Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
3 PROTEINE
3.3.1 Structura. Conformaia. Configuraia
a) Formula general
O
H2N
C
R
H
aminoacid
N-terminal
R
N
H
C
O
H
N
COOH
R
n aminoacid
C-terminal
O
C
R H
C
C
O
H
C
H
N
C
H
C
R
C 2
H
C
C
_
:O
.. :
N
+
C
_
:O
.. :
C 2
trans
N
+
cis
N
H
H R
C
C
O
H
N
H
H
N
R
C
C
H
N
H
H
N
N
H
C
H
O
H R
C
H
N
N
H
R
C
H
N
R
C
C
N
H
H
N
H
C
O
O
C
C
H
H
N
O
N
H
R
H
C
C
R
H
N
R
N
H
O
C
H
N
C
R
R
C
C
C
H
H
N
N
H
H
C
N
H
C
H
67
68
C1
O1
H1
N1
O2
C2
C
N2
H2
Figura 3.6
Diagrama Ramachandran
- cheie greceasc:
69
- meandre :
d) Structura teriar
Structura teriar este dat de poziia relativ n spaiu a lanurilor
polipeptidice care formeaz o protein (vezi i pag.66).
Ea este determinat de formarea altor tipuri de legturi ntre catenele
laterale R ale aminoacizilor:
- interaciuni van der Waals ntre resturi alchilice :
CH
CH
H3C
H3C
CH3
CH3
CH
CH
-legturi de hidrogen:
CH
C=O
S
S
NH3
CH2
CH
70
71
72
grupa prostetic
metal
hem, clorofil,etc.
acid fosforic
glucide
lipide
acizi nucleici
glucid + acid fosforic
74
CH
CH2
H2C
H
CO
_ prolinhidroxilaza
+ O2 + COO
vitamina C
CH2
CH2
CO
C
H
COO
CH
CH2
H2C
C
H
CO
_
COO
+
+ CO2
CH2
CH2
OH
COO
CO
lizinoxidaza
+
CH (CH2)3CH2NH3
NH
O2
CO
CH
(CH2)3 CHO
NH
+
NH4+H2O
allizina
CO
CO
CH (CH2)3 CHO + H2N (CH2)4CH
NH
NH
CO
CH (CH2)3 CH=N
_ HO
2
NH
(CH2)4 CH
CO
NH
reductaza
NH
CO
CH
NH
CO
CO
CO
CH (CH2)3 CHO + H2C (CH2)2 CH
NH
NH
CHO
CO
CH (CH2)3 CH=C
NH
NH
(CH2)2 CH
CHO
CO
reductaza
NH
CO
CH (CH2)3 CH2CH
NH
(CH2)2 CH
CHO
76
CO
_ HO
2
Colagenul fixeaz cu ajutorul resturilor hidroxil din 5-hidroxilizin oligozaharide, el fiind o glicoprotein. O dizaharid des ntlnit n colagen este cea format
dintr-un rest de -D-glucoz i unul de -D-galactoz prin aciunea unor enzime
specifice: galactoziltransferaza i glucoziltransferaza:
+ NH3
CH2
CH2OH
O
O CH
HO H
NH
OH H
H (CH2)2 CH
HOH2C H
H
CO
O
H
HH
OH H
O
HO
H
OH
d) Elastina
Se gsete n esutul conjunctiv. Este o protein fibroas, flexibil i
extensibil n toate direciile datorit prezenei n compoziia sa a dezmozinei, care se
formeaz din allizin prin condensare cu lizin:
NH CH CO
(CH2)3
CO
CO
CHO
CH (CH2)2
CH2
NH
CHO
H2C
NH2
CHO
(CH2)4
NH
CH
77
(CH2)2 CH
CO
NH
NH
CH CO
(CH2)3
CO
CO
(CH2)2 CH
CH (CH2)2
+
N
NH
NH
(CH2)4
CH
NH
CO
78
Proteinele globulare au forma sferic sau oval. Ele sunt foarte importante
n viaa celulei avnd activitate biologic specific, spre deosebire de proteinele
fibroase care au funcie structural i mecanic.
Majoritatea proteinelor globulare sunt enzime (catalizatori biologici)
absolut indispensabili celulei vii.
Imunoglobulinele au rol de aprare a organismului viu mpotriva bolilor.
Mioglobina i hemoglobina sunt proteine responsabile pentru transportul
oxigenului.
