Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
BIOMOLECULE – MACRO- ȘI
MICROMOLECULE, MOLECULE
COMPLEXE
AMINOACIZII: STRUCTURA,
CLASIFICAREA, ROLUL BIOLOGIC
Silvia Stratulat
conferențiar universitar
Obiectivele:
1. Introducere în biochimie. Biochimia structurală, metabolică și clinică și
sarcinile lor. Importanța biochimiei pentru educația și practica medicală.
2. Biomolecule – macro- și micromolecule, molecule complexe.
3. Noțiuni de grupă funcțională. Tipurile de grupe funcționale specifice
biomoleculelor. Caracteristica lor generală.
4. Tipurile de legături chimice specifice biomoleculelor. Caracteristica lor
generală.
5. Aminoacizii – rolul în organismele vii. Aminoacizii proteinogeni și
neproteinogeni.
6. Clasificarea aminoacizilor după structura chimică, proprietățile fizico-
chimice, importanţa biologică.
7. Stereoizomeria, solubilitatea și proprietățile acido-bazice ale aminoacizilor.
8. Teoria polipeptidică a structurii proteinelor. Proprietățile legăturii peptidice.
Notarea şi citirea aminoacizilor în peptide şi proteine. Aminoacizii N- și C-
terminali.
Biochimia:
• pentru prima dată ca termen a fost introdus in 1903
de către Carl Neiberg.
Metale (Na, K,
Ca, Mg, Zn, Mn, Nemetale
C, H, O, N, P и S Fe, Cu, Cr, V, (Cl, I, F, Br)
Мо)
Clasificarea bioelementelor (după
conținutul lor în organism):
Bioelemente
Macroelemente Microelemente
Oxigenul 65 45.5
Carbonul 18.5 12.6
Hidrogenul 9.5 7
Azotul 3.2 2.1
Calciul 1.5 1.05
Fosforul 1 0.7
Potasiul 0.4 0.14
Sulful 0.3 0.175
Sodiul 0.2 0.105
Clorul 0.2 0.105
Magneziul 0.1 0.035
ROLUL
Macr
obioe
leme
ntul
Legătura
covalentă
polară
H2O
NH3
HCl Legatura covalenta polara
C-O perechea de electroni comună este deplasată către
atomul de oxigen care este mai electronegativ decît
C-N
atomul de carbon
C-S
Tipuri de legături chimice
Legătura
covalentă
donor-
acceptor
Legăturile
ionice- prin
atractia
electrostatica
dintre ioni de
semn contrar
(pozitivi și
negativi)
NaCl
Na2CO3
În contact cu H2O –
disociază ușor
Tipuri de legături chimice
Legăturile
de
hidrogen
Interacțiuni
hidrofobe
PARTICULARITĂȚILE MATERIEI VII
PARTICULARITĂȚILE MATERIEI
VII
PARTICULARITĂȚILE MATERIEI VII
• Gradul superior de organizare structurală (caracterizat
prin structura compusă şi diversitatea de molecule)
• Funcţia strict determinată şi sensul său specific pentru
fiecare parte componentă.
• Capacitatea de a transforma şi a utiliza energia
• Schimbul de substanţe cu mediul înconjurător şi
autoreglarea transformărilor chimice.
• Capacitatea de autoreplicare sau transmitere a
informaţiei genetice.
CARACTERISTICA GENERALĂ A AMINOACIZILOR
• Sunt derivați aminați ai acizilor organici, astfel
• Conțin obligator o grupare carboxil (-COOH) și o grupare
amino (-NH2)
Aminoacizii
Proteinogeni Neproteinogeni
– sunt elemente – nu se regăsesc în
structurale ale proteinelor structura proteinelor
Codificați genetic
Necodificați – nu sunt codificați în
- 20 aminoacizi, ADN și se formează după sinteza
sunt codificați în ADN proteinei prin modificări ale celor
de codoni specifici codificați
AA proteinogeni, codificați genetic
AA proteinogeni necodificați
(modificați posttranslațional)
AA neproteinogeni
1. Nu sunt prezenți în proteine
2. Au alte funcții biologice
- Aminoacizii (AA)
• unităţi fundamentale ce participă la sinteza unei proteinelor
• sunt de tip -aminoacizi.
Conțin, atașați la atomul de carbon-:
gruparea carboxil (-COOH)
gruparea amino (-NH2)
radicalul (R)
Stereoizomeria aminoacizilor
• Două molecule sunt stereoizomeri dacă sunt
formate din aceiași atomi, conectați în aceeași
secvență, dar atomii sunt poziționați diferit în
spațiu.
