravieuiasc numai n
condiii deosebite furnizate de experimentator, care nu sunt ndeplinite
nafara laboratorului. In agricultur, restricionarea biologic este util
pentru protejarea culturilor de plante convenionale de fluxul de gene
dinspre, sau impurificarea cu plante modificate genetic (PMG) din culturile
aflate n vecintate. Odat cu sfritul de facto al moratoriului asupra
plantelor modificate genetic n Europa, mai multe programe de cercetare au
ca obiectiv elaborarea de strategii pentru restricionarea OMG. Printre
strategiile avute n vedere sunt cele bazate pe plante cleistogamice, plante cu
sterilitate mascul i plante transplastomice.
biological engineering (inginerie biologic) Vezi bio-engineering.
biological nanotechnology (nanotehnologie biologic) Vezi nanobiotechnology.
biological vectors (vectori biologici) Vezi vectors.
biologics (produse biologice) Termen referitor la proteinele recombinante
terapeutice (produse biofarmaceutice), create prin tehnologia ADN
recombinant i produse n culturi de celule vii (linii celulare bacteriene, de
drojdii, animale sau umane). Printre cele mai importante produse biologice
se numr insulina, hormonul uman de cretere, interferonii i eritropoietina.
biomodification (biomodificare) Procesul de modificare a unui material
biologic pe cale genetic sau enzimatic.
bionanotechnology (nanotehnologie biologic) Vezi nanobiotechnology.
biopharming (*) Producerea de biofarmaceutice n plante sau animale
domestice. Vezi de asemenea pharming.
biopolymer (biopolimer) Orice structur molecular polimeric mare
(protein, acid nucleic, polizaharid, lipid) produs de un organism viu.
bioreceptors (bioreceptori) Se refer la fragmente de ADN, anticorpi,
molecule proteice, componente celulare (de exemplu, molecule de aderare),
atunci cnd acestea sunt ataate la o suprafa sintetic (de exemplu, un
biocip) n scopul analizrii substanelor biologice. Vezi de asemenea
biochip, microarray.
biosafety (biosecuritate) Se refer la prevenirea pierderii pe scar larg a
integritii biologice, concentrat att pe pstrarea echilibrului ecologic, ct
46
48
biotoxin (biotoxin)
Compus toxic produs natural, care prezint o
pronunat activitate biologic i are probabil o anumit semnificaie
adaptativ pentru organismul care l produce.
bis Abreviere pentru bisacrylamide. Vezi polyacrilamide gels.
-lactamase (-lactamaz) O gen de rezisten la ampicilin. Vezi
selectable marker.
blood lysis buffer (tampon de liz eritrocitar) Tampon folosit n
protocoalele de extracie de ADN.
blot (*) 1. (verb) Transferul ADN, ARN sau al unei proteine pe o matrice
imobilizatoare. 2. (substantiv) Termen referitor n mod obinuit la
autoradiografia produs n cursul procedurilor de transfer Southern sau
northern. Variaiile acestui termen depind de moleculele implicate: (1)
Southern blot: moleculele transferate sunt molecule de ADN, i proba
(sonda) este ADN; (2) northern blot: moleculele transferate sunt de ARN,
i proba este ADN; (3) western blot: moleculele transferate sunt de protein,
i proba este un anticorp marcat; (4) southwestern blot: moleculele
transferate sunt de protein, i proba este ADN; (5) dot blot: ADN, ARN sau
o protein sunt transferate direct pe o membran suport, astfel nct ele
formaz spoturi (pete) discrete; (6) colony blot: moleculele (de regul,
ADN) sunt din colonii de bacterii sau drojdii crescute pe o plac
bacteriologic. Vezi de asemenea DNA probes.
blunt end (capt drept, capt tiat drept) Sin. flush end, smooth end, bluntend DNA. Captul unei molecule dublu catenare (duplex) de ADN n care
niciuna dintre catene nu se extinde dincolo de cealalt (catenele se termin
n acelai punct). Astfel de capete se pot forma dup digestia (tierea) cu
unele (tipuri de) endonucleaze.
blunt-end cut (tierea dreapt a unui capt) Despicarea legturilor fosfodiesterice dintre nucleotidele corespondente de pe catenele opuse ale
duplexului de ADN. Acest proces de clivare are ca rezultat terminarea
fiecrei catene la acelai nivel, n sensul c nu exist extensie de nucleotide
pe niciuna dintre catene.
blunt end DNA (ADN cu capt tiat drept) Vezi blunt end.
blunt-end ligation (legarea capetelor tiate drept) Unirea nucleotidelor de
la capetele tiate drept a dou molecule de ADN.
bollworms (viemii capsulelor) Vezi Helicoverpa (Heliothis) virescens,
Helicoverpa (Heliothis) zea, Pectinophora gossypiella.
49
54
C
C Abreviere pentru cytosine. Vezi cytosine.
CAA Codon n structura ADN sau ARNm, ce codific aminoacidul
glutamin (Gln).
CAAT box (caseta CAAT) Sin. CAT box. O secven conservat gsit n
cadrul regiunii promotor a genelor ce codific proteine la multe organisme
eucariote. Are secvena consens GGCCAATCT; apare cu circa 75 baze
nainte de situsul de iniiere a transcripiei; este unul din cele cteva situsuri
de recunoatere i legare al proteinelor reglatoare denumite factori de
transcripie.
CAC Codon n structura ADN sau ARNm, ce codific aminoacidul
histidin (His).
CaMV Abreviere pentru cauliflower mosaic virus. Vezi cauliflower
mosaic virus.
CaMV promoter (promotorul CaMV) Sin. CaMV 35S promoter. Vezi
CaMV 35S promoter.
CaMV 35S promoter (promotorul CaMV 35S) Un promotor constitutiv
foarte puternic, responsabil de transcripia ntregului genom al virusului
mozaicului conopidei (CaMV). Este bine cunoscut pentru folosirea sa n
transformarea plantelor. Promotorul CaMV determin nivele ridicate ale
expresiei genelor la plantele dicotiledonate, ns relativ sczute la
monocotiledonate (n special la cereale). Diferenele de comportament ale
acestui promotor sunt probabil o consecin a diferenelor n calitatea i/sau
cantitatea factorilor de reglare. Denumirea promotorului include 35S
deoarece coeficientul de sedimentare al transcriptului viral, a crui expresie
este n mod natural condus de acest promotor, este 35S.
cancer-promoting genes (gene promotoare ale cancerului)
Sin.
transforming oncogene, transforming genes. Vezi transforming oncogene.
canola (canola) Termen desemnnd oricare dintre cele cteva soiuri de
Brassica napus sau Brassica campestris/rapa pentru ulei comestibil. Uleiul
vegetal obinut din seminele acestor soiuri este bogat n acizi grai mononesaturai. Inainte de 1971, uleiul produs din semine de rapi coninea
30%-60% acid erucic (ale crui nivele ridicate n uleiul de consum erau
asociate cu leziuni cardiace n testrile pe animale experimentale). Dup
55
catalitic const n mod obinuit ntr-o poriune mic din aria total a
enzimei. Vezi de asemenea catalyst, enzyme, active site.
CAT box (caset CAT) Vezi CAAT box.
cat gene (gena cat) Gen izolat de la E. coli, ce codific enzima
cloramfenicolacetil-transferaza (CAT), mult utilizat ca gen raportoare la
plante. Determinarea sa este mai pretenioas, bazndu-se pe monitorizarea
acetilrii cloramfenicolului prin marcarea cu 14C, fie a acetil-CoA, fie a
cloramfenicolului, produii fiind separai prin cromatografie n strat subire
(TLC) i msurai prin densitometrie sau prin scintilaie. Uneori poate exista
activitate CAT i n unele esuturi vegetale, mai ales la Brassicaceae, ceea
ce afecteaz eficiena acestui sistem.
CAU Codon n structura ARNm, ce codific aminoacidul histidin (His).
cauliflower mosaic virus (CaMV) (virusul mozaicului conopidei) Un
membru al familiei caulimovirusurilor ce se replic prin transcripie invers.
CaMV poate fi utilizat ca vector de clonare n plante, avnd avantajul c o
singur infecie are ca rezultat rspndirea virusului n ntreaga plant,
fiecare celul devenind infectat. Totui, utilizarea CaMV este limitat
deoarece la genomul su pot fi adugate numai inserii mici fr s se
interfereze cu mpachetarea ADN n nveliul proteic al virusului. Genomul
CaMV conine 8 gene strns mpachetate, din care doar dou gene mici
(genele II i VII) sunt neeseniale. In consecin, doar aceste dou gene pot
fi nlocuite/deletate fr s se piard infectivitatea. In plus, genomurile
modificate de CaMV ce depesc mrimea natural (8024 pb) cu doar
cteva sute de perechi de baze nu mai sunt mpachetate n virioni. Aceti doi
factori limiteaz serios mrimea insertului de ADN ce poate fi clonat n
CaMV. La aceasta se adaug gama limitat de gazde a CaMV.
CCA Codon n structura ADN sau ARNm, ce codific aminoacidul prolin
(Pro).
CCC Codon n structura ADN sau ARNm, ce codific aminoacidul prolin
(Pro).
CCG Codon n structura ADN sau ARNm, ce codific aminoacidul prolin
(Pro).
CCT Codon n structura ADN, ce codific aminoacidul prolin (Pro).
CCU Codon n structura ADN sau ARNm, ce codific aminoacidul prolin
(Pro).
CD4 EPSPS
Abreviere pentru CD4 5-enolpiruvil-shikimat-3-fosfat
synthase. Vezi EPSP synthase.
59
5ATGAAAGCTTTAGTGGGCGCCCGTAT 3
3TACTTTCGAAATCACCCGCGGGCATA 5
5AUGAAAGCUUUAGUGGGCGCCCGUAU 3
(se) vor hibridiza (uni prin legturi de hidrogen) unul (una) cu cellalt
(cealalt).
complementary homopolymeric tailing (producere de cozi complementare
homopolimerice) Procesul de adugare de nucleotide complementare
(formare de extensii, prelungiri) la diferite molecule de ADN, de exemplu,
dG (deoxiguanozin) la capetele 3-hidroxil ale moleculei de ADN i dC
(deoxicitidin) la capetele 3-hidroxil ale unei alte molecule de ADN,
pentru a facilita, dup amestecare, unirea celor dou molecule de ADN
prin mperecherea bazelor ntre extensiile complementare. Procesul este
cunoscut de asemenea sub denumirea de producere de cozi dG - dC i
respectiv dA - dT.
complementary nucleotides (nucleotide complementare) Membre ale
perechilor adenin-timin, adenin-uracil, i guanin-citozin avnd
capacitatea de a se lega una de alta prin legturi de hidrogen. Vezi de
asemenea nucleotide.
complementary RNA (cRNA) (ARN complementar)
Produi de
transcripie sintetici ai unei anumite molecule de ADN (de exemplu, o
gen), obinui cu ajutorul unui sistem de transcripie in vitro. ARN
complementar poate fi utilizat ca inhibitor genetic antisens, sau poate fi
marcat cu uracil radioactiv i utilizat apoi ca sond.
complete digest (digestie complet) Tratament unui preparat ADN cu o
endonucleaz pentru o durat de timp suficient de lung pentru ca toate
situsurile int poteniale din acel ADN s fie tiate. Vezi de asemenea
(compar cu) partial digest.
composite transposon (transpozon compozit)
Un element (genetic)
transpozabil ce se formeaz atunci cnd doi transpozoni identici sau aproape
identici se inser de fiecare parte a unui segment de ADN non-transpozabil,
aa cum este transpozonul bacterian Tn5.
concatemer (concatemer) Un segment de ADN format din secvene
repetate (monomeri identici) legate cap la cap. Vezi de asemenea
concatenation.
concatenation (concatenare) Legarea mai multor plasmide sau genomuri
fagice n tandem, ca oligomere sau multimere (structuri concatenate sau
concatemere). Vezi de asemenea concatemer.
conditional lethal mutation (mutaie condiionat letal) O mutaie care
este letal n anumite condiii de mediu condiii restrictive dar este
80
cot curve (curba cot, curba cotangentei) Atunci cnd un duplex de ADN
este nclzit, se produce disocierea catenelor (adic denaturarea). Cnd
temperatura scade, catenele complementare au tendina s revin la starea
normal (tendina de renaturare). Msura n care are loc renaturarea depinde
de produsul concentraiei de ADN n moli de nucleotide per litru, i timpului
n secunde. Un grafic prezentnd proporia de ADN renaturat fa de
cotangent este cunoscut sub denumirea de curba cotangent. Cotangenta la
care jumtate din ADN a renaturat este jumtatea cotangentei, un parametru
indicnd gradul de complexitate a ADN.
cotranscriptional splicing (matisarea cotranscripional)
Ipoteza c
matisarea ARN pre-mesager (pre-mRNA) se produce simultan cu sinteza sa
n cursul transcripiei unei gene. Alternativ, matisarea majoritii intronilor
unui ARN mesager precursor poate avea loc de asemenea posttranscripional.
co-transfection (co-transfecie) In sistemele de expresie baculovirale,
procedeul prin care baculovirusul i vectorul de transfer sunt introdui
simultan n celulele insectelor aflate n cultur.
co-transformation (co-transformare)
In experimentele de inginerie
genetic este adesea necesar transformarea cu o plasmid pentru care nu
exist un fenotip selectabil i prin urmare modalitate de selecie pentru
prezena plasmidei n celula gazd. Co-transformarea este tehnica n care
celulele gazd sunt incubate cu dou tipuri de plasmide, dintre care unul este
selectabil, iar cellalt nu este. Sunt apoi selectate celulele care au fost
transformate cu prima plasmid. Dac s-a realizat transformarea la o
concentraie nalt a ADN, exist o probabilitate ridicat ca aceste celule s
fi fost de asemenea transformate i cu cea de a doua plasmid (nonselectabil). Aceast tehnic este folosit frecvent n experimentele cu celule
de mamifere.
countertranscript (contratranscript) Sin. countertranscript RNA, ctRNA,
antisense messenger RNA, anti-mRNA. Orice transcript ARN al unei gene
care este sintetizat n orientare opus transcriptului ARNm. Acest tip de
ARN antisens se poate lega de ARNm i mpiedica funcia (funciile) lui.
Este cunoscut de asemenea ca micRNA (messenger-RNA-interfering
complementary RNA).
countertranscript RNA (contratranscript ARN) Sin. countertranscript,
ctRNA, antisense messenger RNA, anti-mRNA. Vezi countertranscript.
87
cross linking (legarea ncruciat) Sin. DNA cross linking. Vezi DNA
cross linking.
crown gall (*) (denumire compus, avnd la origine termenii crown, care
desemneaz baza unei plante, i gall, nsemnnd gal) (gal bazal,
tumor bazal) O proliferare bulboas ce apare la baza anumitor plante ca
rezultat al infeciei cu bacterii aparinnd, cel mai adesea, speciei
Agrobacterium tumefaciens. Bacteriile fitopatogene din sol ptrund n plant
prin rnile care se pot produce la nivelul esuturilor rdcinilor sau ale bazei
tulpinii; dup ataarea bacteriilor de celulele esutului rnit (mediat de
compuii polifenolici eliberai de acesta) are loc transferul de gene
bacteriene n celulele plantei infectate, respectiv a genelor codificnd sinteza
de fitohormoni i opine, gene existente n regiunea ADN-T a plasmidelor Ti
(abreviere pentru tumor inducing) rezidente n A. tumefaciens. Expresia
genelor bacteriene transferate n celulele plantei infectate are ca rezultat
proliferarea lor aberant i formarea de tumori. Sin. crown gall tumour. Vezi
de asemenea Agrobacterium, hairy root disease.
cry1A (b) protein [proteina cry1A (b)] Una dintre proteinele cry
(abreviere de la crystal-like), o protoxin care atunci cnd este consumat
de anumite insecte (de exemplu larve de Lepidoptere cum sunt Spodoptera
frugiperda, Manduca sexta, sau Ostrinia nubilalis) este toxic i cauzeaz
moartea lor. Pentru orice mamifer, proteina cry1A (b) este inofensiv, fiind
digerat n mai puin de 1 minut. Vezi de asemenea cry proteins, B.t.
kurstaki, protoxin, European corn borer.
cry1A (c) protein [proteina cry1A (c)] Una dintre proteinele cry
(abreviere de la crystal-like), o protoxin derivat din B. thuringiensis
subsp. kurstaki care atunci cnd este consumat de anumite insecte (de
exemplu larve de Lepidoptere) este toxic i cauzeaz moartea lor. Pentru
orice mamifer, proteina cry1A (c) este inofensiv. Vezi de asemenea cry
proteins.
cry1F protein (proteina cry1F) Una dintre proteinele cry (abreviere de la
crystal-like), o protoxin derivat din B. thuringiensis subsp. kurstaki care
atunci cnd este consumat de sfredelitorul European al porumbului
(Ostrinia nubilalis), sfredelitorul sud-vestic al porumbului (Diatraea
grandiosella), viermele negru al porumbului (Agrotis ipsilon), etc., este
toxic pentru larvele lor i le cauzeaz moartea. Vezi de asemenea cry
proteins, Bacillus thuringiensis, protoxin, European corn borer.
