Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Figura 1. Reprezentarea schematic a celor dou tipuri de miceliu (dup Zarnea, 1982).
123
124
1. Functiile
Multe dintre antibioticele produse de bacili sunt active mpotriva bacteriilor Gram
pozitive, dar exist i excepii. Aa cum s-a menionat deja, majoritatea antibioticelor produse de
bacili sunt peptide, dar unele aparin altor clase de compui chimici (de exemplu, leutirosin este o
amiloglicozid, iar protacin este o trien fosforic).
Exist o controvers n ceea ce privete funcia acestor antibiotice la bacteriile din genul
Bacillus. Ele apar, de obicei, n timpul sporutrii, de aceea se crede c antibioticele respective
constituie un factor important ce apare la tranziia de la starea vegetativ la spori (Katz i
Demain,1987).
Multe dintre tulpinile de bacili productoare de compui cu aciune antimicrobian au
fost supuse unor analize speciale de cartare molecular, de identificare i clonare a genelor
codificate. Datele obinute pn n prezent sunt prezentate n Tabelul 1. Metaboliii secundari
datoreaz activitatea antibiotic capacitii lor de a inhiba procesele metabolice primare. Cei mai
muli acioneaz ca antimetabolii deoarece asemnarea lor funcional cu metaboliii normali le
permite legarea la situsuri int i s interfere cu activitatea normal. Produii generai de o
anumit cale metabolic inhib de obicei o alt cale metabolic, activitatea lor depinznd n
ntregime de configuraia antibioticului i de distribuia gruprilor funcionale la nivelul lor.
Tabelul 1. Substane antibiotice produse de bacteriile genului Bacillus
125
Specie
Antibiotic
Aciune inhibitoare
B.subtilis
Subtilin
Surfactin
Bacilysin
Difficidin
Oxydificidin
Bacillomycin F
Mycobacillin
Iturin
Gramicidin S
Tyrocidin
Bacitracin
Proticin
Pumilin
Tetain
Esperin
Polymyxin
Colistin
Octopytin
Baciphelecin
Circulin
Butirosin
Laterospuramine
Laterosporin
Biorin
Cerexin
Bacterii Gram +
B. brevis
B. licheniformis
B. pumilus
B. mesentericus
B. polymyxa
B.tyaminoliticus
B. circulans
B.laterosporus
B. cereus
Harta
genetic
+
+
+
-
Gene
clonate
+
-
Bacterii Gram +
Bacterii Gram +
Bacterii Gram +
Bacterii Gram Bacterii Gram Bacterii Gram +
Bacterii Gram +
Bacterii Gram Bacterii Gram +
Bacterii Gram +
+
+
+
-
+
+
+
-
Bacterii Gram +
Bacterii Gram +
Spectru larg de aciune
Spectru larg de aciune
Antifungic
Antifungic
Antifungic
Bacterii Gram +
Bacterii Gram +
Bacterii Gram +
Deoarece nu exist o corelaie strict ntre intele antibioticului i cile metabolice n care
el este format, este riscant s se spun c toi metaboliii secundari manifest o anumit activitate
biologic, mai ales dac inem cont de faptul c de multe ori aceti compui au semnificaie
numai pentru om i mai puin pentru organismul productor.
Dei cercetrile asupra utilitii medicale a antibioticelor s-au referit n special la
activitatea antibacterian, n prezent sunt studiate aciunile unor asemenea substane i asupra
unor alte tipuri de celule, eucariote. Un exemplu n acest sens l constituie monensinul, identificat
iniial n culturi de Streptomyces cinnamonensis i care n prezent este utilizat pe scar larg ca i
coccidiostatic sau ca stimulator al creterii animalelor (Vining, 1990).
O problem care se pune n cazul producerii de substane antibiotice este aceea a
modalitilor n care bacteriile productoare rezist la aciunea acestor substane care de obicei
inhib creterea sau alte procese biochimice eseniale. Pentru a elimina efectul de inhibare a
creterii, bacteriile productoare pot prezenta mai multe mecanisme de rezisten: modificarea
situsului int al antibioticului, modificarea permeabilitii membranare sau inactivarea
metabolitului toxic (Cundliffe, 1989). Deoarece antibioticele sunt rapid eliminate n exteriorul
celulei pe msur ce el este produs, inactivarea celular nu afecteaz eficiena produsului
extracelular.
Un studiu efectuat asupra rezistenei la antibiotice a tulpinilor bacteriene sensibile ("int") a
evideniat faptul c antibioticele excretate n mediu i care acioneaz n vecintatea
organismului productor au semnificaia unor factori implicai n competiia pentru resurse.
Rezistena la antibioticele obinute a fost observat la multe tulpini bacteriene de colecie,
126
izolate nainte de introducerea acestor antibiotice n practica medical ceea ce sugereaz ideea c
populatiile bacteriene vin n contact cu asemenea compui n mediul lor natural de via. De
asemenea, unii metabolii toxici chiar dac nu au o valoare antibiotic mare, ei pot potena
activitatea altor antibiotice fa de care s-a instalat rezistena la numeroase tulpini bacteriene.
Acesta este cazul acidului clavulanic produs de tulpini de S.clavuligerus care are o slab
activitate antibiotic dar care determin o sporire a aciunii unor antibiotice -lactamice cum este
cefamicinul prin inhibarea -lactamazelor pro-duse de tulpina bacterian int.
Antibioticele descoperite pn n prezent i utilizate mai mult sau mai puin intens n
practica medical pot fi clasificate innd cont de diferite criterii: modul de aciune, natura
chimic, spectru de aciune etc.
O abordare recent a structurii unor antibiotice consider c acestea, alturi de un numr
mare de metabolii sintetizai att de ctre bacterii ct i de fungi sau plante, pot fi grupate ntr-o
familie de compui denumii poliketide (Hopwood i Sherman 1990). Toi aceti compui au n
comun prezena unor grupri keto la nivelul unor atomi de carbon foarte variai ca poziie n
molecula respectiv. Printre compuii inclui n aceast familie menionm: tetraciclinele,
antraciclinele, eritromicina, rifamicinele, granaticinul, avermectinul (toate sintetizate de ctre
streptomicete), aurantininul (sintetizat de Bacillus sp.) mupirocin (elaborat de Pseudomonas sp.)
precum i ale substane elaborate de celule eucariote: micotoxine, flavonoizi, fitoalexine etc.
1.1.1. Antibiotice care inhib sinteza peretelui celular
Dup descoperirea penicilinei de ctre Fleming n 1929, un numr mare de antibiotice
nrudite cu aceasta au fost izolate, ele avnd n comun structura chimic (sunt -lactami) i
modul de aciune (inhibarea sintezei peretelui celular bacterian).
Dei penicilinele au fost descoperite ca fiind produse de ctre fungi, s-a dovedit c
asemenea antibiotice pot fi sintetizate i de ctre unele specii de streptomicete cum ar fi:
S.clavuligerus, S.lipmanii, S.lactamgens, S.cattleya (Martin i Liras, 1989; Matsushima i Baltz,
1989; Srinivasan i colab.,1991).
Pe lng antibioticele -lactamice au mai fost izolai i caracterizai i ali compui care
afecteaz funciile membranei plasmatice. Un exemplu l constituie nistatinul, antifungic produs
de unele specii ale genului Streptomyces. Un alt grup este reprezentat de polimixine, bacitracine
i gramicidine, antibiotice polipeptidice produse de bacterii aparinnd genului Bacillus
(B.polymixa, B.licheniformis, B.brevis). Aceti compui determin creterea permeabilitii
membranei plasmatice ceea ce are drept consecin ieirea masiv a unor aminoacizi sau a unor
derivai purinici i pirimidinici din bacterie, conducnd n final la moartea celulei. De asemenea,
bacitracina acioneaz asupra sintezei peretelui celular, determinnd inhibarea biosintezei
peptidoglicanului unor bacterii Gram negative.
1.1.2. Antibiotice care inhib sinteza proteinelor
Dintre antibioticele care afecteaz sinteza proteinelor, un loc important este ocupat de
aminoglicozide, tetracicline i cloramfenicol, toate cele trei grupe fiind sintetizate de specii ale
genului Streptomyces..
Aminoglicozidele reprezint un grup foarte important de antibiotice care au drept
component principal unele glucide aminate. Primul antibiotic din acest grup care a fost
descoperit n 1944 este streptomicina produs de S.griseus, dup care au fost izolate numeroase
alte aminoglicozide de la bacterii aparinnd n principal genurilor Streptomyces i
Micromonospora: gentamicina produs de specii de Micromonospora, neomicina produs de
S.fradiae, ribostamicina produs de S.ribosidificus, kanamicina sintetizat de tulpini de
S.kanamyceticus, butirozina produs de B.circulans etc.(Okuda i Ito, 1982).
Aminoglicozidele sunt antibiotice cu spectru larg de aciune utilizate de obicei pentru
tratarea unor infecii produse de tulpini de E.coli, Klebsiella sp., Proteus sp., Enterobacter sp.
127
Mecanismul prin care aceste antibiotice omoar celulele sensibile nu este pe deplin elucidat.
Exist numeroase date experimentale care evideniaz c situsul primar de aciune al acestor
antibiotice ar fi ribosomii, ceea ce determin afectarea sintezei proteinelor. Efectele pleiotropice
ale aminoglicozidelor asupra bacteriilor sunt considerate a fi consecina interaciunii lor cu
ribosomii. Alturi de interferena cu sinteza proteic, aminoglicozidele induc distrugeri ale
membranei plasmatice, afecteaz respiraia celular, acumularea de ARN i determin n final
moartea celulelor. In ceea ce privete mecanismul rezistenei bacteriilor productoare la aciunea
acestor antibiotice s-a evideniat faptul c acestea prezint strategii diferite cum ar fi producerea
unor enzime ce inactiveaz antibioticul sau modificarea situsului de aciune al acestuia
(Cundliffe, 1989). Spre exemplu, bacteriile productoare de aminoglicozide sintetizeaz n
acelai timp i enzime ce modific antibioticele respective: aminoglicozid-fosfotransferaza
(APH) i acetiltransferaza (AAC). De asemenea, bacteriile respective (S..kanamyceticus,
S.tenebrarius) pot produce simultan i enzime ce modific unele situsuri de aciune ale
antibioticului (de exemplu, situsurile ribosomale) prin metilarea ARNr.
Tetraciclinele reprezint un grup destul de heterogen de antibiotice produse n special de
bacterii din genul Streptomyces ele avnd n comun o structur chimic de baz dar variind n
funcie de gruprile chimice care se leag de aceast structur: oxitetraciclina (produs de
S.rimosus), tetraciclina (produs de S. viridofaciens), clortetraciclina (sintetizat de
S.aureofaciens). Tetraciclinele prezint un spectru destul de larg de aciune fiind bacteriostatice
pentru diferite bacterii Gram pozitive i Gram negative (cu excepia tulpinilor de Salmonella,
Proteus i Pseudomonas) i bactericide n concentraii mari. Tinta principal de aciune a acestor
antibiotice este sinteza proteic, ele neavnd efecte evidente asupra ADN, ARN sau asupra
sintezei peretelui celular. Modalitatea exact a legrii tetraciclinelor la ribosomi nu este nc pe
deplin cunoscut. Se pare c ele se leag puternic de subunitatea 70S a ribosomilor ceea ce
determin efectul inhibitor al antibioticelor. De asemenea, tetraciclina se leag slab de
subunitatea 30S ceea ce are drept consecin blocarea legrii aminoacil-ARNt la aceast
subunitate i deci a alungirii lanurilor polipeptidice. Autorezistena bacteriilor productoare
poate include modificarea situsurilor int normale, inactivarea intracelular a antibioticului sau
eliminarea sa rapid din celul (Cundliffe, 1989).
