Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
STRUCTURA ŞI ORGANIZAREA
MATERIALULUI GENETIC
1. STRUCTURA ADN
1.1. Structura primară a ADN.
ADN este un polimer de dezoxiribonucleotide. Unitatea structurală a ADN este
dezoxiribonucleotidul, având în componenţă trei elemente distincte: o pentoză, o bază azotată
şi grupul fosfat (figura 1.1).
a) Pentoza este un glucid cu 5 atomi de carbon, reprezentat de dezoxiriboză, care
prezintă o grupare OH în poziţia 3'.
b) Baza azotată
poate fi purinică -
Bază
adenina (A) şi guanina
azotată
(G) (figura 1.2) - sau
pirimidinică - citozina
(C) şi timina (T)
H OH
(figura 1.3). Baza
Pentoză Grup fosfat
azotată se leagă printr-
Nucleozid o legătură N-glicozi-
1
Guanină (G) Adenină (A)
Nucleotidele din ADN se
leagă între ele prin
legături covalente 3'-5'
fosfodiester, stabilite
între OH 5' al dezoxi-
Fig. 1.2. Baze azotate purinice ribozei unui nucleotid şi
OH 3' al dezoxiribozei
Citozină (C) Timină (T) Uracil (U)
nucleotidului următor. Se
constituie, astfel, un lanţ
polinucleotidic continuu,
liniar, lung, care repre-
zintă structura primară
a ADN.
Fig. 1.3. Baze azotate pirimidinice
2
şanţ mic
Complex fosfat-dezoxiriboză
În ADN numărul de adenine este egal cu numărul de timine, iar numărul de guanine egal cu
numărul de citozine,
respectiv raportul lor este
întotdeauna unitar (A/T =
1; G/C = 1); iar raportul
sumelor bazelor purinice
şi pirimidinice este
întotdeauna unitar
(A+G/T+C=1), indiferent
de specie. În schimb,
raportul A+T/G+C nu este
unitar, fiind o caracteris-
tică de specie (la om,
raportul A+T/G+C = 1,7).
Cele două catene
din structura dublului
Fig. 1.5. Legături de hidrogen între bazele azotate
helix au o orientare complementare (modificat după Passarge, 2001)
antiparalelă (în sensurile
5' - 3', respectiv 3' - 5'), ca urmare a legăturilor dintre bazele complementare. Catenele,
3
asemănătoare cu două panglici, sunt răsucite dextrogir una în jurul alteia, şi ambele în jurul
unui ax imaginar, de la stânga la dreapta
Se formează, astfel, o dublă spirală helicoidală, asemănătoare unei scări în spirală, în
care axele glucidofosforice reprezintă marginile, iar perechile de baze treptele scării.
Bazele azotate sunt dispuse în interiorul helixului, perpendicular pe axul glucido-
fosforic; fiecare pereche de baze (pb) este deviată cu aproximativ 36º faţă de pb vecine.
Fiecărui tur complet al spirei îi corespund 10 pb. Distanţa dintre bazele suprapuse este de 0,34
nm, astfel că unui tur de helix (10 pb) (pasul elicei) îi corespunde o lungime de 3,4 nm.
Diametrul dublului helix este de 2 nm. La exteriorul helixului sunt vizibile două
şanţuri: un şanţ mare, important pentru fixarea pe molecula de ADN a proteinelor reglatoare, şi
un şanţ mic, necesar fixării histonelor.
Modelul descris corespunde formei B a ADN care, în condiţii fiziologice, este forma
predominantă. Dintre celelalte variante structurale ale ADN celular, cele mai bine cunoscute
sunt formele A şi Z, care pot fi prezente pe distanţe scurte. Forma A este mai compactă decât
forma B şi este adoptată la concentraţii saline mari. Forma Z este un helix levogir, mai lax ca
forma B, cu pasul de răsucire în zig-zag. Formele C, D, E, dextrogire, par să nu existe in vivo.
Modelul dublu catenar al ADN asigură stabilitatea informaţiei genetice.
4
2.1. Genomul nuclear
2.1.1. Organizarea genomului uman nuclear
Genomul nuclear cuprinde 20.000-25.000 de gene şi are o lungime de 3,2 Gb. Conţine
peste 99% din ADN celular (figura 1.6).
