Biochimie i tehnici

de laborator.
Biofizica
Conf. Dr. Mihaela Badea
Asist univ drd. Nicusor Bigiu

Continutul disciplinei
Introducere in studiul biochimiei. Apa
Zaharide

(Monozaharide,

Oligozaharide,

Polizaharide)
Aminoacizi. Peptide. Proteine.
Enzime
Lipide si membrane
Acizi nucleici. Vitamine. Hormoni

Continutul disciplinei
Biomecanica. Termodinamica si fizica fluidelor.
Notiuni de optica
Camp electric. Camp electromagnetic. Unde.
Elemente de bioelectricitate si bioexcitabilitate.

Efectele factorilor fizici utilizati in terapie:

radioterapie, mecanoterapie, termoterapie,
crioterapie, electroterapie, magnetoterapie,
ultrasonoterapie, fototerapie.

Continutul disciplinei
Lucrari practice
- Tehnici de laborator
+ Biofizica notiuni de teorie si
aplicatii practice

Bibliografie

Coman Gh, Draghici C, Badea M., Bigiu N, Codrut

Ciurea, Biochimie Ilustrata, Editura Universitatii
Transilvania din Brasov, 2011
Coman Gh, Draghici C, Badea M., Bigiu N, Codrut
Ciurea, Biochimie Descriptiva, Editura Universitatii
Transilvania din Brasov, 2009
Coman Gh., Badea M., Draghici C., Ciurea C., Virtosu
A., Biochimie. Elemente de biochimie descriptiva si
energetica biochimica, 2005, Ed. Univ. Transilvania,
Brasov;
Coman Gh., Badea M., Draghici, C., Dumitrescu L.,
Tiut M., Biochimie. Reactii care se desfasoara in
organismele vii, Ed. Ermetic, Brasov, 2003

Bibliografie
Coman Gh., Badea M., Draghici C., Biochimie
problematizata, Ed. Lux Libris, Brasov, 2000
S. Gocan, Gh. Coman, Imunochimie analitica, Ed
Lux Libris, Brasov, 19995
Thomas M. Devlin (Editor), Textbook of
Biochemistry with Clinical Correlations, Ed. WileyLiss, Hoboken, 2006
N.V. Bhagavan, Medical Biochemistry, Harcourt
Academic Press, Burlington, 2002

Examinare
Partial 1 40% - scris traditional
Partial 2 40% - scris traditional
Examen de laborator 20% - oral
OBS prezenta la laboratoare este
OBLIGATORIE

Chimia biologic sau biochimia

aplicaie a teoriilor chimiei organice n
studiul sistemelor vii.

unul din cele mai dinamice domenii din

ansamblul tiinelor contemporane, cu
implicaii profunde n diferite ramuri ale
biologiei teoretice i aplicate.

Chimia biologic sau biochimia

tiina care studiaz materia vie i
fenomenele specifice

organizarea molecular,

compoziia chimic

corelaiile biomoleculelor componente i al

proceselor de transformare (degradare i
biosintez) a acestora, prin care se
genereaz i se utilizeaz energia necesar
manifestrilor vitale.

Metabolism celular
Reaciile organice
sistem dinamic, continuu i interdependent la nivelul
celulei vii.

au loc ntotdeauna n ap (ca solvent),

sunt catalizate de enzime
se desfoar foarte rapid, dar controlat,
temperaturi apropiate de cea a camerei.

Suma tuturor acestor reacii reprezint metabolismul

celular i asigur pe de o parte energia necesar
funciilor vitale ct i componentele celulare proprii
necesare pentru dezvoltare i regenerare.

 sistem viu un ansamblu de reacii

metabolice a cror coordonare este
asigurat prin mecanisme biochimice de
reglare i control.
bacterii primitive . om

acelai set de reacii i mecanisme chimice

servete pentru a produce funciile vieii n toate
organismele
moleculele fundamentale care parcurg aceste
ci metabolice se regsesc n toate speciile

Plante
energia (Soare)
substanele organice (sintez din CO i H O)
2
2

Animale

moleculele (mediu) oxidare energia + CO2

energia legturilor chimice, moleculelor labile

travaliul muscular,
impulsurile electrice i nervoase,
percepia senzorial,
termoreglarea
sinteza moleculelor necesare creterii i multiplicrii
celulelor.

