Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Definiii
Microbiologia = tiina care se ocup cu studiul
microorganismelor. Microorganism = organism unicelular care poate fi pus n eviden numai cu ajutorul microscopului optic sau electronic.
Istoric
sute de ani existena microbilor a fost bnuit dar prezena lor a putut fi documentat doar odat cu apariia microscopului;
Istoric
1665 Robert Hooke, un tnr cercettor englez, a fost primul care a vzut i descris fungii cu ajutorul unui microscop rudimentar.
Istoric
n 1673 Antonius van Leeuwenhoek, cercettor olandez, a observat primele microorganisme tot la un microscop propriu, rudimentar. Este considerat printele microbiologiei
Istoric
Desenele cu animalculi publicate la Londra n 1784 au zdruncinat lumea tiinific de atunci. A fost pentru prima dat cnd bacteriile au putut fi vzute.
Francesco Redi, un filosof italian, a artat c viermii nu se nasc spontan din carne, ci din oule depuse de mute.
Biblio: pg 1-3, Microbiologie medical, D Buiuc (ed), 2003, Editura Gr. T. Popa Iai
n 1859 chimistul francez Louis Pasteur discrediteaz definitiv aceast teorie prin conceperea balonului cu gt de lebd n care aerul nu avea acces i bulionul fiert putea fi pstrat indefinit fr ca n el s se devolte microorganisme.
Istoric
Intemeietorii microbiologiei:
- Descoper natura microbian a proceselor de fermentare anormal a vinului. Face legatura ntre bolile vinului i unele boli infectocontagioase la animale i om. Descoper numeroi ageni etiologici ai acestora. Realizeaz vaccinuri prin inactivarea sau atenuarea patogenitii unor microorganisme (rabie, antrax, holera ginilor).
Istoric
n 1776, Edward Jenner, medic englez, realizeaz prima vaccinare experimental mpotriva variolei. In prezent, variola este singura boal infeioas eradicat.
Istoric
n 1841, cu 30 de ani nainte de formularea teoriei germenilor, Ignaz Semmelweis introduce pentru prima dat n lume splatul pe mini i folosirea halatelor curate n maternitatea pe care a condus-o la Viena (prima aplicaie practic a antisepsiei).
Teoria germenilor
ncepnd cu 1870 Robert Koch, medic german, a evideniat agentul etiologic al antraxului, holerei i tuberculozei; Public n 1876 rezultatele experimenteloro care au stat la baza formulrii postulatelor lui Koch
fixate prin caldur i colorate cu colorani bazici. A introdus mediile solide n practica diagnosticului microbiologic. A reprodus experimental boli infecioase prin inocularea agentului etiologic la animale de laborator.
Robert Koch
A descris secvene experimentale pentru susinerea relaiei cauzale ntre un microorganism i manifestrile de boal (postulatele lui Koch): microorganismul care a determinat boala este depistat la toi bolnavii iar distribuia n organism corespunde leziunilor caracteristice bolii; - Consecine practice microorganismul care a determinat boala poate fi izolat n cultur pur i subcultivat pentru a fi studiat; - Consecine practice cultura pur inoculat la un animal receptiv reproduce boala cu leziuni specifice de unde poate fi reizolat. - Consecine practice, excepii
Istoric
Chirurgul englez Joseph Lister a folosit principiile antiseptizrii i asepsiei i a redus, n 1860, la 15% mortalitatea datorat interveniilor chirurgicale.
Alte descoperiri
1928 Alexander Fleming descoper penicilina; 1977 Gilbert i Sanger secvenializeaz ADN-ul; 1983 Mullis pune bazele reaciei de amplificare genic (PCR); 1983 Luc Montaigner i Robert Gallo descoper HIV; Microbiologi romni: Victor Babe (co-autor la primul tratat de bacteriologie) i Ion Cantacuzino (creatorul colii de microbiologie n Romnia).