Genom uman
~ 3,3 Gb
6
► ADN înalt repetitiv
ADN înalt repetitiv reprezintă 10% din genom şi este alcătuit din secvenţe foarte
scurte (2-200 pb), repetate de în tandem de milioane de ori. Secvenţele înalt repetitive, care
nu sunt transcrise, sunt reprezentate de:
- sateliţi (ADN satelit), prezenţi în heterocromatina constitutivă din anumite regiuni
cromozomiale - centromer (banda C), telomere (secvenţa TTAGGG), constricţii secundare,
benzi G, precum şi din cromozomul Y (corpusculul fluorescent); ADN satelit are deci rol
structural.
- minisateliţii sunt secvenţe foarte scurte, de circa 15 pb, repetate în tandem şi
dispersate în toţi cromozomii (cu excepţia cromozomilor X şi Y), unde ocupă situsuri
specifice.
Minisateliţii sunt alcătuiţi dintr-o regiune centrală, cu o secvenţă identică, şi regiuni
periferice variabile. Numărul de copii ale secvenţei unui minisatelit, precum şi variantele
secvenţelor acestuia variază de la o persoană la alta; minisateliţii sunt denumiţi şi regiuni
hipervariabile (VNTR - variable number of tandem repeats) şi reprezintă markeri genetici ai
individului: amprenta ADN (DNA fingerprinting) sau profilul ADN; probabilitatea de a
întâlni doi indivizi neînrudiţi identici este mai mică de 10-20.
- microsateliţii sunt secvenţe de 1-13 pb, cel mai frecvent dinucleotidice (STR - short
tandem repeats sau VNDR - variable number of dinucleotides repeats), distribuite neuniform
la nivelul genomului.
Mini- şi microsateliţii sunt localizaţi în regiunile de eucromatină, şi anume în ADN
extragenic şi introni. Aceste secvenţe repetitive sunt, cel mai probabil, rezultatul unor defecte
ale împerecherii (slippage = alunecare) în timpul procesului de replicare a ADN.
OH
ARNr
12S Cit
b
ARNr
16S ND
Sensul 6
replicării
catenei H ND5
ND
1
ND4
Sensul
ND replicării ND4L
2 catenei L
ND3
COIII
OL
COI
ATP6
COII
ATP8
8
În fiecare celulă umană există câteva mii de copii ale ADN mitocondrial (ADNmt).
Genomul mitocondrial al zigotului provine exclusiv de la ovul, deci este moştenit numai de la
mamă.
ADNmt diferă de cel nuclear şi prin următoarele: 1) nu formează complexe cu
proteine; 2) procentul de ADN codant este mare – circa 97%; 3) conţine foarte puţin ADN
repetitiv; 4) este lipsit de introni; 5) replicarea este unidirecţională şi începe în puncte de
origine diferite pentru cele două catene; 6) transcrierea este continuă, fără întrerupere, în
direcţii diferite pe cele două catene, rezultând un transcript multigenic de dimensiune mare; 7)
lipsesc unele mecanisme de reparare a leziunilor ADN, astfel că mutaţiile se acumulează rapid;
8) conţine 37 de gene, care codifică ARNr de dimensiuni reduse, ARNt şi polipeptide; 9) are 4
codoni stop, din care doi sunt codoni sens în ADN nuclear, iar codonul stop UGA din ADN
nuclear este codon sens în ADNmt.
3.1. Cromatina
3.1.1. Eucromatina şi heterocromatina
9
Cromatina reprezintă complexul format din ADN nuclear şi proteine. Ea se prezintă
microscopic sub două aspecte, diferite ca structură şi funcţie: eucromatina şi heterocromatina.
► Eucromatina este mai puţin condensată şi slab colorată cu coloranţi bazici;
reprezintă cromatina activă genetic (transcripţională); se replică precoce în faza S a ciclului
celular; conţine mai mult ADN nerepetitiv (în care predomină perechile de baze G-C) şi
proteine nehistonice. Eucromatina poate fi evidenţiată în cromozomii metafazici sub forma
benzilor R.
► Heterocromatina este puternic condensată sub formă de cromocentri şi colorată
mai intens cu coloranţi bazici; este cromatina inactivă genetic; se replică tardiv în faza S;
conţine mai mult ADN repetitiv (în care predomină perechile de baze A-T) şi histone.
Heterocromatina este de două tipuri: constitutivă şi facultativă.
- Heterocromatina constitutivă rămâne sub formă condensată pe tot parcursul
ciclului celular. Nu conţine gene funcţionale şi este formată din ADN înalt repetitiv. La nivel
cromozomial, heterocromatina constitutivă se găseşte în la nivelul centromerului, a
telomerelor, la nivelul constricţiilor secundare, pe braţul lung al cromozomului Y şi pe braţele
scurte ale cromozomilor acrocentrici. Ea ocupă poziţii identice pe cromozomii omologi şi
poate fi evidenţiată în cromozomii metafazici sub forma benzilor C. Se presupune că
heterocromatina constitutivă are rol în stabilizarea centromerelor şi telomerelor, precum şi în
sinapsa dintre cromozomii omologi meiotici.
