Imagistica Medicala

Curs 1: Introducere
_____________________

Gabriela Niculescu
 Sumar
Acest curs prezinta o introducere in principiile fizice,
matematice si al algoritmilor care stau la baza diverselor
sisteme moderne de imagistica medicala folosite in aplicatiile
clinice.

Se vor prezenta fundamentele radiografiei cu raze X, X-ray

tomografie computerizata (CT), imagistica nucleara:
tomografie computerizata cu emisie de fotoni (SPECT) si
tomografie cu emisie de pozitroni (PET), imagistica prin
rezonanta magnetica (MRI) si imagistica cu ultrasunete (US).
Se vor introduce concepte de baza necesare in analiza imaginilor
medicale.
 Obiective

La sfarsitul cursului veti fi capabili sa:

recunoasteti diferitele sisteme de imagistica si elementele de

baza ale acestora

descrieti cele mai frecvente tehnici pentru generarea imaginilor

medicale

intelegeti principiile fizice, avantajele si limitarile fiecarei

modalitati de imagistica medicala

identificati proprietatile fizice sau fiziologice ce pot fi masurate

cu fiecare modalitate

familiarizati cu tehnicile populare de analiza imaginilor

medicale, de vizualizare, segmentare etc.
 Note de curs

Fundamentals of Medical Imaging -Paul Suetens

Cambridge University press, 2nd Ed.

Materiale:

http://fim.curs.pub.ro/2016/ImagisticaMedicala
 Notare

50 % - laborator
40% prezentare articol
10% teste laborator

50% - verificare finala

20% recenzii articole predate la timp
30% examen

Promovati: laborator peste 46 puncte

examen peste 26 puncte
Conceptul de imagistica medicala
 Clasificarea modalitatilor de imagistica
Pe baza energiei sursei de radiatii

Pe baza locatiei sursei de radiatii: extern, intern, combinatie

Modalitati de imagistica
 Istoric: raze X
Wilhelm Conrad Roentgen (1845-1923)

8 Nov 1895: descopera razele X

22 Nov1895: prima imagine cu raze X

Premiul Nobel in Fizica 1901

proiectie
 Istoric: tomografie computerizata CT
Achizitia mai multor proiectii in jurul
obiectului permite reconstructia unei
sectiuni transversale a obiectului.

Pionierii reconstructiei CT
1917: Johann Radon stabileste
formalismul matematic ptr tomografie-
transformata Radon
1963: Allan Cormack publica analiza
matematica de reconstructie a imaginii
tomografice
1971: Godfrey Hounsfield construieste
primul sistem tomografic si dezvolta
propria metoda de reconstructie

Hounsfield si Cormack premiul

Nobel in Medicina 1979 Radon Cormack Hounsfield
Conceptul tomografiei computerizate
 Tomografia computerizata: trecut si prezent
1971: Scanner CT axial
Siemens Sieretom CT

128 x 128 matrice

1- 4 ore timp de acizitie

1-5 zile reconstructia

imaginii

2000:Scanner Siemens

512 x 512 matrice

0.35 sec timp de achizitie

1 sec reconstructia
imaginii
 Vizualizare 3D
Reconstructia obiectelor permite:

vizualizarea din diferite unghiuri

diferite grade de intensitate MIP

- Maximum Intensity Projection

umbrirea
 Medicina Virtuala

Endoscopie, Colonoscopie, Artroscopie

Planificarea operatiilor

Terapie virtuala, platforma de invatare

 Istoric:
Istoric:
rezonanta
rezonanta
magnetica
magnetica
MRI
1946: Felix Bloch (Stanford) si Edward Purcell (Harvard)
au demonstrat rezonanta magnetica nucleara (NMR)- efectul
produs de miscarea de precesie a spinilor in jurul liniilor de
camp magnetic exterior