90
cry3B (b) protein [proteina cry3B (b)] Una dintre proteinele cry
(abreviere de la crystal-like), o protoxin derivat din B. thuringiensis
subsp. kurstaki care atunci cnd este consumat de anumite insecte (de
exemplu larve de Diabrotica virgifera virgifera) este toxic i cauzeaz
moartea lor. Vezi de asemenea cry proteins, protoxin, corn rootworm, B.t.
kumamotoensis.
cry9C protein (proteina cry9C) Una dintre proteinele cry (abreviere de
la crystal-like), o protoxin derivat din B. thuringiensis subsp. kurstaki
care atunci cnd este consumat de sfredelitorul European al porumbului
(Ostrinia nubilalis), sfredelitorul sud-vestic al porumbului (Diatraea
grandiosella), viermele negru al porumbului (Agrotis ipsilon), etc., este
toxic pentru larvele lor i le cauzeaz moartea. Vezi de asemenea cry
proteins, Bacillus thuringiensis, protoxin, European corn borer.
cry genes (genele cry) Genele ce codific sinteza proteinelor cristaline
(insecticide) la Bacillus thuringiensis. Vezi de asemenea cry protein.
cry protein (proteina cristalin) Proteinele cristaline insecticide sunt o
clas de proteine produse de diferite tulpini de Bacillus thuringiensis (de
exemplu var. kurstaki i var. tenebrionis), avnd efect toxic pentru grupe
specifice de insecte duntoare. Ingerat de insecte, protoxina (aproximativ
130 kDa) este degradat proteolitic la peptida toxin matur (aproximativ 66
kDa), care se ataeaz de celulele epiteliale ale intestinului mijlociu,
cauznd moartea acestora i scurgerea electroliilor n hemocel. Aceasta are
ca rezultat modificri fatale ale pH-ului i echilibrului ionic. Proteinele
toxice codificate de genele cry sunt letale pentru mai mult de 100 de specii
de insecte duntoare (lepidoptere, coleoptere, diptere), dar sunt inofensive
pentru pianjeni, alte insecte, animale i oameni. In mediu, aceste proteine
se degradeaz rapid i nu las reziduuri toxice.
cryptic (criptic, ascuns) Vezi cryptic genetic variation, cryptic mutation,
cryptic polymorphism.
cryptic mutation (mutaie criptic, mutaie ascuns) Orice mutaie care
este expus de o mutaie sensibilizatoare, altfel fiind greu de detectat
(sesizat); astfel de mutaii scap probabil deteciei datorit plasticitii
compoziiei polipeptidei corespunztoare.
cryptic plasmid (plasmid criptic) O plasmid care nu prezint funcii
definite, altele dect cele necesare pentru replicare i transfer.
cryptic polymorphism (polimorfism criptic, polimorfism ascuns) O form
de polimorfism controlat de gene recesive.
91
93
D
(delta; majuscul: ) Simbol pentru a patra liter a alfabetului grec.
dA - dT tailing (construirea cozii dA-dT)
Vezi complementary
homopolymeric tailing.
DAPI
Abreviere pentru 4,6-diamidino-2-phenylindole. Vezi 4,6diamidino-2-phenylindole.
data mining (explorarea datelor) Se refer la metodologia de lucru cu
computerul utilizat pentru cutarea relaiilor dintre, i a modelelor de
ansamblu printre miriadele de date din bazele de date (bioinformatice).
Unele tehnici de explorare a datelor includ analiza reelei neurale, algoritmii
genetici, interpretarea/ transformarea volumului, etc. Vezi de asemenea bioinformatics.
ddNTP Abreviere pentru dideoxy nucleoside triphosphates. Vezi dideoxynucleotide, di-deoxynucleotide. Vezi de asemenea dideoxy
sequencing.
decoy promoter (promotor fals) O secven de ADN, n totalitate sau
parial identic unui promotor care conine secvene consens pentru legarea
factorilor de transcripie. Astfel de secvene promotor false pot fi injectate n
nucleii celulelor int, unde concureaz cu promotorii endogeni pentru
factorii de transcripie comuni. Competiia are ca rezultat disponibilitatea
redus a acestor factori pentru promotorii endogeni i n consecin o
transcripie redus a genei adiacente. Promotorii fali pot fi folosii n
terapia genic. Vezi de asemenea promoter.
degenerate oligonucleotide-primed PCR (DOP-PCR) (PCR primat cu
oligonucleotide degenerate) Metod folosit pentru amplificarea unor
secvene nrudite de ADN, bazat pe folosirea unor seturi de primeri
oligonucleotidici care au fost sintetizai n aa fel nct s aib aceleai
nucleotide n anumite poziii i nucleotide diferite n alte poziii.
deletion mutation (mutaie prin deleie) Vezi deletion.
deliberate release (eliberare deliberat) A plasa ceva n lumea (mediul)
de afar; n biotehnologie semnific introducerea unui organism modificat
genetic (OMG) n teste de cmp. Pot fi eliberate deliberat numai OMG
recunoscute ca lipsite de risc prin teste de securitate biologic. In general,
acordul este limitat n timp i spaiu, n condiiile n care rspndirea
94
(ddATP, ddGTP, ddCTP, sau ddTTP). Poziiile relative ale diferitelor benzi
pe cele patru culoare sunt folosite apoi pentru citirea (de la baz la vrf) a
secvenei de ADN. Metodele bazate pe terminarea catenei au simplificat
considerabil secvenierea ADN. De exemplu, sunt disponibile comercial kituri ce conin reactivii pentru secveniere, pre-porionai i gata de utilizare.
Limitrile includ legarea nespecific a primerului la ADN, afectnd citirea
cu acuratee a secvenei de ADN, i structurile secundare ale ADN, afectnd
fidelitatea secvenei.
dideoxy terminator sequencing (secvenierea cu dideoxiterminatori) Vezi
dideoxy sequencing.
didN Abreviere pentru di-deoxynucleotide. Vezi di-deoxynucleotide
(ddNTP).
dielectrophoresis (dielectroforez) O tehnic de separare implicnd
micarea particulelor polarizabile ncrcate electric sau neutre ntr-un cmp
electric neuniform. Aceast tehnic ofer dou avantaje majore: 1) micarea
particulelor are loc spre regiunea cu cea mai ridicat trie a cmpului
indiferent de polaritatea electrodului. De aceea, poate fi folosit curentul
alternativ, reducndu-se problemele asociate cu folosirea curentului direct n
soluie apoas; 2) sistemul poate fi foarte selectiv, deoarece fora aplicat
particulelor este dependent de capacitatea lor de polarizare, care este o
funcie a particulelor neomogene ca celulele. In funcie de constantele
dielectrice ale particulelor i respectiv ale mediului n care acestea sunt
suspendate, micarea (deplasarea) poate fi pozitiv (cel mai frecvent), cnd
particulele se deplaseaz spre regiunea cu cea mai mare intensitate a
cmpului electric, sau negativ (dielectroforez negativ), cnd polarizarea
particulelor este inferioar celei a mediului i ca urmare sunt atrase mai
puin dect mediul n zona cmpului cel mai intens. Dielectroforeza pozitiv
este utilizat pentru alinierea protoplatilor celulelor microbiene, vegetale,
sau animale n faza premergtoare electrofuziunii. Pentru protoplatii
celulelor vegetale se folosesc de regul cmpuri alternative cu intensitatea
de 100-200 V/cm i frecvena de 0.5-1.5 MHz. Vezi de asemenea protoplast
fusion, electrofusion.
differential centrifugation (centrifugare diferenial)
O metod de
separare a particulelor sub-celulare dependent de coeficienii lor de
sedimentare, care sunt aproximativ proporionali cu mrimea lor. Extractele
celulare sunt supuse la o succesiune de centrifugri la viteze de rotaie
progresiv mai mari. Particulele mari, cum sunt nucleii i mitocondriile, vor
100
mai scump dect tungstenul, dar spre deosebire de acesta nu oxideaz. ADN
este precipitat pe particule nainte de bombardament. Cel mai adesea, pentru
precipitarea ADN plasmidial (avnd inserat gena strin ce se dorete a fi
integrat n genomul unei plante) pe particulele de tungsten se folosesc
CaCl2 i spermidina. Pentru precipitarea ADN pe particulele de aur se
folosete alcoolul etilic (etanolul).
DNA construct (construct ADN) O molecul de ADN inserat ntr-un
vector de clonare, de obicei o plasmid.
DNA cross linking (legarea ncruciat a ADN) Vezi DNA crosslinks.
DNA crosslinks (legturi ncruciate n ADN) Legturi ce apar atunci cnd
diferii ageni exogeni sau endogeni reacioneaz cu dou poziii diferite n
ADN. Aceste pot s apar n aceeai caten (intrastrand crosslink) sau n
catenele opuse ale ADN (interstrand crosslink). Legturi ncruciate pot s
apar de asemenea ntre ADN i proteine. Acestea pot s blocheze replicarea
ADN, determinnd moartea celulei dac legtura ncruciat nu este
reparat.
DNA damage (lezarea ADN) Sin. DNA injury. Producerea de leziuni
induse de substane chimice (inclusiv medicamente) n ADN, care cauzeaz
deviaii de la conformaia sa normal dublu-elicoidal. Aceste modificri
includ distorsiuni ce interfereaz cu replicarea i transcrierea, precum i
mutaii punctiforme ce afecteaz perechile de baze i exercit efecte
duntoare asupra generaiilor viitoare prin modificri n secvena ADN.
Dac leziunea este minor, aceasta poate fi cel mai adesea reparat. Dac
leziunea este extins, aceasta poate induce apoptoza.
DNA delivery system (sistem de livrare de ADN) Termen generic pentru
orice procedeu prin care se transport ADN ntr-o celul receptor
(recipient). Vezi de asemenea direct gene transfer, biolistics, microprojectile
bombardment, Agrobacterium tumefaciens-mediated gene transformation,
whisker-mediated plant transformation, liposome-based gene transfection,
liposome mediated gene transfer.
DNA denaturation (denaturarea ADN) Sin. DNA melting. Conversia
ADN dublu catenar la ADN monocatenar prin nclzirea suspensiei la 63100C, care determin ruperea legturilor de hidrogen. Denaturarea termic,
numit i topire (melting), se poate realiza i prin tratare cu acizi sau
alcooli i este nsoit de un efect hipercromic (creterea capacitii de
absorbie a radiaiilor ultraviolete cu lungimea de und de 260 nm),
106
posibilitatea citirii secvenei direct n (din) gel. Vezi de asemenea MaxamGilbert method.
DNA shearing (fragmentarea mecanic a ADN) Clivarea mecanic,
neenzimatic, aleatorie, a moleculelor de ADN genomic prin trecerea forat
(sub presiune mecanic) printr-un ac hipodermic foarte subire. Procedeul
(folosit rar n prezent) genereaz fragmente de ADN utilizabile pentru
subclonare n vectori, n vederea obinerii de bnci genomice aleatorii.
DNA shuffling (amestecarea ADN) Utilizarea recombinrii ADN pentru
producerea de biblioteci mari de gene noi, himerice, dintr-o populaie de
fragmente de ADN (rezultate prin fragmentarea la ntmplare) din secvene
genice nrudite.
DNA topo-isomerase (ADN topoizomeraz) O enzim care catalizeaz
producerea sau eliminarea superrsucirilor ADN.
DNA transformation (transformarea ADN)
Vezi transfection, transformation.
DNA typing (caracterizarea ADN, tipizarea ADN) Vezi DNA profiling.
DNA unwinding enzyme (enzima de desfurare/dersucire a ADN) Sin.
DNA helicase, gyrase. Vezi DNA helicase.
DNA vaccine (vaccin ADN) Un vaccin realizat prin construirea de
plasmide vector care poart gene sau fragmente de genom ce codific una
sau mai multe proteine antigenice, selectate pentru ageni patogeni de
interes. Producerea vaccinurilor ADN are la baz observaia c inocularea
unei plasmide (de exemplu, prin injectare intramuscular) care conine un
ADNc codificnd o protein antigenic determin un rspuns imun umoral
i mediat celular puternic i de lung durat fa de antigenul respectiv.
Dup integrarea n genomul celulelor receptoare, genele coninute n
plasmide sunt transcrise la ARNm, care este transportat din nucleu n
citoplasm i tradus la numeroase molecule de proteine antigenice.
Vaccinurile ADN cumuleaz toate calitile vaccinurilor convenionale: 1) o
singur plasmid, codificnd o protein imunogen, declaneaz un rspuns
imun complet umoral i celular; 2) sunt uor de preparat prin tehnologia
ADN recombinat i uor de produs n cantiti mari; 3) sunt inofensive
(evit contactul cu microorganismele i cu produsele lor); 4) sunt mai stabile
comparativ cu vaccinurile clasice, mai ieftine i mai uor de aplicat pe scar
larg; ADN este slab antigenic sau practic neantigenic. Vezi de asemenea
vacine, genetic engineering, recombinant vaccine.
114
Dolly (*) Numele primului mamifer creat prin clonarea unei celule de la un
animal adult. In acest caz particular, celula a fost prelevat din esutul
mamar al unei oi adulte. Crearea lui Dolly a artat c procesul de
difereniere a celulelor dintr-un esut adult nu este ireversibil, aa cum s-a
considerat anterior. Clonarea s-a realizat prin transfer nuclear. Naterea lui
Dolly a fost anunat n 1997. In acelai an au fost clonate alte dou oi
Molly i Polly cu proteinele umane pentru coagularea sngelui n laptele
lor (ce pot fi extrase pentru tratarea hemofiliei umane). De atunci, alte
cteva organisme animale au mai fost clonate pornind de la celule adulte,
printre care vaci i oareci.
dominant marker selection (selecia cu ajutorul unui marker dominant)
Selecia celular cu ajutorul unei gene codificnd un produs ce permite
numai celulelor ce poart gena respectiv s creasc n anumite condiii. De
exemplu, celulele vegetale i animale care exprim gena Neor (introdus
prin transformare) sunt rezistente la antibioticul G418, n timp ce celulele
care nu posed gena Neor sunt omorte de G418. Este cunoscut de
asemenea sub denumirea de selecie pozitiv (positive selection). Vezi de
asemenea positive selectable marker.
dominant selectable marker gene (gen marker de selecie dominant)
O gen ce permite celulei care o poart s supravieuiasc n condiii n care
altfel ar muri.
DOP-PCR Abreviere pentru degenerate oligonucleotide-primed PCR.
Vezi degenerate oligonucleotide-primed PCR.
dot-blot (*) O metod pentru screening-ul rapid al unui numr mare de
probe de ADN sau ARN pentru detectarea i cuantificarea prezenei unei
anumite secvene de baze.
DOT-PCR Abreviere pentru degenerate oligonucleotide-primed PCR.
Vezi degenerate oligonucleotide-primed PCR.
double digestion (digestie dubl) Tierea (clivarea) unei molecule de ADN
cu dou endonucleaze de restricie diferite, fie consecutiv, fie simultan.
double helix (dublu helix) Catenele antiparalele ale molecule de ADN,
rsucite una n jurul celeilalte n mod asemntor unei scri n spiral, n
care perechile de baze formeaz treptele, iar coloanele de zahar-fosfat
formeaz balustradele.
double-stranded complementary DNA (dscDNA) (ADN complementar
dublu-catenar) O molecul dublu-catenar de ADN creat dup o matri de
ADNc.
115
118
E
early gene (gen timpurie) O gen transcris timpuriu n cursul procesului
de infecie mediat de bacteriofagi [spre deosebire de genele transcrise trziu
(late genes)]. Poate necesita diferii factori p (sigma) pentru
recunoaterea promotorului.
early protein (protein timpurie) O protein sintetizat timpuriu n cursul
infeciei virale [spre deosebire de proteinele sintetizate trziu (late
proteins)].
E. coli (*) Vezi Escherichia coli.
EcoRI (*) Abreviere pentru cea mai comun i cea mai utilizat
endonucleaz de restricie, izolat de la Escherichia coli. Aceast enzim
recunoate secvena de nucleotide GAATTC (situsul de restricie pentru
EcoRI) i taie (cliveaz) molecula de ADN la nivelul lui, ntre G i A
(GAATTC), producnd capete (extremiti) coezive (lipicioase). Vezi de
asemenea restriction enzymes.
EcoRII (*) Abreviere pentru o endonucleaz de restricie de tip II, izolat
de la Escherichia coli, care recunoate secvena de nucleotide CCTAGG
(situsul de restricie pentru EcoRII) i taie (cliveaz) molecula de ADN
naintea primei citozine a acestei secvene (CCTAGG), producnd capete
coezive 5. Vezi de asemenea restriction enzymes.
edible vaccines (vaccinuri comestibile) Plante transgenice sau esuturile lor
ce produc antigene i pot fi consumate pentru vaccinare/imunizare. Astfel de
plante se pot obine prin transfer de gene codificnd proteine antigenice,
izolate din patogeni. Bananele n care au fost introduse secvene de ADN ce
codific anticorpi capabili s recunoasc virusul hepatitei B (HBV),
constituie cel mai bine cunoscut exemplu de vaccin comestibil. Un alt
exemplu de vaccin comestibil este cel mpotriva diareei, purtat de tuberculii
plantelor de cartof modificate prin inginerie genetic pentru a produce o
parte a toxinei secretate de Escherichia coli, care cauzeaz diareea.
Tomatele, morcovii, salata i tutunul, au fost de asemenea transformate
pentru a deveni vaccinuri comestibile. Vezi de asemenea molecular
farming.
editing (editare) 1. In transcripie: procesul prin care, n cursul sintezei
ARNm din ADN, sunt ndeprtate secvenele intronice i asamblate
119
furajele obinute sau derivate din organisme modificate genetic. EFSA ofer
o baz tiinific solid pentru luarea de decizii politice corecte. Deciziile
sunt totui responsabilitatea organismelor politice cum sunt Parlamentul
European, Comisia European i Consiliul Minitrilor. EFSA colaboreaz
strns cu autoritile n domeniu din statele membre ale Uniunii Europene.
event (eveniment) Termen referitor la un eveniment unic de recombinare ce
a avut loc ntr-o celul vegetal, care a fost folosit apoi pentru a genera
plante transgenice ntregi. In orice aplicaie practic avnd ca scop crearea
de plante transgenice, celulele vegetale sunt transformate individual cu
ADN strin. Fiecare celul care incorporeaz gena de interes reprezint un
eveniment unic. Celulele transformate sunt identificate cu ajutorul genelor
marker de selecie i fiecare plant transgenic format din astfel de celule
este rezultatul unui eveniment. Linia transgenic derivat din aceasta este
identificat cu ajutorul unei abrevieri, de exemplu Bt 11, MON 863, etc.