Cloramfenicolul este un antibiotic cu spectru destul de larg de aciune, el fiind izolat n
1947 din filtrat de cultur de S.venezuelae. Aciunea cloramfenicolului const n mpiedicarea
ARNm s se lege la ribosomi ceea ce se concretizeaz prin inhibarea sintezei proteice (a formrii
legturilor peptidice) (Pongs, 1979).
1.1.3. Antibiotice care inhib replicarea i transcrierea informaiei genetice
Dintre antibioticele care mpiedic replicarea ADN i sinteza ARNm menionm
novobiocina, coumermicina i rifamicinele.
Novobiocina este un antibiotic cu o structur complex produs de S.sphaeroides cu
efect, de obicei, bacteriostatic asupra bacteriilor, mai ales n mediu acid. Similar ca aciune este
coumermicina A, un antibiotic izolat din culturi de S.rishinensis i S.hazeliensis. La concentraii
mai mici de novobiocin i cumermicin A este afectat doar replicarea ADN din celulele
sensibile, nu i procesul de transcriere. Cele dou antibiotice pot afecta aciunea ADN girazei,
enzim ce determin suprarsuciri ale moleculei de ADN, ceea ce explic inhibarea replicrii i
transcrierii informaiei genetice (Ryan, 1979). Rezistena la novobiocin a bacteriei productoare
S.sphaeroides este determinat de gena gyrB al crei produs, ADN giraza B este rezistent la
aciunea acestui antibiotic (Cundliffe, 1989).
Rifamicinele, avnd ca reprezentat tipic rifampicina reprezint un grup de antibiotice
macrociclice care acioneaz, n special, asupra micobacteriilor i bacteriilor Gram pozitive.
Mecanismul lor de aciune se refer la inhibarea procesului de transcriere a informaiei genetice
prin blocarea aciunii enzimei ARN-polimeraza.
128
subtilis produc o serie de substane de natur lipooligopeptidic din gama iturinului, care au
activitate antifungic, hemolitic precum i proprieti antibiotice. Structura chimic a acestor
substane a fost determinat prin diverse metode (spectrometrie de mas (MS), gel
cromatografie, cromatografie n strat subire (TLC), lichid cromatografie (HPLC)).
Componenta proteic a acestor substane este reprezentat de oligopeptide alctuite din apte
aminoacizi, iar componenta lipidic conine acizi grai cu catena carbonic lung (C14-C16).
Astfel, iturin AL conine o heptapeptid (2 D-Asp, 1 L-Asp, 1 L-Glu, 1 L-Pro, 1 L-Ser,
1 D-Tir) i un amestec de -amino acizi grai cu caten lung C14-C16. Iturin D i iturin E
conin o heptapeptid (3 Asp, 1 Glu, 1 Pro, 1 Ser, 1 Tyr) i un amestec de -amino acizi grai
cu caten C14-C16, diferind de iturin A prin prezena unei grupri carboxil la iturin D i o
grupare carboximetil la iturin E. Mycosubtilin, o substan din gama iturinului, conine o
heptapeptid ciclic (Asn, Tyr, Asn, Gln, Pro, Ser, Asn) legat de un -amino acid gras. Tot
din gama iturinului fac parte surfactinul i fengycinul care conin un -hidroxiacid gras i
bacillomycinul care conine un -amino acid gras.
Studii mai intense au fost efectuate cu o substan produs de mai multe specii de
Streptomyces (S. hygroscopicus, S. viridochromogenes) i care a primit denumirea de bialafos
(fosfinotricin-alanil-alanina). Aceasta substan a fost iniial selectat pentru activitatea sa
antibiotic dup care s-a observat c ea are, de fapt, o aciune mult mai complex. Componentul
activ al bialafosului este fosfinotricinul care inhib glutamin-sintetaza din celulele vegetale, ceea
ce i confer bialafosului o puternic aciune herbicid (Lea i colab., 1984).
Muli dintre metaboliii secundari produi de diverse microorganisme au fost testai
pentru eventuala lor aciune asupra unor enzime. Atunci cnd sistemul test a inclus enzime cheie
n procesele farmacologice de la animale, numeroi metabolii secundari au fost detectai ca
avnd activiti fiziologice "in vivo". Muli dintre aceti compui au fost descoperii a fi inhibitori
proteazici, acionnd asupra pepsinei, papainei, tripsinei, chimiotripsinei, catepsinei, elastazelor,
aminopeptidazei B i leucin-aminopeptidazei (Umezawa, 1982). Printre inhibitorii proteazici
izolai de la actinomicete unii acioneaz asupra reninei sau asupra unei zinc-exopeptidaze care
convertete angiotensina I n angiotensin II.
Cercetrile efectuate asupra culturilor microbiene au permis izolarea unor inhibitori i ai
altor enzime. Acesta este cazul inhibitorilor pentru glucozidaze (Muller, 1986), pentru cAMP
(reticulol), pentru kinaze etc.
2. Determinismul
activitate antibiotic, cum ar fi unii pigmeni, alcaloizi, reglatori ai celulei vegetale etc. (Martin
i Liras, 1989).
In ceea ce privete localizarea plasmidial a unor gene implicate n biosinteza unor
antibiotice, datele referitoare la acest aspect sunt mai puine. Un exemplu l constituie genele
pentru biosinteza metilenomicinei care se gsesc plasate pe plasmida SCP1 de la S. coelicolor
(Wright i Hopwood, 1978; Chater i Bruton, 1985). De asemenea, de la bacteriile din genul
Streptomyces au fost izolate o serie de plasmide lineare cu dimensiuni variate, ntre 5,4-17 Kb
pn la 350-520 Kb (Chardon-Loriaux, 1985; Kinashi i colab., 1987). Evidenierea plasmidelor
lineare uriae la ase tulpini de Streptomyces productoare de antibiotice i examinarea corelaiei
dintre prezena lor i sinteza de antibiotice a dus la concluzia c, cel puin n cazul
metilenomicinei, genele implicate n sinteza sa sunt plasate pe aceste plasmide care reprezint
aproximativ 5 % din cantitatea total de ADN celular. Sunt ns necesare studii suplimentare
pentru a stabili dac i n alte cazuri genele care determin sinteza unor antibiotice sunt localizate
pe plasmide similare.
2.1. Organizarea i exprimarea genelor pentru unii metabolii secundari sintetiza i de
specii de Bacillus
Cea mai mare parte a metaboliilor secundari produi de bacteriile din genul Bacillus sunt
homo- sau heteropeptide. Spre exemplu, gramicidina S este un decapeptid ciclic format din
dou uniti de D-Phe-L-Pro-L-Val-L-Orn-L-Leu, fiind produs de tulpini de B. brevis, ca de
altfel i tirocidinele. Familia bacitracinelor cuprinde peptide alctuite din 12 aminoacizi, produse
de tulpini de B. licheniformis. Studiile cu extracte celulare au evideniat c aminoacizii
constitueni ai acestor compui sunt activai i legai n subunitile respective de ctre mai multe
tipuri de peptid-sintetaze (Kleinkauf i Van Dohren, 1987).
Experimentele de clonare n E. coli a genelor pentru sinteza gramicidinei i tirocidinei au
evideniat faptul c n cazul tirocidinei sunt implicate trei enzime multifuncionale, n timp ce la
producerea gramicidinei S particip cel puin 2 sintetaze (GS1 i GS2) codificate de dou gene
diferite grsA i grsB.
2.2. Organizarea i exprimarea genelor pentru unele antibiotice sintetizate de bacteriile din
genul Streptomyces
In cazul streptomicetelor au fost evideniai numeroi metabolii secundari, dar numai
puini au o structur peptidic. Unul dintre acetia, bialafosul prezint importan practic
deosebit, deoarece manifest activitate herbicid. Recent, Nakajima i colaboratorii (1991) au
izolat de la S.hygroscopicus un nou compus cu activitate herbicid, care a primit denumirea de
hidantocidin. Bialafosul, care a fost mai intens studiat, este sintetizat pornind de la piruvat sau
fosfoenolpiruvat, printr-o cale metabolic care cuprinde cel puin 13 etape (Thompson i Anzai,
1987). Experimentele de clonare cu genele implicate n sinteza acestui compus au evideniat
faptul c n acest proces sunt implicate mai multe gene (cel puin 7) grupate, alturi de care se
afl i gena pentru rezistena la bialafos (bar). Astfel, au fost obinute dou grupe de clone
derivate de la mutante neproductoare i care au fost transformate cu plasmida pIJ61
recombinant (coninea diferite gene de la S.hygroscopicus). Un grup de asemenea plasmide
recombinante restabilete productivitatea mutantelor care prezint modificri ale etapelor 5, 6, 12
i 13 ale cii metabolice, n timp ce un alt grup restabilea producerea de bialafos de ctre
mutantele blocate la nivelul etapelor 1, 3 i 4. In plus, a fost realizat transferul unui segment de
16 Kb, care restabilea productivitatea tuturor celor 7 tipuri de mutante. Acest segment de ADN
coninea i gena bar care, de altfel, a permis i identificarea clonelor transformate. Totui, acest
fragment nu determin o producie semnificativ de bialafos la mutantele neproductoare, ceea
132
ce sugereaz existena unor gene suplimentare aflate n afara segmentului de 16 Kb, necesare
exprimrii complete a operonului pentru sinteza bialafosului.
De asemenea, n urma experimentelor de clonare a genelor bar (de rezisten la bialafos)
n diferite celule gazd, inclusiv n celulele vegetale s-a evideniat faptul c pentru funcionarea
normal a genelor pentru biosinteza bialafosului sunt necesare nc trei gene diferite care
determin adenilarea la diferite etape ale biosintezei. Aceste noi date conduc la presupunerea c
genele implicate n biosinteza acestui compus se gsesc localizate la nivelul unui fragment de
ADN de peste 34 Kb.
Experimentele lui Anzai si ale colaboratorilor (1987) au evideniat faptul c prin clonarea
unui fragment de ADN de 5,9 Kb, care conine gena brpA are loc activarea transcrierii att a
genei bar ct i a cel puin altor 6 gene structurale bap. De asemenea, aceti autori au artat c
att la S.viridochromogenes, ct i la S. hygroscopicus organizarea genetic a genelor implicate
n sinteza bialafosului este identic.
Un alt grup de metabolii secundari peptidici, actinomicinele (cromopeptide) este
sintetizat n urma aciunii unei enzime, fenoxazinon-sintetaza (PHS). Prin clonarea genei pentru
PHS de la S. antibioticus n S. lividans (Jones i Hopwood, 1984) s-au obinut mai multe tipuri
de clone: unele care conineau gena structural pentru PHS, iar altele care prezentau activitate
PHS, dar care a rezultat n urma activrii unei gene "tcute" (silent gene) endogene de ctre
fragmentul de ADN exogen transformant. Fenomenul este frecvent ntlnit n cazul
streptomicetelor, el fiind semnalat i n cazul tulpinilor productoare de ali metabolii secundari.
Un exemplu l constituie clonarea genelor pentru producerea cefamicinei de la S.cattleya la
S.lividans, clonele productoare rezultnd n urma activrii unor gene endogene silenioase
(Martin i Liras, 1989).
