Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
FACULTATEA DE BIOLOGIE
Specializarea ECOLOGIE I PROTECIA MEDIULUI
NVMNT LA DISTAN
TITULAR DISCIPLIN
ef lucr.dr. Elena CIORNEA
IAI
2009
Date de contact:
- coordonator disciplin ef lucr.dr. Elena CIORNEA e.mail: ciornea@uaic.ro
- tutore:
ef lucr. dr. Elena CIORNEA
Propuneri tematice pentru activiti tutoriale:
compoziia chimic a lumii vii
metabolismul glucidelor
metabolismul lipidelor
metabolismul proteinelor
Obligaiile minime ale studenilor:
participarea activ la activitile tutoriale
prezena obligatorie la orele de lucrri de laborator
Modul de stabilire a notei finale:
25% activitatea de laborator
25% notele obinute la verificrile pe parcurs
50% nota la examen
Teme de licen ce pot fi abordate la disciplina BIOCHIMIE:
Cinetica reaciilor enzimatice cu un singur substrat
Studiul diferitelor principii active din diverse surse de origine animal i vegetal
Rolul lipidelor complexe n structura membranelor biologice
Utilizarea practic a polizaharidelor
Rolul biologic al cromoproteinelor
INTRODUCERE
Fiecare etap a dezvoltrii societii umane s-a caracterizat prin dezvoltarea cu precdere
a anumitor domenii caracteristice pentru etapele respective. n ceea ce privete de exemplu
pictura, sculptura astronomia etc., umanitatea a aezat la loc de cinste n primul rnd operele
Evului mediu n timp ce apariia zorilor capitalismului s-a caracterizat prin dezvoltarea fr
precedent a tehnologiilor. n vremurile noastre putem afirma fr a grei c secolul XX a fost
secolul fizicii iar secolul XXI va aparine cu siguran dezvoltrii biotehnologiilor.
Progresele tehnologice moderne au permis extinderea i aprofundarea studiilor referitoare
la diveri constitueni celulari i subcelulari. Noile cuceriri ale biotehnologiei nu sunt ns posibile
fr aportul substanial al unor tiine de grani, n marea lor majoritate tinere, cum ar fi
biochimia, biofizica, biologia molecular, microbiologia industrial i altele.
Biochimia este definit ca fiind tiina ce se ocup cu studiul structurii chimice a
organismelor vii, totalitatea reaciilor i transformrilor care au loc n celula vie, reglarea acestora i
interdependena permanent cu mediul nconjurtor.
Din punctul de vedere al de obiectului de studiu distingem mai multe ramuri ale biochimiei:
Biochimie microbian
Biochimie vegetal
Biochimie animal
n ultimul secol, n cadrul biochimiei animalelor, o amploare deosebit a fost nregistrat de
biochimia omului, n special biochimia medical sau clinic, dat fiind importana practic
imens a acesteia pentru pstrarea sntii omului.
n funcie de modul de abordare a problemelor studiate, se disting dou ramuri principale
ale biochimiei:
Biochimie structural (descriptiv)
Biochimie dinamic (biochimia metabolismului)
Din punct de vedere istoric, biochimia devine o tiin de sine stttoare n cea de a doua
jumtate a secolului al XIX-lea cnd ea s-a desprins din complexul tiinelor chimice i biologice.
Locul biochimiei ntre tiinele moderne poate fi considerat unul central.
Pe de o parte , dezvoltarea biochimiei nu ar fi fost posibil fr aportul unor tiine clasice
cum ar fi biologia, chimia, fizica, matematica etc.
Pe de alt parte, realizrile tiinifice ale biochimiei au contribuit i contribuie la dezvoltarea
altor tiine i domenii ale activitii umane cum ar fi genetica, fiziologia, medicina, biotehnologia
(domeniu nou, deosebit de vast care poate s ofere soluii avantajoase n rezolvarea multor
probleme practice de interes major), industria alimentar etc.
I. BIOCHIMIA STRUCTURAL
I.1. Compoziia chimic a organismelor vii
Organismele vii conin aproape toate elementele chimice ntlnite n lumea nevie (moart).
Compoziia chimic a organismelor vii este extrem de complex datorit constituiei diferite a
compuilor biochimici, precum i datorit proporiei diferite a elementelor chimice ntlnite n lumea
vie. n funcie de ponderea i rolul pe care l joac n celula vie, elementele chimice se clasific
astfel:
a) bioelemente majore (macrobioelemente) care ndeplinesc de regul un rol plastic
(structural) gsindu-se n cantiti majore C, H, O, N, P, S, Ca, K, Na etc.
b) microelemente care sunt bioelemente ce intr n cantiti foarte mici n constituia
vieuitoarelor dar sunt absolut indispensabile vieii B, Al, V, Cr, Mn, Zn, I, Mo, Sr etc.
Bioelementele, att cele majore ct i microelementele, se gsesc n cantiti mici i foarte
mici n stare liber n organism. n marea lor majoritate ele intr n structura unor substane
chimice specifice lumii vii care se numesc biomolecule.
n funcie de natura acestora, biomoleculele se mpart n dou clase:
a) molecule bioanorganice (apa, srurile minerale)
b) molecule bioorganice (glucide, lipide , aminoacizi, peptide, proteine, acizi
nucleici, vitamine, hormoni, factori de cretere etc.).
I. 1.1. Molecule bioanorganice componenii minerali ai organismelor vii
Principalele substane anorganice ntlnite n toate organismele vii sunt reprezentate de
ap i sruri minerale.
Apa este un constituent absolut indispensabil tuturor organismelor vii, deoarece toate
procesele celulare care stau la baza vieii nu pot avea loc n lipsa apei. Chiar i diminuarea mai
mult sau mai puin accentuat a coninutului de ap n celule i esuturi determin scderea sau
chiar ncetarea funciilor vitale. Coninutul n ap al organismelor vii este extrem de variat, oscilnd
ntre 20-30% n semine, tulpinile plantelor lemnoase, esutul osos etc. i 95-98% n frunze,
microorganisme, multe esuturi animale etc.
Principala funcie a apei n lumea vie o constituie rolul su de mediu de reacie pentru toate
procesele biochimice. n acelai timp, apa reprezint mijlocul de transport pentru metabolii (seva
plantelor, sngele, urina, lichidul cefalorahidian, limfa etc.)
Apa legat este reprezentat de acea cantitate de ap care nconjoar biomoleculele
organice i care prezint proprieti diferite. Astfel, aceast ap nu nghea nici chiar la 100oC,
fapt ce explic existena formelor de via n condiii extreme cum ar fi zonele polare, ghearii etc.
Srurile minerale sunt prezente n toate organismele vii, n diferite proporii. n mediul
celular, care este un mediu apos, aceste sruri se gsesc sub form ionizat. Cel mai frecvent se
ntlnesc ioni de Na+, K+, Ca2+, Mg2+, NO3, PO43, SO42, Cl etc.
I.1.2. Molecule bioorganice
I.1.2.1. Aminoacizii uniti structurale de baz ale proteinelor
Definiie, structur chimic, rspndire n natur
Aminoacizii sunt compui organici cu funciune mixt (conin n molecul o grupare amino
NH2 i o grupare carboxilic COOH) i reprezint unitile structurale de baz ale proteinelor. Din
cei aproximativ 200 de aminoacizi cunoscui n prezent, un numr de 20 sunt proteinogeni, adic
intr n mod curent n structura proteinelor. Din punct de vedere structural, aminoacizii proteinogeni
sunt aminoacizi i au formula general:
R CH COOH
I
NH2
Radicalul R poate fi alifatic, aromatic sau heterociclic. n funcie de natura acestui radical,
aminoacizii se clasific n 7 clase.
CH 3 CH COOH
I
NH 2
CH 3 CH CH COOH
I
I
CH 3 NH 2
Valin (Val)
Alanin (Ala)
CH3 CH CH 2 CH COOH
I
I
NH2
CH
3
Leucin (Leu)
Izoleucin (Ile)
CH2 CH COOH
I
I
OH
NH2
Serin (Ser)
Treonin (Thr)
Cistein (Cys)
Metionin (Met)
O = C CH2 CH COOH
I
I
NH2
NH2
Asparagina (Asn)
CH2 CH COOH
I
NH2
HO
Fenilalanin (Phe)
CH2 CH COOH
I
NH2
Tirozin (Tyr)
CH2 CH COOH
I
NH2
N
HN
N
H
Triptofan (Trp)
Histidin (His)
HO
N
H
COOH
N
H
Prolin (Pro)
COOH
Hidroxiprolin (ProOH)
n afar de aminoacizii proteinogeni descrii mai sus, care stau la baza structurii catenelor
polipeptidice ale proteinelor native, n natur se ntlnesc i ali aminoacizi, att sub form liber
ct i n structura unor compui biologic activi. Unii dintre ei ndeplinesc funcii biochimice i
fiziologice importante, alii reprezint produi intermediari n unele ci metabolice sau sunt
precursori n biosinteza unor substane biologic active.
Acidul amino-butiric (GABA) este un important mediator chimic n sistemul nervos i se
formeaz n organism prin decarboxilarea enzimatic a acidului glutamic:
CO2
HOOC CH CH 2 CH 2 COOH
I
PALP
NH2
Glutamat- -decarboxilaza
Acid glutamic
CH2 CH 2 CH 2 COOH
I
NH2
Acid aminobutiric (GABA)
El ndeplinete diferite funcii printre care, cea mai important este cea de mediator chimic
de blocare a sinapselor.
Ornitina este un aminoacid cu caracter bazic (din clasa acizilor diamino-monocarboxilici)
ntlnit n organismele mamiferelor ca produs intermediar al ciclului ureogenetic (ciclul Krebs
Henseleit). Sub form liber se ntlnete numai la unele plante:
CH2 CH2 CH2 CH COOH
I
I
NH2
NH2
Ornitin
Alanina intr n structura unor substane biologic active de mare importan cum ar fi
acidul pantotenic. Intr de asemenea n structura carnozinei i anserinei, dipeptide izolate din
esutul muscular al mamiferelor:
CH2 CH2 COOH
I
NH2
Alanin
H2N
COOH
Acid p-aminobenzoic
Cu excepia glicocolului, toi aminoacizii conin cel puin un atom de carbon asimetric.
Aceasta nseamn c ei prezint izomerie optic. Ca i n cazul monozaharidelor ns,
apartenena la seria D sau L nu coincide cu sensul rotirii planului luminii polarizate ci se determin
prin compararea configuraiei atomului de carbon chiral al aminoacidului cu configuraia carbonului
chiral al aldehidei L-glicerice, respectiv aldehidei D-glicerice:
CHO
I
*
H C OH
I
CH2 OH
COOH
I
H2N * C H
I
R
COOH
I
H *C NH2
I
R
CHO
I
* H
HO C
I
CH2 OH
L-aminoacid
D-aminoacid
L-gliceraldehid
D-gliceraldehid
H2O
+
OH
H
H
N CH NH
I
R2
O
II
H 2N CH C N CH NH
I
I
I
R1
H R2
i II), structura real (forma III) fiind dat de repartizarea uniform a electronilor neparticipani ntrun nor electronic ce aparine n egal msur atomilor de O, C i N:
O
O
II
.... C N ....
I
H
II
+
.... C N ....
I
H
II
O
I
+
.... C
N ....
I
H
III
Carnozina
H2N CH2 CH2 CO NH CH COOH
I
CH2
I
H3 C N
Anserina
COOH
glutationul
I.1.2.3. Proteine
Proteinele sunt substane macromoleculare prezente n celulele tuturor organismelor vii
unde reprezint peste 50% din masa uscat a acestora. Proteinele ndeplinesc n organismele vii
mai multe funcii biochimice absolut indispensabile tuturor proceselor metabolice i fiziologice.
a) Rolul plastic este jucat de proteinele structurale ce reprezint constitueni principali ai
membranei celulare, citoplasmei, organitelor subcelulare, umorilor i fluidelor tuturor organismelor
vii.
b) Rolul energetic este asigurat prin faptul c n urma degradrii lor catabolice se
elibereaz o mare cantitate de energie ce se nmagazineaz n legturile macroergice ale
moleculelor de ATP, energie ce va fi utilizat n diferite procese vitale (efort fizic i intelectual,
procese de biosintez etc.).
c) Rolul reglator este ndeplinit de o serie de hormoni cu structur polipeptidic (hormonii
reglatori ai hipotalamusului, ai hipofizei, hormonii pancreasului, hormonii paratiroidieni, ai timusului
i cei gastrointestinali).
d) Rolul de aprare este ndeplinit de proteinele specifice din clasa imunoglobulinelor
(anticorpi) care prezint proprieti speciale de a interaciona cu proteinele strine (antigene) n
procesul complex de aprare a organismului fa de agenii patogeni din mediul extern.
e) Rolul de transport al proteinelor se refer att la transportul activ prin membranele
biologice care se efectueaz cu consum energetic, contra gradientului de concentraie al
metabolitului transportat, ct i la transportul specific al unor metabolii sau elemente absolut
necesare vieii. n acest din urm caz, un exemplu concludent l reprezint hemoglobina al crui rol
biologic const n transportul oxigenului de la plmni la nivelul tuturor organelor i esuturilor i a
dioxidului de carbon pe calea invers.
f) Rol n contracia muscular. Procesul contraciei musculare, care st la baza efortului
fizic, este un proces fiziologic i biochimic complex realizat prin consum energetic (cnd se
utilizeaz energia nmagazinat n legturile macroergice ale moleculelor de ATP) de ctre o serie
de proteine specifice actina i miozina ce formeaz un complex proteic cuaternar cunoscut
sub numele de complexul acto-miozinic.
g) Rolul catalitic este ndeplinit de ctre enzime care sunt, fr excepie, substane
proteice. n afara funciilor enumerate mai sus, proteinele reprezint instrumentul molecular al
expresiei informaiei genetice coninute n acidul deoxiribonucleic din cromozomi. De aceea,
proteinele sunt componente structurale i funcionale intim legate de procesele vieii, procese ce
nu pot i concepute n lipsa substanelor proteice.
Clasificarea proteinelor
n funcie de structura loc chimic, de rolul pe care l ndeplinesc n organismele vii i de
proprietile lor fizico-chimice, proteinele pot fi clasificate n mai multe moduri.
Delimitarea net ntre proteine i polipeptide este foarte dificil deoarece exist proteine
alctuite numai din catene polipeptidice (aa-numitele proteine simple sau holoproteine).