Biosisteme
structuri organizate n trepte,
trepte cu grade
diferite de complexitate: celule, esuturi,
organe, organisme, cu variaii taxonomice;
structuri spaio-temporale ritmicitate
cu frecvene bine determinate

structuri
constituite

moleculare
pe

repetitive

principiul

identitii

(concepie de baz a geneticii moderne);

Principiile organizrii structurilor

biologice
geometrii constructive de minim energie
scderea energiei libere i travaliu maxim
(chimic, osmotic, mecanic);
sistemele biologice sunt termodinamic
deschise i ireversibile;
ireversibile

complementaritatea

structurii biomoleculelor

specificitatea

Principiile organizrii structurilor

biologice

structuri discontinue (uniti de dimensiuni

bine definite) uniti structurale de nivel
superior de organizare;
diversitatea i complexitatea au la baz
economia i simplitatea

20 aminoacizi standard,
2 baze purinice
3 baze pirimidinice.

Bioelemente
Macrobioelemente
Macrobioelement (99%)

C, O, H, N, P, S, Cl, Na, K, Ca, Mg

rol plastic structura substanelor din organism

celule i lichide biologice.

Oligobioelemente (microbioelementele)

rol important n moleculele biologic active: enzime

(Zn, Mn, Cu), hormoni (I) vitamine (Co)
hemoglobin i citocromi (Fe).

Ultramicrobioelemente

Ag, Ba, Be

Biomolecule
glucide
lipide
aminoacizi - peptide-proteine
baze azotate nucleotide - polinucleotide
vitamine
hormoni
compui macroergici

Rolul
biomoleculelor
structural
catalitic
informaional
reglator
energetic

Interacii intra i inter-moleculare

ionice
covalente polare, nepolare, covalent-coordinative
legturi de hidrogen,
van der Waals ->hidrofobe

Legturi chimice
Legturi ionice (electrostatice)

formarea ionilor pozitivi si negativi

atracia electrostatic

Legturi covalente nepolare

nu exist diferene de electronegativitate

Legturi covalente polare

exist diferene de electronegativitate ntre nemetale

Legturi covalent coordinative

de tip donor acceptor de perechi de electroni

Legturile covalente heteronucleare

proteine

zaharide

-C-N-C-

-C-O-CO

acizii nucleici - C - O - P - O - C OH

mai puin stabile situsuri de clivare

chimic n procesele de degradare.

Legturile de hidrogen
interacii necovalente care se exercit
intramolecular sau intermolecular
natur electrostatic sarcini electrice
pariale de semn opus

for de tip coulombian

Legturile de hidrogen
energie 3-7 Kcal/mol
mai puternice dect legturile van der Waals
mai slabe dect cele covalente
direcionare spaial

Legturile de hidrogen

Legturile van der Waals

se manifest ntre doi atomi aflai la
distane cuprinse ntre (3-4)
sunt mai slabe (1Kcal/mol)
mai puin specifice
distribuia neuniform n timp, a sarcinii
electrice
tranzitorie)

din

jurul

atomilor

asimetrie

(asimetria
distribuia

electronilor din jurul atomilor din apropiere.

Interaciile hidrofobe
tendina de grupare a moleculelor nepolare n
prezena apei.
se materializeaz prin eliminarea apei din
sistem
sunt nestoiechiometrice
Exemple

constituirea membranelor
interacii specifice enzim-substrat sau antigenanticorp.

Apa. Sisteme apoase

Rolul apei

structural;

mediu lichid;

stabilizator al mediului biologic;

generator de ioni hidroniu i hidroxid necesari

pentru realizarea proceselor de tamponare, de
cataliz enzimatic i hidroliz;
efector direct al reaciilor de hidratare, hidroliz,
oxidare;

mediu de vehiculare a diferitelor substane

termoregulator.

Apa. Structur
structur angular

distane egale - 0,9584

unghiul de valen - 104,54o
dipolul electric al apei
(sistem asimetric)

2-

O
+

2 legturi ntre H s i O sp3

legturi de hidrogen intermoleculare

Apa. Structur

ghea tetraedru prin intermediul

legturilor de hidrogen
la topire, se rup 15% din legturile de
hidrogen din cristalul de ghea,
la 40oC aproximativ jumtate din legturile de
hidrogen sunt distruse.

vapori moleculele de ap sunt libere,

nemaiexistnd legturi de hidrogen
intermoleculare.

Solubilitatea n ap
Compui ionici

disociere
hidratarea ionilor

Compui neionici, dar polari

legturi de hidrogen cu moleculele apei

Compui nepolari, ce posed i grupri

polare

interacii hidrofobe
micele (acizi nucleici, lipide, proteine)

hidrofil (lipofob)
hidrofob (lipofil)

HOH

HOH

Ionizarea apei
acid + e- baza
Bronsted - schimb protoni: acid - H+ baza
Lewis - schimb electroni:

caracter acid

H2O

H + HO

H2O + A
caracter bazic

H2O + H

H2O + HB

HA + HO
+

H3O

H3O + B

Molecula apei prezint caracter amfoter

 Constanta echilibrului de disociere a apei

H HO
K

H O
2

Produsul ionic al apei

K W H HO 10

14

pH = - lg [H+] - Sorensen
pOH = - lg [HO-]
Pentru apa pur (250C; 1atm)

