Protide
Tabelul 2
Diversitatea funcţiilor protidelor
În grupa protidelor se clasifică, în mod convenţional, toţi compuşii chimici care prin
hidroliză eliberează aminoacizi, precum şi aminoacizii înşişi. În funcţie de numărul
aminoacizilor constituenţi, ca şi a existenţei unor compuşi de natură neprotidică în
structura lor, protidele se clasifică astfel: (Figura 4.1.)
Aminoacizi
Oligopeptide
PROTIDE Peptide
Polipeptide
Proteine simple
Proteine
Proteine conjugate
Fig. 4.1. Schema clasificării protidelor
4.2. Aminoacizi
+
H NH2 NH3
OH O-
R C NH2
R R
COOH O O
A B C
unde R – radical, adică un grup de atomi din molecula aminoacidului, legat de
atomul de carbon α şi care nu ia parte la formarea lanţului polipeptidic.
A şi B nu pot exista la nici un pH fiziologic, dar pot fi utilizate în mod
formal atunci când se discută chimia aminoacizilor;
C este structura ionică a unui aminoacid la pH-ul fiziologic.
Aminoacizii existenţi în proteine se pot clasifica după mai multe criterii. În funcţie
de structura radicalului R se pot împărţi în alifatici şi nealifatici (ciclici). O altă
clasificare se poate face în funcţie de reacţia lor: aminoacizi neutri, bazici şi acizi.
Aminoacizi neutri au câte o singură grupă aminică şi o singură grupă carboxil, în
timp ce la cei bazici există o grupă aminică suplimentară. În aminoacizii cu caracter
acid există două grupe carboxilice şi una aminică.
Cea mai raţională clasificare este cea care se bazează pe polaritatea radicalilor
aminoacizilor. La pH 7, adică la pH–ul ce corespunde condiţiilor intracelulare,
radicalii R se subîmpart în nepolari ( hidrofobi), polari sau neîncărcaţi, încărcaţi
pozitiv şi încărcaţi negativ. În concordanţă cu aceasta, aminoacizii care intră în
structura proteinelor se pot subîmpărţi în patru clase:
82
NH
Fenilalanina (Phe) Triptofanul (Trp) Metionina (Met) Prolina (Pro)
Datorită radicalului alifatic R, alanina, valina, leucina, izoleucina şi metionina
participă la interacţiuni hidrofobe cu alte resturi de radicali R ai unor aminoacizi ce
aparţin aceleiaşi clase. Catena laterală fenilică a fenilalaninei şi ciclul indolic al
triptofanului sunt, de asemenea, capabili de a interacţiona hidrofob. Atomul de
hidrogen de la azotul ciclului indolic poate să participe la formarea legăturilor de
hidrogen cu alte grupe localizate în interiorul globulei proteice.
În această grupă intră şi prolina, un α-iminoacid care conţine o amină secundară în
ciclul pirolidinic. Prezenţa restului de prolină în lanţul polipeptidic al proteinei îi
permite acestuia să se răsucească şi să se adune.
Aminoacizii aromatici sunt responsabili de proprietatea pe care o au majoritatea
proteinelor de a prezenta absorbţie în ultraviolet (UV), cu un maxim între 275 şi
285 nm.
Dintre toţi aminoacizii aromatici, cea mai mare absorbţie o prezintă triptofanul.
b) Aminoacizi cu radicali polari neîncărcaţi
Această clasă include un aminoacid alifatic – glicina (glicocol), doi hidroxi-
aminoacizi (serina şi treonina), un aminoacid cu sulf (cisteina), un aminoacid
aromatic (tirozina) şi două amide (asparagina şi glutamina). Aceşti aminoacizi sunt
mai solubili în apă decât aminoacizii cu radicali nepolari deoarece grupele lor
polare pot forma legături de hidrogen cu moleculele de apă:
+H N CH COO- +H N CH COO- +H N CH COO- +H N CH COO-
3 2 3 3 3
CH2OH CH OH CH2 SH
CH3
Glicina (Gly) Serina (Ser) Treonina (Thr) Cisteina (Cys)
OH
Tirozina (Tyr) Asparagina (Asn) Glutamina (Gln)
+H N CH COO- +H N CH COO-
3 3
CH2 CH2
COO- CH2
COO-
Acidul aspartic (Asp) Acidul glutamic (Glu)
H2C CH COO- i i
NH + OH
2
Hidroxiprolina Tiroxina Dezmozina
Alanina
Acidul γ-aminobutiric se găseşte în plante, precum şi în ţesutul nervos al
mamiferelor şi păsărilor. Participă în calitate de agent chimic în transmiterea
impulsurilor nervoase.
