Explorați Cărți electronice
Categorii
Explorați Cărți audio
Categorii
Explorați Reviste
Categorii
Explorați Documente
Categorii
i F a r m a c i e N. T e s t e m i a n u
L. LSI
BIOCHIMIE
MEDICAL
Chiinu 2007
Universitatea de Stat de Medicin i Farmacie
N. Testemitanu
9
L. L S ll
BIOCHIMIE
MEDICALA
..... 665146
I UNIVERSITATEA OB STAT
I DE MEDICINA l FARMACIE
NICOLAE TESTEMIEANU"
'B IB L IO T EC A
C h i in u 2007
Aprobat de Consiliul metodic central al U.S.M.F. Nicolae Testem ianu
Recenzeni:
I.Vaintraub, ef al laboratorului Biochimia proteinelor de la U.S.M., profesor
universitar, doctor habilitat n biologie
V.Gudumac, ef al laboratorului Biochimie n L..C. de la U.S.M.F. Nicolae
Testemianu, profesor universitar, doctor habilitat n medicin
V.Hotineanu, profesor universitar, doctor habilitat n medicin, Laureat al Premiului
de Stat al RM n domeniul tiinei i Tehnicii, Om Emerit
CUPRINS
Cuprins IV-IX
Cuvnt in a in te..................................................................................................... X
Prefa
- Noiuni generale................................................................................................ 1
-Particularitilemateriei v ii................................................................................... 3
Cap.I. Proteinele.Enzimele
- Structura i funcia biologic a proteinelor.......................................................12
- Structura prim ar............................................................................................. 20
- Structura secundar.......................................................................................... 27
- Structura tridimensional...................................................................................31
- Foldingul. Problema mpachetriispecifice a lanului polipeptidic................... 35
- Peptidele active................................................................................................ 40
- Clasificarea proteinelor.................................................................................... 44
- Holoproteinele..................................................................................................45
- Heteroproteinele.............................................................................................. 48
- Proprietile generale ale proteinelor...............................................................49
- Solubilitatea......................................................................................................49
- Proprietile electrochimice.............................................................................. 50
- Precipitarea i denaturarea proteinelor........................................................... 52
- Metodele de identificare a proteinelor.............................................................54
- Enzimele...........................................................................................................58
- Structura enzimelor........................................................................................... 59
- Specifitatea enzimelor....................................................................................... 61
- Exprimarea activitii enzimatice...................................................................... 6 8
- Enzimele alosterice........................................................................................... 70
- Inhibiia activitii enzimelor.............................................................................. 75
- l7X)cnzimele.............................................................................................................. 81
- Clasificarea enzimelor.......................................................................................83
- Coenzimele....................................................................................................... 87
- Metaloproteinazele..........................................................................................94
Cap.II. Acizii nucleici
- Structura chimic................................................................................................95
- Proprietile fizico-chimice.................................................................................96
- Rolul nucleotidelor..............................................................................................98
- DNA. Structura prim ar....................................................................................98
- Structura secundar.......................................................................................... 100
- Structura teriar.............................................................................................. 102
- Structura R N A ................................................................................................ 107
- Replicarea (biosinteza D N A )......................................................................... 111
- Repararea DNA................................................................................................115
- Particularitile biosintezei DNA la eucariote................................................... 117
- Telomeraza....................................................................................................... 118
- Transcrierea (biosinteza RNA) .....................................................................130
- Particularitile transcrierii la eucariote.............................................................136
- Sinteza DNA pe matricea de R N A ................................................................. 137
- Codul genetic.....................................................................................................139
- Mutaiile............................................................................................................. 142
- Recombinarea genetic (ingineria genetic)..................................................... 145
- Biosinteza proteinelor..................................................................................... 152
- Particularitile biosintezei proteice la eucariote................................................ 161
- Inhibitorii sintezei proteinelor............................................................................. 161
- Reglarea biosintezei proteinelor........................................................................ 163
Cap.III. Bioenergetica
- Aspecte generale............................................................. .................................. 171
- Metabolismul.....................................................................................................174
- Ciclul ..........................................................................................................176
- Mecanismele de reglare ale metabolismului......................................................179
- Decarboxilarea oxidativ a piruvatului.............................................................. 181
- Ciclul Krebs.......................................................................................................185
- Reacii anaplerotice...........................................................................................189
- Reglarea ciclului Krebs..................................................................................... 190
- Patologiile medicale...........................................................................................190
- Oxidarea biologic-respiraia tisular.......................................................... 192
- Lanul respirator................................................................................................ 193
- Caracteristica complexelor lanului respirator................................................ 196
- Inhibitorii lanului respirator.............................................................................. 200
- Generarea radicalilior liberi............................................................................... 201
- Mecanismele fosforilrii oxidative(cuplarea oxidrii cu fosforilarea)...............202
- Decuplanii fosforilrii oxidative........................................................................208
- Bolile mitocondriale...........................................................................................209
- Citopatiile mitocondriale...................................................................................210
- Sistemele-navet de transport al echivalenilor de reducere........................... 211
- Reglarea fosforilrii oxidative......................................... ..................................212
- Oxigenazele. Citocromul P4 5 0 i reaciile de oxido-reducere...........................213
- Bibliografie selectiv.....................................................................................605
- Index................................................................................................................ 606
Publicarea manualului Biochimie medical costituie o iniiativ meritorie a
profesorului universitar Leonid Lsi, ef catedr biochimie i biochimie clinic, USMF
N.Testemianu, care a extins coninutul cu date relevante n aspect teoretic i aplicativ.
O reediie a manualului precedent, primul manual consacrat biochimiei, e destul de
bine venit pentru coala naional. Biochimia, ca produs al gndirii laborioase i al ateniei
permanente a majoritii savanilor, are n ultimii anii un succes deosebit.
Materialul redat e compact aranjat i ilustreaz esena contemporan a tiinei date.
Progresul n medicin nu poate fi conceput fr o argumentare tiinific, de natur
biochimic, la diferite niveluri. Implicareabiochimici n specificul medical att n explicarea
strilor normale, ct i patologice reclama imperios cunoaterea reaciilor moleculare,
enzimelor specifice, ciclurilor tipice ale metabolismului, care au loc n toate celulele umane,
n fiecare capitol sunt ilustrate compartmentele de baz ale biochimiei modeme, cu adaosul
concis al realizrilor din ultimii ani. Coninutului e mult apropiat de medicina practica -
sunt expuse valorile normale ale majoritii indicilor biochimici ce se utilizeaz n
diagnosticul i pronosticul maladiilor. O importan deosebit are redarea mecanismelor
fine de reglare a metabolismului de ctre diferii factori (hormoni, ioni, vitamine,
medicamente) la diverse niveluri de organizare a materiei vii.
Autorul i-a asumat o responsabilitate distins de a prezenta acest material vast,
profund tiinific, ntr-un volum modest, strict necesar pentru nelegerea i dezvoltarea
capacitilor intelectuale ale viitorului medic.
Manualul prezint o baz tiinific pentru viitorii savani i/sau medici practicieni,
care doresc s ating culmile tiinei moderne, s-i consolideze i s-i completeze
nivelul cunotinelor n domeniul medicinii.
leremia ZOTA
d.h.m., profesor universitar,
Laureat al Premiului de Stat al RM
n domeniul tiinei i Tehnicii,
Om Emerit, membru corespondent a AM
CUVNT NAINTE
Autorul
PREFA
9
Editarea crii Biochimie medical aflat la a doua ediie are o conotaie deosebit.
Progresele acestei tiine sunt uimitoare, capabile s explice, prin modificri la nivel
molecular i atomar, cele mai dificile comportri ale materiei vii.
La dispoziia studenilor medici se pune un vast volum de cunotine ce corespund
cerinelor actuale, demne de atenia celor ce studiaz viaa. Sunt redate detalii tiinifice
de interes biochimic i medical, sunt expuse diverse aspecte de genetic medical.
Studenilor le sunt oferite aceste date tiinifice pentru -i ajuta s-i pun un fundament
puternic n studiul medicinii contemporane.
Manualul de biochimie medical utilizat de studeni trebuie s asigure realizarea
urmtoarelor deziderate:
a) asimilarea cunotinelor tiinifice despre fenomenele studiate n disciplinile inrudite
preclinice (fiziologie, fiziopatologie, farmacologie);
b) stimularea interesului pentru studierea i nelegerea proceselor fiziologice i
patologice predate n cursul clinic medical;
c) integrarea tiinific n variata cazuistic medical ntlnit n studiul disciplinelor
clinice care poate fi neleas numai dac se va realiza n baza noiunilor i cunotinilor
acumulate n anii precedeni.
Cunoaterea proceselor biochimice fundamentale i bazate pe elucidarea acestor
mecanisme, utilizarea unor teste de diagnostic - acesta e viitorul apropiat pentru diferitele
domenii ale medicinii practice.
Cele reprezentate pot fi i un imbold pentru viitorii savani, care i vor nchina viaa
studiului fascinantelor compartimente ale biochimiei modeme i medicinii.
Exprim cordiale mulumiri tuturor celor care au favorizat realizarea acestui volum, i
ndeosebi colaboratorilor pentru amabilitate i receptivitate.
i m gndesc la studenii care, studiind acest material i descoperind tainele vieii,
vor contientiza c s-a depus un efort considerabil pentru viitorul. M ncred n tinerii, de
azi specialiti redutabili de mine, care vor fauri un viitor demn de naintaii notri.
A u to ru l
NOIUNI
5 GENERALE
Cluzit de relevrile spirituale i practice, omul a depus i depune ncontinuu eforturi
dea ptrunde sensul vieii. La diferite etape de dezvoltare a gndirii el a desprins cele
mai fine legiti ale existenei materiei vii. Anticii nu ncetau s se minuneze de frumuseea
i misterele naturii fiinelor vii, remarend noi i noi fenomene, exprimri ale perfeciunii
ei, dar nu erau n stare s explice esena i armonia lumii nconjurtoare. Marele
adevr era interpretat c Mntuitorul a creat aceast lume.
Calea de acumulare a cunotinelor a fost lung i complicat. Aspectul tiinific i
croia drumul prin scolastica i metafizica materialitilor din epoca timpurie. Descoperirea
lui C. Darwin a contribuit la desctuarea spiritului uman. In baza unor date modeste i
a analizei profunde n domeniul paleontologiei, el formuleaz cea mai vast i universal
concepie n biologie - evoluia biologic continu.
Studiile savanilor din jumtatea a doua a secolului XIX sunt inspirate de aceas
t concepie. Dezvoltarea impetuoas a chimiei organice, anorganice i fizice a
permis i cercetarea unor sisteme vii - crete i numrul compuilor extrai din
organismele vii.
Complexitatea obiectelor materiale a condus la diferenierea cercetrilor tiin
ifice. Emil Fisher a determinat structura multor glucide, a elaborat metode de
extragere a aminoacizilor din hidrolizate proteice, a stabilit configuraiile optice
ale aminoacizilor i glucidelor, a demonstrat specificitatea aciunii enzimelor. Aceste
studii au stat la baza biochimiei.
Termenul biochimie a fost aplicat pentru prima dat n 1903 de ctre Cari Neiberg.
Astfel, pornind de la pilonii chimiei organice i fiziologiei noua tiin s-a structurat n mai
multe aspecte: enzimologie, imunologie, genetic, etc - net astzi optica cercetrilor
eclipseaz oportuniti din cele mai strigente ale problemelor actuale.
Ce reprezint azi biochimia modern?
1. Savanii, n calitate de criteriu, n investigaiile lor iau n considerare mrimea
particulelor studiate. Biochimiei i corespunde aranjamentul atomilor n molecul, adic
la nivel molecular. Bios n limba greac nseamn via. Prin urmare, biochimia este
tiina care studiaz bazele molcculare ale vieii.
2. Compuii organici simpli, constituentele organismelor aparin doar lumii vii i
sunt produse ale activitii biologice. Aceti compui sunt numii biom olecule i
au rol funcional de a servi drept blocuri de construcii n formarea structurilor biologice.
Ele au fost selectate evolutiv datorit capacitii de a ndeplini funcii strict determinate n
celulele vii. n toate organismele vii aceti compui sunt similari, interdependeni, care
interacioneaz, particip la procesele de transfer al energiei i ale transformrilor de
substane. Prin unnare, aceste biomolecule pot fi caracterizate din dou puncte de vedere:
chimic i biologic, ceea ce denot c biochim ia este o superchimie a materiei
organizat perfect, fapt ce ofer largi posibiliti n studiul tainelor organismelor
vii, o chimic a celei mai perfect organizate materii.
Biochimia este una dintre sferele tiinifice cele mai atrgtoare n aplicarea raiunii
umane, a talentului i forelor creatoare ale tineretului. Ea nregistreaz succese
remarcabile i o evoluie continu.
n ce rezid succesul acestei tiine?
1. Biochimia a reuit s elucideze bazele chimice ale unui ir de probleme referitoare
la structurile biomoleculelor i proceselor metabolice ca: dublul helix al DNA, codul
genetic, structura tridimensional a unor proteine, cile generale ale metabolismului.
2. Datorit biochimiei au fost determinate cile generale de transformare a molecule
lor i a principiilor ce stau la baza diferitelor forme de exprimare a vieii. Omul i
bacteriile au mult n comun la nivel molecular - aceleai blocuri de construcii pentru
formarea macromoleculelor, identitatea transmiterii infomiaiei genetice de la DNA *-
RNA protein, iar ATP, valuta energetic, este folosit n ambele cazuri.
3. Biochimia are o influen tot mai surprinztoare asupra medicinei, mai ales n stabilirea
diagnosticului clinic n baza activitatii enzimelor. Coninutul (prezena) unor enzime n
serul sanguin poate servi drept criteriu determinant al diagnosticului infarctului miocardic,
hepatitelor etc. Anume biochimia este suportul medicaiei. O importan deosebit o
are elucidarea mecanismelor moleculare ce stau la baza unor afeciuni ereditare, a
anomaliilor metabolismului.
Biochimia are o vast aplicare, fiind destinat att studenilor, medicilor, biologilor,
chimitilor, ct i oricrui om inteligent. Puini contientizeaz c un termen, azi simplu
pn la banalitate, conine un revers - munca titanic a multor savani, unii dintre care au
fost distini cu premiul Nobel.
4. Evoluia rapid a biochimiei le-a permis savanilor s cerceteze probleme cmciale
n biologie, medicin, cum ar fi: diferenierea celulelor i reglarea creterii lor, determinarea
rolului celulelor la formarea organismului, la dezvoltarea mecanismului memoriei, n
determinarea cauzelor cancerului i schizofreniei etc. Deocamdat rspunsuri complete
la multe ntrebri nu avem, dar un lucru e cert - toate aceste probleme sunt determinate
de factorii moleculari ce se modific continuu.
Complexele
Celula i organitele supramoleculare Macromoleculele Uniti monomerice
Un alt important nivel de studiu este cel multienzimatic, viznd proteinele specifice
reglatoare, ce intr n componena endo- i exomembranelor.
Compartimentele intracelulare se caracterizeaz prin prezena unor procese bio
chimice dominante. Aceste structuri se deosebesc nu numai morfologic i citochimic, dar
i biochimic. Anume la acest nivel are loc compartimentalizarea i specificarea proceselor
biochimice. Ca obiect pentru studiul metabolismului energetic servesc mitocondriile, iar
procesele biosintetice sunt concentrate n ribozomi i fraciunile citoplasmatice.
La nivelul celular are loc o interaciune ntre procesele biochimice n diferite structuri
intracelulare, cu integrarea lor. La acelai nivel, datorit prezenei n celule a diferitelor
mecanisme reglatoare, se evideniaz o aciune specific evident a substanelor biologice
active: hormoni, mediatori, oligopeptide, stimuleni i inhibitori. Acionnd asupra sistemelor
polienzimatice, apariia mecanismelor reglatorii condiioneaz un echilibru dinamic al
proceselor biochimice i de aceea celula intact e n stare de homeostazie. W.Canon
propune acest termen n 1929 pentru detenninarea constantei mediului intern - condiie
indispensabil pentru existena organismelor vii. Acest echilibru e circumstana primordial
a proceselor de autoasamblare, autoorganizare i autoreglare, ce determin funciile
biologice cardinale: creterea, nmulirea, mitoza i diferenierea celulelor. Starea de ho-
meostazie se pstreaz nu numai n condiii normale, dar i la aciunea diferitor factori
nocivi asupra organismului i, de asemenea, n stri de stres. n aceste condiii
homeostazia e determinat de prezena n organism a sistemelor complexe reglatoare
coordonate de mecanisme adaptive.
Studierea profund i vast a proceselor biochimice ce determin meninerea
homeostaziei, graie mecanismelor de adaptaie, e o problem actual a biochimiei
funcionale. Aceste investigaii determin esena proceselor chimice ce stau la baza
funciilor fiziologice i pot preciza mecanismele reglatorii ce delimiteaz homeostazia n
stri extremale. Aceasta e o problem ce prezint att interes teoretic, ct i practic.
n ultimii 30-40 de ani n studiile biochimice au aprut modificri radicale datorit
utilizrii metodelor moderne de cercetare. A crescut considerabil sensibilitatea i
exactitatea aprecierilor cantitative ale diferitor metabolii n structurile biologice.
Datorit spectroscopiei infraroii se poate studia caracterul structural al molecu
lei, e posibil determinarea diferitor compui strini n microcantiti. Perfecionarea
metodei cromatografice - n straturi subiri - a permis extragerea metaboliilor
individuali din esut chiar i atunci, cnd ei sunt n cantiti minime. O caracteristic
deosebit o au metodele imunochimice care au favorizat i au justificat identificarea
proteinelor individuale, secvena aminoacizilor n lan.
Un rol deosebit aparine metodei de depistare radioactiv, metod care faciliteaz
studierea metabolismului plastic i energetic n condiii adecvate organismului intact.
O rspndire larg o are metoda de nregistrare a izotopilor (scintigrafia) ce ne
permite examinarea perfect a proceselor metabolice la toate nivelurile sistemelor vii. La
baza ei se afl procesul de transformare a energiei particulelor primare radioactive n
energia radiaiei electromagnetice cu lungimea de und 430 nm. Transformarea energiei
este efectuat de scintilator (lichid-pentru -particule i cristal - pentru Y-particule).
Absorbind energia particulelor radioactive, scintilatorul elimin fotoni ce se nregistreaz
pe amplificatorul fotoelectronic.
Incontestabil c succesul biochimiei depinde de realizrile vdite n tiinele nrudite
precum sunt: bioorganica, anorganica, chimia analitic, fizic i coloidal, biologia, fizica
i chiar matematica.
Rolul biochimiei pentru medicin e de netgduit, ca argument servesc doar cuvintele
lui M.V. Lomonosov: Medicul - fr cunotine suficiente n chimie - nu poate fi competent
n materie.
Foarte accelerat se dezvolt biochimia clinic, care studiaz modificrile procese
lor biochimice n organismul uman n diferite patologii i, concomitent, elaborndu-se
metodele depistrii anumitelor devieri cu scopul de a diagnostica i a pronostica evoluia
strilor morbide. n ultimii 1 0 ani, numrul analizelor chimice la un bolnav a crescut n
medie de 4 ori. E necesar de menionat c descrierea datelor de laborator este direct
dependent de gradul i nivelul de instruire a medicului.
Compuii chimici n organismele vii sunt compleci i variai dup structura lor i
sunt supui modificrilor permanente. Masa unor molecule e de milioane de Da (daltoni).
Modificrile conformaionale ale macromoleculelor biologice au loc foarte repede.
Pentru despletirea unei spirale de DNA, util pentru replicare i expresie, e necesar
numai o milisecund.Modificarea poziional a unui domen de protein fa de altul
e de o nanosecund, iar fenomenul de senzaie optic - modificri structurale ale
grupelor luminoabsorbante - are loc n cteva picosecunde.
Pentru a percepe mai profund structura i funciile proteinelor, e necesar s ne amintim
de unele proprieti ale biomoleculelor. Organisme le vii conin n cantiti mai mari 4
elemente: H, , si N. Dac excludem H ,0 , creia i revine 75% din greutate, apoi
90% din masa rezidual Ie revine acestor patru elemente. Din masa total uscat
carbonului i revin 50-60%, oxigenului - 25-30%, azotului - 8 -10% i hidrogenului - 3-
4% .
1. Particularitile chimice deosebite ale organismelor vii constau n prezena
carbonului. El, la fel ca i oxigenul, hidrogenul, azotul, poate fonna legturi covalente,
adic legturi determinate de perechi de electroni aparinnd ambilor atomi.
I I - -- I
: - >
: N : N - : -
I I ' I
::
I c ::0 : C = 0
C :
'N: -C=N -
I
Varietatea substanelor are ca schelet atomi de carbon, ce formeaz legturi covalente,
practic infinite: liniare, ciclice, ramurale, structuri combinate etc.
Cele 4 legturi covalente ordinare ale carbonului n spaiu se configureaz n tetraedru,
iar mrimea unghiului dintre 2 legturi indiferente e de 109,5. n moleculele unor substane
acest unghi poate s se modifice puin. Datorit acestei proprieti, com puii
carbonului formeaz diferite structuri tridimensionale. Nici un alt element chimic
nu poate forma molecule att de diferite dup mrime i form, dup complexitatea
lanului periferic i a grupelor funcionale.
2. A doua proprietate de baz a compuilor organici const n faptul c particulele
moleculare sunt capabile, absolut liber, s se roteasc n jurul legturilor C-C ordinare,
'-""-Na V>
Unghiul dintre dou legturi Legtur ordinar Legtur dubl
(a> <b) (c)
Geometria legturilor carbonului
numai dac la atomii de carbon, care iau parte la formarea acestei legturi, nu sunt
ataate grupe foarte mari sau au o sarcin electric mare. n ultimele cazuri rotaia poate
fi limitat. Aadar, moleculele organice cu un numr mare de legturi ordinare pot avea
diferite forme numite conformaii, ce depind de unghiul de rotaie al acestei legturi.
3. A treia proprietate a legturilor covalente fonnate de carbon const n faptul c ele
au o anumit lungime. n medie, lungimea legturilor ordinare e de 0,154 nm; cele
duble sunt mai scurte i, respectiv, egale cu 0,124 nm. Ultimele au o duritate mai mare i
nu permit rotaia liber. Datorit acestei legturi din molecul unghiurile ntre moleculele
ordinare se mresc.
Structura tridimensional (conformaia) a biomoleculelor organice joac un rol
important n multe procese biochimice, dar mai ales n interaciunea centrului catalitic al
enzimelor cu substraturile. Pentru efectuarea funciilor biologice normale molecula
enzimelor i a substraturilor trebuie s fie complementar, adic trebuie neaprat s
coincid. Astfel de complementare strict e necesar pentru fixarea moleculei de hormon
la receptorul su pe suprafaa celulei, pentru procesul de replicare a DNA .a.
Poziia legturilor ordinare n tetraedru atribuie unor compui organici nc o
proprietate deosebit, cu o repercusiune primordial n biologie. S ne amintim c unul
sau mai muli atomi de hidrogen pot fi nlocuii cu diferite grupe funcionale, care
sunt reactibile i pot modifica repartizarea electronilor i poziia electronilor nvecinai,
modificnd astfel i reactibilitatea ntregii molecule. Majoritatea biomoleculelor conin
grupe funcionale de diferite tipuri i de aceea posed diferite insuiri polifuncionale,
determinnd i activitatea biologic.
R -C H 3
M etilic R -C ( R N H C N H 2 R j -R2
II
Carboxil^^ GuanidinicNH O
R NH2 C arbonilic
A min R C O R, R C _ C H R , S R2
R SH O Estcric
I I
HN -N
Tio
* 0
O
T ioesteric
R -O H R -C Im idazolic
\H OH
H idroxil A ldchidic I
R C NH2
R O P = 0
R - O - R , R_ s _ s R, II
O I
E teric D isulfidic A m idic F osforic O H
Unele grupe funcionale n biomolecule
ntotdeauna, cnd n molecula compuilor organici atomul de carbon e legat cu 4
atomi sau grupe funcionale diferite, se spune c acest atom e asimetric, deoarece el
poate funciona n dou forme izomerice, dcosebindu-se printr-o configuraie spaial
proprie - enantiomerii (stereoizomeri sau izomeri optici). n reaciile chimice izomerii
se comport n acelai mod, dar se deosebesc dup o proprietate fizic, i anume - dup
capacitatea de a roti planul luminii polarizate n stnga sau n dreapta.
Deoarece astfel de compui cu atomi de carbon se atest n dou forme, au fost
numii compui chiralici (chiros-din greac - mn).
Atomul central asimetric din aceti compui e numit atom chiralic sau centru chiralic.
n organismele vii moleculele chiralice se afl numai n una din cele dou forme posibile,
cauza fiind structura hiralic a moleculelor enzimelor.
O H 0=C< O H 0=
o H.. N = = N H....... N =
Legturi de hidrogen
La distane reduse acioneaz forele lui Van der Waals ce sunt determinate de
atracia electrostatic a electronilor cu sarcin negativa de ctre un atom de nucleu ncrcat
pozitiv al altui atom.
Atracia ntre grupele electrizate detenninforele electrostatice i apare ntre sarcinile
de for mare care se afl n apropiere, modificnd conformaia moleculelor (COO i
NH,+), (COO i CaTT). Acest tip de legtur dipol-dipol este caracteristic moleculelor
polare care, ajunse n contact, se influeneaz reciproc datorit efectelor electrostatice.
Moleculele polare sub raport structural pot fi identice sau diferite. Dispunerea acestor
molecule n spaiu se face ordonat cu polii de semn contrar proximitate reciproc.
Interaciuni dipol-dipol
Interaciuni ion-dipol
Fenomenul acesta este denumit solvatare, iar n cazul n care moleculele polare aparin
apei este numit hidratare.
Distingem ifore (legturi) hidrofobe, ceea ce denot agregaia grupelor nepolare.
Procesul poate fi explicat ca un transfer al particulelor nepolare ale moleculei de ap n
poriunea hidrofob.Un rol deosebit l joac n acest proces capacitatea pronunat a
moleculelor de ap de a se lega ntre ele.Un efect incontestabil al aciunii acestor fore se
manifest prin creterea vdit a structurii apei-limitarea fluiditii moleculelor de ap.
De interaciunea hidrofob depinde i aa-numita interaciune Stacking (fore de
instivuire), care apare ntre perechile de baze azotate aranjate n stive la distana razelor
Van der Waals. Acestc fore stabilizeaz dublul helix de DNA.
Un caz particular al legturii covalente este legtura coordinativ. n cazul acestei
legturi dubletul de electroni pui n comun aparine doar unuia din atomi, denumit donator
sau atom nucleofil, iar cellalt atom (legat prin acest dublet) se numete acceptor sau
atom electrofil.
Astfel de legturi pot da atomii donatori de azot, oxigen, fosfor i sulf. n cazul azotului,
acesta particip la formarea amoniacului cu trei din cei cinci electroni de valen:
H
3H + -N: : n *.
h
H
rmnnd o pereche de electroni care nu particip la formarea legturii, pereche denumit
dublet neparticipant.
n cazul tratrii unei soluii de acid clorhidric (care este disociat n H+i Cl') cu
amoniac, ionul de H+, neavnd o configuraie stabil, se ataeaz dubletului neparticipant,
formnd ionul de amoniu. Sarcina acestuia se echilibreaz prin anionul Cl':
H H
H * N + H ++ C r ^ h; n jh ci
H L H J
sau
o *H
r ! n ; + h ++ a
*
H
H ,N
NH
in n :3
A cid fosforic C lorura arg en tic S ulfat tetraam in o cu p ric
lor. ntr-un anumit interval de timp n viaa organismului se produce expresia numai la o
parte mic din genomul celulei. Funcia dat o ndeplinesc aa-numiteleproteine-represor,
care inhib poriuni specifice n DNA celular. Aici pot fi ataate i proteinele ce regleaz
activitatea fiziologic celular.
7. O grup specific de proteine poate stoca, transmite i genera diverse mesaje
chimice, impulsuri nervoase, servind drept receptori (rodopsina - proteina fotore-
ceptorie n retina ochiului) sau transmitori ai impulsului nervos n sinapse etc.
8 . Funcia fizico-chimic a proteinelor e capabil s menin constantele snge-
proteinele laptelui, ovalbumina, seminele unor plante (soe, gru etc.), remarcndu-
se prin deosebitul lor rol energetic.
n momentul actual se studiaz mii de proteine, structura i funcia sutelor dintre care
sunt cunoscute. Astzi deseori putem auzi despre obinerea unor proteine noi cu fuAcii
excepionale. Dup zeci de ani de investigaii, un grup de savani de la Universitatea
HARVARD (America) au obinut (1985) o protein pur, susceptibil de formarea
vaselor sanguine Ia om - angiogenina, compus din 123 de aminoacizi ce constitue
un singur lan. Folosind metodele ingineriei genetice, a fost reconstituit gena care
regleaz n organismul uman producerea angiogeninei. Investigaiile prognozeaz sinteza
unor preparate care vor ameliora circulaia sanguin n muchiul cardiac, contracarnd
infarctul, insultul, vor contribui la cicatrizarea leziunilor, ulcerului etc. Blocada angiogeninei,
ns, poate fi util n tratamentul cancerului, bolilor n care apar vase mici nedorite -
psoriazis, rinopatie diabetic, artrit reumatoid; la supravegherea natalitii, preparatele
contraceptive fiind inhibitori ai acestei proteine.
E uimitor faptul c toate proteinele cu diversele lor proprieti i funcii, sunt
constituite din aceiai 2 0 aminoacizi fundamentali, ncepnd cu cea mai simpl bacterie
i pna la om. Se tie c separat fiecare aminoacid nu are nici o funcie biologic. Care
e cauza c o protein are proprietate catalitic, alta honnonal, cealalt - anticorp? Prin
ce se deosebesc ele din punct de vedere chimic?
Rspunsul e foarte simplu: proteinele se deosebesc prin faptul c pentru fiecare
n parte e caracteristic numai o singur secven de aminoacizi. Aminoacizii
sunt alfabetul structurii proteice.
Prin legarea n lanuri polipeptidice, variate ca lungime i succesiune a unitilor,
se poate obine un numr infinit de mbinri de compui. Fiecare specie conine mii
de proteine, dar specii exist circa 10 milioane. Putem oare asigura aceste proteine
numai cu 2 0 aminoacizi? O analiz matematic simpl arat c pentru un polipeptid
din 2 0 aminoacizi diferii, nici unul dintre care nu se repet mcar de 2 ori, numrul
de variaii este de 20x19x18 .a.m.d., ~ 2x1018. Masa moleculei e de 2600 Da.
Dar dac lum o protein cu masa de 34000 Da, unde 12 aminoacizi sunt reprezentai
n acelai raport, atunci cptm 10 30 0 de combinaii. Dac n componena lor vor fi
inclui 20 aminoacizi n acelai raport, numrul va crete enorm. Dac ar exista numai
cte o molecul din fiecare protein posibil, apoi greutatea lor ar fi mai mare dect
a planetei noastre. Variaii din aceti 20 aminoacizi pot fi att de multe, nct ar fi suficiente
nu numai pentru proteinele existente azi, dar i pentru cele care vor apare n viitor.
Potrivit calculelor specialitilor, azi pe pmnt exist 0,001 de specii dintre cele
cunoscute cndva.
Unitatea structural de baz a proteinelor sunt aminoacizii.
Primul aminoacid descris n 1806 a fost asparagina, iar ultimul - treonina - a fost
identificat de abia n 1936. Fiecare aminoacid are denumirea sa tradiional (conform
originii lui), raional (chimic), abreviere din trei litere i simbol de o liter. Aminoacizii
sunt derivaii acizilor grai saturai-aminoderivai. Au o structur n care, cu acelai atom
de carbon este legat grupa carboxilic i aminic.
Aminoacizii se deosebesc ntre ei prin natura acestui radical R _ p j_ c o O H
(R). I
Anume radicalul R la diferii aminoacizi difer dup structur, N H2
sarcin electric, solubilitate n ap.
Dup proprietatea de a interaciona cu H;0 la un pH = 7,0, deosebim 4 grupe de
aminoacizi (tab. 1 . 1 ):
1. Aminoacizi cu radicali hidrofobi, nepolari - hidrocarburi. Reprezentani: alanina,
valina, leucina, izoleucina, prolina, metionina,fenilalanina, triptofanul.
2. Aminoacizii cu radicali polari, dar far sarcin electric. Ei formeaz legturi de
hidrogen cu molecule de H ,0. Reprezentani: serina, tirozina, treonina - polaritatea
e determinat de grupa OH'; asparagina i glutamina - de grupa NH,; cisteina - de
SH, iar la glicin - radicalul (H) ce nu compenseaz polaritatea grupelor NH, i COOH.
3. Aminoacizii cu radicali ncrcai negativ {acidul aspartic i glutamic).
4. Aminoacizii cu radicali ncrcai pozitiv (,Uzina, arginina - grupa guanidinic
i histidina - grupa imidazolic).
n structura unor proteine se remarc i aminoacizi nefundamentali n compo
nena colagenului: 4-hidroxiprolin, 5-hidroxilizin] n miozin - metillizin; n
protrombin - acidul carboxiglutamic; n elastin - desmozin format din 4 molecule
de lizin. Aceti aminoacizi se mai numesc aminoacizi minori (tab. 1.2).
Se mai ntlnesc aminoacizi cu alte funcii ca: ornitina, citrulina, -alanina, etc.
(tab. 1 .2 ).
Solubilitatea aminoacizilor n ap este influienat de prezena srurilor. Cea
mai mic solubilitate n ap o au cistina i tirozina (0,04 g/100 g a.d.), mult mai mare -
prolina i oxiprolina (154 g/l 00 g a.d.). Foarte solubili sunt arginina, lizina i cisteina la
pl n ap distilat i 20C (tab. 1.3). Prolina este singurul aminoacid cu o solubilitate bun
n alcool, ceilali aminoacizi se dizolv foarte greu. Toi aminoacizii sunt uor solubili n
soluii slab acide sau alcaline. De remarcat c triptofanul pur n soluii acide este stabil, n
timp ce n amestecuri sau n hidrolizate proteice uor se oxideaz.
Toi aminoacizii fundamentali, cu excepia glicinei, posed un carbon asimetric
(centru chiralic) care este C a (excepie prezint izoleucina i treonina care au 2 centre
chiraliceC ( 2 x 2 - 4)).
Formulele de configuraie ale enantiomerilor unui aminoacid oarecare, repre-
.Grupa acizilor hidrofobi nepolari.
H 3 N - C H COO' H3 N - C H - C O O '
2 2
c=o CH 2
O' c=o
O'
+
H3N CH "COO' H3N CH-COO' H 3 NCH COO'
I I I
CH 2 CH2 C H -C H 3
i I
c -n h 2 CH2 OH
II I
o c nh2
I!