Bloch Purcell Lauterbur

1973: Paul Lauterbur (Stony Brook) prima imagine obtinuta cu
NMR introducand gradienti in campul magnetic
1974: Peter Mansfield prezinta formalismul matematic ptr
scanare si ptr reconstructia imaginii MRI

Lauterbur si Mansfield premiul Nobel in Medicina in 2003

Inceputul anilor 1980: primul sistem comercial MRI disponibil

1993: functional MRI demonstrat pe oameni
 Conceptul MRI
MRI masoara efectul proprietatilor magnetice ale tesuturilor

specifice fiecarui tip de tesut

specifice gradului de oxigenare a sangelui (functional MRI)

MRI foarte versatil (dar mult mai scump ca CT)

T1 densitate T2

Slice viewer
 Aplicatii MRI
Cardiac MRI

evalueaza miscarea inimii si a sistemului

cardiovascular

Diffusion Tensor Imaging

masoara difuzia apei

permite evidentierea conectivitatii fibrelor

nervoase din creier
 Aplicatii MRI
Functional MRI

permite evaluarea activitatii creierului

diagnostic si in planificarea operatiilor

Activitate in cortexul
motor datorita miscarii
ritmate a degetul stang
 Aplicatii MRI
Angiografia MR

evidentierea vaselor de sange

neinvaziva- comparativ cu CT angiografie (radiatii de 12mSv)

 Aplicatii MRI
Microscopie MR

se pot evalua volume pana la 50 mm3 (1 mm3 in MRI clinic)

folosit in experimentele cu animale mici, in locul histologiei

 Istoric:Istoric
Ultrasunete
US US
1942: Dr. Karl Theodore Dussik

transmisie cu ultrasunete ptr investigarea creierului

1955: Holmes si Howry

subiecti scufundati in apa - acustica de cuplare buna

gemeni
1959: Automatic Scanner, Glasgow
 Ultrasunete
Istoric in
USprezent

3D

Intravascular US Doppler US
 Istoric
OchiulUS
Retina -3 straturi suprapuse celule fotoreceptoare -
transforma lumina incidenta cu diferite filtre colorate

Bastonase: pe toata suprafata retinei(75-150 milione), rezolutie

mica, vederea alb/negru, foarte sensibile la intensitati joase ale
luminei
Conuri: concentrate dens in partea centrala a retinei, fovea (6-7
milioane), rezolutie mare, vederea in culori, foarte sensibile la
intensitati mari ale luminei
 Perceperea
Istoric US
culorii
Sunt trei tipuri de fotoreceptori conuri
de culoare: rosu, verde si albastru

Monitoarele au trei tunuri de culoare:

Red, Green and Blue

Se poate genera (aproape) orice

culoare pe monitor prin amestecul
RGB.
 Spatiul
Istoric
culorilor
US HSV
Modelul HSV transformare neliniara a spatiului RGB
cum e perceputa culoarea, sistem de coordonate polare HSV

Nuanta (hue): lungimea de unda dominanta-diferentierea culorilor

Saturatie: intensitatea culorii sau departarea fata de culoarea gri
Valoare: integrala peste toate lungimile de unda - diferenta intre o
culoare luminoasa si una intunecata
 Imaginea
Istoric digitala
US
Imagine digitala: grid de puncte = matrice 2D de pixeli
Rezolutia imaginii ~ numarul de pixeli de-a lungul fiecarei
dimensiuni a matricei (linear pixel density) - incorect ?

