STRUCTURA PROTEINELOR Biochimia: - ca termen a fost ntrodus pentru prima dat in 1903 de ctre Carl Neiberg.

- Bios (din greac nseamn " ia!"". - este #tiin!a care studia$ ba$ele moleculare ale ie!ii. - este %tiin!a despre structura #i transformarea substan!elor c&imice' care ntr n componen!a materiei ii' procesele fi$ico-c&imice' care stau la ba$a acti it!ii itale. - este nrudit cu fi$iologia' c&imia organic dar nu este o simpl sinte$ a acestor #tiin!e.

Deosebim biohimie: - static - studia$ componen!a materiei ii #i propriet!ile compu#ilor biologici separa!i. - dinamic studia$ comple(itatea modificrilor de substan!e n organism. - funcional cercetea$ procesele c&imice ce stau la ba$a diferitelor manifestri ale italit!ii. )olul bioc&imiei n practica medical* +e plan teoretic descoperirile bioc&imiei , mbog!esc #i ad-ncesc cuno#tin!ele despre manifestrile itale. .n domeniul practicii promo ea$ progresul * cercetrilor medicale/ diagnosticului clinic de laborator/ al farmacologiei #i farmaceuticii/ al microbiologiei' irusologiei #i imunologiei. 0tudia$* -compo$i!ia c&imic a !esuturilor #i lic&idelor biologice n condi!ii fi$iologice #i patologice' -corela!iile dintre modificrile metabolice ale diferitor organe' !esuturi #i lic&ide biologice/ -dinamica indicilor metabolici n di erse stri fi$iologice (.mbtr-nire' efort fi$ic" #i n patologii 1. +articularit!ile materiei ii* gradul superior de organi$are structural (caracteri$at (caracteri$at prin structura compus #i di ersitatea de molecule" 2unc!ia strict determinat #i sensul su specific pentru fiecare parte component. Capacitatea de a transforma #i a utili$a energia 0c&imbul de substan!e cu mediul ncon3urtor #i autoreglarea transformrilor c&imice. Capacitatea de autoreplicare sau transmitere a informa!iei genetice. Metodele Metodele de studii biochimice Bioc&imia are de-a face cu obiectele ii' folosind metode e(trem de fine de separare a anumitor substan!e. - 4biect de studiu poate fi organismul integru pe care se fac conclu$ii (administrarea unor substan!e #i determinarea produselor finale' care se elimin"' - organ' !esut' celul care mai nti se supun omogeni$rii (frmi!rii" folosind omogeni$atoare speciale care le de$integrea$ pn la structuri subcelulare (nuclee' mitocondrii' li$o$omi' pero(isomi' citomembrane"' care se separ prin ultracentrifugare' apoi se e(trag structuri biomoleculare' care se ree(trag'se purific prin distilare' e aporare' diali$' e aporare' electrofore$' cromatografie' #i multe alte metode. Cele mai importante descoperiri ale secolului XX 1901 - 5 2i#er , a efectuat sinte$a artificial a proteinei' a elaborat teoria polipeptidic a structurii proteinei 6noop #i 7inen' 7ipman' 6enned8' 7enin3er au elucidat procesele de o(idare #i sinte$ a aci$ilor gra#i #i altor lipide. 9mben' :eier&of 6rebs' :.;i<<ens' =arburg ct #i 9ngel&ardt' +arnas' > ano ' au creat sc&emele diferitor ci de transformare a glucidelor #i formare n cursul acestor transformri a 5?+- ca purttor c&imic de energie. Brau#tein' 0e erin' 4re&o sc&i' Co#land' 7inen au separat multe en$ime n stare cristalin' au stabilit structura lor' mecanismele reac!iilor c&imice #i reglarea acti it!ii acestora. .n ultimii 30-@0 de ani n studiile bioc&imice au aprut modificri radicale datorit utili$rii metodelor moderne de cercetare. 5 crescut considerabil sensibilitatea #i e(actici tatea aprecierilor cantitati e a diferitor metaboli!i n e(acticitatea structurile biologice.