Dei multe plante transgenice diferite sunt create cu aceeai construcie
genic, doar cteva merit s fie folosite. Diferitele evenimente pot avea
consecine mult diferite. Acestea depind de numrul de copii ale genei de
interes integrate stabil n genomul celulei transformate i de asemenea de
localizarea (poziia) lor n genom. Evenimentele care au ca rezultat o
exprimare optim a transgenei, respectiv a caracterului introdus, sunt
considerate evenimente elit. Fiecare plant derivat dintr-un eveniment
transgenic este considerat un organism modificat genetic. Utilizarea lui
comercial i eliberarea n mediu necesit autorizarea n conformitate cu
reglementrile Uniunii Europene. Evenimentele pot fi introduse n alte
soiuri ale speciei respective prin hibridare (ncruciare). Aa se explic de ce
anumite evenimente (de exemplu MON 810) sunt prezente n multe soiuri
diferite.
excinuclease (nucleaz de excizie)
Complexul proteic coninnd o
exonucleaz, care excizeaz un segment de ADN modificat prin mutaie, n
cursul procesului de reparare prin excizie. Aceast enzim este parte a unui
mecanism care repar n faza G1 a ciclului celular al eucariotelor erorile de
incorporare a nucleotidelor n molecula de ADN, cum ar fi cele de includere
a dimerilor timinei, cauzate de radiaia UV. In acest mecanism, denumit
repararea prin excizia de nucleotide (nucleotide excision repair) sunt
implicate de asemenea ADN polimerazele i ADN ligazele. Vezi de
asemenea nucleotide excision repair.
130
131
Este cunoscut de asemenea sub denumirea exo III sau exodeoxyribonuclease III (exodeoxi-ribonucleaza III).
exosome (exozom) Un fragment de ADN exogen care nu se poate integra
n ADN-ul celulei receptor (gazd) imediat dup ptrunderea n aceasta, dar
rmne funcional, fiind capabil de replicare i de exprimare a genelor pe
care le conine, o perioad de timp.
exosome complex (complex exozomal) Un complex macromolecular
implicat n degradarea ARN.
express (verb: a exprima)
A transcrie i a translata (traduce) mesajul
genetic coninut de secvena de nucleotide a unei gene ntr-un produs
peptidic.
expressed sequence tag (EST) (secven etichet exprimat, secven
tag exprimat) Secven scurt de ADNc. Este denumit astfel deoarece
reprezint parte a secvenei (adic tag-ul unei secvene) unei gene
exprimate.
expressed sequence tag array (matrice de secvene etichet exprimate)
Alinierea ordonat pe suporturi de dimensiuni minuscule (membrane de
nylon, lame de sticl sau quartz, cip-uri de silicon) a tag-urilor diferitelor
secvene exprimate. Aray-urile EST permit detectarea simultan a mii de
gene exprimate la un moment dat ntr-un anumit celul, esut, organ, sau
organism, prin hibridizarea la array a preparatelor de ADNc marcate cu
fluorocromi. Orice eveniment de hibridizare ntre EST i ADNc este
detectat apoi prin fluorescen.
expressed single nucleotide polymorphism (eSNP) (polimorfism mononucleotidic exprimat) Orice polimorfism mononucleotidic prezent n exoni,
adic n secvenele exprimate.
expression library (bibliotec de exprimare/expresie) O populaie de
diferite molecule de ADN codificnd peptide, care au fost clonate ntr-un tip
de vector de expresie. Vezi library.
expression marker (marker de expresie) Orice secven exprimat, ca de
exemplu, un ADNc, un tag derivat dintr-o analiz serial a expresiei genice
(SAGE), sau un tag al unei secvene exprimate (EST), care a fost
identificat prin oricare dintre platformele microarray sau analiza serial a
expresiei genice, i servete ca un marker de diagnostic pentru o boal.
expression system (sistem de exprimare/expresie) Combinaia dintre o
gazd i un vector care furnizeaz contextul genetic pentru funcionarea unei
gene clonate, adic, s produc o peptid, n celula gazd.
134
135
F
(fi; majuscul: ) A 21 liter a alfabetului grec.
fad3 gene (gena fad3) O gen gsit n mod natural n ADN-ul plantelor de
soia (Glycine max), care codific producerea -desaturazei, o enzim cu
activitate n calea metabolic n care plantele de soia sintetizeaz acid oleic.
Mai exact, -desaturaza convertete acidul linoleic la acid linolenic.
Creterea expresiei genei fad3 ntr-o plant modificat genetic poate face ca
acea plant s produc ulei coninnd pn la 50% acid linolenic. Vezi de
asemenea fad genes, enzyme, desaturase, delta 12 desaturase, linoleic acid,
linolenic acid, genetic engineering.
fad genes (genele fad) Genele ce codific sinteza unei enzime specifice
plantelor desaturaza acizilor grai. Vezi de asemenea fad3 gene,
desaturase, delta 12 desaturase.
false-negative (fals negativ) Se refer la un rezultat negativ al unei analize,
care ar fi trebuit s fie pozitiv.
false-positive (fals pozitiv) Se refer la un rezultat pozitiv al unei analize,
care ar fi trebuit s fie negativ.
field inversion gel electrophoresis (gel electroforeza n cmp inversat)
Un procedeu cromatografic pentru separarea unui amestec de molecule cu
ajutorul unui cmp electric bidimensional aplicat matricei de gel coninnd
acele molecule. De exemplu, FIGE este folosit n mod comun pentru
separarea amestecurilor de molecule mari de ADN dup mrimea i
ncrctura (sarcina) lor electric. FIGE poate fi utilizat pentru a separa
molecule de ADN cu o lungime de pn la 2.000 Kpb. Vezi de asemenea
electrophoresis.
FIGE Abreviere pentru field inversion gel electrophoresis. Vezi field
inversion gel electrophoresis.
firefly luciferase (luciferaza de licurici) Vezi luciferase.
FISH
Abreviere pentru fluorescence in situ hybridization. Vezi
fluorescence in situ hybridization.
FITC Abreviere pentru fluorescein isothiocyanate. Vezi fluorescein
isothiocyanate.
FIV-derived vectors (vectori derivai din FIV) O serie de vectori lentivirali
derivai din virusul imunodeficienei felinelor (FIV), folosii pentru
136
144
G
G Abreviere pentru guanine. Vezi guanine.
GAA Codon n structura ADN i ARNm, ce codific acidul glutamic (Glu).
GAC Codon n structura ADN i ARNm, ce codific acidul aspartic (Asp).
GAG Codon n structura ADN i ARNm, ce codific acidul glutamic (Glu).
gall (gal) Cretere tumoral la plante.
gap (bre, lacun, gol) 1. Perioade de timp, n cursul ciclului celular
(G1, G2), intercalate ntre fazele M (mitoza) i S (de sintez); 2. O poriune
lips pe una dintre catenele ADN dublu-catenar, caz n care ADN are o
regiune monocatenar.
gapped DNA (ADN cu bree, ADN cu ntreruperi) O molecul duplex de
ADN cu una sau mai multe regiuni interne mono-catenare.
GAT Codon n structura ADN, ce codific acidul aspartic (Asp).
GAU Codon n structura ARNm, ce codific acidul aspartic (Asp).
Gb Abreviere pentru gigabase. Vezi gigabase.
GCA Codon n structura ADN i ARNm, ce codific aminoacidul alanina
(Ala).
G cap (*) Nucleozid 5-terminal coninnd guanin metilat, care este
prezent n ARNm al multor eucariote; este adugat, dup transcripie, la
ARNm. Vezi cap.
GCC Codon n structura ADN i ARNm, ce codific aminoacidul alanina
(Ala).
GCG Codon n structura ADN i ARNm, ce codific aminoacidul alanina
(Ala).
GC island (insul GC) Un segment de ADN bogat n perechi de baze G=C
care precede adesea n genomul organismelor vertebrate o gen transcris.
GC ratio (raportul GC) Cantitatea relativ a celor patru baze n moleculele
de ADN variaz n funcie de sursa de la care provin i se exprim, n
general, prin compoziia n baze G+C. Dei este variabil de la o specie la
alta, raportul G+C este constant i foarte caracteristic pentru un organism
dat. De aceea, dou organisme similare din punct de vedere fenotipic au cel
mai adesea un raport GC similar.
GCT Codon n structura ADN, ce codific aminoacidul alanina (Ala).
GCU Codon n structura ARNm, ce codific aminoacidul alanina (Ala).
145
ADN
agaroz
ARN
agaroz
sau poliacrilamid
Proteine
poliacrilamid
sau amidon
148
pereche de populaii. Din aceste distane, poate fi obinut cea mai bun
reprezentare a relaiilor (legturilor) ntre toate populaiile.
genetic engineering (inginerie genetic) Modificri ale constituiei genetice
a celulelor (altele dect cele produse prin ameliorare) ce rezult n urma
introducerii sau eliminrii anumitor gene prin tehnicile moderne de biologie
molecular. Aceast tehnologie se bazeaz pe folosirea unui vector pentru
transferul de informaie genetic util de la un organism donor ntr-o celul
sau organism care nu o posed. Termenul de inginerie genetic a fost
introdus de Jack Williamson n romanul su de ficiune Insula Dragonului
publicat n 1951, cu doi ani nainte ca James Watson i Francis Crick s
arate c informaia genetic este nregistrat n ADN. In esen, ingineria
genetic modern const n: 1) izolarea genei (genelor) de interes; 2) inseria
genei (genelor) ntr-un vector de transfer; 3) transferul vectorului n
organismul (n celule ale organismului) supus modificrii; 4) transformarea
celulelor organismului respectiv; 5) regenerarea i selecia organismelor
modificate genetic (OMG). Vezi gene cloning.
genetic event (eveniment genetic) Vezi event.
genetic fingerprinting (amprentare genetic) O tehnic prin care ADN al
unui anumit individ este analizat pentru a evidenia modelul de repetare a
anumitor secvene (a unor secvene particulare) n ansamblul genomului.
Prin utilizarea PCR pentru detectarea numrului de repetiii nucleotidice la
nivelul ctorva loci, este posibil stabilirea unei potriviri (similariti) care
este extrem de improbabil s apar din coinciden. Vezi DNA fingerprint.
genetic homology (omologia genetic) Sin. DNA homology. Vezi DNA
homology.
genetic immunization (imunizare genetic) Introducerea ntr-un organism
gazd a unei gene codificnd un antigen. Exprimarea genei clonate
declaneaz un rspuns imun (producere de anticorpi) ce protejeaz
organismul de infecia cu un virus, bacterie sau alt organism cauzator de
boal.
genetic information (informaie genetic) Informaia coninut ntr-o
secven de nucleotide din ADN cromozomial sau ARN.
genetic linkage (nlnuire genetic) Vezi linkage map, linkage.
genetic manipulation (manipulare genetic) Vezi genetic engineering.
genetic map (hart genetic) Aranjamentul liniar al genelor ntr-un
cromozom, bazat pe frecvenele de recombinare (harta de nlnuire) sau pe
localizarea fizic (harta fizic, sau harta cromozomial). Vezi mapping.
161
Secvenele ghid pot fi externe (EGS, external guide sequence) sau interne
(IGS, internal guide sequence) ARN ce este procesat, i pot hibridiza fie
cu secvenele intronice, fie cu cele exonice apropiate de jonciunea de
asamblare (mbinare). Vezi de asemenea split gene, exon.
gus (*) Gena ce codific sinteza -glucuronidazei, folosit ca (gen)
reporter (raportor) n vectorii folosii pentru transformarea plantelor.
Gena gus, sin. uidA, a fost izolat de la tulpina K12 de Escherichia coli i
raporteaz att transformarea permanent, ct i transformarea tranzient.
Folosirea genei gus permite de asemenea monitorizarea i optimizarea
tehnologiei de transformare. Este gena raportoare utilizat cel mai frecvent
pentru selecia plantelor transgenice. Vezi de asemenea transformation,
reporter gene.
GURT Acronim pentru genetic use restriction technologies. Vezi traitspecific genetic use restriction technology.
GUS Enzima -glucuronidaz, codificat de gena gus (uidA). Ca urmare a
reaciei cu anumii compui substrat, aceast hidrolaz permite evidenierea
prin metode spectrofotometrice, fluorimetrice sau histochimice a celulelor,
esuturilor sau organelor vegetale transformate, relevat de formarea unui
compus de culoare albastr. La pH-ul folosit pentru determinarea GUS nu
exist activitate -glucuronidazic n nici un esut vegetal.
GUU Codon n structura ARNm, ce codific aminoacidul valin (Val).
gyrase (giraz) Vezi DNA helicase.
172
H
HAC Abreviere pentru human artificial chromosome. Vezi human
artificial chromosome.
hairpin (ac de pr) Vezi hairpin structure.
hairpin loop (bucl n ac de pr) Sin. hairpin, hairpin structure, stem-loop.
Vezi hairpin structure.
hairpin RNA vector (vector ARN n ac de pr) Orice vector de clonare i
transformare ce codific dou secvene auto-complementare de ARN n ac
de pr (hairpin RNA) cu orientare invers repetat, care sunt exprimate n
organismele transgenice pentru producerea de molecule de ARN dublucatenare, i care la rndul lor inactiveaz (sileniaz) post-transcripional
gena din care a derivat ARN-ul mesager complementar.
hairpin structure (bucl n ac de pr) Sin. hairpin, hairpin loop, stem-loop.
Tip de structur secundar caracteristic moleculelor de acizi nucleici
monocatenare care conin secvene de baze inversate complementare, dar
cu polaritate opus (5-AGGACGT ACGTCCT-3), ce le permit
formarea unor regiuni dublu catenare prin mperecherea bazelor respective.
Regiunile nemperecheate formeaz bucle monocatenare scurte, limitate de
regul la cteva nucleotide. Vezi de asemenea hairpin RNA vector.
hairy root culture (cultura de rdcini proase) O aplicaie relativ recent
a culturii de esuturi, constnd n rdcini nalt ramificate la o plant. Atunci
cnd un esut vegetal este co-cultivat cu o suspensie de celule de
Agrobacterium rhizogenes, acestea transfer n celulele esutului respectiv o
parte a propriilor plasmide ADN (plasmidele Ri). Aceasta modific
metabolismul plantei, n primul rnd fiind afectate nivelele de hormoni, care
cauzeaz formarea de rdcini nalt ramificate la locurile de infecie a
explantului. Rdcinile induse de infecia cu Agrobacterium rhizogenes
ramific mult mai frecvent dect sistemul radicular normal al unei plante i
sunt de asemenea acoperite cu o mas de periori radiculari minusculi.
Trstura lor cea mai semnificativ este aceea c produc metabolii
secundari la niveluri similare celor din planta original. De aceea, astfel de
rdcini pot fi folosite pentru nlocuirea plantelor la producerea de compui
cum ar fi aromele alimentare sau parfumurile.
173
187
I
ICGEB Acronim pentru International Centre for Genetic Engineering and
Biotechnology (Centrul Internaional pentru Inginerie Genetic i
Biotehnologie).
ICSI
Abreviere pentru intracytoplasmic sperm injection. Vezi
intracytoplasmic sperm injection.
I/E region (regiune I/E) Vezi integration-excision region.
IGR Abreviere pentru intergenic region. Vezi intergenic region.
IGS Abreviere pentru internal guide sequence. Vezi guide sequence.
illegitimate recombination (recombinare nelegitim) Sin. non-homologous
recombination, non-homologous end joining. Recombinarea ntre secvene
de ADN care conin un numr redus de nucleotide identice, sau ntre
secvene neomoloage. Vezi de asemenea genetic recombination.
imidazolinone-tolerant soybeans (soia tolerant la imidazolinon) Plante
de soia (Glycine max) capabile s reziste la efectele erbicidelor bazate pe
imidazolinon (incluznd imazethapyr i imazaquin). Varieti rezistente la
astfel de erbicide au fost obinute prin inginerie genetic ncepnd cu anul
2003. Vezi de asemenea genetic engineering, herbicide resistance.
immunoblot (imunoblot) Un procedeu de laborator, cum este analiza
Western blot, n care proteinele care au fost separate prin electroforez sunt
transferate pe pelicule de nitroceluloz i sunt identificate prin reacia lor cu
anticorpi marcai. Vezi de asemenea immunoblotting.
immunoblotting (imunoblotare) O tehnic bazat pe utilizarea anticorpilor
pentru identificarea proteinelor int printre numeroase specii de proteine
nenrudite. Imunoblotarea implic identificarea proteinei int pe calea
reaciilor specifice antigen-anticorp (sau protein-ligand). Proteinele sunt
separate prin electroforez i transferate pe membrane (de obicei nitroceluloz). Membrana este acoperit cu un anticorp primar pentru o anumit
int i apoi cu un anticorp secundar marcat (de exemplu, cu radioizotopi).
Atunci cnd ligandul nu este un anticorp, reacia poate fi vizualizat
folosind un ligand care este marcat direct. Dot blot este un procedeu
simplificat n care eantioanele de proteine nu sunt separate prin
electroforez, ci sunt spotate direct pe membran. Tehnica immunoblotting este larg utilizat n combinaie cu electroforeza bidimensional n
188
190
inhibitor (inhibitor) Orice substan sau obiect care ntrzie sau ncetinete
o reacie chimic; o gen major sau modificatoare care interfereaz cu o
reacie sau cu expresia altei gene.
initiation factors (factori de iniiere) Proteine solubile necesare pentru
iniierea translaiei.
initiator element (element iniiator) Sin. INR element, Inr. Elementul
iniiator, denumit uneori i initiator motif (motiv iniiator) este un miez de
promotor cu funcie similar casetei Pribnow (la procariote) sau casetei
TATA (la eucariote). Are secvena consens YYANWYY. In mod similar
casetei TATA, elementul INR faciliteaz legarea factorului de transcripie II
D (TBP).
in planta transformation (transformare in planta) Metod alternativ de
transformare folosit la Arabidopsis thaliana, care nu implic condiii
sterile, cultura in vitro i regenerarea de plante. Aceast metod se bazeaz
fie pe infiltrarea n plant, n condiii de vid (vacuum), a unei suspensii de
celule de Agrobacterium coninnd un vector binar, fie pe co-cultivarea
seminelor cu Agrobacterium pentru o zi (dup mbibarea prealabil cu ap).
Vezi de asemenea transformation.