H2N (CH2) COOH
3
Acidaminobutiric
+H N CH COO- +H N CH COO-
3 3
(CH2) (CH2)
3 3
NH2 NH
C O
NH2
Ornitina Citrulina
Acidul α,ε–diaminopimelic se găseşte în cantităţi importante în membrana celulei
bacteriene.
H2N CH COOH
CH2
I
CH2 OH
Homoserina
Aminoacizi neesenţiali şi esenţiali. În organismul majorităţii animalelor şi al
omului se sintetizează aproximativ jumătate din aminoacizii necesari pentru sinteza
proteinelor. Aceştia se numesc aminoacizi banali sau neesenţiali : glicina, alanina,
serina, cisteina, tirozina, acidul aspartic, acidul glutamic, prolina. Ceilalţi aminoacizi
(10) nu pot fi sintetizaţi de aceste organisme. Ei trebuie să pătrundă în organism
cu hrana şi de aceea se numesc aminoacizi esenţiali (indispensabili) : valina,
leucina, izoleucina, treonina, lizina, histidina, arginina, fenilalanina, triptofanul,
metionina. Tipul aminoacizilor esenţiali este oarecum diferit pentru diverse
organisme animale.
Proprietăţile fizice
Aminoacizii sunt substanţe incolore în majoritatea cazurilor, cristalizate, care se
topesc la temperaturi înalte (mai mari de 250C), descompunându-se. Sunt
solubili în apă şi insolubili în eter.
Peptidele sunt compuşi care iau naştere ca rezultat al formării legăturilor peptidice
între resturile unui număr restrâns de aminoacizi. Legătura peptidică este o
legătură puternic covalentă ce se formează în reacţia dintre doi aminoacizi cu
eliminare de apă între grupa -carboxilică şi grupa -aminică:
PEPTIDE
Peptidul care conţine două resturi de aminoacizi se numeşte dipeptid, cel care
conţine trei resturi se numeşte tripeptid, ş.a.m.d. În general, peptidele constituite
din două până la zece resturi de aminoacizi se definesc ca oligopeptide, iar cele a
căror structură este formată din zece până la sute de resturi de aminoacizi se
definesc ca polipeptide.
Pentru stabilirea denumirii chimice a peptidelor, de regulă primul rest de aminoacid
este considerat cel ce are grupa aminică liberă (N-terminal), şi ultimul, cel cu grupa
carboxilică liberă (C-terminal). Dacă aminoacidul participă la legătura peptidică prin
grupa sa carboxilică, atunci el este privit ca un radical acil şi în consecinţă primeşte
terminaţia „il”. Aminoacidul final care conţine grupa carboxilică liberă nu îşi
schimbă denumirea. Ca urmare, pentru denumirea unei peptide se indică succesiv
denumirea fiecărui aminoacid component cu adăugarea sufixului „il”, cu excepţia
aminoacidului C-terminal.
De exemplu, dacă un dipeptid este format din glicină şi alanină, atunci el poate fi,
fie glicilalanină:
H2N CH2 CONH CH COOH H2N CH CONH CH2 COOH
CH3 CH3
fie alanilglicină:
Aceste două dipeptide se deosebesc între ele prin proprietăţile lor fizice şi chimice.
Deci, dacă la cuplarea aminoacizilor între ei variază ordinea în care se succed
pentru eliminarea moleculelor de apă, se obţin peptide diferite. De exemplu, trei
aminoacizi A, B, C pot forma următoarele şase tripeptide: A-B-C, A-C-B, B-A-C,
B-C-A, C-A-B, C-B-A. Din patru aminoacizi diferiţi se pot obţine 24 de tetrapeptide
diferite, din cinci – 120 de pentapeptide.
În felul acesta este clar că aminoacizii se pot lega unul cu altul prin legături
peptidice, conducând la un număr foarte mare de izomeri.
Peptidele prezente în organism pot proveni fie prin biosinteză din aminoacizi şi se
găsesc ca atare în mod normal – cum este cazul unor peptide cu funcţii biologice,
fie apar ca produşi intermediari în procesele biochimice de degradare sau de
biosinteză a proteinelor.
Majoritatea peptidelor sunt substanţe incolore, cristaline, destul de uşor solubile în
apă, oligopeptidele formând soluţii adevărate iar polipeptidele, dispersii coloidale.
Tendinţa de cristalizare şi solubilitatea în apă scad cu creşterea greutăţii
moleculare. În alcool absolut şi în alţi solvenţi organici, peptidele sunt insolubile.