De asemenea, proteinele globulare transport lipide, hormoni sau
mediatori hormonali.
Conformaia acestor proteine este foarte complex.
Astfel, mioglobina este format din opt segmente de elice , racordate
ntre ele, formnd o structur globular. Unitatea fixatoare de oxigen este hemul
cu structur porfirinic i cu un atom de fier bivalent, care reprezint 0.335% din
masa mioglobinei:
CH=CH2
H3C
CH3
CH=CH2
+2 N
Fe
N
N
CH3
H3C
_
OOCCH2CH2
CH2CH2COO
Structura hemului
79
* Metoda ultracentrifugrii
Acest procedeu se bazeaz pe proprietatea proteinelor de a se sedimenta
n funcie de mrimea, forma i densitatea lor. Un rol important n procesul de
sedimentare l joac densitatea solventului.
Masa molecular se calculeaz cu ecuaia Svedberg:
sRT
M = --------------------D (1 v )
unde : s = coeficientul de sedimentare
= densitatea solventului
R = constanta gazelor (8.31.107 erg/mol. oK)
D = coeficientul de difuzie
v = volumul specific parial
T = temperatura absolut (oK)
Obs.: v = creterea volumului cnd se adaug 1 g de substan uscat la un
volum de solvent infinit de mare. Pentru majoritatea proteinelor volumul parial
specific este de ~ 0.74 cm3/g.
Coeficientul de sedimentare de 1.10-13 se numete unitate Svedberg.
n Tabelul 3.3 sunt date constante fizice pentru cteva proteine.
Masa
molecular
(daltoni, D)
16.700
23.240
37.100
68.500
Coeficientul
de difuzie
(D20.107 cm2/ s)
11,3
9,5
7,48
6,1
Coef.de
sedimentare
(s20.1013, s)
2,04
2,54
2,85
4,6
64.500
6,9
4,46
339.700
1,98
7,63
81
* Gel-filtrarea
Este separarea moleculelor de proteine prin trecerea pe o coloan
umplut cu gel de poliacrilamid (Biogel) sau dextran (Sephadex). Moleculele
cu dimensiuni mai mari dect porii gelului sunt antrenate spre ieirea din
coloan, iar moleculele mai mici dect porii gelului trec prin aceti pori, astfel
nct avansarea lor este ntrziat. Aceste geluri se comport ca nite site
moleculare, care cern moleculele dup mrimea lor.
Se calibreaz coloanele cu proteine cu mase moleculare cunoscute i
apoi se separ amestecuri necunoscute.
* Determinarea masei moleculare minime
pe baza compoziiei chimice
O metod mai simpl pentru determinarea masei moleculare minime se
aplic pentru cromoproteinele care au un atom de metal drept grup
prostetic.
Exemplu: pentru masa mioglobinei se folosete relaia:
masa atomic a fierului
M = -------------------------------- . 100 =
% fier
55.8
------ x 100 = 16.700 daltoni
0.335
83
3. Histone
Sunt proteine solubile avnd mase moleculare mici. Conin lizin i arginin n proporie de 30-90%, avnd un caracter bazic; punctul izoelectric este
aproximativ 11.
Histonele sunt coagulabile la nclzire.
In celula vie se gsesc libere n leucocite i n asociaie cu acizi nucleici n
nucleoproteine.
Rolul histonelor este acela de reglare a activitii genelor.
4. Protamine
85
Sunt solubile n ap, au caracter mai bazic dect histonele, fiind formate n
proporie de 80 90% din aminoacizi bazici. Nu conin triptofan, cistein,
fenilalanin, tirozin i nu se coaguleaz la nclzire.
5. Prolamine
Sunt insolubile n ap, solubile n soluii diluate de acizi, baze, n metanol,
glicerin , etanol 70% i greu solubile n etanol absolut.
Diferena de solubilitate n etanol de diverse concentraii este utilizat pentru
operaiile de separare.
Au coninut mic n lizin i triptofan, iar valoarea nutritiv este mic.
Nu se coaguleaz la nclzire.
6. Gluteine
Sunt insolubile n ap, dar solubile n soluii alcaline diluate.
Sunt insolubile n etanol. Au valoare nutritiv mai mare n raport cu
prolaminele.
Gluteina se gsete n boabele de gru sub form de gluten ( 25 40%)
mpreun cu gliadina (40 50%). Glutenul faciliteaz formarea aluatului capabil
s rein dioxid de carbon.