Majoritatea autorilor delimiteaz aceste dou clase de biomolecule dup masa lor molecular
considernd c polipeptidele au o mas molecular de pn la 10.000 Da, iar proteinele au masa
molecular superioar acestei valori. n funcie de forma moleculelor, proteinele sunt de dou
tipuri:
proteine fibrilare care au molecula filiform i sunt, n general, insolubile n ap. Din
aceast grup fac parte de exemplu fibroina, keratinele, colagenul etc.
proteine globulare a cror molecul are form sferic sau elipsoidal i sunt uor
solubile n ap. Din clasa proteinelor globulare fac parte toate enzimele, globulinele serice i alte.
n funcie de rolul biologic principal pe care l ndeplinesc, proteinele se mparte n 6 clase
astfel:
Proteine structurale. Acestea sunt reprezentate de proteinele ce joac rol plastic, adic
acele proteine ce intr n structura membranelor biologice, a esuturilor i organelor. Proteinele
structurale cele mai bine studiate sunt: colagenul ntlnit n esutul conjunctiv din cartilaje,
tendoane, piele, oase etc., elastina ce intr n structura esutului conjunctiv elastic din ligamente,
fibroina din mtasea produs de Bombix mori, sclerotina ntlnit n exoscheletul insectelor,
keratina ce se gsete n cantiti mari n derm, pr, pene etc., proteinele membranare ce intr
n structura tuturor membranelor biologice i altele.
Proteinele de rezerv au rolul principal de a constitui principala rezerv de aminoacizi a
organismelor vii. Din aceast grup fac parte cazeina care este componenta proteic major a
laptelui, gliadina din cariopsele cerealelor, zeina ce reprezint principala protein de rezerv din
boabele de porumb, ovalbumina i lactalbumina din ou i respectiv din lapte, feritina care
faciliteaz acumularea ionilor de fier n splin i altele.
Proteinele contractile au un rol important pentru micarea organismelor vii fiind
implicate n contracia muchilor, cililor, flagelilor etc. Cele mai bine studiate proteine contractile
sunt actina i miozina implicate n contracia miofibrilelor i dineina care asigur micarea cililor
i flagelilor la nevertebrate.
Proteinele de transport sunt proteine cu o structur deseori complex ce ndeplinesc un
important rol n transportul diferiilor metabolii n organism. Cele mai bine studiate proteine de
transport sunt hemoglobina care asigur transportul oxigenului i dioxidului de carbon,
mioglobina cu rol n transportul oxigenului la nivel muscular, albuminele serice care realizeaz
transportul acizilor grai n circulaia sanguin, -lipoproteinele serice care asigur transportul
lipidelor n snge etc. Tot din aceast categorie fac parte i transportorii membranari care
realizeaz transportul activ, contra gradientului de concentraie, al diferiilor metabolii prin
membranele biologice.
Proteinele cu rol catalitic i hormonal reprezint o grup extrem de important de
proteine funcionale. Din aceast grup fac parte enzimele (care sunt toate, fr nici o excepie,
proteine), precum i unii hormoni (hormonii reglatori ai hipotalamusului, hormonii hipofizei, cei
pancreatici, hormonii paratiroidieni, hormonii timusului etc.).
Proteine cu rol de protecie. Acestea sunt proteine implicate n diferite procese
fiziologice de protecie i aprare a organismului fa de anumii factori externi. Cele mai bine
studiate sunt trombina (o protein ce particip la procesul coagulrii sanguine), fibrinogenul
(care este precursorul fibrinei, protein implicat, de asemenea, n procesul coagulrii sanguine),
imunoglobulinele sau anticorpii (proteine capabile s formeze compleci anticorp antigen cu
proteinele strine organismului respectiv i altele.
n funcie de structura lor chimic, proteinele se mpart n dou mari grupe: proteine simple
i proteine complexe.
Proteine simple (holoproteine). Acestea sunt proteine ale cror molecule sunt formate
numai din catene polipeptidice. Acest lucru a fost demonstrat prin faptul c prin hidroliz complet,
holoproteinele pun n libertate numai aminoacizi. Din aceast grup fac parte o serie de proteine
ce ndeplinesc importante funcii biochimice i fiziologice: , i -globulinele serice, anticorpii,
histonele, protaminele, fibrinogenul, miozina, actina, colagenul, fibroina, keratinele etc.
Proteinele complexe (numite i conjugate, sau heteroproteine) conin n molecula lor,
pe lng componenta proteic i o component de alt natur numit grupare prostetic. La
rndul lor, heteroproteinele se mpart n mai multe grupe n funcie de natura chimic a gruprilor
prostetice.
Cromoproteinele conin n molecula lor o grupare prostetic de natur protoporfirinic.
Din aceast categorie fac parte o serie de proteine ce ndeplinesc importante funcii biochimice i
fiziologice: hemoglobina, mioglobina, citocromii, catalaza, peroxidaza etc.
Lipoproteinele conin n molecula lor grupri prostetice de natur lipidic. Din aceast
grup fac parte de exemplu lipoproteinele serice.
Fosfoproteinele. Gruprile prostetice ale hetero-proteinelor din aceast grup sunt
reprezentate de resturi de serin esterificate cu acid fosforic. Cele mai cunoscute fosfoproteine
sunt cazeina, vitelina, vitelenina, fosvitina i altele.
10
.......... N CH COOH
I
I
H Rn
.......
Studiul peptidelor sintetice cu ajutorul metodei difraciei de raze X prin cristale pure a
permis determinarea distanelor interatomice ntr-o caten polipeptidic, precum i a unghiurilor
dintre atomii componeni. Aceste determinri au demonstrat existena unei perioade de identitate
de 7,2 pentru fiecare dou resturi de aminoacizi. Totodat s-a observat c distana interatomic
C N este mai mic, iar distana C = O este mai mare dect cele normal ntlnite n ali compui
(fig. I.1.).
11
H
R
110
121
1,53
117
1,23
120 1,32
122
120
1,47
120
110
R'
Fig. I.1. Reprezentarea schematic a distanelor interatomice i unghiurilor de valen n catenele polipeptidice
Aceste rezultate indic prezena unei stri de rezonan a legturii peptidice ntre dou
forme limit din care cauz, legtura peptidic C N nu este simpl ci parial dubl, fiind astfel
mpiedicat rotaia liber a substituenilor. Acest caracter de legtur parial dubl are o importan
deosebit pentru structurile de ordin superior ale proteinelor.
La nivelul legturilor peptidice se ntlnete izomeria de tip trans, iar rotaia liber este
permis numai la nivelul celorlalte legturi covalente. Orientarea spaial a catenelor polipeptidice
este datorat, n principal, acestor rotaii libere n jurul legturilor menionate:
H
I
C
I
R
N
I
H
R'
I
C
I
H
Fig. I.2. Reprezentarea schematic a modelului -helicoidal al structurii secundare a proteinelor (dup Buckow,
2006).
Fiecare tur (spir) este alctuit din 3,6 resturi de aminoacizi. Distana ntre ture de-a
lungul axei -helixului este egal cu 0,541nm (). Diametrul -helixului este de 0,101nm (). O alt
variant a structurii secundare a proteinelor este structura -pliat care este de dou tipuri:
modelul straturilor pliate antiparalele format din lanuri polipeptidice n form de zig-zag,
ale cror grupe NH2 terminal i COOH terminal sunt orientate n direcii opuse;
12
modelul straturilor pliate paralele alctuit din lanuri polipeptidice cu aceeai orientare (fig.
I.3).Ambele tipuri, existente n proporii diferite, sunt stabilizate prin puni de hidrogen intercatenare
ntre grupele carbonilice i aminice ale legturilor peptidice din lanurile polipeptidice adiacente.
Fig. I.3. Reprezentarea schematic a modelului straturilor pliate ale structurii secundare a proteinelor(dup
Buckow, 2006).
Structura teriar. Structura teriar reprezint replierea i nfurarea segmentelor helicoidale i -pliate ntr-o organizare spaial complex sub form de ghem sau globul.
Structura teriar a proteinelor se constituie ntr-un sistem stabil datorit interaciunilor hidrofobe
ntre radicalii laterali ai aminoacizilor, legturilor de hidrogen, legturilor ionice i legturilor
disulfidice.
Structura cuaternar. Structura cuaternar este specific numai anumitor proteine i
reprezint nivelul de organizare structural cel mai nalt. Este rezultatul asocierii a dou sau mai
multe catene polipeptidice numite protomeri, fiecare cu structura sa primar, secundar i teriar
ntr-un conglomerat spaial complex. Proteinele formate din mai multe lanuri (catene) polipeptidice
se numesc proteine oligomere.
Proprieti specifice proteinelor
Masa molecular a proteinelor este foarte mare i diferit de la cteva mii pn la sute de
mii i chiar milioane de daltoni. De ex. insulina-5.700 D, hemoglobina-64.500 D, fibrinogenul
339.700 D. Solubilitatea proteinelor este diferit. Unele se dizolv uor n ap i soluii saline,
altele numai n soluii de sruri sau n amestecul de ap i alcool. Sunt insolubile n solveni
organici. Precipitarea proteinelor poate fi reversibil sau ireversibil. Precipitarea ireversibil se
mai numete denaturare care poate fi cauzat de factori fizici (cldur, radiaii, agitare) sau de
diferii reactivi. Denaturarea conduce la schimbarea proprietilor fizice i reactivitii moleculelor
proteice. De cele mai multe ori prin denaturare, proteinele pierd activitatea lor biologic.
Soluiile de proteine au comportare de acid sau baz (amfoter) n funcie de partenerul cu
care reacioneaz, deoarece conin grupe NH2 i -COOH libere, aparinnd aminoacizilor
constitueni. Caracterul amfoter al proteinelor se afl la baza funciei lor de sisteme tampon care
asigur meninerea constant a pH-ului lichidelor biologice n organismul animal i vegetal. Starea
de ionizare a proteinelor determin migrarea lor n cmpul electric Pe aceast proprietate se
bazeaz separarea i determinarea cantitativ a proteinelor cu ajutorul electroforezei. La un pH
specific pentru fiecare protein denumit punct izoelectric (pI), moleculele ei sunt neutre din punct
de vedere electric i nu se deplaseaz sub aciunea curentului electric. Molecula proteic se
ncarc pozitiv dac pH-ul mediului este mai mic dect pI i negativ dac pH-ul mediului este mai
mare dect pI.
__________________________________________________________________________
__________________________________________________________________________
I.1.2.4. Acizi nucleici
Acizii nucleici sunt substane macromoleculare cu rol n stocare i transmiterea informaiei
ereditare. Ele sunt greu solubile n ap rece, puin solubile n ap la cald i uor solubile n soluii
alcaline diluate. Sunt insolubile n etanol i n numeroi ali solveni organici care, adugai peste
soluiile de acizi nucleici, determin denaturarea lor. Degradarea hidrolitic succesiv a
nucleoproteinelor n mediu acid sau alcalin, sau n prezena unor enzime proteolitice specifice
numite nucleaze realizeaz clivarea celor dou componente: acidul nucleic (ARN sau ADN) i
componenta proteic. Hidroliza n continuare a acizilor nucleici conduce la formarea nucleotidelor
care reprezint unitile lor structurale e baz. La rndul lor, nucleotidele pot fi hidrolizate n
continuare sub aciunea unor fosfoesteraze cu formare de nucleozide i fosfor anorganic.
Degradarea nucleozidelor conduce la obinerea unui amestec de baze azotate i pentoze. Din
cele afirmate mai sus rezult c prin condensarea unei baze azotate cu o pentoz se formeaz un
nucleozid. Nucleozidele se pot fosforila la nivelul grupelor hidroxilice libere ale restului de pentoz
cu formare de nucleotide, iar polimerizarea (sau mai exact ncatenarea) nucleotidelor conduce la
formarea acizilor nucleici. Deci, din punct de vedere structural, acizii nucleici sunt polinucleotide
care, n funcie de natura pentozei se clasific n poliribonucleotide (n ARN) i respectiv
polideoxiribonucleotide (n ADN).
Bazele azotate purinice i pirimidinice
Bazele azotate din structura nucleozidelor i nucleotidelor sunt compui heterociclici ce
deriv de la dou cicluri de baz numite pirimidin i purin prin substituirea unor atomi de
hidrogen:
4
5N
1N
N
1
Pirimidin
7
N
8
N9
H
N 4
3
Purin
Principalele baze azotate purinice sunt adenina i guanina, iar cele pirimidinice sunt
citozina, timina i uracilul:
O
NH2
N
N
N
N
H
H2N
Adenin
NH2
N
Citozin
N
H
Guanin
O
HN
N
H
HN
O
CH 3
HN
N
H
Uracil
N
H
Timin
Compoziia n baze azotate a acizilor nucleici este urmtoarea: moleculele de ADN conin
adenin, guanin, citozin i timin, iar cele de ARN au n compoziia lor adenin, guanin,
citozin i uracil. Deci, din punctul de vedere al compoziiei n baze azotate, cele dou tipuri de
acizi nucleici difer doar printr-o baz azotat pirimidinic (timin n ADN i respectiv uracil n
ARN). Aceste baze azotate, ca i altele care nu intr n structura acizilor nucleici, pot exista n
dou forme structurale: o form enolic (sau form lactim) i o form cetonic (sau form lactam).
n cazul guaninei de exemplu, cele dou forme au urmtoarele structuri:
14
O
HN
H2N
OH
I
N
N
N
H
Guanin
(lactam)
H2N
N
N
H
Guanin
(lactim)
n mod simila, tautomeria ceto-enolic se ntlnete la toate celelalte baze azotate ce intr
n structura acizilor nucleici.
Pentozele din structura acizilor nucleici
n structura acizilor ribonucleici intr riboza sub forma sa furanozic, anomer . Moleculele
de ADN conin un derivat al acesteia (2-deoxiriboza) sub forma anomerului al ciclului furanozic:
CH 2OH
-D-ribofuranoza
CH 2OH
-D-2-deoxi-ribofuranoza
NH 2
N
CH 2OH
4'
1'
2'
HN
5'
H2N
Guanozin
NH2
HN
N
CH2OH
CH 2OH
Uridin
Citidin
NH2
N
N
CH 2OH
3'
Adenozin
HN
CH2OH
Deoxiadenozin
H2N
CH2OH
Deoxiguanozin
15
NH2
CH3
HN
N
N
CH2OH
CH2OH
Deoxitimidin
Deoxicitidin
N
N
CH2
O
O
O
POH
cAMP
NH 2
NH 2
N
N
N
O
II
CH 2O POH
I
OH
N
N
CH 2OH
O
II
O POH
I
OH
Acid adenozin-3'-monofosforic (3'-AMP)
Nucleotidele celorlalte baze azotate se formeaz n mod similar. Adenina mai st la baza
structurii a numeroi derivai nucleotidici ce joac un rol important n procesele de activare a
acizilor grai i a aminoacizilor. Dintre acetia, cei mai importani sunt aminoacil-adenozinmonofosfaii, acil-adenozin-monofosfaii, acidul adenozin-5-fosfo-sulfuric i acidul adenozin-3fosfat-5- fosfo-sulfuric.