Muli dintre metaboliii secundari produi de streptomicete au o structur de tip
macrolidic n care inelul macrociclic derivat de la poliketide este nchis printr-o legtur
lactonic. La acest inel macrociclic sunt, de obicei, ataate glucide bazice sau neutre. Spre
exemplu, eritromicina produs de Saccharopolyspora erythraea (Streptomyces erythraeus)
conine un inel lactonic (eritronolid) i 2 glucide specifice, dezozamina i cladinoza, sinteza sa
realizndu-se n aproximativ 30 etape enzimatice Prin clonarea n S.lividans a unor fragmente de
ADN cromosomal izolate de la tulpini de S.erythraea productoare de eritromicin s-a stabilit c
trei dintre genele implicate n biosinteza antibioticului, eryA, eryB i eryC sunt grupate i
localizate ntr-o unic regiune a cromosomului bacteriei productoare. Utiliznd un vector de
clonare integrativ (care se poate integra n cromosomul gazdei) s-a stabilit c alturi de genele
care determin sinteza antibioticului se afl i gena pentru rezistena la eritromicin, ermE (gen
care determin sinteza unei metilaze pentru ARNr) (Stanzak i colab., 1986). De asemenea, Mc
Alpine i colab. (1987) au comunicat obinerea unui antibiotic hibrid care a primit denumirea de
2-noreritromicin, n urma clonrii ntr-o mutant de S.erythraea, care avea blocat ultima etap
a sintezei eritromicinei a unui fragment de ADN de 30-35 Kb izolat de la S.antibioticus
productor de oleandomicin.
Un alt antibiotic, tilozina produs de tulpini de S.fradiae prezint o structur chimic
asemntoare eritromicinei, avnd un inel macrociclic, tilanolid i trei glucide mai puin
rspndite: micaminoza, micaroza i micinoza. Studiile referitoare la organizarea genelor
implicate n sinteza acestui antibiotic au evideniat faptul c genele tyl (aproximativ 9 gene) sunt
grupate, alturi de ele aflndu-se i gena de rezisten (tlrB), precum i o secven de ADN
amplificabil flancat de 2 secvene repetate direct (Baltz i Seno, 1988). De asemenea, s-a stabilit
c pentru exprimarea genei tylF, care codific enzima ce controleaz ultima etap a cii
metabolice de sintez a antibioticului este necesar o protein reglatoare (efector pozitiv)
produs de gena tylG. O situaie asemntoare prezint i genele care codific sinteza
carbomicinei i rezistena la acest antibiotic (Martin i Liras, 1989).
133
Figura 4. Reprezentarea schematic a genelor implicate n biosinteza streptomicinei la dou specii de streptomicete:
S.griseus i S.glaucescens.
Ohnuki i colaboratorii (1985) au artat c la S.griseus grupul de gene str este format din
cel puin 4 gene: strR, strA, strB i strC. Gena strA codific enzima streptomicin-6'fosfotransferaza care asigur rezistena la acest antibiotic; strB complementeaz o mutaie la o
tulpin care prezenta deficien n legarea streptidin-6-fosfatului de dihidrostreptoz; strR este o
gen reglatoare care codific un efector pozitiv necesar exprimrii complete a genelor strA i
strB. Rezultate similare au obinut Distler i colab.(1987), care au evideniat c la S.griseus
genele necesare sintezei streptomicinei sunt linkate cu gena aphD care codific pentru enzima
streptomicin 6-fosfotransferaza, gen similar genei sph pentru enzima hidroxi-streptomicin134
Figura 5. Model ipotetic al transcrierii genelor implicate n sinteza i rezistena la streptomicin (dup Piepersberg i
colab., 1988).
Date recente (Buttner i colab., 1988) indic faptul c gena pentru agaraz (dagA) de la
S.coelicolor care conine patru promotori diferii este transcris de cel puin trei forme diferite
(holoenzime) de ARN polimeraz. Similar, genele galE i galK de la S.lividans sunt transcrise de
dou ARN polimeraze de la nivelul a doi promotori, galP1 i galP2.
Dei existena mai multor factori sigma este bine cunoscut, semnificaia fiziologic a
diferitelor holoenzime de ARN polimeraz rmne nc neclar. La streptomicete multe dintre
secvenele aflate naintea regiunii start a transcrierii unor gene conin doi sau mai muli
promotori dar nu este clar dac toi promotorii funcioneaz "in vivo" (Tomich, 1988).
Recunoaterea difereniat a promotorilor aranjai n tandem de ctre diferite ARN polimeraze
poate explica exprimarea selectiv a anumitor seturi de gene n timpul creterii i diferenierii
morfologice i a altor gene n timpul desfurrii metabolismului secundar. Aranjarea genelor
implicate n biosinteza antibioticelor n grupuri ("clusteri") este deci de mare interes n legtur
cu exprimarea difereniat a genelor.
2.6. Seminificaia biologic a metaboliilor secundari
Semnificaia biologic a metaboliilor secundari produi de diferite microorganisme nu
este nc foarte clar. Sinteza lor ar reprezenta rezultatul unor "erori de metabolism" fr
importan pentru fiziologia microorganismului productor. In legtur cu rolul metaboliilor
secundari au fost avansate numeroase propuneri pornind de la studiul n laborator al activitii
acestor compui. Vining (1990) consider c funciile metaboliilor secundari pot fi grupate n
dou categorii: unele care privesc direct productorul (funcii intrinseci) i altele care asigur
anumite beneficii productorului prin aciunea n exterior, n mediu (funcii extrinseci). In cadrul
funciilor intrinseci, unii metabolii secundari pot fi precursori ai unor componente structurale
cum ar fi de exemplu streptomicina care, se sugereaz c ar fi un constituent al nveliului
mureinic (Szabo i colab., 1989). De asemenea, ali metabolii secundari joac un rol important
n sporulare i n germinarea sporilor la actinomicete i la bacili ca i n diferenierea celular
(Chater, 1989; Maplestone i colab.,1992).
Atunci cnd activitatea metaboliilor secundari este direcionat asupra altor organisme
din mediul nconjurtor, aceste substane pot fi considerate ca "ageni ecologici" asigurnd productorilor supravieuirea n cadrul competiiei cu alte organisme ce populeaz aceeai ni
ecologic. De asemenea, datele obinute pn n prezent n urma analizei secvenei de nucleotide
sprijin conceptul c metabolismul secundar a rezultat n urma modificrilor cilor existente ale
metabolismului primar. Dei secvena de aminoacizi identificat deductiv din secvena de
nucleotide a genelor corespunztoare este suficient pentru a indica o origine comun, pentru ca
datele s fie mai concludente ar fi necesar o comparare a genelor de la specii diferite dect de la
aceeai specie. Informaiile obinute n acest fel sugereaz c transferul natural de gene ntre
diferite organisme a reprezentat un important factor n evoluia metaboliilor secundari. Multe
dintre cile metabolismului secundar pot avea o origine foarte veche, modificrile care apar la
nivelul lor putnd rezulta n urma achiziiilor mai recente de material genetic exogen la nivelul
unor microorganisme productoare.
Pe baza cunotinelor acumulate n domeniu, Vining (1992) stabilete o serie de
caracteristici clare ale metabolismului secundar:
1. metaboliii secundari nu sunt eseniali pentru cretere i tind s fie specifici de tulpin;
2. aceti compui au o mare varietate de structuri chimice i activiti biologice;
3. metaboliii secundari deriv din intermediari ai metabolismului primar prin ci de
biosintez unice. Aceste ci sunt deseori lungi i complexe; reaciile biochimice sunt catalizate
de enzime cu specificitate de substrat diferit de cea a enzimelor echivalente ale metabolismului
primar;
138
Unele dintre enzimele sintetizate de ctre streptomicete sunt sau pot fi folosite n practica
medical fie n stabilirea unor diagnostice fie n terapie. Acesta este cazul colesterol-oxidazei
produs de unele specii de Streptomyces i Nocardia care este utilizat pentru dozrile de
colesterol din ser, sau al urat-oxidazei produs de S.cyanogenus care poate fi utilizat pe scar
larg pentru detectarea enzimatic a acidului uric (Srinivasan i colab., 1991).
Producerea enzimelor hidrolitice de ctre streptomicete depinde n mare msur de
substratul pe care acestea sunt cultivate astfel c datele prezentate n Tabelul 2 pot fi completate
i cu alte tipuri de enzime. Uneori ns, datorit scopului n care enzimele ar putea fi utilizate (de
exemplu n industria alimentar) se prefer utilizarea unor tulpini bacteriene productoare care
ns s nu sintetizeze substane toxice sau potenial toxice (cum sunt de altfel antibioticele)
Tabelul 2. Enzime entracelulare produse de unele bacterii productoare de antibiotice
Specia bacterian
S.griseus
S.rimosus
S.aureofaciens
S.fradiae
S.antibioticus
S.venezuelae
B.licheniformis
B.subtilis
Antibioticul
streptomicina
oxitetraciclin
tetraciclina
neomicina
oleandomicina
cloramfenicol
Bacitracina
Bacitracina
Enzimele detectate
proteaze, elastaze, amilaze, peptidaze
proteaze, elastaze,
proteaze, amilaze
proteaze, elastaze, keratinaze
proteaze, amilaze
Proteaze
Proteaze
Proteaze
Tipul enzimei
Extracelulare
Proteaze neutre
Extracelulare
-amilaze
Extracelulare
-amilaz
Extracelulare
Celulaze
Extracelulare
Specia productoare
B. subtilis
B. pumillus
B. amylosacchariticus
B. licheniformis
B.subtilis
B. amyloliquefaciens
B. thermoproteolyticus
B. amylosacchariticus
B. stearothermophilus
B. cereus
B. subtilis
B.licheniformis
B.coagulans
B. stearothermophilus
B. cereus var.mycoides
B. polymyxa
B.circulans
B. megatherium
B. cereus var.mycoides
B.subtilis
B.polymyxa
140
Utilizri
detergeni
industria alimentar
industria pielriei
Industria berii
Industria alimentar
Industria alimentar
degradarea amidonului
industria alimentar
degradarea amidonului
Industria alimentar
Industria textil
B. licheniformis
B. cereus
implicai cu gruparea amino n legtura peptidic. Ele au un pH optim de aciune cuprins ntre
pH 7 i pH 8, sunt inhibate complet de EDTA (care complexeaz atomul de Zn din structur)
fiind sensibile la concentraii de EDTA sub 10-3M, orto-fenantrolin, nefiind afectate de DIFP
i PCMB.
Metaloproteazele alcaline conin, de asemenea, un ion metalic implicat n mecanismul
de reacie catalitic. Ele i manifest activitatea optim n domeniul de pH 79, fiind mai
puin inhibate de EDTA dect proteazele neutre, necesitnd concentraii mai ridicate de 10 -2 M
pentru inactivare.
Proteazele neutre produse de Bacillus subtilis var. amylosacchariticus sunt diferite de
proteazele neutre produse de Bacillus subtilis NRRL B3441 i din acest motiv este necesar
specificarea exact a provenienei proteazei neutre respective. Producerea lor este supus
represiei exercitate de prezena n mediul de incubare a unor aminoacizi n cantitate mai mare
(Bawden i colab.,1987). Aceste enzime sunt folosite n prezent la fabricarea detergenilor la
tratarea pieilor n industria pielriei, frgezirea crnii, eliminarea depozitelor proteice din
buturile fermentate (Sasson, 1988). La aceste bacterii s-au realizat i numeroase studii
referitoare la determinismul genetic i controlul producerii i excreiei acestor enzime n scopul
obinerii prin clonare a unor tulpini superproductoare (Mc Connell i colab., 1986).
S-a dovedit faptul c producerea de proteaze este supus unor mecanisme reglatoare
complexe, ntre care un rol cheie este jucat de sistemul DegS-DegU precum i de factorii de
reglare DegR and DegQ (Nagami and Tanaka, 1986; Tanaka et al., 1987; Ogura et al., 1994).