INR element (element de iniiere) Vezi initiator element.
insect resistance (rezistena la insecte) Unul dintre obiectivele majore ale
ingineriei genetice aplicate la plante. Pn n prezent strategia folosit
pentru crearea de plante transgenice cu rezisten la insecte s-a bazat
aproape exclusiv pe transferul genelor ce codific proteina toxic Bt, izolate
de la bacteria din sol Bacillus thuringiensis. Cele mai importante rezultate
ale aplicrii acestei strategii sunt porumbul transgenic i respectiv bumbacul
transgenic cu rezisten la duntori specifici. Sunt n curs de elaborare alte
strategii pentru crearea de plante modificate genetic cu rezisten la insect,
bazate pe: 1. Transferul de gene codificnd sinteza de lectine, implicate n
mecanismele de rezisten la atacul de insecte; 2. Transferul de gene
codificnd inhibitori ai enzimelor digestive (unele plante se apr prin
producerea de ageni activi ce blocheaz enzimele digestive ale prdtorilor
lor). Aceste strategii se deosebesc de strategia Bt prin faptul c genele
transferate sunt isolate nu din microorganisme, ci din diferite alte plante
(de exemplu, Galanthus nivalis - ghiocelul). Vezi de asemenea Bt protein,
lectins.
insert (insert) O molecul de ADN incorporat ntr-un vector de clonare.
Vezi de asemenea DNA insert.
191
insertion (inserie) Integrarea unei piese de informaie genetic (ADN) ntro gen. Inseria se poate produce spontan, ca n cazul mutaiei naturale, sau
poate fi realizat prin inginerie genetic. In cel de al doilea caz, o caten
ADN este tiat cu ajutorul unei enzime de restricie, secvena de ADN
strin fiind integrat la capetele deschise.
insertional inactivation (inactivare inserional) O strategie de clonare n
care inseria unui segment de ADN ntr-un vector inactiveaz o gen purtat
de vector. Pierderea produsului acestei gene poate fi folosit pentru
detectarea transformanilor (de exemplu, pierderea rezistenei la un anumit
antibiotic).
insertion element (element de inserie) Termen generic pentru secvenele
de ADN existente la bacterii, capabile s se insereze n genom. Se consider
a fi responsabile de integrarea specific de situs a fagilor i plasmidelor.
insertion mutations (mutaii prin inserie) Modificri n secvena de baze a
unei molecule de ADN determinate de integrarea la ntmplare a ADN
dintr-o alt surs. Vezi de asemenea deoxyribonucleic acid, mutation.
insertion sequence (secven de inserie) Vezi IS element.
insertion site (situs de inserie) Sin. cloning site. Un situs unic de restricie
ntr-o molecul vector de ADN n care poate fi inserat ADN strin.
Termenul este folosit de asemenea pentru a descrie poziia de integrare a
unui transpozon sau locul de inserie a unui element.
insertion vector (vector de inserie) Un vector care are un singur situs de
restricie, situat (n general) ntr-o poziie central n structura sa. Dup
secionarea de ctre endonucleaza de restricie respectiv, se formeaz dou
extremiti (capete) libere, ntre care poate fi inserat un fragment de ADN
strin. Vezi de asemenea vector.
insertion vector (vector de inserie ) Un vector fagic produs prin
deletarea unui segment neesenial al ADN. Regiunea deletat conine
majoritatea genelor implicate n integrarea i excizia profagului din
genomul bacterian. Astfel de vectori deletai sunt n consecin nelizogenici
i pot manifesta doar ciclul de infecie litic (ciclul litic). Dac o molecul
de ADN este inserat n molecula normal de ADN , doar aproximativ
3 kpb pot fi inserate nainte ca ADN s devin prea mare pentru a fi
mpachetat n capul fagului . Totui, folosind un vector de inserie , pot fi
clonate fragmente de ADN cu o mrime de la 3 la 9 kpb. Vezi de asemenea
vector, replacement vector.
192
202
J
J 1. Abreviere pentru joining segment. Vezi joining segment.
jellyfish green fluorescent protein (proteina fluorescent verde de meduz)
O gen marker (izolat de la Aequorea victoria) pentru expresia genic i
localizarea subcelular. Vezi green fluorescent protein.
joinase (ligaz) Sin. DNA joinase, nicking-closing enzyme, DNA nickingclosing enzyme, sealase, DNA sealase, polynucleotide ligase. Termen
alternativ (folosit rar) pentru polynucleotide ligase (polinucleotid ligaz).
Vezi polynucleotide ligase.
joining enzymes (enzime de ligare) Sin. DNA joining enzymes, ligases.
Enzime ce acioneaz pentru eliminarea lacunelor (gaps) din moleculele
(fragmentele) de ADN, care sunt unite prin mperecherea complementar a
bazelor. Vezi de asemenea ligases.
joining segment (J) (segment de unire) Un segment scurt de ADN care
leag genele pentru producerea unei gene funcionale codificnd o
imunoglobulin.
jumping DNA (ADN sritor) Vezi transposable elements.
jumping genes (gene sritoare) Vezi transposable elements.
jumping library (bibliotec de secvene pe srite) Un instrument pentru
cartarea i secvenierea unor poriuni mari ale unui cromozom. Pornind de la
un anumit punct n secvena de nucleotide, este localizat un punct distal fr
s se secvenieze nti bazele intercalate. ADN dublu-catenar este divizat n
fragmente lungi cu o enzim de restricie ce recunoate situsuri de restricie
formate din 6-8 perechi de baze (rare cutter) i un capt al fiecrui
fragment este legat la un marker selectiv, ciclizat, i apoi tiat cu o enzim
de restricie ce recunoate situsuri de restricie formate din 4 perechi de baze
(frequent cutter). Markerul permite izolarea celor dou capete ale
fragmentului original de lungime mare, fr secvena intercalat. Vezi de
asemenea chromosome jumping.
junctional sliding (glisare joncional) Termen pentru descrierea faptului
c localizarea jonciunilor intron-exon nu este constant la toi membrii unei
familii de gene, cum ar fi cea pentru proteaze serinice. Variaia lungimii
unor astfel de produi genici poate fi atribuit expansiunii/extinderii sau
203
204
K
kanamycin (kanamicin) Un antibiotic din familia aminoglicozidelor care
interfer negativ cu translaia prin legarea de ribozomi.
kanamycin resistance (rezisten la kanamicin) Rezistena la antibioticul
kanamicin. Gena nptII (neomycin phosphotransferase II) prezent la
bacterii confer rezisten la kanamicin i neomicin, codificnd sinteza
unei enzime (NPTII) care face antibioticul inofensiv (l detoxific prin
fosforilare). Aceast gen este folosit ca marker pentru selecia plantelor i
microorganismelor transgenice (atunci cnd construcia folosit pentru
transformare conine gena nptII alturi de gena de interes). Intruct
kanamicina i neomicina au utilizare terapeutic limitat n medicina uman
i veterinar, EFSA (European Food Safety Authority) a recomandat
aprobarea folosirii fr restricii a genei nptII n aplicaiile avnd ca scop
crearea de plante transgenice, apreciind totodat c aceasta nu afecteaz
distribuia lor n mediu.
kanr (*) Abreviere pentru kanamycin-resistance gene. Vezi selectable
marker.
kb Abreviere pentru kilobase pairs. Vezi base pair, kilobase.
kbp Abreviere pentru kilobase pairs. Vezi base pair, kilobase.
key miRNAs (kmiRs) (microARN-uri cheie) MicroARN-uri produse de
gene ce codific cteva clase de proteine implicate n anumite ci biologice,
cum ar fi metabolismul lipidic pentru statine. Unele kmiRs identificate
pentru mevastatin sunt implicate n repararea ADN i controlul ciclului
celular. Vezi de asemenea microRNA.
kilobase (kb) O unitate de lungime egal cu 1 000 perechi de baze ale unei
molecule dublu-catenare de acid nucleic. O kilobaz de ADN dublu-catenar
are o mas de aproximativ 660 kilodaltoni.
kilobase pairs (kbp) Unitate folosit uneori n locul kilobazei. Vezi
kilobase.
kilodalton (kDa) Unitate pentru masa atomic, egal cu 1000 daltoni.
Vezi dalton.
kinetic PCR (reacia de polimerizare n lan cinetic). Sin. quantitative
polymerase chain reaction, Q-PCR, real-time PCR. Vezi quantitative
polymerase chain reaction.
205
206
L
(lambda) A unsprezecea liter a alfabetului grec.
label (etichet, marc) Un compus sau atom care este fie ataat la, fie
incorporat ntr-o molecul, i este folosit pentru a detecta prezena unui
compus, substan sau macromolecul, ntr-o prob.
labeled cells (celule etichetate, celule marcate) Sin. tagged cells. Vezi label,
tag. Vezi de asemenea labeling, molecular beacon, microarray, DNA
microarray, affinity tag, expressed sequence tags.
labeled molecules (molecule etichetate, molecule marcate) Sin. tagged
molecules. Vezi label, tag. Vezi de asemenea labeling, molecular beacon,
microarray, DNA microarray, affinity tag, expressed sequence tags.
labelling (etichetare, marcare) Procesul de nlocuire a unui atom stabil
dintr-un compus cu un izotop radioactiv al aceluiai element pentru a
permite detectarea compusului respectiv prin autoradiografie sau alte
tehnici. Marcarea radioactiv este din ce n ce mai frecvent nlocuit cu
marcarea fluorescent. Metoda este folosit pentru a urmri traseul unui
compus marcat ntr-un sistem biologic sau chimic.
lab-on-a-chip (laborator ntr-un cip) Termen folosit pentru a face referire
la dispozitivele microfluidice cu care se realizeaz aplicaii cum sunt
separarea acizilor nucleici, analiza proteinelor, sinteza de molecule organice
mici, detectarea i hibridizarea ADN, etc. Vezi de asemenea biochip,
genosensors, gene expression analysis, hybridization.
lac repressor-lac promoter system (sistemul lac represor - lac promotor)
Vezi IPTG.
ladder (scal) Vezi DNA ladder.
lagging strand (catena ntrziat) Catena de ADN care este sintetizat
discontinuu n cursul replicaiei (deoarece sinteza ADN se poate realiza
numai n direcia 5 spre 3).
LATE-PCR Abreviere pentru linear after the exponential polymerase
chain reaction. Vezi linear after the exponential polymerase chain reaction.
lateral gene transfer (LGT) (transfer lateral de gene) Sin. horizontal gene
transfer. Vezi horizontal gene transfer.
LCR Abreviere pentru ligase chain reaction. Vezi ligase chain reaction.
207
liposome (lipozom)
O vezicul membranar artificial microscopic
constnd ntr-un dublu strat sferic fosfolipidic. Lipozomii pot fi incorporai
n celulele vii i de aceea sunt folosii pentru transportul medicamentelor
relativ toxice n celulele bolnave, unde acestea i pot exercita efectul la
maximum. Moleculele de ADN pot fi prinse n interiorul, sau legate de
suprafaa veziculei, i prin fuziunea lipozomului cu membrana celulei ADN
va fi introdus n celul. Lipozomii au fost folosii pentru elaborarea unui
procedeu eficient de transfecie pentru bacteriile din genul Streptomyces.
liposome-based gene transfection (transferul de gene prin transfecie
mediat de lipozomi) Sin. liposome mediated gene transfer, lipid-mediated
gene delivery, lipid-based transfection, lipofection. Vezi liposome mediated
gene transfer.
liposome mediated gene transfer (transfer de gene mediat de lipozomi)
Sin. lipid-mediated gene delivery, lipofection. O metod de transfer de gene
bazat pe utilizarea lipozomilor (molecule sferice de lipide cu un interior
apos) n care au fost ncapsulate fragmente de ADN. Dup aderarea
lipozomilor la membranele celulare i fuzionarea cu acestea, ADN ptrunde
n celul i apoi n nucleu. Transferul de gene mediat de lipozomi este
folosit pentru transformarea, n unele cazuri cu eficien foarte ridicat, a
celulelor bacteriene, animale i vegetale.
liquid nitrogen (azot lichid) Azot gazos condensat la starea de lichid cu un
punct de fierbere de circa -196C. Este n mod obinuit mediul n care se
pstreaz containerele cu material genetic. Azotul lichid este folosit pe scar
larg pentru extracia ADN, congelarea rapid (instantanee) a materialului
biologic (de exemplu, esut vegetal) i mojararea la o pulbere fin,
permind mrirea ariei de extracie i integritatea ADN. Temperatura
sczut mpiedic de asemenea activarea ADN-azelor n timpul mojarrii i
digestia enzimatic a ADN. Vezi de asemenea DNA extraction.
LNA Abreviere pentru locked nucleic acid. Vezi locked nucleic acid.
lncRNA Abreviere pentru long non-coding RNA Sin. long ncRNAs. Vezi
long non-coding RNA.
locked nucleic acid (LNA) (acid nucleic blocat/ncuiat) Un analog de
acid nucleic ce imit ARN, n care riboza este blocat printr-o punte
oximetilenic ntre atomii de carbon din poziiile 2 i 4; astfel, monomerii
LNA sunt obligai s adopte o conformaie C3-endo. Studii structurale cu
ajutorul spectroscopiei RMN au evideniat asemnarea cu duplexurile de
acizi nucleici (geometrie a structurii secundare de tip A) i au confirmat
212
faptul c LNA imit ARN. Mai multe proprieti unice fac din LNA analogi
foarte importani pentru biotehnologiile moleculare i terapia genic.
Oligonucleotidele de tip LNA demonstreaz: 1) o afinitate de legare
extraordinar cu oligonucleotidele ADN sau ARN complementare; de
exemplu, pentru un duplex mixt, comparativ cu duplexurile normale,
temperatura de topire crete cu 2 pn la 8C pentru fiecare monomer cu
conformaie C3-endo prezent; 2) o excelent specificitate de mperechere a
bazelor azotate; 3) o nalt biostabilitate (rezisten fa de nucleaze);
4) o toxicitate redus n experimentele pe animale; 5) sintez simpl i
ieftin. Astfel de analogi structurali vor putea sta la baza dezvoltrii de noi
medicamente bazate pe acizi nucleici.
locus control regions (LCR) (regiuni de control al locusului) Elemente
cis-reglatoare situate la distan de un grup de gene care se exprim ntr-un
anumit esut, dar n perioade ontogenetice diferite.
long form (forma lung) Termen folosit n limbajul de laborator pentru
ARNm (sau ADN-ul su complementar) de tip slbatic mai lung, matisat
normal, transcris dintr-o anumit gen, comparativ cu forma scurt a
transcriptului aceleiai gene care a parcurs matisarea alternativ. O form
mai lung poate s apar de asemenea ca rezultat al matisrii alternative cu
reinere (retenie) de introni. Forma mai scurt este aadar forma de tip
slbatic.
long interspersed nuclear elements (LINE) (elemente nucleare lungi
dispersate) Familii de elemente lungi (lungimea medie = 6500 pb), moderat
repetitive (circa 10.000 copii). LINE sunt copii de ADNc ale genelor
funcionale prezente n acelai genom. Codific o protein de legare a ARN
i o protein bifuncional, cu activitate de ADN endonucleaz i de
transcriptaz invers. La om reprezint pn la 21% din ADN genomic.
Sunt cunoscute de asemenea ca pseudogene expuse.
long non-coding RNA (long ncRNAs, lncRNA) (ARN lung necodificator)
Un grup de molecule de ARN cu secvene mai lungi de 200 nucleotide, care
nu codific proteine. Lungimea acestor molecule de ARN este de altfel
caracteristica pe baza creia se face distincia fa de alte tipuri de molecule
mici de ARN cu rol de reglare (de exemplu, microARN sau ARN mic de
interferen). Reprezint populaia cea mai numeroas i mai divers de
acizi ribonucleici. Iniial au fost considerate precursori ai moleculelor mici
de ARN sau inactivatori ai unor gene. Mai recent s-a demonstrat c
213
M
(miu) A dousprezecea liter a alfabetului grec. Simbol pentru factorul de
multiplicare 10-6 (micro-).
M13 Un bacteriofag ADN monocatenar folosit ca vector pentru
secvenierea ADN.
M13 strand (caten M13) Molecula monocatenar de ADN prezent n
forma infecioas a bacteriofagului M13.
macroinjection (macroinjecie)
Procedeu de transformare bazat pe
injectarea ADN cu ace (de sering) al cror diametru este mai mare dect
diametrul celulelor. Intruct acest procedeu nu a putut fi repetat cu succes n
experimentele cu cereale realizate n cteva laboratoare diferite, exist o
ndoial n ceea ce privete validitatea rezultatelor raportate n anul 1987
(De la Pena i colab.), care indicau obinerea de plante transgenice de secar
(Secale cereale) n care se exprima o gen marker introdus prin
macroinjectare n tulpin, sub meristemul floral imatur.
macromolecule (macromolecul) Molecul cu greutate molecular mare,
cum sunt proteinele, acizii nucleici i polizaharidele.
magnetic labeling (marcarea magnetic) Vezi magnetic particles.
magnetic particles (particule magnetice) Buci minuscule de materiale
magnetice (n mod natural) ataate la molecule de capturare, cum ar fi
liganzi moleculari specifici, receptori, aptameri, antigene, anticorpi (de
exemplu, anticorpi monoclonali specifici unui tip particular de celule), etc.
Acestea pot fi apoi amestecate cu o populaie mare coninnd multe tipuri de
celule, n care moleculele de capturare magnetizate (obinute prin ataarea
particulelor magnetice) se vor ataa la rndul lor numai la celulele dorite;
acestea sunt separate utiliznd un cmp magnetic, iar ulterior sunt
ndeprtate particulele magnetice. De exemplu, nanoparticule magnetice (cu
un diametru de 100 nm) ataate la anticorpi mpotriva celulelor epiteliale pot
fi utilizate pentru detectarea metastazelor (de cancer) la om. Anticorpii
magnetizai se ataeaz la celulele epiteliale (biomarker al metastazei) ntr-o
prob de snge, oferind posibilitatea detectrii i numrrii lor. Intr-o
manier similar, secvene de acid nucleic/ADN pot fi ataate la particule
magnetice. Acestea pot fi apoi amestecate cu un amestec de secvene de
acizi nucleici/ADN n care particulele magnetice se vor ataa (prin
216
(de la cteva pn la 30 sau mai multe) ale unei secvene de circa 5 baze sau
mai puine (denumit unitate de repetiie). Un microsatelit tipic este unitatea
repetitiv AC, care apare n aproximativ 100.000 situsuri diferite ntr-un
genom tipic de mamifere. In fiecare situs (locus), exist de obicei cteva
alele diferite, fiecare identificabil dup numrul de uniti repetitive.