16
N
N
O
O
O
II
II
II
CH 2 O PO ~ P O ~ P OH
I
I
I
OH
OH
OH
AMP
ADP
ATP
17
..
.
O
HO P = O
O
NH 2
I
CH 2 N
O
5'
HO P = O
CH 2
O
3'
5'
NH
NH 2
G
P
O
HO P = O
NH 2
CH 2
O
P
O
3'
5'
P
O
HO P = O
O
CH 2
O
3'
NH
N
O
HO P = O
O
..
..
Numrul legturilor duble ce se formeaz ntre bazele azotate este determinat de structura
chimic a acestora. Astfel, ntre adenin i uracil se formeaz dou puni de hidrogen, iar ntre
guanin i citozin trei asemenea legturi conform schemei:
O
HN
N H
O
Uracil
HNH
I
N
N
N
N
I
H
Adenin
18
H
I
NH
O
N
H N
HN
Citozin
HN
I
H
I
H
Guanin
U
G
bucl
U
C
.......
C .......
....... G
.......
U ....... A
.......
G .......
....... C
.......
A .......
U
fragment
dublu spiralat
A
Fig. I.5. Reprezentarea schematic a fragmentelor spiralate i nespiralate din moleculele de ARN
cantitate de ADN n genom mai mic de 5103 pg sunt considerate procariote, iar cele cu o
cantitate mai mare de 3,610-2 pg sunt eucariote.
Structura primar a ADN-ului este dat de numrul, natura i succesiunea
deoxiribonucleotidelor n catenele moleculelor de ADN. Spre deosebire de ARN, macromoleculele
de ADN sunt dublu-catenare. Una din catene este complementar cu cealalt din punctul de
vedere al succesiunii bazelor azotate datorit specificitii formrii punilor de hidrogen ntre
acestea:
si
CH 3
I
O
HN
HNH
I
N H
N
N
O
Timin
sau
Adenin H
H
I
NH
O
N
H N
HN
HN
I
H
O
Citozin
I
H
Guanin
Structura dublu catenar este meninut datorit acestor puni de hidrogen. Structura
primar dublu-catenar a macromoleculelor de ADN poate fi reprezentat n mod similar cu cea a
ARN-ului (fig. I.6). Schematic, un fragment tetranucleotidic al moleculei de ADN poate fi
reprezentat astfel:
3'
3'
5'
P
3'
5'
P
A
3'
P
G
P
C
P
3'
5'
A
P
P
5'
5'
5'
3'
3'
20
..
.
NH 2
I
HO P = O
O
CH 2
O
..
.
O
HO P = O
HN
O
CH 3 CH 2
O
O
HO P = O
O
CH 2
O
HO P = O
N
NH
NH 2
NH 2
CH 2
HO P = O
NH 2
CH 2
O
H2 N
HO P = O
N
H N
N
O
O
O
HO P = O
H3C
NH 2
I
CH 2
O
CH 2
N
NH
HO P = O
N
CH 2
O
O
HO P = O
HO P = O
O
..
..
..
..
__________________________________________________________________________
21
I.1.2.5. Enzime
Reaciile chimice din organismele vii au loc datorit aciunii catalizatorilor biologici numii
enzime. Acestea reprezint instrumentul prin intermediul cruia se realizeaz totalitatea
transformrilor chimice din organismul viu, transformri ce alctuiesc metabolismul substanelor
i energiei. Substana asupra creia acioneaz enzima se numete substrat iar compusul chimic
rezultat n urma aciunii enzimei se numete produs de reacie. Toate enzimele fr nici o excepie
sunt proteine. n funcie de structura lor chimic ele pot fi enzime monocomponente i enzime
bicomponente.
Enzimele monocomponente sunt proteine simple (holoproteine) cu moleculele alctuite
numai din radicali de aminoacizi legai ntre ei prin legturi peptidice, iar enzimele bicomponente
fac parte din clasa proteinelor complexe (heteroproteine) i au molecula alctuit dintr-o
component proteinic numit apoenzim i o grupare de natur neproteic numit cofactor
enzimatic. Cofactorii legai puternic cu apoenzimele lor se numesc grupri prostetice iar cei uor
disociabili se numesc coenzime. Aciunea catalitic a enzimelor este condiionat de existena n
moleculele lor a unor regiuni distincte, denumite situsuri (centre) active sau catalitice. Aminoacizii
participani la formarea centrului activ sunt grupai ntr-o geometrie spaial, la nivelul creia se afl
grupele funcionale implicate n legarea direct a substratului i n transformarea catalitic a
acestuia. Situsurile active ale enzimelor bicomponente cuprind pe lng aminoacizii respectivi de
asemenea coenzima sau gruparea prostetic, care interacioneaz cu substratul i faciliteaz
desfurarea reaciei enzimatice.
O alt clasificare a enzimelor se poate face n funcie de natura reaciei catalizate. Dup
acest criteriu enzimele se grupeaz n 6 clase:
1. oxidoreductaze
2. transferaze
3. hidrolaze
4. liaze
5. izomeraze
6. ligaze (sintetaze)
Fiecare clas se subdivide n subclase i subsubclase. n acest sistem (elaborat de
Comisia de Enzimologie a Uniunii Internaionale de Biochimie) o enzim este definit printr-o
denumire i un cod de patru cifre. Prima cifr indic clasa la care aparine enzima, a doua cifr
subclasa i precizeaz natura grupelor chimice sau a legturilor chimice din molecula substratului,
a treia cifr natura chimic a substratului, a acceptorului etc., iar a patra cifr indic numrul de
ordine al enzimei n cadrul subsubclasei date. De regul naintea codului enzimei se nscriu literele
EC (Enzyme Commission).
Coenzime
n funcie de natura lor chimic se mpart n patru clase:
coenzime cu structur alifatic
coenzime cu structur alifatic
coenzime cu structur heterociclic
coenzime cu structur nucleozidic
1. Coenzime cu structur alifatic. Din aceast grup fac parte acidul lipoic, glutationul
i acidul ascorbic (vit. C).
Acidul lipoic poate exista sub o form aciclic i una ciclic:
forma oxidat
forma redus
Datorit capacitii sale de a trece uor i reversibil din forma disulfidic (oxidat) n forma
ditiolic (redus), acidul lipoic este implicat n diferite procese metabolice legate de oxidarea
biologic:
dehidrogenarea -cetoacizilor
biosinteza i degradarea glicocolului
22
biosinteza prostaglandinelor
Glutationul este o tripeptid:
HOOC
CH
CH2 CH2
NH2
H
C N
O
H
C N
CH
CH2 COOH
CH2 O
SH
glutation (glutamil-cisteinil-glicina)
Rolul coenzimatic al glutationului este asigurat prin prezena gruprii SH n molecul care
se poate oxida reversibil:
2 G SH
_ 2 + _ 2 eH ;
G S S G
+ 2 H+ ; + 2e-
glutation
redus
glutation
oxidat
Acidul ascorbic Din grupa coenzimelor de natur alifatic face parte i acidul L-ascorbic,
dei mecanismul de aciune prin care acesta este implicat n diferite procese metabolice nu justific
pe deplin apartenena vitaminei C la clasa coenzimelor.
O C
HO C
HO C
O C
O C
O
H C
_H _ e
;
+
+ H+; + e-
HO C H
O C
HO C
_ H+ _ e;
+H; + e
H C
HO C H
CH2 OH
O C
H C
HO C H
CH2 OH
acid L-ascorbic
O C
radical ascorbic
liber
CH2 OH
acid L-dehidroascorbic
H3C O
H3C O
CH3
O
CH3
(CH2 CH C CH2)n H
ubichinonele ( coenzimele Q )
CH2 N Cl
N
H3C
CH2 CH2 OH
NH2
CH3
clorhidrat de tiamin
b) coenzime
derivate
de
la
biotin
Biotina (vit. H) se
prezint sub 3 forme din care
doar -biotina joac rol
coenzimatic:
O
HN
O
NH
HN
CH2 CH2 CH2 CH2 COOH
NH
S
-biotina
O
HN
NH
S
HO
H3C
CH2 OH
CH2 OH
N
C
HO
H3C
Piridoxol
O
H
CH2 OH
HO
H3C
CH2 NH2
CH2 OH
N
Piridoxamina
Piridoxal
Aceast
coenzim este implicat ntr-o serie de reacii extrem de importante ale metabolismului
aminoacizilor cum ar fi O
transaminarea, decarboxilarea i
C H
racemizarea acestora.
CH2 NH2
HO
H3C
CH2 O PO3H2
Piridoxal-5-fosfat
(PALP)
HO
H3C
CH2 O-PO3H2
N
Piridoxamin-5-fosfat
(PAMP)
24
d) coenzime derivate de la acidul folic. Acidul folic a fost extras prima dat din
frunzele de spanac dup care a fost descoperit n ficat i alte organe i esuturi. Acidul folic
(vitamina M) conine n molecul un rest de pteridin, un rest de acid p-aminobenzoic i unul de
acid glutamic:
OH
N
N
H2N
CH2 NH
N
Acid folic
OH
N
H2N
CHO
CH2 NH
N
H
Acid formil-tetrahidrofolic
n stare liber, acidul folic se ntlnete foarte rar, fiind de obicei prezent sub forma unor
derivai care ndeplinesc acelai rol biochimic. Cel mai adesea se ntlnete sub form parial
redus care este acidul tetrahidro-folic sau acid folinic FH4 care ndeplinete rol de transfer a unor
grupri C1 (metil, formil, hidroximetil etc.)
4. Coenzime cu structur nucleozidic i nucleotidic. Exist mai multe coenzime de
natur nucleozidic i nucleotidic, cele mai importante fiind urmtoarele:
a) adenozintrifosfatul este principalul compus macroergic al organismelor vii i,
n acelai timp, principalul transportor de grupri fosfat.
Legturile dintre radicalii fosfat ale moleculei de ATP au o energie liber cu mult mai mare dect n
cazul altor esteri fosforici din care cauz ele se numesc legturi macroergice.
NH2
N
N
N
CH2 O P O~ P O ~ P OH
O
OH
OH
OH
25
CH3
CH2 C
O
HO P O
O
HO P O
O
SH
NH2
N
CH2
O
O
O P OH
OH
Din punct de vedere structural, coenzima A este format dintr-un rest de acid adenilic, un
rest de ribozo-3-fosfat, un rest de pirofosfat, unul de acid pantotenic i unul de tioetanolamin:
Gruparea funcional SH reprezint partea activ a moleculei din care cauz notarea
prescurtat este CoA-SH. Atomul de sulf al grupei SH poate forma legturi macroergice cu
radicalii acil. Din aceast cauz, CoA-SH este implicat n reaciile n care se realizeaz transfer
de radicali acil.
c) coenzime piridin-nucleotidice
Majoritatea organismelor animale precum i numeroase microorganisme necesit un aport
zilnic de acid nicotinic sau nicotinamid (vit. PP).
n afar de rolul vitaminic jucat de acidul nicotinic i amida sa, acesta intr n structura a
dou
coenzime
importante:
nicotinamidadenindinucleotid
(NAD+)
i
+
nicotinamidadenindinucleotidfosfat (NADP )
NH2
O
C NH2
N
N
N
O
O
CH2 O P O P O CH2
O
O
OH OH
OH OH
OH OX
+
X=H
NAD
X = PO3H2
NADP
O
C NH2
+ DH2
N
R
N
R
+D+H
sau :
+
NAD(P) + S
NAD(P)H+ P + H
26
O
CH2 O P OH
HO C H
HO C H
O
O
CH2 O P O P
OH
H3C
HO C H
CH2
N
N
H3C
HO C H
HO C H
O
NH
OH
H3C
HO C H
CH2
N
N
H3C
NH2
OH
CH2
O
OH OH
NH
O
flavinmononucleotidul (FMN)
flavinadenindinucleotidul (FAD)
H3C
H3C
R
N
O
NH
H3C
H
N
+ DH2
H3C
O
FMN (FAD)
R
N
Donor de
hidrogen
N
H
O
NH
+ D
FMNH2 (FADH2)
27
V max
pH
pHoptim
Fig. I.7. Influena pH-ului mediului de incubare asupra vitezei reaciilor enzimatice
V max
t2
toptim
t1
oC
E + S
K+1
K-1
ES
K+2
E + P
Conform teoriei acestor autori, viteza de reacie enzimatic este de fapt viteza cu care
complexul ES se descompune pentru a forma produsul de reacie. Totodat autorii iau n
considerare i conceptul de stare staionar conform cruia n sistem se instaleaz un echilibru
28
atunci cnd viteza de formare (Vf) a complexului ES devine egal cu viteza de descompunere (Vd)
a acestuia.
Vf = k1[E] . [S] = k1([Et] [ES]) . [S]
unde Et reprezint cantitatea total de enzim iar diferena reprezint enzima liber
Vd = k2 [ES] + k3[ES] = (k2+ k3) [ES]
La echilibru:
Vf = Vd
Rezult:
k1([Et] [ES]) . [S] = (k2+ k3) [ES]
Sau:
([Et] [ES]) . [S]
(k2+ k3)
=
= const. = KM
[ES]
k1
Constanta Km poart numele de constanta Michaelis i are o semnificaie concret,
identificndu-se cu acea concentraie a substratului la care v=1/2 Vmax. Din relaia de mai sus KM
este egal cu concentraia molar a substratului la care jumtate din enzim se gsete legat cu
substratul, iar cealalt jumtate se afl n stare liber. Constanta KM se poate determina
experimental prin trasarea curbei de vitez funcie de concentraia substratului. Pentru construirea
graficului se determin viteza de reacie la diferite valori ale concentraiei substratului. Pentru
evaluarea mai precis a KM i Vmax ecuaia M. M. se prelucreaz n urmtoarea ecuaie liniar,
numit ecuaia Lineweaver-Burck (fig. I.9.)
1
v
1
V max
_ 1
KM
1/[s]
Graficul dependenei ntre 1/v i 1/[S] reprezint o linie dreapt a crei pant este egal cu
KM/Vmax i care intersecteaz ordonata n punctul 1/Vmax. din acest grafic se pot afla uor Vmax i KM.
Parametrul KM al unei enzime depinde de substrat i condiiile de reacie valorile sale
variind pentru diferite enzime n limite foarte largi. O constant KM mare indic o afinitate mic a
enzimei pentru substrat. Enzima cu KM mic va manifesta n organismul viu o activitate mare,
posibil chiar maxim.
Influena efectorilor asupra activitii enzimelor. Se numesc efectori (modulatori)
substanele chimice care modific viteza unor reacii enzimatice cnd sunt adugate n mediul de
incubare. n funcie de modul cum acioneaz efectorii pot fi activatori sau inhibitori.