Grupele –NH2 şi –COOH terminale precum şi radicalii R capabili de a se ioniza,
determină proprietăţile acido-bazice ale peptidelor.
Peptidele constituite din cel puţin trei aminoacizi reacţionează, ca şi proteinele, cu
săruri de cupru în mediu alcalin, producând o coloraţie albastră-violetă. Această
reacţie este denumită reacţia biuretului şi este utilizată pentru identificarea şi
dozarea peptidelor şi proteinelor.
Prin hidroliză acidă sau enzimatică, peptidele sunt scindate în aminoacizii
componenţi.
Multe dintre peptidele care se întâlnesc în stare liberă în plante, ţesuturile animale
şi la microorganisme au o mare importanţă în calitate de produşi intermediari de
metabolism şi compuşi foarte activi fiziologic.
88
4.4. Proteine
4.4.1. Caracterizare generală
Proteinele sunt compuşi macromoleculari a căror moleculă este constituită din
resturi de -aminoacizi. Prin hidroliza proteinelor, de exemplu prin încălzirea lor cu
acizi sau baze concentrate sau prin acţiunea asupra lor a enzimelor proteolitice,
se obţine un amestec de -aminoacizi. Aceste elemente structurale - „cărămizi de
construcţie” - conţin cel puţin o grupă carboxil şi o grupă - amino, dar diferă între
ele prin natura radicalilor R. În mod obişnuit, la hidroliza proteinelor se formează
20 de aminoacizi diferiţi care se deosebesc între ei prin mărimea acestor radicali.
Pot fi radicali mai mici (ca –H la glicină sau –CH3 la alanină), sau mai mari
(triptofan, leucină). Există atât radicali nepolari (la valină, leucină, fenilalanină etc.),
cât şi polari neîncărcaţi (la tirozină, cisteină, serină) şi radicali polari încărcaţi (la
lizină, arginină, acid glutamic etc.). Toate grupele funcţionale ale proteinelor se
găsesc în lanţurile laterale (radicali), cu excepţia unei grupei aminice terminale şi
respectiv, a unei grupe carboxilice terminale la capetele libere ale lanţului
polipeptidic.
În funcţie de compoziţia lor, proteinele se împart în două clase principale: proteine
simple şi proteine conjugate. Proteinele simple sunt cele care la hidroliză dau
numai aminoacizi; proteinele conjugate sunt cele care la hidroliză dau, pe lângă
aminoacizi şi alţi compuşi organici sau anorganici care alcătuiesc aşa numita
„grupare prostetică”.
4.4.2. Structura proteinelor
Masa moleculară
Proteinele reprezintă în sine nişte compuşi macromoleculari. Masa moleculară
relativă a lor variază de la câteva mii până la mai multe milioane. Limita inferioară a
masei moleculare a proteinelor, în mod convenţional, a fost luată 6.000; compuşii
cu structură asemănătoare dar cu masă moleculară mai mică fac parte din
polipeptide. Masele moleculare ale diferitelor proteine variază în limite foarte largi:
4.4.7.Clasificarea proteinelor
Proteine simple
Pe baza comportării în prezenţa diferiţilor solvenţi şi a compoziţiei în aminoacizi,
proteinele simple se subîmpart în următoarele grupe: protamine, histone, albumine,
globuline, prolamine, gluteline, proteinoide.
92
Globuline- sunt proteine insolubile în apă, dar solubile în soluţii saline diluate.
Pentru extracţia lor din diferite materii biologice se utilizează frecvent, în calitate de
solvent, o soluţie caldă 10% de clorură de sodiu. Pentru separarea globulinelor din
soluţia lor salină, aceasta se diluează cu cantităţi mari de apă sau se dializează
folosind o membrană semipermeabilă.
Globulinele (M = 150.000), în comparaţie cu albuminele, precipită la concentraţii
mai mici (50%) de sulfat de amoniu şi în felul acesta se pot separa de albuminele
cu care, de regulă, coexistă.
Globulinele sunt cele mai răspândite proteine din organismul animal. Astfel, în
plasma sanguină se găsesc serumglobuline, în lapte – lactoglobulina, în ou –
ovoglobulina, în muşchi – proteina contractilă care se numeşte miozină şi
reprezintă suportul biochimic al contracţiei musculare.
În stările infecţioase se înregistrează o creştere a cantităţii de globuline din sânge
ca urmare a formării compuşilor de apărare (răspunsul imun) – anticorpi – în
compoziţia cărora intră (imunoglobuline - Ig).
