Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Svetlana Protopop
doctor în științe medicale,
conferențiar universitar
• Ferment – din l. latină «fermentum»
(anul 1877).
• Enzimă – «еn zyme» – în drojdii.
• Enzimele sunt catalizatori biologici de natură
proteică.
Noțiuni de enzimologie
• E (enzimă,ferment).
• S (substrat) – compusul chimic supus acțiunii
unei enzime.
• P (produs al reacției) – compus chimic care se
formează în urma unei reacții catalizate de o
enzimă.
E
S →P
Asemănările enzimelor și a catalizatorilor
nebiologici
Complexe –
Simple
holoenzime
Partea proteică –
Partea neproteică
аpoenzimă
Coenzimă –
Cofactor – ioni metalici
compus organic
Grupare prostetică –
coenzima legată trainic
cu apoenzima
Centrul activ (CA) al enzimelor
• Reprezintă o porțiune a enzimei la care se
leagă substratul.
• CA este o structură spațială, adică se formează
la împachetarea lanțului polipeptidic în
structura terțiară.
Centrul activ al enzimelor
• CA al enzimelor simple constau din radicali ai
aminoacizilor:
• Ser, Thr, Tyr (–OH)
• Asp, Glu (–COO-)
• Lys (–NH3+)
• His (imidazol)
• Cys (–SH)
• CA ale enzimelor complexe conțin și coenzima.
Centrul activ ale enzimei
constă din:
• Centrul de recunoaștere și fixare a substratului.
NH2
N CH2 N CH3
CH2 CH2OH
H3C N S
N CH2 N CH3 O O
CH2 CH2 O P O P OH
H3C N S
OH OH
Rolul metabolic al ТРР:
O
CH3 C COOH CH3 C + CO2
H
O
Piruvat Aldehida acetică
O
H3C N H
N Inelul izoalocsazinic
H3C N N O
CH2
CH OH 3
Ribitol
CH2 OH
Coenzima vitaminei В2:
FMN (flavin mono nucleotid)
O
H3C N H
N
H3C N N O
CH2
CH OH 3
CH2
O
HO P O
OH
O
H3C N H
N
H3C N N O
CH2
Coenzima CH OH 3
vitaminei В2: CH2
FAD (flavin adenin O
dinucleotid) HO P O
O NH2
HO P O N N
O CH2 N
O N
OH OH
Rolul metabolic al FMN иi FAD:
Participă la reacții de oxido-reducere
O H O
H3C N H +2H+, +2e- H3C N H
N N
SH2 + S +
H3C N N O -2H+, -2e- H3C N N O
H
R R
Enzima – dehidrogenaza
SH2 + FAD S + FADH2
Exemplu de reacție cu participarea FAD
COOH COOH
CH2 CH
FAD FADH2
CH2 HC
COOH COOH
Succinat Fumarat
COOH CONH2
N N
O
HO P O OH OH
NH2
O CH2 N N
N N
O
OH OH
Coenzima vitaminei РР:
NAD+ (nicotinamid adenin dinucleotid fosfat)
H
CONH2
O CH2
N
HO P O O
O
HO P O OH OH
NH2
O CH2 N N
N N
O
OH O PO3H2
Rolul metabolic al NAD+ și NADP+:
participă la reacții de oxido-reducere
H
H H
CONH2 CONH2
+2H+, +2e-
SH2 + S + + H+
N -2H+, -2e- N
R R
NAD+ (NADP +) NADH+H+ (NADPH+H +)
forma oxidată forma redusă
Enzima – dehidrogenaza
SH2 + NAD+ S + NADH+H+
Exemplu de reacție cu participarea NAD+
COOH COOH
CH OH NAD + C O NADH+H+
CH3 CH3
Lactat Piruvat
COH CH2NH2
HO CH2OPO3H2 HO CH2OPO3H2
H3C N H3C N
Piridoxalfosfat Piridoxaminfosfat
Rolul metabolic al piridoxalfosfatului:
• Transaminarea aminoacizilor;
• Dezaminarea aminoacizilor;
• Decarboxilarea aminoacizilor;
• Transsulfurarea aminoacizilor.