• Diferența dintre stereoizomeri poate fi observată
numai atunci când este luată în considerare
aranjarea tridimensională a moleculelor.
• Stereoizomerii pot fi împărțiți în izomeri optici și
geometrici.
Stereoizomeria aminoacizilor
• Molecule chirale sunt molecule ce dețin centre chirale (un
atom de carbon asimetric), care este un atom de carbon la
care sunt atașate 4 grupe funcționale diferite, deci el este
completamente asimetric
• Toți -aminoacizii (cu excepția glicinei) conțin un α-carbon
chiralic și formează L- și D- stereoizomeri, care sunt
imaginea în oglindă unul al celuilalt
glutamină
Acizi - Asp (acid aspartic) și Glu (acid glutamic)
Bazici - Lys (lizină), Arg (arginină) și His (histidină)
Imino - Pro
CLASIFICAREA AA
în corespundere cu structura chimică a radicalului
Ciclici și alifatici
Ciclici:
(a) homociclici
(b) heterociclici
Ciclici:
(c) aromatici
(d) non-aromatici
CLASIFICAREA AA:
Esențiali Neesențiali
(dispensabili):
indispensabili: Glicina
Valina* Semiesențiali Alanina
Leucina* (semi- Prolina
Izoleucina* dispensabili): Serina
Fenilalanina* Tirozina
Triptofanul* Arginina* Cisteina
Asparagina
Metionina* Histidina*
Glutamina
Treonina*
Acidul aspartic
Lizina*
Acidul glutamic
Nu se sintetizează în Se sintetizează în
organism, e necesar sa-i organism, dar în cantități Se sintetizează în
primim cu alimentele insuficiente, e necesar organism
sa-i primim cu alimentele
AA structura chimică
Glicina
Alanina
Serina Cisteina
AA structura chimică
Tirozina
Fenilalanina
AA structura chimică
Triptofan
Histidina
AA structura chimică
Treonina
Metionina
AA structura chimică
Izoleucina
Arginina
Valina
AA structura chimică
Leucina
Lizina
AA structura chimică
Acid glutamic
Acid aspartic (aspartat)
(glutamat) -Glu
Asp
Prolina
AA nepolari sau hidrofobi
AA polari sau hidrofili neutri
AA polari sau
hidrophili acizi
(cu sarcină
negativă)
AA polari sau
hidrophili bazici
(cu sarcină
pozitivă)
Proprietăţile acido-bazice ale -
aminoacizilor
R
+H N CH
3
-
COO
Amfion
(ion bipolar)
În condiții de pH fiziologic, în soluţii apoase -aminoacizii
există în formă de ioni bipolari (amfiioni):
• gruparea amino este protonată (NH2 + H+ → NH3+) – are
proprietăti bazice – este acceptor de protoni;
• gruparea carboxil este disociată (deprotonată) (COOH →
COO‒ + H+) – are proprietăți acide – este donor de protoni;
Astfel, aminoacizii posedă proprietăți amfotere - și de bază, și
de acid.
PROPRIETĂȚILE ACIDO-BAZICE ALE α-AA
1. În soluție acide (pH <7) AA este protonat și există în formă de cation (+);
2. În soluție bazică (pH> 7), AA este deprotonat și există în formă de anion
(‒)
• Datorită capacităţii lor de a disocia ca anioni sau cationi, AA se pot deplasa
sub acţiunea unui câmp electric, astfel:
• -în mediu acid - AA migrează spre catod,
• - în mediu bazic - spre anod
3. la un pH intermediar, AA este echilibrat între formele anionică și cationică
și există în forma unui ion neutru, bipolar (zwitterion) – aceasta este
starea izoelectrică a -AA.
2. Acest pH este numit punct izoelectric al AA (pI).
PROPRIETĂȚILE ACIDO-BAZICE ALE α-AA
1. Lanțurile ce conțin:
‒ de la 2 până la 10 aminoacizi se numesc oligopeptide:
2 aminoacizi - dipeptidă;
3 aminoacizi- tripeptidă; etc.
• 2 etape:
• A. determinarea compoziției AA
• B. determinarea succesiunii AA
Determinarea compoziției
AA în proteină
1. Hidroliza acidă completă (fierberea proteinei în soluţie de acid
clorhidric)