0
Serina (Ser) S C isteina (Cys) T irozina (Tyr) Y
A cid a-am ino- A cid a-am in o - A cid p-hidroxifenil-
-hidroxipropionic -tiopropionic alaninic
H3N-CH COO'
H
C itrulina H idroxilizina
acid a - am ino- N orleucina acid a ,e - diam ino-
5 -carbam ilovalerianic acid a-am inocapronic 5 -hidroxicapronic
CH2 HN--CH-COOH
I
CH
HOOC COOH
nh2
W
C am itina
-A lan in a
acid -am inopropionic
HO CH 2- N(CH3)3
CH2 COO' h2n ch2 CH2- COOH
665H G
u n iv e r s it a t e a s t a t
OE MEDICINA l FARMACIE
NICOLAE TESTEMIEANU"
S IB L ilQ T E C A
Selenocisteina A cid 8 - aminolevulinic
H2 NC H -C O O H 0= - 2-2- COOH
I I
CH 2 CH 2
I
SeH NH 2
Ilom ocisteina
Metillizina
acid a - amino-
H 2 N C fb -C O O H Y - tiobutiric
H 2 N C H -C O O H
lzu2 " I
CH 2
1
CH 2
I I
CH 2 NHCH 3 SH
Desmozina
nh2
I
C H -C O O H
I
h 2n (CH 2 ) 3 NH 2
I I
HOOC CH (CH 2 ) 2 -(CH 2 )2 C H -C O O H
(CH 2 ) 4
C H -C O O H
I
NHo
Histidina 4,00
COO- C O ir
Ionizaia aminoacizilor depinde de valorile pH. n soluii acide grupa COOH este
neionizat, iar cea amin - ionizat (NH3+).
H H
I I
RC COO + H - R - C COOH
1+ 1+
NH 3 NFI3
H H
I
R - C - C O O + OH R - C COO + H ,0
!+
NH, NH,
STRUCTURA PRIM AR
Cum se leag aminoacizii n proteine? Procesul decurge n felul urmtor: a-grupa
carboxilic a unui aminoacid se unete cu a -aminogrupa altui aminoacid, fonnnd legtura
peptidic, cu eliberarea unei molecule de ap.
O H
II "I-
H 2 N CH + N C H -C O O H
I -I I I -H20
R, OH H R2 o
II
w H2N CH N CHCOOH
I I I
Ri H r 2
Echilibrul acestei reacii nclin mai mult spre procesul de hidroliz, dar nu de sintez.
De aceea procesul de sintez necesit energie, pe cnd hidroliza decurge cu degajarea ei.
La unirea multor aminoacizi cu legturile peptidice se formeaz un lan (caten)
polipeptidic, avnd o structur liniar.
Lanul are o anumit direcie. S-a stabilit condiional c el ncepe cu captul purttor
de aminogrup, captul N. Descrierea unei sccvene de aminoacizi n lan ncepe
anume dc la acest capt terminal. Aminoacidul, care n legtura peptidic particip cu
grupa sa COOH, capt sfritul - il; aminoacidul final, care conine grupa COOH
liber, nu-i schimb denumirea, fonnnd captul -terminal.
Aadar, lanul polipeptidic are un schelet cu o structur strict, repetat i
catene laterale diferite.
+ + H o N -C H COOH
COH I
R
, C om pui + C 0 ,+ R C H 0 + H20
interm ediari
I
H3c CHCOO
2,4-dinitrofenil - derivat
al restului aminotemiinal
Atunci cnd aminoacizii constituie cantiti mici, e folosit un alt reagent - clorura de
dabsil, care, reacionnd cu grupa NH,, confer compusului sulfamidic o culoare intensiv,
fluorescent.
4 N- / V _ n = n / \ - S 0 2NHCH C O ' +
H .C 7 \ = / 1 1 Gly Asp Gly
Dabsil-alanina 3 e Arg
N=C=S
+ H 2 N CH G ly -A sp - P h e A rg -G ly COO
Fenilizotiocianatul CH 3
H s 1 PH=9
I II Y
N C NHCH C O GlyA s p -P h e A rg -G ly COO
ii
IrN _c + H2 N GlyAspPheArgGlyCOO
t
C H -C H 3 Degradarea dup Edman
n mediu slab acid are loc disocierea compusului ciclic, iar peptida rmas e mai mic
cu un rest de aminoacid. Produsul este identificat cromatografic. Degradarea dup Edman
este repetat.
n fine, se ajunge la etapa in care succesiunea n fragmente de peptide e clar, dar nu
e identificat succesiunea peptidelor nsei. Ultimele se determin dup suprapunerea
diferitelor segmente de peptide, stabilindu-sc astfel segmentele de coinciden. Se folosesc
i ali fermeni ca: chimotripsina (scindeaz legtura peptidic format de COOH a
Phe, Tyr i Trp\p ep sin a etc.
Metodele descrise mai sus se refer la proteinele compuse dintr-un singur lan
polipeptidic, far prezena legturilor disulfidice. n caz contrar, sunt necesare metode
suplimentare. Disociaia a mai multor catene polipeptidice e posibil sub aciunea
detergenilor ca: ureea, hidroclorura de guanidin, care scindeaz legturile
necovalente, distrugmd structura teriar i cuatemar.
/N H 2
H 2 Nc N H , HN=C -HC1
II " nn h 2
o
Ureea Hidroclorura d e guanidin
NH NH
1 : 1 O
CH-CH 2-S-5-S CH,-CH + HC^
c= o : c= o
^ C istin a I A cid perform ic
i
NH NH
I I
C H - C H 2 SO 3 II + HO 3 S CH 2 CH
I ' I
c=o c=o
I A cid ciste in ic I
(I = 0,1 nm)
- terminal
/V - termi nal
Spirala are forma unui cilindru, rsucit tensionat, lanul de baz formeaz partea
intern a cilindrului, iar radicalii (lan exterior) sunt orientai spre exterior, miendu-se
conform spiralei. Spirala este stabilizat de legturile de hidrogen dintre N11 i ,
grupe ale lanului de baz. Grupa a fiecrui aminoacid se reunete prin legmra de
hidrogen cu NH, grupa aminoacidului situat n succesiune liniar cu patru resturi n
avans. Deci, toate grupele i NH ale lanului de baz sunt unite ntre ele prin legturi
de hidrogen. Pasul elicei conine 3,6 resturi de aminoacizi, adic aminoacizi separai
n succesiuni liniare de 3 - 4 resturi de aminoacizi, fiind amplasai foarte aproape n
structura spiralei. Dimpotriv, aminoacizii aflai la dou resturi diferen unul de altul,
spaial sunt plasai opus unul fa de altul i, deci, interaciunea reciproc devine imposibil.
Pasul spiralei este de 5,4 (angstrom, unitate de lungime echivalent cu 0,1 nm, denumit
astfel n cinstea savantului spectroscopist A. Angstrom). La ficcarercst, aminoacidul
avanseaz pe vertical cu 1,5. Diametrul acesii bastona n care se afl atomul C -a
estedelO. Sensul rsucirii lanului polipeptidic poate fiatt de la stnga la dreapta, ct
i viceversa. Toate cercetrile a-elicei proteinelor se refer la primul tip.
Cota a-elicei n proteinele studiate pn acum este imens de variabil. n unele
proteine, de exemplu mioglobina i hemoglobina, a-elicea st la baza acestor structuri,
ns proteina chimotripsina e lipsit de ea complet. Elicele formeaz unele elemente
proteice lungi, ajungnd la mai mult de 1000. Dou i mai bine spirale pot s se rsu
ceasc ca firele n fringhie groas. Astfel de structur se numete superspiral i o gsim
n diferite proteine ca: miozina, keratina, tropomiozina, fibrina i n alte proteine sanguine
etc. Asemenea structuri ndeplinesc un rol mecanic, fonnnd fibre, i sunt caracteristice
pentru proteinele fibrilare. L.Pauling cu R.Corey au prezis aceast structur cu 6 ani
nainte de a fi experimental depistat prin metoda analizei R-structurale. A fost descoperit
o er nou n biologia molecular, favoriznd posibiliti de a prezice confonnaia lanului
polipeptidic, n cazul n care sunt explorate proprietile ingredientelor.
ns nu toate polipeptidele sunt capabile s formeze spirale. Exist aminoacizi
dezorganizatori ai elicei n structura primar. Aceste resturi de aminoacizi mpiedic sau
diminueaz tendina de rsucire elicoidal a unui lan polipeptidic. S-a stabilit c:
1. Prezena pralinei ntrerupe rsucirea elicoidal a lanului polipeptidic. Atomul de
azot se include n componena inelului rigid din structura aminoacidului, ce exclude
orice rotire ct de mic n jurul legturii N-C. Atomul de azot care formeaz legtura
peptidic n-are atom de hidrogen i de aceea el nu-i capabil s formeze legturi de
hidrogen intracatenare. n consecin, structura spiralic se deregleaz ntotdeauna acolo
unde e prezent acest aminoacid, formndu-se un cot, o ndoire, o ncovoiere n lan.
2. Dac n succesiunea aminoacizilor sunt alturate multe resturi de acid glutamic,
apoi la pH = 7 apare o for de respingere ntre grupele carboxilice ncrcate negativ,
fora crora e mult mai mare dect forele stabilizatoare ale punii de H a spiralei. Din
aceeai cauz segmentul de caten, cu un numr mare alturat dc resturi ale aminoacizi
lor ca lizina sau arginina, cu o sarcin pozitiv, nu va avea form elicoidal.
3. Resturile unor aminoacizi (valina, serina, treonina, izoleucina, asparagina), avnd
radicali voluminoi la -a, confer o oarecare strngere steric a elicei, servind drept
factori destabilizatori (grupa OH a serinei, treoninei pot forma puni de H). La fel vor
reaciona i resturile de cistein, care formeaz puni disulfidice covalente. Ele vor lega
rigid poziiile lanurilor polipeptidice i n vecintatea acestor regiuni rsucirea elicoloidal
nu mai poate avea loc.
Rezult c avem 4 tipuri de limitri care influeneaz asupra conformaiei catenei
polipeptidice:
1 . rigiditatea legturii peptidice;
2 . forele electrostatice de respingere sau atragere, dac aminoacizii le au n
apropiere;
3. prezena radicalilor voluminoi;
4. prezena iminoacidului - prolina.
S-a stabilit c structura primar const n succesiunea aminoacizilor n lan, legturile
covalente pcptidice aparinnd catenelor. Structura secundar se caracterizeaz prin
conformaia n spaiu a resturilor de aminoacizi n lanul polipeptidic. Exemplu clasic de
a - spiral e a -spirala keratinei ce conine mult cistein. Dup cantitatea de Cys se
evideniaz keratina diferitelor surse. La broasca estoas, de exemplu, coninutul de
Cys este egal cu 18%. Carapacea ei nu numai c are o duritate excelent, dar n
condiii fiziologice e insolubil n ap. Globulinele i mai ales albuminele datorit solubilitii
lor n ap, permit formarea unei soluii de 60%.
Care-i cauza acestei deosebiri? a-keratinele conin aminoacizi care au grupe
hidrofobe localizate pe suprafaa exterioar a elicei, ce ocup o poziie fixat i sunt
orientate spre faza apoas. n proteinele globulare de asemenea avem grupe hidrofobe,
dar ele sunt camuflate, n-au contact cu apa, iar pe suprafaa exterioar sunt ataate
grupe hidrofile sau polare.
In acelai an L. Pauling i R. Corey au descris o alt variant de structur periodic
- aa-numita -structur sau structura n foaie plisat (fig. 1.4).
F igura 1.7 .Conformaia catenei mioglobinei (A) i a catenei din hemoglobina (B)
Scheletul are 8 segmente elicoidale, cel mai lung conine 23 aminoacizi, cel mai scurt
-7 aminoacizi, ce includ aproape 80% din resturile de aminoacizi. Radicalii ocup aproape
tot spaiul dintre segmente. Molecula e att de compact, nct n interiorul ei pot s se
acumuleze numai 4 molecule de ap.
Regiunile elicoidale sunt separate de segmente neelicoidale la nivelul crora lanul
polipeptidic i schimb direcia. n aceste puncte finale se posteaz prolina. Interiorul
moleculei e format din aminoacizi cu radicalul nepolar, excepie fiind dou resturi de
histidin ce leag hemul.
Grupele polare se afl pe exteriorul moleculei, n alte rsuciri - resturi de serin,
treonin, asparagin: hemul ce conine Fe leag o molecul de O,.
Cum sunt mpachetate alte proteine globulare, la fel constituite dintr-un lan
polipeptidic?
Citocrom - protein ce conine hem, dar se deosebete dup structura secunda
r, teriar, succesiunea de aminoacizi i proprietile biologice; lizowna - 40% fonneaz
structuri elicoidale; ribonucleaza, la fel protein globular, conine foarte puine a -
segmente, majoritatea se gsesc n -structuri, dar ca i lizozima conine 4 resturi de
cistein ce determin duritatea structurii (fig.
1.8, 1.9).
n proteinele ce funcioneaz n exteriorul
celulei astfel de legturi intracatenare disul
fidice sunt permanente. Fiecare protein se
caracterizeaz prin structur tridimensional
proprie doar ei, special adaptat pentru
ndeplinirea anumitei funcii biologice.
Proteinele acestei clase sunt mult mai
complexe dup conformaie dect cele
fibrilare, ndeplinesc funcii variate i
activitatea lor are un caracter dinamic. n
majoritatea lor proteinele sunt globulare.
Care sunt datele experimentale ce
confirm c anume conformaia molecu
lei e necesar pentru activitatea biologic
Figura 1.8. Scheletul moleculei de citocrom - n a p r o te in e i?
centru hemogrupa fixat covalent , mai intensiv ' _
colorat sunt aminoacizii invariani 1 S-a constatat c
sub aciunea ureei, la
nclzire, structura scheletului covalent
rrnne neschimbat, dar lanul polipeptidic
deine o conformaie neregulat i i pierde activitatea biologic.
2. La compararea lungumii lanului i diametrului spiralei cu mrimile reale ale proteinei
se constat c un lan polipeptidic din 584 aminoacizi are n -structur o lungime de
200 nm i grosime de 0,5 nm, n a-spiral - 90 nm lungime i grosimea de 1,1 nm,
globula acestui lan se cuprinde n lungimea de 13 nm i diametrul de 3 nm. Aadar,
lanul polipeptidic al albuminei este foarte bine mpachetat, n caz contrar nu ar ndeplini
funcia necesar.
Modul de mpachetare a catenelorpoli
peptidice n proteinele globulare ntr-o glo
bul steric e structura teriar. La forma
rea acestei structuri se evideniaz centrele
active, locusurile de fixare i identificare a li-
ganzilor ce detennin funcia proteinelor.
Concluzie: Dac structura secundar e
determinat de interaciunea resturilor de
aminoacizi n segmentele apropiate, apoi
cea teriar - de interaciunea lor din
segmentele deprtate. Un rol deosebit l are
i interaciunea R -grupelor catenelor
nvecinate.
O anumit importan structural n lanurile
F ig u ra 1.9. M odetui spaial al moleculei de polipeptidice au aminoacizii invariani ce
h zo zim a - m ai in te n s colorat su b stra tu l r r . '
polizaharidic. Lizozima e o m olecul fo a rte OCUp O p O Z lie S ta n d a r d 1 la n , i n d i f e r e n t d e
compact specia organismului respectiv (sursa proteinei).
Acetia se grupeaz la unghi, n locul fixrii grupelor prostetice.
La o rcire lent a soluiei proteice sau la evoluarea pi I spre normal, proteina i
restabilete funcia biologic (renaturaie), fapt ce confirm c infonnaia necesar pentru
mpachetare e determinat de structura primar. Proteina se mpacheteaz nu chiar simplu,
de exemplu: ribonucleaza n care se formeaz 4 puni disulfidice n aceleai poziii ca i n
cea nativ, teoretic, din 8 resturi de aminoacizi se pot forma 105 variante, dar se for
meaz numai una. Structura teriar nu-i rigid absolut, se caracterizeaz printr-un grad
de fluctuaie local i o anumit elasticitate. De exemplu, moleculele enzimei la legarea
substratului i schimb conformaia.
Proteinele se fonneaz din aminoacizi, cu o vitez mare. Proteina compus din 100
aminoacizi n 5 sec. i capt conformaia final. Dar dac s-ar cuta toate variantele, ar
fi nevoie de 105 ani. Procesul de asamblare are loc momentan, cu un grad mare de
cooperativitate. Aceasta nseamn c dac s-a mpachetat un segment mic, apoi
instantaneu crete probabilitatea aranjrii celorlalte segmente.
Dup uncie scheme structurale la nivelul organizrii teriare a moleculelor proteice, n
planul de asamblare e inclus un concept nou, care faciliteaz perceperea perfect a
raporturilor dintre structur i funcie, a organizrii pe domenii structurale. Prin cuvntul
domeniu se subneleg regiunile compacte cu organizarea teriar relativ rigid, separate
ntre ele de ctre segmentele mai puin organizate, care permit micarea unui domeniu
fa de altul (fig. 1 . 1 0 ).
Fiecare domeniu structural e responsabil de o anumit funcie a proteinei. Gradul de
flexibilitate a domeniilor variaz de la micri mai ample la altele mai restrnse, n
dependen de natura segmentelor interdomcniale. Domeniile se asociaz cu funciile de
legtur. Centrele active ale enzimelor sunt situate ntre domenii care i schimb poziia
unul fa de altul n procesul funcionrii biologice a proteinei. O alt proprietate foarte
important: domeniile cu structuri i proprieti similare suntprezente n diferite proteine,
exercitnd roluri asemntoare.
Multe proteine sunt alctuite din mai
multe lanuri polipeptidice i se numesc
proteine oligomere (hemoglobina e
constituit din patru lanuri i patru grupe
prostetice cu atomii si deFe) (fig.
1.11).
Fiecare lan (2a i 2) are structura
sa teriar, ocup poziia de tetraedru
unul fa de altul, formnd n ansamblu
s tr u c t u r a c u a te r n a r . Catena a con
tacteaz cu , interaciunea dintre ele (a-
a i -) fiind minim. Hemoglobina
animalelor are aproape aceeai structu
r te r t in r c i 1 n v n H m u l t n F igu ra 1.10. Imaginea schematic a unei
' 1 proteine compuse din 2 domenii. Centrul de fixare a
comun CUStructura mioglobinei, aceleai ligandului se afl ntre domenii
funcii. Cu certitudine, n cadrul
succesiunii aminoacizilor, proteinele omoloage conin un rnd de resturi de aminoacizi
invariani, 9 aminoacizi ocup aceeai poziie; e aceeai histidin distal i proximal, e la
fel de reprezentativ i interiorul nepolar al structurii.
Modul de asociere n spaiu a protomerilor - moleculelor oligomere - se atest
ca s tr u c tu r c u a te r n a r . La o asemenea protein funcia specific se manifest
numai Ia nivelul structurii cuaternare, protomerii separai sunt neactivi. Asamblarea
subunitilor se realizeaz prin fore slabe nccovalente i asocierea devine stabil dac
suprafeele de contact (ale domeniilor) sunt complementare, iar un numr ct mai mare
de atomi se apropie de nivelul razelor
Van der Waals. Complementaritatea
asigur un grad nalt de exactitate i de
specificitate a structurii cuaternare.
Interaciunea prin suprafeele de con
tact reprezint fenomenul de coopera
re, adic primele interaciuni favorizeaz
form area c e lo rlalte. S tru ctu rile
cuaternare permit funcionarea unor
mecanisme fine de reglare a activitii
proteinelor (forma T - tensionat i R -
relaxat). Perturbaia are loc la nivelul
unui protomer (Fe iese la 0 , 6 A din
planul hemului, la oxidare intr un plan -
histidin proximal avnd 15 contacte,
modific conformaia oligomerului, re- F ig u r a 1.11. M od elu l hem oglobinei
. .. .
structureaz spirala i unghiurile ei) (fig. - catene sunt colorate mai intensiv; a-catene sunt
] j2) celelalte; h - hemul n molecul (dup M. Perutz)
F igura 1.12. Modificrile conformafionale induse de deplasarea Fe la oxigenare. Structura
oxigenat e colorat mai intensiv dect cea dezoxigenat
H id r o liz a A T P-uhsi
d e te rm in e lib erare a a
14 ADP-uri i GroES
A GroES
PEPTIDELE ACTIVE
Endotelinele reprezint o familie de peptide noi cu o activitate biologic deosebit.
In 1988, M. Yanagisawa i alti savani au cptat din cultura endoteliului vascular un
peptid cu un efect biologic foarte pronunat, numit endotelin. Timp de zece ani s-a
efectuat un studiu amplu referitor la peptida respectiv, receptorii ci, enzima - endotelin
convertaza i inhibitorii ei.
Endotelinele sunt cei mai efectivi factori vasoactivi. Sunt implicate n patogenia
unor forme de maladii hipertonice, ischemii renale, hemoragii subarahnoidale. Este
determinat rolul lor n infarctul miocardic, aritmiile cardiace.
De rind cu endotelin-1 (ET-1), un peptid biciclic din 21 aminoacizi, s-au depistat i
alte 2 izoforme - ET-2 i ET-3, codificate probabil de gene diferite. Aceste peptide sunt
marea speran a savanilor pe viitor! Toate trei endoteline n mod diferit sunt expresate
n esuturile vasculare. Primele dou au o activitate major de vasoconstrictori.
Sunt donate i secvenate 2 tipuri de receptori (ET-A i ET-B), care s-au depistat att
n endoteliul vaselor, ct i n rinichi, plmni, suprarenale, esutul nervos. Constricia
vaselor e mediat de ET-A receptori, structuri fixatoare de G-protein; pe cnd inducia
receptorilor ET-B conduce att la constricia, ct i la dilatarea vaselor. Funcia acestor
receptori e cuplat cu activarea fosfolipazei i A,, cu majorarea nivelului de Ca2+
intracelular, fonnarea intensiv a prostaciclinei i/sau tromboxanului Ar ET-1 i ET-3 n
esutul nervos intensific sinteza fosfoinozitfosfatului.
ET-1 apare ca rezultat al proteolizei limitate a endotelinei majore - (B = ET) n trei
etape:
a) hidroliza protcolitic a preproendotelinei-1 la Arg(92) n endotelina-l-Lys-
Arg (40) sub aciunea convcrtazei (E,);
b) hidroliza captului -terminal = ET-1-Lys-Arg(40) la = -38) de o
carboxipeptidaz (EJ;
c) scindarea premergtorului B-ET-1 la legtura Trp(21) = Val (22) cu formarea
endotelinei ET-1, etap determinat de convertaza respectiv (E3).
Schematic:
Pre-Pro-ET-1 B=ET-1 -Lys-Arg(40) B-ET-1 (38)
, Endotelin-1
E 3 (enzima endotelin convertaza - ECE-1) este o metalproteinaz din grupa celor
fixate n membran, care particip n procesingul postsccrctorial al hormonilor peptidici
i neuropeptidelor. Are unele proprieti asemntoare cu familia Z\r - metaloproteazelor.
n centrul activ este restul Tyr i regiunea fixatoare de Zn2+.
E depistat enzima ECE (endothelin-converting enzyme) n majoritatea esuturilor.
Activitatea ei e determinat att prin metode imunochimice, ct i prin testare biologic.
Ea prezint un dimer cu subunitile de 120-130 kDa fixate prin puni disulfidice. Splaisingul
alternativ a demonstrat variante ale ECE c grupa N terminal e diferit, cu o specificitate
selectiv la substraturi. ECE-1arc o specificitate mare la B-ET-1 i mult mai puin efectiv
la ET-2 i ET-3. Aceste date presupun prezena enzimei n mai multe izoforme ale ECE-
1 ( 1 a i l).
ECE-2, o alt endotelin convertaz, n 59% e omoloag cu ECE-1 - o expresie
major e depistat n esuturile creierului. Ambele enzime au structuri de baz comune:
sunt proteine integrale membranare de tip II, ce conin o secven cu Zn2 caracteristic;
au 1 0 site-uri glicozil, cu o localizare nu chiar identic, sunt inhibate de aceiai inhibitori
cu diferit sensibilitate.
ECE-2 hidrolizeaz B-ET-1 mai efectiv dect B-ET-2 i B-ET-3. Dar cea mai
esenial deosebire e pH optim pentru forma 2, care este egal cu 5,5, i enzima e
neactiv la valori neutre, optime pentru ECE-1. Prezena, de asemenea, a ECE-2 n
esuturile neendoteliale demonstreaz c acest ferment funcioneaz ca enzim extra- i
intracelular, responsabil de hidroliza intravezicular a precursorului ET-1, sintetizat n
aparatul Golgi. Cele prezentate presupun 2 tipuri de sintez a endotelinelor: extra i
intracelular.
Sunt depistate i enzime ce degradeaz fiziologic endotelinele mature-
metaloendopeptidaza cu pH optim de 5,5; endotelinaza (serin proteinaza).
Endotelin i, corespunztor, ECE regleaz tonusul vaselor i, n general,
cardiohemodinamica. Peptidul particip la patogenia hipertensiei eseniale - inhibitorii
ECE previn dezvoltarea hipertensiei pulmonare n experiment. Efectele sunt
dependente de funcionarea sistemului renin-angiotenzin.
S-au depistat unele efecte neurologice ale ET-1 i ET-3, modificri n reaciile de
comportare, efect central cardiorespirator.
n prezent se presupune c endotelinele, de rnd cu ali reglatori ca histamina,
bradikinina, angiotensina II, particip la relisingul difereniat al adrenalinei i/sau
noradrenalinei din suprarenale n stres (situaii extremale). Esenial e rolul lor n
reglarea strii funcionale a endoteliului - stratului intim arterial i venos din diferitele vase
ale organismului. Dereglrile metabolismului nonnal al endotelinelor, expresia intensiv a
precursorilor i receptorilor respectivi, activitatea major a ECE devin factori de dezvoltare
a proceselor patologice din organism, motiv care impune investigarea unor metode de
control i de reglare a activitii lor n organism - inhibitorii metaloproteazelor. Inhibitor
clasic se consider fosfoamidonul. Mult mai activ este analogul tiorfanului. n baza
compuilor acidului fosfonic s-au sintetizat inhibitori ai ECE, foarte puternici i selectivi.
Sunt utilizai i analogi ai ET-1, care blocheaz activitatea ECE att in vitro, ct i in vivo.
n ultimii ani se confirm c unele peptide cu o structurfoarte simpl, predominant
din glicin iprolin (PG, GP, PGP, GPGG), posed o activitate biologic deosebit
referitor la coagularea sngelui, aciunea protectoare a mucoasei, nociceptie. La aceste
peptide se altur i PGc (ciclic) depistat n creier. O particularitate deosebit a acestor
fragmente, ce conin prolina terminal, este stabilitatea major n fluidele organismului
fa de altele (de mii de ori).
Aceste peptide au ca surs i alimentele, cci e stabilit c tripeptidele ce conin
prolin sunt absorbite de celulele endoteliale intestinale nescindate. Un precursor al
lor poate fi i enterostatina (APGPR), precum i colagenul i elastina.
Compartimentalizarea strict a proceselor permite realizarea unor funcii diametral
opuse, de exemplu, acidul glutamic, glicina, care ndeplinesc att rol plastic, ct i energetic
i servesc drept neurotransmitori. Asemenea compartimentalizare e real i pentru
precursorii peptidelor reglatoare (PR). Determinant poate fi esutul, organul, precum i
repartiia local a proteazelor.
S-a stabilit c aceste peptide blocheaz agrcgaia trombocitelor, formarea
trombinei i a fibrinci; sunt inhibitori ai fibrinazei (XIIIa). Posibil c aceste pcptide
simple ce conin prolin (fragmente ale colagenului i elastinei) sunt factori endogeni
cu aciunc de antitromboz i trombolitic.
Prolincomponentele peptidice, POP i GPGG, amplific rezistena mucoasei
gastrice la aciunea factorilor nocivi, devenind protectori antiulceroi. Este inhibat
endo- i exosecrcia pancreasului, motorica stomacului, utilizarea alimentelor (anorexia)
de enterostatin (pentapeptida APGPR).
Peptida GPc are efect stimulator n consolidarea memoriei, posibil se fonneaz
din colagen sau elastin.
Peptidele scurte, ce conin prolin, sunt activatori ai hemotaxisei, favorizeaz
formarea superoxidului, neutralizeaz analgezia provocat de morfin. Comparnd structura
peptidelor respective, se presupune dependena efectului dc prezena prolinei la captul
N-sau C-tenninal al peptidei.
I I CH2 CH NH C CH 2 C H ; NH :
N ^ N H COOH Camo*ina
Capacitatea tampon protonic mrimea - se msoar n slake i se determin
dup numrul de mkmol NaOI I sau HC1, necesari pentru a modifica pH a 1 g esut cu o
unitate - de la 6 la 7 sau 6,5 - 7,5. Se consider c i peptidele nrudite iau parte la
reglarea activitii enzimatice, la diminuarea reaciilor oxidante.
Datele experimentale confinn c carnozina prezint un antioxidant multifuncional,
capabil s inactiveze radicalii liberi, s formeze compui chelai cu metalele prooxidante
(Cu) i posed capacitatea de a fonna conjugate cu produse aldehidice toxice de oxidarc
a lipidelor. n prezena camozinei, limita Heiflikse extinde - celula din cultur mbtrnete
mult mai lent. Posibil, e i rezultatul unic al efectului diferit al camozinei ca: izvor al histidinei,
imunostimulator i neurotransmiter etc.
Glicozilarea nefennentativ a proteinelor este un proces dependent de vrst, activ n
diabet. Formarea legturilor transversale ntre polipeptidele modificate i proteinele
normale este cauza complicaiilor n diabet. S-a confirmat c carnozina este un agent
antiglical natural, ce se conine preponderent n muchii albi cu o glicoliz intensiv.
Carnozina indus de aldehida malonic inhib formarea n proteine a legturilor
transversale, precum i fonnarca gruprilor carbonilice n proteine, specifice la mbtrnirea
proteinelor i celulelor. Carnozina e capabil s reacioneze cu metil-glioxalul i, indus
de el, prentmpin modificrile proteice. Carnozina protejeaz celulele de aciunea toxic
a aldehidelor i cetonelor.
Proteinele glicate sunt imunogene, iau parte la generare n procesul de mbtrnirc a
autoantigenelor. E stabilit c carnozina glicat nu e mutagen, spre deosebire de
aminoacizi. Ea inhib reacia de glicare a lizinei, moduleaz toxicitatea produsului pentru
cultura celulelor.
mbtrnirea proteinelor este nsoit de acumularea polipeptidelor aderante,
ndeosebi ale celor ce conin grupa carbonil. Ultimele apar ca rezultat al oxidrii radicalilor
aminoacidici de FAO, precum i la interaciunea produselor oxidrii lipidelor- aldehida
malonic i hidroxinonenalii - cu lizina i n al treilea rnd, n procesul de glicare n care
aldehidele toxice induc fonnarea gruprilor carbonil n proteine.
S-a constatat c carnozina nu doar se fixeaz de gruparea carbonil din proteine, dar
i moduleaz activitatea lor, inhibnd formarea legturilor transversale n proteine, ca
rezultat al generrii complexului protein-carbonil-camozin aduct.
Deocamdat nu e clar unde anume are loc fonnarca acestui complex: n interiorul
celulei sau n afara ei?
Care este soarta proteinelor camozilate?
Posibil c reprezint o fonn a lipofuscinei - pigmentul mbtrnirii. Lipofuscina
are o natur foarte heterogen i efectele ei sunt controversate. E enorm de mult n
esuturile bogate n camozin- nervos i muchi, creier. Posibil c forma lipofuscinei fr
carnozina e capabil s reacioneze cu alte macromolecule celulare.
O alt variant ar fi proteoliza - scindarea de un sistem deproteozome. Carnozina
mascheaz gruprile carbonil, care sunt rezistente i chiar pot inhiba funcia proteozomelor.
S-a constatat c n prezena camozinei se activeaz metabolizarea unor proteine greu
metabolizante.
Grupele carbonil se fonneaz i la oxidarea fosfolipidelor (etanolamina) meinbranare.
La depurinizare i depirimidinizare a DNA, cu scindarea legturilor glicozidice, se
formeaz o molecul de D-oxiriboz cu proprieti toxice aldehidice. Carnozina fixeaz,
posibil, i aceste fonne toxice, inhibnd formarea legturilor transversale protein - DNA,
cu participarea aldehidelor, i micoreaz numrul de aderaii cromozomiale n cultura
celular. Carnozina favorizeaz procesele de detoxifiere. O dat cu mbtrnirea,
concentraia camozinei se micoreaz: nivelul coreleaz cu durata vieii. Indivizii care au
o statur nalt sunt asigurai cu longevitate mai mare.
Biosinteza camozinei: se sintetizeaz din -alanin i histidin, rea CpCcatalizat
de carnozin sintaza. -alanin aminoacid neproteinogen se produce n ficat ca
mctabolit final n degradarea uracilului i a timinei. Celulele capabile de sintez posed i
un sistem benefic de transport al acestui aminoacid. Cu ct celulele sunt mai difereniate,
absorbia -ala este mai efectiv. n oligodendrocite viteza maxim de sintez corespundc
capacitii majore de expresie a proteinei - mielina - marker al diferenierii
oligodendrocitelor n creier.
Carnozina e legat de cclulele neurogliei, care pot absorbi rapid carnozina marcat
pi int-un mecanism activ de transport al dipeptizilor. E prezent carnozina n neuronii
senzitivi, mpreun cu acidul glutamic, ce marcheaz rolul de neuromediatorn acest
proces. n secreie se consider c sunt prezente mai multe mecanisme (depolarizare
membranar, tumefierea astrocitelor cauzate de ionii K~, inversarea mecanismelor de
transport). Se confirm mecanismul vezicular, exocitoza determinat de Ca2+.
Carnozina este un inliibitor selectiv al NO-dependent-activare a guanilatciclazei, ce o
poate utiliza ca remediu efectiv la tratarea sepsisului, cancerului, astmului, migrenei, toate
fiind legate de activarea sistemului de semnalizare intracelular: NO-Gc solubil- GMPc.
Hidroliza camozinei e cauzat de 2 izoenzime: 1) camozinaza tisular (citozolic) i
2) cea seric (KF.3.4.13.3 i KF3.4.13.20). Forma tisular e zincodependent i poate
fi stabilizat de alte metale bivalente (Cd >Mn Z n C o ).
Carnozina mrete de 2-3 ori longevitatea celulelor cultivate in vitro. E stabilit
efectul de ntinerire a celulelor senile. Carnozina distruge celulele transformate sau
cancerigene. n amestec cu piruvatul (acidul oxaloacetatul i a-cetoglutaratul), efectul se
micoreaz. Citralul, izocitratul, fumaratul, succinatul i malatul nu influeneaz asupra
efectului citotoxic al camozinei.
Efectul camozinei poate consta n:
a) diminuarea gradului sau exprimarea efectelor care conduc la includerea
mecanismelor ce blocheaz ciclul celular. De exemplu: poate favoriza micorarea lungimii
fragmentelor pierdute n DNA-telomeric sau diminueaz metilarea DNA;
b) micorarea efectelor fiziologice determinate de modificrile n RNA, ce ar favoriza
ndeprtarea momentului de oprire tenninal a diviziunii celulelor. Un astfel de efect s-ar
manifesta n ntinerirea fenotipului celular, care se observ la cultivarea cclulclor in vitro
cu camozin. Carnozina, posibil, inhib glicoliza, de altfel i fonnarea de ATP n celulele
cancerigene. Acest efect e reversibil la adaosul piruvatul ui.