Activatorii influeneaz pozitiv activitatea enzimelor pe care o intensific sau stimuleaz.
ntre activatorii enzimatici se numr numeroi ioni metalici (Na+, K+, Mg2+, Ca2+, Zn2+, Mn2+, Co2+
etc.), unii anioni (Cl etc.), diferii compui organici cum ar fi unii tioli (cisteina, glutationul etc.).
Inhibitorii sunt modulatori care diminueaz sau anuleaz activitatea enzimelor. n funcie
de modul de aciune al inhibitorilor asupra enzimelor inhibiia poate fi:
- inhibiie reversibil
- inhibiie ireversibil
Ultima conduce la pierderea definitiv a activitii enzimei, datorit denaturrii ei prin
legarea covalent a inhibitorului cu un aminoacid esenial pentru funcia catalitic. La rndul ei
inhibiia reversibil este de 2 tipuri, n funcie de mecanismul de aciune al inhibitorului, competitiv
i necompetitiv. Inhibitorii competitivi interacioneaz cu centrul activ al enzimei. Ei prezint o
analogie structural cu substratul i n consecin concureaz cu acesta pentru centrul activ al
enzimei. n inhibiia necompetitiv inhibitorul nu prezint analogie structural cu substratul i se
29
leag cu enzima ntr-o alt zon a moleculei, diferit de centrul activ. Inhibitorii necompetitivi pot
reaciona att cu enzima liber ct i cu complexul ES.
Reglarea activitii enzimelor se realizeaz prin mai multe mecanisme:
Conversia precursorilor inactivi n enzime active. Unele enzime care funcioneaz n
exteriorul celulei (n tractul digestiv sau n plasma sanguin) sunt sintetizate sub form de
precursori inactivi numii proenzime sau zimogene. Hidroliza unui numr limitat de legturi
peptidice n moleculele zimogenelor conduce la conversia lor n enzime active. Modificarea
covalent a unor enzime se poate realiza prin inseria de grupri micromoleculare n moleculele
lor. Spre exemplu activitatea enzimelor care catalizeaz sinteza i degradarea glicogenului este
reglat prin fosforilarea unui anumit radical de serin din moleculele acestor enzime.
Un mecanism de reglare mai rspndit dect modificarea covalent, este inhibiia de tip
feed back, cnd acumularea produsului final al unei ci metabolice cauzeaz inactivarea enzimelor
necesare pentru sinteza lui.
Cel mai rspndit mecanism de reglare a activitii enzimelor n lumea vie se consider
reglarea allosteric. Caracteristica esenial a enzimelor alosterice este susceptibilitatea lor de a
fi activate sau inhibate de ali metabolii dect substratele naturale. Aceti metabolii se numesc
efectori alosterici sau modulatori alosterici. Dac modulatorul induce creterea capacitii catalitice
a enzimei se numete activator sau modulator pozitiv, iar dac acesta provoac scderea
eficienei ei catalitice se numete inhibitor sau modulator negativ. Un alt mecanism este reglarea
vitezei de biosintez a enzimelor sau reglarea genetic.
______________________________________________________________________
ntrebri de verificare i evaluare a cunotinelor
Ce sunt enzimele i cum se clasific ele?
Ce coenzime cunoatei? Care sunt formulele lor chimice?
Care sunt principalele proprieti ale enzimelor?
Care sunt principalele aspecte ale cineticii reaciilor enzimatice?
Ce este constanta KM i cum se deduce formula sa?
__________________________________________________________________________
C =O
(CH OH) n
(CH OH) n
CH 2 OH
CH 2 OH
aldoz
cetoz
30
Monozaharidele cel mai des ntlnite n organismele vii sunt urmtoarele (cu reprezentani
mai importani):
Triozele sunt monozaharide cu trei atomi de carbon n molecul. Dintre trioze dou sunt
rspndite n celulele animale i vegetale gliceraldehida (aldotrioz) i dihidroxiacetona
(cetotrioza):
H C =O
CH 2 OH
CH OH
C =O
CH 2 OH
CH 2 OH
gliceraldehid
(aldotrioz)
dihidroxiacetona
(cetotrioz)
Dintre cetopentoze n organismele vii se ntlnesc sub form fosforilat ribuloza i xiluloza:
CH2OH
C O
H C OH
H C OH
CH2OH
ribuloza
CH2OH
C O
HO C H
H C OH
CH2OH
xiluloza
31
H
HO
H
H
O
C
H
C OH
C H
C OH
C OH
CH2OH
H
HO
HO
H
O
C
H
C OH
C H
C H
C OH
CH2 OH
O
C
H
C H
C H
C OH
C OH
CH2OH
HO
HO
H
H
galactoza
glucoza
CH2OH
C O
HO C H
H C OH
H C OH
CH2OH
fructoza
manoza
Galactoza se ntlnete rar n stare liber, n fructe. Sub form combinat se ntlnete n
lactoz, melibioz (dizaharide), rafinoz (trizaharid), i n cteva polizaharide. Manoza se gsete
sub form combinat n cteva polizaharide(mucilagiile i gumele vegetale).
Fructoza denumit i levuloz este ntlnit n stare liber n miere, n sucul unor fructe, n
mere, tomate etc., iar sub form combinat n structura zaharozei, n unele oligozaharide etc.
Heptozele sunt monozaharide cu apte atomi de carbon n molecul.
Sedoheptuloza se gsete n sucul numeroaselor plante i ca produs intermediar n
procesul de fotosintez (rol important n biosinteza hexozelor din compui care conin un numr
mai mic de atomi de carbon):
HO
H
H
H
CH 2OH
C O
C H
C OH
C OH
C OH
CH 2OH
sedoheptuloza
Cele mai simple monoglucide sunt triozele. Se cunoate o aldotrioz denumit aldehida
gliceric (gliceraldehida sau gliceroza) i o cetotrioz-dihidroxiacetona. Cu excepia dihidroxiacetonei, toate ozele conin cel puin un atom de carbon asimetric (chiral) deci prezint izomerie
optic. Aldehida gliceric conine un atom de carbon asimetric (C*) i prin urmare exist dou
forme cu configuraii diferite, adic doi enantiomeri: aldehida D-gliceric i aldehida L-gliceric:
O
O
C
C * OH
CH 2
HO
C* H
CH 2
OH
aldehida D-gliceric
OH
aldehida L-gliceric
Toate monoglucidele (tetroze, pentoze, hexoze etc.) care teoretic pot fi obinute din
aldehida D-gliceric prin creterea succesiv a catenei atomilor de carbon de la captul cu grupa
aldehidic, formeaz seria D.
Monoglucidele provenite pe aceeai cale din L-gliceraldehid constituie seria L. Prin
urmare, monoglucidele aparin seriei D sau L dac atomul de carbon asimetric, cel mai ndeprtat
de grupa carbonil, are aceeai configuraie ca i atomul de carbon asimetric din aldehida D- sau Lgliceric. Marea majoritate a monoglucidelor descoperite n natur fac parte din seria D deoarece
organismele vii nu conin enzimele capabile s metabolizeze ozele seriei L.
Ozele mai prezint un tip special de izomerie numit epimerie. Dou oze epimere difer
structural prin configuraia unui singur atom de carbon asimetric. De exemplu D-glucoza i Dmanoza sunt epimere n raport cu C-2 iar D-ribuloza i D-xiluloza sunt epimeri dup atomul C-3:
H
HO
H
H
CHO
C OH
C H
C OH
C OH
CH2 OH
D glucoza
HO
HO
H
H
CHO
C H
C H
C OH
C OH
CH2 OH
D manoza
32
O
C
C OH
C H
C OH
C OH
CH2OH
H
H
HO
H
H
OH
C
C OH
C H
O
C OH
C
CH2OH
n cazul glucozei:
n structura astfel rezultat, grupa carbonil este mascat i n locul ei apare o nou grup
OH numit hidroxil glicozidic sau semiacetalic (semicetalic).
Prin ciclizarea monoglucidelor apare un nou centru de asimetrie la atomul de carbon care a
aparinut grupei carbonil. Prezena acestui nou centru asimetric n molecula monoglucidelor face
posibil existena a doi stereoizomeri numii - i -anomeri. Anomerul desemneaz forma n
care orientarea hidroxilului glicozidic este identic cu cea a hidroxilului de la atomul de carbon
asimetric care determin apartenena monoglucidului respectiv la seria D sau L, iar -anomerul are
configuraia opus la cei doi atomi de carbon.
Un tablou mai complet asupra strii reale a moleculelor de monoglucide se obine dac
formulele ciclice se reprezint prin formulele de perspectiv:
CH2 OH
CH2 OH
H
O H
H
OH OH
H
OH
OH
-D-glucoz
O OH
H
OH OH
H
OH
-D-glucoz
Ciclul piranozic sau furanozic este imaginat perpendicular pe planul hrtiei, atomul de
oxigen aflndu-se la distana cea mai mare de observator. Legturile dinspre observator se
traseaz cu linie groas. Substituenii orientai n formele ciclice la dreapta liniei verticale se
plaseaz n formulele de perspectiv sub planul heterociclului, iar cei dispui la stnga deasupra.
Grupa alcoolic primar, sau restul catenei de la atomul de carbon asimetric cu cel mai mare
numr de ordine din ciclul piranozic sau furanozic se trece deasupra planului moleculei, dac
atomul menionat are configuraie D i sub acest plan n cazul atomului cu configuraia L. Aceeai
regul se aplic i pentru grupa alcoolic primar legat la C-2 n piranozele sau furanozele
provenite din cetoze.
Derivai funcionali ai monoglucidelor
n organismele vii se ntlnesc att ozele ca atare ct i sub forma unor derivai funcionali.
ntre derivaii monoglucidelor se numr: deoxiglucidele, aminoglucidele, derivai acizi, glicozide.
a) Deoxiglucidele sunt derivai ai monozaharidelor n care una sau mai multe grupri
OH sunt substituite cu atomi de H. Un astfel de compus foarte des ntlnit n natur este 2-Ddeoxiribza care intr n structura ADN-ului.
33
riboza
deoxiriboza
glucozamina
galactozamina
Acidul neuraminic
b) Acizii derivai de la monozaharide
Gruparea aldehidic a aldozelor se poate oxida la gruparea COOH cu formarea
hidroxiacizilor corespunztori numii acizi aldonici. Prin aceast proprietate se explic capacitatea
reductoare a aldozelor. Dac se protejeaz gruparea aldehidic i se oxideaz gruparea alcoolic
primar rezult acizii uronici. Atunci cnd se oxideaz att gruparea aldehidic ct i cea
alcoolic primar se obin acizii aldarici (zaharici). n cazul glucozei cei trei acizi sunt:
CHO
COOH
CHO
COOH
OH
OH
OH
OH
HO
HO
HO
HO
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
CH2
OH
glucoz
CH2
OH
acid gluconic
COOH
acid glucaric
COOH
acid glucuronic
34
c) Glicozidele sunt derivai ai ozelor care iau natere prin substituirea hidroxilului
glicozidic din formele ciclice ale ozelor cu alcooli, fenoli, amine etc.
Fragmentul de monoglucid din molecula glicozidic se numete rest glicozidic sau
glicon iar cealalt component se numete aglicon. n funcie de natura atomului prin care se
leag cele dou componente, glicozidele sunt de mai multe tipuri: O-glicozide, N-glicozide, Sglicozide. Multe glicozide au importan practic, ns marea lor majoritate sunt toxice pentru om i
animale.
Oligoglucide (oligozaharide, oligozide)
Sunt combinaii formate din 2 10 resturi de oze legate ntre ele prin legturi O-glicozidice.
Atunci cnd legtura glicozidic se formeaz ntre hidroxilul glicozidic al unei oze i un hidroxil
alcoolic al alteia se formeaz oligoglucide reductoare. De exemplu maltoza (2 resturi de -Dglucoz), celobioza (2 resturi de -D-glucoz, lactoza (-galactoz + -glucoz).
maltoza
celobioza
lactoza
Dac legtura glicozidic se stabilete ntre hidroxilii glicozidici rezult oligoglucide
nereductoare. De exemplu zaharoza (-D-glucoz + -D-fructoz), trehaloza, rafinoza etc.
zaharoza
n funcie de numrul resturilor de oze oligoglucidele pot fi:
- diglucide
- triglucide
- tetraglucide etc.
Poliglucide (polizaharide)
35
Sunt compui macromoleculari formai dintr-un numr mare de resturi de oze legate ntre
ele prin legturi glicozidice.
n funcie de structura chimic se mpart n dou grupe:
homopolizaharide (homoglicani) care se caracterizeaz prin aceea c au molecula
format din acelai tip de monozaharide;
heteropolizaharide (heteroglicani)care au n structura lor 2 sau mai multe tipuri de oze
sau derivai ai acestora.
Homoglicanii pot fi la rndul lor: homoglicani neutri rezultai prin condensarea
monoglucidelor neutre i homoglicani acizi - rezultai din acizi derivai de la monoglucide.
Celuloza este cea mai rspndit substan organic natural. Este o poliglucid
predominant vegetal, dar se poate ntlni i la unele bacterii i nevertebrate. Este un polimer liniar
alctuit din resturi de -D-glucoz unite prin legturi -1,4-glicozidice. Hidroliza complet a
celulozei conduce la obinerea cantitativ a -D-glucozei iar hidroliza parial la celobioz, diglucid
care reprezint unitatea structural de baz a celulozei. Celuloza conine aproximativ 3 000 resturi
de celobioz, avnd o mas molecular de aproximativ 400 000 daltoni (1D = 1,67x10-24g).
Celuloza joac preponderent un rol structural n organismele vegetale.
Amidonul este principala polizaharid de rezerv din plante (este depozitat n semine,
bulbi, tuberculi etc.). Prin hidroliza complet a amidonului rezult -D-glucopiranoz. Amidonul
reprezint un amestec de 2 polizaharide:
amiloza (15-25%) este un polimer liniar alctuit din resturi alctuit de -D-glucopiranoz
unite prin legturi -1,4-glicozidice:
36
Ce sunt monozaharidele?
37
__________________________________________________________________________
I.1.2.7. Lipide
Lipidele constituie o grup de substane bioorganice larg rspndite n organismele vii,
caracterizat prin heterogenitatea structurii i a proprietilor fizico-chimice. Lipidele sunt substane
insolubile n ap i solubile n solveni organici. n organismele vii, lipidele ndeplinesc mai multe
funcii:
rol energetic datorit energiei ce rezult n urma degradrii lor catabolice, aceast
energie, acumulat sub forma legturilor macroergice ale moleculelor de ATP, putnd fi utilizat de
ctre organisme n procesele de biosintez i n efortul fizic i intelectul;
rol de rezerv ndeplinit de lipidele localizate n esuturile adipoase;
rol plastic jucat de lipidele citoplasmatice care sunt, n general, lipide complexe care intr
n compoziia citoplasmei i a tuturor membranelor biologice.