Aceste alele pot fi detectate prin PCR (Polymerase Chain Reaction),
folosind primeri proiectai (construii) din secvena unic localizat de
oricare parte a microsatelitului. Cnd produsul PCR este supus migrrii ntrun gel de electroforez, se constat c alelele difer n lungime n uniti
egale cu mrimea unitii repetitive, de exemplu, dac primerii corespund
secvenei unice immediate de pe cealalt parte a microsatelitului i au
fiecare o lungime de 20 baze, iar un individ este heterozigot pentru un
microsatelit AC cu o alel coninnd 5 repetiii i cealalt coninnd 6
repetiii, heterozigotul va expune dou benzi n gel, o band avnd o
lungime de 20 + (2 5) + 20 = 50 baze, i cealalt avnd o lungime de 20 +
(2 6) + 20 = 52 baze. Microsateliii au fost markeri ADN standard: ei pot
fi uor detectabili prin PCR, i tind s aib localizare uniform n ntreg
genomul. Mii de microsatelii au fost cartai la multe specii diferite.
microsatellite DNA (ADN microsatelit) Vezi microsatellite.
microsatellite instability (MSI) (instabilitatea microsatelitului, instabilitate
microsatelitic) Prezena unor alele microsatelitice adiionale (segmente
repetate) n celule (de exemplu, in celulele tumorale), ca rezultat al
susceptibilitii inerente a acestor regiuni la astfel de alterri i al mutaiilor
produse n mecanismul de reparare a erorilor de mperechere a nucleotidelor
n ADN, care n mod normal ar corecta aceste erori.
microtargeting (microintire) Metod de transformare bazat pe legea lui
Bernoulli pentru accelerarea unor particule de aur de mrime foarte
uniform n fragmente mici de esut. Sistemul este capabil s distribuie
80% din particule pe o arie ce nu depete 150 micrometri n diametru,
ceea ce corespunde mrimii unui meristem. Vezi de asemenea biolistics,
microprojectile bombardment, direct gene transfer.
mini-chromosome stacking technology (tehnologia stivuirii genelor n
minicromozomi) O tehnologie utilizabil pentru transferul simultan n
celulele int al ctorva gene (chiar zeci) coninute n mini-cromozomi
(Chromatin Inc., Chicago, avnd exclusivitate pentru producerea lor).
Aplicarea aceastei tehnologii (pentru care compania Monsanto a ncheiat un
acord de colaborare cu Chromatin Inc.) este considerat ca avnd un
226
236
N
naked cells (celule nude) Sin. protoplasts. Vezi protoplasts.
naked DNA (ADN nud) Vezi naked gene.
naked gene (gen nud) O gen (secven de ADN ce codific o protein)
izolat dintr-un genom, sau sintetizat conform unei secvene cunoscute.
nano Prefix cu semnificaia 10 -9.
nanobiotechnology (nanobiotehnologie) Sin. biological nanotechnology,
bionano-technology. Crearea i folosirea de biomolecule ca componente n
nanotehnologie. Termeni nrudii: nanotehnologie molecular.
nanometer (nanometru) O milionime dintr-un milimetru (1 10-9 m).
Poart de asemenea denumirea de milimicron; este egal cu zece angstromi.
nanometre (nanometru) Vezi nanometer.
narrow-host-range plasmid (plasmid cu gam redus/restrns de gazde)
O plasmid care se poate replica doar n una, sau cel mult cteva specii
bacteriene diferite.
natural antisense transcript (NAT) (transcript antisens natural) Oricare
dintr-o serie de ARN-uri mesager antisens aprute n mod natural la
organismele procariote sau eucariote. Aceti produi de transcripie sunt
capabili s formeze ARN-uri dublu-catenare cu produii de transcripie sens
i prin urmare au o funcie important n reglarea matisrii ARN mesager
precursor (pre-mRNA), matisarea alternativ, controlul translaiei,
degradarea ARN int, stabilitatea ARN, transportul ARN din nucleu n
citoplasm, interferena ARN, amprentarea genomic, inactivarea unuia
dintre cromozomii X (la mamifere i om), sau editarea ARN.
negative autogenous regulation (reglare autogen negativ) Sin. negative
self-regulation. Inhibarea expresiei unei gene sau a unui set de gene reglate
coordonat, de ctre produsul genei sau produsul unei dintre gene.
negative control system (sistem de control negativ) Un mecanism n care
este necesar o protein (sau sunt necesare cteva proteine) pentru ncetarea
expresiei genei.
negative selection (selecie negativ) Selecia indivizilor care nu posed un
anumit caracter. O metod prin care sunt selectate celulele n cretere
(cultivate) care nu poart un anumit insert ADN, cu o anumit localizare
cromozomial. Vezi de asemenea (compar cu) positive selection.
237
240
245
O
ochratoxins (ochratoxine) O grup de micotoxine (metabolii toxici
produi de fungi) produse de unele specii de Aspergillus (A. ochraceus, sin.
A. alutaceus) i Penicillium (P. verrucosum, P. viridicatum). Micotoxinele
sunt produse n special atunci cnd speciile mai sus menionate cresc n
cerealele depozitate la o temperatur mai mare de 4C, iar coninutul de
umiditate al boabelor depete 18%. Dac pentru furajarea vacilor de lapte
se folosesc cereale coninnd ochratoxin A, micotoxina va aprea foarte
repede n lapte. Ochratoxina A este o toxin puternic carcinogenic, ce
cauzeaz de asemenea vtmarea rinichilor atunci cnd ajunge n
organismul uman. Vezi de asemenea mycotoxins.
ochre codon (codonul ocru/limonit) Codonul UAA, unul dintre cei trei
codoni (ceilali doi fiind UAG i UGA) ce reprezint semnal de terminare a
sintezei unei catene polipeptidice. Acest codon nu este recunoscut de
molecula de ARNt, ci de factorii de eliberare (release factors) care
asigur eliberarea polipeptidului de pe ribozom. Vezi de asemenea amber
codon, opal codon.
ochre mutation (mutaie ochre) O mutaie non-sens produs prin
substituirea unui codon ce codific un anumit aminoacid cu un codon stop,
de exemplu prin substituirea codonului CAA (pentru glutamin) de ctre
codonul UAA (ochre). O astfel de substituie determin terminarea
prematur a traducerii informaiei genetice i, implicit, sinteza unei catene
polipeptidice mai scurte. Vezi de asemenea mutation, amber mutation, opal
mutation.
octamer (octamer) 1. Secven de opt baze comune regiunilor promotor de
la eucariote (ATTTGCAT), bine conservat (secven consens). Reprezint
situsul de legare a diferiilor factori de transcripie; 2. Structura format prin
asamblarea a opt molecule de histone (cte dou molecule din fiecare din
tipurile H2A, H2B, H3 i H4), care formeaz regiunea central (miezul) a
nucleozomului.
octopine (octopin) Un derivat al aminoacizilor arginina i alanina ([N2(D-1-carboxietil)-L-arginina]). Plasmidele Ti prezente n unele tulpini de
Agrobacterium tumefaciens posed gena ce codific sinteza de octopin
localizat n regiunea ADN-T. Octopina este folosit ca marker al creterii
246
250
P
palindrome (Gr. palindromos, ntoarcere) (palindrom) Termenul definea la
origine un cuvnt, fraz sau vers, care se citete la fel de la dreapta la stnga
aa cum se citete de la stnga la dreapta. In biotehnologie, termenul se
aplic unui segment de ADN n care secvena de perechi de baze se citete
identic n ambele direcii pornind de la un punct central de simetrie. Vezi de
asemenea inverted repeat, palindromic sequence.
palindromic sequence (secven palindromic) Un segment de ADN
dublu-catenar al crei secven 5-3 este identic pe fiecare dintre catenele
de ADN. Secvena este aceeai cnd o caten este citit de la stnga la
dreapta, iar cealalt caten este citit de la dreapta la stnga. In mod tipic,
situsurile de recunoatere pentru endonucleazele de restricie de tip II sunt
palindroame. Vezi de asemenea inverted repeat, palindrome.
partial digest (digestie parial) Adugarea unei enzime de restricie la o
prob de ADN n condiii particulare, sau pentru o durat limitat, astfel
nct s fie tiate doar o parte a situsurilor int din orice molecul
individual. Digestia parial este realizat adesea pentru a obine o colecie
de fragmente de ADN cu secvene de nucleotide suprapuse, utilizate n
construirea unei bnci de gene. Vezi complete digest, library.
particle bombardment (bombardament cu particule) Sin. microparticle
bombardment. Metod de transformare larg folosit, capabil s depeasc
restriciile (limitrile) asociate cu transferul de gene mediat de
Agrobacterium i cu regenerarea de plante ntregi din protoplati
transformai. Aceast metod de transformare poate fi folosit i pentru
transformarea organitelor celulare (de exemplu, genomul plastidic este o
int atractiv pentru ingineria genetic a plantelor cultivate, datorit
exprimrii transgenelor la un nivel ridicat). Vezi de asemenea biolistics,
microprojectile bombardment, particle gun, direct gene transfer.
particle gun (tunul de particule) Vezi particle bombardment, microprojectile bombardment, biolistics, direct gene transfer.
parts per million (ppm) (pri per milion) Uniti ale oricrei substane
raportate la 1 milion de uniti echivalente, cum ar fi uniti de greutate a
substanelor dizolvate raportate la 1 milion de uniti de soluie (de
exemplu, 1 ppm = 1 mg/l).
251
passenger strand (catena pasager) Una dintre cele dou catene ale unui
ARN de interferen mic dublu-catenar (ARNsi) care nu este recunoscut de
proteina R2D2 de legare de ARN dublu-catenar i care prin urmare nu este
incorporat n complexul de ncrcare RISC (RLC, RISC-loading complex).
Totui, catena sa complementar, catena ghid, este recunoscut de R2D2 i
n final incorporat n RISC (RNA-induced silencing complex), i ghideaz
distrugerea ARN mesager complementar. Catena pasager este exclus i
distrus. Vezi de asemenea RNA-induced silencing complex.
patent (patent) Un document emis de guvern care stabilete dreptul
exclusiv al deintorului pentru o perioad definit de timp de a folosi
sau vinde o invenie. O form de proprietate intelectual.
pat gene (gena pat) Gen ce mediaz tolerana la erbicidul fosfinotricin
(glufosinat). Numeroase bacterii din sol posed gena pat (codificnd enzima
fosfinotricin acetiltransferaza), care le permite s degradeze fosfinotricinul
n sol. Gena pat a fost izolat n anul 1988 i transferat la plante prin
tehnicile de inginerie genetic. Plantele transgenice care exprim gena pat
sunt capabile s degradeze erbicidul glufosinat. Vezi de asemenea
glufosinate.
pathogen (Gr. pathos, suferin + genesis, nceput) (patogen) Un organism
ce cauzeaz o boal unui alt organism.
pBR322 (*) Unul dintre primii vectori plasmidici larg utilizat, n special
pentru clonarea ADN n E. coli. Vezi de asemenea plasmid.
PCR Abreviere pentru polymerase chain reaction. Vezi polymerase chain
reaction.
PCR additives (aditivi PCR) O serie de substane chimice organice care
sporesc amplificarea, incluznd formamida, dimetilsulfoxidul (DMSO),
glicerolul, betaina i soluia de sporire a PCR (PCRx Enhancer Solution).
Mecanismul lor de aciune este acela al scderii temperaturii de topire,
facilitnd astfel ataarea (alinierea) primerului i ajutnd ADN polimeraza
s realizeze extensia, respectiv generarea structurii secundare.
PCR multiplex (PCR multiplex, PCR simultan) Variant a PCR constnd
n utilizarea mai multor seturi de primeri ntr-un singur amestec PCR pentru
a produce ampliconi de mrimi variate care sunt specifici unor secvene
diferite de ADN. Prin intirea mai multor gene deodat, se poate obine mai
mult informaie dintr-un singur test, care altfel ar fi necesitat folosirea
reactivilor de mai multe ori i mai mult timp pentru realizarea de teste
separate. Utilizarea corect a PCR multiplex (simultan) implic optimizarea
252
phosphite triester synthesis (sinteza de fosfit-triesteri) Sin. phosphoramidite method. Una dintre cele dou metode principale (cealalt fiind
sinteza de fosfat-triesteri) pentru sinteza oligonucleotidelor. Metoda implic
legarea monomerilor de nucleozid-3-O(N,N-dialchilamino)fosforamidit.
Aceti monomeri sunt utilizai datorit rezistenei lor la hidroliz i oxidarea
la aer, care reprezint o problem n cazul celorlalte nucleozide fosfit.
phospho-diester bond (legtur fosfo-diesteric) O legtur n care un
grup fosfat se altur atomilor de carbon adiaceni prin legturi esterice.
O reacie de condensare ntre nucleotidele adiacente determin formarea de
legturi fosfo-diesterice ntre atomii de carbon 3 i 5 n ADN i ARN.
phospho-diester synthesis (sinteza fosfodisteric) O metod (elaborat de
Khorana i colab. si n anii 50) pentru sinteza de seturi de tri- sau tetradeoxiribonucleotide, care erau apoi convertite pe cale enzimatic la oligonucleotide mai lungi. Aceast metod prezenta dezavantajul formrii de
oligomeri pirofosfat i oligonucleotide ramificate la fosfatul internucleozidic.
phosphoramidite method (metoda fosforamiditic) Vezi phosphite triester
synthesis.
phosphotriester synthesis (sinteza fosfotriesteric) Una dintre cele dou
metode principale (cealalt fiind metoda fosfit-triesteric) pentru sinteza de
oligonucleotide. Metoda implic legarea chimic a nucleotidelor protejate
adecvat, n care legtura fosfodiesteric internucleotidic este protejat prin
esterificarea cu o a treia grupare.
phylogenetic tree (arbore filogenetic) O reprezentare grafic a datelor
obinute prin studii de filogenie molecular dup modelul unui arbore.
Prezint relaiile evolutive dintre secvenele de ADN, dintre gene, proteine,
sau dintre proprietile biologice ale unor organisme. Topologia (ordinea de
ramificare i lungimea ramificaiilor) este corelat proporional cu distanele
evolutive calculate.
physically-regulated promoter (promotor reglat fizic) Promotor a crui
activitate transcripional este reglat de prezena sau absena luminii sau a
temperaturii sczute/ridicate. Vezi de asemenea promoter, chemicallyregulated promoter.
phytopathogen (fitopatogen) Un organism care cauzeaz boli la plante.
phytoremediation (fitoremediere) Curarea solurilor, apei sau aerului
contaminat(e), cu ajutorul plantelor. Multe plante sunt capabile s creasc n
medii contaminate (sol, ap sau aer). Dei absorb poluanii din ap sau aer,
257
260
polyadenylation (poliadenilare) Adugarea unei secvene de acid poliadenilic la captul 3 al ARNm eucariotic dup transcripia sa (posttranscripional). Vezi de asemenea messenger RNA, transcription.
polyadenylation signal (semnal de poliadenilare) O secven nucleotidic
(cel mai adesea AAUAAA), n apropierea extremitii 3 a transcriptului
primar, care marcheaz poziia n care trebuie adugat secvena poli(A)
pe molecula matur de ARNm.
poly(A) polymerase (polimeraza poliA) Sin. polynucleotide adenylyl
transferase. Enzima care catalizeaz adugarea resturilor de adenin la
captul 3 al ARNm precursor pentru a forma coada/extensia poli(A). Vezi
de asemenea polyadenylation, polymerase.
poly-(A) tail (coad poliA, extensie poliA) Vezi polyadenylation.
polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) (electroforeza n gel de
poliacrilamid) O metod de separare a acizilor nucleici sau a moleculelor
de proteine n funcie de mrimea lor molecular. Moleculele migreaz prin
matricea inert a gelului sub influena unui cmp electric. In cazul folosirii
acestei metode pentru separarea proteinelor, n mod frecvent se adaug
detergeni cum ar fi dodecil sulfatul de sodiu (SDS) pentru a asigura o
ncrctur uniform a tuturor moleculelor. Structura secundar poate
conduce adesea la anomalii ale migrrii moleculelor. De aceea a devenit o
procedur comun denaturarea probelor de proteine prin fierbere nainte de
a fi supuse separrii prin metoda electroforezei n gel de poliacrilamid
(PAGE). In cazul acizilor nucleici, sunt adesea incorporai n gel ageni de
denaturare cum sunt formamida, ureea sau hidroxidul de mercur metil.
PAGE este folosit de asemenea pentru a separa produii reaciilor de
secveniere a ADN, caz n care gelurile folosite sunt nalt denaturate,
ntruct trebuie s fie separate molecule care difer n mrime printr-o
singur nucleotid.
polyacrylamide gels (geluri de poliacrilamid) Se refer adesea, n mod
incorect, la gelurile de acrilamid. Aceste geluri sunt obinute prin legarea
ncruciat a acrilamidei de N,N'-metilen-bis-acrilamid. Gelurile de poliacrilamid sunt folosite pentru separarea electroforetic a proteinelor i a
moleculelor de ADN i ARN. Mrgelele (perlele) de poliacrilamid
(comercializate sub denumirea Bio-gelTM) sunt de asemenea folosite ca site
moleculare n cromatografia n gel.