7. Proteine fibrilare (fibroase, scleroproteine)
Sunt insolubile n ap, acizi i baze diluate. (vezi keratinele, colagenul,
elastina, pag.73).
8. Miozina
Este proteina contractil din muchi. Are structura parial globular, parial
fibrilar:
86
2. Cromoproteine
Sunt heteroproteine care au drept grup prostetic un compus colorat.
Exemple:
87
O
O
N
2+
Fe
N
N
N
NH
NH
CH2
CH CO
[HbO2]4
+
[HbO2] + H3O
[HbH] + O2 + H2O
CH CO
CH2
NH
globina + apa
HN
O
H
O
N
2+
O2
Fe
Fe
N
N
N
NH
N
NH
NH
NH
2+
CH2
CH
CO
CH2
CH CO
91
Hb NH2 +
_
+
Hb NHCOO + H
CO2
Hb + CO
HbCO
93
CH=CH2
H3C
H3C
H
N 2+ N
Mg
N
H
ROOCCH2CH2
CH3
CH CO
COOCH3
CH3
3. Glicoproteine
Glicoproteinele sunt heteroproteine formate dintr-o parte proteic i un
rest glucidic: monozaharide, oligozaharide sau polizaharide. Se gsesc n
plasma sanguin, saliv, secreia mucoaselor, etc.
Glicoproteinele protejeaz mucoasele aparatului digestiv, respirator i
uro-genital mpotriva enzimelor proteolitice, a agenilor chimici i mecanici.
Sunt componente specifice de grup sanguin i mpiedic aglutinarea
hematiilor.
Exemple:
Colagenul conine o dizaharid format dintr-un rest de -D-glucoz
legat (1- 2) de un rest de -D- galactoz, iar galactoza se leag de protein
prin intermediul grupei OH din poziia 5 a unui rest de lizin (vezi structura la
pag. 76).
Ovomucoidul restul glucidic este 2-N-acetil--D-galactozamin
legat cu grupa OH glicozidic de un rest asparagil.
Mucopoliglucidele sunt glicoproteine n care predomin componenta
glucidic format din: galactoz, glucoz, manoz, xiloz, glucozamin, Nacetilgalactozamin, acid glucuronic i galacturonic.
4. Lipoproteine
Lipoproteinele sunt formate dintr-o parte proteic i una lipidic.
In funcie de locul unde se gsesc n organism, lipoproteinele sunt:
- celulare (n membrane, mitocondrii, cloroplaste) i
- circulante (n snge).
Din serul sanguin s-au separat prin centrifugare un numr mare de
lipoproteine circulante.
Lipoproteinele au densitatea cu att mai mic cu ct coninutul lor n
lipide este mai mare. La centrifugare ele se ridic la suprafa, prezentnd
fenomenul de flotaie. Unele lipoproteine conin ~ 80% lipide: triacilgliceroli,
colesterol, steride.
Cea mai studiat lipoprotein este -lipoproteina.
S-au mai izolat lipoproteine din mitocondriile hepatice i lipoviteline din
glbenuul de ou.
95
Rolul lipoproteinelor
- ajut la transportul unor compui dintr-o parte n alta a membranei
celulare datorit caracterului hidrofil al prii prostetice;
- furnizeaz energie celulei.
Lipoproteinele celulare se gsesc n membrane, mitocondrii i cloroplaste.
5. Fosfoproteine
Gruparea prostetic din fosfoproteine este acidul fosforic legat printr-o
legtur esteric de o grupare OH din serin, treonin sau tirozin.
In fosforilserin gruparea fosforic este legat de un rest de serin:
NHCHCONHCHCONHCHCO
CH2
R
_ R
2
OPO3
Fosfoproteinele au un caracter acid i pot forma sruri de calciu sau
potasiu.
Se gsesc n lapte, ou, etc.
Exemple:
* cazeinele din lapte
* ovovitelinele din glbenuul de ou
Cazeinele sunt insolubile n mediu acid. Ele sunt principalele proteine
din lapte. Prin electroforez s-au izolat trei tipuri de cazein cu mobilitate
electroforetic diferit: , , - cazeina.
La fierberea laptelui cazeinele nu precipit, ele protejeaz albuminele
i globulinele contra coagulrii. Ionii de Ca 2+ precipit cazeinatul de calciu,
insolubil n ap, care este digerat n stomac prin aciunea enzimelor
proteolitice.