Exemplu de reacție cu participarea
piridoxalfosfatului – transaminrea aminoacizilor
Histidina Hisamina
Roluil metabolic:
Reacții de reducere:
• Fe3+ → Fe2+ (în timpul absorbției fierului);
• Methemoglobina → hemoglobina;
Reacții de hidroxilare:
• Prolina → hidroxiprolina;
• Lizina → hidroxilizina.
Exemplu de reacție cu participarea vitaminei С –
reacția de hidroxilare a prolinei
OH
O COOH O COOH
C N CH2 O2 C N CH2 CO2
H H
CH2 CH2
C N C N
C O COOH
O O
COOH
Radicalul Pro în
componența Radicalul hidroxiprolinei
lanțului polipeptidic (4-Hyp)
al colagenului
Enzima – prolilhidroxilaza
Rolul metalelor în calitate de
cofactori
• Stabilizarea substratului (Mg2+-ATP reprezintă substrat
pentru kinaze) Е-S-Ме.
• Stabilizarea centrului activ al enzimei (Mg2+ servește
pentru legarea substratului la piruvatkinază) – Е-Ме-S.
• Stabilizarea structurii enzimei (Zn2+ stabilizează
structura cuaternară a alcooldehidrogenazei).
• Participă nemijlocit la cataliză (citocromii participă la
transportul electronilor).
• Activarea enzimei (Са2+ este activator al proteinkinazei
C).
Hexokinaza
Piruvatkinaza
Alcooldehidrogenaza
Clasificarea și nomenclatura
enzimelor
Denumirea trivială a enzimelor se formează:
• Denumirea substratului + terminația ”aza”
(ureaza, lipaza, nucleaza) sau
• denumirea substratului + tipul de transformare
chimică + terminația ”aza”
(lactatdehidrogenaza, piruvatcarboxilaza).
Clasificarea enzimelor
În funcție de tipul reacției chimice –
7 clase de enzime:
1. Oxidoreductaze
2. Transferaze
3. Hidrolaze
4. Liaze
5. Izomeraze
6. Ligaze (sintetaze)
7. Translocaze
Cifrul (codul) enzimei este alcătuit din 4 cifre
1 – clasa
2 – subclasa
3 – subsubclasa
Exemple:
• Dehidrogenaze AH2 + B → A + BH2
• Reductaze A + BH2 → AH2 + B
• Oxidaze AH2 + ½O2 → A + H2O
AH2 + O2 → A + H2O2
• Monooxigenaze (hidroxilaze)
AH + O2 + BH2 → A-OH + B + H2O
COOH COOH
I I
CH-OH C=O
I I
CH2 CH2
I NAD+ NADH+H+ I
CООН CООН
Malat Oxaloacetat
Glucoza Glucozo-6-fosfat
Enzima – glucozo-6-fosfataza
4. Liazele
• Catalizează reacții de scindare a legăturilor
covalente C-C, C-N, C-O (scindarea СО2,
Н2О, NН3) sau de formare a acestor legături.
• 7 subclase (în funcție de tipul legăturii chimice
sau a grupării chimice scindate/adiționate).
• Denumirea – substrat-grupă scindată sau
adiționată-aza.