CLASIFICAREA PROTEINELOR
Savanii M. Levitt i C. Chothia (1970), examinnd structura proteinelor, le-au divizat
n 5 clase (fiecare clas difer dup prezena i poziia -spiralei i -structurii
(fig. 1.14, a-h)):
I. Proteine ce conin 100% a-elice, formnd o structur globular.
II. Proteine ce conin -structur i, de regul, sunt alctuite din dou straturi
antiparalele sau situate n form de butoiae.
III. Proteine ce includ att a, ct i componente segregate n structura teriar.
IV. Proteine ce nglobeaz a / segmente alternate n structura secundar, formnd
structura teriar cu centrul i ncercuite de a-spiral.
V. Proteine neorganizate cu structur secundar evideniat nesemnificativ. Plie
rea lanului este determinat n exclusivitate de interaciunea radicalilor (coit pro
teic) - punilor disulfidice. Acestea sunt proteinele mici.
Clasificarea sus-numit a fost desvrit de J.S. Richardson (1981).
Aadar, organizarea structural este determinat de modul aranjrii reciproce a
structurilor secundare. De aceea, un imperativ primordial pentru prognosticarea structurii
proteinelor o au principiile de mpachetare a elementelor constituente. Se tie c un rol
deosebit n accst context l joac repartiia resturilor hidrofobe n a-elice i -
stmetur.
Proteinele se mai clasific (W. Bennet i R. Huber, 1984) i dup dinamica dome
niilor structurale:
I. Proteine cu domenii rigide, imobile, dure, unite prin segmente mari, flexibile, ce le
permit acestora fluctuaii n diapazon larg reciproc.
II. Proteine cu domenii rigide, dure, unite prin poriuni mici, denumite Balama, cu o
circulaie mai redus.
. Proteine n care domeniile au roluri diverse - folosesc flexibilitatea pentru asigurarea
unor funcii (de legare); interacioneaz cu grupri determinate de antigen.
Clasificarea proteinelor e o problem dificil, deoarece structura multor protei
ne nu este studiat complet. O clasificare a proteinelor dup funcie e practic imposibil.
Exist proteine cu structuri apropiate, dar care ndeplinesc funcii diferite. Posibiliti
limitate de clasificare prezint i proprietile fizico-chimice.
Dup atitudinea fa de hidroliz se disting proteine simple i proteine conjugate
(proteide). Proteinele simple la hidroliz elimin numai aminoacizi, iar cele conjugate mai
conin i un component neproteic i, deci, deosebim: fosfoproteide, cromoproteide,
nucleoproteide, glico-, lipo-, metaloproteide.
Holoproteinele (proteine simple). Protaminele au o mas molecular mic i un
caracter alcalin, determinat de prezena argininei i lizinei - 60-80%, fiindu-le caracteristic
punctul izoelectric ce se afl n mediul alcalin i la fierbere se coaguleaz la adaosul bazei
n soluie. Proteinele sunt solubile n ap, se dizolv i n soluie de NH4, soluii diluate de
acizi i baze. Aceste proteine se gsesc n cantiti mari n celulele gemiinale naturale ale
petilor: salmina (lapii somnului), scumbrina (scrumbia), clupeina (heringul), n
componena lor triptofanul lipsete. Aminoacizii ce conin sulf n majoritatea lor nu includ,
de altfel ca i tirozina, i fenilalanina.
Histonele din componena nucleului celular iau parte la reglarea metabolic a activitii
genomului. Aminoacizi bazici se conin pn la 30%. Masa lor molecular e mai mare
dect la protamine, conin puin sau deloc triptofan. Sunt solubile n aceiai solveni i
precipitate de soluia NH4, se coaguleaz la nclzire.
Albuminele iglobulinele prezint masa principal a proteinelor sanguine, a lactate
lor, masei musculare, a proteinelor oului. Raportul albumine-globuline n diferite esuturi
rmne constant i este egal cu 1,5-2,3. n patologie acest coeficient se schimb. Albuminele
sunt mai solubile n ap, pe cnd globulinele sunt solubile numai n soluii diluate de sruri,
iar n celelalte cazuri insolubile. Solubilitatea diferit folosit pentru fracionarea i
detemiinarea lor n practica clinic. Pentru ultimele scopuri azi se folosete electroforeza
pe hrtie sau n gel, la cantiti nensemnate de snge. Albuminele conin 575 aminoacizi,
formnd un lan polipeptidic, au un punct izoelectric mic. Ele detennin presiunea oncotic
a sngelui, iau parte la transportul substanelor, prezint o fracie omogen. Globulinele
formeaz o fracie heterogen, fiecare comportnd diferite funcii.
Glutelinele i prolaminele sunt proteine de natur vegetal, se depoziteaz n
seminele cerealelor, masa principal a glutenului.
Prolaminele sunt solubile n soluie apoas de alcool etilic (60-80%). Conin 20-25%
acid glutamic i 10-15% prolin. Reprezentanii prolaminelor sunt: gliadina (gru), zeina
(porumb), orzeina (orez), hordeina (orz).
,
F igura 1.14. Tipologia unor structuri proteice:
a - spiralele sunt n form de cilindre i spirale;
- structura e reprezentat prin sgei;
a)protein n a - structur (miohemeritina);
b) protein n - structur (Cu, Zn-superoxiddismutaza);
c) a / structur (2 proiecii ale domeniului NA D din LDH);
d) Itemaglutenina virusului gripei;
e) a / structur (triozofosfatizomeraza);
f) CAP din E. coli;
g) a+ structur (lizozim);
h) neuroaminidaza virusului gripei.
Heteroproteidele (proteine conjugate) conin, pe ling compui proteici, diverse
grupe neproteice numite grupe prostetice. Acestea sunt mai profund studiate. Ele sunt
indispensabil legate de protein i prezint un anumit interes biologic.
Nudeoproteidele sunt compuse din proteine i acizi nucleici. Denumirea lor e
derivat de la numirea nucleului celular, dar se afl i n alte compartimente ale celulei. De
aceea nudeoproteidele constituie o clas individual de substane organice, cu o
componen, structur i funcie independent de localizarea lor n celul. Astzi putem
afirma c natura proteinelor studiate n celul e determinat de un reprezentant al
nucleoproteinelor - DNA.
Proprietile organismelor vii, ale celulelor i ntregului organism sunt detenninate ns
de proprietile proteinelor sintetizate. La hidroliza perfect se observ descompunerea
nucleoprotcidelor n proteine i acizi nucleici. Componena proteic o alctuiesc histonclc
bogate n arginin i lizin. Natura proteinelor nu este suficient studiat.
Cromoproteidele sunt compuse din compartimentul proteic i cel neproteic colorat,
de unde provine i denumirea lor; iau parte activ i obligatorie la procesele de acumulare
a energiei, ncepnd cu fixarea energiei solare n plantele verzi, utilizarea ei judicioas de
ctre organismul animalelor i al omului: fotosintez, respiraia celular, transportul 0 2 i
CO.,, reaciile de oxido-reducere, senzaiile de lumin i culoare etc.
Reprezentani: clorofila, hemoproteidele, sistemul de citocromi, catalaza, peroxida-
za. La baza structurii grupei prostetice se afl inelul porfirinic, care adiioneaz elemente
chimice diferite (Fe, Mg).
Fosfoproteidele sunt proteine compuse dintr-o parte proteic i acid fosl'oric.
Accstor molecule Ie sunt proprii legturi esterice ale acidului fosforic cu proteina
ce se adiioneaz prin OH al aminoacizilorserina, treonina.
Reprezentanii proteidelorcazeinogcnul (proteina laptelui), fosfovitina, vitelina, vitelinina
(din glbenuul oului), ihtulina (icre de pete)ocup un loc deosebit n compuii ce conin
fosfor, muli dintre acetia se gsesc n sistemul nervos central. Fosfatul labil e absolut
necesar pentru funcionarea celulei i exerc itarea menirii sale biologice. n procesul de
embriogenez, de cretere postnatal i dezvoltare servesc drept material preios energetic
i plastic. Un ir ntreg de enzime, ce regleaz procesclc de metabolism celular, se
caracterizeaz prin legtura strnscu fosforul.
Glicuproteidele, ca exponeni ai grupei prostetice servind glicoaminglicanii, se
includ n esuturi i n form liber. Legtura cu glucozamina, galactozamina com
puilor proteici se realizeaz prin asparagin, serin, treonin. Componena glucidic
determin rolul biologic al glicoproteidelor indispensabili de existena membranelor
celulare, participnd la rcaciile imunologice, schimbul de ioni, adeziunea intercelular.
Lipoproteidele, ca grup prosteic, sunt reprezentate de lipide neutre, acizi grai
liberi, fosfolipide, colesterol, cu funcii variate. Fiind compui ai membranelor cclularc i
organitelor, pot exista i n form liber n plasma sngelui.
Metaloproteidele metalul este legat complex de resturile de aminoacizi (transferi-
n, ceruloplasmin, feritin). Aici se includ i unele proteine enzimatice ca anhidraza
carbonic (Zn), ascorbatoxidaza (Cu) etc.
PROPRIETILE GENERALE ALE PROTEINELOR
Proteinele sunt compui macromoleculan cu proprieti hidrofile, adic sunt solubile.
Aceast nsuire se datoreaz repartizrii pe suprafaa moleculelor a resturilor de
aminoacizi cu sarcini electrice sau a grupelor polare. Proteinele fbrilare sunt insolubile n
ap, pe cnd cele globulare atest grade diferite de solubilitate.
Solubilitatea proteinelor
Solubilitatca n ap este puternic influenat de diverse sruri ale metalelor uoa
re: NaCl, MgCl2, Na2 S 0 4, (NH 4 )2 S 0 4. n concentraii mici ele au un efect favorabil.
De exemplu, globulinele sunt greu solubile n apa pur i se dizolv uor numai n
soluii saline diluate. Efectul nu depinde de natura srii, dar dc concentraia ei i de
numrul de sarcini ale fiecrui ion din soluie. Mai eficace sunt srurile ce conin ioni
bivaleni (Mg), fa de cele ce au ioni monovaleni. Solubilitatea mrit e determinat de
creterea gradului de disociere a grupelor ionizate n proteine.
n concentraii foarte mari srurile amintite reduc solubilitatea proteinelor pn
la precipitarea lor din soluie - salifiere. Procesul e mai efectiv n punctul izoelectric
al proteinelor. Mecanismul e complicat: ionii de sare atrag moleculele de ap
polarizat, micornd cantitatea de ap ce interacioneaz cu proteina, cauza fiind
concentraiile mari de sare n care numrul ionilor este imens fa de numrul grupelor cu
sarcin a proteinei. Dar avnd n vedere c solubi 1itatea proteinelor n ap este dependent
de formarea membranei apoase n juml grupelor ionice hidrofile, transferul molecular de
ap la ali ioni micoreaz solubilitatea proteinei. Procesul decurge mai rezultativ atunci
cnd toate operaiile se efectueaz la temperaturi joase, n condiiile n care proteinele
sunt mai stabile.
Diferite proteine se salifieaz la diferite concentraii de sruri fenomen ce este
utilizat pentru fracionarea lor. Globulinele precipit cnd soluiile care le cuprind sunt
aproximativ semisaturate n (NH4 )2 S 0 4, pe cnd albuminele precipit la concentraii mai
mari de 75% saturaie.
Procesul de salifiere a proteinelor n multe cazuri nu e legat de pierderea capacitii
proteinei de a se resolubiliza dup nlturarea agentului. Eliminarea prin dializ a
(NH4 ) 2 SO, sau Na - sulfat complet conduce la resolubilizarea n ap a proteinei salifiate
cu formarea soluiilor adecvate. Capacitatea de resolubilizare rapid se menine i n
cazul nlturrii imediate a proteinei de la salifiat (alcool): proteina i pstreaz proprietile
native.
Soluiile n ap a proteinelor au un caracter coloidal. Diametrul unor astfel de
particule e de la 1 la 100 n m . Remarcm soluii reale:
a) ioniceparticulele sunt mai mici dect 1 nune, disociaz n ioni, conduc curentul
electric;
b) molecularese descompun pn la molecule, nu disociaz i nu conduc electricitatea
(glucoza, alcoolul)dau spaiu optic nul.
Dac particulele sunt mai mari de 100 ininc i substana rmne solid n faza lichid,
rezult suspensia, iar cea lichid n lichid - emulsie.
Pentru soluiile coloidale (dar proteinele formeaz soluii coloidale) e caracteristic:
a) fenomenul lui Tindal pozitiv;
b) nu di fundeaz prin membrane semipermeabile, care uor transfer apa sau sub
stanele micromoleculare. Procesul e numit dializ i st la baza funcionrii aparatului
rinichiului artificial. Majoritatea membranelor biologice normale nu sunt penneabile pentm
proteine;
c) substanele ce fonneaz soluii coloidale nu se cristalizeaz la mrirea concentra
iei, dar genereaz precipitat amorf. Proteinele pot forma cnstale numai n anumite condiii,
din soluia-mam;
d) soluiile coloidale au o viscozitate mrit ce depinde de masa i fonna mole
culelor. Proteinele de aceeai mas molecular, dar cu molecule asimetrice, au o viscozitate
mult mai mare. Substanele coloidale interacioneaz cu apa. n proteine grupele ionogenice
leag apa: COOI I - 4 molecule de H 2 0 , NH2- 3 molecule, OH i NH - cte 2 molecule;
e) viteza de difuziune e foarte mic. Difuzia este procesul sumar de transfer al
moleculelor dizolvate sub influena gradientului de concentraie. Coeficientul de
difuzie depinde de mrimea i fonna moleculelor, de rezistena detenninat de vis-
cozitatea solventului. Procesul de difuzie constituie baza funcionrii celulei,
transferului de substane. Viteza difuziei i distana la care pot fi transportai diferii
metabolii n celul sunt parametrii principali ce limiteaz metabolismul n celulele
vii i organitele lor;
f) soluiile coloidale n concentraii mari au o presiune osmotic mic. Ea depinde de
numrul particulelor dizolvate n unitate de volum, dar nu de natura lor;
g) au tendina de a fonna diferite complexe moleculare;
h) sunt capabile de absorbie i singure se supun absorbiei;
i) se tumefiaz i se coaguleaz.
Soluiile coloidale capt fonna de so lsoluie lichid cu o anumit fluiditate i
compoziie de gel, pierzndu-i fluiditatea dm cauza fonnrii structurii de reea intern cu
fixarea apei. Atare structuri apar: 1) la tumefierea xerogelului (agar-agar, clei, gelatin);
2) n unna polimerizrii fibrinogenului; 3) n urma condensrii amidonului, gelatinei.
La nvechirea gelului are loc sinereza, proces de expulzare a apei datorit contraciei
structurilor fonnate din particulele coloidale i eliminarea solventului imobilizat. Apa inclus
n reeaua structural e numit imobilizat, pe cnd apa structural e legat de gmpcle
hidrofile interne ale macromoleculei proteice. Sinereza are loc la coagularea sngelui, n
proccsul de retracie a cheagului.
Proprietile electrochimice
Proteinele sunt amfolii macromoleculari, nglobnd un numr redus de grupri acidc
i bazicc. Contribuia cea mai important o au resturile de glutamil, aspartil, lizil, arginil i
histidil. Resturile aminoacide de la capetele i N tenninale nu au o influen semnificativ,
mai ales cnd lanul polipeptidic este mai lung. Grupele ionizate sunt dispuse n interiorul
suprafeei moleculare.
Proprietile acido-bazice sunt determinate de numrul mare dc grupe ionizate ale
resturi lor de aminoacizi. De predominarea lor depind proprietile electrice. n albumin
exist 109 resturi dc C 001I i 120 de NH.,; hemoglobina conine 48 COOH i 48
NH,. Sarcina electric determinat de structura proteinei.
Moleculele proteice, fiind electrolii amfolii, interacioneaz cu acizii i cu bazele,
particip la meninerea pH. n intervalul 6-7 al pH capacitatea-tampon a proteinelor
foarte mic. Numai aminoacidul histidin posed proprieti tampon la valori normale
ale pH. Hemoglobina (Hb) eritrocitelor, transfernd O,, sc caracterizeaz prin coninut
evident de histidin, dc aceea i are Hb - aceste proprieti - tampon la pH = 7.
Particulele proteice n soluie pot s-i schimbe sarcina electric n dependen de
pH. n soluie acid are loc inhibarea disociaiei COOl I i, avnd sarcina pozitiv, proteina
migreaz spre catod, n soluie bazic inversspre anod.
pH - soluiei, n carc proteina apare cu o sarcin electric nul, numrul gruprilor (+)
este egal cu acela al gruprilor (-), este denumit pH izoelectric sau punct izoelectric
(pi). Valoarea pl depinde de compoziia proteinei n aminoacizi. O protein ce arc surplus
de lizin i arginin denot un pi >7, iar aceea care are o proporie mare de aminoacizi
dicarboxilici - pi < 7.
R COO +H+ R ~ COOIi R -C O O ' +OH- R COO'
1+ !+ > I + 2
NH 3 ~ > NH3 NH3
n tabelele 1.4. i 1.5. sunt date valorile pi ale unor aminoacizi i ale unor proteide.
La pH izoelectric solubilitatea, mobilitatea proteinei n cmpul electric este minim;
pentru fiecare protein e caracteristic pi propriu. Valoarea lui e determinat de numrul
de grupe ionizate i de valoarea constantelor de ionizare (ribonucleaza7,8; citocromul
10,6; pepsina1,0). n p l molecula proteic e cu sarcin nul i ntre moleculele
nvecinate nu apar fore electrostatice de respingere, ceea ce nseamn c n atare condiii
soluiile sunt nestabile.
la o eiu i 1.4. vaiorue pu nctuiui izoelectric pentr u unu aminoacizi proteino em
Aminoacid pi Aminoacid Pi
2 ) micorarea solubilitii;
Denaturarea este provocat de diferii ageni: temperatura nalt, sruri ale metalelor
grele care n concentraii mici produc denaturarea, coagularea proteinei. Proteina coa
gulat din soluie se leag i se precipit cu factorul nociv. Fenomenul e utilizat n practica
medical. La intoxicaie cu sublimat bolnavului i se administreaz lapte, ovalbumin n
cantiti mari. Proteina fonneaz, n ansamblu cu substanele toxice, un precipitat ce
micoreaz absorbia lui. n unele condiii proteina denaturat poate rmne n soluie,
dac aceasta este acid sau alcalin, chiar i la temperatura de 100C. Precipitatul va
aprea la neutralizarea soluiei.
La o aciune de scurt durat i la eliminarea rapid a agentului denaturant e posibil
renaturarea proteinei cu restabilirea activitii ei biologice. Denaturarea e ireversibil
atunci cnd se mp legturile chimice, n special cele disulfidice inter- i intracatenare.
n procesul de sterilizare are loc denaturarea tennic i, n consecin, insuficiena de
timp sau de t duce la generarea i rspndirea microbului etc.
Multe proteine nu sc denatureaz la sublimare (liofilizare). Totui, unele enzime i
diminueaz activitatea. E necesar s tim c exist substane ce pol mpiedica denaturarea,
i anume: soluia de glucide simpl saturat, alcooli multiatomi (glicerina), unii anioni
organici (dodecilsulfat, unii acizi grai) etc. Pentru a evita denaturarea proteinele se izo
leaz. Ele se pstreaz la rece, n soluii concentrate de sruri i la un pH anumit.
M etodele de identificare a proteinelor. Problema elucidrii complete a
structurii macromoleculare a proteinelor este una dintre cele mai actuale i de o
incontestabil importan teoretic i practic. Pentru determinarea masei moleculare
proteice pot fi utilizate urmtoarele metode: mrimea presiunii osmotice, constanta
ultracentrifugrii (proteinele sedimenteaz n raport cu mrimea i masa lor); metoda
difuziunii luminii (intensitatea difuziunii e dependent dc numrul particulelor i dc masa
lor molecular); mrimea difraciei razelor Roentghen, microscopia electronic; coninutul
unor elemente (n Hb concentraia Fe este egal cu 0,34%), care se conin n cantiti
mici (n albumina seric concentraia triptofanului e de 0,58%).
Amestecul proteic
este adugat n
Granule coloana ce conine
polimerice un ligand fixat la j
cu pori polimer, specific
pentru proteina ce
prezint interes
F igura 1.16. Metode utilizate pentru purificarea proteinelor: a) electroforez, b) focalizarea izoelectric
Un gradient constant al pH-lui este stabilit n gel prin adausul amfoliilor potrivii (1).
Amestecul proteic este plasat ntr-un rezervor n gelul la care se aplic un cmp electric
(2). Proteinele ptrund n gel i migreaz pn ce fiecare atinge pH-ul echivalent pl propriu
(3). Amintim c atunci cnd pH este egal cu pi, sarcina net a proteinei este egal cu
zero. n figur sunt artate proteinele dup coloraie, care sunt distribuite dc-a lungul
gradientului pH-lui n dependen de valoarea pi.
n electroforez bidimensional (fig. 1.16c) proteinele iniial sunt separate prin
focalizarea izoelectric ntr-un gel cilindric. Apoi gelul este amplasat orizontal pe un alt
gel n form de plac, unde proteinele sunt separate prin elecroforez n gel de
_ Mr---------f
w , . . Electroforez
Gelul focalizat
izoelectric este
* \
i
*
1t *
I
plasat n ------- V
gelul de
0 m s ) r>: poliacrilamid \ t
Focalizarea
;
izoelectric
1 '
.: - 1 t j
poliacrilamid. Separarea orizontal reflect diferenele de pi, iar cea vertical masa
molecular. Utiliznd aceast tehnic, pot fi separate mai mult de o 1000 de diverse
proteine din E. coli.
Mobilitatea electroforetic a proteinei n gel de poliacrilamid poate fi utilizat i n
determinarea masei moleculare (fig. 1.17).
Proteinele standarde cu masa molccular cunoscut sunt supuse electroforezei. Aceste
proteine - marker (1.17a) pot fi utilizate pentru a estima masa molecular a proteinelor
necunoscute.
n (1.17b) este redat dependena logaritmului masei moleculare a proteinelor marker
versus migraiei relative la o electroforez liniar. Graficul respectiv pennite determinarea
masei moleculare a proteinei necunoscute. La moment sunt cunoscute metode mult mai
sofisticate de purificare i apreciere structural a proteinelor.
a) 1 2
_ j n n
Miozina 200,000
-galactozidaza 116,250
Glicogen fosforilaza 97,400
P r o te in a
Seraibumina 66,200 studiat
Ovalbumina 45,000
Carhanliidraza 31,000
MT standard
Figu ra 1.17. Estimarea masei moleculare
ENZIMELE
Istoria biochimiei este, n primul rind, istoria studierii enzimelorcelor mai distinctive
i specifice proteine cu proprieti catalitice.
Enzimologia e demult considerat o tiin aparte i s-a dezvoltat efectiv n ultima
perioad de timp, dar nceputurile ei se atest din primele decenii ale secolului al XIX-
lea.
Dac n 1920 erau estimate 10-15 enzime prin observarea efectului aciunii lor,
astzi sunt caracterizate partial peste 2000 enzime, dintre care circa 500 au fost obinute
sub fonna unor preparate perfect purificate (unele cristaline) i studiate din punct de
vedere fizico-chimic i biologic.
Manifestrile aciunii enzimelor (fermentaia, digestia) erau cunoscute de foarte mult
timp, dar explicaia mecanismului acestor procese complexe, rolul i locul enzimelor n
transformrile substanelor celulare rmneau neclucidate. Un ir de mecanisme sunt i
pn astzi nedefinite.
Definiia cnzimei s-a conturat atunci cnd s-a observat c n sistemele biologice
au loc procese catalitice survenite din extractele de orz genninal ce realizeaz hidroliza
am id o n u lu i. Cu a ju to ru l p re c ip it rii re p e ta te cu alco o l etilic
s-a obinut (1833) o pulbere alb extrem de termolabildiastaza (din grecete
didotabis - separare).
n perioada 1834-1837 savantul suedez J.Beizelius formuleaz conceptul de cataliz,
confonn cruia un catalizator mrete viteza reaciilor chimice i rezult la sfiritul
lor nemodificatcantitativ i calitativ. El sugereaz c diferitele fenomene biologice
(fennentaia, digestia) pot fi explicate prin prezena unor catalizatori biologici specifici
materiei vii. n 1860, L.Pasteur stabilete c fermentarea zahrului de drojdii n spirt e
catalizat de fermeni organizai indispensabil de organismele implicate n procesele
fennentative.
Aceast concluzie era n contradicie cu postulatul lui J.Liebig, care considera c
fennentul e solubil, fiind produs de celula vie i nu constituie celula propriu-zis.
n anul 1877, W.Kuhne propune termenul enzim (de la grecescul enzyme n
drojdii) pentru atare grup de substane. O fierbere aparent cauzat dc ferment (n
latinferverea fierbe), cu degajarea C 0 2 n procesul fermentativ, caracterizeaz
aceste fenomene biologice.
Celebra disput tiinific Pasteur Liebig a fost finalizat cu brio n 1897, de ctre
H. i E.Buchner, care au demonstrat c sucul cclular al unei culturi de drojdii conservcaz
ntreaga activitate fermentativ, proprie acestui microorganism.
n ultimii ani ai sec.XIX, E.Fischer, efectund studii asupra unor enzime hidrolitice, a
specificitii enzimelor, elaboreaz teoria interaciunii enzim-substrat. Aceast teorie a
stimulat cercetrile n acest domeniu.
Epoca modern ncepe o dat cu izolarea, purificarea i cristalizarea primelor enzime.
n 1926, J. Sumner a cristalizat ureaza i a determinat c enzimele totalmente sunt de
natur proteic. El nainteaz conceptul c toate enzimele sunt proteine, dar savantul
german Richard Willsttter, o adevrat somitate n materie, confirm c enzimele
sunt substane cu o greutate molecular mic, iar proteina depistat e o simpl murdrie.
Mai trziu, J.Northrop, mpreun cu colaboratorii si, cristalizeazpepsina i tripsina,
confirmnd astfel c i ele sunt proteine. Aadar, natura proteic e stabilit incontestabil.
S-au nceput studii intensivem acest domeniu, ce au dat rezultate rcmarcabi le. Cu toate
acestea, o serie de ntrebri, cutn ar fi: dc ce proteinele joac rol de catalizatori; care
este cauza c molecula enzimeie mult mai tnare dect a substratului; decc aminoacizii
nu posed proprieti similare, dar unite n lan polipeptidic capt proprieti catalitice;
n ce mod are loc reglarea activitii enzimelortoate ateapt rspunsuri explicite.
Ce sunt enzimele?
Enzimele sunt uniti funcionale ale metabolismului celular. Acioneaz strict ntr-o
anumit consecutivitate. Catalizeaz sute de reacii n lan, finaliznd cu eliberarea
moleculelor din substane nutritive. Energia substanelor rcagente trece dintr-o form n
alta cu o eficacitate mare i se acumulcz n ATP ce este utilizat n proccsele vitale.Din
micile biomolecule se asambleaz macromoleculele celulei.
O grup deosebit sunt enzimele reglatoare, care sesizeaz diferite semnale perfect
metabolice i, respectiv, i modific activitatea catalitic. Datorit acestor enzime n
celul totul e coordonat: garantat un echilibru armonios dintre procesele metabolice
necesare pentru meninerea integritii i, n final, a vieii celulelor, viabilitii sistemului i
al ntregului organism.
Insuficiena sau lipsa complet a unuia sau a mai multor fermeni duce la apariia
diferitelor afeciuni ereditare; diferite stri patologice apar la o activitate excesiv a uneia
sau a mai multor enzime. i o dat cu elaborarea unui preparat medicamentos care ar
regla activitatea acestor enzime, vom trata eficient boala.
Enzimele joac un rol important la stabilirea diagnosticului, detenninnd activitatea lor
n lichidul biologic. n industria chimic i alimentar evaluarea enzimelor este utilizat
pe larg. Enzimele au un rol aparte i n agricultur.
Structura enzimelor
Enzimele sunt proteine i posed toate proprietile fizico-chimice specifice accstor
macromolecule (solubilitate, proprieti osmotice, sarcin electric net, denaturare termic,
reacii chimice etc.). Activitatea lor e dependent dc pstrarea structurii native a proteinei.
Confirmrile experimentale ale acestui postulat sunt:
1 . Distrugerea lanului polipeptidic prin fierbere m soluii acide sau prelucrarea lui cu
tripsin ducc la pierderea activitii catalitice. Pentru meninerea ultimei e necesar pstrarea
structurii primare.
2. Modificrile n mpachetarea lanului polipeptidic (nclzind proteina sau acionnd
cu pH de valori extreme, cu ageni denaturani) cauzeaz pierderea activitii catalitice,
ccea ce indic necesitatea meninerii structurii secundare i teriare a proteinei.
Masele moleculare ale enzimelor variaz n limite foarte largi. Ribonucleaza are o
mas molecular egal cu 13700Da. Limita superioar este greu de definit. Numeroase
enzime sunt alctuite numai din resturi de aminoacizi unite ntre ele prin legturi covalente,
peptidice i nu doar printr-un lan, ci prin mai multe lanuri polipeptidice.
Unele enzime sunt asociate cu compui dc mase moleculare mici, dializabili. Cnd
aceti compui organici sunt strns legai n structura enzimei, ei poart denumirea dc
grupri prostetice, ns cnd mbinarea lor este uor disociabilcoenzime.
Aceti biocatalizatori se numesc halo enzime, iar componenta proteicapoenzime.
Pentru totalitatea compuilor neproteici din structura heteroenziinelor se utilizeaz termenul
cofactor. n calitate de cofactori apar frecvent cationii unor metale i foarte rar unii
anioni. Un numr relativ redus de cofactori, de coenzime n asociere cu diferite apoenzi
me dau natere unui numr foarte mare de heteroenzime. Se atest sute de dehidrogcnaze
cu coenzima NAD+. Datorit legturilor foarte slabe ntre NAD+i diverse apoenzime,
un numr mare pot aciona simultan ntr-un compartiment celular, utiliznd o cantitate
nensemnat de coenzime. i n aceste situaii este absolut necesar ca procesele de redu
cere s fie echilibrate cu reoxidarea lor.
Ce e comun i ce e distinct la cataliza enzimatic i cea chimic?
Enzimele sunt catalizatori i respect legile catalizei:
1. Enzimele accelereaz viteza reaciilor chimice posibile din punct de vedere
termodinamic, determinnd o scdere a energiei de activare i conducnd la instaurarea
mai rapid a strii de echilibru; accelereaz reaciile n ambele direcii n mod identic
A B.
Ln lipsa enzimei viteza (A B) e egal, de exemplu, cu 1O' 4 sec., reacia invers
(A - B) decurge n IO' 6 sec.
Constanta acestei reacii este egal:
[] Cd io4
c = --- = 7 = 1 0 0
-
[A ] Ci IO' 6
n stare de echilibru concentraia substanei este de 100 ori mai marc dect a
substanei A, chiar dac prezent sau nu enzima. n lipsa enzimei echilibrul se stabilete
timp de cteva ore, iar cu enzim an cteva secunde. Enzimele accelereaz apariia
echilibrului chimic n reacia catalizat.
2. Viteza reaciei crete de milioane de ori. De exemplu, reacia catalizat de
carbanhidraz: C 0 2 + H ,0 H2 C 0 3
Fiecare molecul de enzim hidrateaz n 1 sec.- 105 molecule dc COn i, prin
urmare, viteza reaciei n prezena enzimei crete dc 1 0 7 ori.
Efectul enzimelor e extraordinar n comparaie cu cel al catalizatori lor sintetici. Enzimele
se prezint n concentraii extrem de mici la concentraii de substrat relativ mari. Eficiena
catalitic a enzimei este net superioar celei nregistrate n cazul catalazei chimice,
exprimndu-sc prin numrul de turnover numrul de molecule ale substratului
transformat ntr-un minut de o molecul de enzim.
3. La sfritul reaciilor chimice enzimele, la fel ca i catalizatorii, se regsesc, din
punct de vedere cantitativ i calitativ, ntr-o stare chimic neschimbat, participnd la un
nou act catalitic.
4. Enzimele sunt substane macromoleculare extrem de instabile, reacionnd n condiii
optime numai la anumii parametri - parametri optimi de aciune a enzimei soluii apoase
diluate, pH valorii fiziologice, T anumit i presiune adecvat.
SPECIFICITATEA EN ZIM ELO R
Cea mai important prioritate a enzimelor e nalta lor specificitate de aciune -
atribut fundamental ce determin succesiunea reaciilor care favorizeaz calea metabolic.
Multitudinea formelor de manifestare a specificitii poate fi ncadrat n 2 categorii -
cea de reacie i de substrat.
1. Specificitatea de reacie este proprietatea de a cataliza un anumit tip de reacie
ce st la baza clasificrii enzimelor. Enzimele proteolitice catalizeaz hidroliza legturilor
peptidice:
O O
H 2 N CH C-i-NHCHC-i-NHCHCOOH + 2H20
I ' I ' I
RI R2 R3
H 2 N C H -C O O H + H 2 N C H -C O O H + H 2 N C H -C O O H
- I - I - I
RI R9 R2
H 22 N C NH
2
2
2
+ H ,0 , + 2NH 3
O
Specificitatea relativ se manifest n diferite ipostaze:
a) posed o arie larg, fa de numrul substraturilor (proteazele n funcie de resturi
de aminoacizi: chimotripsina legtura peptidic, format de COOH a Phe, Tyr, Tip;
tripsina-deC O O H ai Lysi Arg; trombina de COOH ai Arg i NH, ai Gly);
b) formeaz o arie mai ngust: alcool dehidrogenaza dehidrogenaz un grup
de alcooli monohidroxilici cu un numr mic de atomi de (specificitatea de grup),
adic se manifest prin gruparea chimic:
r - c h 2- o h ^ ^ r - c h = o
N A D + NADH+ H +
) n lipazele digestive specificitatea coreleaz cu poziia legturii esterice ntre
glicerin i acizii grai:
O
II
CH2- 0 C - R , c h 2- o h
I Lipaza pancreatic
C H - O c o - r 2 C H - O R2
I
CH2 o c R, 2H20
r , - cooh ch, - oh
II R 3- C O O I I
O
CH2OH
Lipaza intestinal
CH OH
II2 0 r 2- cooh c h 2- o h
doar punct, linie sau plan) structur
complex, la fonnarea creia particip vel Ctr _ **'
grupe ale diferitelor resturi de aminoacizi \ \ I
Ser- n j
(exemplu: nstructuralizozimului,dincei 129 Sn \
de aminoacizi radicalii aminoacizilor din Os ft
secvena liniar35,52,62,63,101 particip
la formarea CA). Centrele active ale unor F igu ra 1.17. Centrul activ al chintotripsinei
enzime sunt redate n fi guri le 1.17-1.18.