Disciplinele Microbiologiei
-
Microbiologia are numeroase discipline si sub-discipline. In principal, ne vom adresa cunoaterii: Virusologiei Bacteriologiei Geneticii microbiene Parazitologiei (modul separat)
Ca discipline ale MICROBIOLOGIEI, putem enumera: - Fiziologia microorganismelor - Genetica microbian - Microbiologie celular - Microbiologia medical - Microbiologia veterinar - Microbiologia mediului -Microbiologia industrial -Microbiologia aerului, alimentului -Microbiologie farmaceutic
-Aceste domenii presupun cunoaterea unor noiuni privind nutriia i metabolismul microorganismelor, mecanisme de reproducere, vaccinologie, etc.
Conexiuni inter-disciplinare
Biochimie Fiziologie Genetic Imunologie Histologie Semiologie medical i chirurgical Cariologie Paradontologie
Lumea microorganismelor
Clasificarea bacteriilor
1. 2.
3.
Clasificarea fenotipic; Clasificarea analitic; Clasificarea genotipic; Taxonomie: clasificarea sistematic a bacteriilor n grupe ordonate.
Clasificarea fenotipic
Dup afinitatea tinctorial: Gram pozitive; Gram negative; Dup form: Sferice sau ovalare coci; Alungite bacili; Virgul vibrioni; Spiralate spirochete;
Coloratia Gram
Stafilococi: microscopie
Clasificarea fenotipic
Dup caracterele de cultur: Hemoliza, pigmentogeneza, forma, mrimea coloniilor, mirosul degajat de o cultur; Dup prezena sau absena unor markeri biochimici specifici. Serotipare: anticorpii formai fa de antigenele bacteriene unice pot fi folosii pentru identificarea lor. Dup comportamentul fa de antibiotice (patern de rezisten).
Clasificarea analitic
Regn ordin familie gen- specie subspecie. Ex. Ordin: Eubacteriales Ex. Familie: Enterobacteriaceae Ex. Gen: Escherichia Ex. Specie: Escherichia coli Ex. Specie: Fusobacterium nucleatum subsp. nucleatum
Clasificarea genotipic
Analiza materialului genetic: Raportul guanin citozin Hibridizarea ADN Analiza secvenelor nucleotidice Analiza plasmidelor Ribotipare (analiza fragmentului ARN-16S, de la
Analiza
ADN-ului cromosomal.
Lumea microorganismelor
Structuri constante material nuclear sau nucleoid citoplasm membran citoplasmatic perete celular Structuri facultative glicocalix flageli pili comuni (fimbrii) i pili sexuali endospor
STRUCTURA BACTERIILOR
STRUCTURI ESENTIALE:
Materialul nuclear Citoplasma
Membrana citoplasmatica
Peretele bacterian (exceptie:
Mollicutes - Mycoplasma)
Material nuclear
echivalentul nucleului celulelor eucariote, fr
membran nuclear i nucleol; molecul circular unic de ADN (1000-2000 m) cu structur bicatenar complementar i antiparalel; pentru a ocupa un spaiu ct mai redus, dublul helix este rulat n sens negativ sub efectul ADN-girazei;
mici, circulare de ADN, care confer avantaje selective (e.g. rezistena la antibiotice, producerea de toxine, etc.); plasmidele reprezint informaie genetic extracromozomal.
Material nuclear
funcii:
- reprezint suportul genetic al caracterelor ereditare; transmite informaia genetic la celulele fiice prin autoreplicare; transmite informaia catre ribozomi prin heteroreplicare;
STRUCTURI ESENTIALE:
Materialul nuclear Citoplasma
Membrana citoplasmatica
Peretele bacterian (exceptie:
Mollicutes)
Citoplasma
hidrogel coloidal care prezint: - o faz dispersant ce conine ap, substane organice i sruri anorganice; - o faz dispersat reprezentat de: ribozomi, mai mici dect la celulele eucariote (50S i 30S), sediul sintezelor proteice; incluzii, acumulri de substane organice sau anorganice prezente la unele bacterii (reprezint depozite de nutrieni; pot avea carcater taxonomic e.g. granulaiile de volutin prezente la Corynebacterium diphteriae).
