CATEDRA

DE BIOCHIMIE MEDICAL
eful catedrei: Prof.Dr. Ileana Olteanu
Membrii:
Conf. Dr. Ioana Brudasca
Conf. Dr. Alexandra Craciun
Conf. Dr. Luminia Diaconescu
Conf. Dr. Maria Dronca
Conf. Dr. Cristina Drugan
ef de lucrri Dr.Tiberiu Nistor
ef de lucrri Dr. Lucia Procopciuc
ef de lucrri Dr. Lucia Dican
Asistent Ciprian Silaghi
Asistent Razvan Rusu

Ce este biochimia?
9 Punte de legtur dintre
Chimie, stiina ce studiaz:
structura atomilor i moleculelor
interaciunile lor

Biologie, stiina ce studiaz:

structura celulelor i organismelor
interaciunile lor

9 Stiina care studiaz organismele vii la nivel molecular

Scopul principal al biochimiei

De a determina
modul cum interacioneaz variatele molecule
din organismele vii
pentru a
constitui, menine i perpetua viaa.

Domeniile principale ale biochimiei

9Structura i funcia biologic a compuilor
chimici ce alctuiesc organismele vii.
Relaia structur-funcie.
9Totalitatea transformrilor chimice din
organismele vii (metabolism)
9Mecanismul stocrii i transmiterii informaiei
genetice

PROGRAMA ANALITIC
BIOCHIMIE MEDICAL Sem I

AMINOACIZI
PEPTIDE
PROTEINE
STRUCTUR
RELAIA STRUCTUR-FUNCIE
Mioglobina
Hemoglobina
Albumina
Imunoglobuline
Colagen
Elastina

ENZIME
COFACTORI ENZIMATICI
VITAMINE
RECEPTORI
NUCLEOTDE & ACIZI NUCLEICI

TEMATICA CURSULUI 1
Aminoacizi

Formula general
Importana biomedical
Standard & Nonstandard
Eseniali & Neeseniali
Clasificare funcie de structura i polaritatea radicalului
Denumiri. Abrevieri
Proprieti optice & spectrale
Proprieti acido-bazice. Relaia Henderson-Hasselbalch
Incrcare electric la pH fizilogic
Sisteme tampon

Peptide

Importana biomedical
Caracteristici structurale
Definiie & Denumire
Proprietati
Clasificare
Semnificaie biologica
Peptide naturale (ex. familia POMC, ocitocin, vasopresin , glutation)
Peptide artificiale (ex. aspartam)

TEMATICA CURSULUI 2
Proteine
Importana biomedical
Clasificare
Nivele de organizare structural
Impachetarea proteinelor
Denaturarea proteinelor
Proteine chaperon

AMINOACIZI- Formula general

Partea comun tuturor
aminoacizilor

H
+

Grupare
amino

H3N

C COO

Grupare
carboxil
Carbonul se gsete ntre
gruprile carboxil i amino

Radicalul este caracteristic

fiecrui aminoacid

AMINOACIZI
Gruprile -carboxil i -amino
sunt implicate n formarea legturii peptidice
H

H
NH

C CO

NH

Radicalii determin
proprietile proteinei

C CO

AMINOACIZI
Importanta biomedicala

Unitati de constructie ale proteinelor

Precursori ai unor compusi cu importante roluri biologice

Tyr Catecolamine
Melanina
Trp Serotonina
Melatonina
Arg Creatina
His Histamina
Glu GABA (acid gama aminobutiric)
Met SAM (S-Adenozil metionina)
Asp, Gln Nucleotide
Arg NO