-64
3. Substratul relativ slab se leag cu
enzima. Energia liber a interaciunii e de
3-12 kcal/mol. Fora legturilor covalente
nu deviaz de la limitele 50-110 kcal/mol.
4. CA are form de adncitur sau
cavitate (an, despictur), unde apa n-
are acces, cu excepia dac aceasta servete
drept reagent al reaciei. Aceast cavitate
conine civa aminoacizi polari ce exercit
legarea i cataliza. Regiunea CA are un
caractcr nepolar ce favorizeaz fixarea
substratului. De menionat c forma CA
creeaz un microspaiu, n care resturile Figura 1.18. Centrul activ al elastazei
polare capt nsuiri deosebite, necesare
pentru cataliz.
5. Fixarea specific e dependent de
poziia bine dctenninat a atomilor n CA.
Substratul ptrunde n CA, cu condiia
similitudinii de form. n 1890, Emil Fischer
+
>
a elaborat modelul clasic al structurii Figura 1.19. Formarea complexului enzim-
substrat (ES) dup modelul E. Fischer
spaiale a CA n raport cu structura
substratului. Anume acest principiu' lact
-ch eie a contribuit cu succes la evoluia conceptului catalizei stereospecifice
(fig. 1.19).
n ultimii ani ns s-a constatat c centrul activ nu e o structur rigid cum presupunea
E.Fischer, ci se modific la fixarea substratului. Modelul dinamic, propus de D. Koshland,
presupune o flexibilitate a zonei de cazare a CA n enzima liber. CA este preformat,
ceea ce denot c are o conformaie spaial puin diferit de cea necesar fixrii
substratului. Substratul induce o
modificare conformaional a zonei
CA, realiznd o configuraie optim
fixrii (fig, 1.19a).
Unele enzime fixeaz substratul n
form a lor te n sio n at , ce
corespunde strii de tranziie.
D in p u n ct de vedere
F igura 1.19a. Modificrile conformaionale n molecula
termodinamic, situarea cea mai enzimei la fixarea substratului (modelul D. Koshland)
potrivit a substratului n raport cu
enzima reduce la mi ni m gradele de libertate ale transirii i rotaiei substratului, i micoreaz
entropia, ceea ce favorizeaz obinerea efectiv a strii de tranziie i motiveaz n mare
parte scderea energiei dc activare a reaciei catalizate enzimatic.
E incontestabil faptul c flexibilitatea structurii enzimei determin prezena substratului
n sfera de aciune a grupelor catalitice i ieirea produsului din acest sistem.
Unele enzime induc o peiturbaie a electronilor pe substrat, amplificnd cu mult viteza
catalizei (carboxipeptidaz).
Exist o varietate mare de factori ce influeneaz viteza reaciilor ferm entative
i determin activitatea catalitic a enzimelor.
1. Concentraia fermentului:
a) n condiii standard, 2 molecule de enzime ntr-o anumit perioad de timp vor
cataliza de 2 ori mai multe molecule de substrat dect o molecul de enzim V = R[E]
o relaie strict proporional. La mrirea concentraiei de enzim se observ devieri de la
relaiile strict liniaredevieri imaginare ce in de metoda de studiu;
b) n prezena mai multor enzime, viteza va fi limitat de concentraia uneia dintre ele;
c) o dat cu sporirea concentraiei enzimei, viteza unei reacii complexe se va micora
n cazul n care coenzima practic va fi legat de o enzim inaccesibil pentru celelalte;
d) adaosurile toxice pot fixa enzima. Numai dup legarea lor, enzima va deveni apt
pentru activitate.
2. Concentraia substratului. Concentraia enzimei din esuturi suport variaii mici
n timp (cu excepia enzimelor inductibile), astfel net ea poate fi considerat
constant.
n schimb, concentraia substratului poate varia destul de mult conform strii
metabolice a esutului. Dependena vitezei reaciilor de concentraia substratului constituie
aspectul cel mai important al cineticii
enzimatice (fig. 1.20). v (/min)
Reprezentarea grafic reflect o I V =V_
curb cu afiniti de hiperbol.
E xplicarca ei se datoreaz lui
L.Michaelis i M.Menten. KMeste
egal cu concentraia substratului
pentru care Vo prezint o jumatate
din V . Exprimarea KMse face n
uniti de concentraie i se deduce
din presupunerea de baz precum c
factorul-limit al vitezei reaciilor
fe rm e n ta tiv e este scin d area
complexului ES n produs i enzim. F igura 1.20. Variaiile vitezei reaciilor enzimatice n
Fiecare enzim n parte are valoarea fu n cie de concentraia substratului
KM pentru substratul dat. Unele Ecuaia lui Michaelis-Menten.
enzime (catalaza, carbanhidraza) cer cantiti relativ mari de
substrat pentru a atinge viteza egal cu Vo; altele (hexokinaza) V maxL[S]J
ating mrimea dat la concentraii mici de substrat. V =-
n condiiile de mediu al celulei, enzima nu-i saturat cu
substrat Ti nu funcioneaz
*
cu Vmax. Modificnd concentraia
substratului, posibil, n anumit msur, reglarea proceselor oxidative din celul.
3. pH optim al fiecrei enzime, ce genereaz o aciune maxim a ei, nu coincide
obligatoriu cu valorile pH caracteristice mediului intracelular al enzimei.
Mrind sau micornd pH-ul mediului,
se poate regla activitatea catalitic a
enzimelor. Acest optim pH e dependent de
gradul de ionizare a grupelor funcionale, al
afinittii enzimei cu substratul i stabilittii ei
(fig. 1 .2 1 ).
Ionii H+ i OH' au un efect denaturant
asupra enzim elor rup legturile, ce
determin structura teriar. Dac n CA al
enzimelor se afl grupri ionizabile, acide
sau bazice, acestea interactioneaz direct
cu ionii H+ i OH;, rezultnd creterea sau Figura 1.21. Activitatea unor enzime n
dependen de p H
scderea gradului lor de disociere i
acionnd ca adevrai inhibitori ai enzimelor
(am ilaza n sucul g a stric).
4. Influena temperaturii (T) determin
sta b ilita te a i v iteza de scin d are a
complexului ES, influennd afinitatea enzimei
la substratul activator sau inhibitor. Creterea
vitezei reaciei o dat cu creterea
temperaturii este interpretat prin prisma
energiei de activare. Pentru fiecare enzim
se poate stabili o temperatur optim,
viteza atingnd valoarea maxim. Creterea
temperaturii cu 10C pn la 40C dubleaz
n continuare viteza reaciei. Viteza scade activitii enzimelor
ENZIM ELE ALOSTERICE. Ele posed cu totul alt sau alte centre dect cel
activ, n care sunt fixai liganzii. Ce le este caracteristic acestor enzime?
1. Posed, ca i toate enzimele, centru catalitic, unde se fixeaz i se modific sub
stratul, dar mai posed un alt centru care are o poziie spaial pentru fixarea
metabolitului reglator, numit efector sau modulator. Acest centru e specific pentru
fiecare modulator.
2. Moleculele enzimelor alosterice sunt
mai mari, mai complexe i primordial Mioglobina
oligomere pare.
3. Au cinetica lor viteza reaciilor, n
dependen de concentraia substratului, are
forma sigmoidal, dar nu hiperbolic,
cauzat dc urmrile interaciunii ntre
protomeri ce leag substratul n mod
cooperativ (exemplu mioglobina i
hemoglobinafig. 1.26).
Exist 2 tipuri de enzime alosterice:
a) homotrope n care modulatorul i
substratul constituie aceeai substan. 1.33 2.67 3 38 5.3 6.67 kPa
Acumularea substratului activeaz viteza Figura 1.26. Curbele de oxigenare ale
inioglohiitei (Mb) i hemoglobinei (Hb)
reaciei catalizate dc aceast enzim:
H exokinaza
Glucoza + ATP G - 6 - P + ADP
(de altfel, ca i alcoolul ce activeaz enzima ce l
scindeaz - alcooldehidrogenaza);
b) heterotrope enzimele sunt reglate de
modulatori care difer dup structur de
substrat, muli dintre ei avnd aciune antipod.
La fixarea modulatorului, enzimele alosterice i
modific conformaia. Modulatorii accelereaz
sau inhib utilizarea substratului de enzima
respectiv (fig. 1.27).
Unele sisteme enzimatice manifest o parti pozitivi (+) i negativi (-) asupra cineticii
cularitate deosebit: produsul final al sistemului reaciilor catalizate de enzimele alosterice
inactiveaza enzimaun rezultat al activittii mai
productive a sistemelor multienzimatice, dect e necesar
COO
celulei. Acest produs final acioneaz ca un inhibitor specific
H3N- H
al primei enzime i, ca rezultat, viteza sistemului se echili
I breaz n corespundere cu cerinele celulei - retroinhibi-
H- -C-OH
H,
ie sau inhibiie prin produs final, inhibiie de tipfeed back.
L-treonina Transformrile L-treonina L-izoleucina necesit
. Treonin
: i dehidrataza 5 enzime. Prima enzim e treonindehidrataza, inactivat
de izoleucin, modulator ce se fixeaz n CA. Este un
exemplu clasic de reglare necovalent i e reprodus n
fig. 1.28.
Se nregistreaz enzime reglatoare, la baza activrii
crora se atest modificri covalente ale moleculei:
E
Glicogenn+ P Glicogenn , + Glucozo-l-P
peptidaza;
2 ) coagularea sngelui e determinat de
avalana de reacii cu aciune proteolitic;
3) hormonii proteici (insulina);
4) proteinele fibrilare (colagenul). - / Fosforilaza A
Exist o grup de proteine-enzime, starea activ
a crora e condiionat de mpachetarea spontan 1 ,29' Res la re< aciyitau ghcogen
1 r fosforilazei prut modificrile covalente
a m oleculelor cu form area unei structuri
tridimensionale caracteristice enzimei date (lizozim).
UTP PPi
11 T yr
E nz E n z P O C H , o . U ra c ilu l
U rid ila re a
O" II H .
H H
OH OH
NAD Nicotinam ida o
E nz x _ z I?
Enz ,0 CH2 O P O P O C H 2^ o _A d e n in a
A D P - rib o z ila r e a O' O'
H H
H ' A
ou OH OH
S -a d en ozil S -a d en o zil A r g , G in , C y s
M e tila re a m etio n in a h o m o c iste in a
E nz s ______ _
E nz CH 3 Ght
Figura 1.30. Exemple de modificri covalente ale diferitelor enzime
n 1922 Al. Fleming descoper, ntr-un mod deosebit,
lizozimul, iar n 1929 tot dnsul descoper i penicilina.
M ecanismul interaciunii alosterice
n 1965 savanii J. Monod, J. Wyman, J. Changeux au
propus un model fin i clar al interaciunilor alosterice (MWC)
modelul simetric sau concentrat , avnd urmtoa
rele caracteristici cardinale (fig. 1.31):
1 . enzima alosteric este compus din 2 subuniti identice,
vdite;
3. modificrile conformaionale detenninate de substrat la o subunitate pot mri sau
micora afinitatea la substrat a celorlalte subuniti. Fixarea este cooperativ.
Deosebirile ntre modele: cel simetric nu presupune echilibm ntre formele R i T n
lipsa substramlui, dar din contra, fixarea substratului induce trecerea T R.
n accst model esenial este simetria monomerilor.
Modelul secvenial denot c trecerea de la T la R n diferite
\
subuniti are loc coordonat i ntr-o anumit succesiune. Un rol I J
primordial are fonna hibrid RT. Monomerii interacioneaz cu TT
condiia prezenei formei confonnaionale diferite. n ultimul model
(secvenial) efectul substanelor homotrope poate fi pozitiv i 1
negativ. Fixarea de enzim a dou molecule dc substrat depinde
efectiv de natura modificrilor structurale, detenninate de fixarea
primei molecule de substrat.
?
Recent se consider c aceste modele reprezint dou cazuri TR
aparte de interaciune. n realitate ea e mult mai complex, de +s
pendent de particularitile structurii cuaternare, teriare etc.
E stabilit c sub aciunea guanidinhidroclorurei (G4 HC1) sau a
ureei inactivaia unor enzime are loc la concentraii relativ mici ale
agenilor denaturani, n care nu se observ modificri globale n
conformaia moleculei. Studiile recente confinn c pierderea RR
activitii fermentative e detenninat de micorarea interaciunii n F ig u ra i .3 3 . M odelul
molecule ce are, drept consecin, creterea mobilitii prii ei se cv en ia l de fix a r e
luntrice. i denaturarea tennic prezint date c pentru un ir de Sh
enzime inactivarea este antecedent modificrilor confonnaiei,
care este indus de T nalt. Pierderea activitii enzimatice n
acest caz nu e provocat de efectul inhibitorilor. Posibil c enzimele oligomere (creatin
kinaz), disociind la monomeri, ar putea s se inactiveze n lipsa vdit a desfurrii
moleculei enzimatice. Observaiile denot c disocierea creatin kinazei are loc la
concentraii ale agentului denaturant, cu mult mai majore dect ale celor ce provoac
inactivarea enzimei.
Studiile actuale demonstreaz c micorarea activitii enzimatice n condiii de
concentraii relativ mici ale agenilor denaturani sunt cauzate nu de efectul lor inhibitor
sau de disociaia enzimelor oligomere, dar de dependena de perturbarea conformaiei
centrului activ.
Datele experimentale elucideaz c centrele active ale majoritii enzimelor sunt situate
n regiuni ale moleculei mult mai mobile (ntre domenii) i deci sunt mult mai sensibile la
aciunea agenilor denaturani sau a factorilor fizici. n confonnitate cu ipoteza potrivirii
induse a lui D.Koshland, n fiecare faz a ciclului catalitic regiunea centrului activ capt
o conformaie specific fazei. Activarea enzimei este rezultatul coaptrii CA a confonnaiei,
perfecte, ce detennin efectul catalitic maxim. Dar n caz de sporire a activitii enzimatice
la nclzire i proteoliz, are loc trecerea dintr-o conformaie compact i stabil n alta
relativ mai deschis i structurat mai fin. La proteoliz limitat activarea zimogenului e
cauzat nu de coaptarca CA a conformaiei perfecte cu modificri fine n trcccrea de la
conformaia zimogenului la cea neccsar pentru cataliz, dar de majorarea mobilitii
moleculei proteice n regiunea CA. Anumeflexibilitatea, dar nu structura bine format
a centrului activ, e responsabil pentru funcia catalitic.
INH IBIIA ACTIVITII ENZIM ELOR
Activitatea enzimatic poate fi inhibat de molecule mici specifice, precum i de ioni,
n ansamblu prezentnd un mecanism de control. Distingem inhibiie specific i
nespecific. Inhibiia st la baza aciunii substanelor medicamentoase, a agenilor
toxici i poate fi reversibil i ireversibil.
La inhibiia ireversibil inhibitorul se fixeaz sau se leag covalent att de profund
de enzim, nct disocierea are loc foarte lent. n acest tip de inhibiie se formeaz un
complex enzim-inhibitor stabil, nedisociabil: E + 1 *- EI (reacie ireversibil).
Inhibiia ireversibil prezint urmtoarele caracteristici:
1. Inhibiia se accentueaz progresiv, pn la nlturarea complet a activitii enzimatice
i nu poate fi anulat prin ndeprtarea inhibitorului.
2. Se datoreaz unor modificri covalente i permanente ale gruprilor funcionale
necesare catalizei, transfonnnd enzimele n molecule inactive.
3. La nceput, acest tip de inhibiie este incomplet, dar crete pe durata timpului, pe
msur ce apar modificrile chimice respective.
Aproape toi inhibitorii ireversibili sunt substane toxice, fiind numite i otrvuri
enzimatice. Amintim n acest sens acidul iodacetic, DIPFP, metalele grele, compuii
arsenici, etc. Acetia interacioneaz cu radicalii aminoacizilor din centrul activ al enzimei,
eseniali pentru structura i funcia acestuia.
Exemple: Diizopropilfluorfosfatul (toxina neuroparalitic) se fixeaz de grupa OH
aserincinCAalacetilcolinesterazei cu fonnarea enzimei neactive:
H 3 CC H - C I I 3
I
O O
E CH 2 O P = 0 + HF
:
O o
H 3c CHCH 3 H3c CHCH 3
COOH COOH
Ca surse nedietare de cianide poate fi nitroprusidul de sodiu (agent hipotcnsiv),
succinonitrilul (agent antidepresant), acrilonitrilul, ct i fumul de igar. Expoziia
cronic se manifest prin demielinizare, leziuni ale nervului optic, ataxia i depresia funciei
glandei tirade. Intoxicaia acut cu cianidc necesit un tratament rapid. Baza biochimic
a tratamentului efectiv const n crearea unui complex nontoxic al fiero-porfirinei.
Administrnd nitriii (NaNO, - intravenos, amilnitrita - inhalaie) convertim poriunea de
hemoglobin normal n methemoglobin (Fe3+). Ultima e capabil s fixez complexul
CN-citocromoxidazic elibernd citocromoxidaza i genernd cianmethemoglobina.
Methemoglobin este rentoars n proces graie activitii rodanazei (tiosulfat-cianid
sulftransferaza) eritrocitare, care va transforma tiosulfatul n tiocianat.
t ^ C i t . a a 3(Fe3+)]
Cianmethemoglobina
Tlios
iosulfat (S 2 0 3 )
Rodana
Rodanaza
Sulfit (S 0 3 )
Km 1 1
n cazul inhibiiei competitive: 0 + - ) + V,
V Vnmax [S ]
Analiznd aceast ecuaie se constat c dac concentraia S crete foarte mult, 1/[S]
tinde spre zero, iar ecuaia devine: 1 _ 1
V Vmax
n inhibiia competitiv, unde are loc interaciunea de tipul E + 1 =?== EI, KM
crete, Vmax rmne nemodificat, panta curbei L - variaz la intersepta constant
(fg. 1.35 a i b).
Prin urmare, n cazul inhibiiei
competitive viteza de reacie poate
atinge Vmax, ca i cum inhibitorul nu
ar fi prezent, dac se m rete
suficient de m ult concentraia
substratului.
Inhibitorii competitivi ns mresc
considerabil panta curbei KM, scznd
afinitatea enzimei pentru substrat.
Se ob serv c a d u g a re a
inhibitorului nu modific Vmax, deci
Figu 1.35a. Curba Michaelis-Menten n absena i atmgndu-Se viteza maxim. l l acelai
prezena inhibitorilor competitivi. timp crete mult , scznd afinitatea
a) Jaru inhibitor; b) cu cantitai nuci ile inhibitor; c) . . M
cu cantiti mari de inhibitor enzimei pentTU substrat.
Exemplu:
SDH
H O O C -C H 2 - C H 2- C O O I I - IIOO - -C O O H
Acid succinic fad F A D lb Acid lumaric
T/tS]
1/Km
F igura 1.35b. Inhibiia competitiv a) - cu inhibitor
b) - far inhibitor
O structur similar o au acizii malonic, oxalic, malic, care pot servi drept inhibitori
competitivi ai SDH.
HOOC CH2-C O O H H O O C -C O O H hooc- ch - c h 2- c o o h
I
Acid malonic Acid oxalic OH
Acid malic
Inhibitorul nu se scindeaz fennentativ. O particularitate esenial const n faptul c
efectul se nltur la cretcrea concentraiei de substrat (succinat). Acest principiu st
la baza tratamentului intoxicaiilor cu etilenglicol(CH2OU)2, component al antigelului.
Produsul oxidrii, (COOH)2, este toxic i apare ca rezultat al aciunii alcool
dehidrogenazei (ADH). Cristalele de oxalai uor se precipit, dereglnd funciilc rinichilor.
Administrarea etanolului n doze aproape toxice inhib reacia de oxidare i
etilenglicolul se elimin din organism far consecine grave.
=
[
Q
Cei mai vdii inhibitori de acest tip n celulele vii sunt produsele intermediare ale
metabolismului, care se fixeaz reversibil cu locusurile specifice pe suprafaa unor
enzime reglatoare, modifcnd activitatea lor.
Iat cteva exemple:
1. Cel mai comun tip dc inhibiie necompetitiv este produs de agenii chimici care se
pot combina cu unele grupri funcionale ale enzimei; acestea, chiar dac nu fac parte din
centrul activ al enzimei, sunt eseniale pentru meninerea structurii tridimensionale i, prin
urmare, pentru activitatea catalitic a acesteia.
Spre exemplu, ionii metalelor grele (I Ig2+, Ag+, Pb2+), unele substane organice ca
acidul iodacetic, PCMB, DTNB etc. sunt inhibitori necompetitivi pentru numeroase
enzime.
2. Unele enzime metaloactive sunt inhibate necompetitiv de ageni capabili s lege
aceste metale, precum este EDTA care complexeaz ionii Mg2+, Ca2+, Mn2+.
3. Inhibitori necompetitivi sunt i CN' i pentru citocromi, substane care intervin
n ultimul segment al lanului respirator mitocondrial.
Inhibiia uncompetitiv (incompetitiv) prezint urmtoarele caracteristici:
1. Inhibitorul nu sc combin cu enzima liber i nu afecteaz relaia ei cu substratul.
2. Inhibitorul se combin cu complexul ES, formnd un complex ESI ce nu poate
genera produsul dorit.
3. Se ntlnete rar n reaciile cu un substrat, dar este frecvent n reaciile cu dou sau
mai multe substraturi.
Dcci, la o inhibiie incompetitiv panta este constant, intersepta variaz, KMi Vmax
se micoreaz (fig. 1.37a i b).
Reprezentarea grafic a ecuaiei Lineweaver-Burk n diferite cazuri de inhibiie este
redat n fig. 1.38.
E+ S
,'
ESI
0
Originea LD, ld 4 LD, LD, LD,
M4 M 3H M 2H2 MH3 H*
1. Oxidoreductazele
Enzimele date catalizeaz reaciile de oxidoreducere, transferul electronilor cu
participarea a dou substraturi: Sr + S o '= ^ = S 0 + Sr'. Sunt catalizate reaciile cu
participarea grupelor: CFI-OH (1), C-OH, C = 0 (2), CH-CH (3), CH-NH,(4) i CFI-
NH- (5).
Unele exemple de subclase:
1.1. Enzimele ce acioneaz asupra grupei CH-OFI ca donatoare.
1.1.1.1. Alcool: NA D f - oxidoreductaza (alcool dehidrogenaza)
Alcool + NAD+ Aldehid sau Ceton + NADH + FP
1.2. Enzimele ce acioneaz asupra gmpelor C-OH sau C = 0 ca donatoare.
1.2.1.12. D-gliceraldehid-3-fosfat: NAD+- oxidoreductaza (gliceraldehid-
fosfat dehidrogenaza)
D-GA-3-P +P. + NAD+ ===== D -1,3-difosfoglicerat +N A D H + H +
1.3. Enzimele ce acioneaz asupra grupei CH-CH ca donatoare.
1.3.1.3.4,5-dihidrocortizon: NADP+- oxidoreductaza (cortizon rcductaza).
4,5-dihidrocortizon + NADP+ Cortizon + NADPH + H+
1.4. Enzimele ce acioneaz asupra grupei CH-NH 2 ca donatoare.
1.4.1.3. L-glutamat: NAD(P)+- oxidoreductaza (dezaminaza). Denumirea
trivial - glutamat dehidrogenaza. Forma NAD(P)+confirm c acccptori
de electroni pot fi att N A D \ ct i NADP+.
L-glutamat + H ,0 + NAD(P) a-Cctoglutarat + N H f++
+ NAD(P)H + iP
1.5. Enzimele ce acioneaz asupra grupei C-NH ca donatoare.
1.5.1.3.5,6,7,8-tetrahidrofolat: NAD(P)+- oxidoreductaza (tetrahidrofolat
dehidrogenaza).
5,6,7,8-THF + NAD(P)+ 7,8-DHF + NAD(P)H + H+
1.6 . Enzimele ce acioneaz asupra grupelor NADH sau NADPH ca donatoare.
1.6.4.2. NAD(P)H: glutation-oxidoreductaza (glutation reductaza).
NAD(P)II + H+ + GSSG NAD(P)+ +2G SH
1.8 . Enzimele ce acioneaz asupra grupelor ce conin sulf ca donator.
1.8.4.1. Glutation: homocistin-oxidoreductaza (glutation-homocistin
transhidrogenaza).
2GSH + Homocistin = ^= GSSG + 2Homocistein.
1.11. Enzimele ce acioneaz asupra H ,0 , ca acceptor.
1.11.1.6 . H 2 0 2: H ,0 , - oxidoreductaza (catalaza).
+ H 20 2 O, + 2 H ,0
1.11.1.7. Donator: H 2 0 2 - oxidoreductaza (peroxidaza).
Donator + H 2,0 ,2 D o + 2H2,0
1.99. Alte enzime ce utilizeaz O, ca oxidant - lipooxigenaza, homogentizat oxigenaza
etc.
HUC
Tiamin pirofosft (vit.Bi)
R. Ri
CH 3
N- -CH 3 I H3c n ' CII 3
+
c=o h o o c -R o
-r2
COOH
OII
R R,
CH,
H3C N- -CH 3 N- -CH,
c=o
-. H -C - r 2 R, +
H H
HCOH
I
HCOH
I
C lh O P 0 2 O PO 2 Riboza Adenina
Riboflavma (B2 )
FMN
~F A D
Vitamina PP niacina, niacinamida, B ,. Se include n structura a dou coenzime
nicotinamidice, care particip la reaciile de oxidoreducere NAD" i NADP'. Ambele
contribuie la dehidrogenarea substraturilortransferul unui hidrid-ionH'(H+i 2e ),
alt proton se permut n soluie (H+). Legtura cu componenii proteici este slab (enzimele
NAD+dependente particip la procesele catabolice, cele NADP+dependente anabolice).
-COOH -CONH 2
4 ,
N N'
Acid nicotinic Nicotinamida (NA)
Structura NAD + i i\ADP~
H
CONl-b -c o n h 2
0 -----CH 2 O N -----Gbb N
0 = 0 = . - _
nh2 nh2
N- N. N
= - ' < 0= - ' <
N- N^ N-
-----? 2/0.
.
II
NADH NADPH
Structura DH i NADPH
Vitamina Bhpiridoxina. Drept coenzim servesc formele activepiridoxalfosfat
i piridoxaminfosfat.
: h 2o h :o h : h 2 n h 2
2-
HO- -CH 2 OH HO- -CH 2 OPO 3 H O ' -CH 2 OPO 3
H3 O h 3c- N. 3 -
N N' N
Piridoxina Piridoxalfosfat Piridoxaminofosfat
O OH CH 3
Acid pantotenic
0 H CH,
II I I
C - C H 2- CH2 N - C - ^ H - C - C H 2O
NH O OH CH
1
CH 2
CH 2
SH
Coenzim A
Vitamina H biotina servete drept coenzim a carboxilazelor ce leag ,
i-l transfer la substraturi. , se activeaz, unindu-se cu biotina i utiliznd ATP.
C O -E C O -E
I , I
(CH2)4 (CH 2 ) 4
\
c=o
V V -W
I ,o
c< -
Biotina Carboxibiotina O
OH COOH
- N H CH Acid
I glutamic
(CH 2 ) 2
COOH
Pteridina Acid p-aminobenzoic
Vitaminele liposolubile:
Vitamina servete drept cofactor al sistemului cnzimatic (carboxilaza), ce exercit
carboxilarea acidului glutamic n gama-carboxiglutamic cu asocieri de oxigen. Acest
acid se conine n protrombin ( 1 0 resturi de acid) ce poate chelata calciul.
Se presupune c ea particip
activ la fosforilarea oxidativ,
fiindc sub aciunea antivitamine- C IL
lor acest proces se decupleaz. I
Vitamina e necesar pentru (CH 2 C H = c CH 2 )n H
coagul are (vezi capitolul
respectiv). Vitamina Kt
Vitamina A retinoluleste un derivat poliizoprenoidic, care conine nucleul
ciclohexenului i mai multe uniti izoprenice.
Retinolul (retinalul) este un component al rodopsinei din bastonaele retinei (opsina
i 1 1 -cis-retinal).
CH
I 3
3 CH
!
3
C H = C H - C = C H C H = C H C = C H CH2OH
CH 3
Retinol (vitamina A)
CH 3
I
CH 2 (CH2 CH2- C H - CH2)3- H
Vitamina E
STRUCTURA CH IM IC
Acizii nucleici sunt compui macromoleculari, degradnd hidrolitic n nuclcotide i
nucleozidc, dealtfel ei suntpolinucleotide, compui dintr-un numr foarte mare de
mononucleotide. La hidroliza complet degradeaz i mononucleotidele, genernd
baze azotate (purinice i pirimidinice), pentoze i acid fosforic n cantiti echimolare.
Bazele azotate pirimidinice sunt derivai ai pirimidinei, se ntlnesc n acizii nucleici.
De notat trei baze majore: uracilul, citozinai timina.
NH,
H
.C
ti I
. C .'sx CH, C.
n 3:
4
, HN' CH HN CH
I !!
11 CH CH
^ 6 /'/' 'S, M
N N N o N
H II
Uracilul Timina Utozina
Pirimidina 2,4-dioxipiri- 5-metil-2,4-dioxi- 2-oxi-4-amino-
midina pirimidina pirimidina
0
Riboza
H N ^ S lf
i !
( " N /
H
NH, O
H II
.N ,N ^ ^N
Ni -,C A\ N" C' HN C ^ \\
I II CH I I! CH CH
HC* , / HC c. C.
N N 'N 'N H,N
H H
A denina G uanina
Purina (6-am ino-purina) (2-am ino-6-oxipurina)
HN N
>
- N 'N ' NH
'N H
Riboza I
6-metil-adenina 2-metil-guanina Inozina 7-metil-guanina
Proprietile
Bazele azotate prezint fenom enul de tautomerie (structuri ce difer prin poziia
unui atom de hidrogen i a unei duble legturi): formele lactim sau lactam, ultimele mai
stabile, predomin n structur.
O OH OH
HN | j _______ a N ^K , N ^ j
Bazele azotate sunt slab solubile n ap; cele pirimidinice au o structur plan, cele
puriniceaproape plan, puin pliat. Bazele pirimidinice sunt mai stabile dect cele
purinicc. Bazele azotate posed maxim capacitate de absorbie de ultraviolet (ntre
260-280 nm), ceea ce permite determinarea cantitii dc acizi nuclcici (cu att mai
mult ai componentelor- baze, nucleozide). Pentru identificare se utilizeaz i cromatografia
etc.
La o hidroliz menajat nucleotidele degradeaz n nucleozide i acid fosforic.
Nucleozidul constituie N-nucleozide ale bazelor purinice sau pirimidinice, n care glucidul,
pentoza (riboza sau dezoxiriboza) cu atomul su de C, formeaz legtura glicozidic cu
Nj (pirimidina) sau N 9 (purina). Legtura glucozidic n nucleozidele naturale este .
Pentozele sunt prezente n forma furanozic, fonnnd legtura cu hidroxilul semiacetalic.
Distingem ribonucleozide i dezoxiribonucleozide. Nucleozidele sunt mai solubile n
ap dect bazele azotate, mai stabile n soluii alcaline i uor sc hidrolizeaz la nclzire n
mediul acid, producnd baze libere i pentoze. n organism nucleozidele sunt hidrolizate
de nucleozidaze specifice. Denumirea nucleozidelor deriv de la bazele azotate prin
adugarea sufixelor: -uzina, pentru derivaii purinici i -idina, pentru cei pirimidinici.
Adenina i riboza rezult n adenozin, respectiv: guanozina) aceiai analogi cu
dezoxiriboza; uridina, citidina, timina, cu dezoxiriboza, se numete timidin, iar
compusul timinei din tRNA poart denumirea de riboziltimin.
Din punct de vedere steric, nucleozidele pot avea dou conformaii: sin i anti. Forma
anti este caracteristic compuilor naturali, fiind cerut de aezarea corect a bazelor
complementare n structura dublu helicoidal a DNA. n forma Z conformaia sin
alterneaz cu anti.
Esterii fosforici ai nucleozidelor egaleaza cu nucleotidele la legturile C 5 i C 3 ale
pentozei. n dezoxiribonucleotide se manifest numai aceste dou poziii, iar
ribonucleotidele se completeaz i cu poziia Cr Modificnd condiiile de hidroliz, se
pot obine toate tipurile. Celulele n stare liber coopteaz, preponderent n poziia 5',
grupa fosfat. Structural, pentoza sau dezoxipentoza ocup o poziie dc legtur ntre
fosfat i baze azotate.
Purinice Pirimidinice
BAZELE
A denina (A) G uanina (G) Citozina (C) U racilul (U) Tim ina (T)
A denozin G uanozina Citidina U ridina
N uclcozidul n: dA dcnozina dG uanozina dCitidina Tim idina
A denilat G uanilat Citidilat U iidilat
N uclcotidui n: dCitidilat
D NA dA denilat dG uanilat Timidilat
Ambele mononucleotide reprezint acizi deosebit de activi i se afl sub fonn de 5'-
mono, di- sau trifosfai. Grupa fosfat 2 i 3 uor poate fi hidrolizat de enzime specifice,
far scindarea altor legturi.
Rolul nucleotidelor
1. Element structural al acizilor nucleici.
2. ATPpurttorul energiei chimice n celul, servete la transferul grupelor fosfat
macroergice i prezint cheia de legtur ntre procesele ce decurg cu eliminarea,
degajarea energiei i ntre cele ce utilizeaz energia. ADP i AMP se fonneaz n
rezultatul defosforilrii ATP, fosforilnd pn la ATP n procesul respiraiei tisulare. Ciclul
ADP-ATP n celul constituie sistemul principal de transfer al grupei fosforice.
3. Acizii nucleici iau parte la transfenil unor blocuri de constmcie (acidul acetic,
glucoza, cholina), transfonnndu-le n substane biologice active uridinddifosfatglucoz,
citinddifosfatcholina etc.
4. Servesc ca precursori macroergici ai unitilor mononucleotidice la sinteza
fermentativ a DNA i RNA, cednd grupa pirofosfat, se transform n resturi de
nucleozidmonofosfatbaza structural a lanului polinucleotidic.
5. Unele mononucleotide primordiale conin i ali compui - nicotinamida n nicotin-
amidmononucleotid, precursorul NAD, vit. B, n flavinmononucleotid i FAD.
6 . n organisme sunt prezente 2 feluri de esteri fosforici ai nucleotidelor (AMP, ADP,
ATP), n alte cazuri fosfatul leag 2 atomi de O, ai pentozei n cadrul aceluiai nucleotid,
fonnndu-se nucleotide ciclice - 2',3' i 3',5'.
OH OH 0:-P - 0
AMP AMPc 2,3' AMPc 3',5
3'
a 4 OII
Lanul are o direcie i o polaritate specificcapetele 5'-OH i '-OH care nu
sunt angajate ntr-o legtur internucleotidic. S-a convenit c structura unei
catene polinucleotidice va fi indicaia strict dc la captul 5' spre stnga, iar cel 3' spre
dreapta. Direcia 5' 3'.