Ribozomii
Ribozomii
Sintetizarea proteinelor
STRUCTURI ESENTIALE:
Materialul nuclear Citoplasma
Membrana citoplasmatic
Peretele bacterian (excepie:
Membrana citoplasmatic
Membrana citoplasmatic
Membrana citoplasmatic
funcii:
STRUCTURI ESENTIALE:
Materialul nuclear Membrana citoplasmatica
Citoplasma
Peretele bacterian (excepie: nu
Peretele celular
membrana citoplasmatic; structura sa diferit condiioneaz comportamentul bacteriilor n coloraiile difereniale: Gram i Ziehl-Neelsen; peptidoglicanul sau mureina reprezint constituentul de baz, constant prezent la bacterii (excepie chlamidiile i micoplasmele).
Coloraia Gram
Gram negativ (roii) Gram pozitiv (violet)
Structura peptidoglicanului
legate prin puni peptidice; este mai bine reprezentat cantitativ la bacteriile grampozitive; lanurile glicanice sunt formate din alternana a dou aminozaharuri: N-acetilglucozamina i acidul Nacetilmuramic; lanurile tetrapeptidice constituite din alternana unor aminoacizi n forma L sau D se leag de gruprile carboxil ale acidului N-acetilmuramic ; la bacteriile gram-pozitive unitile tetrapeptidice ale lanurilor glicanice adiacente sunt legate prin puni transversale polipeptidice.
Reeaua macromolecular alctuit din lanuri glicanice legate prin puni peptidice
Peptidoglycan
Muramic acid
Glucosamine
Peptidoglican- schematic
(sunt proteinele de legare ale penicilinei PLP analog strutural de Dala-D-ala, se fixeaz pe PLP si inhib sinteza peptidoglicanului)
Citoplasma
Membrana celulara
undecaprenol
Perete celular
Sinteza peptidoglicanului
Controlat de enzime de pe suprafaa extern a membranei citoplasmatice: - transglicozilazele, leag cele 2 zaharuri; - transpeptidazele, catalizeaz formarea subunitilor i punilor peptidice structuri care conin dipeptidul D-alanin-D-alanin. Peretele bacterian este ancorat n MC, prin lanurile de glican in formare.
Sinteza peptidoglicanului
PLP analog strutural de D-ala-D-ala; Penicilina se fixeaz pe PLP si inhib sinteza peptidoglicanului penicilina face parte dintrre antibioticele care acioneaz asupra bacteriilor prin distrugerea peretelui.
Funciile petidoglicanului
Interes medical
sensibilitatea la lizozim; este inta unor antibiotice active asupra peretelui bacterian (e.g. penicilinele); are proprieti antigenice i de adjuvant imunologic.
Forma bacteriilor
proteine de suprafa cu funcie de - adezine (implicate n ataare) sau cu - efect antifagocitar (proteina M, proteina A, proteine de
legare la fibronectin etc)
apar ca structuri fibrilare pe suprafaa celulei au urmtoarele funii: Ag de specificitate; leag ioni de Mg i enzime autolitice; se ataeaz de suprafaa celulelor eucariote (factori de
ataare/colonizare); se leag de receptori de pe suprafaa macrofagelor, cu eliberare de citokine proinflamatorii; prezint receptori pentru bacteriofagi (virusuri ale bacteriilor) sau bacteriocine (antibiotice produse de bacterii);
2 straturi asimetrice din fosfolipide; stratul extern care include LPS (lipopolizaharidul), molecul complex cu trei regiuni: lipidul A (endotoxina); core (miez) sau Ag R, de natur polizaharidic; Ag O, cu specificitate de grup, format din uniti oligozaharidice repetate; lipoproteine care leag membrana extern de peptidoglican;
formeaz pori pentru pasajul unor molecule hidrofile; proteine cu rol n transportul specific al unor molecule (vit. B12, aa, nucleozide); proteine receptor pentru complexul Fesiderofor, pentru bacteriofagi sau bacteriocine; proteine cu rol n patogenitate (adezine sau cu efect antifagocitar).
Membrana extern
* Membrana extern oprete accesul spre
protoplast a unor substane cu greutate molecular mare i a unor molecule hidrofobe potenial nocive. * In consecin, bacteriile gram-negative sunt mai rezistente dect cele gram-pozitive la dezinfectante, antiseptice, antibiotice.