Proteinele: roteinele: - sunt substan!ele organice a$otate' alctuite din 55' lega!i n lan!uri prin legturi peptidice' care posed cel mai nnalt grad de comple(itate' arietate molecular' #i care pre$int specificitate de specie' de organ. -"proteios"' din greac greac nseamn "de prim rang"' pentru ia!. - ca termen folosit pentru prima dat n 1A3A de ctre sa antul german :ulder. -":a3oritatea modificrilor bioc&imice n organismele ii snt determinate de proteine . )olul biologic al proteinelor* proteinelor* 0tructural (colagenul' elastina' <eratina"/

Catalitic (amila$a' pepsina' 7;B"/ ;e recep!ie (receptorii &ormonali"/ contractil #i loc locomotor (dinamic" ,actina' mio$ina/ mio$ina/ transport #i depo$itare (Bb transport o(igenul' iar :b l depo$itea$ n mu#c&i/ transferina #i feritina transport #i depo$itea$ fierul n snge' ficat"/ reglator #i &ormonal - reglarea cre#terii #i diferen!ierii celulelor (insulina' (insulina' proteinele- represor"/ de protec!ie protec!ie fa! de corpi strini' irusuri' bacterii (imunoglobuline"/ &omeostatic , men!inerea constantelor s-ngelui (albuminele determin presiunea oncotic , cantitatea' olumul lic&idului n asele sanguine"/ de re$er ' trofic , proteinele alimentare. Teoria polipeptidic a structurii proteinei

- nnaintat n 1901 de 9mil 2i#er 9ste* +roteinele sunt substan!ele organice a$otate' alctuite din 55' lega!i n lan!uri prin legturi peptidice' care posed cel mai nnalt grad de comple(itate' arietate molecular' #i care pre$int specificitate de specie' de organ. +utem deduce principalele caracteristici ale proteinelor con!inutul de 5$ot este destul de constant (n medie 1CD din masa uscat". +re$en!a permanent a componen!ilor structurali , 55 +re$en!a legturilor peptidice ntre 55 cu a3utorul crora se leag n 7+ :asa molecular mare (de la @-E pn la cte a milioane de ;altoni". 4rgani$area structural complicat. Argumente experimentale ale teoriei polipeptidice : 9liberarea la &idroli$ a unui numr esen!ial de grupri func!ionale carbo(ilice #i aminice' care erau ocupate n formarea legturii peptidice. )eac!ia po$iti cu biuretul , do ede#te pre$en!a legturii peptidice' alte reac!ii de culoare ca Nin&idrinicdo ede#te pre$en!a alfa 55. 5nali$a )entgenostructural a permis de a edea reparti!ia resturilor de 55 din catena polipeptidic ct #i organi$area lor. 5rgumentarea de ba$ este posibilitatea de a sinteti$a proteina' care posed acti itate biologic.

Structura: primar, secundar, , secundar, teriar eriar,

Gradele de organizare ale moleculei proteice cuaternara

Aminoacizii sunt deri a!ii aci$ilor carbo(ilici la care un atom de B a fost substituit de grupa aminic. .n func!ie de po$i!ia n care a a ut loc substitu!ia destingem alfa' beta' gama #i etc. 55. 10 de aminoaci$i fundamentali proteinogeni sunt 5lfa 55 #i sunt de linia 7. AA pot fi clasificai dup urmtoarele principii:

;up structura ) lateral (n alifatici , aromatici/ substitui!i-nesubstitui!i/ dup acidul carbo(ilic' n care a fost substituit atomul de B" .n func!ie de propriet!ile fi$ico- c&imice (aci$i' ba$ici #i neutri" %i clasificarea biologic dup gradul de indespensibilitate al 55 pentru organism