- Heterocromatina facultativă este o formă de cromatină care a fost sau va fi activă
într-un stadiu al dezvoltării ontogenetice şi care intervine probabil în reglarea genelor; conţine
secvenţe de ADN nerepetitiv. Exemplul cel mai caracteristic îl constituie cromatina sexuală
X, unul dintre cei doi cromozomi X inactivaţi în celulele somatice feminine.
Cromatina Y
La bărbaţi (XY), cromatina sexuală este reprezentată de heterocromatina de la nivelul
celor 2/3 distale ale braţului lung al cromozomului Y; poate fi vizualizată, prin coloraţia cu
quinacrină şi examinare microscopică în lumină ultravioletă, sub forma unui corpuscul intens
fluorescent, denumit şi cromatină Y sau corpuscul F.
Numărul de corpusculi F este egal cu numărul cromozomilor Y.
11
numit ADN de legătură (ADN linker), care este asociat cu histona H 1. Se constituie astfel
filamentul nucleozomic, asemănător cu un „şirag de mărgele”. Această structură reduce
lungimea dublului helix ADN (2 nm) de circa 10 ori.
2. Al doilea nivel de organizare a cromatinei este fibra de cromatină de 30 nm
(figura 1.11c), care rezultă din spiralizarea sub formă de solenoid a fibrei de 10 nm. Această
structură, care reduce lungimea dublului helix de 40 de ori, este stabilizată de histona H 1 şi
conţine 6 nucleozomi per tur de helix. Cromatina din nucleul interfazic are ca unitate de
organizare fibra de cromatină de 30 nm.
3. Al treilea nivel de organizare a cromatinei este reprezentat de buclele de cromatină
(fibra pliată în bucle laterale) (figura 1.11d) cu un diametru de 300 nm, care rezultă prin
plierea fibrei de cromatină de 30
Histone H2A, H2B, H3, H4
nm. Fiecare buclă este ataşată
prin anumite regiuni din
structura fibrei de ADN (bogate
în AT) la un schelet proteic
ADN linker
central. Scheletul proteic central
este format din proteine
nehistonice. Fixarea buclelor la
scheletul central este neregulată,
10 nm
ele formând, din loc în loc, mici
Fig. 1. 10. Nucleozomul aglomerări de bucle, denumite
cromomere. În cromozomii
condensaţi, cromomerele formează grămezi, vizibile sub forma benzilor G intens colorate.
Buclele de cromatină se spiralizează şi condensează puternic la începutul diviziunii,
alcătuind cromatida unui cromozom (figura 1.11e) care, în metafază, are un diametru de 700
nm şi care atinge cel mai înalt grad de condensare a fibrei elementare de cromatină de 30 nm.
Fiecare cromatidă a unui cromozom conţine deci o singură moleculă de ADN cu grade
succesive de împachetare. La sfârşitul diviziunii, cromozomii se despiralizează.
Histonele sunt proteine mici bazice, bogate în arginină şi lizină, care se fixează de
ADN la nivelul şanţului mic. Sunt codificate de gene lipsite de introni, situate pe cromozomii
1, 6 şi 12. Se deosebesc cinci tipuri de histone: H1, H2A, H2B, H3, H4, cu rol important în
organizarea supramoleculară a ADN. Histonele H2A, H2B, şi mai ales H3 şi H4, au o structură
12
conservată în evoluţie. În diferite stadii ale ciclului celular, histonele sunt supuse unor
transformări chimice care le conferă importante proprietăţi funcţionale: acetilarea lor
(a) determină activarea unor gene, metilarea
2 nm
produce represia genelor, iar fosforilarea
histonei H1 este urmată de condensarea
fibrelor de cromatină în cromozomi şi
declanşarea mitozei.
(b) 10 nm
14
(2) Centromerul (cen) este regiunea cromozomială în care sunt ataşate cele două
cromatide, formând constricţia primară. În mod normal, fiecare cromozom are un singur
centromer, constituit din ADN înalt
Telomere
repetitiv (ADN satelit) denumit ADN Heterocromatină
centromeric, identic la toţi cromozomii, ce
poate fi identificat prin tehnica de bandare
C. La aceste secvenţe repetitive se leagă
un complex de proteine cunoscut sub
denumirea de kinetocor, câte unul pentru
fiecare cromatidă. Kinetocorul reprezintă Centromer
15
- metacentrici, cu centromerul situat în mijlocul cromozo-mului şi braţele aproximativ
egale;
- submetacentrici, cu centromerul situate în vecinătatea punctului median al
cromozomului şi braţe de lungimi diferite;
- acrocentrici, cu centromerul situat spre un capăt al cromozomului.