Dac lipidele de rezerv sunt consumate n caz de subnutriie, lipidele plastice reprezint
elementul constant, concentraia lor rmnnd nemodificat.
rolul de material izolant jucat de lipidele localizate n esuturile subcutanate sau n jurul
diferitelor organe unde asigur protecia mecanic i termic.
Din punct de vedere structural, lipidele se clasific n dou mari grupe care la rndul lor se
mpart n alte subgrupe: lipide simple (ceride, acilgliceroli, steride i etolide) i lipide complexe
(fosfolipide i glicolipide). La rndul lor, acilglicerolii pot fi mono-, di- i triacilgliceroli, fosfolipidele
se mpart n glicerofosfatide i sfingofosfatide, iar glicolipidele pot fi glicosfingolipide (cerebrozide i
gangliozide) i glicozil-gliceride).
Acizii grai ce intr n structura lipidelor sunt n general acizi monocarboxilici saturai
sau nesaturai, cu numr par de atomi de carbon (doar rareori se ntlnesc acizi grai cu numr
impar de atomi de carbon), cu caten normal sau ramificat.
Acizi grai cu caten normal:
acid tuberculosteraic
Acizi grai nesaturai
cu o dubl legtur
acid crotonic
acid palmitoleic
acid oleic
38
Lipide simple
Ceridele sunt esteri ai acizilor grai superiori (C24 C32) cu alcooli monohidroxilici superiori.
n natur, ceridele apar sub forma unui amestec de hidrocarburi, alcooli i acizi grai care poart
numele de ceruri. Cerurile pot fi de provenien animal (spermacet, ceara de albine, lanolina)
sau vegetal (ceara de Carnauba). Cerurile formeaz un strat protector pe pielea, prul i penele
vieuitoarelor, de asemenea, pe frunzele, florile i fructele diferitelor plante.
Acilglicerolii sunt esteri ai acizilor grai cu glicerolul. ntruct glicerolul este un alcool trihidroxilic se deosebesc monoacilgliceroli, diacilgliceroli i triacilgliceroli care au formulele generale:
CH 2OCOR
CH 2OH
CH 2OCOR 1
CH 2OCOR 1
CH 2OCOR 1
CHOH
CHOCOR
CHOH
CHOCOR 2
CHOCOR 2
CH 2OH
CH 2OH
CH 2OCOR 2
CH 2OH
CH 2OCOR 3
triacil-monoacil-monoacil,'-diacil, -diacil-glicerol
-glicerol
-glicerol
-glicerol
-glicerol
Acilglicerolii sunt cele mai rspndite lipide n esuturile plantelor (uleiuri) i animalelor
(grsimi). Ei sunt insolubili n ap dar foarte solubili n solveni organici nepolari (benzen,
cloroform, eter etilic etc.). Ca esteri, acilglicerolii pot fi hidrolizai prin fierbere cu acizi sau baze.
Hidroliza acilglicerolilor sub aciunea hidroxizilor alcalini se numete saponificare. Ionii carboxilai
eliberai n urma acestei reacii formeaz cu cationii srurile corespunztoare numite spunuri.
Cantitatea n mg de KOH necesar pentru saponificarea unui gram de triacilglicerol se numete
indice de saponificare.
Deosebit de importante sunt reaciile de adiie la dublele legturi din moleculele
acilglicerolilor. Prin hidrogenare, uleiurile vegetale se solidific, proces folosit la prepararea
margarinei. Cantitatea de I2 sau Br2, n grame, adiionat la dublele legturi ale acizilor grai din
100g acilglicerol se numete indice de iod. Sub aciunea oxigenului i a umiditii acilglicerolii
sufer un proces de rncezire care conduce la cetone i aldehide cu miros neplcut.
Steridele sunt esteri ai acizilor grai superiori cu alcooli tetraciclici monohidroxilici saturai
cunoscui sub numele de steroli. Unitatea structural de baz a acestora este steranul (nucleul
ciclopentanoperhidrofenantrenic):
39
nucleu ciclopentanoperhidrofenantrenic
Sterolii sunt rspndii att n esuturile animale (zoosteroli) ct i n plante (fitosteroli) i
ciuperci (micosteroli). Cel mai rspndit sterol din organismele animalelor superioare i omului
este colesterolul:
colesterol
colesterid
n sngele uman, o treime din cantitatea total de colesterol se afl sub form de alcool
liber, iar 2/3 sub form esterificat.
Lipide complexe
Conin n molecula lor, pe lng componenta lipidic i o component de alt natur. Din
punct de vedere al structurii lor chimice, lipidele complexe se mpart n dou clase: fosfolipide i
glicolipide.
A. Fosfolipidele denumite i fosfatide, se mpart la rndul lor n dou grupe
glicerofosfolipide (glicerofosfatide) i sfingofosfolipide (sfingofosfatide).
Glicerofosfatidele sunt derivai ai acidului L--fosfatidic
acid L - - fosfatidic
Prezena radicalului fosfat confer fosfolipidelor proprieti specifice: un capt al moleculei
este polar, hidrofil, iar cellalt este hidrofob. De aceea, fosfolipidele intr n structura membranelor
biologice a cror funcionare o condiioneaz.
n structura glicerofosfatidelor, restul de acid fosforic este la rndul lui esterificat cu ali
compui. n funcie de natura acestora, glicerofosfatidele se clasific astfel:
fosfatidilcoline (lecitine)
fosfatidiletanolamine (cefaline)
fosfatidilserina
40
fosfatidilinozitoli
n esuturile animale, n special n muchi i n esutul nervos, au fost identificate
glicerofosfatide n care grupa OH din poziia 1 este eterificat cu un alcool --nesaturat. Aceti
compui au primit numele de plasmalogene.
Sfingofosfatidele (sfingomieline) sunt fosfolipide ce conin n molecula lor un
aminoalcool dihidroxilic nesaturat numit sfingozin, un acid gras superior, acid fosforic i colin:
sfingozina
sfingomielina
B) Glicolipidele conin n molecula lor, pe lng componenta lipidic i o component
glucidic. Din punct de vedere al structurii lor chimice se mpart n:
glicosfingolipide
glicozilgliceride
Glicosfingolipidele sunt glicolipide care conin sfingozin, un derivat al acesteia, un rest
de acid cerebronic i un rest de hexoz. ntre glicosfingolipide se disting: cerebrozide, sulfatide,
ceramidoligozaharide i gangliozide.
Cerebrozidele conin sfingozin, acid gras i hexoz (galactoz sau glucoz). De aceea
adesea se numesc galactocerebrozide sau glucocerebrozide. Cerebrozidele se gsesc n
esuturile vertebratelor, nevertebratelor i plantelor.
galactocerebrozid
Sulfatidele (cerebrozidsulfatidele) se deosebesc de cerebrozide prin prezena restului de
acid sulfuric, legat esteric la carbonul C-3 al galactozei. Se gsesc n creier i alte esuturi i au rol
deosebit n transportul ionilor la nivelul membranelor biologice.
Ceramidoligozaharidele conin heterooligozaharide unite printr-o legtur -glicozidic cu
ceramida.
Gangliozidele sunt cele mai complexe lipide a cror component glucidic conine glucoz,
galactoz, N-acetilgalactozamin i acid N-acetil-neuraminic. Ele au fost descoperite n ganglionii
sistemului nervos, creier i alte esuturi. Gangliozidele au un rol extrem de important n
funcionarea membranelor celulare nervoase. S-a observat c n unele boli neuropsihice, n
sistemul nervos apar gangliozide cu structur modificat.
Glicozil-gliceridele. Din surse vegetale (gru, porumb, alge etc.), precum i din unele
esuturi animale (creier) au fost izolate glicolipidele numite glicozildiacilgliceroli i sulfoglicozil
diacilgliceroli n care componenta glucidic poate fi galactoza, glucoza, manoza etc.
__________________________________________________________________________
Care sunt principalii acizi grai ce intr n structura lipidelor? Scriei formulele lor chimice.
Cum se clasific i care sunt formulele chimice ale lipidelor simple?
Cum se clasific i care sunt formulele chimice ale lipidelor complexe?
__________________________________________________________________________
I.1.2.8. Vitamine
Vitaminele sunt substane organice micromoleculare cu structuri chimice extrem de diferite
care exercit o influen considerabil asupra desfurrii normale a tuturor proceselor biochimice
din organismele vii. Denumirea de vitamin (amina vieii) a fost utilizat pentru prima dat n
1912 de ctre K. Funk. Dup descoperirea mai multor vitamine n prima jumtate a secolului
nostru, s-a constatat c nu toate aceste substane conineau grupri aminice i ca atare aceast
denumire este improprie. Fiind deja intrat n uz, continu s fie utilizat i astzi. Pentru
vitaminele cunoscute pn n prezent se folosesc mai multe denumiri:
denumirea alfabetic care utilizeaz majuscule ale alfabetului latin (A, B, C, D, E, F etc).
Odat cu creterea numrului de vitamine cunoscute a nceput utilizarea unor indici (A 1, A2, D2-D7,
B1-B15, B12a, B12b etc);
denumirea chimic se bazeaz pe structura chimic a fiecrei vitamine (ergocalciferol,
retinol, tocoferol, piridoxin etc.);
denumirea terapeutic se bazeaz pe efectul farmacodinamic principal (vitamina
antiscorbutic, vitamina antirahitic, vitamina antipelagroas etc.).
Clasificarea este dificil de realizat din cauza structurii chimice foarte diferite. Vitaminele
cunoscute pn n prezent se mpart n trei grupe:
vitamine liposolubile;
vitamine hidrosolubile;
substane cu aciune asemntoare vitaminelor.
Lipsa unei sau altei vitamine din hrana omului i a animalelor provoac tulburri ale
metabolismului substanelor care se manifest prin boli specifice numite avitaminoze. Dac hrana
conine o vitamin n cantitate insuficient pentru a acoperi cerinele organismului maladia se
numete hipovitaminoz. Introducerea n organism a unui exces de vitamine poate cauza boli
numite hipervitaminoze. Biosinteza vitaminelor n organismul vegetal i animal se poate realiza
prin precursori specifici numii provitamine care n urma unor modificri chimice minore se
transform n vitamine active. Unele substane organice naturale i sintetice au o structur
asemntoare cu cea a diverselor vitamine. Aceste substane se numesc antivitamine i
determin apariia simptomelor de hipo- i avitaminoz, chiar dac vitamina respectiv este
coninut n hran n cantitate suficient.
Vitamine liposolubile A, D, E, K i F
Vitamina A (retinol, vitamina antixeroftalmic sau vitamina creterii). Cea mai mare
cantitate de vitamin A se gsete n untura petilor marini.
H3C
CH3
CH3
CH2 OH
CH3
H3C
CH3
CH3
Retinal
CH3
CH3
CH3
H
I
C=O
H3C
CH3
CH2 OH
CH3
Retinol
CH3
CH3
H3C
3 Dehidroretinol
CH3
CH3
CH3
CH3
COOH
Acid retinoic
HO
HO
ergocalciferol (D 2)
colecalciferol (D 3)
Transformarea sterolilor n vitamine D se face sub aciunea radiaiilor UV. Din ergosterol,
sub aciunea UV se formeaz un intermediar precalciferol care apoi se transform n vitamina
D2. Vitaminele D sunt substane termostabile. Se gsesc n ulei de pete, unt, unt ficat, ou, lapte,
drojdie de bere. Rolul lor fiziologic este de a favoriza absorbia fosforului i calciului i formarea
sistemului osos. Avitaminoza D creeaz rahitismul la copii i osteomalacia la aduli.
Hipervitaminoza D provoac demineralizarea oaselor i apariia calculilor renali i biliari.
Vitamine E (tocoferoli, vitaminele antisterilitii, vitaminele de reproducere)
Aceste vitamine sunt sintetizate numai de plante. Din punct de vedere chimic sunt derivai
ai benzopiranului fiind alctuite dintr-un inel benzenic, un heterociclu cu oxigen i o caten lateral
ramificat. n prezent se cunosc 6 tocoferoli, cei mai importani fiind - i -tocoferolul:
CH3
CH3
HO
HO
CH3
H3C
CH3
CH3
CH3
O
CH3
CH3
CH3
CH3
CH3
CH3
CH3
CH3
tocoferol
tocoferol
CH3
CH3
CH3
I
I
CH2CH=CCH2(CH2CH2CHCH2)3H
O COCH3
CH3
Vitamina K3
CH3
I
(CH2CH=CCH2n
) H
O
Vitamina K1
CH3
O COCH3
Vitamina K4
CH3
Vitamina K2
OH
CH3
+ _
Vitamina K5
NH3 ]Cl
43
OH
NH3 ]Cl
CH3
CH
_3
NH3 ]Cl
NH3 ]Cl
Vitamina K6
Vitamina K7
N
H 3C
CH 3
+
N
S
NH2
CH 2CH 2OH
Este o substan alb, cristalin care se distruge la fierbere. Prin fosforilarea tiaminei cu
ATP se obine coenzima tiaminpirofosfat (TPP). Lipsa vitaminei B1 determin apariia unor tulburri
ale sistemului nervos, oboseal, tulburri gastrointestinale. n cazuri mai grave pot aprea
nevralgii, convulsii, pareze ale extremitilor.
Vitamina B2 (riboflavina) Din punct de vedere chimic este un nucleu izoaloxazinic i un
tetraol:
OH OH OH
I
I
I
CH2C HCHCHCH2OH
H 3C
NH
H 3C
Este o substan fluorescent care intr n structura unor coenzime dehidrogenazice cum
ar fi FMN i FAD. Stimuleaz creterea organismelor tinere i are rol n procesul de
bioluminescen la licurici. Lipsa acestei vitamine scade rezistena la infecii, determin cderea
prului i conjunctivit.
Vitaminele B6. (piridoxina). Sunt derivai piridinici. Cele mai importante sunt. piridoxolul,
piridoxalul i piridoxamina.
O
CH 2OH
HO
H 3C
CH 2OH
N
piridoxol
C
HO
H 3C
CH 2OH
piridoxal
HO
H 3C
CH 2NH 2
CH 2OH
N
piridoxamin
44
n natur se gsesc de obicei mpreun i se pot transforma una n alta. Prin fosforilarea
piridoxalului i piridoxaminei se obin coenzimele importante piridoxal-fosfatul i piridoxaminfosfatul care particip la decarboxilarea i transaminarea aminoacizilor.
Avitaminoza B6 produce modificri cutanate, tulburri nervoase, anemie, insomnii etc.
Vitaminele B12 (cobalamine, corinoide) Sunt compui chimici cu o structur chimic
complicat alctuit dintr-un nucleu corinic format din 4 inele pirolice, un atom central de Co, un
nucleotid legat -glicozidic.