Structura primar pre$int componen!a #i succesiunea aminoaci$ilor din lan!ul polipeptidic' determinat genetic. 9ste stabili$at de legturile peptidice co alente' care se formea$ la interac!iunea grupei -carbo(ilice a unui aminoacid cu -aminogrupa urmtorului aminoacid. Structura primar Proprietile legturii peptidice: este o legtur co alent coplanarea , to!i atomii grupelor peptidice se afl ntr-un singur plan 1 forme de re$onan!(ceto sau enol" po$i!ia trans a subst substituien!ilor n raport cu leg C-N capacitatea de a forma legturi de &idrogen (fiecare gr. peptidic poate forma 1 legturi de &idrogen" Principiile de descifrare a succesiunii AA-etapele: AA-etapele: &idroli$a acid a proteinelor cu determinarea calitati #i cantitati a 55. 55.

determinarea 55r 55r N #i C terminali. La determinarea AA N-terminal se utilizeaz: -metoda 0andger (cu fluordinitroben$ol" - 9dman (cu fenili$otiocianat" - en$imatic (cu aminopeptida$a" -metoda cu dansil Determinarea AA C-terminal se efectueaz prin: :etoda c&imic cu &idra$ina (metoda 5cabori" en$imatic (carbo(ipeptida$" reductori* NaBB@ sau 7iBB@ Principiile de descifrare a succesiunii AA-etapele: AA-etapele: &idroli$a selecti a proteinei prin doua metodele diferite (tripsina' c&imotripsina' pepsina" sau c&imice (cu bromura cianidic" identificarea succesiunii 55 n fragmentele ob!inute prin metoda 9dman. deducerea structurii primare prin suprapunerea segmentelor ob!inute.

Metoda lui and andger Metoda lui !dman Metoda lui Aca"ori #rice dereglare a structurii primare a proteinelor duce afectarea proprietii "iologice$ BF29? ,BF69? .n anii E0 a fost descris structura primar a &emoglobinei' ce const din C00 resturi de 55 #i dac n loc de acidul glutamic se include alina Bb de ine mai nestabil' mai ru fi(ea$ 41 ' este insolubil #i duce la apari!ia anemiei cu celule falciforme. tructura secundar repre$int modul mpac&etrii catenei polipeptidice ntr-o structur ordonat' datorit formrii legturii de B ntre grupele peptidice ale unei catene sau a catenelor n ecinate. ;up configura!ie structura secundar poate fi sub form de -elice' sau s structur .n spa!iu molecula proteic tinde s ocupe o form cu cea mai mic energie liber. Particularitile de baza ale -spiralei: orientat spre dreapta posed simetrie elicoidal/ legturile de &idrogen se formea$ ntre grupele peptidice ale primului #i ale celui de al patrulea rest de aminoacid/ radicalii laterali ai aminoaci$ilor nu particip la formarea -spiralei #i snt dispu#i n e(terior. regularitatea #i identitatea spirelor* nal!imea nal!imea unei spire constituie 0'E@ nm (E'@ 5" #i cuprinde 3'C resturi de aminoaci$i (nl!imea unui aminoacid este de 0'1E nm sau 1'E 5". 5". +eriodicitatea regularit!ii -spiralei este egal cu E spire sau cu 1A aminoaci$i. 7ungimea unei perioade este de 1'G nm.

5minoaci$ii ce diminuiea$ (mpedic" formarea elicei* +re$en!a* +re$en!a* prolinei (atomul de N nu are B #i nu e capabil s forme$e legturi de &idrogen intracatenar , se formea$ o ndoire' o nco oiere n lan!. radicalilor olumino#i ((=al' 5sp" confer o str-ngere steric a elicei" 0er' ?re , gr. 4B pot forma pun!i de B , pot ser i ca factori destabili$atori Hlu' 7i$' Bis' 5rg , apar for!e electrostatice de respingere sau atragere -structur are configura!ia curbat' care se formea$ cu a3utorul legturilor de &idrogen intercatenare n limita unor sectoare a aceluia# lan! polipeptidic sau a lan!urilor alturate. 5ceast structur se mai nume#te structur n straturi pliante. -structur poate fi de 1 tipuri* Icross formJ , particip un singur lan! -structur complet , particip 1 sau mai multe catene' care pot fi* - paralele (N-termina!iile catenelor polipeptidice snt ndreptate n aceea#i direc!ie" - antiparalele (N-termina!iile snt ndreptate n diferite direc!ii". distan!a ntre 1 resturi de aminoaci$i este de 3'E 5