Spaiul periplasmic
citoplasmatic; conine peptidoglican, lipoproteine, proteine de transport i enzime degradative (hidrolaze, enzime de
eliberate dup necesiti in mediul extracelular, spre deosebire de bacteriile gram-pozitive care le elibereaz imediat dup ce au fost sintetizate.
arabinogalactan, polizaharid cu unele proprieti ale endotoxinei; acizi micolici acizi grai cu catene lung (C70-C90) Complexul arabinogalactan acizi
micolici confer:
exterior un nveli care contribuie la supravieuirea in celule fagocitare (rezistent la enzimele lizozomale din fagolizozomul macrofagelor) sunt bacterii facultativ intracelulare.
- apar sub efectul unor ageni inhibitori ai peptidoglicanului (lizozim, antibiotice); - pot supravieui n medii hipertone, pot fi metabolic active dar nu pot s se multiplice; - sferoplatii, n absena agentului inductor, pot reveni la
forma de origine.
forme L
- apar spontan sau sub efectul unor ageni inductori (oc osmotic sau termic, antibiotice); - pot s se multiplice (mai lent), dnd colonii cu aspect particular (aspect de ou prjit); - pot fi reversibile sau stabile.
Consecine
Este posibil ca n medulara renal, sub efectul unor antibiotice beta-lactamice s apar sferoplati care pot explica recderi ale infeciei renale dup ntreruperea antibioterapiei.
Structuri constante material nuclear sau nucleoid citoplasm membran citoplasmatic perete celular Structuri facultative glicocalix flageli pili comuni (fimbrii) i pili comuni endospor
Glicocalix
a treia structur de nveli, constiuit din polizaharide (la Bacillus anthracis structur polipeptidic); se prezint sub dou forme: - capsula (glicocalix dens: nu poate fi separat prin centrifugare, nu
este penetrat de colorani, deci este vizibil doar in coloraii negative cu tu de India sau nigrozin) penetrat de particule colorate vizibil in ME, dup coloraii speciale rou ruteniu)
funcii: - confer rezisten la fagocitoz i ageni chimici (antibiotice); - ligant la receptorii de pe suprafaa celulelor eucariote sau suprafee inerte; - Ag de specificitate (Ag K)
Structuri constante material nuclear sau nucleoid citoplasm membran citoplasmatic perete celular Structuri facultative glicocalix flageli pili comuni (fimbrii) i pili comuni endospor
20.10
Flageli
structuri filamentoase lungi i subiri, de natur proteic (flagelina); constituii din filament flagelar flexuos, articulat printr-un croet
la corpusculul/complexul bazal - cilindru axial asociat cu unul sau dou perechi de inele (la gram-pozitivi: inelul M si S, respectiv gram-negativi: inelele M si S, la care se adaug P i L); M- flotant in ME, S supramembranar; P n stratul de peptidoglican; L flotant n ME
numrul i dispoziia flagelilor reprezint un caracter taxonomic; confer mobilitate bacteriilor (bacili, vibrioni, spirili, spirochete); prezint Ag cu specificitate de tip (Ag H).
FLAGELI (ME)
Structuri constante material nuclear sau nucleoid citoplasm membran citoplasmatic perete celular Structuri facultative glicocalix flageli pili comuni (fimbrii) i pili sexuali endospor
Pili sexuali
structuri fibrilare
n numr mai redus, mai lungi dect flagelii, cu extremitatea liber butonat; au rol n transferul ADN prin conjugare.
Structuri constante material nuclear sau nucleoid citoplasm membran citoplasmatic perete celular Structuri facultative glicocalix flageli pili comuni (fimbrii) i pili sexuali endospor
Endospor
Fungi-caractere generale
Fungii sunt un grup mare de organisme multinucleate, cu nuclei de tip eucariot, dispersai ntr-un cenocit micelial (mas citoplasmatic continu, multinucleat) si acoperit cu un perete celular polizaharidic (hemiceluloz, chitin), adesea septat.
Majoritatea fungilor sunt microorganisme saprofite care triesc pe materie organic moart. Circa 100 specii de fungi determin boli ale omului si animalelor numite micoze.
Levuri
celule ovalare sau poligonale (3-6 microni) care prin nmugurire formeaz celule fiice numite blastoconidii; - acestea se pot alungi, ramnnd nlnuite i formeaz pseudohife. - Levurile din genul Candida sunt cel mai frecvent implicate in infecii la om determin candidoze.