Pna la mijlocul secolului trecut enigma DNA nu era descoperit, pe cnd istoria
DNA ncepe cu F. Mischer. n 1944,0.Colin, C.McLeod i M.McCarty au demon
strat c acizii nucleici de tipul dezoxi sunt factorul detenninantn transfonnnle extractului
de pneumococi III forme le neviru lente se transformau n virulente, la adugarea
DNA extrase din formele virulente ale pneumococilor. Proprietile virulente se transmit
prin ereditate.
Cu ajutorul izotopilor radioactivi, Alfred Hershey i Martha Chase au demonstrat
c informaia genetic pentru replicarea virusului T, n celulele Escherichia coli e
transmis nu dc componenta proteic, dar dc DNA. S-a constatat c anume DNA este
componenta cromozomilor, purttoarea informaiei genetice n cclulcle vii.
Un merit major la descoperirea tainelor structurii DNA i aparine lui Erwin Chargaff,
care, la sfritul anilor 40 al secolului trecut, a ajuns la urmtoarele concluzii:
1. Preparatele de DNA obinute din esuturile aceleiai specii de organisme au
componena nucleotidic identic.
2. Componena nucleotidic a DNA e diferit la diferite specii.
3. Componena nuclcotidic a DNA la aceeai spccic nu se modific cu vrsta, nu
depinde de alimentare i de influena mediului ambiant.
4. Numrul resturilor de adenin n orice DNA, indiferent dc spccic, este egal cu cel
al timinei A = T; G = C. Din acest raport rezult c A + G = T + C.
Aceste relaii au facilitat nelegerea codificrii informaiei gcneticcn DNA i transmiterii
de la o generaie la alta. Secvena mononucleotidelor n lanulpolinucleotidic al
DNA reprezint structura sa primar, structura covalent. Aceast structur e
stabilizat de legturile fosfodiesterice.
S tru ctu ra secundar. n 1953, J.Watson i F.Crick au depistat structura
tridimensional a DNA i au propus mecanismul posibil al replicaiciun fenomen
excepional n istoria biologiei, ce a deschis calea conceptului funcionrii genei la
nivel molecular. Ei au analizat tabloul difraciei razelor X, efectuate pe cristale de DNA
de ctre R.Franklin i M.Wilkins, au propus modelul structural, care n linii generale e
justificat i const n urmtoarele caracteristici:
1. Dou lanuri polidezoxiribonucleotidice se rsucesc helicoidal n jurul unei axe
comune. Lanurile au sens opus, sunt antiparalele, formnd o dubl elice cu orientare
spre dreapta (fig.2 . 1 ).
2. Bazele azotate, hidrofobe sunt orientate spre interior i perpendicular pe axa
elicei, inelele glucidice, legate prin resturi fosfat, constituie schcletul extern al dublului
helix i sunt orientate aproape sub un unghi drept fa dc baze. Toate gruprile fosfat
la pH = 7 sunt ionizate i ncrcate negativ (fig. 2.2).
3. Cilindrul ce ncadreaz dublul helix are un diametru de 20, distana ntre bazele
azotate nvecinate e de 3,4 A, iar poziia uneia fa de alta este de 36 grade. Structura se
repet dup 10 nucleotide, avnd o perioad de identitate (pasul) de 34 (3,4nm) (fig.
2.3.).
Figura 2.1. Spirala ile DNA, F ig u r a 2 .2 . M o d elu l spiralei F ig u r a 2 .3 . M odelul schem atic
al
potrivit axei spiralei duble de DNA bazele ocup dublului helix de DMA. Structura se
interiorul, iar scheletul glucido- repet dup 36 , ce corespunde la III
fo s fo r ic - exteriorul cilindrului n ,v ,r/ nflecare caten
4. Stabilitatea dublului helix e asigurat de
interaciunile hidrofobe ntre bazele azotate, precum
i dc legturile de hidrogen ce se stabilesc ntre
bazele azotate de pc o caten i cele complemen
tare de pe cealalt. Dublul helix este de tip plecto-
nemical(adic transversal n acelai plan), i nu
paranemical (adic longitudinal). Legturile de
hidrogen determin primordial mperecherea spe
cific a bazelor.
5. n seciune, dublul helix are trei straturi:
a) unul intem, cu bazele nucleice;
b) unul mij lociuglucidiccu planurile dispu
se radiar;
c) altul periferic resturi de acid fosforic;
d) cele dou catcne delimiteaz pe suprafaa
moleculei 2 caneluri:mareimic(fig. 2.4.).
6 . Nu exist limitri n succesiunea bazelor azo
tate din lanul polinucleotidic; o anumit secven- Figura 2 4 ModeM spaial al dMului
determin O informaie genetic concret. helix de DNA. Se vd cele 2 caneluri -
O proprietate primordial a dublului helix "Iare ^ l m,c ^
e mpachetarea specific a bazelor azotate.
Rcieind din limitrile sterice i din capacitatea de a fonna legtura de hidrogen, se
postuleaz c adenina se mperecheaz numai cu timina, guanina cu citozina. Acest
spaiu poate fi ocupat numai de perechea purin-pirimidinic: pentru 2 purine e mic,
pentru 2 pirimidine e mare i nu pot forma legturi de hidrogen. mpachetarea depin
de i de regulile de formare a legturii de hidrogen. Hidrogenul ocup o anumit
poziie n baze. Adenina nu sc poate mperechea cu citozina, la fel cum guanina nu se
poate mperechea cu timina, fiindc n locul unei legturi s-ar gsi doi atomi de hidro
gen, iar n alt locnici unul.
Adenina fonneaz cu timina dou legturi de hidrogen, pe cnd guanina cu citozina
trei. Orientarea acestor legturi i deprtarea dintre ele e optim pentru o interaciune
puternic ntre baze.
E de menionat c cele dou catene antiparalele ale dublului helix de DNA nu
sunt identice nici dup succesiunea bazelor, nici dup componena lor. Ele sunt
numai complementare una fa de alta. Una conine adenina, cealalt neaprat
timina; guaninei i corespunde citozina.
Investigaiile efectuate la dou Universiti din Cambridge au confirmat c s-a sintetizat,
cristalizat i descifrat structura a dou fragmente de DNA deosebite. n mijlocul lor
se afl o secven, n care catena conine multe A, iar cea complementarT. E curios
faptul c aceast DNA are proprieti uimitoare e rezistent la aciunea factorilor
externi. Care-i cauza? Aceeai a-elice de dreapta, n care A i T n fiecare pereche
sunt dispuse una fa de alta aidoma clicelor la elicopter, adic nu sunt n acelai plan.
Efcctul este neordinar: 1) e mai ngust cnelui spiralei; 2) NH, a A ocup o poziie de
mijloc ntre O, a dou T nvecinate, formnd legturi de hidrogen n plus cu T din lan
o legtura vertical ce joncioncaz longitudinal stivele dc baze azotate. Rezult o
rezisten mai mare la factorii nocivi ai mediului. Astfel, legturile sunt proprii i proteinelor,
dar n DNA s-au stabilit pentru prima dat.
n dependen de cantitatea de ap i fora ionic a mediului, configuraia dublului
helix al DNA se poate modifica. Este elocvent prezena ctorva fonne de DNA.
Forma B spirala clasic a lui Watson i Crickconine lOresiri, ca perioad de
identitate e de dreapta i planul bazelor e perpendicular pe axa spiralei. Forma A -
pasul e compus din 1 1 resturi i planul deviaz aproximativ cu 2 0 grade fa dc
perpendicular de pe axa spiralei. Se fonneaz la dehidratarea fonnei beta. Dac A
ndeplinete rolul de matrice n transcripie, apoi rolul dc matrice la replicarea DNA
(ambele sunt n confomaia anti). Forma Z rsucit spre stnga, conine 12 resturi la
pas (fig. 2.5).
Dublul helix are o rezisten deosebit, concordat cu rolul de purttor al
informaiei genetice. Nu este o structur rigid, fixat pe toat lungimea ei. Ea este
supus permanent unor defonnaii interne, ce oscileaz dc la o parte a moleculei la alta,
adic posed un anumit dinamism. Acestor devieri le e caracteristic dependena de
anftirajul extern al moleculei de DNA.
Structura teriar. n procesul de izolare a DNA s-a stabilit c n unele segmente
dublul helix poate fi mpachetat ntr-o structur tridimensional superhelix sau
form deschis - inelar, ce presupune integritatea catenei, dar nu fonn geometric.
28
F igu ra 2.5. Compararea form elor , i Z de
I DNA. Structurile se deosebesc dup pasul
spiralei i orientarea perechilor de haze fat
de ax (20" ,6" ,7), diametru! (26A., 20A ,
18A l distanta dintre bazele azotate nvecinate
(2,6A ; 3,4A ; 3,7A )
z
ADP*.
DNA-giraza
ATP3 a)
A
b)
DNA-giraza
d u b lu lu i h elix -
denaturarea lui.
iHistone Degradarea unei
D NA
core jumti de structur
spiralic are loc la
Nucleozom te m p e ratu ra de
topire. Dublul helix
F igura 2.8. Nucleozomul cu
e o structur cu un
DNA linker i histonele H t
grad mare de coo-
perativitate. Temperatura de topire depinde de compo
nena nucleotidic. Moleculele bogate n i G au o
temperatur mai nalt dect cele nnobilate cu A i T. Dac
temperatura e mai joas dect cea de topire, lanurile de
DNA reasociaz cu fonnarea dublului helix, produendu-
se regenerarea renaturarea (fig 2.1b).
Aproape tot DNA n celula eucariotelor se afl n
cromatina nucleului, care formeaz cromozomi naintea
mitozei. Cromatina conine DNA (35%), RNA (5%),
proteine specifice (60%). DNA n cromatin este legat de Fibra de
proteine-histone, care mpacheteaz compact DNA i crom atin
(diam etrul - 30
formeaz uniti structuralenucleozomi. Ele sunt sta
bilizate de fore electrostatice. Nucleozomii au o struc
tur asementoare fonnei discului.
DNA ncolcete histonele. ntre nucleozomi se situ
eaz DNA de legtur (linker) (fig. 2.8.). Nucleozomii (diam etrul ~ 10
ocup o anumit poziie n spaiu. Modelul mpachetrii
DNA n nucleozomi, cromatin, cromatide cromozomi
mitotici este redat n fig. 2.8.a.
mpachetarea DNA cu proteinele n spaiu reprezint
structura sa cuaternar. Un rol deosebit l au hertonele
proteine nehistonice. Diametrul unei superspirale de
DNA e egal n medie cu 90 ntr-o spir sunt localiza
te 80 de perechi de baze pasul ei.
Cristalografia cu raze Roentgen a constatat c buclele DNA
pe carc se ncolcete DNA reprezint octameri, fiecare
fiind constituit din 8 molecule proteice a cte 2H4,2 H 3,
H, A i H,B (fig 2.8.b). Octamerul este nfurat de DNA Figura 2.8a. Modelul
npachetrii DNA n
(dublul helix) cu lungimea de 146 nucleotide cromozomi
nucleozomul, ce recent s-a confirmat, cu ajutorul
F igura 2.9. PoHnucleozomii constituind
un solenoid cu diametru! de 30
2 4
( )
F igura 2.8b. Reprezentarea spaial a proteinelor in itucleozom
NH
HOH2C o N
V?
OH
Dihidrouridina
Inozina
Moleculele de tRNA reprezint o conformaie aidoma foii de trifoi, unde mai mult
de 1/2 din baze sunt complementare. Toate moleculele de tRNA posed particulariti
structurale comune, fiindc toate interacioneaz n acelai mod cu mRNA i ribozomii
cu enzimele ce catalizeaz activarea aminoacizilor i fonnarea legturilor peptidice (fig.
2.10.).
Caracteristica tRNA:
1. Sunt monocatenare cu un numr mic
de ribonucleotide.
2. Conin baze minore (metilate)
metilarea mpiedic mpachetarea unor baze
capabile de alte interaciuni, modific
capacitatea hidrofob a unor segmente de
RNA.
3. Posed 4 zone de perechi comple
mentare i 3 necomplementare, expulzate n
form de bucle:
a) captul 5' tenninal are rest guanilic
fosforilat;
b) captul 3' term inal - secvena
nucleotid CCA. Aminoacidul activat se
leag de '-OH al adenozinei;
c) la captul buclei inferioare se afl
poriunea anticodon compus din 7 baze -
Pir - Pir - X - Y - Z, purin modificat, baz
variabil. Tripletul (XYZ) e complementar F igura 2.10. Structura tRNA atu cu secvena
nucleotidic
secvcnei nucleotidicc din mRNA;
Bucla TtyC Bucla am inoacidic
------------------ _ 1(----- ----------
3'
Captul 3'
Bucla 5'
dihidroU
1 0 -2 5
B ucla
anticodon
A nticodon
60S
50 S A 2 .5 0 0 .0 0 0 D a X 30S 40S
4 .2 0 0 .0 0 0 Da
1.600.000 Da 9 0 0 .0 0 0 Da 2 .8 0 0 .0 0 0 Da
1.400.000 Da
/ \ / \ \
*''**'**
160 120
120 nuclcotidc
n u cicu u u c --- nuclcotidc
2900 1540 1900 5,8S RN A r f 5S RNAr
nuclcotidc nuclcotidc n u c lc o tid c , r , , nuclcotidc nuclcotidc,
5S RNAr 23S RNAr 16S RN A r 18S RNAr 28S RNAr
34 proteine 21 proteine 45 proteine 33 proteine
Ml 4*- I\ I
transferat cu o exactitate maxim cclulei-fiice de III Ml
DNA. Replicarea se bazeaz pe mpachetarea com 1 1> * *
. f mi*"
plementar a bazelor nucleice. Activitatea matricea IM *- AMI .
l a DNA se manifest prin faptul c secvena Ml s' 1 V-**!
mi
nucleotidic se reproduce prin aceast mpachetare \ |, I% I -?
Ml "
111
** M i t
complementar a bazelor (fig. 2.13).
Replicarea const n desfacerea dublului helix / * IM
l \I / J"* * 1 V'Wk
parental i construirea catenelor pe fiecare dintre cele fj m * . m i *- 111 w v
*. M l v r ' \ y m mi yr
2 catene complementare replica cclor dinti. Re 'I * \ / - 4-
zult 2 molecule de DNA identice cu parentala. DNA M olcculc DNA
parental fiicc p a re n ta l
Fiecare dintre ele conserveaz o caten parental
veche. Aadar, proccsul replicrii e semiconserva- F igura 2.13. Replicarea DNA
dup J. Watson i F.Crick
tiv.
Precizrile lui J. Watson i F.Crick au fost confirmate de M.Meselson i F.Stahl,
care au cultivat Escherichia coli n diferite medii cu izotopi marcai. n 1956 a fost
descris prima enzim ce catalizeaz polimerizarea fennentativ DNA -polimeraza.
Procesul de biosintez este deosebit de complex i necesit urmtoarele:
1. Prezena matricei DNA (templat).
2. Prezena celor 4 dRN trifosfai dATP, dGTP, dCTP si TTP.
3. Prezena ribonucleozid trifosfailorATP, GTP, CTP, UTP
4. Prezena ionilor de magneziu.
5. Sistem multienzimatic n baza constituenilor:
a) helicaza enzim ce realizeaz desfacerea dublului helix parental n dou
catene complementare. Desfacerea decurge treptat, n poriuni mici de DNA, pe
msur ce replicarea avanseaz. Cele dou catene vor rmne separate ca urmare a
interveniei proteinelor de stabilizare (SSB) a DNA monocatenare. La desfacerea unei
perechi de baze se utilizeaz minimum 2 molecule de ATP. Un rol important la desfacere
i revine unei enzime topoizomerazei;
b) RNAprimaza sintetizeaz mici fragmente de RNA - primer;
c) DNA polimeraza preia indicaiile dc la matricea care decide-secvena mononu-
cleotidelor n catena nou-sintetizat (o sintetizeaz n direcia 5' 3'). Enzima are
i o aciune exonuclcazic, exciznd nucleotidele de la ambele capetc alccatcnci.
Sunt atestate trei enzime de DNA-polimcraza (I, II, III). Enzima exercit i funcia
de control a replicrii, asigurnd procesului o eficien sporit. Cele expuse sunt confirmate
prin:
1. Sinteza ce evolueaz n prezena celor 4 dezoxiribonucleotidtrifosfai i a DNA
matriceal.
2. Componena nucleotidic a DNA sintetizat, dependent de caracterul matricei, dar
nu de numrul relativ al nucleotidelor.
3. Cea mai convingtoare prob - DNA fagului FX174 replicat in vitro de DNA
polimeraz e complet contagioas erorile la sintez sunt extrem de rare.
d) DNA - ligazaenzima ce catalizeaz formarea legturilor fosfodiesterice ntre 3'-
OH ale unui fragment i 5'- monofosfat ale celuilalt. Reacia necesit ATP sau NAD'
(la procariote). Capetele trebuie s aparin moleculelor bicatenare de DNA, n
cadrul reconstituirii sau splicing-ului catenei de DNA la recombinarea genetic.
Procesul decurge n felul urmtor:
1.E + ATP E-AMP + PP I
(aminogrupa lizinei din enzim se leag cu fosfatul din AMP)
2.E -A M P + P-5'-DNA E + AMP-(P)-5'-DNA.
3. DNA-3'-OH + AMP-(P)-5'-DNA DNA-3'-(P)-5'-DNA + AMP
4. PP I + HOH *- 2P.1
Fora motrice a procesului de sudare a catenei e hidroliza pirofosfatului.
Recent s-a stabilit c sinteza DNA se cupleaz cu desfurarea DNA parental. Lo
calizarea acestui proces e denumitfurc de replicaie. Ea ncepe ntr-un loc anumit cu
extinderea la aceeai vitez n ambele direcii (fig. 2.14).
Topoizomeraza < j
Dna - Helicaza
Proteine de stabilizare
Prim ozom a DnaB
DnaC complex
Primaza
Prim er
rN M P
dNMP
5
Lanul lider
r Lanul succesor
F igura 2.14. Imaginea schematic a proceselor fermentative n regiunea bifurcaiei
DNA templat Enzima helicaza (Dna B), ce desfoar DNA,
conduce la formarea superspirelor (torsiuni
pozitive) ntr-o molecul inelar. In regiunea furcii
DNA parental se rsucete cu o vitez de 100
rotaii pc secund. Continuarea procesului de
S egm ente
replicare implic lichidarea acestor structuri
repetabile -9pb formate de rotaie. Topoizomeraza (DNA
T andem ul A =T (13)
giraza) efectucaz rupturi monocatenare, apoi
sudeaz legtura fosfodiesteric i favorizeaz re
DnaA laxarea structurii teriare a DNA.
Iniierea specific a unui ciclu nou de
replicaie este determinat de complexul de
proteine specifice (Dna A), aductor al complexului
dc protein Dna - Dna la poriunea anumit a
genei, adic punctul (origine) de replicaie(OR).
Timpul de iniiere a replicaiei este o valoare critic
coordonat cu mitoza celulei. Proteinele Dna se
deplaseaz pe DNA, utiliznd energia hidrolitic a
ATP. Enzima servete drept semnal pentru
activarea primazei. n fig. 2.14a este redat iniierea
replicaiei la E.coli.
S-a stabilit c DNA polimeraza nu e capabil
s iniieze sinteza catenei. Ea are nevoie de un
fragment cu grup liber '-OH. Acest fragment
este sintetizat de primaz (Dna G - proteina) -
Replicarea un fragment complementar cuplat la DNA
T andem ul A = T (13) Site-urile dc fixare a Dna A proteine dc segm ente repetabile -9pb
------- ----- \ !-----------------------------------------------r------------- T--------------1
w
&
djGATCTNTTNTTTT TTATCCACA
O'
I
O -P-O '
I
o
0 P-0- 0~
O P-0
o - P -o 0
5 0 3' ; o 5 L o- P-0
5# 6
P r im e r - ' .' I OH 1 OH
te o* I i fc
A $ i t
'a'
@ fi 0 iA- G
D N A tem plat i i m j
si Elongarea catenei de DNA
3 'm "m
D ezoxiriboza
o
domenul. Fiecare molecul de
TRF1 am
H,N T~1 TRF 1nfoar DNA sub un unghi
TRF2 coon
H,N-CZ ~n de 120. E x p erim en tal s-a
0 constatat c n prezena TRF1 e
Figura 2.22. Modelul schematic al buclelor telomerice i
facilitat circulaia moleculei
structura domenic a proteinelor telomerice T R F l i TRF2.
Structura domenic a proteinelor telomerice TRFI i TRF2 scurte de DNA, compus din
segmente telomerice repetate, ce confirm rolul proteinei n formarea structurii spaiale
telomerice.
Proteina TRF2 dup structur e asemntoare cuTRFl, dar domenul final nu interacioneaz
cu domeniile omoloage ale reprezentantei urmtoare din familia respectiv i deci ambele
proteine n molecul pot exist n fonn de homodimeri. TRF2, ca i TRF1, n consecina
splaisingului alternativ formeaz dou variante.
S-a constatat c TRF2 se ataeaz n regiunea contactului telomeric cu baza (desenul).
Buclele telomerice s-au depistat n cromozomii celulelor HeLa, n leucocitele periferice la om,
n hepatocitele oriceilor etc. Cele mai mici bucle conin circa o mie de perechi de baze.
Fixarea TRF2 la captul cromozomului necesit un segment de DNA telomeric ce conine nu
mai puin de 6 nucleotide (TTAGGG). Cu ct mai multe sunt segmentele repetabile, cu att
procesul de fixare e mai favorizat. Se consider c n acest ioc DNA unicatenar-3', hibridizat
cu poriunea antiparalel parial desfurat a spiralei duble trunchi, fonneaz aa - numita
bucla-d (displacement loop).
Consecinele fenotipi.ee n modificrile activitii proteinelor TRF. Lungimea
telomerelor este asociat cu vrsta celulelor fenotipice. In celulele somatice, graie lipsei
telomerazei sau a altor cauze, numrul segmentelor repetate telomerice se micoreaz la
fiecare diviziune celular. La fibroblati in vitro, dublarea numrului de celule duce la
micorarea telomerei cu 48-21 perechi nucleotidice. In vivo, la fibroblatii umani valoarea
e de 75 perechi la o mitoz. Telomera celulelor sanguine periferice la copii pierde mai mult
de 1000 perechi nuclcotidicc n an. Sc consider c ntre 4 i 20 ani telomerele se micoreaz
mai ncet, dar la vrst matur i senil se micoreaz cu o vitez constant de 30-60
perechi nucleotide anual.
Cu vrsta, telomerele ating o lungime critic, la fibroblatii omului circa 5-7 mii perechi, la
care apare o mbtrnire replicativ i n consecina inhibiia i stoparea proliferaiei.
Expresia artificial a telomerazei prentmpin mbtrnirea i e posibil de imortalizat celulele
respective, ce ntlnim n celulele cancerigene. n ultimele inhibnd telomeraza, e posibil stoparea
rspndirii celulelor.
S-a constatat c expresia proteinei TRF 1n cultura celular duce la o mitoz prematur i
moartea celulelor. Reglarea expresiei permite celulelor s supravieuiasc, dar dup cteva
cicluri celulare are loc micorarea telomerelor. n condiiile de inhibare a sintezei TRF1 n
celule, ce exprescaz telomeraza, are loc o cretere lent a lungimii telomerelor. Posibil, TRF1
favorizeaz fonnarea t-buclei, mpiedicnd creterea telomerelor din contul activitii
telomerazice. S-a artat c TRF 1 in vitro inhibib lungirea catenei - telomerice.
Inhibiia proteinei TRF2 conduce la o stopare imediat i ireversibil a proliferaiei. La
modificri morfologice n celulele, caracteristice mbtrnirii i induciei markerilor celulari ai
procesului, cromozomii formeaz structuri inelare, neperznd segmentele telomerice. n
telomerele nemodificate dispar segmentele unicatenare, far modificri n activitatea telomerazei.
Se confirm c nu telomera apar cromozomul de nucleaze, de adiie i niperi n mitoz -
asta-i funcia proteinei TRF2.
Creterea concentraiei de TRF2 n cultura de fibroblati conduce la majorarea vitezei dc
micorare a telomerelor n procesul de mbtrnire. Efectul nu duce la o mbtrnire
precoce celulele continu s prolifereze. Dac numrul limit la o mbtrnireede
6-7 mii perechi nucleotide la celule in control, apoi la cele care expreseaz mai mult TRF2
aceast limit e de 2-2,7 mii de perechi mai mic, ce permite ca ele b se divizeze de i 5 ori
mai mult pn la mbtrnire. De altfel, sunt prentmpinate alipirea i ruperea cromozomilor.
Se consider c nu lungimea telomerei e cardinal pentru inducerea mbtrnirii celulare, ci
starea lor, determinat de funcia protectoare a proteinei TRF2.
Experimental s-a demonstrat c inhibiia TRF2 nu numai c conduce la modificri
fenotipice caracteristice mbtrnirii, dar i provoac modificri genetice: alipirea cromozomi lor,
activarea p53, creterea concentraiei p l 6, micorarea nivelului ciclinei A i
hipofosforilarea pRb. Inactivarea simultan a p53 i pRb prentmpin mbtrnirea
celulelor experimentale, determinat de inhibiia TRF2. Proteina p53 are o afinitate major
faa de segmentul unicatenar al telomerei, ctre locul de fixare a t-buclei i favorizeaz
formarea ei n prezena TRF2.
Reglatorii naturali ai proteinelor TRF umane.
Efectul TRF2 asupra telomerei e stabilit cert n condiii de experiment, dar modulatorii
proteinei nu sunt nc identificai. A fost identificat proteina hRapl, care are influen,
fiind fixat pe telomere, dar ea poate interaciona i cu alte poriuni ale cromozomului.
Proteina TRF1 uor modific lungimea telomerei, fiind reglat in vivo diferit.
Proteina TRF 1 poate fi poli-ADP-ribozilat, cu disocierea consecutiv de la DNA. O
aa modificaie spaial e catalizat de tankiraz (poli-ADP-ribozil-polimeraz ankirat
de telomer). Proteina (K.F.2.4.2.30) e partener al TRF 1, care ptrunde n nucleu i n forma
sa neactiv e fixat de proteina telomeric. Dup activare, tankiraz poli-ADP ribozileaz pe
sine, ct i pe TRF 1, ce conduce la disocierea complexului nucleoprotidic i eliberarea
telomerelor. Ultimele sunt disponibile pentru aciunea telomerazelor i a altor enzime.
Tankiraz se consider reglator pozitiv al telomerazei.
La om i la vertebrate sunt depistate dou izoforme ale tankirazei TNKS (1) i
TNKL (2) cu masa molecular, respectiv, de 142 i 127 kDa. Tankiraz posed un
domen enzimatic, alt domen fixat (ankorat) compus din 24 repetri i al treilea domen-
SAM; ultimele particip n interaciuni proteo-proteice. Tankiraz 1, spre deosebire de
tankiraz 2, posed i un domen suplimentar - N-terminal domen, care deocamdat nu-
i asociat cu nici o funcie. Nu are localizaie nuclear i majoritatea enzimei se gsete n
citozol, unde este supus fosforilrii i activrii de MAP-kinaza. Nu e clar dac enzim activ
este transferat n nucleu sau pulul nuclear al tankirazei este activat de M AP-kinaz
(proteinkinaz, activat de mutageni).
Ultima poate fi translocat n nucleu. MAP-kinaza este reglat de insulin i factorii de
cretere i se consider c graie tankirazei organismul menine telomercle celulelor sub controlul
hormonal.
A fost depistat o alt protein telomeric, ce interacioneaz cu TRF1 numit TINF2
(TRF-1-interacting nuclear factor 2) cu o mas molecular aproximativ de 40 kDa.
Structural e asemntoare cu proteinele TRF, avnd la captul C-tenninal un domen fixator
de DNA de tipul Myb. Acest factor favorizeaz scurtarea telomerei i negativ regleaz
activitatea telomerazei, intermediind efectul TRF1. Mecanismul de aciune aTRFl const
nu numai n superspiralizarea DNA i favorizarea formrii buclei t. Graie interaciunii cu
diferite i multiple proteine TRF 1, le poate conccntra n apropierea telomerelor. Ea poate
fixa proteina PinXI-inhibitor, puternic al telomerazei, care acioneaz direct asupra enzimei,
spre deosebire de ali modulatori, care vizeaz disponibilitatea telomerelor.
Recent, s-a depistat o alta protein telomeric - Potl, ce se fixeaz de segmentul
unicatenar. Posibil, funcia proteinei respective const n protejarea acestui fragment de efectul
nucleazelor, agenilor chimici, radiaiei. Pot 1 (Protection O f Telomeres)un polipeptid
de 71 kDa, interacioneaz cu TRF1. Acionnd asupra procesului de fixare a Potl,
proteina TRF 1, concentraia creia este proporional cu lungimea telomerei, transmite
la capetele unicatenare informaia despre mrimea total a DNA telomerice. Toate
proteinele cunoscute i necunoscute ale complexului nucleoprotidic fonneaz telozoma.
E de constatat c numai unele proteine telomerice au omologie la alte eucariote. n
organismele model nu au fost depistate toate proteinele cunoscute n genomul uman. Evoluia
a parcurs alt cale, dar studiind, se poate obine informaie utilizant.
Telomera si sistemul reparativ
Radiaia ionizant i ali factori nocivi provoac rupturi n DNA bicatenar - DSB (Double
Strand Break). De altfel, transformrile n DSB sunt considerate ca metod de reiniiere
a furcilor replicative lezate, ce prentmpin dublarea normal a cromozomilor n faza S.
Deosebim 2 ci concurente de reparaie a DSB: 1) mperecherea cromozomilor omologi,
recombinarea i resinteza catenelor scurte; 2) legarea neomologic a capetelor DNA (NHEJ
- Non-I Iomologous End Joining). Se consider c prima cale predomin n fazele S i G,
ale ciclului celular i la celulele ce se nmulesc activ (drojdiile), a douan fazele Go, si G ,
i la cclulele ce se divizeaz rar (fig.2.23).
C apetele telom erei,
dac nu sunt protejate de t- M - M itoza (diviziunea nuclear) i
bucl, sunt identice cu DSB citokineza (diviziunea celular)
Go - C e l u l e l e
i trebuie s fie reparate G , - Sinteza DNA stopat. difereniate definitiv,
Continu sinteza RNA i
fie p rin fo rm area a proteinelor eite din ciclu l
c e lu la r p e tim p
cromozomilor inelari sau a nedefinit
cromozomilor cu dou sau P - Punctul de reintrare -
celula rentoars din Go
mai multe centromcrc, dup ntr n faz G1
mecanismul NHEJ. Ultima se
G1 - Sinteza RNA i a
observ n celulclc cu proteinelor. Sinteza DNA
telomere scurte la limit. e stopat
Recombinare tntra-
i extra grupal
terminal detection
Recombinare teloraeric
X-internal este inhibat
Succesiuni unicale
Centru! X
Factorii silencing
Nuclcu
Factorii de ancorare
RAP1, alii
+ 1 T )TR
S ecvene Pribnow ( 5----------- *-
5 Transcript RN A
P unctul start
C. Prom otorul eucariot
(5s tRNA )
51--------- ---------------------------------------- Transcript
Figura 2.26. Secvenele tipice n promotor la pro- fi eucariote
Figura 2.28. Transcripia la E.coli. a) RNAp fi procesele ce sunt cauzate de activitatea ei, b) direcia
elongrii
Dup procesul de transcriere con
tinu fonnarea moleculelor funcional \R N A p \
active de RNA aa-num itu l " 3'
J\ ' aten a
procesing, care const n unntoarele: CTACCCGCTAAGCCCTATCTTAOCOQA/ , _.
IIIHIIUIIIlUinilllllilIllilll tem p lat
1. Cap-area. La captul 5' este ----------G
V
A T G G G e G A T T C G G O A T A G A A C C C C r A A
, -
A A A T -
DNA V
Kxort Intron
..C a p
Completarea
transcriptului primari
Transcriptul primar Segvene necodificatc
Clivarea, poliadenilarca
i splaisingul
- 133-
Secvenele intronilor au dimensiuni de 10-100 ori mai mari dect exonii.
Cum se manifest excizia intronilor? Aa-numitul splicing are loc n nucleul celulei.
a) unele enzime specifice identific secvenele de baze la jonciunea intron-exon
(excizia pe introni este o excizie incorect i conduce la generarea unui RNA inactiv ce
conine un intron rezidual. n unele -talasemii are loc descreterea sintezei a lanurilor
-globin);
b) n excizia intronilor un rol important i revine unei categorii de RNA nuclear cu
mas molecular mic, desemnat RNA U (snRNAs), care are o secven a bazelor
complementar cu secvenele de la capetele fiecrui intron. Intronii sunt scoi de
RNA nuclear i capetele exonilor corect juxtapuse, apoi sunt sudate ntr-un aparat enzi-
matic specializat (fig. 2.31);
Intron
Cronomicina Proflavina
Echinimicina Etidium
Hedamicina Daunomicina
Netropsina Nogalamicina Mitomicina
Distamicina Cloroquina N-gaze
Fleomicina Miracil D Acid nalidixic
Kancanomicina Actino- / Streptonigrina Alcool
Luteoskirina micjna f Bleomicina fenetil 4 /
Antramicina
rS
/
Rifampicin^ Bazeanaloage Azaserina
Streptovaricina Nucleotide Metotrexat
Antibiotice
Figura 2.32. Locul aciunii unor medicamente
1. O fixare noncovalent cu DNA, ce mpiedic replicarea.
2. Se leag rigid n duplex, joncionnd cu guanina i inhibnd activitatea DNA ca matrice pentru RNA
olimeraz.a (inhib transcripia). Acioneaz similar: doxorubicina (adriamicina), cronomicina A i
I distamicina.
3. Se fixeaz de DNA, fr a modifica structura helixului.
4.Medicamente ce rup punile n DNA.
\ 5. Preparate ceformeaz legturi covalente ntre spiralele de DNA.
14 Substane ce Jixndu-se n bifurcaie mpiedic replicarea.
i 7. Inhib sigma i beta subuniti de RNAp, ngreuind iniierea procesului de transcripie.
A| Transcript primar
Transcript primar |
Cap Cap
+ + . + + + +
CODUL GENETIC
Noiunea de gen s-a concretizat i am putea afirma c gena este un fragm ent al
DNA, transcris n molecula de mRNA ce codific un lan polipeptidic sau are o
semnificaie funcional particular (tRNA etc). Dup descoperirea din a. 1977 a
intermitenei genelor, noiunea nu s-a schimbat, ns unele fragmente ale DNA, datorit
splicingului alternativ al RNA primartranscript, pot asigura sinteza a mai mult de 2
mRNA i, n consecin, a mai mult de 2 proteine, fiecare cu funcia sa. Rmne admisi
bil ideea c o gen determin sinteza unui lan polipeptidic.
