Reacia PCR prezint trei etape:

Denaturarea ;
Alinierea ;
Extensia.
Etapa de denaturare const n nclzirea amestecului de reacie (94C, 3minute )n scopul
desfacerii structurii ADN de la dublu catenar, la monocatenar.
Hibridizarea sau alinierea primerilor const n asigurarea temperaturii necesare
procesului de ataare a primerilor oligonucleotidici la zonele complementare de pe catena de
ADN tinta
. Faza de extensie sau elongare presupune sinteza segmentului de ADN i este realizat,
de obicei la 72C, temperatur la care Taq polimeraza funcioneaz optim [319; 320].
Aparatul folosit pentru amplificare este denumit thermal cycler care are proprietatea de a
repeta automat parametrii de timp i temperatur a celor trei trepte i de a le relua ciclic ntr-un
numr de circa 30-50 de ori. Numrul mare de cicluri de amplificare a fragmentului de ADN din
locusul genei, permite obinerea a peste un miliard de copii ale genei de analizat.