Totodată, globulinele reprezintă cea mai mare parte a proteinelor multor seminţe şi
în special a celor de leguminoase şi oleaginoase. Astfel, în seminţele de mazăre se
găseşte o cantitate importantă de globulină care se numeşte legumină, în
seminţele de fasole – faseolină, în cele de cânepă – edestină, de soia –
glicinină.
Gluteline -se găsesc în seminţele cerealelor şi în părţile verzi ale plantelor. Sunt
solubile numai în soluţii diluate de alcalii (0,2%) din care precipită prin acidulare
slabă. Cele mai studiate gluteline sunt: glutenina din boabele de grâu şi orizenina
din orez.
Amestecul format din glutenină (25-40%) şi gliadină (40–50%) care se izolează din
făina de grâu poartă denumirea de gluten. Proteinele din gluten, prin punţile lor –
S-S-, conferă făinii de grâu proprietatea de a da cu apa un aluat elastic care reţine
într-un mod caracteristic dioxidul de carbon format în timpul fermentării, dând pâinii
o structură poroasă şi un volum corespunzător.
Porfirina
Izoaloxazina reprezintă compusul de bază pentru sinteza grupărilor flavinice care
formează împreună cu proteinele specifice o serie de flavinproteide, enzime ce
participă la reacţiile de oxido-reducere din organism.
Derivaţii carotenului dau cromoproteidele purpurei vizuale (rodopsina din retină).
Derivaţii porfirinei cu magneziul formează clorofila, al cărui complex cu proteinele
– cloroplastina - asigură activitatea fotosintetică a plantelor. În organele verzi ale
plantelor, clorofila este localizată sub formă de cloroplastină în formaţiunile din
citosol numite cloroplaste.
Clorofila din plantele superioare şi din algele verzi reprezintă un amestec format
din două clorofile, a şi b al căror raport, în majoritatea plantelor, este 3:1.
Clorofila a este un complex cu Mg al unei porfirine. În ciclul IV al acesteia există
substituit un rest de acid propionic esterificat cu un alcool superior nesaturat numit
fitol. Fitolul este un derivat al izoprenului, iar prezenţa sa în structura clorofilei îi
conferă acesteia proprietăţi lipofile manifestate prin solubilitatea ei în grăsimi şi
solvenţi ai acestora
Clorofila b are o structură foarte asemănătoare cu cea a clorofilei a, deosebindu-se
de aceasta numai prin prezenţa unei grupe formil O=C-H în ciclul pirolic II, în locul
grupei metil.
O enzimă care se găseşte în frunzele verzi alături de clorofilă, clorofilaza,
descompune legătura esterică dintre grupa carboxilică a moleculei de clorofilă şi
restul de fitol, pe care-l înlocuieşte cu un rest de alcool etilic. Compusul rezultat se
numeşte etilclorofilidă. Prin încălzire, clorofila pierde magneziul din molecula sa
trecând în feofitină, un compus de culoare cenuşie, caracteristică pentru ţesuturile
verzi (legume, fructe) tratate termic.
Derivatul porfirinei cu fierul reprezintă pigmentul hem care este compusul de bază
în complexul cu proteinele pentru formarea hemoglobinei, mioglobinei şi a o
serie de enzime din clasa oxido-reductazelor (citocromi, catalaze, peroxidaze).
Fiecare hem conţine patru cicluri pirolice legate între ele prin punţi metinice.
Prezenţa a patru grupe metil şi a două grupe vinil, precum şi a două resturi de acid
propionic, transformă porfirina în protoporfirină. Introducerea unui atom de fier
bivalent conferă compusului aspectul final al hemului.
Cel mai studiat reprezentant al cromoproteidelor este hemoglobina din sângele
animalelor vertebrate şi al omului şi care este concentrată în eritrocite. Este
alcătuită dintr-o componentă proteică denumită globină şi una prostetică, colorată,
care este hemul.
Globinele hemoglobinelor din sângele diferitelor animale se deosebesc sub
aspectul compoziţiei şi distribuţiei aminoacizilor. Prin conţinutul lor în aminoacizi
diamino-monocarboxilici aparţin histonelor. Sunt alcătuite din patru lanţuri
polipeptidice (două α şi două β). În lanţul α se găsesc 141 de aminoacizi, în β –
146 de aminoacizi.Molecula de hemoglobină conţine patru molecule de hem care
la rândul lor au câte un atom de Fe bivalent.
Unirea hemului cu globina se realizează prin legătură coordinativă între fierul
hemului şi histidina globinei.
96
Sunt toxice când sunt injectate animalelor şi devin inhibitori ai creşterii când sunt
introduse în hrană.
O NH
+ +
O P O- H2N C NH (CH2) CH
3
O NH2 CO