Neuromediatori: Glu
Sursa de energie

AMINOACIZI STANDARD
= amino acizii codificai genetic

AMINOACIZI CLASIFICARE structura R

Aminoacizi* standard
I. Monoamino monocarboxilici

Radical alifatic
aciclic

Radical aromatic
ciclic

homociclic

heterociclic
Triptofan

nesubstituit

subsituit

nesubstituit

nesubstituit

Glicina
Alanina
Valina
Leucina
Izoleucina

hidroxilici

*iminoacid

Fenilalanina

Serina
Treonina

Prolina

substituit

tiolici & tioeterici

Cisteina
Metionina
amidici
Asparagina
Glutamina

fenolic
Tirozina

AMINOACIZI CLASIFICARE Structura R

Aminoacizi standard

II. Monoamino dicarboxilici

Acidul aspartic (asparagic)
Acidul glutamic

III. Diamino monocarboxilici

Lizina (-amino)
Histidina (-imidazol)
Arginina (-guanidino)

AMINOACIZI
Monoamino monocarboxilici
-AMINOACIZI

Alifatici, aciclici, nesubstituiti

COO
H3N

C H
H

COO
H3N

C H

COO
H3N

CH3

C H

COO
H3N

CH
H3C

CH3
H3C

Glicina Gly G

Alanina Ala A

Valina Val V

C H

COO
H3N

C H

CH2

CH CH3

CH

CH2

CH3

Leucina Leu L

CH3
Izoleucina Ile I

AMINOACIZI
Monoamino monocarboxilici
Alifatici, aciclici, substituiti

Hidroxilici
COO
H3N

C H

COO
H3N

Tioeterici

Tiolici
+

C H

COO
H3N

C H

COO
H3N

C H

CH2

CH OH

CH2

CH2

OH

CH3

SH

CH2
S
CH3

Serina Ser S

Treonina Thr T

Cisteina Cys C

Metionina Met M

AMINOACIZI
Monoamino monocarboxilici
Am idici
COO
H3N

COO
H3N

CH2

CH2

CH2
NH2

C
O

Asparagina Asn N

NH2

Glutamina Gln Q

AMINOACIZI
Monoamino monocarboxilici
Alifatici, ciclici,
nesubstituiti

Aromatici
COO

Iminoacid

H3N

H2C CH2
H2C

CH COO

C H

COO
H3N

CH2

C H
CH2

COO
H3N

C H
CH2

N
H2

NH
OH

Prolina Pro P

Fenilalanina Phe F

Tirozina Tyr Y

Triptofan Trp W

AMINOACIZI
Monoamino dicarboxilici

COO
H3N

CH2
COO

COO
H3N

CH2
-

CH2
COO

Aspartat Asp D

Glutamat Glu E

AMINOACIZI
Diamino monocarboxilici
COO
H3N

COO
H3N

CH2

CH2

CH2

CH2

CH2

CH2

CH2

NH

NH3

COO
H3N

CH2
HN

NH

H2N
Lizina Lys K

NH2

Arginina Arg R

Histidina His H

AMINOACIZI - Denumiri
Denumire uzuala
Alanina
Aspartat
Asparagina
Arginina
Cisteina
Fenilalanina
Glicina (glicocol)
Glutamat
Glutamina
Histidina
Izoleucina
Leucina
Lizina
Metionina
Prolina
Serina
Tirozina
Treonina
Triptofan
Valina

Denumire stiintifica
Acid -amino propionic
Acid -Amino succinic
-Monoamida acidului aspartic
Acid -amino, -guanidino valerianic
Acid -amino, -mercapto propionic
Acid -amino, -fenil propionic
Acid -amino acetic
Acid -Amino glutaric
-Monoamida acidului glutamic
Acid -amino, -imidazol propionic
Acid -amino, -metil valerianic
Acid -amino izocaproic
Acid , -diamino caproic
Acid -amino, -tiometil butiric
Acid pirolidin-2-carboxilic
Acid -amino, -hidroxi propionic
Acid -amino, -p-hidroxifenil propionic
Acid -amino, -hidroxi butiric
Acid -amino, -3-indolil propionic
Acid -amino izovalerianic