Vitaminele B12 sunt sintetizate n principal de ctre microorganismele din tractul
gastrointestinal al rumegtoarelor, din sol precum i de alte microorganisme.
Vitaminele B12 particip la metabolismul glucidelor, lipidelor i proteinelor.
Avitaminoza B12 determin tulburri ale procesului de eritropoez, apariia unei forme
canceroase de anemie numit anemie pernicioas, ncetinirea creterii, leziuni nervoase,
deteriorarea funciei de reproducere.
Vitaminele PP (vitaminele B5)
CONH2
COOH
N
Acid nicotinic
Nicotinamid
O
HN
O
NH
HN
CH2 CH2 CH2 CH2 COOH
-biotina
NH
S
O
HN
NH
S
constituenii coenzimei A, aceasta din urm reprezentnd la rndul ei o adevrat plac turnant
n metabolismul celular. Lipsa acidului pantotenic conduce la dermatite, depigmentarea i cderea
prului, ncetinirea creterii.
Acidul folic (vitamina M). Din punct de vedere chimic este alctuit dintr-un rest pteridinic
substituit, un rest de acid p-aminobenzoic, un rest de acid glutamic.
Prin reducerea acidului folic rezult acidul tetrahidrofolic sintetizat de microorganismele
intestinale. Rol biochimic are acidul tetrahidrofolic care este un agent de metilare. Avitaminoza
produce tulburarea procesului de hematopoiez, oprirea creterii, anemie macrocitar (modificarea
dimensiunilor elementelor figurate ale sngelui), inflamarea cavitii bucale, iminen de avort.
Vitamina C (acidul ascorbic, vitamina antiscorbutic)
HOCH 2CHOH
O
H
HO
OH
Are caracter slab acid i este sintetizat din monoglucide de numeroase specii de
microorganisme plante i animale. Avitaminoza C provoac afeciuni ale esuturilor conjunctive,
oboseal, somnolen. Boala numit scorbut se manifest prin fragilitatea capilarelor, hemoragii,
scderea rezistenei la infecii precum i tumefiere i hemoragii gingivale. Rolul su biochimic
const n participarea la procese de oxido-reducere.
______________________________________________________________________
ntrebri de verificare i evaluare a cunotinelor
Ce sunt vitaminele i cum se clasific ele?
Ce vitamine liposolubile cunoatei? Scriei formulele lor chimice.
Care sunt principalele vitamine hidrosolubile? Scriei formulele lor chimice.
______________________________________________________________________
I.1.2.9. Hormoni
Dei tendina actual a unor ramuri ale biologiei o constituie aprofundarea mecanismelor
moleculare ce stau la baza funcionrii celulei vii, nu trebuie s neglijm faptul c aceste
mecanisme se integreaz ntr-un tot unitar deoarece celulele, esuturile i organele reprezint pri
componente ale organismului viu n ansamblul su i se afl ntr-o strns interdependen i
interaciune.
Iat de ce, cunoaterea hormonilor sub aspectul structurii lor chimice, rolului biologic i
mecanismelor de aciune este important nu numai din punct de vedere practic, n scopul
profilaxiei i tratamentului unor disfuncii glandulare ci, mai ales, pentru nelegerea global a
proceselor biochimice i fiziologice ce au loc n organismele vii.
Sistemul endocrin ndeplinete funcia major de legtur ntre sistemul nervos i celelalte
sisteme de control, inclusiv cel ce acioneaz la nivel molecular. Aadar, sistemul endocrin face
parte integrant din edificiul sistemelor de reglare ce s-au dezvoltat n cursul evoluiei i anume:
a) sistemul nervos central (SNC) al crui rol const n reglarea rapid a interrelaiilor
mediu extern organism;
b) sistemul endocrin ce realizeaz o reglare mai lent, dar continu;
c) sistemul imunitar cu rol de aprare fa de proteinele strine organismului n cauz.
Hormonii sunt definii ca fiind substane organice specifice, sintetizate i secretate de ctre
esuturi glandulare specializate ce formeaz glandele cu secreie intern sau glande endocrine,
care sunt deversate direct n snge, fiind transportate de ctre acesta spre diferite organe i
esuturi numite organe int, asupra crora i exercit aciunea lor specific.
Hormonii, numii i mesageri sau reglatori chimici, coordoneaz activitatea diferitelor pri
ale organismului, acionnd asupra celulelor ce compun esuturile i organele respective. Acestea
din urm "rspund" n funcie de tipul lor, starea lor funcional i nutriional, vrst etc.,
integrndu-se n ansamblul controlului hormonal i nervos la care sunt supuse.
Hormonii vertebratelor sunt secretai de glandele endocrine i se mpart n trei clase
principale n funcie de structura lor chimic.
46
I
O
HO
I
CH 2CHCOOH
HO
NH 2
3,5,3'-triiodtironina (T 3)
I
CH 2CHCOOH
NH2
4)
OH
OH
CHCH 2NHCH 3 HO
CHCH 2NH2 HO
OH
OH
adrenalin
noradrenalin
CH 2CH2NH2
DOP-amin
melatonina
Alturi de reglarea metabolismului pigmenilor melatonina inhib dezvoltarea funciilor
sexuale la animalele tinere i joac rol principal n apariia somnului. Mediaz de asemenea
legtura ntre radiaiile luminoase , sistemul nervos i funcionalitatea anumitor organe.
2. Hormoni cu structur polipeptidic i proteic
Hormonii neurohipofizei sunt ocitocina (oxitocina), vasopresina i coherina. Din punct de
vedere chimic sunt peptide alctuite din 9 aminoacizi. Determin stimularea contraciei muchilor
netezi, n special a uterului, stimuleaz evacuarea laptelui din glanda mamar. Vasopresina
regleaz presiunea sngelui.
Hormoni reglatori ai hipotalamusului. Hipotalamusul secret o serie de peptide
micromoleculare care stimuleaz (liberine) sau inhib (statine) secreia hormonilor de ctre alte
glande endocrine. De exemplu: melanostatina, melanoliberina sau somatostatina, somatoliberina.
Hormonii adenohipofizei. Adenohipofiza secret o serie de hormoni peptidici cu aciune
biologic foarte diferit:
a) hormonul tireotrop (tireotropina), TTH, care controleaz funcia glandei tiroide i
stimuleaz mobilizarea ionilor de iod din snge
b) hormonul adrenocorticotrop (corticotropina), ACTH, controleaz funciile
suprarenalei i intensific biosinteza hormonilor corticosteroizi
c) hormonii gonadotropi (gonadotropinele) regleaz funcionarea gonadelor. Cei
mai importani sunt: hormonul foliculostimulant, hormonul luteinizant, prolactina etc.
d) hormonul de cretere (hormonul somatotrop), STH, influeneaz creterea i
dezvoltarea armonioas a organismului. Excesul de STH determin apariia gigantismului la copii
i agromegalia la aduli. Insuficiena STH determin nanismul (stagnarea creterii).
e) Hormonul melanotrop (melanotropina) regleaz pigmentarea pielii.
47
OH
O
CH3
CH3
CH3
CH3
CH3
HO
Testosteron
Dehidroepiandrosteron
Androstendion
HO
OH
HO
Estron
OH
CH3
CH3
OH
HO
Estradiol
Estriol
48
___________________________________________________________________
ntrebri de verificare i evaluare a cunotinelor
Ce sunt hormonii i cum se clasific ei? Scriei formulele lor chimice.
______________________________________________________________________
NADH+H
NAD
R CH 2 COOH
Aminoacid-reductaza
NH
Acid carboxilic
R CH COOH
I
OH
Hidroxiacid
NH 3
1/2O2
Aminoacid-oxidaza
R C COOH
II
O
Cetoacid
NH3
H2O
NAD
NADH+H
Glutamat-dehidrogenaza
COOH
I
CH 2
I
CH 2
I
C=O
I
COOH
NH 3
Acid -ceto-glutaric
Reacia de dezaminare oxidativ decurge n dou etape. n prima faz are loc un proces de
dehidrogenare a aminoacidului cu formarea -iminoacidului corespunztor. n aceast etap
acceptorul de hidrogen este FAD-ul n calitatea sa de coenzim a aminoacid-oxidazei, dar care
50
joac n aceast reacie i rol de cosubstrat. n etapa a II-a are loc adiionarea elementelor apei cu
formarea -cetoacidului corespunztor i eliminarea amoniacului:
FAD
H2O
FADH 2
R CH COOH
I
NH2
NH3
R C COOH
II
NH
-Aminoacid
R C COOH
II
O
-Iminoacid
-Cetoacid
n numeroase organisme s-a pus n eviden faptul c n realitate exist dou categorii de
flavoenzime ce catalizeaz acest proces care se deosebesc ntre ele prin natura cofactorului.
Unele din ele sunt specifice L-aminoacizilor, poart numele de L-aminoacid-oxidaze, au FMN-ul
drept cofactor i sunt localizate n reticulul endoplasmatic:
R CH COOH
I
NH 2
-Aminoacid
E-FMN
E-FMNH 2
R C COOH
II
+
O
L-aminoacid-oxidaza
NH 3
-Cetoacid
Enzimele din cealalt categorie sunt specifice D-aminoacizilor, se numesc D-aminoacidoxidaze, au drept cofactor FAD-ul i sunt localizate n microsomii hepatocitelor:
R CH COOH
I
NH 2
-Aminoacid
EFAD
EFADH
D-aminoacid-oxidaza
R C COOH
II
O
NH 3
-Cetoacid
R CH = CH COOH
Acid ,-nesaturat
Aminoacid
CO2
Aminoacid-decarboxilaza
R CH2 NH2
Amin
Aminoacizii
diaminomonocarboxilici
formeaz
prin
decarboxilare
diaminele
corespunztoare. Astfel, prin decarboxilarea lizinei se formeaz cadaverina, iar ornitina trece n
putrescein. Aceste diamine au un miros specific, iar procesul de decarboxilare este deosebit de
intens n cadavre unde se realizeaz sub aciunea decarboxilazelor din microflora de putrefacie.
Mirosul specific de cadavru este datorat diaminelor care se formeaz n cantiti crescute:
51
CO 2
H2N (CH 2)4 CH COOH
I
NH2
Lezin-decarboxilaza
Lizin
CO2
H2N (CH 2)3 CH COOH
I
NH2 Ornitin-decarboxilaza
Ornitin
Putresceina se mai formeaz i prin decarboxilarea argininei. n acest caz se formeaz mai
nti agmatina n calitate de compus intermediar, iar aceasta se descompune prin hidroliz n uree
i putrescein:
CO2
H2N C NH (CH 2)3 CH COOH
II
I
ArgininNH
NH2
decarboxilaza
Arginin
H2N C NH (CH 2)3 CH 2 NH 2
II
NH
Agmatin
H2N (CH 2)4 NH 2
Putrescein
H2O
Agmatin-ureohidrolaza
H2N C NH
II
O
Uree
N
N
N
O
+
CH 2 S CH 3
I
(CH 2)2
I
CH NH 2
I
COOH
CO 2
S-Adenozil-metionindecarboxilaza
S-Adenozil-metionin
N
N
N
N
O
+
CH2 S CH3
I
(CH2)2
I
CH2 NH2
S-(3'-Adenozil)-5'-metilmercaptopropilamin
Restul propilamin din S-(3-adenozil)-5-metilmercapto-propilamin se condenseaz apoi
cu o molecul de putrescein cu formare de metiltioadenozin i spermidin:
52
N
N
N
O
N
+
CH2 S CH3
N
I
H2N(CH2)4NH2
(CH2)2
I
CH2 NH 2
S-(3'-Adenozil)-5'-metilmercaptopropilamin
+
N
CH2 S CH3
N
O
Metiltioadenozin
Spermidin
Pentru biosinteza sperminei se repet procesul de decarboxilare a S-adenozilmetioninei,
iar restul propilamin din S-adenozilmetil-mercapto-propilamina format se transfer pe o molecul
de spermidin:
H2N (CH2)4 NH (CH 2)3 NH2
CH2CH2CH2NH2
Spermidin
CH 2 CH 2 NH 2
Fenilalanindecarboxilaza
Feniletilamin
CO2
HO
N
N
H
CH 2 CH COOH
TirozinI
decarboxilaza
NH2
Tirozin
HO
CH 2 CH COOH
CO2
I
NH 2
Histidin-decarboxilaza
Histidin
CH 2 CH 2 NH 2
Tiramin
CH 2 CH 2 NH 2
N
N
H
Histamin
CO2
HOOC CH 2 CH2 CH COOH
HOOC CH 2 CH2 CH 2 NH2
I
NH2
Glutamat-decarboxilaza
Acid glutamic
Acid -aminobutiric
N
H
Triptofan
CO2
CH2 CH COOH
I
NH2 Triptofan-decarboxilaza
HO
N
H
HO
N
H
Triptamin
HO
CO2
CH2 CH COOH
I
NH2 Triptofan-decarboxilaza
5-Hidroxitriptofan
HO
CH 2 CH 2 NH 2
CO2
CH2 CH COOH
I
NH2
Triptofan-decarboxilaza
3,4-Dihidroxifenilalanin
(DOPA)
HO
HO
Dihidroxifeniletilamin
(DOP-amin)
CH2 CH2 NH CO CH 3
N
H
Melatonin
(triptamina, serotonina, DOP-amina etc.), iar la unele plante muli alcaloizi se sintetizeaz prin
utilizarea n calitate de precursori a aminelor biogene. Multe amine biogene sunt deosebit de toxice
pentru organismul uman i animal, din care cauz, excesul lor n organism poate fi letal. O
cantitate relativ crescut de amine biogene se poate forma prin alterarea alimentelor de origine
animal bogate n proteine, sub aciunea decarboxilazelor microorganismelor. Acest fenomen
explic toxiinfeciile alimentare cauzate de consumul de preparate din carne alterat, mai ales cele
din ficat i pete care sunt alimentele cele mai uor alterabile. La consumuri exagerate de proteine
de origine animal, procesul de decarboxilare a aminoacizilor este deosebit de intens datorit
necesitii degradrii rapide a excesului de aminoacizi. Aminele biogene formate n acest caz sub
aciunea decarboxilazelor endogene pot determina apariia gutei.
Formarea aminelor biogene toxice poate avea loc i n organismele vegetale. n anumite
condiii nefavorabile de dezvoltare, n esuturile plantelor se acumuleaz cantiti mari de amine
biogene care provoac intoxicaii. De exemplu, insuficiena potasiului n sol determin
intensificarea formrii putresceinei care influeneaz nefavorabil frunzele.
n condiiile unui metabolism echilibrat, organismele vii au capacitatea de a metaboliza n
continuare aminele biogene toxice prin oxidarea lor sub aciunea unor enzime specifice. De
exemplu, monoaminoxidazele (MAO) catalizeaz dezaminarea oxidativ a monoaminelor cu
formarea aldehidelor corespunztoare, amoniacului i apei oxigenate:
R CH 2 NH 2+ O2 + H2O
Monoaminoxidaza
R C = O + NH 3 + H2O2
I
H
Aceste reacii sunt cuplate de regul cu aciunea catalazei sau peroxidazei deoarece unul
din produii de reacie (H2O2) este, de asemenea, toxic pentru celula vie.