(3) Telomerele (t) sunt structurile situate la capetele cromozomului, formate din ADN
şi proteine. În structura telomerului există un bloc de ADN repetitiv, identic la toţi
cromozomii, în care o secvenţă scurtă (5'-TTAGGG-3') se repetă în tandem de cîteva mii de
ori. Regiunea subtelomerică, notată TAR (telomere associated repeats) se află sub acest bloc şi
este constituită din ADN repetitiv cu funcţie încă necunoscută.
Se presupune că telomerele au următoarele funcţii:
- menţin integritatea structurală a cromozomului, împiedicând digestia prin nucleaze;
pierderea telomerelor generează capete cromozomiale instabile, “lipicioase”, care au tendinţa
de a fuziona cu capetele altor cromozomi lipsiţi de telomere, determinănd diferite aberaţii
structurale;
- asigură o replicare completă a capetelor cromozomiale, proces realizat de o
telomerază (vezi Capitolul Replicare); când activitatea acesteia se reduce, la fiecare replicare
se pierd treptat secvenţe telomerice. Astfel, lungimea telomerelor va scădea progresiv, iar când
este atinsă o limită critică, celulele nu se mai divid şi mor prin apoptoză;
- participă la stabilirea structurii tridimensionale a nucleului, ca urmare a fixării, prin
telomere, a cromozomilor pe faţa internă a învelişului nuclear;
- asigură împerecherea cromozomilor omologi în timpul meiozei primare.
17
3.2.3. Clasificarea cromozomilor umani
Cromozomii sunt identificaţi pe baza morfologiei lor. Ei sunt clasificaţi conform
Sistemului internaţional de nomenclatură citogenetică umană (International System of
Human Cytogenetic Nomenclature - ISCN), adoptat în 1995.
Pe baza taliei şi poziţiei centromerului, cromozomii au fost clasificaţi în 7 grupe,
notate de la A la G; fiecare cromozom somatic este desemnat printr-un număr de la 1 la 22
(figura 1.14). Se obţine astfel o aranjare sistematizată a cromozomilor unei celule numită
cariotip .
● Cromozomi mari sunt cromozomii grupei A (perechile 1-3), metacentrici
(cromozomul 2 este mai submetacentric) şi cromozomii grupei B (perechile 4-5),
submetacentrici;
● Cromozomi mijlocii sunt cromozomii grupei C (perechile 6-12 şi cromozomul X),
submetacentrici, cromozomii grupei D (perechile 13-15), acrocentrici şi cromozomul 16
(aparţine grupei E ), metacentric;
● Cromozomi mici sunt cromozomii grupei F (perechile 19-20), metacentrici,
perechile 17-18 (aparţin grupei E), submetacentrici şi cromozomii grupei G (perechile 21-22
şi cromozomul Y), acrocentrici.
Conform ISCN, pentru a desemna un cariotip normal sau anormal, se menţionează în
următoarea ordine şi separaţi prin
virgule: numărul de cromozomi,
constituţia cromozomilor sexuali şi
anomaliile numerice sau structurale
ale cromozomilor somatici (atunci
când sunt prezente). Prezenţa unui
mozaic cromozomial se notează
menţionând cariotipurile liniilor
celulare componente, separate printr-
o diagonală (/) (pentru detalii – vezi
Caiet lucrări practice).
18
Termenul de heteromorfism cromozomial defineşte variaţiile în morfologia
cromozomilor omologi la un individ sau la persoane diferite, iar cromozomul deosebit
morfologic de omologul său este considerat a fi cromozom marker.
Fiecare individ are cel puţin un cromozom marker pe care îl transmite, de obicei,
neschimbat la descendenţii săi (poate fi folosit în stabilirea paternităţii).
Regiunile cromozomiale heteromorfice sunt regiuni de heterocromatină alcătuite din
ADN repetitiv inactiv genetic, astfel încât nu determină modificări fenotipice şi sunt
considerate variante morfologice normale. Cele mai cunoscute tipuri de heteromorfism
cromozomial sunt:
dimensiunea braţului scurt al cromozomului Y
dimensiunea heterocromatinei centromerice (banda C)
dimensiunea sateliţilor
situsurile fragile induse de inhibitori ai acidului folic
19