Abreviere

Denumire radical

Ala
Asp
Asn
Arg
Cis
Phe
Gly
Glu
Gln
His
Ile
Leu
Arg
Met
Pro
Ser
Tyr
Thr
Trp
Val

Alanil
Aspartil
Asparaginil
Arginil
Cisteinil
Fenilalanil
Glicil
Glutamil
Glutaminil
Histidil
Izoleucil
Leucil
Arginil
Metionil
Prolil
Seril
Tirozil
Treonil
Triptofanil
Valil

AMINOACIZI CLASIFICARE polaritatea R

Aminoacizi standard
(complet protonai)
alctuii din

Grupare carboxil
(-COOH)

Deprotonat (COO-)
la pH fiziologic

Grupare -amino
(-NH3+)

Protonat (NH3+)
la pH fiziologic

Radical nepolar
hidrofob
Alanina
Valina
Leucina
Izoleucina
Prolina
Metionina
Fenilalanina
Triptofan

Radical (20 tipuri)

(R)

Radical polar
hidrofil
La pH fiziologic
Neutru
Nencrcat electric

Glicina
Cisteina
Serina
Treonina
Tirozina
Asparagina
Glutamina

Acid deprotonat,
negativ

Aspartat
Glutamat

Basic
Protonat, pozitiv

Arginina
Histidina
Lizina (la pH6)

Localizarea aminoacizilor nepolari n proteine

Hidrosolubile

Aminoacizii nepolari formeaz

miezul proteinei
evit contactul cu mediul apos

Membranare

Aminoacizii nepolari cptuesc

suprafaa proteinei
sunt n contact cu mediul lipidic

Aminoacizi nonstandard existeni n proteine

Nu sunt codificai genetic
Se formeaz prin modificare post-translaional a aminoacizilor standard!

5-Hidroxilizina, 5-Hidroxiprolina, allizina Colagen

N-metil lizina Actin
Acidul -carboxi glutamic Factori ai coagulrii
Cistina Insulin, albumin, imunoglobuline etc.
Fosfo serina, fosfo tirozina Enzime reglatoare
N-Acetilglucozamin asparagina Glicoproteine cu legatur N-glicozidic
N-Acetilgalactozil serina Glicoproteine cu legatur O-glicozidic

Aminoacizi nonstandard existeni n proteine

NH

HO

COOH

COOH

COOH

H2N CH2 CH CH2 CH2 CH NH2

OH

4-Hidroxi prolina

5-Hidroxi lizina
COOH

HN CH2 CH2 CH2 CH2 CH NH2

N-metil lizina

CH2

COOH
CH NH2

S
S
CH2

COOH
CH NH2

Cistina

NH2

Allizina
COOH

HOOC CH CH2 CH NH2

COOH

CH3

HC CH2 CH2 CH2 CH

O

Acid -carboxi glutamic

COOH

HO P O CH2 CH NH2
HO

Fosfo serina

Aminoacizi nonstandard neexisteni n proteine

Nu sunt codificai genetic
Sunt componente ale unor coenzime, neuromediatori, intermediari metabolici

- Alanina Coenzima A
Acidul -aminobutiric = Neuromediator
Homocisteina = Intermediar n metabolismul Met
Ornitina, citrulina = Intermediari n sinteza ureei
5-Hidroxi triptofanul = Intermediar n sinteza serotoninei, melatoninei

Aminoacizi nonstandard neexisteni n proteine

COOH

H2N CH CH2

COOH

H2N CH2 CH2 CH

-Alanina

Acid -aminobutiric
COOH

HN CH2 CH2 CH2 CH NH2

COOH

H2N CH2 CH2 CH2 CH NH2

C O
H2N

Ornitina

Citrulina

COOH
HS CH2 CH2 CH NH2

Homocisteina

CH2

HO
NH

CH COOH
NH2

5-Hidroxi triptofan

Aminoacizi eseniali
Aminoacizi standard care nu pot fi sintetizai n organismul uman, deci
trebuie sa fie preluai din alimente
Aminoacizi ramificai: Val, Leu, Ile
Aminoacizi aromatici: Phe, trp
Aminoacizi bazici: Lys, His, Arg (numai n situaii speciale)
Aminoacizi hidroxilici: Thr
Aminoacizi cu sulf: Met