Aceti factori reglatori se pare c sunt implicai n superproducia de proteaze cel puin n
cazul unor tulpini de B.subtilis. De asemenea, relativ recent, Ogura et al (1994) au caracterizat
alte dou gene: proB (ce codific sinteza -glutamil kinazei) i proA (codific sinteza
glutamil--semialdehid dehidrogenaza) ale cror produi par a fi implicai n sporirea
capacitii de biosintez a exoproteazelor la o tulpin de B.subtilis. Astfel, cele dou gene au
fost clonate ntr-un vector e clonare (pLC1) i apoi introduse, mpreun cu un alt vector
(pNC61) ce conine gena reglatoare prtR (degR) ntr-o tulpin de B.subtilis. Transformanii
obinui au prezentat o activitate proteolitic mai mare dect a tulpinii parentale.
Date fiind aplicaiile practice ale acestor enzime extracelulare, preocuprile
cercettorilor vizeaz sporirea nivelului de biosintez ca i mrirea stabilitii enzimelor n
diferite condiii experimentale. Aceste deziderate se pot realiza pe mai multe ci, printre care
cele ce utilizeaz metodele clasice de ameliorare a microoganismelor (prin tratament cu ageni
mutageni) i cele moderne, de inginerie genetic (fuziunea de protoplati i tehnologia ADN
recombinant).
Conform datelor de literatur, mutagenii cei mai eficieni sunt nitrosometiluree,
nitrosoguanidina, dietilsulfatul, precum i ageni fizici de tipul radiaiilor X sau a radiaiilor .
Astfel, prin mutagenez s-a reuit ridicarea nivelului de biosintez a tulpinilor de B.subtilis de
aproximativ 8-10 ori.
n cel de-al doilea caz, majoritatea tulpinilor superproductoare de proteaze care
prezint anumite caracteristici s-au obinut prin inginerie genetic. Astfel, sunt foarte
cunoscute rezultatele obinute de cercettorii japonezi care, pornind de la tulpini slbatice de
B.thermoproteolyticus i B.stearothermophilus au reuit obinerea de tulpini productoare de
termolizin, o proteaz foarte diferit de celelalte proteaze neutre n ceea ce privete
termostabilitatea i mecanismul de aciune. n prezent, cunoscndu-se structura termolizinei
precum i genele rspunztoare de caracteristicile sale deosebite, se ncearc obinerea de
tulpini de B.subtilis, B.stearothermophilus modificate genetic, capabile s produc proteaze
termostabile sau stabile la valori diferite ale pH sau la aciunea unor ageni inhibitori.
In cazul bacteriilor din genul Streptomyces examinarea lichidelor de cultur a unor tulpini
productoare de antibiotice a dus la evidenierea prezenei unui amestec de enzime dintre care,
143
un loc important din punct de vedere cantitativ l ocup proteazele (neutre i alcaline) i
peptidazele (aminopeptidaze) (Pokorny i Vitale, 1980).
Vitale i colab.(1980) au reuit izolarea din filtrat de cultur de S.rimosus a unei serin
proteaze care a prezentat un pH optim de aciune cuprins ntre 7 i 9 i al crei substrat de aciune
este reprezentat de proteine sau de peptide mari, hidroliznd n general esterii terminali simpli.
Recent, Renko i colab.(1989) au prezentat particularitile unei proteaze de tip tripsinic
("trypsin-like proteinase") izolat tot din filtrat de cultur de S.rimosus evideniind faptul c
aceasta este o proteaz alcalin, sensibil la aciunea inhibitorului proteazic PMSF (specific
pentru serin-proteaze) ca i la cea a -antitripsinei. Aceste enzime au activitate arginilaminopeptidazic att asupra proteinelor ct i asupra peptidelor mai mici. Enzime similare au
fost izolate i caracterizate i de la alte specii de Streptomyces: S.fradiae, S.paromomycinus,
S.moderatus, S.hygroscopicus etc. O situaie oarecum special o prezint S.griseus care produce
un amestec de proteaze neutre i alcaline, produsul obinut fiind denumit pronaz, el fiind studiat
mai intens n scopul elucidrii mecanismului de aciune i a omologiei sale cu tripsinele
vertebratelor (Read i colab.,1984).
Aceste studii au importan att teoretic prin contribuiile aduse la nelegerea unor
aspecte evolutive, a taxonomiei serin-proteazelor dar i practic, aceste enzime putnd nlocui
tripsina n anumite reacii biochimice.
S-a dovedit de asemenea c unele specii de streptomicete, cum ar fi de pild S.rimosus,
pot produce i o alt categorie de proteaze: metaloproteaze (Vitale i colab.,1987). Aceste enzime
sunt fie bazice fie neutre, fiind activate de ionii de calciu, mangan sau zinc, stabilizate de ionii de
calciu i inhibate de EDTA. Metaloproteazele alcaline acioneaz doar asupra proteinelor, nu i
asupra peptidelor n timp ce metaloproteazele neutre degradeaz n egal msur proteinele i
peptidele. In cazul acestora din urm aciunea enzimatic se manifest la extremitatea COOH,
ceea ce permite ncadrarea lor printre dipeptidil-carboxipeptidaze. De asemenea, s-a reuit
izolarea de la mai multe specii de Streptomyces (S.rimosus, S.fradiae, S.peptidofaciens,
S.griseus) a unor peptidaze care, pe baza proprietilor specifice (specificitatea de substrat,
inhibarea de ctre EDTA, activare de ctre ionii de calciu, magneziu, prezena leucinei la captul
NH2 terminal) au fost identificate ca fiind leucin-amino-peptidaze (Vitale i colab.,1986).
Tinnd cont c n ultima vreme streptomicetele au nceput s fie utilizate drept gazde
pentru clonarea de material genetic heterolog, este interesant de tiut dac tulpinile utilizate de
obicei drept acceptori elaboreaz sau nu proteaze. Producerea unor asemenea enzime la aceste
tulpini constituie un serios impediment n obinerea produsului dorit. Pornind de la aceast idee,
Aretz i colab.(1989) au studiat prezena enzimelor proteolitice la tulpina S.lividans TK24,
tulpin recombinat obinut pentru prelucrarea i secretarea unei proteine de fuziune (ntre
inhibitorul -amilazei de la S.tendae i proinsulina de la maimua Macacca fascicularis). Dup
purificarea prin cromatografie pe schimbtori de ion au fost separate mai multe tipuri de enzime
proteolitice: alanin-aminopeptidaze, leucin-aminopeptidaze, proteaze de tip tripsinic i proteaze
de tip chimiotripsinic. Dintre acestea, proteazele de tip chimiotripsinic ("chemo-trypsin-like")
sunt cele care degradeaz proteina de fuziune dar aceast aciune poate fi inhibat prin adugarea
n mediul de cultura unor sruri de zinc sau nichel.
Dac n cazul bacililor au fost izolate i clonate genele ce codific sinteza a dou
subtilizine i a unei proteaze neutre (Mc Connell i colab.,1986), n cazul bacteriilor din genul
Streptomyces studiile referitoare la determinismul genetic al producerii de proteaze sunt mult mai
puine. Astfel, Duez i colab.(1987) au reuit izolarea, clonarea i secvenierea genei pentru o
peptidaz extracelular de la Streptomyces sp.R61 la S.lividans, iar Henderson i colab.(1987) au
caracterizat genele pentru proteazele A i B de la S.griseus.
In cazul unor tulpini de streptomicete au fost evideniate unele enzime proteolitice care
degradeaz preferenial colagenul ("collagenase-like")(Mukhopadhyay i Chandra, 1987). Dei
nu au fost izolate i purificate (s-au utilizat filtrate de cultur) enzimele de tip colagenaze de la
144
Streptomyces au evideniat o activitate specific pe colagen din tendon bovin i piele de viel, la
280 C i pH 7,2-7,5, fiind inhibate de EDTA i azid de sodiu. Dei neobinuit, producerea unor
asemenea enzime de ctre streptomicete nu este surprinztoare dac ne gndim la multitudinea
de substrate nutritive pe care aceste bacterii le pot gsi n sol.
3.2. -Amilazele
-Amilazele (1,4--D-glucan-glucanhidrolaza, EC 3.2.1.1.) sunt larg rspndite n rndul
microorganismelor, att la fungi ct i la bacterii, mai ales la specii ale genurilor Bacillus i
Streptomyces, aciunea lor constnd n hidroliza legturilor -1,4-glicozidice de la nivelul
amidonului, elibernd maltoza. Cel mai mult studiate i utilizate n practic sunt -amilazele
produse de speciile de Bacillus (B.amilolyquefaciens, B.licheniformis, B.stearothermophilus,
B.subtilis etc). Aceste bacterii produc dou tipuri de -amilaze: de lichefiere a amidonului
(degradarea amidonului pn la maltodextrine) i de zaharificare (convertesc maltoza la
glucoz). -Amilazele produse de tulpinile de B.licheniformis prezint un interes special datorit
rezistenei lor la temperaturi ridicate (85-1150C). In general, enzimele respective sunt utilizate n
practic n lichefierea amidonului n industria distilatelor ca i n industria textil (Zarnea i
colab.,1980).
O serie de studii genetice realizate prin experimente de mutagenez sau prin clonri de
gene au evideniat faptul c gena pentru -amilaz de la B.subtilis se afl sub un control genetic
complex care este ns puin cunoscut la nivel molecular (Mc Connell i colab.,1986). Se pare
ns c exist mai multe gene reglatoare cu efecte pleiotropice (sacU, sacQ, prtR) care intervin n
exprimarea genei pentru -amilaz, levansucraz, serin proteaz, proteaze neutre i -glucanaz
(Priest, 1987).
In cazul streptomicetelor au fost izolate i caracterizate -amilaze de la mai multe specii,
acest tip de enzime prnd a fi sintetizat practic de majoritatea bacteriilor aparinnd acestui
grup. O atenie special a fost acordat -amilazei produs de S.hygroscopicus (Hoshiko i
colab.,1987), S.limosus (Virolle i Bibb, 1988) i S.venezuelae (Virolle i colab.,1988) la aceste
specii fiind studiat i genele ce codific sinteza i reglarea sintezei acestor enzime. De asemenea,
s-au efectuat experimente de clonare a genelor respective n diferite gazde (E.coli, S.lividans) n
scopul obinerii unor tulpini superproductoare de interes industrial. Pe lng aspectul practic al
cercetrilor de acest tip, ele mai pot oferi o serie de informaii referitoare la modul de exprimare
i reglare a funciilor genelor de la streptomicete (n particular a genelor pentru -amilaz). Mai
mult, rezultatele obinute au permis o comparare a enzimelor de tip -amilaz produse de
streptomicete cu cele produse de alte organisme, n special cu cele produse de eucarioate (Mac
Gregor, 1988).
S-a dovedit c S.hygrosopicus produce o -amilaz care degradeaz amidonul pn la
maltoz, aciunea sa fiind de tip endoglucanolitic (taie legturile -1,4 glicozidice din interiorul
lanului polizaharidic). Compararea secvenei de aminoacizi pe care aceast enzim o conine cu
cele ale altor enzime de acest tip, fie de la procariote (de la bacili) fie de la eucariote (de la
Aspergillus oryzae, A.nidulans, Hordeum vulgare, Drosophila melanosgaster etc) a evideniat
faptul c exist trei regiuni care sunt conservate la toate aceste enzime, indiferent de origine
(Ihara i colab.,1985). Cu toate acestea, -amilaza de la S.hygroscopicus este unic deoarece
conine triptofan la nivelul celei de-a treia regiuni conservate (Mac Gregor, 1988).