0tructura ter!iar repre$int modul de mpac&etare a 7+ n spa!iu tridimensional. proteinele se mpart n globulare #i fibrilare. se formea$ datorit interac!iunii dintre radicalii 55 situa!i la distanta. 7egturile ce stabili$ea$ structura ter!iar* 7egturile co alente* - disulfidice' - pseudopeptidice - esterice 7egturile polare - de &idrogen' - ionice' - electrostatice interac!iuni &idrofobe , -for!ele -for!ele =an der Kaals ;omeniile* omeniile* , repre$int regiuni compacte cu organi$area ter!iar specific' relati rigide' separate ntre ele de segmente mai pu!in organi$ate care permit mi#carea unui domeniu n n raport cu altul. altul. - sunt responsabile de anumite func!ii - cu structuri #i propriet!i similare sunt pre$ente n diferite proteine 0tructura cuaternar a proteinelor* proteinelor* este caracteristic pentru proteinele proteinele alctuite din mai multe 7+( 7+(protomeri sau subunit!i" subunit!i". repre$int asamblarea asamblarea protomerilor n spa!iu (oligomer" 2unc!ia specific a unei proteine oligomere se manifest numai la ni elul structurii cuaternare' protomeri separa!i sunt inacti i. 7egturi care stabili$ea$ structura cuaternar sunt legturile slabe (de &idrogen' saline' for!e &idrofobe etc.". >nterac!iunile prin suprafe!e complementare pre$int fenomenul de cooperare- primele interac!iuni fa ori$ea$ formarea celorlalte. 9(. molecula &emoglobinei const din @ protomeri.

Proteinele fixatoare de Ca sunt proteine ce posed afinitate ma3or de legare a ionilor de Ca. ?oate aceste proteine con!in resturi de L carbo(iglutamat de care se fi(ea$ ionii de Ca. L carbo(iglutamatul se formea$ din Hlu sub ac!iunea en$imei (carbo(ila$a"' care ca coen$im are itamina 6. !xemple: - colagenul - calmodulina , o protein mic ce posed patru locusuri de fi(are pentru ionii de Ca - factorii coagulrii s-ngelui(>>'=>>'>M' M" - fosfolipa$a C Colagenul: cea mai rspndita protein din organism. 9ste o protein e(tracelular' fibrilar' componenta ma3or a !esutului con3ucti #i osos. .n !esutul con3ucti ea ofer re$isten!' iar n cel osos constituie carcasa organic a minerali$rii. +articularit!ile structurale* 1. 2iecare al treilea aminoacid din caten este pre$entat prin glicin (30D" 1. 2iecare al patrulea - prin prolin #i &idro(iprolin (1ED" 3. Con!ine 10D alanin @. Con!ine &idro(ili$in E. Con!inutul tioaminoaci$ilor #i tiro$inei este redus 0e deosebesc cinci feluri de lan!uri primare* 1>' 1>>' 1>>>' 1>=' 1. +rin combinarea lor se formea$ @ tipuri principale de colagen. Colagenul* 0tructura primar pre$int o caten polipeptidic curbat alctuit din circa 1000 resturi de aminoaci$i. 0tructura secundar repre$int alfa catene spiralate rsucite spre st-nga 3 alfa catene spiralate' rsucite spre st-nga formea$ tropocolagenul. ?ropocolagenul este subunitatea structural a colagenului.