Aminoacizi Proprieti optice

Toi aminoacizii (cu exceptia Gly) au cel puin un centru asimetric (carbon cu 4
substitueni diferii) = carbonul
Carbonul = chiral sau optic activ
Aminoacizii cu carbon chiral pot avea 2 stereoizomeri (enantiomeri), notati D i
L, care se gsesc n relaia obiect-imaginen oglind
Toi aminoacizii din proteine sunt L-aminoacizi

Aminoacizi - Proprieti spectrale

Aminoacizii aromatici prezint un maxim de absorbie n UV la ~ 280nm

Aminoacizi - Proprieti acido-bazice

Acizii slabi sunt parial disociati

HA
Acid slab

H
Proton

A
Sare
Baza conjugata

Echilibrul de disociere este caracterizat de constanta de aciditate

[ H + ][ A ]
Ka =
[ HA]
Relaia cantitativ dintre concentraia acidului slab [HA] i concentraia bazei
conjugate [A-] este descris de ecuaia Henderson-Hasselbalch

[ A ]
pH = pKa + log
[ HA]

Aminoacizi Soluii tampon

Soluie tampon dpdv compoziional:
9 acid slab + baz conjugat (-COOH / -COO-)
9 baza slab + acid conjugat (-NH2 / -NH3+)

Soluie tampon dpdv funcional:

9 Se opune variaiilor de pH cnd se adaug cantiti limitate de
acid sau baz tare

Capacitatea maxim de tamponare corespunde

pH = pKa 1
unde pKa = - log Ka
La pH < pKa predomin forma protonat (-COOH)
pH > pKa predomin forma deprotonat (-COO-)

Curba de titrare a acidului acetic

Curba titrare a glicocolului

Peptide - Definiie
Peptide = combinaii de tip amidic rezultate prin condensarea a 2 sau mai
multe molecule de aminocizi
= succesiune de aminoacizi legai prin legatur peptidic
Radicali diferii legai de C

Succesiune constant de legturi peptidice separate prin C

Peptide - Denumire
Se denumesc succesiv radicalii aminoacizilor ncepnd cu captul N-terminal
Ser-Gly-Tyr-Ala-Leu = Seril-Glicil-Tirozil-Alanil-Leucina

Peptide -Proprieti
9 La pH = 7 gruprile carboxilice sunt deprotonate, iar gruprile amino sunt protonate

9 La pH = pH izoelectric ncrcarea electric net = 0, ca urmare solubilitatea n ap

este minim i viteza de migrare n cmp electric = 0

Peptide Clasificare
Funcie de numrul aminoacizilor componeni

Oligopeptide = peptide formate din civa aminoacizi

dipeptide
tripeptide
tetrapeptide, etc

Polipeptide = peptide formate din < 50 aminoacizi

= peptide cu GM <10000

Funcie de modul cum sunt sintetizate

Peptide ribozomale = peptide sintetizate prin traducere folosind ca matri ARN

mesager; n general au rolul de hormoni sau molecule de semnalizare.
Exemplu: peptidele din familia pro-opiomelanocortinei, glucagonul, angiotensina,
vasopresina, oxitocina etc.