-
Trichophyton rubrum
Fungii dimorfi
cresc sub form de levuri la 37 C (forma patogen) i sub form filamentoas la 20 C (forma saprofit). - Fungii dimorfi (Histoplasma, Blastomyces, Sporotrix) pot determina micoze profunde sau sistemice.
-
Inmulirea fungilor se poate face asexuat sau sexuat, n ambele forme de nmulire sporularea joaca un rol important.
Inmulirea fungilor
-
n condiii favorabile conidiile sau sporii germineaz pentru a forma levuri sau hife. Modul de sporulare i tipul sporilor sunt criterii de clasificare si de identificare a fungilor.
cultur, microscopie
Microorganisme eucariote unicelulare mai mari, asemntoare celulelor animale Prezint o form de via activ numit trofozoit i o form de rezisten, cu viat latent, numit chist
Majoritatea sunt mobile prin structuri variate: cili, flageli, pseudopode Unele protozoare prezint capacitatea de a ngloba particule alimentare prin pseudopode altele, prezint un citostom
Se nmulesc att asexuat cat si sexuat
Plasmodium determina malaria (P. falciparum, P. vivax) Toxoplasma gondii - determina toxoplasmoza
Entamoeba histolytica
(de regul, fagociteaz eritrocite RBC)
Entamoeba histolytica
Toxoplasma gondii
- pisicile - gazde defintive (omul gazd intermediar)
determina toxoplasmoza
virusuri = particule infecioase acelulare, cu dimensiuni foarte mici (20-300 nm), lipsite de capaciti proprii de metabolism, care nu cresc i nu se divid, fiind replicate de o celul gazd (parazite obligator intracelular); pot parazita celule animale, vegetale, fungi, protozoare, bacterii; observarea i/sau aprecierea dimensiunii particulei virale prin microscopie elecronic, ultrafiltrare, ultracentrifugare.
reprezentat de o molecul ARN (cele mai numeroase virusuri) sau ADN; deine informaia necesar replicrii; ADN-ul are cel mai frecvent o structur bicatenar (monocatenar la parvovirusuri), liniar (circular la papovavirusuri i hepadnavirusuri); ARN-ul are cel mai frecvent o structur monocatenar (bicatenar la reovirusuri), cu polaritate pozitiv (funcioneaz ca ARNm) sau polaritate negativ (are asociat o ARN-polimeraz); constituit la unele virusuri din mai multe segmente (orthomixovirusuri, reovirusuri).
Capsida viral
complex (poxvirusuri).
Anvelopa (peplos)
virusuri cu simetrie icosaedric; deriv din sistemul membranar al celulei gazd (membrana citoplasmatic, membrana nuclear, reticul endoplasmatic); include glicoproteine codificate de genomul viral (peplomere) cu rol de:
A/H1N1); receptori pentru Fc i C3b (la herpesvirusuri); enzime (ex hialuronidaza, neurmanidaza - A/H1N1).
Replicarea virusurilor
- proces desfurat numai n celula vie parazitat; - genomul viral subordoneaz metabolismul energetic
i de biosintez al celulei pentru sinteza proteinelor virale i replicarea acidului nucleic viral; metabolismul celular poate fi subordonat total sau poate continua paralel cu sinteza componentelor virale
- adsorbia, - penetrarea n celul, - decapsidarea, - biosinteza proteinelor precoce - replicarea genomului viral, - biosinteza proteinelor tardive, - morfogeneza particulei virale, - eliberarea din celul.
Retrovirusuri
- genomul viral de tip ARN (+) este transcris ntr-o caten ADN cu participarea unei reverstranscriptaze; o polimeraz celular determin sinteza unui pregenom ADN d.c. care se integreaz n genomul celulei gazd; sub efectul unor stimuli, o ARN-polimeraz celular transcrie una din catene n ARN m.c. (+) care funcioneaz att ca ARNm ct i ca genom viral.
Virusul hepatitei B
- genomul viral este reprezentat de ADN parial d.c.; - o ADN-polimeraz viral completeaz dublul helix; - replicarea genomului viral are loc cu sinteza unui
pregenom ARN care servete ca tipar pentru sinteza ADN parial d.c. cu participarea unei reverstranscriptaze.
Replicarea HIV
Taxonomia viral