Cazeinele conin toi aminoacizii eseniali i de aceea prin coninutul n
cazein, laptele este un aliment cu valoare nutritiv foarte mare.
Fosfoproteinele din glbenuul oului sunt asociate cu lecitinele, fiind o
surs de aminoacizi i de fosfat pentru dezvoltarea embrionului.
96
6. Nucleoproteinele
Grupa prostetic a acestor heteroproteine sunt acizi nucleici.
In funcie de acidul nucleic, nucleoproteinele pot fi :
- ribonucleoproteine cu ARN ( exemplu: ribozomii)
- deoxiribonucleoproteine cu ADN prezente n nucleul celular.
Rolul nucleoproteinelor este de a stabiliza configuraia acizilor nucleici.
3.3.3.5 Procedee de separare i purificare a proteinelor
a. Dializa
Proteinele globulare aflate n soluie pot fi uor separate de substane cu
molecule mici prin dializ. Se utilizeaz o membran semipermeabil, care las
s treac numai moleculele de ap i moleculele mici dizolvate.
Moleculele proteinelor au mase moleculare mai mari dect porii
membranei i vor rmne n sacul de dializ.
Deplasarea moleculelor mici are loc prin difuzie pe baza gradienilor de
concentraie care se stabilesc de o parte i de alta a membranei de dializ.
Pentru mrirea vitezei de separare se lucreaz cu agitare sau se schimb
solventul fa de care se face dializa.
Desalinizarea unei soluii saline de albu de ou fa de ap distilat se
face utiliznd o membran de celofan (acetat de celuloz).
Se verific trecerea ionilor de clor din sacul de dializ n ap cu soluie de
azotat de argint. La sfritul dializei se observ c n sacul de dializ au
precipitat ovoglobulinele, insolubile n soluii saline diluate i ap distilat.
b. Ultrafiltrarea
Este o filtrare a unei soluii proteice saline printr-o membran
semipermeabil, sub aciunea unei fore centrifuge sau a presiunii externe a
unui gaz (azot).
Ca membran se poate utiliza celofanul sau alte materiale sintetice
poroase.
c. Centrifugarea n gradient de densitate (centrifugare zonal)
Aceast metod se utilizeaz pentru separarea proteinelor, ct i pentru
separarea organitelor celulare.
97
99
+
OOC CH2O celuloza + proteina NH3
_
+
proteina NH3 OOC CH2O celuloza
Se poate folosi i o metod de separare mixt, care mbin cromatografia
de schimb ionic cu gel filtrarea (excluderea molecular) utilizndu-se ca faz
staionar DEAEC-Sephadex sau DEAC-Sephacel.
i. Adsorbie selectiv
Este o metod cromatografic n care faza staionar este crbune,
silicagel sau gel de aluminiu, care adsorb selectiv proteinele. Prin eluarea
ulterioar selectiv se pot izola proteinele adsorbite.
O faz staionar des utilizat este hidroxiapatita (fosfat de calciu
cristalizat), care reine proteina cu ajutorul ionilor de calciu din reeaua sa. Prin
eluare cu tampoane de fosfat adecvate se pot desorbi selectiv proteinele astfel
reinute.
j. Cromatografia de afinitate
Aceast metod se bazeaz pe proprietile biologice ale proteinelor.
Metoda presupune imobilizarea (n mod obinuit printr-o legtur
covalent) a unui ligand specific capabil s lege o anumit protein dintr-un
amestec de proteine. Dup trecerea amestecului de proteine prin coloana astfel
pregtit are loc eluarea proteinei legate prin anihilarea interaciei protein
ligand, sau prin introducerea n eluent a unui
partener competitiv, care se va lega de ligandul imobilizat, punnd astfel n
libertate proteina fixat anterior.
Aceast tehnic cromatografic servete i la purificarea enzimelor care
se pot lega necovalent de coenzimele specifice.
Pentru a separa o anumit enzim dintr-un amestec de proteine, se
folosete o faz staionar inert (agaroz reticulat) pe care se imobilizeaz
cofactorul sau coenzima capabil s lege enzima respectiv.
La trecerea amestecului de proteine, enzima rmne fixat pe faza
staionar, iar restul proteinelor ies din coloan.
Ulterior se elueaz enzima de pe faza staionar.
100
101