Peptide nonribozomale = peptide sintetizate prin condensri succesive de

aminoacizi catalizate de enzime specifice.
Exemplu: glutation = -Glu-Cys-Gly

Peptide artificiale = sintetizate prin sinteza chimica

Exemplu: aspartam

Peptide Semnificaie biologic

Denumire

Structura

Functie

Sinteza

Calcitonina

32 Aminoacizi

Hipocalcemiant

Celulele C adiacente celulelor foliculare

ale tiroidei

Glucagonul

29 Aminoacizi

Hiperglicemiant

Celulele din insulele Langerhans ale

pancreasului

Secretina

27 Aminoacizi

Stimuleaz secreia de
H2O i HCO3- de ctre
pancreas

Celulele S din duoden i jejunul proximal

ACTH

39 Aminoacizi

Controleaza dezvoltarea
cortexului adrenalelor si
sinteza de steroizi

Celulele corticotrope ale adenohipofizei

Vasopresina 9 Aminoacizi

Regleaza eliminarea
renala de H2O

Nucleul supraoptic al al hipotalamusului

Oxitocina

9 Aminoacizi

Regleaza contracia
muchiului neted al
uterului i a celulelor
mioepiteliale ce nconjoar
alveolele mamare

Nucleul paraventricular al hipotalamusului

-Endorfina

16 Aminoacizi

Analgezic, euforic
asemntor morfinei

Celulele corticotrope ale adenohipofizei

sub forma de POMC

Familia pro-opiomelanocortinei (POMC)

Clivarea POMC depinde de esut

ACTH- Structura

Fragment 1 (Aa 1-4) = interacioneaz cu receptorii melanofori

Fragment 2 (Aa 5-10 = mreste activitatea fragmentului 1 de 1000x
Fragment 3 (Aa 11-14) = mreste activitatea fragmentului 1 de 1000x
Fragment 4 (Aa 15-18) = adapteaz cuvintele 1,2 si 3 la receptorul suprarenal introducnd activitile
corticotrope si corticotrofe, reduce activitatea melanoforetic
Fragment 5 (Aa 19-24) = stabilizeaz hormonul n timpul transportului
Fragment 6 (Aa 25-33) = stabilizeaz hormonul n timpul transportului
Fragment 7 (Aa 34-39) = determin specificitatea de specie, induce formarea de anticorpi la alte specii

ACTH- Rol

Stimuleaz secreia de hormoni corticosuprarenali

intensificarea
catabolismului proteic i lipidic
gluconeogenezei

Vasopresina & Oxitocina

Vasopresina

Antidiuretic
Vasopresor

Determin

Oxitocina

declanarea contraciilor uterului gravid

secreia laptelui din glanda mamar

Tripeptida natural Glutation

Caracteristicile sintezei:
condensare succesiv a aminoacizilor Glu, Cys, Gly
catalizat de sintetaze specifice
nu este necesar prezenta unei de matrice (ARNm)

Glutation Roluri biologice

9Antioxidant major
ajut la descompunea H2O2, reciclizeaz ali antioxidani (vitaminele C, E)
9Reductor intracelular
ajut la meninerea gr. SH i la rearanjarea punilor S-S din proteine
9Cosubstrat al gamaglutamil transpeptidazei (GT)
ajut la transportul aminoacizilor prin membrana celular
9Component al leucotrienei C4 (LTC4), hormon local cu rol n inflamaie
9Implicat n eliminarea metalelor grele, toxinelor, medicamentelor

Rolul GSH n protejarea celulelor fa de SRO

Forma oxidat a glutationului

Rolul GSH n transportul aminoacizilor

Aa + GSH

GT

Glu-Aa + Cys-Gly
Aa
Oxoprolina

Rolul GSH in conjugarea xenobioticelor

Glu
R-SH + GSH

R-S-S- Cys
Gly

Dipeptida artificial

Educaia a dat natere la o vast

populaie capabil s citeasc, dar
incapabil s disting ceea ce merit
s fie citit
Charles Darwin

Ignorana este noaptea minii,

dar o noapte fr lun i stele
A studia i a nu gndi este o risip.
A gndi i a nu studia este periculos
Confucius

Omul este constituit din corp,minte i

imaginaie.
Corpul omului este imperfect,
mintea lui nedemn de ncredere,
dar imaginaia lui l-a fcut remarcabil
James B. Conan
(chimist, prof. la Harvard)