Experimentele de clonare a genei amy de la S.hygroscopicus n alte gazde cum ar fi
E.coli i S.lividans au evideniat faptul c, dei transferul genei s-a realizat eficient, exprimarea
sa variaz n funcie de gazd i de numrul de copii ale genei respective (efectul de dozare a
genei). Hoshika i colab. (1987) utiliznd cartarea cu o nucleaz specific ("mung bean
nuclease") au determinat faptul c gena amy de la S.hygroscopicus prezint trei situsuri de
145
iniiere a transcrierii (trei promotori): amyP1, amyP2 i amyP3, care au asemnri mai mult sau
mai puin extinse cu promotorii altor gene de la Streptomyces (endoH, ermP1, aphP1).
Studii similare au fost fcute i cu gena pentru -amilaz (aml) de la S.limosus i
S.venezuelae. In cazul tulpinilor de S.venezuelae analizate s-a observat c exprimarea genei aml
este represat puternic de glucoz n timp ce asupra exprimrii genei similare de la S.limosus
glucoza nu are efect. Exprimarea acestei gene este ns influenat (represat) puternic de
manitol (Virolle i colab.,1988). Interesant este c prin clonarea genei aml de la S.limosus n
S.lividans exprimarea genei este puternic represat de glucoz n noua gazd (Virolle i Bibb
1988). Acesta nseamn c rezistena la aciunea glucozei evideniat la tulpinile de S.limosus
analizate este mai degrab o particularitate a bacteriei dect a genei pentru -amilaz. De
asemenea, n urma comparrii secvenei de aminoacizi a acestei proteine cu proteine similare de
la eucariote s-a observat o omologie ridicat cu -amilaza produs de Drosophila melanogaster
(>40%), Mus musculus (36,8%), Aspergillus nidulans (36,1%) i mai mic cu enzimele similare
de la B.subtilis (22,6%) i B.amylolyquefaciens (16,1%)(Long i colab.,1987).
3.3. Glucoz-izomeraza
In ultimii ani, de mare interes n Japonia, SUA i Frana este obinerea siropurilor cu
coninut ridicat de fructoz din hidrolizate de amidon n urma aciunii glucoz-izomerazei (xilozoizomeraza, EC 5.3.1.5.). Printre productorii recunoscui de asemenea enzime se numr i
unele specii de streptomicete: S.violaceoniger i S.olivochromogenes. Suekane i Iizuka (1982),
n cadrul unor cercetri legate de producerea de glucoz-izomeraz de ctre streptomicete au
evideniat faptul c abilitatea de a converti glucoza la fructoz este larg rspndit ntre bacteriile
acestui gen. Localizarea acestei enzime este att intracelular (cea mai mare parte) dar i
extracelular.
Experimentele lui Szentirmai i colab.(1986) au evideniat faptul c, cel puin n cazul
S.matensis, glucoz-izomeraza intracelular difer de cea extracelular din punctul de vedere al
greutii moleculare. De asemenea, s-a observat c utilizarea ca surs de azot a unei combinaii
de glicocol i sulfat de amoniu i adugarea xilozei i a ionilor de cobalt (de magneziu sau
mangan n cazul altor specii bacteriene) duce la stimularea producerii de enzim la
S.olivochromogenes, S.flavogriseus sau S.violaceoniger (Chen i colab.,1979; Sicard i colab.,
1990).
Park i Toma (1974) au observat c la unele tulpini de streptomicete exist o interrelaie
ntre producerea de glucoz-izomeraz i cea de xilanaz, n funcie de sursa de carbon utilizat
pentru cultivarea bacteriilor respective. Utilizarea unui mediu de cultur ce conine fie xilan fie
glucoz ca surs de carbon determin producerea de glucoz-izomeraz n timp ce xilanaza este
produs doar de bacteriile crescute pe mediu cu xilan, nu i pe cel ce conine glucoz.
Datorit importanei practice deosebite a acestei enzime, n ultimii ani au fost realizate
studii referitoare la determinismul genetic al sintezei glucoz-izomerazei ca i la controlul acestei
sinteze, scopul fiind acela al obinerii prin tehnici de inginerie genetic a unor tulpini capabile de
a sintetiza noi tipuri de glucoz-izomeraze cu proprieti modificate, cu aciunea mai eficient.
Utilizarea D-xilozei ca surs de carbon de ctre bacterii se realizeaz pe o cale metabolic
ce presupune transportul prin membrana plasmatic, izomerizarea la D-xiluloz i apoi
fosforilarea acesteia cu ajutorul xiluloz-kinazei cu formarea de D-xiluloz-5-fosfat. Intermediarul
fosforilat este apoi metabolizat fie pe calea pentozo-fosfailor fie pe calea Embden-Meyerhoff.
Pornind de la aceste date s-a determinat faptul c operonul xyl de la streptomicete (de la
S.violaceoniger n particular) este alctuit din cel puin trei gene: xylA care codific pentru
sinteza xiloz-izomerazei, xylB care codific xiluloz-kinaza i xylX care determin sinteza unei
proteine reglatoare. In cazul acestor bacterii s-a evideniat o situaie interesant: genele xylA i
xylB plasate apropiat una de cealalt pe cromosomul bacterian prezint o orientare diferit,
146
exprimarea lor datorndu-se unor promotori divergeni plasai n regiunea dintre cele dou gene
(Tiraby i colab.,1989). Produsul genei xylX pare a fi o protein reglatoare care controleaz att
exprimarea celor dou gene cu orientare opus ct i propria sa sintez.
Experimentele de clonare care se realizeaz n diferite laboratoare ncearc, pe de o parte
stabilirea cu precizie a genelor ce alctuiesc operonul xyl la streptomicete i modul de reglare a
exprimrii lor att n tulpina de origine ct i n diferite tulpini gazd n care genele respective au
fost clonate, i, pe de alt parte s se construiasc "in vitro" tulpini recombinate genetic capabile
de a sintetiza glucoz-izomeraz cu proprieti ameliorate (de exemplu termostabil) (Sicard i
colab, 1990). Rezultatele obiute pn n prezent sunt promitoare, cercetrile fiind continuate
pe direciile menionate mai sus.
3.4. Celulazele
Biomasa vegetal reprezint sursa major de carbon n ecosistemele terestre astfel c este
fireasc presupunerea c multe dintre microorganismele care populeaz aceste ecosisteme s fie
capabile s degradeze aceste substrate, deci s sintetizeze enzime de timpul celulazelor i
hemicelulazelor. Actinomicetele i n mod special bacteriile din genul Streptomyces constituie un
grup important care intr n alctuirea populaiilor microbiene respective (Mc Carthy i
Williams, 1992).
Celuloza este un polimer neramificat de glucoz compus din uniti de anhidro Dglucoz unite prin legturi 1,4--D-glucozidice. Aceste legturi pot fi hidrolizate de ctre
enzimele celulozolitice. De obicei celuloza este foarte rezistent la hidroliz datorit gradului
ridicat de cristalinitate, rezultatul unei conformai lineare (paralele) care permite realizarea unor
puternice legturi de hidrogen ntre gruprile OH ale lanurilor paralele vecine. In fibrele de
celuloz regiunile cu structur nalt cristalin coexist cu regiunile cu structur amorf iar cele cu
un raport favorabil zonelor cristaline prezint o rezisten crescut la aciunea enzimatic.
Celuloza, aa cum se gsete n natur este un homopolimer cu greutate molecular mare,
insolubil i adesea n asociere intim cu lignina, hemiceluloza la nivelul peretelui celular vegetal
fapt ce o face puin accesibil degradrii enzimatice (Robson i Chambliss, 1989).
Toate organismele care degradeaz celuloza cristalin secret sisteme enzimatice mai
mult sau mai puin complexe care sunt alctuite din enzime cu diferite modaliti de aciune,
specificitate de substrat i care acioneaz de obicei sinergic pentru a hidroliza celuloza. Cel mai
bine studiat sistem celulazic este cel de la fungi (de la Trichoderma reesei), enzimele care l
alctuiesc fiind grupate n trei categorii:
- exo--1,4-glucanaze sau celobiohidrolaze (EC 3.2.1.91.)
- endo--1,4-glucanaze sau endocelulaze (endoglucanaze)(EC 3.2.1.4.)
- -glucozidaza sau celobiaza (EC 3.2.1.21.)
Aceste trei grupe de enzime acioneaz sinergic ducnd la hidroliza celulozei cristaline.
Endoglucanazele determin ruperea legturilor interne ale lanului de celuloz, atacul fcndu-se
la ntmplare i ducnd la formarea de oligozaharide. Efectul direct al acestui tip de enzime este
fragmentarea lanului de celuloz cuplat cu o cretere slab a cantitii de zaharuri reductoare
eliberate. De obicei, n complexele celulozolitice sunt cuprinse mai multe endoglucanaze care
pot prezenta afiniti diferite pentru celo-oligozaharide cu lungimi variate. Spre deosebire de
aceste, exoglucanazele (celobiohidrolazele) acioneaz la nivelul extremitilor nereductoare ale
lanului de celuloz, elibernd glucoz sau celobioz (zaharuri reductoare) n cantitate crescut,
lungimea lanului celulozic nefiind modificat semnificativ.
Acionnd individual, att endoglucanazele ct i celobiohidrolazele pot degrada regiuni
restrnse ale lanului celulozic (cele cu structur amorf). Pentru a determina hidroliza regiunilor
147
cu structur cristalin este necesar ca n amestecul enzimatic s fie prezente ambele tipuri de
enzime.
In ceea ce privete -glucozidazele, acestea determin hidroliza celobiozei n dou
uniti de glucoz. Dei aceste enzime nu sunt propriu-zis celulaze, ele particip la mbuntirea
randamentului degradrii celulozei prin eliminarea inhibrii prin feedback a celulazelor realizat
de obicei de celobioz (Robson i Chambliss, 1989).
Utilizarea a numeroase substrate i diverse tehnici de evideniere a activitii
celulazice a dus la o comparare dificil a sistemelor celulozolitice de la diferite organisme.
Mai mult, deoarece celulazele aflate n extracte brute prezint o suprapunere parial a
specificitii de substrat, un studiu corect trebuie realizat n condiiile purificrii acestor enzime.
In ultima vreme au fost obinute o serie de substrate celulozice care ar putea fi folosite ca
substrate mai mult sau mai puin specifice pentru fiecare dintre componentele sistemului
celulazic (Wood i Bhat, 1988). Cel mai utilizat procedeu de determinare a activitii enzimatice
este msurarea cantitii de zaharuri reductoare eliberate n urma aciunii enzimelor asupra
substratului. Astfel, substratele celulozice cu structur amorf sau cele modificate chimic cum
sunt celuloza-azur, carboximetilceluloza(CMC), celuloza tratat cu acizi ("acid-swollen
cellulose") sau trinitrofenil-carboximetilceluloza (TNP-CMC) sunt degradate n mod
semnificativ i specific de ctre endoglucanaze dar, n unele situaii i celobiohidrolazele le pot
hidroliza de i cu o eficien mai mic. In cazul utilizrii drept substrat a celulozei cu structur
cristalin de tipul Avicelului (celuloz microcristalin), bumbacului sau hrtiei de filtru, pentru
degradarea lor eficient este necesar un sistem celulazic complet, care s conin att
endoglucanaz ct i celobiohidrolaz. De obidei, pentru a determina prezena ntr-un preparat
enzimatic brut a ambelor tipuri de enzime se determin eliberarea de zaharuri reductoare n
funcie de substrat. Astfel, endoglucanazele cauzeaz o cretere rapid a fluiditii (reducerea
vscozitii) carboximetilcelulozei dar o eliberare sczut de zaharuri reductoare. In contrast,
celobiohidrolazele nu modific fluiditatea substratului dar conduce la eliberarea unei cantiti
mai mari de zaharuri reductoare. Cu toate acestea este dificil de precizat dac o celulaz este sau
nu celobiohidrolaz deoarece nu exist un substrat specific pentru aceasta. Deshpande i colab.,
(1988) au artat ns c hidroliza unor compui cum ar fi metil-umbeliferil-celobiozid (MUC)
sau p-nitrofenil--D-celobiozid (pNPC) ar fi un indiciu al activitii exo--1,4-glucanazice.