262
Termenul este folosit pentru a descrie ADN sau ARN. Vezi de asemenea
nucleotide.
polynucleotide adenylyl transferase (polinucleotid adenilil transferaz)
Sin. poly(A) polymerase. Vezi poly(A) polymerase.
polynucleotide kinase (PNK) (polinucleotid kinaz) O enzim izolat din
celule de Escherichia coli infectate cu bacteriofagul T4, care transfer o
grupare fosfat de la ATP pentru a fosforila extremitile 5-OH ale catenelor
de ADN sau ARN. PNK este folosit experimental pentru a marca ADN i
ARN cu 32P. Vezi de asemenea enzyme, phosphorylation.
polynucleotide ligase (polinucleotid ligaza) Sin. DNA ligase. Vezi DNA
ligase.
pomato (*) Un hibrid intergeneric ntre cartof (potato) i tomate
(tomato), obinut prin hibridare somatic (fuziune de protoplati).
positional cloning (clonare poziional) Procesul care ncepe cu cutarea
markerilor legai de un caracter particular motenit (transmis ereditar),
continu cu folosirea acelor markeri pentru identificarea localizrii
aproximative a genei responsabile de caracter, i apoi utilizarea unor
strategii variate de clonare (incluznd chromosome walking) pentru
identificarea, izolarea i caracterizarea genei. La nceput, strategia a fost
denumit genetic invers (reverse genetics), termen pe care unii l
consider ca fiind impropriu i greit (inducnd n eroare).
positive control system (sistem de control pozitiv) Un mecanism n care
pentru activarea expresiei unei gene este necesar o protein reglatoare, sau
sunt necesare cteva proteine reglatoare.
positive selectable markers (markeri de selecie pozitiv) Vezi dominant
marker selection, positive selectable marker genes.
positive selectable marker genes (gene marker de selecie pozitiv) Gene
marker de selecie care sunt dependente de substane netoxice ca substraturi
pentru cretere, sau care induc creterea celulelor sau esuturilor
transformate. Spre deosebire de markerii de rezisten la antibiotice i
erbicide, aceti markeri de selecie doar suprim creterea celulelor
netransformate. De exemplu, evenimentele transgenice pot fi selectate
utiliznd markeri ce le permit s foloseasc o anumit surs de hran. Un
astfel de marker este gena pmi, ce codific sinteza fosfomanozo izomerazei.
Celulele care au incorporat ADN strin pot fi identificate deoarece ele sunt
capabile s utilizeze manoza ca unic surs de hran. PMI a fost folosit
ca marker de selecie pentru transformarea unui mare numr de plante,
266
275
276
Q
Q beta replicase (replicaza Q beta) O ARN polimeraz ARN-dependent
derivat din bacteriofagul Q-beta. Genomul ARN al fagului Q-beta are
cteva bucle monocatenare i regiuni parial dublu catenare. Complexul
enzimatic activ (215 kDa) este format din patru subuniti, dintre care una
singur este codificat de bacteriofagul Q-beta; celelalte trei subuniti sunt
produse de celulele gazd de E. coli. Replicaza Q beta este capabil s
replice o familie limitat de molecule de ARN. Aceast enzim este
remarcabil sub trei aspecte: (1) efectueaz amplificarea de 10.000 de ori a
monocatenei de ARN de 4200 nucleotide a fagului Q-beta ntr-un interval
de timp foarte scurt; (2) replic n mod specific ARN genomic viral n
prezena excesului de ARN al gazdei; (3) copiaz n ntregime ARN-urile
matri, de la captul 3 la captul 5, fr s utilizeze primeri endogeni.
Qdot nanocrystals (nanocristale Qdot) Nanocristale compuse din
material anorganice (semiconductori), cu o absorban de 100 de ori mai
mare dect a unui colorant organic tipic i care genereaz un semnal
fluorescent de circa 200 de ori mai puternic, utilizate pentru secvenierea
genomurilor.
Q-PCR Abreviere pentru quantitative polymerase chain reaction. Vezi
quantitative polymerase chain reaction.
quantitative PCR (PCR cantitativ) Vezi quantitative polymerase chain
reaction.
quantitative polymerase chain reaction (reacia de polimerizare n lan
cantitativ) Sin. Q-PCR, kinetic PCR, real-time PCR, TaqMan technique.
O tehnic utilizat pentru msurarea cantitativ a unui produs PCR (de
obicei la fiecare ciclu de reacie, deci n timp real). Q-PCR permite s se
determine dac o secven ADN este prezent n prob i numrul de copii
ale secvenei respective. Cuantificarea se bazeaz pe detecia unor semnale
fluorescente, generate dup legarea anumitor compui (de exemplu, Sybr
Green, EvaGreen, sau probe de ADN coninnd fluorofori, cum este
TaqMan) la produsul amplificat, n stadiile iniiale ale PCR, cnd reacia de
amplificare este liniar. Reacia de polimerizare n lan cantitativ (PCR
cantitativ/n timp real) este aplicat pentru detectarea rapid a acizilor
nucleici n diagnosticarea anomaliilor (bolilor) genetice (n special a
277
278
R
RACE Abreviere pentru rapid amplification of cDNA ends (amplificarea
rapid a capetelor ADN complementar). Sin. RACE-PCR. Vezi rapid
amplification of cDNA ends.
RACE-PCR Abreviere pentru rapid amplification of cDNA ends
(amplificarea rapid a capetelor ADN complementar). Sin. RACE. Vezi
rapid amplification of cDNA ends.
radioactive labeling (marcare radioactiv) Incorporarea unui izotop
radioactiv al unui element (de exemplu, 32P, 3H, 35S) ntr-un compus chimic
pentru a urmri traseul compusului ntr-o serie de procese sau reacii.
radioisotope (radioizotop) Vezi radioactive isotope.
radiolabeled (marcat radioactiv) Vezi radioactive labeling.
RAGE Abreviere pentru rapid analysis of gene expression (analiza
rapid a expresiei genice/exprimrii genei). Vezi rapid analysis of gene
expression.
random amplified polymorphic DNA (ADN polimorfic amplificat
randomizat, ADN polimorfic amplificat la ntmplare) O tehnic bazat pe
folosirea unor primeri oligonucleotidici sintetici, scuri (de regul, formai
din 10 nucleotide), pentru PCR. Primer-ul, a crui secven a fost aleas la
ntmplare, iniiaz replicarea la nivelul situsurilor sale complementare pe
molecula de ADN, producnd fragmente de pn la circa 2 kb n lungime,
care pot fi separate prin electroforez i colorate cu bromur de etidiu. Un
primer poate s prezinte polimorfism ntre indivizi, iar fragmentele
polimorfice pot fi utilizate ca markeri.
random cloning (clonare aleatorie) O tehnic experimental de clonare, cu
grad ridicat de nesiguran i risc, prin care ADN genomic este fragmentat
mecanic la ntmplare sau supus aciunii mai multor endonucleaze de
restricie, pentru a obine un numr ct mai mare de fragmente, care sunt
recombinate cu un vector de clonare adecvat. Moleculele himere rezultate
sunt grefate aleatoriu n celule de Escherichia coli care sunt dispersate pe
suprafaa unui mediu de cultur solidificat. Fiecare bacterie care conine o
secven strin de ADN d natere unei colonii, iar n ansamblul coloniilor
dezvoltate se vor regsi toate secvenele care formau genomul iniial, grefate
la ntmplare. Aceast tehnic este utilizat pentru obinerea de bnci
279
recombinaze: Cre, Hin, RecA/RAD51, Tre, FLP. Vezi de asemenea sitespecific recombination.
recombined (recombinat) Termen ce definete situaia n care materialul
genetic exogen (strin) a fost inserat n genomul sau repliconul preexistent
n celula receptoare. Vezi de asemenea DNA recombination.
recombineering (inginerie recombinatorie)
Vezi recombinogenic
engineering.
recombinogenic engineering (inginerie recombinatorial; inginerie
recombinogenic) Termen introdus n 2001 de Ellis i colab. pentru a
desemna o tehnic de genetic i biologie molecular bazat pe sistemele de
recombinare omolog n E. coli pentru modificarea ADN. Recombinarea
este mediat de proteine fagice, fie RecE/RecT de la profagul Rac, fie Red
alpha/beta/gamma de la bacteriofagul lambda. Sistemul de recombinare
lambda Red este folosit cel mai frecvent n prezent. Aceste sisteme de
recombinare omolog mediaz recombinarea eficient a unui fragment int
(cu secvene de omologie nu mai mari de 30 perechi de baze) n construcia
ADN. Secvenele de omologie (sau braele) flancnd modificrile dorite
sunt omologe regiunilor 5' i 3' ale regiunii ce urmeaz s fie modificate.
Pentru creterea eficienei acestui proces pot fi folosite att selecia pozitiv,
ct i selecia negativ.
recon (recon) 1. Unitatea genetic de recombinare, care corespunde celei
mai mici pri din ADN interschimbabil (dar indivizibil) prin recombinare
genetic; 2. Celul viabil reconstruit prin fuziunea unui carioplast cu un
citoplast.
reconstituted cell (celul reconstituit). Sin. recon. Vezi recon.
reconstructed cell (celul reconstruit) O celul transformat viabil,
rezultat dintr-un experiment de inginerie genetic.
red biotechnology (biotehnologia roie) Se refer la aplicaiile biotehnologiei n medicin. Exemple sunt crearea (producerea) de (micro)
organisme transgenice pentru producerea de antibiotice i manipularea
genomic sau terapia genic pentru eliminarea cauzelor unor boli genetice i
nsntoirea pacienilor afectai de astfel de boli.
refugia (refugiu, refugii) Termen desemnnd zone menite s asigure
supravieuirea unor organisme, cum ar fi insectele int ale strategiilor de
control al duntorilor bazate pe proteinele toxice Bt. Refugiile sunt parte
ale conceptului de cultivare pentru prevenirea proliferrii de insecte
rezistente la pesticide. Mai devreme sau mai trziu, cultivarea pe scar larg
284
repeat unit (unitate repetat) O secven de baze care apare n mod repetat
n genom, adesea cap la cap, adic n tandem.
repetitive DNA (ADN repetitiv) Secvene de ADN care sunt prezente ntrun genom n copii multiple, uneori de un milion de ori sau chiar mai mult.
replacement (nlocuire)
Sin. gene replacement (nlocuirea genei)
Incorporarea unei transgene ntr-un cromozom n locaia ei normal prin
recombinare omoloag, nlocuind astfel gena prezent la origine n acel
locus. Vezi homogenotization.
replacement vector (vector de nlocuire) Vezi replacement vector.
replacement vector (vector de nlocuire ) Un ADN modificat care are
dou situsuri de recunoatere pentru aceeai enzim de restricie pe oricare
latur a prii sale neeseniale (partea de umplutur = stuffer). Fragmentul
de ADN ce trebuie clonat (cu o lungime maxim de 21 kpb) este produs prin
tierea (clivarea) cu aceeai enzim i nlocuiete regiunea stuffer
excizat.
replicase (replicaz)
Termen folosit iniial pentru polimeraza care
sintetizeaz molecule de ARN utiliznd o caten matri de ARN. Ins,
frecvent, termenul de replicaz este folosit pentru a desemna orice enzim
care realizeaz duplicarea unei secvene poli-nucleotidice (de ARN, sau
ADN).
replication (replicare, replicaie) 1. Repetarea unui test sau experiment, n
condiii identice, n vederea estimrii erorilor; 2. Sinteza unei molecule
purttoare de informaie (ADN sau ARN), identic unei molecule
preexistente, prin copierea unei matrie monocatenare. Vezi de asemenea
DNA replication.
replicative form (RF) (form replicativ) Configuraia molecular a
acidului nucleic viral care este matri pentru replicarea n celula gazd.
replicon (replicon) Partea unei molecule de ADN care se poate replica de
la o singur origine. Plasmidele i cromozomii bacteriilor, fagii i alte
virusuri, au n mod obinuit o singur origine de replicare (replicaie) i,
n aceste cazuri, ntreaga molecul de ADN constitue un singur replicon.
Cromozomii eucariotici au multiple origini de replicare (replicaie) i prin
urmare conin mai muli repliconi. Termenul este folosit adesea n sensul
unei molecule de ADN capabile de replicare independent; de exemplu,
vectorul navet pJDB219 este un replicon att la drojdii, ct i la E. coli.
288
ARN). Implic inseria unor nucleotide noi, deleia sau modificarea chimic
a unor baze. Se produce astfel modificarea mesajului genetic, apar noi
codoni start (iniiatori) sau codoni stop (de terminare a sintezei), avnd ca
rezultat codificarea altor proteine funcionale.
RNAi Abreviere pentru RNA interference. Vezi RNA interference.
RNA interference (RNAi) (interferena ARN) Termen introdus de Andrew
Fire i Craig Mello (1998) pentru a descrie ce se ntmpl atunci cnd
catene scurte de ARN (complementar) dublu-catenar (dsRNA) sunt
introduse n celule vii. Aceast interaciune, care are loc fie dup inseria
(fizic) a ARN dublu catenar, fie dup modificarea genetic a organismului,
face ca celulele organismului s produc ele nsele acel ARN dublu catenar
nou. De exemplu, inginerii geneticieni pot utiliza ARN polimeraza T7
pentru a provoca (determina) producerea unor astfel de molecule dublu
catenare de ARN n celule vii. Dac acele molecule de ARN dublu catenar
sunt relativ lungi, ele sunt clivate de enzimele cunoscute ca ribonucleaze
ARN-azice III dimerice (denumite de asemenea enzime dicer) n
segmente cu o lungime de aproximativ 21 pn la 25 pb, denumite ARN-uri
scurte de interferen. Aceste ARN-uri (specifice anumitor ARNm) fac ca
anumite enzime de tiere ale complexului de sileniere indus de ARN s
adere la moleculele de ARNm transcrise din gen, crora moleculele de
ARN dublu catenar le sunt specifice. Acele enzime de tiere taie i
marcheaz pentru distrugere ARNm transcris din gen, anihilnd astfel
efectul acelei gene. Acest efect este cunoscut sub denumirea de sileniere
genic i el persist chiar i n descendena (prima generaie) organismului
afectat (de sileniere). De aceea, ARN de interferen este unul dintre
instrumentele folosite de cercettori/inginerii geneticieni pentru a provoca
silenierea genic (sau knockout). Inc din anul 2002 au fost create prin
inginerie genetic animale care produc ARN dublu catenar ce sileniaz
anumite gene. Vezi de asemenea short interfering RNAs, dicer enzymes,
gene silencing.
RNA-only gene (gen doar ARN) Un termen folosit pentru orice gen ce
codific un ARN care nu este translat ntr-o protein. Exemple de astfel de
gene sunt cele care codific micro ARN-urile.
RNA polymerase (ARN polimeraza) Sin. transcriptase, DNA-dependent
RNA polymerase, RNA nucleotidyltransferase. O enzim ce catalizeaz
sinteza de ARN pe baza matriei de ADN. Vezi polymerase, RNA.
298
300
S
SAAT Abreviere pentru sonication assisted Agrobacterium-mediated
transformation. Vezi sonication assisted Agrobacterium-mediated
transformation.
SAGE Abreviere pentru serial analysis of gene expression. Vezi serial
analysis of gene expression.
SAGE library construction (construirea bibliotecii SAGE, construirea
bibliotecii pentru analiza n serie a expresiei genice) Vezi serial analysis of
gene expression.
SAGE library sequencing (secvenierea bibliotecii SAGE) Vezi serial
analysis of gene expression.
SAGE technology (tehnologia SAGE) Tehnologie ce permite generarea
unui profil cuprinztor al expresiei genice n orice prob dorit, coninnd
nu mai mult de 100.000 celule sau 1 g de ARN total. SAGE genereaz
msurtori mai degrab absolute dect relative ale nivelelor de abunden a
ARN, ceea ce permite compararea uoar i sigur a datelor. Au fost de
asemenea create programe informatice adaptate pentru analiza serial a
expresiei genice, respectiv pentru analiza gruprii tag-urilor. Vezi serial
analysis of gene expression.
SAM Abreviere pentru S-adenosylmethionine. Vezi sam-k gene.
sam-k gene (gena sam-k) O gen prezent n mod natural n bacteriofagul
T3 E. coli. Inseria prin inginerie genetic a genei sam-k n genomul unei
specii fructifere (de exemplu, tomate, cpun, zmeur, etc.) determin
reducerea drastic a producerii compusului chimic S-adenilmetionin
(SAM) n fructele acelei specii. In fructele soiurilor tradiionale SAM este n
mod normal convertit n acid 1-aminociclopropan-1-carboxilic (ACC).
Plantele coninnd n genomul lor gena sam-k produc fructe care se coc i
matureaz pentru consum mai lent dect fructele soiurilor tradiionale, ceea
ce determin reducerea perisabilitii i pierderilor la recoltarea i
transportul lor. Explicaia const n faptul c ACC este necesar fructelor
pentru a produce etilen, fitohormonul care declaneaz (supra)coacerea sau
nmuierea lor. Vezi de asemenea genetic engineering, ACC synthase.
sandwich hybridization (hibridizare sandwich) O metod de hibridizare
bazat pe utilizarea a dou sonde: o sond nemarcat care este ataat unui
301
suport solid (de exemplu, unei membrane de nylon); o alt sond marcat ce
servete la detectarea intei capturate. Cele dou sonde sunt proiectate s se
lege la int n regiuni diferite. Adgarea de acid nucleic int denaturat va
avea ca rezultat capturarea lui de ctre sonda de capturare. Dup splare,
prezena acidului nucleic este detectat prin adugarea celei de a doua sonde
nemarcat, care se leag ntr-o regiune diferit. Acidul nucleic int este
astfel sandwich ntre cele dou sonde. Dup splare, sunt detectate
semnalele emise de sondele marcate.
satellite DNA (ADN satelit) Partea ADN din celulele vegetale i animale
care const n secvene nalt repetitive (milioane de copii), n mod tipic n
gama de la 5 pn la 500 baze. Mii de copii apar n tandem (cap la cap) la
fiecare dintre multele situsuri de acest fel. ADN satelit poate fi izolat de
restul ADN prin centrifugare n gradient de densitate.
satellite RNA (ARN satelit) O molecul de ARN mic, capabil de autoasamblare/auto-mbinare, prezent n cteva virusuri ale plantelor, incluznd
virusul ptrii inelare a tutunului (tobacco ringspot virus). Este cunoscut
de asemenea sub denumirea de viroid.
scrambled transcript (transcript amestecat) Sin. alternatively spliced
transcript. Vezi alternatively spliced transcript.
screening (selectare, sortare, alegere) Aciunea de a selecta, sorta, alege sau
exclude, pe baza unor caracteristici sau proprieti (morfologice, structurale,
biochimice, fiziologice, genetice, etc), folosind procedee i tehnici de
investigaie specifice. Screening-ul este aplicat adesea n procesul de
selecie pentru anumite obiective (scopuri), cum sunt rezistena la boli sau
caliti agronomice mbuntite la plante, caractere de producie
mbuntite la animale, anumite proprieti enzimatice la microorganisme,
etc. Un exemplu de screening poate fi i selectarea plantelor regenerate
din celule supuse transferului de gene strine, n care transgenele se exprim
stabil.