Oxidarea diaminelor are loc sub aciunea diaminoxidazelor specifice (DAO) i conduce la
formarea amino-aldehidelor corespunztoare, amoniacului i apei oxigenate:
O2
H2O
H2N (CH 2)n NH 2
DAO
CO2
HOOC CH 2 CH COOH
I
NH 2
Acid aspartic
55
urm se formeaz din etanolamin prin metilare treptat, donorul de grupri metil fiind S-adenozilmetionina:
CO2
CH 2 CH COOH
I
I
OH NH 2
Serin-decarboxilaza
HO CH 2 CH 2 NH 2
Serin
Etanolamin
(colamin)
CH3
CH3
HO CH2 CH2 NH CH3
Metiletanolamin
CH3
CH3
HO CH2 CH2 N
CH3
+
HO CH 2 CH2 N
CH3
CH3
Colin
Dimetiletanolamin
CH3
NH3
Aspartat
NAD(P)H
H2O
NAD(P)
Glutamat
Oxaloacetat
1 glutamat-dehidrogenaza
2 aspartat-aminotransferaza
Aminotransferaz
COOH
I
C=O +
I
R1
COOH
I
CH NH 2
I
R2
56
Reacia de transaminare a fost pus n eviden prima dat n 1938 de ctre Braunstein i
Kritzman. Ulterior s-a demonstrat c ea este larg rspndit, att n lumea vegetal ct i n cea
animal. Din cei 22 aminoacizi proteinogeni, un numr de 11 sufer n mod obinuit reacii de
transaminare: alanina, fenilalanina, triptofanul, tirozina, valina, arginina, acidul aspartic,
asparagina, izoleucina, cisteina i lizina. Aminotransferazele ce catalizeaz aceste reacii conin n
calitate de cofactor enzimatic piridoxal-fosfatul. Reaciile de transaminare sunt reacii reversibile,
iar n condiii normale constanta de echilibru are o valoare apropiat de unitate.
Aminotransferazele sunt localizate att intramitocondrial ct i n faza solubil a
citoplasmei celulelor eucariote, iar rolul este extrem de diferit.
Pe parcursul reaciei de transaminare, piridoxal 5 fosfatul (PALP) trece reversibil n
pirodixamin-5-fosfat (PAMP):
HO
H3C
HC=O
I
CH 2 O P
CH2 NH 2
I
CH 2 O P
HO
H3C
Piridoxamin-5-fosfat (PAMP)
Piridoxal-5-fosfat (PALP)
CH3
E N = CH
N +
R1 CH COOH
I
NH2
CH2 O P
S1
HO
CH3
R1 CH N = CH
N
I
COOH
CH2 O P
E NH2
ES1 (aldimin)
Se formeaz o nou baz Schiff ntre aminoacid i piridoxal-fosfat care este o aldimin i
care rmne legat de apoenzim prin legturi slabe, necovalente (ceea ce nseamn c n acest
caz cofactorul enzimatic este coenzim). n etapa urmtoare are loc o izomerizare cnd legtura
dubl i schimb poziia, aldimina trecnd n cetimin. Aceasta din urm, sufer apoi o reacie de
hidroliz cu formarea -cetoacidului i eliberarea cofactorului sub form de piridoxamin-5-fosfat:
HO
CH3
R1 CH N = CH
N
I
COOH
CH2 O P
E NH 2
ES1 (aldimin)
HO
CH3
R1 C = N CH 2
N
I
COOH
CH2 O P
E NH 2
EP1 (cetimin)
57
H2O
HO
R1 C COOH +
II
O
CH3
H2N CH2
E NH2
CH2 O P
Cetoacid
CH 3
H2N CH 2
H2O
R2 C COOH
II
O
CH 2 O P
-Cetoacid
E
HO
R2 C = N CH
I
COOH
CH 3
E NH 2
CH 2 O P
ES 2 (Cetimin)
HO
CH3
R2 CH N = CH
N
I
COOH
CH2 O P
H2O
E NH2
ES2 (Aldimin)
HO
R2 CH NH
I
COOH
-Aminoacid
E N = CH
CH 3
N
CH 2 O P
E
58
COOH
COOH
COOH
COOH
I
I
I
I
CH2
CH2
CH2
CH2
I
I
I
I
PALP
CH NH 2 + CH2
C = O + CH2
Aspartat-aminotransferaza
I
I
I
I
COOH
COOH
(TGO)
C=O
CH NH 2
I
I
COOH
COOH
Acid aspartic
Acid
Acid glutamic
Acid
oxalilacetic
-cetoglutaric
COOH
I
CH NH 2 +
I
CH 3
COOH
I
PALP
CH 2
I
Alanin-aminotransferaza
CH 2
(TGP)
I
C=O
I
COOH
Acid
-cetoglutaric
COOH
I
C=O +
I
CH 3
Alanin
Acid
piruvic
COOH
I
CH 2
I
CH 2
I
CH NH 2
I
COOH
Acid glutamic
Determinarea activitii acestor dou enzime n serul sanguin se efectueaz n mod curent
n laboratoarele clinice pentru diagnosticul unor maladii ale ficatului i inimii. n general,
aminotransferazele prezint o nalt specificitate fa de ambele substrate, avnd ns o mai mare
afinitate fa de cetoacid dect fa de aminoacid (KM cetoacid < KM aminoacid). Pentru metabolismul
proteic, transaminarea aminoacizilor prezint o importan deosebit deoarece aceste reacii fac
parte din cile de degradare a unor aminoacizi i, n acelai timp, de biosintez a altora. Pe de alt
parte, participarea -cetoacizilor face ca aceste reacii s reprezinte puncte de ntretiere ale cilor
metabolismului proteic, glucidic i lipidic. n urma acestor reacii, alturi de cetoacid, se formeaz
acidul glutamic care, la rndul su se poate dezamina oxidativ sau poate intra n alte ci de
degradare sau biosintez. Fiind reversibil, reacia de transaminare servete la biosinteza
aminoacizilor neeseniali prin utilizarea n calitate de precursori a acidului glutamic i a cetoacizilor corespunztori. Reaciile de transaminare mai fac parte din unele secvene metabolice
cum ar fi cele de biosintez a ureei, acidului -aminobutiric etc.
Transamidinarea i transmetilarea aminoacizilor
Spre deosebire de decarboxilare, dezaminare i transaminare care se ntlnesc la toi
aminoacizii, reaciile de transamidinare i transmetilare sunt procese enzimatice pe care le sufer
doar unii aminoacizi, n urma lor formndu-se o serie de compui cum ar fi creatina, carnitina,
ornitina, canavalina, canavanina i altele. Enzimele ce catalizeaz aceste reacii se numesc
transamidinaze i respectiv transmetilaze (sau metiltransferaze). Enzimele din prima categorie
au fost evideniate n rinichi, ficat i pancreas, sunt nalt specifice i folosesc arginina n calitate de
donor de grupri amidinice. Metiltransferazele se ntlnesc n majoritatea esuturilor i utilizeaz Sadenozilmetionina n calitate de donor de radicali metil.
II.1.2. Ciclul ureogenetic
Amoniacul rezultat n urma proceselor de dezaminare a aminoacizilor, precum i din alte
procese metabolice ale acestor biomolecule este un produs toxic pentru celula vie, chiar i n
concentraii relativ mici. La mamifere, acest produs final de metabolism este convertit n uree, fiind
apoi eliminat pe cale renal.
Primele observaii asupra acestei ci metabolice au fost fcute de ctre Krebs care a
observat c ornitina, citrulina i arginina accelereaz producerea de uree n prezena amoniacului,
fr ca ele nsele s se consume. Clarificarea complet ns a mecanismului prin care amoniacul
este convertit in vivo n uree a fost realizat mult mai trziu.
Aceast cale metabolic debuteaz prin mobilizarea amoniacului sub aciunea
carbamilfosfat-sintetazei care, n prezen de ATP ca surs de energie i radicali ortofosfat,
catalizeaz reacia de condensare a amoniacului cu dioxidul de carbon cu formare de carbamilfosfat:
59
2ATP
2ADP + P i
2+
HCO 3
+
NH 4
Mg
Carbamilfosfatsintetaza
O
O
II
II
2N C O P OH
I
OH
ATP
2+
ADP + Pi
Mg K
Carbamilfosfat
sintetaza II
O
O
II
II
H2N C O P OH + CH 2 CH 2 CH COOH
I
I
I
OH
COOH
NH 2
Acid glutamic
Carbamil-fosfat
Ornitin
O
II
H2N C NH (CH 2)3 CH COOH
I
NH2
Citrulin
Acid aspartic
AMP + PPi
Mg2+
Argininosuccinatsintetaza
HN
CH 2 COOH
I
NH CH COOH
C
I
NH (CH 2)3 CH COOH
I
NH 2
Acid arginino-succinic
60
Reacia de mai sus este, n principiu, reversibil ns, n condiii fiziologic normale,
pirofosfatul rezultat este hidrolizat rapid sub aciunea pirofosfatazei, ceea ce face ca echilibrul
reaciei s se deplaseze spre dreapta. n etapa urmtoare acioneaz arginino-succinat liaza
care scindeaz acidul arginino-succinic cu formare de arginin i acid fumaric:
HN
CH 2 COOH
I
NH CH COOH
Argininosuccinat liaza
H C COOH
II
HOOC C H
C
I
NH (CH 2)3 CH COOH
I
NH 2
Acid fumaric
Acid arginino-succinic
Arginin
H2O
Arginaza
NH2
HN
I
NH2
(CH2)3
C
+
I
I
CH NH2
OH
I
COOH
Ornitin
H2N
NH2
C
II
O
Uree
Ureea format n aceast cale metabolic este transportat pe cale sanguin la rinichi, fiind
eliminat apoi prin urin. Pentru fiecare molecul de uree format se consum o molecul de
dioxid de carbon i o molecul de amoniac care reprezint precursorii atomului de carbon i
respectiv a unuia din atomii de azot ai ureei. Cellalt atom de azot este cedat de acidul aspartic
care, la rndul su, este regenerat continuu n cursul proceselor de transaminare ce au loc ntre
glutamat i oxaloacetat.
______________________________________________________________________
ntrebri de verificare i evaluare a cunotinelor
Care sunt cile comune de degradare a aminoacizilor? Scriei succesiunile reaciilor ce au loc.
Care este importana biologic a ciclului ureogenetic i ce reacii au loc n aceast cale
metabolic?
______________________________________________________________________
II.2. Biosinteza proteinelor
n toate organismele vii, biosinteza proteinelor reprezint principalul proces prin intermediul
cruia se asigur expresia informaiei genetice codificat n succesiunea bazelor azotate din
moleculele de ADN ntr-un tip de metabolism, specific fiecrei specii de vieuitoare n parte.
Principala caracteristic a procesului de biosintez a proteinelor const n exactitatea sa
deosebit. Structura proteinelor este programat genetic i se conserv din generaie n generaie,
moleculele proteice sintetizndu-se de mai multe ori n acelai organism, fr abateri eseniale de
la succesiunea dat a aminoacizilor. Aceast exactitate deosebit este asigurat de ctre
mecanismele moleculare ce stau la baza cilor de biosintez proteic.
61
Codul genetic
Plecnd de la faptul c n moleculele de ADN exist patru tipuri de baze azotate, iar n
structura proteinelor intr de regul 20 de aminoacizi, prin calcul matematic se constat c
secvena nucleotidic suficient pentru codificarea unui aminoacid este reprezentat de o
combinare de trei nucleotide adiacente, aceasta primind numele de triplet sau codon. Din cele
patru nucleotide se pot forma C43 = 64 de triplete diferite, fapt ce ofer posibilitatea codificrii
tuturor celor 20 de aminoacizi proteinogeni. Raportul numeric nucleotide/aminoacizi = 3/1 a fost
determinat i pe cale experimental. Decodificarea codului genetic, adic stabilirea compoziiei
nucleotidice concrete i a succesiunii tripletelor pentru toi cei 20 de aminoacizi proteinogeni a fost
elucidat relativ recent. Deoarece n procesul de biosintez a proteinelor se decodific informaia
coninut n ARNm, codonii se reprezint grafic de regul sub forma tripletelor de ribonucleotide.
P L V
h e a yC
e u s
l
G
A
C
U
G
A
C
U
G
A
C
U
G
A
AG
U C AG U C A G
G U
C
G U
U
G
C
GA
U G
A
G
U
A C
A
C
U
UC
A
CU
G
G A UG ACU
C
UG
etc.
C
A
G
U
C
A
G
U
C
A
G
U
C
A
62
PP i
ATP
H2N CH COOH
I
Aminoacil-ARN t-sintetaza
R
O
II
E [H 2N CH C ~ O AMP]
I
R
Aminoacid
Aminoacil-AMP
(complex ES)
Se formeaz deci complexul hiperreactiv dintre enzim i dou din cele trei substrate, adic
aminoacidul i molecula de ATP. Acest complex interacioneaz apoi cu cel de-al treilea substrat
care este ARNt-ul specific aminoacidului activat:
O
II
E [H2N CH C ~ O AMP]
I
R
ARNt
Aminoacil-AMP
AMP Enzim
O
II
H2N CH C ~ ARN t
I
R
Aminoacil-ARN t
Sub aceast form, aminoacizii sunt api de a intra n procesul propriu-zis de biosintez a
proteinelor.
Biosinteza propriu-zis a proteinelor (translaia)
Complecii aminoacilARNt sintetizai n citoplasm sunt transportai spre ribozomi unde
are loc procesul propriu-zis de biosintez a catenelor polipeptidice ce vor alctui viitoarele
molecule proteice. Etapa ribozomal a biosintezei proteinelor poart numele de translaie
deoarece acest proces const n traducerea (sau translarea) informaiei genetice stocat n
succesiunea mononucleotidelor ce formeaz ARNm n succesiunea resturilor de aminoacizi din
proteina nou sintetizat. Translaia informaiei genetice din ARNm n structura primar a proteinelor
se realizeaz la rndul ei n trei etape distincte:
iniierea translaiei;
elongarea sau translaia propriu-zis;
terminarea translaiei.
Iniierea translaiei nseamn recunoaterea punctului de start n ARNm. Pentru ca
iniierea translaiei s debuteze este nevoie ca aminoacizii dizolvai n citoplasm s fie activai.