Informaia genetic referitor la biosinteza proteinelor se transmite cu ajutorul
codului genetic ce reprezint fonna de exprimare a relaiei dintre secvena de nucleotide
din DNA i succesiunea dc aminoacizi din lanul polipeptidic.Avnd 4 nucleotide i 20
de aminoacizi, este evident c un aminoacid este reprezentat de 3 nucleotidecodul
este triplet i poate oferi 64 de posibiliti pentru cei 20 de aminoacizi. i toate tripletele
sunt numite codoni. Ei (codonii) sunt identificai consecutiv de moleculele de tRNA,
care ndeplinesc rolul de adaptor n sinteza proteinelor (tab.2.1).
I II III
(5) A G (3)
UUU'i UCTP U A U'l yr U
Phe
/ ucc UACJ
> Ser
UUA'l UCA U A A 'lC o d o n UGA Cod.ter A
Leu
uugj UCG; UAG > te m i UGG Trp G
CU I P C A U \ U. CGU^ U
c u c > Leu
CUA
CCC
CCA
> Pro
CA J CGC
CGA
> Arg
A
cug J CCG; CAG i CGGJ G
Ue
AAU\ A CU)
Ser
U
AUC ACC A A C / A sn A G C/
> T hr
aua J A A A \ Lys AGA\ A
Arg
AUG M et \C< ,y aag/ AGGJ G
cum GCU^ GAU\ . GGU'' U
G GUC Val GCC
Ala
GAC J GGC
> Gly
GUA GCA GGA A
gugJ GCG-' gggJ G
OH OH
HO
OH
Inozitol
Inozina
Dac toate legturile vor fi de tip W-C, atunci orice aminoacid ar fi acceptat de
un singur codon, iar deblocarea din complexul de sintez s-ar complica, ceea ce ar
micora considerabil viteza procesului de sintez, Anume degenerarea codonului
favorizeaz eliberarea din complex a tRNA.
Degenerarea codului minimalizeaz efectele nocive ale T ab elu l 2.1a. D egenerarea co d u lu i
mutaiilor i permite componenei nucleotidice a DNA g en e tic
s varieze n diapazon larg, nemodificnd secvena
N um rul
aminoacidic n proteina codificat de acest DNA. A m inoacidul
de codoni
Codul nu are virgule sau alte semne de
punctuaie ce ar indica nceputul i sfritul fiecrui Ala 4
codon. Citirea mesajului genetic se face nentrerupt Arg 6
de la codonul start pn la cel final. Asn 2
Asp 2
C odul g e n e tic este u n iv ersa l to ate
Cys 2
vieuitoarele utilizeaz acelai mecanism de a asimila Gin 2
informaia (abaterea prezint codul genetic al Glu 2
mitocondriei). Gly 4
Codul genetic nu este ambiguu (acelai triplet His 2
Ilc 3
nu semnific 2 aminoacizi diferii), nu se suprapune Leu 6
(prezint excepie la virusuri). Lys 2
Codul genetic prezint o structur liniar (este Met 1
coliniar, adic exist o concordan liniar ntre gen Phe 2
Pro 4
i aminoacizii proteinei codificate).
Ser 6
De remarcat c tripletul AUG reprezint Thr 4
codonul de iniiere, iar cei trei UAG, UAA, UGA de Trp 1
terminare (nonsens). Exist unele deosebiri n secvena 2
nucleotidic la DNA mitocondrial. Val 4
Studiile mai recente au confirmat c proprietile chimice ale unor aminoacizi sunt
reflectate n structura codonului: toi codonii cu U (n poziia 2) codific aminoacizi
hidrofobi, iar cei ce au n poziia 2 adenina codific aminoacizii polari sau cu sarcin;
guanina, respectiv, aminoacizi polari sau nepolari, iar uracilul n poziia 1 prezint
codonii nonsens.
Dac n anticodon n direcia (5' 3') prima baz nucleotidice:
a) citozina sau adenina, el va citi un singur R ecunoaterea a unui codon:
codon; Anticodon (3 ') X-V-C (5') (3) X-Y-A (5')
b) uracilul sau guanina, el va citi 2 codoni; Codon (S ') V-X-G (3 ') (5 1 Y-X-U (3 )
Transcript
^ Transcripia (RN A p II) Extra RNA
primar RNA
1 2 3 4 5 6_________________ 7
0 E )
.jF f 7[ G
.
Cap ; !__ ; S p licin g u l, c liv area i
11 - . ~ L poliadenilarea
^ I Extra RNA
L 12 3 4 5 6
Intronii iff AAA(A)n
m RN A
1,872
nuclcotidc
Figu ra 2.33. Structura genei ovalbuminei i modificrileposttranscripionale ale RNA primar transcript cu
formarea unei mRNA mature (zonele haurate prezint intronii)
Lanul DNA O
O
Lanul DNA
N. Al
N"
FI'
//
V
Xantina
O
H
N1/
Nu se supune dezam inrii
N
Timina
O Aminoacidul
re a N~fmet-tRNAf,"et.
Etapa 2. La complexul format adiioneaz
IF--2 legat de GTP i fmet-tRNAfme, care se
fixeaz n centrul peptidilic (P).
Etapa 3. Complexul interacioneaz cu
subunitatea 50S, implicnd simultan hidroliza
GTP pn la GDP i Pi, care se elimin din
complex. Prsesc ribozomul IF-1,1F-2 i
3 ' UAC 5
IF-3. n consecin, se formeaz complexul
Anticodonul
de iniiere, alctuit din ribozomul 70S, 6'
funcional activ, i mRNA, N-frnet-tRNAfmet.
Fixarea corect a ultimei e determinat de
formarea perechii complimentare dintre tripletul
anticodon i codonul mRNA ct i de fixarea
tRN A de locusul P al ribozomuiui.
Aceast etap la eucariote este mult mai com
plex i include o mulime de factori (fig.2.42).
III. Elongaia lanului polipeptidic
Ea reprezint un proces repetat. Pentru
realizarea lui sunt ncccsare: complexul meni
onat deja, urmtorul AA-tRNA corespunz
tor tripletului ulterior al mRNA, trei proteine
solubile citozolicc, factori ai elongaieiTu,
Ts, G i GTP.
Procesul decurgc n trei faze: F igura 2.40. Formarea complexului de iniiere
a) Aminoacidul unntor activ (A A,-tRNA) rR N A 16S
Factorii
deiniere Gp
ATP
Subunitatea fM ct-
m are
IS S tR N A
GD P
70S/80S
<S>
GDP
ADP
F igu ra 2.42. Formarea complexului de iniiere la pro- i eucariote
5 -
Hidroliza
polipeptidului
sintetizat
<:oo
F igura 2.44a. Etapa III a elongrii, translocarea F igura 2.44b. Finalizarea sintezei proteinei
zeaz n celul?
La captul N-terminal se pstreaz secven
e specifice- lider 15-30 de aminoacizi. Ei
sunt sintetizai n primul rnd i sunt identificai
de locusurile receptoralspecifice de pe
suprafaa exterioar areticululuiendoplasmatic
adiacent sintezei complete. Aceast poriune-
lider, de obicei, e hidrofob, liposolubil, uor
ptrunde prin membran in interiorul cisternelor
reticulului endoplasmatic i trage dup sine restul
lanului. Ideea original i aparine lui George
Palade, laureat al Premiului Nobel, original din
Moldova.
n cisterne, o peptidaz specific o cliveaz.
Proteina matur n aparatul Golgi este
incapsulat, apoi prsete celula n forma unei
bule secretoare (fig. 2.45a).
n ultima perioad se postuleaz dou
concepii de asamblare a proteinelor n forma
nativ , stru c tu r unic trisp a ia l :
cotranslaional i p o sttra n sla io n a l .
Confonn concepiei cotranslaionale, proteinele
se aranjeaz spaial n procesul sintezei lanului
polipeptidic n ribozom, iar potrivit concepiei
H3CX y C lh
N
c=o
I c=o
Hc R
NH2CH C H f" \ -0 -
. NH2
A m inoacil-tR N A Purom icina
REGLAREA BIOSINTEZEI PROTEINELOR
Graie procesului de reglare a sintezei, n celule se stabilete un complex adecvat de
enzime ce asigur activitatea normal a fenomenelor celulare. Dei fiecare celul conine
un set de genom caracteristic acestui organism, celulele lui exprim numai o parte din
genele structurale. Toate celulele conin un set de enzime de baz, necesar pentru
manifestarea metabolismului. Diferite celule, ns, conin structuri proprii numai lor i
ndeplinesc anumite funcii biologice. Biosinteza diferitelor tipuri de proteine specializate
sunt programate strict n timp i consecutivitate, ceea ce permite o adaptare biochimic
la aciunea diverilor factori.
Celulele dispun de trei tipuri de enzime: 1. enzime inductibile; 2. enzime represibile;
3. enzime constitutibile. Ultimele se reprezint n cantitate constant, indiferent de sta
rea metabolic a organismului (glicoliza). n alte celule reglarea e asigurat de cele induc
tibile i se sintetizeaz numai atunci cnd este necesar, sub influena inductorului. Induc
torul poate determina sinteza unui grup de enzime inducie coordonat, ceea ce
permite o adaptare imediat i econom n utilizarea substanelor nutritive. Concentraia
enzimelor represibile depinde de prezena sau absena din mediu a unui compus
denumit corepresor. Enzimele acestea sunt implicate n cile anabolice, cele inductibile,
respectiv, n catabolice. Ne confruntm i cu represie coordonat, represieprin produs
final.
Represia, ca i inducia, e reflectarea principiului economiei celulare. Explicarea pro
ceselor de inducie i represie enzimatic se datoreaz lucrrilor lui EJacob i J.Monod
(1961) teoria lac-operonului , adic reglarea la nivelul transcripiei.
Utilizarea lactozei la bacterii implic creterea sintezei -galactozidazei necesare pentru
hidroliza lactozei cu scop energetic, enzim codificat de gena Z. -galactozidele (-
galactoza i oc-glucoza) sunt transportate prin membrana plasmatic printr-un proces
cuplat cu gradientul dc protoni. Proteina implicat n acest proces este -galactozid
permiaza cu o mas molecular de 46,5 kDa; sinteza ei este codificat de gena Y. Unele
-galactozide sunt acetilate sub aciunea transacetilazei, care vor traversa membrana
plasmatic, ieind din celula. Enzim este un dimer i este codificat de gena A. Genele
structurale care codific sintez celor trei enzime sunt controlate de alte dou gene: gena
reglatoare Lacl i gena operatoare O. Ultima, mpreuna cu genele structurale, alctuiete
operonul lactozei (Lac - operon) (fig. 2.47).
Gena reglatoare se afl la distan mic de operon i detennin sinteza unei proteine
numit represor, care, legndu-se de gena operatoare, mpiedic transcrierea genelor
i structurale. Inductorul (metabolit) se leag de proteina represor, modific conformaia,
blocnd fixarea ei de gena operatoare. n acest caz are loc transcrierea genelor i sinteza
enzimelor codificate de ele.
Teoria modernizat const n urmtoarele (fig. 2.47a).
n lipsa glucozei sau la concentraiile mici ale acesteia (ca rezultat al activitii
I adenilatciclazei i inhibrii fosfodiesterazei), apare AMPc, concentraia cruia crete,
I reprezentnd astfel semnalul foamei pentai bacterii. n consecin, se formeaz complcxul
I cu proteina receptoare, cu legarea acesteia de promotor (p-locus). Proteina receptoa-
i r e e numit proteina activatoare a genei catabolice (CAP). Acest proces favorizeaz
a . R epresia
p la c I la c Z lac Y lac A
T ran scrip ia
T ran slarc a
R c p rcso r T e tra m e r
. Inducia
p lac I p lac Z lac Y lac A
T ran scrip ia
T ran slarc a
in activ
In d u cto r
. S tim ulare +
P Ia ci ^ p o lac z lac Y lac A
CRP<'< i
D im cr
cA M P
F igura 2.47. Reglarea activitii Lac - operonului (CRP-protein receptor penru AMPc)
cA M P (+) /
/
Glucoza ( +) L a c to z a
...........
cA M P (- )
Lac represor
Figura 2.47a. Efectele combinate ale glucozei i lactozei n expresia Lac - operonului
F igura 2.48a. Fixarea ferm oar a dou molecule proteice F igura 2.48.b. Fermoarul
prin leucin. Ea favorizeaz fixarea proteinelor reglatoare leucin (fiecare al aptelea
cu DNA, modificnd activitatea genelor aminoacid) n -elicea proteic
F ig u r a 2 .4 8 e . M odelul F igu ra 2.48d. Fermoarul leucin contacteaz cu DNA, favoriznd
com puterizat (im aginea fixarea. Asparagina i ali aminoacizi n aceste fragm ente sunt
m ai n ch is indic invariabile
resturile de leucin)
n proteinele vizate aminoacidul al aptelea este Ieucina aminoacid hidrofobce
permite moleculei de protein s se asocieze n perechi cu locusurile lor, formnd astfel
dimere - superspiral. Fragmentele sunt aranjate paralel, ca-n colagen, determinnd du
ritatea spiralei. Pot asocia diferite proteine, dar la fixarea DNA nu particip.
n apropierea acestor fragmente sunt situate secvene bogate n arginin i lizin, care
contacteaz cu DNA. Poziia adecvat a fragmentelor de arginin i lizin, ce
determin fixarea cu subiectele bilateral simetricc din DNA, este asigurat de asocierea
a 2 molecule de proteine (fermoar (g )-picioaiul - fermoar; umerii-aminoacizi bazici).
Spirala e deformat dc asparagina, cc-i permite spiralei s contactezc cu DNA. Aceste
fragmente au un grad mare dc conservatism, un rezultat evident evolutiv i posibil
relev formarea heterodimerilor din proteinele neidcntice(fig.2.48.d).
Reglarea fin a biosintezei proteinei necesar pentru funcionarea normal att
a celulei, ct i a ntregului organism. Generarea insuficient sau excesiv mcar a unei
proteine poate conduce la consecine nefaste. Surplusul unor factori de evoluie provoac
tnalignizarea celulelor.
E clar c durata sintezei fiecrei proteine e direct proporional cantitii de
mRNA. Factorii ce regleaz cantitatea dc mRNA, n final, determin i nivelul de
sintez a proteinei. Cantitatea de mRNA i protein corespunztoare din celul era
determinat, dup presupuneri, numai de durata procesului de sintez. Recent, s-a
I stabilit c un rol important l joac i durata de degradare a mRNA. Producerea protei-
I nei depinde nu numai de intensitatea sintetizrii mRNA, dar i de durata scindrii lui.
Ce determin durata degradrii tnRNA?
mRNA degradeaz n citozol sub aciunea enzimelor denumite ribonucleaze, carc
I activeaz sub influena unor factori ce se fixeaz de moleculele de mRNA. Unul dintre
I factorii principali este structura lor proprie (fig.2.49.a,b).
Semnal slart Semnal stop Poli A
Ii i i I I I il
( ............ I 11 I I i i
I 1 1I IIII 11 I I I i i I I I li I I 11
Gl G2 M
mRNA pentru
h isto n e
Viteza dc scindare
N ivelul m RN A pentru
relativ h isto n e
H istonele n
cito p lasm
Histona iRibonuclcaza
activ
F igura 2.49d. Ipoteza autoreglrii coninutului de histone la diferite fa ze ale ciclului celular
F igura 2.49e. Mecanismul induciei lizei mRNA propriu de tuhulin (a) i histone (b)
HOp o PO Po 0
OH OH OH
ATP OH OH
Fiind depistat ATP n extractul din muchii scheletali, n 1929, de ctre
K.Lohmann (Germania) i C.Fiske, i J.Subbarow (SUA), abia n 1941, Fritz Lip-
mann a naintat conceptul care prevedea existena n celul a ATP - ciclului, n care
ATP joac principalul i universalul rol de remitor al energiei chimice. Prezena ATP,
ADP, AMP este determinat la toate vietile i ndeplinesc aceleai funcii. Se conin
n toate compartimentele celulei, cota ATP fiind 80% din coninutul total.
La hidroliza ATP, n condiii standard, se elimin energie:
ATP + HOH ADP + P. + H+ + 7,6 kcal/mol
ATP + HOH AMP. + pp. + H- + 7,6 kcal/mol
; + ===== 2P. + H++ 6,9kcal/mol (dup alte date (-7,3-8,0)kcal/mol)
ATP + 2HOH AMP + 2. + 1-+ 14,6 kcal/mol
Energia liber constituie diferena dintre energia liber a substanelor iniiale i
cea a produselor rezultante n condiii standard (T = 298K, P = 1atm., concentraie
= 1,0 mol, pH = 7,0). Se noteaz prin AG n cal/mol sau J (joule);
leal = 4,184 J i se calculeaz conform ecuaiei descrise mai sus.
ATP este principalul donator al energiei libere n sistemele biologice, ceea ce nu
egaleaz cu forma de rezerv a energiei. n celul molecula de ATP se utilizeaz timp de
un minut dup sinteza sa. Omul n repaus utilizeaz n 24 ore circa 40 kg de ATP; la
exerciii intensive viteza utilizrii de ATP ajunge la 0,5 kg/min. Turaia ATP e foarte
mare.
Unele reacii biosintetice sunt iniiate de ctre alte nucleotide, n care GTP, UTP, CTP
servesc drept tumizori de energie.
La hidroliza unor compui fosforilai se elimin mai mult energie liber dect la
scindarea n condiii standard a ATPului:
fosfoenolpiruvatul -14,8 kcal/mol
carbamoilfosfatul -12,3 kcal/mol
3-fosfogliceroilfosfatul -11,8 kcal/mol
creatinfosfatul -10,3 kcal/mol
acilfosfatul - 10,3 kcal/mol
ATP, ADP ocup o poziie intennediar, care are o importan primordial pentru
funciile lor biologice - 7,6 kcal/mol.
AM P - 3,4 kcal/mol
G -l-P - 5,0 kcal/mol
G-6-P - 3,3 kcal/mol
F-6-P - 3,8 kcal/mol
GA-3-P -2,2-kcal/mol
Ocupnd acest loc n scara termodinamic, ATP servete la remiterea grupelor fosfat
de la substanele supermacroergice la acceptorii de fosfat, compuii crora se
caracterizeaz prin valori mici dcAG0 la hidroliz. n procesele de catabolism se
_ formeaz substane supermacroergice (X - P). Cu ajutorul enzimelor specifice din gmpa
kinazelor grupa fosfat este transferat la ADP, cu formarea ATP.
I
X - P + ADP - - ^ X + ATP
- 177-
La etapa a doua, o alt kinaz specific transfer P terminal din ATP pe molecula
acceptomlui de fosfat (Y), mrind energia lui.
ATP + Y *. ADP + Y -P.
ATP ndeplinete funcia de remitor al energiei chimice, deoarece celula nu conine
kinaze specifice, ce ar transfera grupa fosfat de la substanele supermacroergice la
acceptori.
Ce particulariti determin molecula de ATP, la hidroliza fosfatului terminal,
s elimine energie?
Efectul e determinat de trei factori structurali:
1) gradul de disociaie a ATP i a produselor hidrolizei la pH = 7,0
ATP4' + HOH ^ ADP3' + ,2" 4
+ 1
ionii de hidrogen deplaseaz reacia de hidroliz spre dreapta;
2) repulsia electrostatic: cele 4 sarcini negative sunt situate foarte aproape n spaiu
la hidroliza ATP tensiunea intramolecular scade, produsele reaciei posed sarcin
negativ, se resping reciproc i nu pot forma molecula de ATP;
3) gradul de stabilitate, cu rezonana mai mare a ADP +P. dect pentru ATP; primele
au forme structurale mult mai stabile. Stabilitatea e determinat de faptul c o parte
din electroni sunt dispui n configuraii cu energie mult mai mic dect n configuraiile
caracteristice pentru ATP. Cu alte cuvinte, electronii n ADP i P. se situeaz la niveluri
energetice mai joase i conduc la micorarea rezervei de energie liber;
4) prezena ionilor de Mg++afinitatea ADP de Mg2+, este de 6 ori mai mare dect
a ATP, reacia de hidroliz este mpins spre fonnarea ADP i P..
Energia nu se afl n legtur macroergic i contrar se utilizeaz pentru scindarea ei.
La hidroliza esterilor acidului fosforic energia este condiionat nu de ruperea legturii,
dar de reducerea energiei din produsele iniiale. Sistemul dc generare a ATP n cclul
menine raportul ATP/ADP x P. la nivel nait-circa 500. Hidroliza unei molecule de ATP
deplaseaz raportul concentraiei produselor la concentraia substanelor iniiale n
reaciile cuplate = 10s ori. Succesiunea de reacii imposibile, din punct de vedere
tennodinamic, devine posibil, se realizeaz prin cuplarea hidrolizei unui numr mare de
molecule de ATP.
De exemplu: AG transformrii substanei A n este egal cu 4 kcal/mol.
Astfel de transformare devine imposibil far surplus de energie. Fiind
Keq = 10'^ G'1,36, obinem egal cu 1,15 x 10"3, adic, dac relaia molar e egal
sau mai maredect 1,15 x IO'3, substana A nu poate fispontan transformat n B.
Acest lucru va fi posibil numai dac reacia se va cupla cu hidroliza ATP.
A + ATP + H20 + ADP + P. + H
AG - -7,3 + 4 = - 3,3 kcal
Keq = 10'3-3/!36 = 2,67 x 10"2
[B] [ADP] [P ]
Keq = X---------------- -- 2,67 X IO'2
[A] [ATP]
[] [ATP]
= K eq -------------= (2,67 x IO2 ) x 500 = 1,34 x IO5.
[A] [ADP][P. ]
Aceasta nseamn c hidroliza ATP asigur posibilitatea transformrii A *-
atta timp, ct raportul B/A va atinge valoarea 1,34 x 105. Fr ATP, valoarea e egal cu
1,15 X 10 3; hidroliza ATP modific raportul B/A aproximativ de 108ori.
La utilizarea a dou grupe fosfat se formeaz AMP, care se rentoarce n ciclu sub
aciunea unei enzime prezente n toate esuturile - adenilatkinaza.
M g2+
ATP + AMP ^ ADP + ADP
Enzim are i funcia de a menine ATP n celule, cnd reacia catalizat va decurge
n direcie invers.
Metabolismul celular e bazat p e o economie maxim. Viteza metabolismului e
determinat de necesitile n ATP i NADPH. Celula utilizeaz la moment acea cantitate
de substane nutritive, care-i permite satisfacerea necesitilor energetice, precum i
viteza de sintez a blocurilor de construcie i macromoleculelor celulare.
Substanele din multe organisme i plante nutritive trec n rezerv i servesc drept surse
de energie i de carbon (glucidele, lipidele), cu excepia proteinelor i acizilor
nucleici.
Procesele catabolice sunt foarte sensibile i reacioneaz fin la modificrile i
necesitile energetice ale celulei. La musca domestic, bunoar, utilizarea 0 2 i a
surselor celulare n timpul zborului n decurs de 1 sec. crete de 100 ori.
M ECANISM ELE DE REGLARE ALE METABOLISMULUI
Mecanismul cardinal este indispensabil de efectul enzimelor alosterice. In calitate
de inhibitor servete ATP, iar de modulator pozitiv ADP i AMP. Pot participa i alte
rezultante finale sau intermediare ale altor ci metabolice.
Multe reacii sunt reglate de starea energetic a celulei. Indicatorul ei e sarcina
energetic care se detennin: (ATP conine dou legturi anhidrice, ADPuna):
Viteza
s _ 1 + 1/21ADP1
C [ATP]+[ADP]+[AMP]
CH3 CH3
I
COOH + NAD++ CoA-SH C~SCoA+ H+ + NADH + ,
II II
O o
(-8 kcal/mol)
.C H , O NH
/ \ = I
H2C CH H2 (CH2)2 H2 C i- N CH2 (CH2)3 CH
oxidat !
t
Acidul lipoic Lizina
I
.C H , ! I NH
,/ \ II I I
H2C CHCH2(CH2)2C H ^ G r N CH2 (CH2)3 CH
\-i-S redus i 0
(H ): (H) .. V
H
NH, I
c s
n ^ y ~ c h 2- n ' 0 ?
u r _U C=cCH2 CH2 O P O P 0
3 ^ N ^ ! II II
TPP CH, o o
R CH3 R ch R CH3
U I 3
H N -C
N -C N -C
- c c
I
\
I
CH3
s-c 1
CH3
s-c ++ I
CH3
\ s_ c
I I I
Ri R, Ri
Form e rezonante Hidroxietil - TPP
n etapa a IV-a are loc regenerarea formei oxidate a lipoamidei. Reacia e catalizat
de E3 Oxidantul e NADf, i rolul prostetic i revine FAD.
C H .-S H /C H -S
/
H2C H2C
2 \ CH s
CH SH
I I
r2 r2
Dihidrolipoarnid Lipoatnid
Procesul e ireversibil, avnd =-8 kcal/mol. Etapa descris este cheia ireversibil
a metabolismului. Animalele nu sunt capabilc s transforme acetil-CoA n glucoz.
Acetil-CoA se ncadreaz n ciclul Krebs sau n sinteza lipidelor. Reaciile pot fi reproduse
schematic n felul unntor:
FA D H 2 FAD
NAD+ NADH+ H +
c h 2- o - po 23
Complexul PDH Complexul PDH
activ inactiv
c h 2- o - po 23
Acetil-CoA, NADH
CoA, NAD, piruvat
CICLUL KREBS
Reprezint un ciclu primordial pentru funcionarea sistemelor vii. Sistemul enzimatic
acioneaz cu o finee deosebit. Ciclul ncepe cu retrocedarea de ctre acetil-CoA
oxaloacetatului grupei acetil, cu formarea compusului de 6 atomi de carbon - citrat.
Prima reacie este catalizat de citrat sintaz ferment reglator. Produsul interme
diar l constituie citril-CoA. Reacia sumar deviaz spre dreapta (AG = -7,7 kcal/
mol), rezultant a hidrolizei.
OH O
I + II
O O C -C H N A D +(P) NAyDH^ +H o o c - c
I . I
o o c CH " ------------------ o o c CH
I I
CH2CO O ' CH2COO CH2 c o o
Izocitrat O xalosuccinat a-ceto g lu tarat
FAD FA D H 2 H
OOC CHo C O O ' 'oocc=cCOO'
Succinat
I
Fumarat H
_+ +
HO NAD NADH +H
I \ E A O-C-CO O -
ooc - C H - CH2- C O O
(ti
: h 2- c o o
L-malat Oxaloacetat
n urma acestui ciclu de reacii are loc: 1) regenerarea oxaloacetatului, care
interacioneaz cu o nou molecul de acetil-CoA; 2) gruparea acetilic se asimileaz n
dou molecule de ,; 3) sunt captai ionii de hidrogen, bogai n energie.
Stoichiometria ciclului:
Acetil-CoA + 3NAD+ + FAD + GDP + P. + 2 H ,0 - - - 2 C 0 2+ 3NADH
+ FADH2+ GTP + 2 FT + HSCoA.
Reacia descris confirm c O, molecular la ciclul Krebs (CK) nu particip nemijlo
cit, ciclul fimcionnd numai n condiii aerobe, deoarece NAD+i FAD n mitocondrii pot
fi regenerate numai dup transferul electronilor pe 0 2 molecular. Ciclul manifest
caracter aerob, spre deosebire de glicoliz, ce decurge att n condiii aerobe, ct i
anaerobe. Cauza const n faptul c la transformarea piruvatului n lactat n cadrul glicolizei
are loc regenerarea de NAD+.
o
II
CHj ~ SCoA
A cetil- A i H,
Condensarea CoASH
>000 C il* -C O O "
Citrat simaza
I
HOc coo"
I
ch2coo
Dehidrogenarea Citrat
Aconitaza V
cis-A conitat
,
Hidratarea
OOC-CH-OiI
I
O O C -C -H
CH>QOO'
Decarboxilarea
oxidativ
a-cetoglutarat
GTR/ \
F osforilarea la
nivel de substrat ATP GDP
(A D P )
Decarboxilarca
oxidativ
+ Pi
F igu ra 3.2. Ciclul acizilor tricarboxilici (Ciclul Krebs)
Care-i esena biologic a prezenei ciclului acizilor tricarboxilici? Care-i cauza
c oxidarea grupei acetilice solicit un ciclu att de complex?
Molecula acidului acetic, cu dimensiuni mici i o structur relativ simpl, are o
particularitate deosebit: grupa sam etilice foarte rezistent la oxidarea chimic.
Pentru o oxidare direct pn la , sunt necesare condiii rigide, incomparabile cu
cele din celul. n timpul evoluiei celulele se conform cilor din cele mai adaptabile, ce
nu comport energie mare de activare. Celulele ataeaz acetatul la OA, cu formarea
cifratului care se dehidrogeneaz i se decarboxileaz cu mult mai uor dect acetatul.
La aparen, unele reacii sunt foarte complicate, dar studierea principiilor ce stau la
baza acestor mecanisme ale reaciilor organice atest descoperirea celei mai rezonabile
ci chimice ce asigur atare transformare.
Ciclul acizilor tricarbonici (CAT) e calea principal de scindare comun
a glucidelor, proteinelor, lipidelor ce asigur generarea ATP.
Reacii anaplerotice
Ciclul Krebs ndeplinete i alt rol furnizeaz produse intermediare pentru
procesele de biosintez. Utilizarea lor pentru biosintez trebuie s fie nsoit obligatoriu
de compensarea lor, n caz contrar funcia ciclului se va sista. Reaciile fermentative,
ce asigur completarea produselor intermediare ale ciclului, se numesc reacii
anaplerotice sau reacii de completare.
Reacia de carboxilarc a piruvatului cu , i formarea oxaloacetatului are o
nsemntate primordial. Ea este catalizat de piruvat carboxilaz i decurge intensiv
n ficat, rinichi. Ca modulator pozitiv servete CH3CO~SCoA
CH3 , CH2COO'
I I
C=0 + A T P - C 0 2 + H 20 C = 0 + Pj + ADP + 2H +
I I
COOH COO
Piruvat Oxaloacetat
NADH
H H
I
-CONH,
CONH2 + H + 2'e
N r N
I I
R R
NAD4 NADH
RC H Rj + NAD+ NADH + R -C R, + H
OH &
Al doilea H+rmne n soluie.
Alt acceptor principal este FAD i particip n reacii de tipul:
O
II
N
" ^ 'N H + r f + 2e -
Lanul respirator
Este un ansamblu de proteine aranjate ATP sintaza
ntr-o anumit succesiune cu grupe ( F F ,) M em b ran a extern
p e rm e a b il p e n tru
prostetice fixate rigid, care posed m o le c u lc le i io n ii
capacitatea de a adiiona i a dona electroni m ic i
i protoni saturai de energie. Electronii, M em b ran a intern
transferndu-se de la o protein la alta, i im p e r m e a b i l p e n tru
m a j o r i t a t e a m o le c u le lo r
pierd energia liber. O parte considerabil m ic i i io n i, i n c lu s iv i
a ei se acumuleaz n ATP, prin intenncdiul cei de H*
C o n in e :
mecanismelor moleculare. - L a n (u l r e s p i r a t o r ;
Fiecrei perechi de electroni, transferai A D P -A T P tra n s lo c a z a ;
de la NADH la O, pe lanul respirator, i - A T P sin taza;
A li tr a n s p o r to r i
se sintetizeaz 3 molecule de ATP. m e m b ra n a ri
Locusurile, unde energia se elimin n
M atricea
cadrul proceselor de oxido-reduccre, cu C o n in e:
formarea de ATP, se numesc puncte - C om plexul
p iru v a t
de fosforilure. La o rotaie a ciclului dehidrogenazic;
Krebs dehidrogenazele specifice scindea - E nzim ele
c ic lu lu i
z de la substraturi 4 perechi de atomi acid u lu i citric ;
de H, care ntr-un locus anumit i doneaz DNA, rib o zo m i;
- -o x id a re a
electronii lanului respirator i se acizilor grai;
transfonn n H+, cu deplasarea n mediul M u lte a lte
R ibozom i c n z iin c ;
apos. Electronii parcurg pe lanul respirator - ATP, ADP, Pi,
pn la 0 2 acccptorul final al electroni C an alele poroase C a !>, K*;
- A li in te r m e d ia r i
lor la organismele aerobe. m e ta b o lic i
Fosforilarea oxidativ e localizat n s o lu b ili
A m obarbital
P iericidina A
1
Citocrom ( + 0,25 V )
Complex IV
Citocrom c,t a
oxidaza \
cit a 3
jf ---------- A zida.C O
1/2 0 2 H , 0 ( + 0,82 V)
Figura 3.5. Lanul respirator mitocondrial
Caracteristica complexelor lanului respirator
Complexul I. NADH-Q-oxidoreductaza.
Torentul de electroni din lanul respirator n mare msur este detenninat de activitatea
dehidrogenazelor NAD* sau NADP+ dependente i doar foarte puine dintre ele
semnificativ (GDH) pot s interacioneze cu
ambele coenzime.(fig.3.6).
Unele dehidrogenaze sunt localizate n
mitocondrii, altele n citozol, dar semnificativ e
c dehidrogenazele din citozol ct i cele din
mitocondrii interacioneaz cu NAD+, respectiv
Membrana mitocondrial e impermeabil
pentru aceste coenzime. Coenzima NAD are
M atrice (N ) funcia de colector, adunnd H2 de la diferite
substraturi (NADPH, izocitrat, a-ceto-glutarat.
piruvat, lactat, malat, -oxibutirat, -hidroxiacil-
CoA) (fig.3.7.).
F ig u r a 3 .6 . N A D H : u b ic h in o n
oxidoreductaza (Complexul I)
Glicerol 3-fosfat biiccroi 3-tostat
Ulterior perechea de echivaleni redui S p a iu (citozolic) lehidrogcna/a
e transferat pe flavinproteide (FMN in term em b ra n a r
dependente), iar electronii sunt preluai de
complexele fiero-sulf cu rol de grupe
p rostetice. F lavinm ononucleotidul
formeaz cu aceti compui un complex
enzimatic NADH-Q-reductaz. Fierul nu f ETF:Qj^jp
NADH NAD Succinat oxidorcducta:
e de natur hemic i rezult c proteinele
poart denumirea fiero-proteine nehemice
sau centre fiero-sulf. Se atest trei tipuri A cil-C oA
de centre FeS:
1. A tom ul de Fe e tetraedric M a trice (N)
coordonat cu SH grupe a patru resturi de
cistein proteic, FeS 4 ( fig.3.8. (a)).
2. Fe 2 -S 2 conine 2 atomi de Fe i doi Figura 3.7. Transferul electronilor de la NADH,
disulfizi neorganici adiionai la 4 resturi de su ccin a t, a cil-C o A i glicerol-3-fosfat pe
ubichinon
cistein (fig.3.8 . (b)).
3. Fe4 -S 4 - 4 atomi de Fe i 4 disulfizi neorganici adiionai la 4 resturi de cistein
( fig.3.8. (c)).
S-a confirmat c NADH-Q-reductaza conine dou centre: Fe 2 -S 2 i Fe4 -S4.
De la Fe-S al enzimei electronii i H+sunt transferai la coenzima Q.