SDS Abreviere pentru sodium dodecyl sulphate. Vezi sodium dodecyl
sulphate.
sealase (ligaz) Sin. DNA sealase, nicking-closing enzyme, DNA nickingclosing enzyme, joinase, DNA joinase, polynucleotide ligase. Termen
alternativ (folosit rar) pentru polynucleotide ligase (polinucleotid ligaz).
Vezi polynucleotide ligase.
secondary containment (restricionare secundar) Vezi biocontainment.
302
short hairpin RNA (shRNA) (ARN scurt n ac de pr) Sin. small hairpin
RNA. Vezi small hairpin RNA.
short interfering RNA (ARN de interferen scurt) Vezi small interfering
RNA.
short interspersed nuclear elements (SINEs) (elemente nucleare
mprtiate) Familii de elemente moderat repetitive, scurte (de la 150 pn
la 300 pb), la eucariote, ce apar de aproximativ 100.000 de ori ntr-un
genom. SINE par s fie copii ADN ale anumitor molecule de ARNt, create
probabil de aciunea neintenionat a transcriptazei inverse (revers
transcriptazei) n cursul infeciei cu retrovirusuri (retrovirale).
short RNA (sRNA) (ARN scurt) Oricare dintr-o serie de ARN-uri
citoplasmice i nucleare poli-adenilate, mai scurte de 200 nucleotide. Circa
20% din ARN-urile scurte sunt conservate evolutiv i probabil au funcii
celulare.
short template (matri scurt) O caten de ADN sintetizat n cursul
reaciei de polimerizare n lan, care are o secven primer la un capt i o
secven complementar celui de al doilea primer la cellalt capt.
shot gun (arm automat) Sin. gene gun, microprojectile gun. Vezi
biolistics, microprojectile bombardment.
shotgun cloning (clonarea shotgun) O strategie de clonare n care ADN
genomic este tiat (clivat) n fragmente cu o endonucleaz de restricie,
fragmentele sunt inserate ntr-un vector, iar acesta este utilizat apoi pentru a
transforma bacterii. Produsul este un mare numr de clone (bibliotec) care
conin toate, sau majoritatea genelor prezente n genomul de origine.
shRNA Abreviere pentru small hairpin RNA. Vezi small hairpin RNA.
shuttle vector (vector navet, vector bifuncional) Sin. bifunctional vector.
O plasmid capabil de replicare n dou organisme gazd diferite deoarece
poart dou origini de replicare diferite i de aceea poate fi utilizat pentru a
face naveta unor gene de la unul la cellalt. De exemplu, YEp, pJDB219,
este un vector navet capabil s se replice n E. coli (originea fiind pMB9) i
n Saccaromyces cerevisiae (originea fiind plasmida de 2 m).
sigma factor (factor sigma) Sin. factor. Subunitate a ARN polimerazelor
la procariote, care este responsabil de iniierea transcripiei la nivelul unor
secvene specifice de iniiere. Factorul se desprinde de ARN polimeraza
dependent de ADN pentru a recunoate regiunea promotor i situsul de
legare a enzimei. In timp ce ARN polimeraza continu transcrierea
(transcripia) factorul este eliberat pentru a programa legarea corect a
307
snail gut enzyme (enzima din guta de melc) Sin. helicase. Un preparat
comercial din sucul digestiv de melc folosit pentru degradarea pereilor
celulari. Este folosit n special pentru obinerea de protoplati.
snap-back DNA (refacerea ADN) Renaturarea rapid a fragmentelor de
ADN (revenirea la starea iniial).
SNP Abreviere pentru single nucleotide polymorphism. Vezi single
nucleotide polymorphism.
SNP chip (cip SNP, cip pentru polimorfisme mononucleotidice) O pies de
sticl, plastic sau silicon, pe care au fost plasate un mare numr de catene de
ADN care sunt complementare uneia sau mai multor SNP-uri (polimorfisme
mononucleotidice) cunoscute. Astfel de cip-uri SNP (cunoscute i sub
denumirea de microarray-uri/micromatrice) pot fi utilizate pentru a testa
eantioane biologice pentru prezena unui anumit SNP. De exemplu, probele
(eantioanele) de snge pot fi testate pentru prezena SNP-urilor
responsabile pentru fibroza chistic, anemia falciform (sicklemia) distrofia
muscular Duchenne, boala Tay-Sachs, etc. Vezi de asemenea singlenucleotide polymorphisms, point mutation, molecular hybridization,
microarray, DNA chip, biochip, SNP map, pharmacogenetics, pharmacogenomics, toxicogenetics.
SNP map (hart SNP) Un grup de polimorfisme mononucleotidice (SNPuri) cunoscute sau detaliate, suprapuse pe harta genomului unui organism
(de exemplu, pentru a facilita studiile genetice i populaionale, cum ar fi
susceptibilitatea la boli genetice nrudite). Vezi de asemenea singlenucleotide polymorphisms, DNA sequence, genome, mapping, map
distance, marker.
SNP markers (markeri SNP) Vezi single-nucleotide polymorphisms.
snRNA Abreviere pentru small nuclear RNA. Vezi small nuclear RNA.
snRNP Abreviere pentru small nuclear ribonucleoprotein. Vezi small
nuclear ribonucleoprotein.
S1 nuclease (nucleaza S1) O enzim ce degradeaz specific ARN sau ADN
mono-catenar la 5 mononucleotide. Nucleaza S1 este purificat din fungul
filamentos Aspergillus oryzae i folosit n stabilirea msurii n care s-a
produs reacia de hibridizare, prin ndeprtarea regiunilor nemperecheate.
Este folosit de asemenea pentru a ndeprta capetele coezive ale
fragmentelor de restricie. In cartarea S 1, regiunea codificatoare a unei gene
este detectat prin realizarea hibridizrii ARNm-ADN i ndeprtarea ADN
nemperecheat cu nucleaza S1. Vezi de asemenea nuclease.
315
SOLID
Acronim pentru sequencing by oligonucleotide ligation
detection. Vezi sequencing by oligonucleotide ligation detection.
somatic cell gene therapy (terapia genic a celulei somatice) Inlocuirea
unei gene defective (mutante) cu o copie funcional printr-o metod de
transformare (incluznd transfecia) a celulelor unui esut somatic, pentru
tratamentul unei boli genetice. In acest caz, terapia genic va avea efect
numai la pacientul supus tratamentului, gena defectiv responsabil de
apariia bolii genetice putnd fi transmis la descendeni, care prin urmare
vor putea fi afectai de boala respectiv. Vezi de asemenea somatic cell.
somatic hybridization (hibridare somatic) 1. Fuziunea asexual de
protoplati originari din celule somatice de la prini diferii din punct de
vedere genetic; 2. Hibridarea prin fuziune indus a celulelor (protoplatilor)
de la organisme cu genotipuri contrastante pentru producerea de hibrizi sau
cibrizi care conin variate amestecuri de genomuri nucleare, respectiv
citoplasmatice. Este cunoscut de asemenea sub denumirea de hibridare
parasexual (parasexual hybridization).
somatic hybrids (hibrizi somatici) Hibrizii rezultai n urma fuziunii induse
a celulelor (protoplatilor) de la organisme cu genotipuri diferite. Vezi de
asemenea somatic hybridization.
somatotrophin (somatotrofin) Sin. somatotropin. Vezi growth hormone.
somatotropin (somatotropin) Sin. somatotrophin. Vezi growth hormone.
sonication (sonicare) Distrugerea celulelor sau moleculelor de ADN supuse
unor unde sonore de nalt frecven. Este cunoscut de asemenea sub
denumirea de ultrasonicare (ultrasonication).
sonication
assisted
Agrobacterium-mediated
transformation
(transformarea mediat de Agrobacterium asistat de sonicare) O metod
simpl i cu cost redus ce permite creterea substanial a eficienei
transformrii mediate de Agrobacterium la speciile care nu sunt gazde
obinuite pentru aceast bacterie. Fenomenul de cavitaie produs de
sonicare, avnd ca rezultat formarea a mii de rni minuscule la suprafaa i
n interiorul esutului vegetal, permite bacteriilor s ptrund mai n
profunzime, n tot esutul, mrind probablitatea infectrii celulelor din
respectivul esut i implicit rata de transfer al transgenelor.
sonoporation (sonoporare) Sin. ultrasound-mediated gene transfer. Vezi
ultrasound-mediated gene transfer.
316
catenei matri. Acest tip de transcripie este rar, dar tipic pentru
mitocondrii, la care regiunea D n bucl conine doi promotori, unul pentru
transcripia catenei H i altul pentru transcripia catenei L.
synonymous substitution (substituie sinonim, nlocuire sinonim) Sin.
silent substitution. Substituia evolutiv a unei baze cu o alta n exonul unei
gene ce codific o protein, astfel nct secvena de aminoacizi produs
rmne nemodificat. Substituiile sinonime i mutaiile ce afecteaz ADN
necodificator (necodant) sunt denumite n mod colectiv mutaii silenioase.
O substituie nesinonim determin o modificare la nivelul unui aminoacid,
care poate fi clasificat ca: 1) conservativ (nlocuirea unui aminoacid cu un
altul cu proprieti fizico-chimice similare; 2) semi-conservativ (nlocuirea
unui amino-acid cu ncrctur electric negativ cu un altul cu ncrctur
electric pozitiv); radical (nlocuirea cu un aminoacid total diferit). Vezi
de asemenea base, amino acid, non-synonymous substitution.
syntesising enzymes (enzime sintetizatoare) Enzime cu rol n sinteza
catenelor de ADN pe matrie adecvate. Exist dou tipuri de astfel de
enzime: 1) Invers transcriptaze (transcriptaze inverse, revers transcriptaze),
care ajut la sinteza catenelor de ADN complementar pe matrie de ARN;
2) ADN polimeraze, care ajut la sinteza catenelor de ADN complementar
pe matrie de ADN.
synthetic promoter (promotor sintetic) Orice promotor ce conine secvene
de reglare care au fost sintetizate in vitro (de exemplu, casetele TATA,
elementele negative). Termenul sintetic este folosit de asemenea ca
sinonim pentru promotor hibrid (hybrid promoter). Vezi de asemenea
promoter.
325
T
T Abreviere pentru thymine. Vezi thymine.
TAA Codon n structura ADN, cu semnificaia codon stop (ochre).
TAC Codon n structura ADN, ce codific aminoacidul tirozin (Tyr).
tag (etichet) 1. O anumit secven de ADN strin, sau un anumit
transpozon, utilizate ca marker pentru identificarea unei anumite gene;
2. Anticorpi cuplai cu substane fluorescente sau marcai radioactiv, care
permit detectarea anumitor celule prin legarea la acestea. Vezi de asemenea
label, tag sequencing techniques.
TAG Codon n structura ADN, cu semnificaia codon stop (amber).
tagged molecules (molecule etichetate) Vezi label.
tagging (etichetare) In genetica molecular: inseria unui marker n
structura sau n vecintatea unei gene. Vezi de asemenea tag, tag sequencing
techniques.
tag sequencing techniques (tehnici de secveniere bazate pe tag-uri)
O serie de tehnici de nalt randament pentru determinarea profilului ARN,
ce permit izolarea aa numitelor tag-uri, secvenele scurte reprezentnd
(de preferat toi) produii de transcripie dintr-o celul, la un moment dat.
tailing (construirea cozii/extensiei) Procesul enzimatic, realizat in vitro,
de adugare a aceleeai nucleotide de ctre enzima transferaza terminal
(terminal transferase), la extremitile 3-hidroxil ale moleculelor dublu
catenare (duplex) de ADN. Scopul construirii extensiilor homopolimerice
este acela de a obine, dup amestecul moleculelor cu extensii (cozi)
complementare (de exemplu, dezoxiadenozin la extremitile 3-hidroxil al
unei molecule i dezoxitimidin la extremitile 5-fosfat ale altei molecule),
reunirea lor prin formarea de perechi de baze. Este cunoscut de asemenea
sub denumirea de homopolymeric tailing. Vezi de asemenea terminal
transferase.
tandem affinity purification tagging (etichetarea afinitii de purificare n
tandem) Sin. TAP tagging. O metod particular de analiz a interaciunii
proteinelor. Este creat mai nti o protein de fuziune, prin fuzionarea unei
etichete TAP (o secven scurt de aminoacizi, cunoscut) pe o protein
int n ntregime (complet) cunoscut. Apoi, proteina de fuziune este
introdus n celule vii n care sunt prezente proteinele cu care se sper c va
326
intit. Dintre strategiile folosite, cea mai eficient s-a dovedit a fi cea n
care codonul (sau codonii) iniial(i) al(ai) genei sunt deletai, evitndu-se
producerea unei proteine truncate.
target-ligand interaction screening (evaluarea interaciunii int-ligand)
O metodologie utilizat pentru selectarea (trierea) unui numr mare de
candidai (de exemplu, compui) pe baza interaciunii lor (de exemplu, prin
legare chimic) cu o int preselectat (de exemplu, o molecul receptor
prezent n membrana celular, o molecul plasat pe un bio-cip, o molecul
prezent pe suprafaa unui nematod, etc). Vezi de asemenea screening, highthroughput screening, target, receptors, bio-chip.
target site (situs int) In genetica molecular, un situs de recunoatere
specific n molecula de ADN, la nivelul cruia acioneaz endo-nucleazele
de restricie.
target site duplication (duplicarea situsului int) O secven de ADN care
este duplicat cnd se insereaz un element transpozabil; este gsit de
obicei la fiecare capt al inseriei.
TAT Codon n structura ADN sau ARNm, ce codific aminoacidul
asparagin (Asn).
TATA box (caset TATA) O secven de ADN aflat n regiunea
promotorului, bogat n adenin i timin, localizat 25-30 pb n amonte de
o gen, care este situsul de legare fie a factorilor de transcripie, fie a
histonelor (legarea unui factor de transcripie blocheaaz legarea unei
histone i invers). Este considerat miezul secvenei promotor, fiind
implicat n procesul de transcripie cu ajutorul ARN-polimerazei. Poart de
asemenea denumirea de caset Goldberg-Hogness. Vezi de asemenea
Pribnow box.
TATA homology (omologie TATA) Vezi TATA box.
tautomer (tautomer) Un izomer al unui compus organic care se formeaz
printr-o reacie chimic denumit tautomerizare, implicnd deplasarea unei
duble legturi i a unui atom de hidrogen. Tautomerii (izomerii) sunt uor
interconvertibili i exist n echilibru. Vezi de asemenea tautomeric shift.
tautomeric shift (schimb tautomeric) Transferul unui atom de hidrogen
dintr-o poziie ntr-o molecul organic, ntr-o alt poziie.
tautomerism (tautomerie) Un tip special de izomerie, care poate juca un
rol important n mperecherea non-canonic a bazelor n moleculele de ADN
i, n special, de ARN.
329
telomere associated repeats (repetiii asociate telomerelor) O regiune subtelomeric (avnd mrimea cuprins ntre 100 i 300 kb) ce conine repetiii
de mrime variabil, veritabile puncte fierbini (hot spots) de rupere i
reunire.
telomeres (telomere)
Structuri (ansambluri) constnd din secvene de
proteine i ADN care nu codific proteine, localizate la capetele
cromatidelor (cromozomilor). Telomerele sunt formate prin aciunea
telomerazei, care adaug cte o nucleotid n direcia 5 3. Constau din
secvena GGGGTT, repetat de numeroase ori, i sunt implicate n reglarea
duratei i numrului de cicluri de replicare a ADN. Implicit, servesc la
limitarea numrului maxim de diviziuni pe care le poate parcurge o celul
dat (n viaa ei). Telomerele au de asemenea un rol esenial n protejarea
capetelor cromatidelor de digestia enzimatic a ADN i mpiedicarea
fuzionrii capetelor cromatidelor. In prezent se investigheaz legtura
dintre degradarea telomerelor i procese cum sunt transformarea malign
a celulelor i mbtrnirea (senescena) celular. Vezi de asemenea
telomerase.
telomere terminal transferase (transferaza terminal telomeric) Sin.
telomerase. Vezi telomerase.
TE-mediated event (eveniment de modificare mediat de un element
transpozabil). Vezi TE-mediated variation.
TE-mediated variation (variaie mediat de un element transpozabil) Sin.
Transposable element-mediated variation. Variaia cauzat de elementele
transpozabile (TE), care se deosebete de cea cauzat de alte mecanisme
mutaionale prin diversitatea lor remarcabil i gradul n care inducerea lor
este reglat att de gazd, ct i de elementul transpozabil n sine.
Variabilitatea genetic determinat de elementele transpozabile este larg,
de la modificri n mrimea i aranjamentul ntregului genom, pn la
modificri la nivelul unei singure nucleotide. Aceste modificri pot produce
efecte majore asupra caracterelor fenotipice, sau modificri mici, silenioase
(neexprimate), detectabile numai la nivel molecular. Elementele
transpozabile produc efectele lor mutagenice fie la inseria iniial n ADN
gazd, fie la excizarea lor, fr s lase vreo secven de identificare, sau
lsnd mici amprente ale prezenei lor anterioare.
template (matri) O molecul de ARN sau de ADN monocatenar pe care
este sintetizat o caten complementar de nucleotide. Un model sau un
ablon. ADN stocheaz informaia ntr-o form codificat i acioneaz ca
331
355
U
U Abreviere pentru uracil (n ARN). Uracilul se mperecheaz cu adenina
n cursul transcripiei i nlocuiete timina. Metilarea uracilului are ca
rezultat producerea timinei.
UAA Codon n structura ARNm, cu semnificaia stop (ochre).
UAC Codon n structura ARNm, ce codific aminoacidul tirozin (Tyr).