Liaze
Schema generală a unei reacții catalizate de
liaze:
А → В + С или А + В → С
• Decarboxilaze
• Hidrataze/dehidrataze
• Aldolaze
COOH COOH
I I
CH CH-OH
II I
HC + H2O CH2
I I
CООН CООН
Fumarat Malat
Histidină Histamină
CH2 OPO3H2 O
CH2 OH C
O CH2 OPO3H2 H
HO C O CH OH
OH
OH CH2 OPO3H2 CH2 OPO3H2
Determinați clasa enzimei și
denumiți enzima
CH3
SH S
CH2 CH2
CH2 + N5-CH3-THF + THF
CH2
CH NH2 CH NH2
COOH COOH
Determinați clasa enzimei și
denumiți enzima
COOH COOH
CH NH2 + NH3 +ATP CH NH2 + ADP + H3PO4
CH2 CH2
CH2 CH2
COOH CONH2
Determinați clasa enzimei și
denumiți enzima
NH
C NH2 NH2
NH CH2 NH C NH2
CH2 NH2 NH
CH2
CH2 CH2 COOH CH2 COOH
CH2
CH2 CH NH2
CH NH2 COOH
COOH
Determinați clasa enzimei și
denumiți enzima
COOH COOH
CH NH2 + H2O CH NH2 + NH3
CH2 CH2
CH2 CH2
CONH2 COOH
Determinați clasa enzimei și
denumiți enzima
COOH COOH
CH NH2 + NAD+ + H2O C O + NADH+H+ + NH3
CH2 CH2
CH2 CH2
COOH COOH
Determinați clasa enzimei și
denumiți enzima
COOH
CH
CH
COOH
Specificitatea stereochimică
• Enzima catalizează transformarea substratului doar
în unul din izomerii posibili ai produsului de
reacție.
• Exemplu – succinatdehidrogenaza transformă
succinatul în fumarat, dar nu și în meleat.
↓ S →P ↑ E
• Concentrația substratului;
• Concentrația enzimei;
• Temperatură;
• pH-ul mediului.
Dependența vitezei reacției chimice de
concentrația substratului
COOH COOH
CH2 CH COOH
FAD FADH2
CH2
CH2 HC
COOH
COOH COOH
Succinat Fumarat Malonat
Mecanismul antibacterial al sulfamidelor ca
exemplu de inhibiție competitivă
• Sulfamidele sunt analogi structurali ai acidului
para-aminobenzoic ce intră în componența
acidului folic.
Mecanismul antibacterial al sulfamidelor ca
exemplu de inhibitor competitiv
• Acidul folic este o vitamină din care se
formează coenzima THF (acidul tetrahidrofolic).
• THF participă la sinteza nucleotidelor.
• Sulfamidele, fiind analogi structurali ai acidului
para-aminobenzoic, inhibă sinteza acidului folic
prin inhibarea enzimelor bacteriene ce participă
la sinteza acidului folic.
• Corespunzător, se dereglează sinteza acizilor
nucleici și se încetează dezvoltarea
microorganismelor.
Inhibiția necompetitivă a enzimelor
ATP ADP
E-OH E-OPO3H2
Enzima Enzima
defosforilată fosforilată
H3PO4 H2O
Fosfoprotein fosfataza
Fosforilarea/defosforilarea
Unele enzime sunt active în formă fosforilată,
altele – în formă defosforilată.
Exemple:
• Glicogenfosforilaza (enzima reglatoare a
scindării glicogenului) este activă în formă
fosforilată.
• Glicogensintaza (enzima reglatoare a sintezei
glicogenului) este activă în formă defosforilată.
Enzimele alosterice
Lactat Piruvat
Izoenzimele LDH
• LDH constă din 4 subunități (enzimă tetrameră) de 2
tipuri:
• М (de la muscle)
• Н (de la heart)
• 5 izoenzime ale LDH (toate combinațiile posibile):
• LDH1 – НННН (inimă, rinichi)
• LDH2 – НННМ (inimă, rinichi)
• LDH3 – ННММ (rinichi)
• LDH4 – НМММ (ficat, mușchi scheletici)
• LDH5 – ММММ (ficat, mușchi scheletici)
Importanța diagnostică a izoenzimelor
• Determinarea izoenzimelor în serul sanguin are
importanță diagnostică.
• În infarctul miocardic crește activitatea LDH1.
• În bolile ficatului crește activitatea LDH4 și LDH5.
Elecroforeza LDH