Reducerea de potenial constituie 0,42V, = - 19,4 kcal/mol i e suficient pentru
sinteza a 2 mol de ATP, dar se sintetizeaz un singur mol de ATP, restul energiei
risipindu-se sub form de cldur. Enzim NADH-Q-reductaza e compus din 16
subuniti polipeptidice.
F igura 3.8. Centrele ero -su lf
CH-, ? H
CH 3 + 2H + 2e v c' CH,
M a trice (N)
Figura 3.9. Complexul QH 2 citocrom reductaza (III). Complexul este uit dimer compus din
monomeri identici, fiecare cu I I uniti diferite. Structura unui monomer (a). Unitatea funcional este
dimeric (b). Citocromul ( i proteina fiero -su lf a tui Rieske proiectat p e suprafaa P poate interactiona
cu citocromul n spaiul memhranar. Complexul are dou situsuri distincte pentru fixarea ubichinonei,
QKi Qf, ce corespund situsurilor de inhibiie a dou substane ce blocheaz fosforilarea oxidativ. Antimicina
A blocheaz flu x u l de electroni de la hem ft(/ la Q, se leag la Qv aproape de hem ul bu n locusul
N(matrice) al membranei. M yxothiazolul previne flu x u l electronilor de la QH2 la proteina fiero -su lf a lui
Rieske, se leag la Qp, lng centrul 2Fe-2S i hem bLp e partea P a membranei. Structura dimeric este
esenial pentru funcia complexului III
O, :0 2- 1 . OH < L H ,0
-e H:U
2GSH Ghitation
F ig u ra 3 .1 2 . M oilelul hem io
sm otic. In aceast sim pl
prezentare a teoriei hemiosmotice
aplicat mitocondriei, electronii
din N A D H i alt su b stra t
oxidabil trec printr-un lan de
proteine aranjate sim etric n
m em brana in tern . F lu x u l
elec tro n ilo r este cu p la t de
transferul de protoni de-a lungul
membranei, producnd att un
gradient chimic (bpH), ct i un
gradient electric(Ayf). Membana
in te rn m itocondrial este
impermeabil pentru protoni;
protonii pot reintra n matrice
doar p rin ca n a lele p ro to n -
specifice (FJ. Fora motrice ce
co n d u ce p ro to n ii n a p o i n
matrice asigur energia pentru
sin teza ATP, catalizat de
complexul F t asociat cu Fo M atrice (N)
Energia electronilor se stocheaz, deci,
iniial n gradientul protonilor, apoi apare o
for proton-motrice ce condiioneaz
sinteza ATP n complexul enzimaticATP-
azic (fig.3.12.).
Esena general a mecanismului const
n faptul c actul primar de stocare a ener Pi
giei l constituie transferul protonilor prin
membrana intern, cu formarea gradientu-
lui proton.
Numeroasele date experimentale con
firm conceptul lui Mitchell:
1) S-a confinnat generarea gradientului
n cele trei puncte ale lanului respirator.
Gradientul protonic generat n ele se utili
zeaz la sinteza moleculelor de ATP.
2) S-a dem onstrat c pH matricei
mitocondriale crete, iar a mediului extern F igura 3.13a. Complexulmitocondrial ATP-sintaza
al mitocondriilor scade, mediul fiind mai
acid.
3) A fost argumentat teza c transferul IT din mitocondrii n timpul transferului elec
tronilor i revenirii lor prin moleculele de ATP-sintaza sunt comparabile cu viteza lor
din cadrul proceselor de fosforilare oxidativ n mitocondriile intacte.
Teoria hemiosmotic postuleaz c ionii de H+ translocai n exterior datorit energiei
de transfer a electronilor revin n mitocondrii prin canale speciale, ionice, localizate n
complexul ATP-azic. Acest flux de protoni este fora motrice care determin sinteza
cuplat a ATP din ADP i Pi.
Complexul enzimatic,denumit ATP-sintaza sau F Ft -ATP-aza,se compune din
factorii Fo iy F,.] Ultimul se afl n matricea mitocondrial. Savantul Efraim Racker
l-a izolat i n aceast stare izolat de Fo scindeaz ATP (F(- ATPaza). Masa
molecular e de 380 kDa i conine nou subuniti incluse n cinci tipuri diferite, fiind
joncionate i coninnd cteva locusuri de fixare pentru ADP i ATP. F, e fixat de Fo,
aceasta fiind parte component a membranei interne, o transverseaz complet. Zero (nu
e dect o liter) nseamn c aceast parte a complexului leag un antibiotic toxic
oligomicina ce simultan inhib fosforilarea oxidativ.
Structura complexului F F,, dedus prin studii biochimice i cristalografice de John
E.Walker, este redat n fig 3.13a. n Fj trei subuniti a si 3 sunt aranjate precum
feliile alternate ale unei portocale. n centru se afl subunitatea y. Cele dou subuniti
ale Fose asociaz fenn cu subunitile a i ale F ,, meninndu-le strns lng membran,
n Focilindrul membranar al subunitilor este ataat ia subunitile y, i e ale Iui F(. n
timp ce protonii curg prin membran din direcia P spre N - via Fo, complexul cilindric
se rotete i subunitile Fj i schimb conformaia; subunitatea se asociaz cu
fiecare n parte.
n fig. 3.13b este redat conformaia lui F,, vzut din direcia N membranar, cu
cele trei subuniti i 3 a la periferie i subunitatea n centru. Pe fiecare subunitate
, la interfaa ci cu a , este
a-ADP p re z en t un site de legare
nucleotidic. Subunitatea se
asociaz primar cu una din cele
trei perechi a, fornd trecerea
lor n diferite conformaii cu
generare de ATP.
n cursul evoluiei, s-au
d e zv o ltat ctev a tipuri de
tran sp o rtato ri activi ATP-
dependeni, difereniindu-se n
structur, mecanism, localizarea
n e su tu ri sp ec ific e i
compartimente intracelulare
(vezi tab.3.1)
ATP -azele de tip P sunt
transportatori ai ATP-ului ce
F igura 3.13b. Conformaia complexului Fr vzut conduc cationii fosforilai
din direcia N membranar reversibil de ctre ATP, ca parte
a ciclului de transport. Toate
ATP-azele de transport de tip P au asemnri n secvena aminoacidic, mai ales n
apropierea reziduului Asp ce sufer fosforilare, i toate sunt sensibile la inhibiie de ctre
analogul fosfat -vanadatul. Fiecare este o protein integral cu multiple regiuni de
deschideri membranarc ntr-un singur polipeptid, unii avnd i o a doua subunitate
(fig.3.14a).
Transportatorii de tip P sunt larg rspndii. n esuturile animale, Na+, K !- ATP-aza,
un anticonductor pentru Na+, K+; Ca2+- ATP-aza, un uniconductor pentru Ca2+. l ipul P
al ATP-azei menine dezechilibrul n compoziia ionic dintre citozol i mediul extracelular.
Celulele parietale ale stomacului mamiferelor au o ATP-az de tip P ce pompeaz H+i
KHde-a lungul membranei plasmatice, deci acidific i coninutul stomacal. La plantele
superioare, ATP-aza de tip P pompeaz protonii afar din celul, stabilind o diferen de
2 uniti pH i 250mV de-a lungul membranei plasmatice.
O ATP-az de tip P similar din mucegaiul pinii, Neurospora, pompeaz protonii din
celul pentru a stabili un potenial negativ pe partea intern a membranei, utilizat pentru a
conduce aportul de substraturi i ionii din mediul nconjurtor prin transport activ secundar.
Bacteria folosete ATP-aza de tip P pentru a pompa n afar ionii metalelor grele, precum
i Cd2+, Cu2+.
O r g a n is m T ip de R o lu l
sa u e s u t m em b ran
A TP-azele de tip P
Na esu tu ri Plasm M enine sczut N a , riclicind
anim ale K~ n interiorul celulei, creaz
potenial transm em branar
electrolitic
+ C elule acid-
secretorii Plasm A cidifiaz coninutul stom acal
(parietale)ale
m am iferelor
"1
Fungi Plasm C reaz gradientul FT pentru a
(N eurospora) dirija transportul secundar
+ Plante Plasm extracelular n interiorul celulei
superioare
F igura 3.16. Modelul tridimensional (a) i aranjarea spaial a cofactorilor n interiorul modelului
pentru proteinele centrului fotoreactant n bacteriile Rhodopsendomonas viridis (b)
Bolile mitocondriale
Mutaiile genelor care codific proteinele sau moleculele de RNA mitocondrial
cauzeaz bolile mitocondriale mult mai semnificative n patologia general, pe msura
evoluiei cunotinelor actuale despre funcionarea normal a mitocondriilor. Proteinele
mitocondriale pot fi codificate de gene nucleare (fiind importate n mitocondrii dup ce
au fost sintetizate n citoplasm) sau de gene din DNA mitocondrial. Bolile mitocondriale
pot fi cauzate de anomalii ale unuia din complexele din membrana intern (antrennd un
deficit energetic important), de anomalii aleribozomilor i ale biosintezei intramitocondriale
a proteinelor, de anomalii ale transporturilor din membranele mitocondriale etc.
Cele mai importante particulariti ale acestor afeciuni sunt:
a) transmiterea mendelian, dac mutaia afecteaz o gen nuclear;
b) transmiterea matriliniar (exclusiv pe linie matern), dac mutaia afecteaz o gen
a DNA mitocondrial, deoarece DNA mitocondrial este transmis pe linie matern;
c) segregarea replicativ, care const n repartiia aleatorie a mitocondrii lor afectate
i ale celor nonnale n unna diviziunii celulare, ceea ce antreneaz un mozaicism tisular
(exprimarea difereniat a simptomatologiei n funcie de esut sau chiar n cadrul aceluiai
esut);
d) acumularea progresiv a mutaiilor n DNA mitocondrial ca urmare a atacului
radicalilor liberi produi prin funcionarea lanului respirator. Dup atingerea unui anumit
nivel al anomaliilor induse de radicalii liberi, apare expresia clinic a afeciunii, n primul
rnd n organele dependente de un aport constant de energie (miocardul, muchiul scheletic,
sistemul nervos).
Citopatiile mitocondriale
Anomaliile sau deficitul total al proteinelor din lanul respirator sunt denumite genetic
citopatii mitocondriale. Acestea sunt cauzate de deficitul ereditar al unuia dintre
complexele enzimatice respiratorii. Simptomatologia debuteaz precoce, nc n perioada
neonatal n cazul deficienelor grave sau, ulterior, n cazul n care activitatea enzimatic
rezidual pennite sinteza unui numr mic de molecule de ATP. Tabloul clinic depinde de
gradul de afectare a mitocondriilor din diferite esuturi, deoarece nu toate celulele aerobe
sunt n egal msur purttoare ale anomaliilor mitocondriale. esuturile cele mai afectate
sunt cele cu necesiti energetice maximal, n primul rnd sistemul nervos, miocardul i
muchiul scheletic. Frecvent, pacienii prezint semne de encefalopatie metabolic,
cardiomiopatii, hipotonie sever, steatoz hepatic, insuficien renal, etc. Pe plan
bioumoral predomin acidoz lactic consecutiv inhibrii retroactive a ciclului Krebs i
conversiei piruvatului n lactat. O alt modificare caracteristic este accentuarea
cetogenezei cauzat de creterea nivelului cetonemiei i a raportului -hidroxibutirat/
acetoacetat (deoarece -hidroxibutirat dehidrogenaza este activat la creterea raportului
NADH/NAD+).
Cele mai frecvente afeciuni cauzate de disfuncii ale proteinelor sau ale RNA
mitocondrial sunt:
a) sindromul OXPHOS care reunete afeciunile cauzate de disfuncia unuia dintre
complexele lanului respirator;
b) sindromul MERRF, afeciune neurodegenerativ produs de prezena unei mutaii
n gena mitocondrial care codific tRNA-Lys, ceea ce condiioneaz perturbarea
biosintezei tuturor proteinelor mitocondriale;
c) sindromul MELAS, afeciune neurodegenerativ fatal, produs de prezena unei
mutaii n gena mitocondrial pentru un alt tip de RNA de transfer (tRNA leu)-UUR.
Anomaliile mitocondriale secundare
Anomaliile mitocondriale secundare sunt cauzate de diminuarea aportului tisular de
oxigen (anoxie sau hipoxie n insuficienele respiratorii ori cardiocirculatorii severe) sau
de intoxicaiile cu ageni care blocheaz complexele mitocondriale. Drept exemplu ar
servi monooxidul de carbon sau cianurile care blocheaz ireversibil complexul IV, prin
stabilizarea formei fierice a ionului de fier.
Sistemele - navet de transport al echivalenilor de reducere
Este evident c NADH++H +care se produce la nivelul mitocondriilor, se reoxideaz
prin ptrunderea n lanul respirator. Dar care este soarta celui ce genereaz n citoplas
m, doar mitocondriile intacte sunt impermeabile pentru NAD(P)? Reoxidarea va de
curge pe ci indirecte denumite sisteme navete, fiind indispensabile de funcionarea
cilor metabolice citozolice. Prin membran vor fi transferai nu NADH, dar numai
electronii lor. Primul mecanism e naveta glicerol-fosfat, ce opereaz n ansamblu
astfel: NADH i H+rezultat din di verse reacii de reducere din citoplasm se asociaz
cu apoenzima specific, fonund glicerol-3-P-dehidrogenaza (fig.3.17). Drept acceptor
servete DI 1AP (dihidroxiacetonfos-
fatul - intermediar glicolitic). Mem Glicoliz
brana extern mitocondrial este Glicerol I
permeabil pentru glicerol-3-fosfat NAD' 3-fosfat NADH + H*
care difuzeaz cu uurin n spaiu dehidrogenaza >
\^ c ito z o lic ).^ /
intermembranar. Pe suprafaa extern
a membranei interne mitocondriale
este lo c aliza t G -3-P -D H Glicerol 3-fosfat Dihidroxiacetonfosfat
mitocondrial, care - 1 reoxideaz
(glicerolfosfatul) nDHAP, iar cei
doi atomi de H sunt preluai de coen-
zima acestei enzime de tip flavinic
(FP). Hidrogenii sunt preluai la
aceast enzim prin intennediul CoQ
n lanul respirator. DHAP revine n
citoplasm i suita de reacii se reia.
Mecanismul menine n citoplasm F igu ra 3.17 Mecanismul-navet glicerol 3-fosfat
o concentraie necesar de NAD'.
Proccsul e deosebit de activ n muchii scheletali i creier.
E mai complicat mecanismul de transfer al H+la naveta malat- aspartat (fig.3.18).
In schema rcspectiv, 2,5 indic sisteme de transfer al aminoacizilor, dicarboxila-
ilor. Accst mecanism funcioneaz intens n inim, ficat, rinichi. Astfel, se asigur
reoxidarea NADH citozolic i reglarea cuplurilor NADH/NAD+ extra i intra
mitocondriale. Naveta dat cedeaz electroni n lanul respirator, formnd 3ATP.
Naveta malat-aspartat nclude urmtoarele sisteme enzimatice i de transport:
- malat dehidrogenaza (MDH) cu izoformele sale-citozolic i mitocondrial;
aspartatamino transferaza (AST), de asemenea citozolic i mitocondrial;
- transporttorii, care funcioneaz ca sisteme antiport - malat-cetoglutarat i
aspartat - glutamat.
Echivalenii reductori (NADI H H+) citozolici sunt preluai de MDH i utilizai pentru
reducerea oxaloacetatului n malat. Ultimul este transportat n mitocondrii i retransfonnat
n oxaloacetat graie aciunii MDH mitocondriale. NADH+H+mitocondrial este preluat
NAD*
NAD M alat
M a lat ^
NAD1 dchidrogcna NA DH
M alat
dehidrogenaza
Oxaloacetat O x a lo a c e ta t
Clutamat G utamat
oc-cetoglutarai a-cetoglutarat
A sp a rta t-
A sp a rta t-
am ino transferaza
arnino tran sferaza
S p a iu l
intermembranar M a trice (N)
P.Mitchell J. E.Walkcr
c a p i t o l u l IV. GLUCIDELE I METABOLISMUL LOR
STRUCTURA. PROPRIETILE. FUNCIILE
Glucidele reprezint axa metabolic n regnul vegetal, pentru sinteza crora se utilizeaz
energia luminii. Ele reprezint forma de existen a majoritii organismelor,
deoarece glucidele de felul zahrului, amidonului sunt sursa principal de calorii necesare
omului adult, tuturor animalelor i multor bacterii.
Glucidelor le revine funcia fundamental de aprovizionare cu energie i carbon a
celulelor incapabile de fotosintez, iar unele, ca amidonul i glicogenul, reprezint rezerva
de glucoz.
Polimerii glucidici insolubili ndeplinesc funcii structurale n pereii celulari ai bacteriilor,
plantelor, n esutul conjunctiv i n membranele celulare animale.
Un alt tip de glucide servesc la interaciunea celulelor, determinnd specificitatea
biologic a suprafeelor celulelor animale. Glucidele sunt componente ale acizilor nucleici.
Majoritatea reprezentanilor acestei clase de substane organice sunt compui ai
carbonului interacionat cu apa (CFfO)n. Exist ns i glucide care nu respect acest
raport, iar unele dintre ele conin atomi de azot, fosfor sau sulf.
n funcie de comportarea lor la hidroliz, glucidele se clasific n:
1 ) oze - monozaharide, glucide nehidrolizabile, substane incolore, solide, cristalice,
uor solubile n ap, de regul, dulci. Baza lor reprezint un lan neramificat de atomi de
carbon legai ntre ei prin conexiuni ordinare. Unul dintre aceti atomi e fixat printr-o
legtur dubl cu 0 2, formnd grupa carbonil. La ceilali atomi dc carbon e adiionat
grupa hidroxilic. n funcie de natura grupei i carbonul pe care l conin, deosebim
aldoze (C =0 la captul terminal, ca grup aldehidic) i cetoze (C = 0 n orice alt
poziie). Dup numrul diferit de atomi de carbon n molecula lor distingem: trioze,
tetroze, pentoze, hexoze etc.( vezi pag. 215).
2 ) ozide - glucide care prin hidroliz pun n libertate una sau mai multe molecule de
oze (holozide); unele din ele elibereaz un compus n plus de natur neglucidic
(numit aglicon) i se numesc heterozide (glucozide).
Fiecare monozaharid exist n dou forme, alctuind n natur aldo- sau cetofor-
ma. Cele mai rspndite sunt hexozele (D-glucoza, D-fructoza). Aldopentozele (D-
riboza i 2-dezoxi-D-riboza) sunt componente ale acizilor nucleici.
Toate monozaharidele, cu excepia dihidroxiacetonei, posed unul sau mai muli
atomi chirali de carbon i se atest sub form de izomeri optici activi: gliceraldehida
conine un atom chiral i poate fiina n fonn de doi stereoizomeri; aldohexozele au 2 4,
adic 16 izomeri. Stereoizomerii se deosebesc prin modul n care rotesc planul luminii
polarizate, denotnd aceleai proprieti fizice i chimice. Stereoizomerii se numesc
enantiomeri i sunt situai unul fa de cellalt, la fel ca reflectarea oricrui obiect n
oglind. Prin convenie, ei au fost desemnai D i L. Configuraia absolut a celor patru
substitueni n jurul carbonului asimetric stabilit prin studii de difracie a razelor X
este redat prin formule de perspectiv i plane; ca compus de referin este luat
gliceraldehida (GA):
H 0 H 0 H 0
V1 V
1
V
H -C -O H H -C -O H H O -C -H
L 1.
H -C -O H H -C -O H
CH2OH 1
CH2OH CH20H
D-gliceraldehida D-eritroza D-treoza
Pe n t oze
D -a ld o z e
(a)
V I.
V V L
V
H O -C -H
H -C -O H H O -C -H H -C -O H
I. L I.
H -< p -O H H-Cf-OH H O -C -H H O -C -H
I. I.
H -C -O H H -C -O H -- H -C -O H
I I I I
CH2OH CH2OH CH20 H CH2OH
H(: - oh
H
V1
HO-(3-H
- c - - HO-C-H H-C-OH HO-C-H
h - c'- oh H-C-OH HO-C-H HO-C-H H-C-OH H-C-OH H0-(: - h H 0-(3-H
H-i'-OH H-C-OH H-C-OH H-y-OH HO-C-H HO-C-H H0-(
rH HO-(H
H-O-OH H-C-OH
I H-C-OH H-C-OH H-C-OH
1
CH2OH
H-C-OH
CH2OH
1
H-<3-0H
<: 2
h oh
H-<p-OH
<20
CH2OH CH2OH CH20H CH20H
D-alloza D-altroza D-glucoza D-manoza D-guloza D-idoza D-galactoza D-taloza
Treoze Tetroze P en t o z e
CH2OH C H 2OH
CH2OH CH2OH !
A to m ii d e c a r b o n I I C=0 C=0
m ai accentuai p rezin t c= o c=o I
centre chiralice I ! H - C OH H O -C -H
CH2OH H- -C -O H I
I H - 9 -O H H -C -O H
CH2OH I
CH2OH CHaOH
Dihidroxiacetona D-eritruloza D-ribuloza D-xiluloza
Hexoze
CH2OH CH2OH CH2OH CH2OH
I I
C=0 C=0 L o A=o
I
- i H O -C -H H -C -O H H O -C - -H
I I
H -C -O H H -C -O H H O -i-H H O -C - -H
I I I
H - C OH H -C -O H H -C -O H H -C -O H
D -c c to z e I I ?- !
CH2OH CH20H CH20H CH20 H
(b) D-psicoza D -fru cto za D-sorboza D-tagatoza
I!
- -
-
2 2
D - GA L - GA
Multe aldoze posed civa centri chiralici. Astfel, s-a stabilit c seriile D i L vor
confirma configuraia atomului maximum asimetric, deplasat de la atomul de carbon
al grupei carbonilice, dar nu i sensul de rotaie + sau - al planului luminii polarizate de
ctre zahrul respectiv.
Monozaharidele, scheletul crora e compus din 5 i mai muli atomi de carbon, n
soluie capt forma de structuri ciclice nchise, n care grupa carbonil formeaz o
conexiune covalent cu una din grupele hidroxil legat cu atomul de carbon al lanului de
baz:
OH
O R 2
Gruparea hidroxil, aparut la fostul carbon carbonilic, este denumit hidroxil
semiacetalic sau glicozidic. Structurile monozaharidelor, coninnd cicluri de 5
atomi, se numesc furanozice (prin analogie cu heterociclul furri), pe cnd cele de 6
atomi se numesc piranozice (heterociclulpirari).
Pentru trecerea de la formulele liniare de proiecie la cele ciclice (de perspectiv) se
aplic urmtoarea regul: deasupra planului moleculei se indic grupele, ce se gsesc I
pe lng atomii de carbon n L-configuraie (cu excepia C-5 n piranoze i C-4 n fiiranoze);
mai jos - atomii de n D configuraie. Pentru lanul lateral, pe lng C-5 (piranoze) i
C-4 (furanoze), regula se inverseaz. Avantajul const n faptul c ele (grupele) pot fi
rotite n spaiu sub orice unghi, fr ca acestea s-i piard proprietile.
Ca urmare a reaciilor de ciclizare, fostul carbon carbonilic devine carbon asimetric, I
adoptnd dou configuraii sterice diferite - a i anomer. Stereoizomerul care are I
aceeai configuraie la -1 ca i ultimul atom asimetric ce detennin seria monozaharidului
(D sau L), este denumit a-anomer. Stereomerul de configuraie contrar al acestor
doi atomi e denumit -anomer. Reaciile de semiacetalizare sunt reversibile, forma
liniar carbonic se afl n echilibru cu diverse structuri ciclice posibile n soluiile apoase.
Cetohexozele fonneaz, n majoritatea cazurilor, inelul ftiranozic n poziia , cu legtura
semiacetalic. Aldohexozele, ns, pot forma atare inel care e mai puin constant dect
cel piranozic.
Proprietile chimice ale monozaharidelor sunt determinate att de gruprile
funcionale caracteristice, ct i de ansamblul catenei.
2 0 2
2
. 41 ---- r
2I
= 0
- D - fru c to fu ra n o z a
3I
Furan
2 Q
""C H 5 I N
W //
\4V /
2
H 62 f 1
D - fru c to z a
- D - fru c to fu ra n o z a
6,
2
} - \
/
I 4 \ 1
11
2I
P iran
/
- D -g lu c o p ira n o z a
2
---
6I \
2 4
.
1
D - g lu c o z a ^
- D -g lu c o p ira n o z a
COOH
I
(CHOH ) 5
COOH
A c id aldaric (glucozaharic)
Srurile acizilor gluconici sunt foarte solubile i pennit includerea n alimentaie a unor
elemente necesare ca fierul sau calciul. O form utilizat de calciu n medicin este
gluconatul de calciu, n care Ca44-previne hipocalcemiile i apariia tetaniilor, iar acidul
gluconic servete ca substrat energetic.
La tratarea monozaharidelor cu acizi minerali concentrai (HC1, H 2 S 0 4) i cuplarea
imediat cu diveri fenoli (reacia Selivanoff cu rezorcin), fructoza pierde trei
molecule de ap, transformndu-se n oximetilfurfurol
care, mpreun cu rezorcin, formeaz un compus rou- C H = N NHC 6 H 5
viiniu I
Condensarea unor monozaharide cu fenilhidrazina C = N NH Q H c
(C 6 H 5 -NH-NH2) formeaz ozazone, substane galbene, I
(CHOH ) 3
cristalizate. Monozaharidele identice dup C, i C 2
reprezint cristale identice (glucoz, fructoz). Galactoza CH2OH Ozazon
formeaz o ozazon distinct de glucoz.
Condensarea cu compui ce conin gruprile amino ale unor proteine este respon
sabil de formarea n organism a proteinelor glicozilate (hemoglobina, unele proteine la
diabet zaharat).
H -C -O H
I
H -C -O H H -C -O H
I I !
CH2OH CH2OH CH2OH CH2OH
D - glucoza D - sorbitol D - fructoza D - manitol
Reducerea monozaharidelor genereaz polioli. CH 2 OH
n organism reaciile sunt catalizate de enzime NAD-
dependente. Glucoza i fructoza se reduc la D-sorbitol,
galactoza - galactitol.
Un important poliol este i ribitolul, derivat al - - O '
ribozei, un component al vit. B,. Compui rspndii n
regnul vegetal sunt sorbitolul, manitolul i galactitolul.
0-
D -g lu co zo -1-fosfat
n organizmele vii este prezent inozitolul att n stare
liber, ct i fosforilat sau ca un component al fosfolipidelor, esterul hexafosforic al su
(acidul fitic) fiind prezent n plante i servind drept o surs veritabil de fosfat. Srurile
sale de calciu i magneziu se
c h 2o h CH2OH numesc fitin.
O etap im p o rtan t n
meninerea ozelor n celul i n
metabolizarea lor este procesul de
esterificare cu acid fosforic.
La interaciunea gruprilor
se m ia c e ta lic e , ce fo rm eaz
glicozidele. n soluie, exist numai
o singur form ireversibil ( a sau
D -acetilglucozam in O ). Gruparea semiacetalic se blo
ch eaz. D eriv ai de n a tu r
glicozidic sunt oligozaharidele i polizaharidele. Reacia cu o component
neglucidic (aglicon) conduce la O-, S-, N- glucozide. Ultimele, componenta monoza-
haridic a crora constituind-o D-ribo- sau D-dezoxiribofuranoza i agliconul - baz
azotat, sunt nucleozidele. Mucopolizaharidele coninglucozamina i galactozamina,
N-acetil glucozamina. Glucozamina se afl n antibioticul streptomicina (n forma N-
metilat). O aminoglucid mai complex, format dintr-un rest de acid piruvic i alte
resturi de monozoamin este acidul neuraminic - o component esenial a glicolipidelor
i glicoproteinelor. n glicozidele cardiotonice, drept aglicon servete compusul steroidic.
R- ,
H -C -O H
I
H -C -O H
I
CH2OH
,CH2OH CH2OH
N-acetilglucozamina 6 Acidul -N-acetilmuramic
o -O
5
4
OH o.
/I CH3
NH O N H C = 0
0= C - C H 3 H3c C H - C = 0
M ureina A -B -C -D
o c C,H,
Amigdalina CN
Laetrele
3Na+
2Na+
N a+, K +- ATPaza
" \ Glucoza
Sim portorN a
E O
C H 20 - P = 0 E
O 6 CH2OH6 2-
C H 2O H C H 20
5X----- o
2-
Convertirea G -l-P n G-6-P I]O 2 O ~PO 3
OH OH
G-l-P E O G -l, 6-diP
E
6 2- I. 6 2
C H 20 C H 2O - P O 3
o
) n ficat G'6-P (ester Robinson) este hidrolizat sub aciunea enzimei glucozo-6-
fosfcitaz. Enzima se conine n rinichi i intestine.
G-6-P + H2.0 Glucoza + P I
Legtura a - 1,6
C a p tu l
reductor
G lucoz
a-glucozidaza
lizozomal
T ip II: B oala P om pe
(dcficit dc a-1,4 -glucozidaza lizozomal)
- dcfect nnscut dc enzima lizozomal;
- generalizat (ficat, inim, muchi);
- concentraii excesive de glicogcn n
C a p e t e le vacuole anormale din citozol;
nereductoare - valori normale ale zahrului sanguin;
- cardiomegalie sever, de regul,
cu moarte timpurie;
- structura glicogenului este normal.
T ip V: S in drom u l M cA rdle
(deficiena glicogen fosforilazei din muchii sche
letici)
- muchiul schclctal este afectat, enzima
hepatic este normal;
- slbiciune temporar i crampe ale muchilor
scheletali dup efort;
- lactatul nu crete n snge n timpul unui efort
Glicogcn fosforilaza marc;
- dezvoltare mental normal;
- mioglobinuric la vrst naintat;
- pronostic bun;
G lucozo-1 -P - n muchi nivel crescut de glicogen cu structur
normal;
i
V V
Dextrine limite
* V*
:V
V* Debrancing enzim
Glicozil transferaza
20 ..
Ami lo( 1:6) ------- Debrancing
glucozidaza ^ enzima
Glucoza
Q . 1
E ste
^ e lib e ra t
Gluco:
n snge
F igura 4.4. Schem atic e redat degradarea glicogenului cu dereglrile respective
1
defosforilate. Controlul metabolic variat i complex este realizat att prin reglarea cova-
lent, ct i prin cea alosteric. S-a stabilit c: G-Fa e activ n forma fosforilat i G-Fb
e mai puin activ defosforilat, pe cnd G-Sa e activ n forma defosfori lat i G-Sb
mai puin activ - fosforilat.
G licozo - 6-fosfat
F osfogluco m utaza
y j i r o f o l f o rilaza UD P-glucoza
Glicogenira
(UDP# >
HO'
Glicogcn
PPi
in iiato r
UDP
HOH A tsin ta z a
Pirofosfataza
2Pi
UDP -
G licogen sintaza
L e g tu ra a - 1,6
UDP
Interconversia celor dou forme ale G-F se realizeaz graie aciunii antagoniste a
dou enzime: glicogenfosforilaz kinaza i glicogenfosforilazfosfataza. Kinaza fos-
forileaz restul de serin n centrul activ al G-Fb, cu ajutorul ATP. Fosfataza scindeaz
hidrolitic P de la G-Fa.
Glicogen fosforilaz kinaza (G-F-K) reprezint o enzim constituit din 4 tipuri de
subuniti, fiecrei fiindu-i proprii 4 copii. Subunitateay- subunitate catalitic; a - -G
au funcii reglatorii; e reprezentat de calmodulin - protein ce fixeaz Ca2+i care, n
funcie de concentraia citoplasmic a acestuia, i modific conformaia.
nsi enzima glicogen fosforilaz kinaza are dou forme interconvertibile: transforma
rea formei inactive n activ are loc prin fosforilarea realizat la a i , cu contribuia
ATP i a kinazei (Proteinkinaza dependent de AMPc). Se inactiveaz de ctre o
fosfoprotein fosfataza. AMPc e mesagerul secund format ca rspuns la aciunea
adrenalinei, glucagonului care stimuleaz activitatea kinazei (AMPc dependent), efectund
fosforilarea kinazei i activnd C-Fb, concomitent fosforilnd-o i accelernd scindarea
glicogenului. G-Fb n muchi e activat de AMPc (modulator pozitiv), iar ATP este
modulator negativ. Activitatea final e determinat de raportul AMP/ATP. Glicogen
fosforilaza a este AMP independent.
Studiul roentgencristalografic al ^ Cap. N terminal
form elor a i b ale glicogen *'" \ '"A Locusul de fostorilare
fosforilazei au favorizat perceperea Locusul de fixare 1 J *=/ _
mecanismelor catalitice i reglatorii ale . ^ , _ *
acestei enzime cardinale a metabolis
mului. S-a stabilit c 841 de resturi
de aminoacizi sunt aranjate compact n
3 domenii structurale: domeniul amino-
terminal (310); domeniul fixator de
glicogen (160) i carboxiterminal
(371). Centrul catalitic e localizat n
adncul subunitii formate din resturile
Centrul activ
aminoacide ale celor 3 domenii, fiind
aprat de mediul apos ce faciliteaz
predominarea fosforilrii fa de hidro- Figura 4.6. Imaginea schematic a carcasei
liz (fig.4.6). -carbonice din fosforilaza a
Vit.B 6 necesar pentru activitatea
enzimei se fixeaz n apropierea locului de fixare a G -1-P. Molecula enzimei nlesnete
un locus de fixare a glicogenului la o deprtare de 30de la centrul activ, ce favorizeaz
fosforilarea multor capete de glicogen, nedisociind i resociind dup fiecare ciclu
catalitic. Conine, de altfel, i dou locusuri alosterice de reglare la hotare ntre
subuniti (AMPc i locusul de fosforilare a serinei). Enzim se studiaz ncontinuu, dar
i n prezent se poate afirma c ea reprezint un integrator fin informativ al metabo
lismului energetic celular.
Proteinkinaza (PK) favorizeaz fosforilarea conform reaciei:
G-Sa + 2ATP G-Sb + 2ADP,
pe cnd fosfoprotein fosfataza (FPF) detaeaz fosforul, activnd sintaza:
G-Sb + 2H 2O - G-Sa + 2P I
Aceste dou enzime reglatoare ale glicogen sintazei sunt identice cu cele dou
ale glicogen fosforilaz kinazei. De aceea, enzimele se regleaz reciproc. O aciune
adiional ntreprins de celul pentru a evita desfurarea simultan a defosforilrii
i a fosforilrii const n inactivarea fosfoprotein fosfatazei de ctre o protein -
inhibitorul defosfataz, activ prin fosforilare AMPc dependent. Aceast fosforilare
este realizat, ns, cu reziduu de treonin, nu i de serin, ca n celelalte cazuri. Prin
ataarea inhibitorului de fosfataz la FPF este suprimat numai aciunea hidrolitic a
enzimei asupra reziduurilor de fosfoserin, nu i asupra celor de fosfotreonin. G-S se
regleaz de ctre modulatorii alosterici, G-Sb se activeaz de ctrc glucozo-6 -fosfat i
aceast form e denumit dependent.