Aceasta are loc sub aciunea enzimelor numite aminoacil-ARNt-sintetaze. Aciunea acestor enzime
cere prezena ionilor de Mg2+, fiecare aminoacid are enzima sa specific (exist deci cel puin 20
aminoacil-ARNt-sintetaze) iar energia necesar pentru procesul de activare a aminoacizilor este
furnizat de ATP. Iniierea translaiei nu este ntmpltoare. La nivelul ribozomului este transportat
un anumit complex de aminoacid-ARNt pe baza recunoaterii dintre codonul din ARNm i
anticodonul din ARNt. Codonul ce declaneaz iniierea se numete codon de iniiere.
Etapa de elongare clivarea ribozomului de-a lungul ARNm.
Sinteza unei polipeptide ncepe de la captul N-terminal i se termin cu extremitatea Cterminal. Creterea polipeptidei cu un aminoacid se efectueaz n trei stadii:
legarea urmtorului aminoacil-ARNt;
transpeptidarea (formarea legturii peptidice sub aciunea enzimei peptidil-transferaz;
translocaia.
Acest proces complex se repet ciclic pn cnd ntreaga informaie coninut de ARNm
este tradus n secvena aminoacidic a proteinei codificate.
ncheierea (terminarea) translaiei se produce atunci cnd ribozomul ajunge n dreptul
aa numitului codon non-sens (UAG, UGA, UAA) care nu codific nici un aminoacid.
Multe catene polipeptidice eliberate de pe ribozom sufer modificri ulterioare care au drept
rezultat structura spaial final a proteinelor ce determin activitatea lor biologic.
__________________________________________________________________
ntrebri de verificare i evaluare a cunotinelor
Ce este codul genetic i care sunt caracteristicile lui?
63
64
nti zaharificrii cu ajutorul amilazelor. Deoarece levurile nu conin amilaze, mediul de fermentaie
se suplimenteaz cu mal (orz ncolit) sau preparate amilazice izolate din ciuperci. Maltoza
format din amidon sub aciunea amilazelor este scindat apoi n glucoz de ctre maltaza din
levuri. Fermentaia alcoolic decurge dup un mecanism care este identic pn la etapa de
formare a acidului piruvic inclusiv, cu secvena reaciilor din glicoliz. Spre deosebire de glicoliz,
acidul piruvic n fermentaia alcoolic este supus decarboxilrii ireversibile n acetaldehid sub
aciunea piruvatdecarboxilazei care are drept coenzim TPP. n etapa final alcooldehidrogenaza
reduce cu ajutorul NADH acetaldehida n alcool etilic.
II.3.3. Decarboxilarea oxidativ a acidului piruvic
n majoritatea celulelor vegetale i animale, precum i la unele microorganisme, acidul
piruvic se degradeaz prin decarboxilare oxidativ cu formare de acetil CoA. Acest proces este
catalizat de un complex multienzimatic numit piruvatdehidrogenaz, format din trei enzime i cinci
coenzime: piruvatdehidrogenaza, dihidrolipoiltransacetilaza, dihidrolipoildehidrogenaza i respectiv
tiaminpirofosfatul, acidul lipoic, coenzima A, nicotinamidadenindinucleotidul (NAD) i
flavinadenindinucleotidul (FAD) (fig. II.2.).
Fig. II.4. Schema general a structurii piruvatdehidrogenazei i a decarboxilrii oxidative a acidului piruvic
66
Catena respiratorie
Oxidarea substanelor organice n celula vie se realizeaz prin dehidrogenare. Procesul de
transfer al protonilor i electronilor de la substratele supuse oxidrii spre O2 se numete respiraie
i este catalizat de o serie de oxidoreductaze (dehidrogenaze nicotinamiddinucleotidice,
dehidrogenaze flavinice i citocromi - proteine transportoare de electroni -). Totalitatea acestor
enzime formeaz aa numita caten respiratorie care are structur de tip cascad ce permite
eliberarea treptat a energiei libere. Aceast energie liber se acumuleaz parial n legturile
chimice macroergice ale ATP. Transferul protonilor i electronilor prin catena respiratorie spre O 2
are loc cu o scdere mare a energiei libere, care parial se pierde sub form de cldur, parial se
acumuleaz n legturile chimice macroergice ale ATP. Sinteza ATP din ADP i acid fosforic cu
ajutorul energiei procesului de oxidare biologic se numete fosforilare oxidativ.
__________________________________________________________________
ntrebri de verificare i evaluare a cunotinelor
Ce este metabolismul i care sunt principalele lui componente?
Descriei calea de degradare a glucozei prin glicoliz anaerob
____________________________________________________________________
67
Atunci cnd acizii grai rezultai prin hidroliza lipidelor sunt insuficieni, ei se sintetizeaz
prin utilizarea n calitate de precursori a acetil CoA. Calea de biosintez a triacilglicerolilor poate
fi redat schematic astfel:
Catabolismul triacilglicerolilor
Triacilglicerolii (trigliceridele) ca form de depozitare a excesului caloric al organismului se
gsesc n cantiti apreciabile n esutul adipos. Un adult normal (brbat de 40 de ani i 70 de kg)
cuprinde 15 kg esut adipos (135 kilocalorii). Energia potenial a acilglicerolilor este cuprins n
catenele bogate n hidrogen ale resturilor acil. n esuturi catabolismul triacilglicerolilor are loc n
etape, pn la formarea de glicerol i acizi grai corespunztori care se absorb la nivelul peretelui
intestinal. Procesul este catalizat de ctre lipaz, enzim ntlnit att la plante, microorganisme
ct i n esuturile animale. La animale lipidele sunt mai nti emulsionate sub aciunea srurilor
biliare din bil ceea ce determin creterea suprafeei de contact dintre cele dou faze.
68
CH 2
CH
CH 2
OH
ATP
ADP
OH
OH
glicerol-kinaz
CH 2
OH
CH
OH
CH 2
glicerol
glicerol-fosfat
Aceast enzim este foarte activ n ficat, dar este practic absent n adipocite. Glicerolul
format n esutul adipos difuzeaz n plasm de unde este captat de ficat care l utilizeaz dup
conversie n glicerol fosfat.
Glicerolfosfatul mai poate fi obinut din glucoz, mai exact din dihidroxiaceton fosfat,
intermediar al glicolizei anaerobe, prin reacia reversibil:
Dup condiiile specifice fiecrui esut, glicerol fosfatul poate evalua pe urmtoarele ci
metabolice:
poate fi transformat n trigliceride sau fosfogliceride;
dup conversia sa ntr-un triozofosfat (dihidroxiaceton fosfat i 3 gliceraldehid fosfatul)
poate urma calea glicolitic degradativ i apoi oxidare complet la dioxid de carbon i ap; ca
triozofosfat poate fi substrat gluconeogenetic.
II.4.3. Metabolismul acizilor grai
Degradarea acizilor grai se face pe mai multe ci. Cea mai important este -oxidarea
care reprezint procesul de degradare complet cu formare de dioxid de carbon, ap i energie.
Aceast cale de degradare a fost postulat prima dat n 1904 de ctre Franz Knopp. Hrnind
animalele de experien cu fenil derivai ai acizilor carboxilici cu pn la cinci atomi de carbon n
molecul, autorul studiaz metabolismul acestor substane urmrind produii ce apar n urin. El
constat c derivaii cu numr impar de atomi de carbon au fost oxidai la acid benzoic, iar cei cu
numr par de atomi de carbon dau acid fenil acetic.
Din aceste experimente Knopp trage concluzia c degradarea acizilor grai are loc cu
desprinderea treptat a unor fragmente cu doi atomi de carbon. Mecanismul -oxidrii a fost
clarificat cu aproape jumtate de secol mai trziu cnd Lynen reuete s izoleze din drojdii acetil
69
CoA. El conchide c degradarea acizilor grai prin -oxidare se realizeaz prin clivarea unor
fragmente cu doi atomi de carbon sub form de acetil CoA.
Procesul -oxidrii acizilor grai se realizeaz n mai multe etape (fig. II.4.). Prima etap o
reprezint activarea acizilor grai prin formarea unor compleci cu CoA. Reacia de activare este
catalizat de enzime specifice numite tiokinaze sau acil CoA sintetaze. La rndul ei, etapa de
activare cuprinde dou faze: mai nti acidul gras interacioneaz cu ATP ul formnd un produs
intermediar acil - adenilatul. Dup etapa de activare, complecii acil CoA astfel formai ptrund
n mitocondrii unde se realizeaz degradarea propriu-zis. Transformrile ce urmeaz sunt ciclice,
la fiecare ciclu desprinzndu-se cte doi atomi de carbon sub form de acetil CoA, iar noul acil
CoA ce este mai scurt deci cu doi atomi de carbon, reia un nou ciclu de transformri:
______________________________________________________________________
ntrebri de verificare i evaluare a cunotinelor
Ce reacii au loc n calea de biosintez a triacilglicerolilor?
______________________________________________________________________
70
BIBLIOGRAFIE SELECTIV
1. Artenie, Vl. 1976, Curs de chimie biologic, Vol II, Ed. Univ. AL. I. Cuza Iai.
2. Artenie, Vl. 1987, Biochimia i organizarea molecular a cromozomului eucariot, Ed. Univ. Al. I.
Cuza Iai.
3. Artenie, Vl. 1986, Acizii nucleici i rolul lor genetic, Ed. Univ. Al. I. Cuza, Iai.
4. Artenie, Vl. 1991, Biochimie, Ed. Univ. Al. I. Cuza Iai.
5. Ashwell, G., Kawasaki, T. 1978, A Protein from Mammalian Liver That specifically Binds
Galactose-Terminated Glycoproteins, in: Methods in Enzymology, vol. L, Part C, Acad. Press, Inc.
6. Branden, C., Tooze, J. 1991, Introduction to Protein Structure, Garland Publ. Inc., New York7.
8.
9.
10.
11.
12.
13.
14.
15.
16.
17.
18.
19.
20.
21.
22.
23.
24.
25.
26.
27.
28.
London.
Brody, T. 1994, Nutritional Biochemistry, Acad. Press Inc., San Diego, California.
Cacan, R. 1999, La biosynthse des N-glicosylprotines, in: 3me Ecole dt Francophone de
Biochimie, Iai, 5-17 juillet.
Calladine, C. R., Drew, H. R. 1992, Understanding DNA, Acad. Press, Inc., London-San DiegoNew York.
Cann, J. R. 1978, Measurements of Protein Interactions Mediated by Small Molecules Using
Sedimentation Velocity, in: Methods in Enzymology, vol. XLVIII, Part F, Acad. Press, Inc.
Cazzone, A. J. 1988, Protein phosphorylation in prokaryotes, in: Annu. Rev. Microbiol., Vol. 42.
Clavey, V. 2001, Structure et Mtabolisme des Lipoprotines Plasmatiques, in: Biochimie
Structurale.
Cojocaru, D.C. 1996, Biochimia vitaminelor, Ed. Gama, Iai.
Cojocaru, D.C. 1997, Enzimologie, Ed. Gama, Iai.
Cojocaru, D.C., Doina-Irina Cojocaru, Elena Ciornea 1999, Biochimia hormonilor, Ed. Corson,
Iai.
Cojocaru, D.C., Mariana Sandu 2004, Biochimia proteinelor i acizilor nucleici, Ed. Pim, Iai.
Dumitru, I. F. 1980, Biochimie, Ed. Did. i Ped., Bucureti.
Lentner, C. 1986, Geigy Scientific Tables, Vol. 4, Biochemistry, Metabolism of Xenobioticc, Inborn
Errors of Metabolism, Basle, Switzerland.
Montreuil, J. 1996, Structure and Biosynthesis of Glyco-proteins, in: Polysaccharides in Medicinal
Applications (ed. by Severian Dimitriu), M. Dekker, Inc., New York.
Montreuil, J. 1996, Normal and Pathological Catabolism of Glycoproteins, in: Polysaccharides in
Medicinal Applications (ed. by Severian Dimitriu), M. Dekker, Inc., New York.
Pelmont, J. 1995, Enzymes. Catalyseurs du monde vivant, Presse Universitaires de Grenoble,
Grenoble.
Racadot, A. 1990, La Sexbinding protein ou SBP (protine de transport des hormones
sexuelles), in: Immunoanal. Biol. Spc., Vol. 21, Elsevier, Paris.
Racadot, A. 1991, Biosynthse des hormones thyroidiennes. Aspects biochimiques, in:
Immunoanal. Biol. Spc., Vol. 30, Elsevier, Paris.
Popescu Aurora, Dinu Viorica, Truia, E., Popa Cristea Elena 1996, Biochimie Medical, Ed.
Medical, Bucureti.
Simionescu Ligia 1982, Radioimunoanaliza hormonilor, Ed. Medical, Bucureti.
Tma Viorica, Boitor, I. 1977, Hormonii i funciile lor biochimice, Ed. Ceres, Bucureti.
Teodorescu-Exarcu, I. (sub red.) 1974, Patologie biochimic, Ed. Medical, Bucureti.
Voet, D., Voet, J.G. 1990, Biochemistry, John Wiley & Sons, New York.
71
CUPRINS
I.
I.1.
I.1.1.
I.1.2.
I.1.2.1.
I.1.2.2.
I.1.2.3.
I.1.2.4.
I.1.2.5.
I.1.2.6.
I.1.2.7.
I.1.2.8.
I.1.2.9.
II.
II.1.
II.1.1.
II.1.1.1.
II.1.1.2.
II.1.1.3.
II.1.2.
II.2.
II.3.
II.3.1.
II.3.2.
II.3.3.
II.3.4.
II.4.
II.4.1.
II.4.2.
II.4.3.
INTRODUCERE
BIOCHIMIE STRUCTURAL
COMPOZIIA CHIMIC A ORGANISMELOR VII
Molecule bioanorganice
Molecule bioorganice
Aminoacizi
Peptide
Proteine
Acizi nucleici
Enzime
Glucide
Lipide
Vitamine
Hormoni
BIOCHIMIE DINAMIC
METABOLISMUL AMINOACIZILOR
Ci comune de degradare a aminoacizilor
Dezaminarea aminoacizilor
Decarboxilarea aminoacizilor
Transaminarea aminoacizilor
Ciclul ureogenetic
BIOSINTEZA PROTEINELOR
METABOLISMUL GLUCIDELOR
Glicoliza anaerob a glucidelor
Fermentaia
Decarboxilarea oxidativ a acidului piruvic
Ciclul Krebs
METABOLISMUL LIPIDELOR
Metabolismul triacilglicerolilor
Metabolismul glicerolului
Metabolismul acizilor grai
BIBLIOGRAFIE
3
4
4
4
4
4
7
9
13
21
29
36
40
45
47
47
47
47
50
55
58
60
62
62
63
64
64
66
66
67
67
68
72
73