Exist n prezent numeroase date referitoare la bacterii celulozolitice dar muli autori
consider c bacteriile produc doar endoglucanaze i nu un sistem celulazic complet. Dei cea
mai acceptat teorie referitoare la modul de degradare a celulozei este cea bazat pe rezultatele
cercetrilor efectuate asupra fungilor i care presupune c hidroliza eficient a substratelor
celulozice se realizeaz n urma aciunii sinergice a endo- i exoglucanazelor, ea nu este aplicat
bacteriilor. La acestea, modelul de degradare sugerat presupune c endoglucanazele care au ca
substrat specific celo-oligozaharidele cu lungimi variate pot determina hidroliza celulozei
cristaline dac ele se afl n concentraie mare sau dac se leag de fibrele de celuloz sau sunt
grupate n imediata vecintate a acestora ("celulosomi") (Robson i Chambliss, 1989). Reuita
unor laboratoare din lume de a izola i caracteriza celobiohidrolaze de la bacterii vine s
contrazic n cazul speciilor respective teoria enunat mai sus (Creuzet i colab.,1983; Mac
Kenzie i colab.,1984; Gardner i colab., 1987; Beguin, 1990; Ruttersmith i Daniel, 1991).
Printre bacteriile considerate a avea sisteme celulazice complexe, tipice se numr
genurile Clostridium, Cellulomonas, Bacillus, Thermomonospora, Ruminococcus, Bacteroides,
Erwinia i Acetobacter. De asemenea, tulpini celulozilitice au fost identi-ficate i n cadrul altor
genuri de bacterii: Streptomyces, Rhizobium, Cellvibrio, Pseudomonas, Microbispora etc. In
studiul de fa ne vom referi doar la sistemele celulazice de la dou genuri de bacterii Gram
pozitive, Bacillus i Streptomyces.
148
La bacteriile din genul Bacillus s-a evideniat faptul c ele produc doar endoglucanaza i
nu snt capabile de o degradare eficient a celulozei cristaline. Studiile referitoare la celulazele de
la Bacillus au fost sprijinite i de faptul c aceste bacterii pot fi uor manipulate genetic
(genomurile de la mai multe specii fiind destul de bine caracterizate) i de caracterul extracelular
al acestor enzime. Printre speciile care produc celulaze se numr B.subtilis, B.polymyxa,
B.licheniformis, B.cereus etc.
Studiile referitoare la celulazele de la Bacillus se refer att la caracterizarea biochimic a
enzimelor ct i la identificarea i secvenierea genelor implicate n producerea acestor enzime ca
i n clonarea i exprimarea lor n diferite gazde. In prezent se cunoate secvena de nucleotide a
mai multor endoglucanaze de la Bacillus (tabelul 5) i deci secvena de aminoacizi a proteinelor
corespunztoare, realizndu-se astfel comparaii ntre enzimele secretate de diferite specii de
bacili.
Tabelul 5. Genele pentru celulazele de la Bacillus
Tulpina
Gena
Mrimea
proteinei
produse (aminoacizi)
B.circulans
378
B.subtilis DLG
499
B.subtilis N-24
463
B.subtilis PAP 115
499
B.lautus
celB
536
Bacillus N-4
celA
384
celB
465
celC
>800
B.polymyxa
365
Bacillus 1139
celF
770
Bacillus sp.KSM 635
912
S-a stabilit astfel c enzimele produse de diferite tulpini de Bacillus prezint un grad nalt
de omologie, poriunile cu omologie ridicat fiind localizate, n general, n regiunea
aminoterminal, ceea ce sugereaz c situsul catalitic activ al enzimelor se afl plasat n aceast
zon. Aceast supoziie este sprijinit de observaiile c poriunea de la captul carboxiterminal
al endoglucanazei respective nu este necesar pentru activitatea celulozolitic, regiunea
respectiv putnd fi deletat experimental fr pierderea actibvitii (Nakamura i colab. 1991).
Recent, Henrissat i colab.(1989) analiznd gruprile ("clusterii") hidrofobe ale diferitelor
enzime au clasificat celulazele, inclusiv pe cele de la Bacillus, n ase familii. Din acest punct de
vedere, endoglucanazele de la B.subtilis i B.ciculans sunt incluse n familia A, subfamiliile A2 i
A4 (Beguin, 1990; Gilkes i colab.,1991).
De asemenea, rezultatele de pn acum referitoare la genele pentru enduglucanazele de la
Bacillus sugereaz ideea c ele ar deriva dintr-o gen ancestral comun.
In ceea ce privete particularitile biochimice ale endoglucanazelor de la bacteriile din
genul Bacillus acestea au o greutate molecular ce variaz, de obicei, ntre 35 i 46 kDa, dar
poate atinge, la unele tulpini alcalofile, pn la 92 kDa (Fukumori i colab., 1986), sunt n
general termostabile, activitatea optim realizndu-se la 50-60oC.
Reglarea producerii de endoglucanaze de ctre bacteriile din genul Bacillus variaz nu
numai de la specie la specie ci chiar i de la tulpin la tulpin. Spre exemplu, tulpini de B.cereus,
Bacillus sp.N-4, B.subtilis AU1, B.licheniformis sintetizeaz enzima n mod constitutiv n timp ce
la alte tulpini, B.polymyxa, B.subtilis DLG, Bacillus sp.1139, aceasta pare a fi inductibil. De
asemenea, nivelul glucozei i al celobiozei influeneaz diferit producerea englucanazei de ctre
149
tulpinile bacteriene studiate. Dac n cazul tulpinii B.subtilis AU1 att glucoza ct i celobioza
inhib sinteza enzimatic la concentraii mai mari de 2%, n cazul tulpinii alcalofile Bacillus
sp.1139 glucoza inhib, iar celobioza stimuleaz producerea de enzim. La alte tulpini de
Bacillus, B.subtilis DGL, B.cereus, B.licheniformis, ambele zaharuri reductoare stimuleaz
sinteza endoglucanazei.
In urma experimentelor de clonare a genelor pentru endoglucanaz n diferite gazde (fie
tulpini auxotrofe de E.coli fie alte tulpini de B.subtilis) au fost obinute informaii interesante
referitoare la exprimarea genelor respective n gazde heterologe ca i la reglarea exprimrii
acestora. De obicei, celulazele ale cror gene au fost clonate n E.coli sunt sintetizate iniial sub
forma unor compui de dimensiuni mari, activi din punct de vedere enzimatic, cu localizare
intracelular. Aceti compui sufer o "prelucrare" n urma creia dimensiunea enzimei se
micoreaz, sub aceast form ea fiind exportat n spaiul periplasmic (Cantwell i Mc Connel,
1983; Robson i Chambliss, 1989). In cazul utilizrii drept gazda pentru clonare a unor tulpini
mutante de Bacillus s-a observat un fenomen similar de "procesare intracelular" a precursorului
enzimatic n urma cruia dimensiunia enzimei se apropie de cea a enzimei produs de tulpina de
origine (Robson i Chambliss, 1989). De asemenea, Nakamura i colab.(1991) au observat c
utilizarea drept gazd a unei tulpini mutante de B.subtillis care nu produce proteaze a condus la
obinerea unei cantiti superioare de enzim de la tulpina recombinat. Aceast cretere poate fi
de cel puin 9 ori dac n noua gazd este clonat suplimentar i gena sacQ.
Dei cele mai multe informaii referitoare la degradarea substratelor celulozice de ctre
actinomicete sunt legate de bacteriile din genul Thermomonospora (T.fusca, T.curvata)(Wilson,
1992), n ultimii ani au fost realizate i studii referitoare la sistemul celulazic al bacteriilor din
genul Streptomyces.
Tulpinile de streptomicete capabile de a degrada celuloza aparin la mai multe specii cum
ar fi: S.antibioticus (Enger i Mc Coy, 1965), S.thermodiastaticus (Crawford i Mc Coy, 1972),
S.flavogriseus (Ishaque i Kluepfel, 1980), S.olivochromogenes (Mac Kenzie i colab.,1987),
S.reticuli (Wachinger i colab., 1989), S.lividans (Theberge i colab., 1992), S.flavovirens SfG3
(Cornea i colab., 1993), dar lista poate continua dac inem cont de tulpinile de Streptomyces
care nu au fost ncadrate pn acum ntr-o specie anume.
Primele lucrri referitoare la sistemul celulazic de la streptomicete au evideniat faptul c
acesta este complex, enzimele componente fiind capabile de a degrada substrate foarte variate:
CMC, hrtie de filtru, bumbac, celuloz microcristalin, celobioz dar i paie, tre sau alte
deeuri celulozice. Studiind complexul celulazic de la S.flavogriseus, Ishaque i Kluepfel (1980)
au stabilit c aceste bacterii produc enzime extracelulare capabile de a degrada, cu o rat diferit,
carboximetilceluloza, hrtia de filtru i fibrele de bumbac. De asemenea, tulpina respectiv
produce i -glucozidaz dar aceast enzim rmne n cea mai mare parte localizat
intracelular. Cercetrile ulterioare realizate asupra unor tulpini aparinnd aceleiai specii
(S.flavogriseus) au condus la precizarea c aceste bacterii produc att endoglucanaze ct i
exoglucanaze (celobio-hibrolaze)(Mac Kenzie i colab.,1984). Rezultate asemntoare au fost
comunicate i de ali autori n cazul unor specii diferite de Streptomyces: S.reticuli (Wachinger i
colab., 1989) sau Streptomyces sp.SD16 (Cornea i colab.,1992) (Figura 6).
In ceea ce privete stabilirea condiiilor optime de aciune a acestor enzime, exist o
oarecare variaie n funcie de tulpina bacterian studiat i de autor. Astfel, n cazul tulpinilor de
S.flavogriseus analizate, testarea aciunii enzimelor pe CMC se realizeaz la 50 0C, n tampon
fosfat 50mM pH 6 (Mac Kenzie i colab.,1984) sau n tampon citrat-fosfat 50mM pH 7 (Ishaque
i Kluepfel, 1980), n timp ce activitatea enzimatic pe hrtie de filtru sau pe celuloz
microcristalin (Avicel) se realizeaz la 40 0C fie n tampon fosfat 50mM pH 6 (Mac Kenzie i
colab.,1984) fie n tampon citrat 50mM pH 5,6 (Ishaque i Kluepfel, 1980). La o alt specie,
S.reticuli, testarea activitii celulazelor s-a realizat la 45 0C n tampon Tris HCl pH 7,5
150
(Wachinger i colab., 1989). Ali autori (Godden i colab., 1989) testeaz activitatea
endoglucanazic a filtratului de cultur de la o tulpin de Streptomyces n tampon fosfat de
potasiu 100mM, pH 8 la 500C. Recent, Theberge i colab.(1992) au caracterizat o endoglucanaz
de la S.lividans 66 care prezenta o activitate optim la p 5,5 la 50 0C. O situaie particular a fost
evideniat la o tulpin alcalofil de Streptomyces tulpin capabil de a sintetiza trei
endoglucanaze diferite, cu pH optim de aciune ce variaz ntre 6 i 8,5 (Nakai i colab.,1988).
Figura 7. Activitatea enzimatic a unor tulpini de streptomicete izolate din sol (dup Cornea i colab., 1992).