Sporirea concentraiei de AMPc produs prin activarea adenilatciclazei (activat de
glucagon i adrenalin) activeaz proteinkinaza AMPc dependent ce efectueaz fos
forilarea simultan a G-F-K, G-F, G-S i a inhibitorului de FPF (ultimul inactiveaz
FPF), excluznd funcionarea simultan a celor dou enzime antagoniste (PK i FPF).
Procesul de glicogenoliz se va declana, suprimndu-se sinteza (fig. 4.7).
H ,0
G -Sa G-Sb
ATP ADP
FPF
O
Pi
G l(n ) _ A . G l( n - l) + G lu c o z o -l-P
OH
1
OH
+ ATP
Hexokinaza
HO
OH
' OH
OH
1
+ ADP + H
OH a-D-elucozo-6 -P
w
OH a-D-fhictozo-6 -P
Enzima fosfogluco izomeraza este o aldolaz, ce necesit prezena Mg2+ i
transform aldoza n cetoz. Grupa carbonil e transferat din poziia 1 n 2.
3. Fosforilarea fructozo-6 -fosfatului este reprezentat prin urmtoarea reacie:
a-D -F- 6 -P + ATP a -F -1,6 -diP + ADP + H+
Enzimafosfofructo kinaza catalizeaz reacia ireversibil care prezint un indice
important de control al glicolizei. Reprezint o enzim compus, inhibat de ATP, citrat,
acizi grai. Reacia decurge lent i determin viteza glicolizei, n ansamblu.
4. Scindarea fructozo-l,6 -bifosfatului n 2 trioze:
C H 20 C H = 0
C = 0 + Cc Hu
Oo H
I
Fructozodifosfat
aldolaza
C H 2O H C H 20
2-
OH
a -D -fru c to z o -l, 6-diP DHAP G A -3-P
2 -
C H 2O - P O 3
c=o Triozofosfat
Hc -
izomeraza 2.
C H 1 OH C H 2O - P O 3
DHAP G A -3-P
0 = (/ c o o ~ '
- - + NAD+ + Pi <--------- - - + NADH +
2 G ceraldehid I 2-
2 0 " fosrat dehidrogenaza CH 2 O
PO 3
GA3 P 1,3-DPG 1
P i= H 0 -P -0
!_
Mecanismul de aciune a dehidrogenazei complex:
a) adiia unei grupe SH din centrul activ al enzimei la
gliceraldehid-3-fosfat, cu formarea unui semitioacetat (legtur covalent):
R -C f + E - S H ^ = ^ R -C H -S -E
XH I
OH
b) enzima transfer I de la substrat la NAD+, fixat rigid cu centrul activ. n urma
transferului apare complexul macroergic acilfosfat, care ulterior interacioneaz cu P
liber, genernd 3-P-G-P i regenernd enzima liber:
E SCHRE S ~ C R P ~ C R + E - S H
I ^ ^ - II II
OH NAD NADH + H o Pi
Enzima e compus din 4 subuniti identice. Fiecare lan polipeptidic conine 330
aminoacizi. Grupele SH pot fi legate de iodacetat (ICH,COOH) - inhibitor necompetitiv.
2) Fosforilarea la nivel de substrat (AG = -4,5kcal) este rezultatul transferului
restului fosforil pe ADP, reacie catalizat de fosfoglicerat kinaz:
COO' COO'
2+ I,
C H -O H Mg C H -0 -P 0 3
2- Fosfoglicerat nutaza
CH 2 0 PO 3 CH2OH
4) Enzima enolaza catalizeaz reacia reversibil de dehidratare. n cadrul acestui
proces are loc repartiia energiei n molecul:
f 00' 2_ Mg 2 + fo o - 2_
H -C -O -P O 3 ^ 4 - 'O
Enoaza )|
CH 2 OH H2 O H20 CH2
2-PG 2-P-enolpiruvat
corespunztoare. Aproape toate enzimele necesit ioni de M g'1, care fonneaz complexe
cu grupele fosfat n ADP, ATP, la fel ca i intennediarii glicolizei. O anumit specificitate
manifest fa dc complexele cu ioni de Mg^.
Soarta piruvatului. Piruvatul se afl la rscrucea drumurilor metabolice. Poate fi
utilizat n urmtoarele direcii:
1. La organismele aerobe e supus decarboxilrii oxidative - calea studiat mai sus.
Reacia sumar a degradrii este schematic redat n continuare:
G lucoza + 2P + 2A D P + 2NAD+
1
Obinerea unei cantiti mici de ATP eliberat rapid este avantajoas pentru necesitile
imediate de energie sau activitatea unor esuturi cu necesiti energetice minime. In esuturile
anaerobe, inclusiv i n ficat, acidul lactic este transformat n acetil-CoA i utilizat ca
substrat n ciclul Krebs.
3 .0 alt cale de metabolizare este sinteza etanohtlui. Unele microorganisme, de
exemplu drojdiile, fermenteaz glucoza la fel pn la piruvat. Apoi:
a) Piruvat + HOH ^ CH 3 ~ C H = 0 + C 0 2
Enzima epiruvat decarboxilaz (Mg2+, TPP). Reacia n celul e ireversibil. Enzima
nu se conine n esuturile animale.
b )C H 3- C H = 0 + NADH + H+ = = CH 3 CH,OH + NAD+
Enzima reaciei este alcool dehidrogenaz. n 1856, Louis Pasteur a argumentat
fermentaia zahrului n alcool, prin aciunea microorganismelor. n condiii sterile,
fermentaia nu are loc. De pe bobiele de poam proaspete s-a izolat cultura de drojdie
i s-a determinat c ea e responsabil de fermentaia sucului. Transformarea vinului n
oet e cauzat de alte microorganisme.
Reglarea glicolizei. Viteza reaciilor catabolice principale ce asigur scindarea
glucozei i utilizarea energiei chimice sub fonna de ATP, n fiecare moment se regleaz
n corespundere cu necesitile celulei n ATP, indiferent de calea n continuare a
utilizrii ATP - biosinteza, transfer activ sau lucru mecanic. Enzimele reglatoare percep
diferite semnale ale cilor metabolice i sunt receptive la ele.
Prima reacie reglatoare (1) e catalizat de hexokinaza ce fosforileaz glucoza
liber cu ajutorul ATP n poziia 6 . E o enzim alosteric ce se inhib de G- 6 -P.
Glucokinaza ficatului nu se inhib, i surplusul de glucoz e transfonnat prin G -1-P n
glicogen. In condiii normale, insulina stimuleaz sinteza glucokinazei. n inaniie i diabet,
activitatea glucokinazic e redus.
Reglarea major (2) a glicolizei e determinat de activitatea fosfofructo kinazei, enzi
m alosteric conjugat, reglat dc un numr suficient de modulatori pozitivi i negativi.
Activitatea ei e dependent de concentraia substraturilor (ATP i F-6 -P), produselor
(ADP i F-l- 6 -diP). Sunt semnificativi AMP, citratul, Mg2+, fosfatul i ali metabolii.
Principalii modulatori negativi sunt ATP i citratul, pozitivi - AMP, F -1,6 -diP.
Ca rezultat al aciunii alosterice, viteza reaciilor crete de sute de ori la trecerea
muchiului din stare de repaus n stare activ. Cu alte cuvinte:
1 ) stimularea glicolizei are loc n condiiile unei sarcini energetice mici n celula ce
solicit energie;
2 ) coninutul mare de citrat, ca o consecin a surplusului de compui ce joac rolul
O alt reacie reglatoare e cea piruvat kinazic (3). Piruvat kinaza este o enzim
alosteric. Se afl n trei izoforme, ce difer dup repartiia lor n esuturi i receptivitatea
la diferii modulatori. L-forma predomin n esuturi capabile de gluconeogenez (ficat,
rinichi). Enzima e inhibat i de alanin. n condiii de aprovizionare suficient cu
energie i precursori de glucoz, glicoliza se inhib crend o situaie favorabil
gluconeogenezei. Este inhibat de ATP, acetil-CoA, acizi grai cu greutate molecular
mare. M-forma nu posed o atare reglare.
Glicoliza se regleaz subtil, foarte complicat i nu e de mirare, deoarece reprezint
cea mai veche cale metabolic, fiind una din poziiile principale. Glicoliza, ciclul
Krebs, fosforilarea oxidativ sunt coordonate ntre ele, funcionnd n regim de
autoreglare i economie maxim. n celulele cancerigene e dereglat coordonarea lor
i glicoliza e accelerat, formnd mult lactat.
Patologiile medicale
Mutaiile la nivelul genei pentru glucokinaz cauzeaz apariia unei boli monogenetice,
cu debut precoce: diabetul zaharat de tip MODY-2. Diminuarea activitii glucokinazei
cauzeaz scderea fluxului glicolizei n ficat i pancreas, care determin creterea glicemiei
i hipersecreia reacionat de insulin. Cu toate acestea, nivelul insulinei sintetizate de
ctre pancreas este mult diminuat, ca urmare a deficitului energetic la nivelul celulelor
beta ale pancreasului.
n ficat are loc diminuarea glicogenogenezei i amplificarea gluconeogenezei, ca
rspuns la reducerea ratei glicolizei. Aceste perturbri explic hiperglicemia persistent
observat la pacieni.
Deficitul piruvat kinazei cauzeaz blocarea ntregului flux al intermediarilor la nivelul
glicolizei. Manifestrile clinice constau n apariia unei anemii hemolitice ereditare, datorit
imposibilitii desfurrii glicolizei n eritrocite.
Enolaza este inhibat sub aciunea fluorurii de sodiu, care acioneaz ca inhibitor
competitiv, blocnd glicoliza i producerea acidului lactic n hematii. Cu toate c structura
NaF nu seamn cu cea a 2-fosfogliceratului, se consider c efectul inhibitor se datoreaz
formrii unui complex ntre fosfat, Mg2+i NaF, care blocheaz accesul substratului la
centrul activ al enzimei. Acest inhibitor este utilizat frecvent n laboratoarele clinice,
deoarece permite dozarea corect a glicemiei, prin blocarea utilizrii glucozei plasmatice
de ctre eritrocitele prezente n proba recoltat. n caz contrar, consumul glucozei i
producerea acidului lactic n hematii conduc la rezultate incorecte n cursul dozrilor
efectuate.
Deficitul piruvat dehidrogenazei sau blocarea lanului respirator mitocondrial
antreneaz acumularea excesiv a acidului piruvic provenit din glicoliz. Acesta va fi
convertit n acid lactic sub aciunea lactatdehidrogenazei. Creterea nivelului de acid
lactic n circulaie determin apariia acidozei lactice, care poate fi primar sau secundar.
Deficitul ereditar al lactat dehidrogenazei cauzeaz apariia unei miopatii metabolice,
manifestat prin reducerea nivelului seric al lactatului i intoleran la efort fizic.
Distribuia izoenzimelor tisulare de LDH este variabil. LDH, i LDH2 sunt principalele
izoforme n inim, rinichi, creier i eritrocite. LDH 3 i LDH4 sunt predominante n glandele
endocrine (tiroida, suprarenale, pancreas), splin, timus, leucocite, trombocite. LDH^ i
LDII5 preponderent se afl n ficat i muchii scheletali. Distribuia normal a izoenzimelor
LDH n serul sanguin este urmtoarea:
L D H ,< L D H 2> L D H 3> LDH4 <=> LDH,
n infarctul miocardic crete att LD H ,, ct i LDH2, dar LDH, > LDH2. Se constat
creterea LDH 3 cu predominarea fa de LDH, n maladiile neoplastice, limfoproliferative
i ale trombocitelor. LDH, i LDH 3 se majoreaz n infarctul pulmonar. Valori majore
ale LDH, se depisteaz n afeciunele ficatului i muchilor scheletali.
Acidoza lactic constituie un sindrom metabolic caracterizat prin acumularea acidului
lactic n snge (valori care depesc 5 mmol/L), concomitent cu scderea pH-ului sanguin
sub 7,2. Cele mai frecvente cauze care duc la apariia acidozei lactice sunt:
a) deficitul ereditar al piruvat dehidrogenazei sau carena de vitamina B,;
b) imposibilitatea regenerrii formei oxidate a coenzimei NAD+la nivelul lanului
respirator mitocondrial, prin deficitul unuia din complexele lanului transportator de electroni
sau prin blocarea fosforilrii oxidative;
c) producerea exesiv de NADH, de exemplu n caz de intoxicaie cu alcool;
d) blocarea utilizrii acidului lactic pentru gluconeogenez n caz de deficit al enzimelor
gluconeogenezei, de exemplu deficitul piruvat carboxilazei, responsabil de iniierea
gluconeogenezei, deficitul glucozo-6 -fosfatazei;
e) accentuarea marcat a glucozei anaerobe, de exemplu n caz de efort fizic prelungit.
Acidoza lactic secundar se ntlnete n toate situaiile caracterizate prin hipoxie
sau anoxie prelungit, oc, hipoperfuzie, insuficien cardiovascular, precum i n carenele
de vitamin B,.
Tratamentul const n mrirea ratei de perfuzie tisular, respectiv administrarea vitaminei
B,. Se depisteaz o acidoz lactic i a altor acizi organici la pacienii cu afeciuni ale
intestinului subire (malabsorbia, bypass jejunial, rezecia intestinal). D-lactatul este
produsul bacteriilor anaerobe, care apoi, prin via portal, este vehiculat n circulaie. n
terapia acestor maladii se vor utiliza antibioticele, se va limita folosirea carbohidraiilor i
e necesar recolonizarea florei bacteriene.
Acidoza primar va aprea la deficitul uneia din subunitile piruvat dehidrogenazei
i se manifest nc n perioada neonatal prin creterea marcat a acidului lactic n
circulaie (mai mare dect 5mmol/L) i deficit energetic tisular, n special n organele cu
activitate metabolic intens (insuficien hepato-renal, encefalopatie metabolic, etc.).
Tratamentul vizeaz administrarea substanelor nutritive de natur lipidic, a cror oxidare
este independent de complexul piruvat dehidrogenazic.
Cile alternative de degradare a glucozei. Calea pentozo-fosfailor (untul
pentozo-fosfat - HMS)
Premisa biologic primordial, la care etapele oxidative sunt catalizate de dehidro- .
genazele NADP dependente, este producerea NADPH necesar biosintezelor reductive. I
Se desfoar n fracia citoplasmatic, consumatorul major fiind biosinteza acizilor *
grai, proces localizat de asemenea n citoplasm, ca i biosinteza colesterolului,
hormonilor steroizi, hidroxilarea unor compui strini organismului. Reducerea
glutationului, care are importan major pentru meninerea integritii enzimelor tiolice
i prevenirea peroxidrii lipidice, se realizeaz pe seama NADPH, cofactor al glutcition
reduc tazei (GR):
GR
GSSG + NADPH + H+ - -0 ^ 2GSH + NADP+
a) H
1ll1
- o=c
2
Hc OH
I
H O -C -H o + NADPH + H
H -C -O H
5I
H -C
6 1 2-
CH 2 0 - P 0 3
Glucozo-6-fosfat (-anomer) 6-fosfogluconolacton
Activitatea ultimei enzime (E?) e inhibat de fructozo-l,6 -diP, substrat al glico-
lizei, iar 6 -fosfogluconatul, substratul ei, este inhibitor al 6 -fosfogluco izomerazei.
b)
o --------- 0 = C - 0H
I I
- - 2+
H - OH
E 2 Mg' I
H O -C -H + H 2O Lactonaza
H O -C -H + H
! I
H -C -O H H - C -O H
I
H - C -------- H - OH
2 - 2-
C H 2 0 -P 0 3 C H 2 0 -P 0 3
6-fosfogluconolacton Acid 6-fosfogluconic
c)
0 = c OH 0 = C - 0H
I I
H- OH H OH CH20H
F - 6 -P R ibozo 5 -P
* l'
I II
F - 1 ,6 - diP- D H AP - GA - 3
2 Lactat
Cys46- G -
NADPH * FAD ^ I I - 2 GSH
Cys4,_ S G S
HO O- O'
OH
U D P-glucoza
H ,0 . , 2 NAD
N
. / -UDP-glucozo- 0
. 1dehidrogenaza
\ ^ 2 N A D H + 2z.H
r^ N H
/ 5 ------ \ 0 0 I
\? 2 0- - 0- - 0 - N ^ o
3 I I ' \
O' O'
UD P-glucuronat
HO
Glucuronil transferazele sunt enzime inductibile. Imaturitateasau deficienele genetice
ale acestor enzime duc la perturbarea proceselor de detoxifiere.
b) UDP glucuronatul este donator de glucuronil n sinteza polizaharidelor acide
(proteoglicani - glicozoaminglicani).
Forma activ a acidului glucuronic poate fi hidrolizat conform reaciei:
UDP-glucuronat + H20 ---- - Acidul D-glucuronic + UDP
c) acidul glucuronic activat se conjug cu hormonii tiroidieni n hipertiroidism, la un
nivel sczut de hormoni tiroidieni are loc hidroliza acestor compui, cu eliberarea
hormonilor activi.
= C O '
0 o= c
2I I
H O -C -H HO- H
H4 H 2o I o
HOCH HO -C-H 1/202 VH -,0
4-
H Aldonolactonaza
I
H - C ---
Z
Gulonolacton oxidaza
5I
HOC H H O -C -H
6 l I
CH2OH CH2OH
L-gulonat L -gulonolacton
o=c- o= c- o=c-
0 >= 4
I
HO- o=i
o o
HO- H
Spontan
- -H
o=i 0
I I +H
H-C-- H - C ------- H-i-
HO- H HO i - H O -C -H
I
CH2OH Ah 2o h CH2OH
2-ceto-L -gulonolacton L-acid ascorbic A cidul dihidroascorbic
Patologiile medicale
a) Intoleran ereditar lafructoz numit i otrvire cu fructoz se caracterizeaz
prin absena aldolazei B, care conduce la acumularea intercelular a fructozo-1 -fosfat.
Ultima inhib G-6 -fosfataza i glicogen fosforilaza i, prin urmare, glucoza este depozitat
n ficat ca ester fosforic, ceea ce explic hipoglicemia sever, voma, icterul i hemoragia.
Poate provoca insuficien hepatic.
b) Fructozuria este provocat de deficiena ereditar a fructokinazei, ce conduce la
acumularea fructozei n snge. Metabolismul fructozei i dereglrile respective sunt
reproduse n fig. 4.12.
Triacilgliceroli
vrst.
Apoi are loc interconversia celor 2 oze, conform: HO
3) UDP-Gal =?== UDP-glucoza
E nzim a U D P -g lu co zo -ep im era z (C u2+)
catalizeaz aceast reacie. Echilibrul este dominat de Gal-1-P OH
necesitile organismului n componentele ei. n
perioadele de lactaie, de formare a structurilor glicolipidice echilibrul e favorabil form
rii galactozei. Reacia precedent confirm c galactoza nu e obligatorie n raia alimen
tar. UDP-glucoza poate fi precursorul imediat al sintezei de glicogen.
4) UDP-glucoza + PP. = G -l-P + UTP
Enzima e UDP-glucozo-pirofosforilaza ce scindeaz UDP-glucozlaglucozo-1-
fosfat, care, graie unei mutaze (fosfogluco-mutaza), ulterior conduce la:
5) G -l-P G- 6 -P
Cile de utilizare a glucozei-6 -fosfat sunt variate (vezi fig.4.13). CH2OH
Patologiile medicale I
H- -C OH
a) La insuficiena enzimei UDP-a-glucoz-a-galacto-1 -P-
uridil-transferaz are loc acumularea n snge a Gal-l-P. HO H
Consecinele sunt nefavorabile pentru organism: mrirea ficatului I
H O -C -H
i a altor organe, afeciuni ale vzului (cataract), dereglri mentale.
Modificrile menionate sunt rezultatul acumulrii de Gal-l-P toxic HC OH
i a galactitolului - cauza direct a cataractei. Dereglrile au loc I
mai ales la copii, de aceea, reducnd sau eliminnd complet laptele CH2OH
Galactitolul
din raie, scad simptomele patologice.
b) Galactozemia i galactouria este provocat de deficiena galactokinazei ce
conduce la acumularea galactitolului, dac n diet este prezent galactoza:
c) Aldozreductaza - enzim prezent n ficat, esutul nervos, veziculele seminale, nu
este important din punct de vedere fiziologic n metabolismul galactozei, dac nivelul
galactozei nu este ridicat.
d) Intolerana la lactoz este de trei tipuri: copii prematuri (deficit congenital); dcficit
care apare n rezultatul ndeprtrii chirurgicale a unei pri din intestinul subire; deficit
G licoliz Calea uronic v ii r
G liccrol HM S
\ / '
A cid glucuronic
/
A cizi grai
\ D etoxifiere
Procese biosintetice
CPD A cid piruvic- Pentoze (C olesterol, acizi grai)
A cizi nucleici
C oenzim e
Ciclul Krebs
R ibonuclcotide
V \
^2C 02 A m inoacizi
3NADH + 3H+
FADHj Proteine
GTP
F igura 4.13. Diverse ci metabolice ale glucozo-6-fosfatului
Lanul respirator
H20
12 ATP
G lu co zo -6 -P
G licolip id e U D P -g lu co za
Gluco/.o-6-fosfataza
G licoproteine
G licozam in glican i
Glicoliz G lu coza
CH 3
HCOH + N A P 4 Lactat dehidrogenaza^ + NADH + J-[
I - I
COO COO
Lactat Piruvat
^Pancreas
ilucagqnul
Hcogen
rt
Glucoza' ^Glucoza
! \
Piruvai Piruvat
Acizii grai nesaturai conin una sau mai multe legturi duble etilenice care, ca
regul, ocup poziia ntre C9 i C| 0 -cis-A9.
Legturile multiple duble, se situeaz ntre atomul C9 i grupa CH3, nefiind cuplate,
dar cu interferena grupei metilenice:
CH 3 - ( C H 2)4- C H = C H -C H 2- CH = C H -(C H 2 ) 7 -C O O H .
3) nervonic cis-A9.
Cu 2 legturi duble n molecul:
Acidul linoleic C | 8 .,cis-A9, A1- ;
Cu 3 legturi duble:
Acidul linolenic C , g .3 cis-A9, A12, A15;
Cu 4 legturi duble:
Acidul arahidonic C2 0 4 cis-A5, As, A11, A14.
Proprietile. Proprietile acizilor grai i ale lipidelor, servind drept constitueni, n
mare msur depind de lungimea catenei acidului i de gradul de nesaturaie. Acizii
grai nesaturai au o TC de topire mai joas dect cei saturai cu lungime similar a
catenei (acidul stearic - 69,6C, oleic - 13,4C, acidul linoleic - 5,8C). Lungimea
catenei influeneaz asupra TC de topire. Acidul palmitic (C]6) arc o TC cu 6,5 mai
mic dect a celui stearic ( ). Cu alte cuvinte: lungimea mic a catenei i prezena
legturilor duble amplific fluiditatea acizilor grai i a derivailor lor. La T corpului
acizii grai saturai 12 -C 24 sunt n stare solid (ca ceara), cei nesaturai sunt lichizi.
Tot lichizi sunt i cei saturai pn la Cg.
Acizii grai sunt puin solubili n ap. Solubilitatea scade o dat cu creterea lungimii
catenei hidrocarbonate. Acizii grai saturai i nesaturai au proprietate de a forma:
1. Esteri (gliceride, fosfogliceride);
2. Sruri (spunuri cu proprieti tensioactive), cele de Na+i K+sunt solubile n
ap; cu ceilali ioni, n general, fonneaz sruri insolubile;
3. Amide (sfmgolipide).
Acizii grai nesaturai adiioneaz, la nivelul dublei legturi, halogeni (Br,,Cl,), tiocianatul
(SCN),, gruparea hidroxil. Ei se oxideaz uor cu permanganatul de potasiu, acidul
periodic, tetraacetatul de plumb, peroxiacizii. Reaciile de oxidare se utilizeaz n
scopul stabilirii structurii lor chimice.
Oxidarea acizilor grai nesaturai are loc i n prezena ozonului. Ei sunt supui
procesului de pcroxidare (autooxidare), la care se altereaz gustul i mirosul (rncezire).
Radicalii peroxidici atac alte catene nesaturate, iniiind reacia de peroxidare n lan.
CH = CH CH C H = C H +X*------- * -X C H = C H C H C H = C H ----------
Izomerizarea radicalului liber
------ *-----C H = C H CH C H - C H * ------- C H = C H C H = C H C H ----------------
C H = C H C H = C H C H
I
0 0
-
CH C O R,
I /
2 2 N(CH 3 ) 3
I Lecitinele
Cele mai rspndite fosfatide sunt:
a) Fosfatidilcholinele (lecitine) conin cholina (OHCM, CH,N +(CH,)r
Aceste lipide au caracter amfipatic, proprieti tensioactive pronunate, fonneaz n
ap micelii, sunt neutre la electricitate ca i b)fosfalidiletanolamina (cefaiinele) ce se
conine din abunden n esutul nervos.
Cefaiinele, cu 2 resturi de palmitil, sunt componentele lipidice principale ale
surfactantului pulmonar, ce acoper alveolele i mpiedic colapsul la expirare.
Surfactantul include ntr-o proporie mare i fosfatidilglicerolul.
Fosfatidilglicerolul, fiind un lipid far azot, conine unul sau dou resturi de
fosfatidil legat de glicerol.
Difosfatidilglicerolul (cardiolipina) e unul din componenii membranei interne
mitocondirale.
CH2 O - C O - R ,
I
r 2- c o ~ o - c h o o
i li I!
CH2- O P - O -C H 2 R 4 c O CH 2
o" hoch Oh o - c o - r .
c h 2- o - p - o - ( ! : h 2
Difosfatidilglicerol (cardiolipina)
CH 3 - ( C H 2 ) 1 2 - C H = C H - C H - O H (j>
R - C O - N H - C H - C H 2- O - P - 0 - C H 2 - - ^
Sfmgorrrielina
CH2OH
Q
-O -C H 2 9
I II
OH H C NHC R
1/
HCC H = C H (CH 2 ) 1 2 CH 3
OH
Cerebrozida OH
b) Glucocerebrozidele conin constitueni ai membranelor celulelor (nu nervoase'
glucidul de baz este glucoza. Denot caracter amfipatic i nu au sarcini electrice.
CH2OH
O
HO -2 o
OH
H C -N H -C -R
I
H C - C H = C H - ( C H 2)i2CH3
I
Ghicocerebrozida OH
i
c) n creier, galactocerebrozidele mai conin i resturi sulfat legate esteric de
galactoz -sulfai dele, ionul - 0 S 0 3e legat cu atomul 3 din galactoz.
CH2OH
O -0 - C H 2 o
OSCh H t-N H -C -R
j /
H C - C H = C H - (CH2) 12CH 3
OH
Ah S u lfatid a
d) Gangliozidele sunt glicolipide ce conin unul sau mai multe resturi de acid sialic
(NANA), care la pH=7,0 comport sarcin negativ. Ele, la rndul lor, se clasific i
se identific dup numrul resturilor de acid sialic (GM,GD, GT).
CH2OH
( si -----O.
CH2OH
HCOH
I
HCOH
Natura oligozaharidului este desemnat printr-un indice numeric, 5-n (n-numml
de uniti hexozil). Se situeaz pe suprafaa exterioar a membranelor, fragmentelor
receptorice specifice, mai ales n locusul de fixare a moleculelor de neuromediator n
timpul procesului de transmitere chimic a mesajului de la o celul nervoas la alta.
Lipidele nesaponifiabile. Aceste lipide au o structur poliizoprenic, cu un grad
mai mic sau mai mare de nesaturare, manifest funcii oxigenate. Aceast grup include
terpenele, carotenoizii (a, , ) i steroizii.
HoC
CCH = CH 2
H3C
Izoprena
Scualena
(6 uniti izoprenice)
CHj
,0'/ (,
2 == , -II
Ubichinona-cocnzima Q
: 2 = 2 )
Plastochinona
2 2 2^2 2 2 J
Filochinona (vitamina )
Una dintre cele mai active substane cancerigene extrase din bil e metilcolan-
trena. Proprieti analoage poate avea i produsul metabolizrii testosteronului.
Aceti intermediari se inactiveaz normal n ficat graie oxidrii microzomale.
Acizii biliari. Organismul uman nu dispune de enzime care degradeaz nucleul
sterolic. O modalitate de metabolizare a colesterolului este sinteza hepatic a acizilor
biliari. n mod normal, biosinteza i aportul alimentar de colesterol se afl n echilibru cu
pierderea zilnic a colesterolului sub form de acizi biliari i derivai ai acestora.
Sinteza acizilor biliari primari are loc n ficat i implic aciunea coordonat a mai
multor enzime diferite, localizate n diverse compartimente intracelulare. Are loc hidroxilarea
n poziiile 7a i , apoi izomerizarea funciei alcool (C3-a), cu saturarea n poziia 5-
6. Catena lateral este scurtat, conducnd la generarea de propionil-CoA i utilizat, n
consecin, n ciclul Krebs.
Srurile biliare au eficien mai mare n emulsionarea i digestia lipidelor, comparativ
cu acizii biliari. Aceasta se datoreaz faptului c srurile biliare au pK mai sczut dect
acizii biliari. Spre exemplu, pK pentru acizii biliari este de aproximativ 6, pentru derivaii
glicoconjugai - aproximativ 4 i pentru srurile conjugate cu taurina este de aproximativ
2. Scderea pK se explic prin creterea procentului de molecule prezente n form
ionizat la pH-ul intestinal de aproximativ 6, ceea ce permite o mai bun solubilizarc a
lipidelor. Srurile biliare nu sunt absorbite mpreun cu lipidele alimentare, ci dispun de
un transportator specializat care asigur absorbia lor la nivelul ileonului. Majoritatea
srurilor biliare sunt reabsorbite, transportate prin vena port i recaptate de ficat, care
le elimin din nou n fluxul biliar. Astfel se formeaz circuitul hepato-entero-hepatic al
srurilor biliare. Srurile biliare care nu au fost absorbite n ileon ajung n colon, unde
sunt deconjugate de ctre bacteriile intestinale. Printr-o reacie de dehidrogenare (n
poziia C7-oc) rezult acizii biliari secundari: acidul litocolic (hidroxilat n poziia C3) i
acidul dezoxicolic (hidroxilat n poziiile C. i ,). Acetia sunt parial absorbii la nivelul
colonului i reutilizai de ficat, dup captare i reconjugare.
C olesterol Duodenul
Ficatul
SABP-
T aurina
SABS SABP
Glv^/
'aurina
Vena port
F igura 5.4. Aranjarea lipidelor n micel (a), bistrat (b) i lipozom (c)
Fosfo- i glicolipidele formeaz n ap clastere (conglomerai), n care contactul
lanurilor hidrocarbonate cu apa este redus Ia minimum. Aceti factori energetici au
n consecin trei efecte biologice de o valoare major: 1) tendina de a-i mri
suprafaa; 2) capacitatea de a se izola (nchide n sine) n aa mod, nct la capete s nu
rmn cozi ce ar putea interaciona cu apa. Datorit acestei proprieti apare un
spaiu izolat (compartiment); 3) straturile bilipidice sunt capabile s se autosudeze, s
se autosigileze, deoarece orice gaur din strat nu e convenabil energetic.
Studierea permeabilitii bistraturilor lipidice s-a efectuat n dou sisteme artificiale:
lipozom i membrane bimoleculare plate, numite membrane negre. Lipozomii reprezint
o faz apoas n stratul bilipidic, fiind formai la amestecul rapid al apei cu soluia de
lipide i etanol (la introducerea acului subire al seringii se formeaz bule aproape
stenice, cu un diametru de aproximativ 500 . Dac apa conine ioni sau molecule, se
va atesta n faza apoas a lizozomului). Exemplu: Dac lipozomii cu diametrul de 500
se formeaz n soluie de 0,1 mol glicin, apoi n interiorul fiecrui lipozom se vor afla
aproximativ 2000 molecule de glicin. Analiznd viteza de ieire a glicinei din
compartimentul intem al lizozomului n mediu, detenninm permeabilitatea membranei.
Lipozomii prezint interes nu numai pentru studiul permeabilitii. Ei sunt capabili
de o alipire cu membranele plasmatice ale diferitelor celule. Aceast proprietate ofer
mari posibiliti pentru introducerea n celule a diferitelor substane incapabile s traverseze
membranele. O alipire selectiv la celulele de anumit tip poate fi uor utilizat pentru
aportul controlat al medicamentelor n celuleie-int.
Investigaiile n aceast direcie au demonstrat c membrana lipidic bistrat are o
permeabilitate mic pentru ioni i pentru majoritatea moleculelor polare. Abatere
prezint numai apa ce trece uor prin membrane.
Extern Aminoterminal
Intern
Carboxiterminal
F igura 5.8. Bacteriorodopsin - aranjarea spaial n membran. Catena polipeptidic prezint 7 a-
spirale hidrofobe n care fiecare din ele traverseaz stratul bilipidic perpendicular, form nd clastere, cu
componenta aci! a lipidelor membranare. Pigmentul retinal este n contact cu unele segmente ale acestor
a-spirale
Proteinele acestei membrane conin 7 a-spirale fixate rigid, ce cad perpendicular pe
suprafaa membranei, ocupnd n lime 45. Spaiul dintre moleculele proteice este com
pletat cu bistrat lipidic. E posibil ca acest principiu de organizare s fie utilizat n organizarea
altor proteine integrale.
n membranele celulelor de eucariote se conin de la 2 pn la 10% de glucide n
formdeglicolipideiglicoproteine. Glicolipidele sunt compui ai sfingozinei, cu unul
sau mai multe resturi de zaharun. Glicoprotcinele, n membrane, sunt fixate prin una
sau mai multe catene glucidice cu catenele serinei, treoninei sau asparaginei, prin N-
acetilglucozamin sau N-acetilgalactozamin. Studiile efectuate au confirmat c n toate
celulele mamiferelor studiate resturile de zahr n membranele plasmatice se localizeaz pe
partea lor exterioar (fig.5.9). Termenul glicocalixul este utilizat pentru accentuarea
unei zone periferice de pe suprafaa majoritii celulelor eucariote saturate de glucide.
Mai frecvent se ntlnesc: galactoza, manoza, fucoza, galactozaniina, fucozamina, acidul
sialic. Glucidele sunt covalent legate de proteine, situate pe suprafaa celulei, i de unele
molecule lipidice din monostratul lipidic exterior.
Glicolipid
Extern
Fosfolipid polar
Colesterol Intern
Proteine^
periferice
Proteine Proteine
integrale Proteine periferice integrale
covalent fixate de lipide
F igura 5.9. Modelul memhranar fluido-mozaic Singer-Nicolson
Molecula transportat
I
( anale proteice
Proteina
transportatoare
M t
w
Gr adi ent ul
electrochimic
O
Energia
Difuzia simpl Difuzia facilitat
I____________I
o o
F igu ra 5.13. Mecanismul ping-pong
2 . numrul de transportatori;