UAG Codon n structura ARNm, cu semnificaia stop (amber).
UAU Codon n structura ARNm, ce codific aminoacidul tirozin (Tyr).
UBF Abreviere pentru upstream binding factor. Vezi upstream binding
factor.
UCA Codon n structura ARNm, ce codific aminoacidul serin (Ser).
UCC Codon n structura ARNm, ce codific aminoacidul serin (Ser).
UCE Abreviere pentru upstream control element. Vezi upstream control
element.
UCG Codon n structura ARNm, ce codific aminoacidul serin (Ser).
UCU Codon n structura ARNm, ce codific aminoacidul serin (Ser).
UGA Codon n structura ARNm, cu semnificaia stop (opal).
UGC Codon n structura ARNm, ce codific aminoacidul cistein (Cys).
UGG Codon n structura ARNm, ce codific aminoacidul triptofan (Trp).
UGU Codon n structura ARNm, ce codific aminoacidul cistein (Cys).
ultracentrifuge (ultracentrifug) Centrifug cu vitez mare de rotaie
folosit pentru separarea macromoleculelor (de exemplu, proteine, acizi
nucleici). Forele g ridicate (pn la 500.000 g) generate de centrifug
determin sedimentarea moleculelor conform greutii lor moleculare,
densitii i formei.
ultrasonication (ultrasonicare) Vezi sonication.
ultrasound-mediated gene transfer (transferul de gene mediat de
ultrasunete) Sin. sonoporation (sonoporare). O metod (simpl i eficient)
folosit pentru transferul de gene strine, de exemplu, n celulele neuronale.
Introducerea ADN plasmidial se face prin transfecie n celulele int ce
ader la un substrat, sau aflate n stare de flotare, disociate. Vezi de
asemenea gene transfer.
356
359
V
vaccination (vaccinare) Vezi preventive immunization.
vaccine (vaccin) Un preparat biologic care mbuntete imunitatea la o
anumit boal. Vaccinul conine n mod tipic un agent similar
microorganismului cauzator de boal i este reprezentat adesea de forme
atenuate sau omorte ale microbului, toxinelor lui sau proteinelor lui de
suprafa. Agentul stimuleaz sistemul imun al corpului s l recunoasc ca
strin, s l distrug i s l memoreze, astfel nct sistemul imun s
recunoasc mai uor i s distrug orice astfel de microorganism la o
viitoare ntlnire. Prin inginerie genetic au fost create plante care produc
vaccinuri mpotriva unor anumii patogeni, acestea reprezentnd o
alternativ foarte promitoare la vaccinurile produse prin metode
convenionale. Vezi de asemenea edible vaccines, plant expressed vaccines.
variable number tandem repeat (VNTR) (numr variabil de repetiii n
tandem) O secven scurt de ADN care este prezent ca repetiie n tandem
i ntr-un numr de copii care variaz n limite extreme de largi.
variant of uncertain significance (VUS) (variant cu semnificaie incert)
Sin. variant of unknown significance, allelic variant of unknown
significance, unclassified variant. Vezi allelic variant of unknown
significance.
variant of unknown significance (VUS) (variant cu semnificaie
necunoscut) Sin. allelic variant of unknown significance, variant of
uncertain significance, unclassified variant. Vezi allelic variant of unknown
significance.
vector (L. vehere, a purta) (vector) O plasmid sau un fag care este
utilizat() pentru a furniza ADN strin selectat pentru clonare i pentru
transferul de gene. Vezi de asemenea retroviral vectors, Ti plasmid, cosmids,
phagemids, yeast cloning vectors.
vectorless gene transfer (transfer de gene fr vector) Sin. direct gene
transfer. Vezi direct gene transfer.
vector stacked transformation (transformarea cu un vector purtnd gene
stivuite) Un proces mai precis de inserie a genelor, pentru crearea de plante
transgenice n care au fost incorporate dou sau mai multe evenimente de
transformare (cu denumirea de marc VecTranTM). Rezultatul este un
360
la virusul de la care s-a izolat gena. Utiliznd aceast strategie au fost create
plante transgenice de Papaya rezistente la virusul ptrii inelare (Papaya
ringspot virus), plante transgenice de prun i cais rezistente la virusul Plum
pox, plante transgenice de soia rezistente la virusul mozaicului soiei, plante
transgenice de mazre rezistente la virusul mozaicului mazrei, plante
transgenice de cartof rezistente la virusul A (Potato virus A) i respectiv la
virusul X (Potato virus X), etc.
viral oncogene (oncogen viral) O gen n genomul viral care contribuie
la cancerizare n animalele vertebrate gazd. Vezi de asemenea oncogene.
viral pathogen (patogen viral) Un virus cauzator de boal.
virion (virion) O particul viral infecioas. Un patogen al plantelor
constnd ntr-o molecul nud de ARN format din aproximativ 250-350
nucleotide, a cror mperechere de baze extensiv are ca rezultat un dublu
helix aproape corect. Vezi de asemenea satellite RNA.
viroid (viroid) O entitate infecioas similar unui virus, dar mai mic,
constnd doar ntr-o caten de acid nucleic, fr nveliul proteic
caracteristic virusurilor. Vezi de asemenea satellite RNA.
virulence (L. virulentia, duhoare) (virulen) Nivelul la care se exprim
capacitatea unui organism de a cauza o boal. Capacitatea relativ de
infecie a unei bacterii sau a unui virus, sau capacitatea acestora de a
nfrnge rezistena gazdei (asigurat de metabolismul ei).
virulent phage (fag virulent) Un fag (virus) care distruge gazda (bacteria).
virulence plasmids (plasmide pentru virulen)
Plasmide care sunt
patogenice pentru celula gazd (de exemplu, plasmidele Ti din celulele de
Agrobacterium tumefaciens induc cancerul bacterian la plantele
dicotiledonate). Vezi de asemenea Ti plasmid, vir genes.
virus (virus) O particul infecioas compus dintr-o capsul proteic i un
miez format dintr-un acid nucleic (ADN sau ARN), care este dependent de
un organism gazd pentru replicare. ADN sau o copie dublu-catenar a unui
genom ARN viral este integrat() n cromozomul gazdei n cursul infeciei
lizogenice sau replicat() n cursul ciclului chistic. Vezi de asemenea coat
protein, DNA, genome, host, nucleic acid, prion, RNA, tumour virus, viroid.
virus resistance (rezisten la virusuri) Unul dintre obiectivele importante
de ameliorare prin metodele moderne de biotehnologie i inginerie genetic.
Virusurile provoac multe boli la plante i sunt adesea responsabile de
pierderi mari de recolt. Dac pentru controlul majoritii patogenilor i
duntorilor pot fi folosite tratamentele chimice, pentru infeciile virale nu
362
363
W
walking (*) O metod pentru clonarea unor regiuni mari ale unui
cromozom. Pornind de la un situs cunoscut, este examinat o bibliotec de
gene pentru clone care hibridizeaz cu probele de ADN luate de la capetele
primei clone. Aceste clone sunt apoi izolate, i capetele lor sunt folosite
pentru examinarea din nou a bibliotecii. Aceste clone sunt la rndul lor
izolate i folosite capetele lor, i aa mai departe. Vezi gene walking,
chromosome walking.
wandering enzymes (enzime cltoare) Enzime de restricie (ADN
restrictaze) care, dei necesit situsuri de recunoatere specifice, fac un
numr limitat de tieri la nivelul unor situsuri aparent randomizate
(ntmpltoare), departe de situsurile de recunoatere.
weak promoter (promotor slab) Sin. low level promoter. Orice promotor
care nu permite ataarea cu frecven mare a ARN polimerazei dependent
de ADN, ceea ce face ca gena adiacent s fie transcris cu o frecven
sczut.
weed (buruian) La modul simplu, orice plant care crete ntr-un loc unde
nu este dorit. In agricultur, termenul este folosit pentru o plant care are o
capacitate bun de colonizare ntr-un mediu perturbat i, n mod obinuit,
poate concura cu o specie cultivat n acel mediu. Buruienile sunt
considerate ca fiind specii nedorite, nefolositoare din punct de vedere
economic, sau duntoare.
weevils (grgrie) Termen referitor la un numr de insecte care consum
cereale. Multe dintre grgrie prolifereaz n cerealele depozitate i n
produsele derivate din acestea (de exemplu, fina, etc). Prin inginerie
genetic au fost create plante rezistente la atacul acestor insecte. De
exemplu, prin transferul genei ce codific inhibitorul alfa amilazic s-au creat
plante de mazre rezistente la atacul de Bruchus pisorum, mortalitatea
nregistrat n stadiul larvar fiind de 93-98%. Vezi de asemenea alpha
amylase inhibitors.
western blot (*) O tehnic n care o protein este transferat dintr-un gel
electroforetic pe o membran suport de celuloz sau nilon, dup
electroforez. O molecul proteic particular poate fi apoi identificat prin
sondarea membranei suport avnd imprimate moleculele proteice (blot) cu
364
366
X
xenogenesis (xenogenez) Producerea (teoretic) de descendeni care sunt
diferii din punct de vedere genetic de prini i nenrudii din punct de
vedere genotipic cu nici unul dintre ei. Vezi genotype, transgenic.
X-gal (*) Sin. BCIG (5-bromo-4-cloro-3-indolil--D-galactopiranozid)
Un analog al lactozei care este degradat de -galactozidaz, dnd o culoare
albastr. X-gal n sine este incolor, prezena coloraiei albastre (a
produsului de hidroliz) poate fi de aceea folosit ca indicator al prezenei
unei -galactozidaze active. Identificarea uoar a enzimei active permite
folosirea genei pentru -galactozidaz (gena lacZ) ca gen raportor
(reporter) n aplicaii variate, de exemplu n selecia transformanilor.
367
Y
YAC Cromozomul artificial de drojdie, folosit ca un sistem vector
pentru clonarea fragmentelor de ADN, care pot avea lungimi de sute de
kilobaze. Vectori de clonare liniari, construii din elementele eseniale ale
cromozomilor de drojdii. Ei pot gzdui inserii de ADN strin de 200 pn
la 500 kb.
yeast (drojdie) Termenul drojdie este folosit adesea ca echivalent pentru
Saccharomyces cerevisiae, dar diversitatea filogenetic a drojdiilor este
relevat de plasarea lor att n ncrengtura Ascomycota, ct i n
ncrengtura Basidiomycota. Drojdiile sunt microorganisme eucariotice din
regnul Fungi, ncadrate n aproximativ 1.500 specii descrise. Se estimeaz
ns c au fost descrise doar 1% din totalul speciilor de drojdii. Drojdiile
care nmuguresc (drojdiile adevrate) sunt ncadrate n ordinul
Saccharomycetales. Majoritatea se reproduc asexuat prin nmugurire, doar
cteva specii reproducndu-se prin fisiune binar. Drojdiile sunt unicelulare,
chiar dac unele specii pot deveni multicelulare prin formarea unui irag de
celule mugurale conectate, denumite pseudohife sau hife false, ca la
majoritatea mucegaiurilor. Mrimea drojdiilor poate varia n limite largi
dependent de specie, n mod tipic avnd 3-4 m n diametru, dar atingnd la
unele specii peste 40 m. Specia Saccharomyces cerevisiae a fost folosit
pentru producerea pinii i fermentarea buturilor alcoolice de mii de ani.
Este una dintre cele mai profund cercetate microorganisme eucariotice, n
cercetarea din domeniul biologiei celulare moderne fiind un organism model
extrem de important. Alte specii de drojdii, cum este Candida albicans,
sunt patogeni oportuniti i pot cauza infecii la om. Recent, drojdiile au
nceput s fie folosite pentru generarea de electricitate n celule microbiene
de combustie i pentru producerea de etanol pentru industria de
biocombustibili.
yeast artificial chromosome (cromozom artificial de drojdie) Vezi YAC.
yeast cloning vectors (vectori de clonare drojdii) Drojdiile, i n special
Saccharomyces cerevisiae, sunt organismele favorite pentru clonarea i
expresia ADN. Fiind eucariote, pot fi eliminai intronii, secvenele noncodificatoare existente n majoritatea genelor eucariotice.
368
370
Z
Z-DNA (ADN-Z) Sin. zig-zag DNA (ADN zig-zag) O form a duplexului
de ADN n care dublul helix este rsucit spre stnga, n loc s fie rsucit
spre dreapta. ADN adopt configuraia Z cnd purinele i pirimidinele
alterneaz pe o singur caten, de exemplu:
5 CGCGCGCG 3 sau 5 CACACACACA 3
3 GCGCGCGC 5 sau 3 GTGTGTGTGT 5
zeptoliter (zeptolitru) Unitate de msur folosit n genetica molecular,
egal cu 10-21 litri.
ZFNs Abreviere pentru zinc finger nucleases. Vezi zinc finger nucleases.
zig-zag DNA (ADN zig-zag) Vezi Z-DNA.
zinc finger nucleases (nucleaze deget de zinc) Enzime modificate prin
inginerie, care se leag de secvene specifice de ADN i introduc modificri
la nivelul situsului de legare sau n apropierea acestuia. In anul 2009 s-a
demonstrat practic posibilitatea folosirii acestor enzime pentru crearea de
plante modificate genetic. Spre deosebire de tehnologiile de modificare
genetic bazate pe introducerea unor gene strine n genomul plantelor, care
au dat natere la numeroase controverse generate de potenialele efecte
adverse ale OMG asupra sntii i mediului (n primul rnd datorit
integrrii la ntmplare a transgenelor n genomul receptor), tehnologia
preconizat ca alternativ se bazeaz pe modificarea propriului ADN.
zoo blot (*) Hibridizarea ADN clonat de la o specie cu ADN de la alte
organisme, pentru a determina msura n care ADN clonat este conservat
evolutiv.
zoo FISH (zoo FISH) Hibridizarea in situ cu fluorescen a ADN de la o
specie pe cromozomii metafazici ai altei specii. In mod tipic, hibridizarea se
face separat pentru bibliotecile de ADN reprezentnd fiecare cromozom.
Rezultatul este un tablou fascinant al regiunilor de omologie cromozomial
ntre specii.
371
BIBLIOGRAFIE SELECTIV
Badea E.M., Sndulescu D., 2001. Biotehnologii Vegetale. Fundaia Biotech,
Bucureti
Baldi P., Hatfield W.G., 2002. DNA Microarrays and Gene Expression: From
Experiments to Data Analysis and Modeling. Cambridge University Press.
Carson S., Robertson D., 2005. Manipulation and Expression of Recombinant
DNA: A Lab Manual. Academic Press Inc.
Cartwright E.J., 2009. Transgenesis Techniques: Principles and Protocols. Humana
Press Inc.
Coco R., Bohlea L., Raicu F., Neago D., 2006. Metode i Principii de Genetic
Molecular. Ed. Medical, Bucureti.
Cornea C.P., 2002. Inginerie Genetic. Principii de Realizare. Aplicaii. Aspecte
economice i etice. Ed. Printeh, Bucureti.
Cornea C.P., Vtafu I., Barbu A., 1999. Elemente de Inginerie Genetic. Ed. All,
Bucureti.
Covic M., tefnescu D., Sandovici I., 2011. Genetic Medical. Ediia a II-a. Ed.
Polirom, Iai, Bucureti.
Fitzgerald-Hayes M., Reichsman F., 2007. DNA and Biotechnology. The
Awesome Skill. Academic Press Inc.
Grout B.W.W., 1990. Meristem-Tip Culture. In: Methods in Molecular Biology,
Vol. 6. Plant Cell and Tissue Culture. Pollard J.W., Walker J.M. (Eds.), The
Humana Press.
Halford N.G., 2003. Genetically Modified Crops. Imperial College Press.
Herring M.Y., 2005. Genetic Engineering. Greenwood Press.
Howe C., 2007. Gene Cloning and Manipulation. Cambridge University Press.
Joyner A.L., 1999. Gene Targeting: A Practical Approach. Oxford University
Press.
Kahl G., 1994. The Dictionary of Gene Technology. John Wiley and Sons Ltd.
Kimball N., 2006. Glossary of Biotechnology and Nanobiotechnology Terms.
Fourth Edition. CRC Press, Taylor & Francis Group, Boca Raton, USA.
King R.C., Stansfield W.C., 1997. A Dictionary of Genetics. Fifth Edition. Oxford
University Press, New York.
King R.C., Stansfield W.C., Mulligan K.P., 2006. A Dictionary of Genetics.
Seventh Edition. Oxford University Press, New York.
Kmiec E.B., 1999. Gene Targeting Protocols. Humana Press Inc.
Miesfeld R.L., 1999. Applied Molecular Genetics. John Wiley and Sons Ltd.
Nair A.J., 2007. Introduction to Biotechnology and Genetic Engineering. Infinity
Science Press.
372
373
SURSE INTERNET
Allender-Hagedorn S., Hagedorn C., An Agricultural and Environmental
Biotechnology Annotated Dictionary (http://filebox.vt.edu/cals/cses/chagedor/
glossary.html)http://biotechterms.org/
http://filebox.vt.edu/cals/cses/chagedor/glossary.html
http://groups.molbiosci.northwestern.edu/holmgren/Glossary/Definitions/Def-A/
Index-A.html
http://www.argosbiotech.de/600/argos_int/glossary/glossary_Z.htm
http://www.biology-online.org/dictionary/
http://www.expertglossary.com/food-biotechnology/definition/
http://www.exploratorium.edu/genepool/glossary.html
http://www.fao.org/biotech/index_glossary.asp
http://www.fao.org/docrep/003/x3910e/x3910e16.htm
http://www.genetrap.org/tutorials/overview.html
http://www.gmo-safety.eu/en/glossary/
http://www.monsanto.com/biotech-gmo/asp/glossary.asp
http://www.nhgri.nih.gov/DIR/VIP/Glossary/pub_glossary.cgi
http://www.ornl.gov/sci/techresources/Human_Genome/publicat/primer/toc.html
http://www.ucl.ac.uk/~ucbhjow/b241/glossary.html
http://www.wordreference.com/enro/biotechnology
http://www.worthington-biochem.com/tissuedissociation/glossary.html
http://ghr.nlm.nih.gov/glossary/browse/f
374