Figura 8. Aspect electronomicroscopic al suprafeei celulelor de T.curvata cultivate pe fibre de celuloz (dup Bond
i Stutzberger, 1989).
mecanismul de degradare a celulozei este mai complicat dect s-a presupus iniial (Ljungdahl
1989).
Figura 9. Aspect electronomicroscopic al celulelor Streptomyces sp.SD16 cultivate n mediu minimal ce conine
celuloz.
3.5. Hemicelulazele
Alturi de celuloz i lignin, hemicelulozele reprezint componente de baz ale peretelui
celular vegetal, degradarea lor n natur realizndu-se destul de greoi, prin cooperarea unor
sisteme enzimatice de origini foarte diferite. Intre microorganismele productoare de
hemicelulaze un loc important este ocupat de streptomicete datorit sintezei unei game foarte
variate de asemenea enzime.
Hemicelulozele sunt polizaharide care conin diferite tipuri de resturi de zaharuri (xiloz,
manoz, galactoz, arabinoz sau glucoz) ce alctuiesc polimeri lineari sau ramificai.
Clasificarea acestor substane se face n funcie de coninutul n zaharuri. Dintre acestea, -1,4D-xilanii reprezint grupul major de hemiceluloze fiind alctuii din resturi de D-xilopiranozil
unite prin legturi de tip -1,4. In muli xilani resturile de D-xilopiranozil sunt ntocmite de
arabinozil, glucuronozil sau diferite grupri acetil, n funcie de planta de origine. Un alt grup de
hemiceluloze, mananii snt constituii din resturi de D-manopiranozil unite tot prin legturi de tip
-1,4. Si n cazul acestor polimeri unitile specifice de D-manopiranozil pot fi nlocuite de Dgalactozil sau grupri acetat (Zimmermann, 1989). Hemicelulozele reprezint un important
component al peretelui celular vegetal, ele putnd fi linkate la compui fenolici sau pot prezenta
legturi cu lignina.
Sistemul enzimatic pentru degradarea hemicelulozelor const n enzime care cliveaz
legturile din interiorul macromoleculei (endoenzime) i n exoenzime care taie resturile de
zaharuri de la extremitile nereductoare ale polimerului. Prezena unor substitueni variai
influeneaz puternic hidroliza enzimatic. De aceea, pentru hidroliza complet a
hemicelulozelor sunt necesare enzime care s taie n diferite puncte de ramificaie. In sistemul
xilanolitic, aceste enzime acioneaz n cooperare cu xilanazele pentru hidroliza complet a
xilanilor (Biely, 1985).
Tinnd cont de habitatul natural al streptomicetelor i de prezena n acesta a unei mari
cantiti de materiale celulozice i lignocelulozice, bacteriile respective pot fi considerate ca o
surs potenial de enzime hemicelulozolitice (Zimmermann i colab., 1992).
Sistemul enzimatic de degradare a xilanului de la diferite tulpini de Streptomyces a fost
studiat n detaliu. La aceste bacterii au fost identificate mai multe tipuri de hemicelulaze:
xilanaze, -xilozidaze, -L-arabinofuranozidaze, -4-O-metil-glucuronidaze, acetil-xilan
esteraze, ferulic i cumaric esteraze, enzime ce degradeaz mananii (mananaze). Dintre acestea,
1,4--D-xilanazele (EC 3.2.1.8.) au fost mai mult studiate, ele fiind detectate la numeroase
tulpini de Streptomyces (Ball i Mc Carthy, 1988). De asemenea, s-a evideniat faptul c aceeai
tulpin poate produce mai multe xilanaze distincte. Spre exemplu, S.ostreogriseus i S.exfoliatus
produc cte 5 asemenea enzime n timp ce S.lividans produce o singur asemenea xilanaz
(Sreenath i Joseph, 1982; Morosoli i colab.,1986). Recent, Lumba i Penninchx (1992) au
caracterizat mai multe forme de -xilanaz izolate de la o tulpin de Streptomyces cultivat pe
lignoceluloz. Interesant ns c n cazul acestei tulpini, formele de -xilanaz evideniate nu
acioneaz sinergic pentru hidrolizarea substratului ceea ce ar constitui o redundan a crei
semnificaie nu este clar.
Pentru purificarea i caracterizarea xilanazelor de la diferite streptomicete (Tabelul 6) sau utilizat filtrate de cultur din care enzimele au fost precipitate cu sulfat de amoniu i apoi
supuse unor tratamente speciale: ultrafiltrare, cromatrografie pe schimbtori de ioni, gel filtrare i
focusare izoelectric ("isoelectric focusing")(Sreenath i Joseph, 1982; Morosoli i colab., 1986;
Mac Kenzie i colab., 1987; Yasui i colab., 1988).
Cele mai multe dintre aceste enzime au pH ntre 5 i 6,5 iar punctul lor izoelectric variaz
ntre 5,2 i 10,3 (Zimmermann, 1989). Xilanazele determin hidroliza xilanilor prin ruperea
156
legturilor interne -1,4, determinnd eliberarea de xilotrioz, xilobioz sau xiloz (Yasui i
colab., 1988). Un alt tip de hemicelulaze produse de streptomicete, exo--1,4-xilozidazele (1,4-D xylan xylohydrolase, EC 3.2.1.37) hidrolizeaz xilanii prin atac la extremitile nereduc
toare ale lanului de polimer.
Tabelul 6. Proprietile unor xilanaze izolate din diferite tulpini de streptomicete.
Tulpina
pH optim
t0 optim
pI
S.xylophagus
S.flavogriseus
CD45-2
S.exfoliatus
Streptomyces sp.
KT23
S.lividans
Streptomyces sp.E86
6,5
6,5
55-60
50
greutate
molecular (kDa)
-
5,5
5,5
50
55
6,9
43
5,5-6,5
5,5-6,2
55-65
55-60
5,2
7,3
40
Figura 10. Comparaie ntre activitatea enzimatic (celulozolitic) a unor tulpini de streptomicete de tip slbatic
(P216, SD16 i SFG3) i a unor recombinani obinui prin fuziune triparental de protoplati.
In ceea ce privete aciunea pe peretele celular fungic, s-a dovedit c printre enzimele
sintetizate de unele tulpini de Streptomyces se numr i chitinazele, enzimele ce degradeaz
componenta chitinic (dominant) a peretelui celular fungic ducnd la formarea protoplatilor
(Tagawa i Okazaki, 1991). Okazaki i Tagawa (1991) au izolat i caracterizat o chitinaz
produs de S.cinereoruber dup cultivarea pe un mediu ce coninea ca surs de carbon perei
celulari de Aspergillus niger. Enzima respectiv are o greutate molecular de 19 kDa i un pI 8,6
iar pH optim se situeaz n domeniul acid (4,0-5,0) la 500C.
Beyer i Diekeman (1984) au caracterizat enzime de tip laminarinaz de la Streptomyces
sp.ATCC11238 ca i un complex de enzime ce degradeaz eficient chitina i laminarina, fiind
active asupra a peste 50 specii de ascomicete. Fracionarea chitinazei prin gel filtrare i
cromatografie pe schimbtori de ioni a condus la evidenierea unei exo-chitinaze i a unei -Nacetil-glucozoaminidaze ce elibereaz N-acetil glucozamina din crusta chitinoas de crab (Beyer
i Diekman, 1985). In mod asemntor, Billich i colab.(1988) au obinut protoplati de
Fusarium scirpi prin utilizarea unui preparat enzimatic de S.tsushimaensis.
Datele prezentate n aceast lucrare reflect particularitile deosebite ale bacteriilor din
genurile Streptomyces i Bacillus i importana pe care acestea o au att din punct de vedere
teoretic ct i practic, fie pentru obinerea unor compui cu aplicaii in medicin, industria
alimentar, a detergenilor etc. fie n natur, ca verigi importante ale mecanismelor de degradare
i reciclare a unor resturi organice existente de obicei n sol. Cunoaterea echipamentului lor
enzimatic, al potenialului lor de biosintez ca i al determinismului genetic al acestuia corelat
cu tehnicile moderne de biologie molecular i cu cele de fuziuni celulare asigur, pe de o parte,
o mai bun studiere a caracteristicilor acestor bacterii, inclusiv a taxonomiei grupului iar, pe de
158
alt parte, poate conduce la obinerea unor tulpini recombinate genetic capabile de a sintetiza sau
degrada cu o eficien crescut anumii compui cu importan practic deosebit.
Bibliografie selectiv
1. Aretz, W., Koller, K. P., Riess, G., 1989, Proteolytic enzymes from recombinant
Streptomyces lividans TK24, FEMS Microbiol. Letts., 65, p.31-36.
2. Ball, A. S., Mc Carthy, A. J., 1988, Saccharification of straw by actinomycetes enzymes, J.
Gen. Microbiol., 134, p.2139-2147.
3. Baltz, R. H., Seno, E. T., 1988, Genetics of Streptomyces fradiae and tylosin biosynthesis,
Ann. Rev. Microbiol., 42, p. 547-574.
4. Bayer, E. A., Setter, E., Lamed, R., 1985, Organization and distribution of the cellulosome in
Clostridium thermocellum, J. Bact., 163, p.552-559.
5. Beguin, P., 1990, Molecular biology of cellulose degradation, Ann. Rev. Microbiol., 44,
p.
219-248.
6. Beyer, M., Diekman, H., 1985, The chitinase system of Streptomyces sp. ATCC 11238, Appl.
Microbiol. Biotechnol., 23, p. 140-146
7. Billich, A., Keller, U., Kleinkauf, H., Zocher, K., 1988, Production of protoplasts from
Fusarium scirpi by lytic enzymes from Streptomyces tsusimaensis, Appl. Microbiol.
Biotechnol., 28, p.442-444
8. Binnie, C., Warren, M., Butler, M. J., 1989, Cloning and heterologous expression in
S.lividans of S.rimosus genes involved in oxytetracycline biosynthesis, J. Bact., 171, p. 887895
9. Bond, K., Stutzenberger, F., 1989, A note on the localization of cellulosome formation in
Thermomonospora curvata, J. Appl. Bacteriol., 67, p. 605-609.
10. Bonner, M. A., Stutzenberger, F., 1988, Cell surface changes in Thermomonospora curvata
during cellulase induction and repression, Letts. Appl. Microbiol., 6, p.59-63.
11. Buttner, M. J., Smith, A. M., Bibb, M. J., 1988, At least three different RNA polymerase
holoenzymes direct transcription of the agarase gene (dagA) of S.coelicolor A3(2), Cell, 52,
p. 599-607.
12. Chardon-Loriaux, I., Charpentier, M., Percheron, F., 1986, Isolation and characterization of a
linear plasmid from Streptomyces rimosus, FEMS Microbiol.Letts., 35, p.151-155.
13. Chater,K., Bruton,C.J., 1985, Resistance, regulatory and production genes for the antibiotic
methylenomycin are clustered, EMBO.J., 4, p.1893-1900.
14. Cornea, 1996, Obinerea unor bacterii cu importan biotehnologic prin fuziunea i
transformarea genetic a protoplatilor, Tez de doctorat, Universitatea Bucureti.
15. Cornea, C. P., Coglniceanu, G., Brezeanu, A., Vatafu, I., Savu, L., Popescu, I., Pop, A.,
1992, Obinerea protoplatilor de tutun prin utilizarea unui preparat enzimatic brut de
Streptomyces sp. SD16, St. Cercet. Biol., 44, p. 85-88.
16. Cornea, C. P., Vatafu, I., Pop, A., Brezeanu, A., Savu, L., Dobrot, S., 1993, Interspecific
protoplast fusion in Streptomyces, Rev. Roum. Biol., 38, p. 49-53.
17. Cornea, C. P., Vatafu, I., Savu, L., 1994, Plasmid transfer by protoplast fusion, Microbiol.
Ind. Biotehnol., 8, p. 145-148.