0tructura cuaternar* a#e$area subunit!ilor de tropocolagen sub form de trepte' fiecare molecul fiind deplasat cu N din lungime fa! de moleculele ecine. :onomerii sunt lega!i stabil prin legturi co alente ncruci#ate inter #i intramoleculare' care le confer microfibrilelor re$isten! mecanic. +rin asocierea microfibrilelor se formea$ fibrilele' iar din ele - fibra de colagen. Colagenul este proteina care acti fi(ea$ ionii de Ca1O. Clasificarea contemporan a proteinelor. 0a an!ii :.7e itt #i C.C&iot&ia (19G0" e(aminnd structura proteinelor le-au de i$at n E clase (fiecare clas difer dup pre$en!a #i po$i!ia P-spiralei #i Q-structurii". +roteine ce con!in 100D P-elice' formnd o structur globular/ +roteine ce con!in Q-structur #i' de regul' sunt alctuite din dou straturi antiparalele sau situate n forme Rbutoia#eJ/ +roteine ce con!in att P ct #i Q componente/ +roteine ce nglobea$ PS Q segmente alternate n structura secundar' formnd structura ter!iar cu centrul Q #i ncercuite de P-spirale/ +roteine neorgani$ate cu structura secundar e iden!iat nesemnificati . Dup dinamica domeniilor structurale +roteine cu domenii rigide' imobile' dure' unite prin segmente mari' fle(ibile' ce le permit fluctua!ii n diapa$on larg/ +roteine cu domenii rigide' dure' unite prin por!iuni mici' denumite RbalamaJ cu o circula!ie mai redus/ +roteine unde domeniile au roluri di erse , folosesc fle(ibilitatea pentru asigurarea unor func!ii. Proteinele simple %&oloproteine' - (istonele -locali$ate n nucleu' con!in aminoaci$i ba$ici pn la 30D (5rg' 7i$". 5u sarcina po$iti ' sunt legate electrostatic cu aci$ii nucleici. 2unc!ia* iau parte la reglarea metabolic a acti it!ii genomului' func!ie structural 5lbuminele #i globulinele pre$int masa principal a proteinelor sanguine' a lactatelor' masei musculare. )aportul albumine-globuline rmne constant* 1'E , 1'3. Al"uminele , mas molecular mic' +> @'G' sarcin negati ' sunt solubile n ap. )olul* determin presiunea oncotic' particip la transportul substan!elor. - )lo"ulinele - mas molecular mai mare ca albuminele' au caracter acid (+> , C -G'3"' con!in n cantitate mare Hlu' se di$ol n solu!ii saline slabe' dar nu n ap. )olul imunologic* sinteti$ea$ anticorpi. Protaminele* prolaminele* glutelinele +roteinele con3ugate (+roteide"* Nucleoproteine Cromoproteine 2osfoproteine 7ipoproteine :etaloproteine Hlicoproteine Nucleoproteinele compuse din* 1- proteine (&istonele' bogate n 5rg #i 7i$." 1 - aci$i nucleici. )ol* constituie ba$a molecular a unor procese bioc&imice fundamentale ca* stocarea' transmiterea #i e(primarea informa!iei genetice' biosinte$a proteinelor' di i$iunea celular. Cromoproteinele: , compuse din protein #i partea neproteic colorat. - 0unt porfirinice #i neporfirinice )epre$entan!ii* clorofila' &emoproteidele (Bb"' sistemul de citocromi' catala$a' pero(ida$a. )olul* 1. particip n fotosinte$ 1. transportul o(igenului #i C41 3. reac!iile de o(ido-reducere @. sen$a!iile de lumin #i culoare 2osfoproteinele: proteine + acidul fosforic %legate prin legturi esterice- de &idroxiaminoacizi er* ,re ' )epre$entan!i* ca$einogenul (proteina laptelui"' itelina' itelenina (din glbenu#ul de ou"' i&tulina (din icre de pe#te". )olul* - ser esc ca material energetic' plastic n porocesul de embriogene$ #i cre#tere postnatal - alimentar 7ipoproteine - proteine ! lipide "fosfolipide# TAG# colesterol$ -olul:

)epre$int constituien!i structurali ai celulelor inter in n permeabilitatea biomembranelor furni$ea$ energia particip la transportul prin s-nge #i limf a unor substan!e liposolubile ( itaminele liposolubile 5' ;' 9' 6' unii &ormoni' unele medicamente" n plasma sanguin lipoproteinele(7+" se diferen!ia$ n @ frac!iuni pe ba$a densit!ii lor* , c&ilomicronii (d mai mic ca 0'9E" - 7+ cu densitate foarte mic (=7;7" (d mai mic ca 1'00C" - cu densitate mic (7;7" (d mai mic ca 1'0CE" - cu densitate mare (B;7" (d mai mic ca 1'1" Hlicoproteinele , proteine O glucidic (gluco$amin' galacto$amin' a. &ialuronic' gluco$aminglicani" -olul: sunt constituien!i plastici ai celulei' intr n componen!a membranelor biologice au rol de protec!ie a mucoaselor gastrointestinale' ale aparatului respirator #i urogenital fa! de ac!iunea en$imelor proteolitice' a unor compu#i c&imici sau agen!i mecanici sunt in&ibitori ai aglutinrii &ematiilor sunt componente specifice de grup sanguin particip n reac!iile imunologice :etaloproteine* protein Ometal (2e' Cu' Tn' :g" 9(emple* Bb- con!ine 2e* transportul ga$elor 2eritina , con!ine 2e' locali$at n ficat' constituie re$er a' depo$itul de 2e din organism ?ransferina , con!ine 2e' Cu #i Tn' se afl n plasma sanguin' transport 2e n oprganism :ioglobina , con!ine 2e' se afl n mu#c&i' rol de transportor #i re$er or al o(igenului n mu#c&i Ceruloplasmina , con!ine Cu' se afl n plasma sanguin' transportor al Cu n organism #i ac!iune o(ida$ic asupra itaminei C. +eptidele acti e* !ndotelinele o familie de peptide noi cu acti itate biologic acti deosebit. .n anul 19AA Uangisana au ob!inut din cultura endoteliului ascular un peptid cu efect biologic pronun!at numit endotelina (9?". 9?- sunt cei mai efecti i factori asoacti i. Clasificare* deosebim 9?1' 9?1' 9?3 (i$oforme". ;eosebirile ntre ele* sunt codificate de gene diferite sunt e(presate n mod diferit n !esut ascular. 9t-1 #i 9?1 , sunt asoconstrictori puternici tructur: !,. un peptid biciclic format din 11 aminoaci$i. inteza /i degradarea: intez: trei etape: &idroli$a proteolitic a preproendotelinei (91 aSa" sub ac!iunea con erta$ei 1 , cu formare de endotelin (@0 aSa". &idroli$a captului C terminal (, 1 aSa" sub ac!iunea carbo(ipeptida$ei sub ac!iunea con erta$ei 1 proendotelina trece n endotelin (11 aSa". Degradarea: 1 en$ime metaloendopeptida$ cu +B optim de E'E endotelina$ (serinproteina$a" !ndotelinele Aciune: 1 tipuri de receptori* 9?-5 #i 9?-B , situa!i nu numai n endoteliul aselor ci #i n rinic&i' plmni' suprarenale' !esut ner os. 9?-5 ,receptorii O structurile fi(atoare de H protein - media$ constric!ia aselor. 2unc!ia 9?-B receptorilor e cuplat cu acti area fosfolipa$ei C #i 51' ma3orarea ni elului de Ca intracelular , cu ma3orarea intensi a prostaciclinei #iSsau trombo(anului 51 , ceea ce conduce at-t la constric!ia c-t #i dilatarea aselor. )olul* reglea$ tonusul aselor #i n general cardio&emodinamica particip n patogenia B?5 esen!iale 9?-1 #i 9?-3 , posed efecte neurologice (n !esutul ner os intensific sinte$a fosfoino$itolfosfatului"' pro oac modificri n reac!iile de comportare' efect central cardiorespirator. reglea$ starea func!ional a endoteliului' stratului intim arterial #i enos din diferite ase