[H+]=[HO-]=10-7 mol/L
pH=pOH = 7

mol / l
2

Sisteme apoase
apa nedisociat - concentraie molar
mare i constant
sisteme apoase conjugate acid-baz
H3O+ + A-

HA + H2O

acid

acid
baza
conjugat conjugata

baza

Sisteme tampon
mecanisme
adaugare acid
adaugare baza

A +H
+

H3O + HO

HA
-

2 H2O

Relatia Henderson-Hasselbach
-

A +H

HA

[A - ] [H ]
K
[HA]

[baza]
pH pK lg
[acid conjugat]
Punct de tamponare maxim

[baz] = [acid conjugat]

pH = pK

Titrarea unui acid slab cu o baz tare

CH3COOH + ( Na+ + HO- )

CH3COO- + Na+ + H2O

pH
E
7

(
B

A
0

0,5

Eq HO- / Eq H+

Titrarea acizilor polibazici

H3PO4, H2CO3
trepte de ionizare corespunztoare cedrilor
de protoni diferite - salturi de pH - puncte de
echivalen
intervale de tamponare - puncte de
tamponare maxim

Reglarea valorilor de pH din

organismele vii
se realizeaz prin intermediul substanelor
dizolvate manifest caracter acido-bazic
constituie cupluri de tamponare,
n care acizii i bazele lor conjugate se opun
variaiilor de pH, atunci cnd substane cu
caracter acid sau bazic, rezultate din procesele
metabolice, ptrund n lichidele biologice

Reglarea valorilor de pH din

organismele
vii
Fluidele i electroliii din organismul uman se gsesc n trei
compartimente distincte, ntre care exist posibiliti diverse
de comunicare:

fluidul intracelular;
sngele i limfa din canalele vasculare;
fluidul interstiial din esuturile nevasculare.

Pentru sngele normal uman,

uman intervalul fiziologic de pH
este 7,35-7,45.
7,35-7,45
Orice valoare a pH-ului n afara intervalului fiziologic, pentru
sngele uman, presupune existena unei stri patologice,
patologice iar
atingerea valorilor 6,8 sau 7,8 presupune moartea
individului.
individului

Acidoza
Dac valoarea pH-ului sngelui scade sub 7,35

producerea excesiva de produi cu caracter acid la

nivelul esuturilor (acidoza metabolic)
metabolic

eliminrea diminuata prin intermediul rinichiului a

metaboliilor cu caracter acid (acidoza renal).
renal

Acidoza metabolic
diabet, post prelungit, dehidratarea sever,
organismul utilizeaz proteinele proprii i
lipidele pentru obinerea energiei, n defavoarea
zaharidelor,
este datorat deficitului de bicarbonat (scderii
coninutului de dioxid de carbon plasmatic)

Acidoza renal
se produce n sindromul clinic de uremie
apare datorit scderii funciei tubulare renale
ionul de hidroniu este reinut n circuitul
sanguin
n acidoza avansat se produc depresii
nervoase, come i poate surveni i moartea.

Alcaloza
se instaleaz atunci cnd pH-ul sngelui depete
valoarea 7,45.
alcaloza se poate ntlni n ingestia excesiv a unor
medicamente cu caracter bazic sau dup vomele repetate.
alcaloza metabolic este datorat excesului de bicarbonat
(creterii coninutului dioxidului de carbon plasmatic).
n alcaloz, sistemul nervos central este neexcitat, se
instaleaz spasmul muscular, convulsiile i disfunciile
respiratorii.

Determinarea pH-ului
aplicabilitate n biologie, oceanografie,
agricultur, industrie, MEDICINA
pH-ul sngelui este aproximativ constant
(soluie tampon) un pH mai acid poate s apar
datorit alimentaiei carnate sau n urma
eforturilor musculare accentuate. Un pH mai
bazic poate s apar n urma alimentaiei
vegetariene.
la pH 6,9 saliva este activ, iar la pH mai mic (4
uniti) este inactiv.

Determinarea pH-ului
pH-ul mic al coninutului stomacal se explic
prin cantitatea de HCl existent la acest nivel.
n intestinul gros,
gros pH-ul este cuprins n
intervalul 6-7, iar la finalul digestiei este practic
neutru.
pH-ul urinei variaz n intervalul 4,5 - 8, n
funcie de metaboliii eliminai.

14

soda caustica

13
12

amoniac

11
10
9
8
7
6
5

sapun
ocean

sange f iziologic (7,35 - 7,45)

saliva
proaspat de vaca (6,5-6,6)
lapte
ploaie
matern (6,8-6,9)
apa minerala

4
suc de portocale

vin, suc de lamaie

2
1
0

suc gastric
HCl