18. Coughlan, B. P., 1988, Staining techniques for the detection of the individual components of
cellulolytic enzyme system, Methods in Enzymology, 160, p. 135-145.
19. Cundliff, E., 1989, How antibiotic-producing organims avoid suicide, Ann. Rev. Microbiol.,
43, p. 207-233.
20. Damude, H. G., Gilkes, N. R., Kilburn, D. G., Miller, R. C., Warren, R. A., 1993,
Endoglucanase Cas A from alkalophilic Streptomyces strain KSM-9 is a tipical member of
family B of -1,4-endoglucanase, Gene, 123, p. 105-107.
159
21. Davies, J., 1990, What are antibiotics? Archaic functions for modern activities, Molec.
Microbiol. , 4 (8), p. 1227-1232.
22. Deobald, L. A., Crawford, D. L., 1987, Activities of cellulase and other extracellular
enzymes during lignin solubilization by Streptomyces viridosporus, Appl. Microbiol.
Biotechnol., 28, p. 158-163.
23. Dimcev, A., 1988, Protoplast from antibiotic-producing actinomycetes. Application in the
biotechnology, Biotechnol. Bioeng., 4, p. 12-19.
24. Doyle, R. J., 1994, Introduction to lectins and their interactions with microorganisms, in
Lectin-Microorganism Interaction, Eds. R.J.Doyle si M.Slifkin, Marcel Dekker Inc., p. 1-65.
25. Duitman, E., Hamoen, L., Rembold, M., Vater, L., 1999, The mycosubtilin synthetase of
Bacillus subtilis ATCC6633: A multifunctional hybrid between a peptide synthetase, an
amino transferase, and a fatty acid synthase, Proc. Natl. Acad. Sci. USA: 96 (23), 1329413299.
26. Felix, C. R., Ljungdahl, L. G., 1993, The cellulosome: the exocellular organelle of
Clostridium, Ann. Rev. Microbiol., 47, p. 791-819.
27. Fernandez-Abalos, J. M., Sanchez, P., Coll, P. M., Villanueva, J. R., Perez, P., Santamaria, R.
I., 1992, Cloning and nucleotide sequence of celA1, an endo--1,4-glucanase-encoding gene
from Streptomyces halstedii JM8, J. Bacteriol., 174, p. 6338-6376.
28. Ghangas, G. S., Wilson, D. B., 1988, Cloning of the Thermomonospora fusca endoglucanase
E2 gene in Streptomyceslividans: affinity purification and functional domains of the cloned
gene product, Appl. Envir. Microbiol., 54, p. 2521-2526.
29. Gilbert, H. J., Hazlewood, G. P., 1993, Bacterial cellulases and xylanases, J. Gen. Microbiol.,
139, p. 187-194.
30. Godden, B., Legon, T., Helvenstein, P., Penninckx, M., 1989, Regulation and production of
hemicellulolytic and cellulolytic enzymes by a Streptomyces sp. growing on lignocellulose, J.
Gen. Microbiol., 135, p. 285-292.
31. Gokhale, D. V., Deobagkar, D. N., 1989, Differential expression of xylanase and
endoglucanase in the hybrid derived from intergeneric protoplast fusion between
Cellulomonas sp. and Bacillus subtilis, Appl. Envir. Microbiol., 55, p. 2675-2680.
32. Gormley, E. P., Cantwell, B. A., Barker, P. J., Mc Connell, D. J., 1988, Secretion and
processing of the Bacillus subtilis endo--1,3-14-glucanase in Escherichia coli, Molec.
Microbiol, 2, p. 813-819.
33. Horikoshi, K., Nakao, M., Kurono, Y., Sashihara, N., 1984, Cellulases of an alkalophilic
Bacillus strain isolated from soil, Can. J. Microbiol., 30, p. 774-779.
34. Imanaka, T., 1986, Application of recombinant DNA technology to the production of useful
biomaterials, Adv. Biochem. Eng., 33, p. 1-27.
35. Ishaque, M., Kluepfel, D., 1980, Cellulase complex of a mesophilic Streptomyces strain,
Can. J. Microbiol., 26, p. 183 189.
36. Kakoniova, D., Labudova, I, Liskova, D., 1987, Callus culture as substrate for the production
of specific cell wall degradind enzymes for derived protoplast isolation, Biotechnol. Letts., 9,
p. 721-724.
37. Kinashi, H., 1988, Giant linear plasmids in Streptomyces and antibiotic production, in
Biology of Actinomycetes '88, Japan Scientific Societies Press, p. 117-122.
38. Kinashi, H., 1989, Giant linear plasmids in various methylenomycin-producing strains of
Streptomyces species, in Genetics and Molecular Biology of Industrial Microorganisms, Ed.
C. L. Hershberger, S. W. Queener, G. Hegeman, ASM, p. 141-146.
39. Kirby, R., Hopwood, D. A., 1977, Genetic determination of methylenomycin biosynthesis
by the SCP1 plasmid of Streptomyces coelicolor A3(2), J. Gen. Microbiol., 98, p. 239-252.
40. Kluepfel, D., Shareck, F., Mondou, F., Morosoli, R., 1986, Characterization of cellulase and
xylanase activities of Streptomyces lividans, Appl. Microbiol. Biotechnol., 24, p. 230-234.
160
41. Lamed, R., Naimark, J., Morgenstern, E., Bayer, E. A., 1987, Specialized cell surface
structures in cellulolytic bacteria, J. Bacteriol., 169, p. 3792-3800.
42. Mansouri, K., Pissowotzki, K., Distler, J., Ebert, A., Piepersberg, W., 1989, Genetics of
streptomycin production, n Genetics and molecular biology of industrial microorganisms,
Ed. Hershberger, C. L., Queener, S. W., Hegeman, G., ASM, p. 61-67.
43. Martin, J. F., 1989, Molecular mechanisms for the control by phosphate of the biosynthesis
of antibiotics and other secondary metabolites, n Regulation of secondary metabolism in
Actinomycetes, Ed. S. Shapiro, Boca Raton, CRC, p. 230-251.
44. Martin, J. F., Liras, P., 1989, Organization and expression of genes involved in the
biosynthesis of antibiotics and other secondary metabolites, Ann. Rev. Microbiol., 43, p. 173206.
45. Mc Carthy, A. J., Williams, S. T., 1992, Actinomycetes as agents of biodegradation in the
environment - a review, Gene, 115, p. 189-192.
46. Nakano, M. N., Butsuya, I., Ogawara, H., 1989, Expression of the kanamycin resistance gene
in a kanamycin-producing strain of S. kanamyceticus, J. Antib., 42, p. 423-430.
47. Nakano, M. N., Mashiko, H., Ogawara, H., 1984, Cloning of the kanamycin resistance gene
from a kanamycin producing Streptomyces species, J. Bact., 157, p. 79-83.
48. Okanishi, M., Katagiri, K., Furumai, T., Takeda, K., Kawagichi, K., Saitoh, M., Nabeshima,
S., 1983, Basic techniques for DNA cloning and conditions required for streptomycetes as
host, J. Antib., 36, p. 99-108.
49. Okuda, T., Ito, Y., 1982, Biosynthesis and mutasynthesis of aminoglycoside antibiotics, n
Aminoglycoside antibiotics, Ed. Umezawa, H., Hooper, I. R., Springer Verlag., p. 111-203.
50. Omich, P. K., 1988, Streptomyces cloning: useful recombinant DNA systems and a
summation of cloned genes, Antim. Ag. Chemoth., 32, p. 1465-1471.
51. Peberdy, J. F., Illing, G. T., 1985, Genetic manipulation of antibiotic producer strains, in The
Scientific Basis of Antimicrobial Chemotherapy, Ed. D. Greenwood, F. O' Grady, p.283-322.
52. Pettey, T. M., Crawford, D. L., 1984, Enhancement of lignin degradation in Streptomyces
spp. by protoplast fusion, Appl. Envir. Microbiol., 47, p. 439-440.
53. Pokorny, M., Vitale, L., 1980, Enzymes as by-products during biosynthesis of antibiotics, n
Industrial and Clinical Enzymology, Ed. Vitale, L., Simeon, V., Pergamon Press Oxford, p.
13-25.
54. Pongs, O., 1979, Cloramphenicol, n Antibiotics, Ed.Hahn, F. E., Springer Verlag, 5,
p.
26-42.
55. Ramachandra, M., Crawford, D. L., Pometta, A. L., 1987, Extracellular enzyme activities
during lignocellulose degradation by Streptomyces spp.: a comparative study of wild-type
and genetically manipulated strains, Appl. Envir. Microbiol., 53, p. 2754-2760.
56. Robson, J. M., Chambliss, G. H., 1989, Cellulases of bacterial origin, Enzyme Microbiol.
Technol., 11, p. 626-644.
57. Schlochtermeier, A., Miemeier, F., Schrempf, H., 1992, Biochemical and electron
microscopic studies of the Streptomyces reticuli cellulase (avicelase) in its myceliumassociated and extracellular forms, Appl. Environ. Microbiol., 58, p. 3240-3248.
58. Schlochtermeier, A., Walter, S., Schroder, J., Moorman, M., Schrempf, H., 1992, The gene
encoding the cellulase (avicelase) Cel1 from Streptomyces reticuli and analysis of protein
domains, Molec. Microbiol., 6, p. 3611-362.
59. Srinivasan, M. C., Laxman, R. S., Deshpande, M. V., 1991, Physiology and nutritional
aspects of actinomycetes: an overview, World J. Microbiol. Biotechnol., 7, p. 171-184.
60. Tiraby, G., Bejar, S., Reynes, J. P., Sicard, P. J., Farber, G. K., Ringe, D., Petsko, G. A., 1989,
Genetic, enzymatic and crystallographic studies of the glucose isomerase of two
Streptomyces species, n Genetics and molecular biology of industrial microorganisms, Ed.
Hershberger, C. L., Queener, S. W., Hegeman, G., ASM, p. 119-126.
161
61. Vining, L. C., 1990, Functions of secondary metabolites, Ann. Rev. Microbiol., 44, p. 395427
62. Vining, L. C., 1992, Secondary metabolism, inventive evolution and biochemical diversity: a
review, Gene, 115, p. 135-140.
63. Wachinger, G., Bronnenmeier, K., Staudenbauer, W. L., Schrempf, H., 1989, Identification
of mycelium-associated cellulase from Streptomyces reticuli, Appl. Environ. Microbiol., 55,
p. 2653-2657.
64. Wilson, D. B., 1992, Biochemistry and genetics of actinomycete cellulase, Crit.Rev.
Biotechnol., 12, p. 45-63.
65. Winkelmann G., Allgaier H., Lupp R., Jung G., Iturin AL- a new long chain iturin a
possessing an unusual high content of C16--amino acids, J Antibiot (Tokyo) 1987 Apr.,
40(4): 437-42.
66. Wood, T. M., Bhat, K. M., 1988, Methods for measuring cellulase activities, Methods
Enzymol., 160, p. 87-112.
67. Zarnea, G., 1984, Tratat de microbiologie general, 1, Ed. Academiei.
68. Zimmermann, W., 1989, Hemicellulolytic enzyme systems from actinomycetes, n Enzyme
systems for lignocellulose degradation, Ed. Coughlan, M. P., Elsevier Applied Science, p.
167-181.
69. Zimmermann, W., Davis, B., Winter, B., Shou,W., 1992, Actinomycetes and their enzymes
for applications in the pulp and paper industry, n Biotechnology in Pulp and Paper Industry,
Ed. Kuwahara, M., Shimada, M., Uni Publishers, Co. LdT, p. 145-150.
162