300px 150px 75px 37px

Fiecare pixel are o valoare:

un singur numar (intreg) daca e imagine alb/negru
un triplet RGB daca e imagine colorata
 Range
Istoric
dinamic
US
Cuantizarea(quantization): procesul de obtinere dintr-o variabila
continua (analog) una discreta (digitala, in biti).
Fiecare pixel e reprezentat de un numar de biti

8 bpp 4 bpp

Cate nivele de gri sunt necesare? N+1 nivele de gri I0, I1...In
Range dinamic = In/I0 (=100 > 463 nivele de gri)
Majoritatea imaginilor medicale au 4096 nivele de gri (12bpp)
 Histograma
Istoric US
Histograma probabilitatea de distributie a nivelelor de gri -
calculeaza numarul de pixeli la fiecare nivel de gri

h(v)= numarul de pixeli avand valoarea v/ numarul total de pixeli

Calitatea imaginilor medicale

http://www.sprawls.org
Istoric
Rezolutie
US
Fiecare pixel este
reprezentat de PSF (Point
Spread Function)

Rezolutie = latimea la
mijocul inaltimii maxime a
PSF (FullWidthHalfMax)

Rezolutia egala in directiile

x,y,z - LSF (Line Spread
Function)
 Contrast
Contrast - diferenta in intensitate a regiunilor alaturate din imagine
- relatia obiectului in raport cu contextul
Contrast= Amplitudinea transformatei Fourier a imaginii in functie
de frecventa spatiala

http://www.sprawls.org
 Sensibilitatea Contrastului
Defineste relatia dinte contrastul fizic al obiectului si contrastul
imaginii obtinute-caracteristica sistemului imagistic
cel mai mic contrast fizic care produce contrastul din imagine ptr
a fi vizualizat

http://www.sprawls.org
 Sensibilitatea Contrastului
Conversia si transferul contrastului determinat de caracteristicile
sistemului imagistic si de protocolul folosit.
Caracteristicile diferite ale tesuturilor dificultatea compararii
sensibilitatii contrastului a diferitelor metode imagistice

http://www.sprawls.org
 Sensibilitatea Contrastului
Cresterea sensibilitatii contrastului cresterea contrastului
imaginii cresterea vizibilitatii obiectelor

http://www.sprawls.org
 Umbrire (Blur)
Blur- limiteaza vizibilitatea detaliilor

http://www.sprawls.org
 Umbrire (Blur)
Blur- reduce vizibilitatea detaliilor/obiectelor mici, rezolutia
spatiala

http://www.sprawls.org
Vizibilitatea detaliilor in diferite metode imagistice
Cantitatea de blur exprimata in mm - latimea celui mai mic obiect
umbrit

http://www.sprawls.org
 Zgomot (Noise)
Emisia undelor electromagnetice proces stocastic zgomotul e
componenta random, intotdeauna prezent
SNR sau S/N signal to noise ratio (contrast to noise)

http://www.sprawls.org
 Zgomot (Noise)
Efectul zgomotului reduce vizibilitatea obiectelor care au
sensibilitatea contrastului redusa.

http://www.sprawls.org
 Vizibilitate redusa de zgomot si umbrire
Zgomotul - afecteaza structurile cu contrast redus
Umbrirea afecteaza structurile de dimensiuni mici

http://www.sprawls.org
 Artefacte de imagine

Majoritatea metodelor imagistice pot adauga caracteristici in

imagine care nu reprezinta o structura anatomica sau un obiect.

Un artefact nu afecteaza in mod semnificativ vizibilitatea

obiectelor si acuratetea diagnosticului, dar pot ascunde o parte a
imaginii.

O varietate de factori asociati cu fiecare metoda imagistica

poate provoca artefacte de imagine. (ex: calculul intensitatii
pixelilor esantionarea spatiului continuu cu o grila de puncte,
considerate in centrul fiecarui pixel)
Calitatea imaginilor medicale

http://www.sprawls.org
 Bibliografie

Introducere in imagistica medicala coordonator Alexandru

Morega, EdituraMatrixRom,Bucuresti2003

Aparatura medicala. Principiile fizice ale aparaturii medicale

moderne - Sonia Herman, Editura Teora, Bucuresti, 2000

Www.cs.stonybrook.edu/~mueller/
KlausMuellerStonyBrookUniversity

Fundamentals of Medical Imaging - Paul Suetens, Cambridge

University press, 2nd Ed.

http://www.sprawls.org