Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Curs 14
Curs 14
BIOCHIMIA DINAMIC
Biochimia dinamic studiaz ansamblul transformarilor chimice i fizico-chimice ale
substanelor constituente ale materiei vii, nsoite de schimbri n coninutul de energie
(metabolism). Metabolismul, cu cele dou laturi, anabolismul i catabolismul, constituie alturi
de alte caracteristici eseniale (ereditatea, variabilitatea, autoreproductibilitatea, etc.), trstura
esenial a materiei vii.
Anabolismul cuprinde procesele de sintez i cretere a complexitii biomoleculelor i
este asociat cu consumul de energie (reacii endergonice). In organismele autotrofe (celule
clorofiliene, bacterii nitrificante, organisme vegetale superioare), substanele organice sunt
sintetizate (prin fotosintez) din substane minerale (n primul rand CO2), folosind ca surs de
energie, energia luminoas. Organismele heterotrofe nu-i pot sintetiza substanele organice
din cele de natur mineral, ci triesc pe seama substanelor sintetizate de organismele
autotrofe, folosind ca surs de energie, energia chimic.
Catabolismul cuprinde reaciile de biodegradare a biomoleculelor cu structur complex
n biomolecule cu structur simpl (CO2, NH3, H2O), procese biochimice care decurg cu
eliberare de energie (reacii exergonice).
Transformrile metabolice se desfoar n organismele vii (vegetale i animale) n
condiii fiziologice (la temperatur normal, pH caracteristic fiecrei pri a organismului), n
mod continuu, ntr-o strns interdependen, sub aciunea biocatalizatorilor enzime, i prin
reglarea fin, mediat de hormoni.
METABOLISMUL GLUCIDELOR
Biosinteza (anabolismul) glucidelor
Biosinteza monoglucidelor
Biosinteza monoglucidelor poate fi exprimat printr-o reacie global, pornind de la CO2
i H2O, substanele precursoare, practic inepuizabile n natur:
n CO2 + m H2O
CnH2mOm + n O2
Energia necesara biosintezei poate fi realizata prin: (a) chimiosintez, (b) fotosintez.
a) Chimiosinteza furnizeaz energia necesar biosintezei compuilor organici prin
oxidarea unor compui anorganici: H2, H2S, FeCO3, NH3, etc., cu ajutorul hidrogenobacteriilor, sulfobacteriilor, ferobacteriilor, bacteriilor nitrificante, etc.
Importana biologic a chimiosintezei const n faptul c se demonstreaz posibilitatea
eliberrii energiei necesare sintezei materiei vii, de ctre celulele autotrofe, n medii minerale.
b) Fotosinteza, procesul de asimilare a CO2 de ctre plantele verzi, este calitativ si
cantitativ, cel mai important proces biochimic de pe planet, deoarece reprezint:
principala surs de materie organic (se transform C mineral din CO2 n C organic);
unica surs de oxigen
singurul proces celular care folosete drept surs energetic lumina, pe care o
transform n energie chimic.
2H+ + 2OH-
2H+ + 2e-
2H
2H + S
HS
CH2
CH2
CH2
CH2
S
C
H
(CH2)4
COOH
HS
C
H
(CH2)4
COOH
c) fotooxidarea
2 HO- + clorofila fotoreactivata+
(fotooxidare)
2 OH + clorofila dezactivata
1/2 O2 + H2O
2 OH
ATP
nsumnd reaciile pariale, se poate scrie ecuaia global a fotoreaciei (ecuaia lui Hill):
2H2O + 2NADP+ + ADP + H3PO4 = 2NADPH + H+ + 1/2O2 + ATP
produsele fotoreaciei
H2C
O
OH
CH2 O
OH ATP HC OH
-ADP
OH
HC OH
OH
O
OH
OH
OH
O
HC
HC
HC
H2C
P
HC
HC
HC
CH
H2C
OH
HC
CH2
OH
OH
OH
OH
OH
CH2
HC
- ATP
ADP
OH
O
P
CH2 O
HC OH
CO2
HC OH HOOC
H2C
OH
CH2 O
HC OH
H2C
HC
O
OH
OH
COOH
COOH
HC
CH2
HO
OH
OH
HC
HC
HC
H2C
OH
OH
OH
C
CH2
OH
H2C
Eritrozo-4-fosfat
H2C
CH
CH
HC
H2C
OH
OH
OH
ATP
Fructoza
Fructoza 6-fosfat
CH2
HC
HC
CH
OH
OH
HC
HC
CH
OH
OH
Glucoza
Glucoza 6 fosfat
Zaharoza
OH
Dihidroxiacetonfosfat
H2C
CH2
CH2 O
P
Fructoza 1,6-difosfat
ADPHO
H2C
Aldehida
3-fosfoglicerica
HC
CH2
HO
H2C
O
P
Acidul 2-carboxi- H2C
Esterul 3-cetopentozo 1.5-difosfat 3-ceto pentozo- Acidul 3-fosfo1.5 difosfat
gliceric (APG)
Xilulozo-5-fosfat
HO
H2C
forma
dienolica
OH
HC
CH2
OH
OH
CH2
H2C O P
H2C O P
Sedoheptulozo - 7-fosfat Sedoheptulozo - 1,7-fosfat
HO
Ribulozo-5-fosfat
OH
HC
CH2
OH
OH
Ribozo -5-fosfat
H2C
H2C
HC
HC
H2C
Biosinteza pentozelor
Pentozele, glucide deosebit de importante pentru organismele animale i vegetale (riboza
este component a acizilor nucleici i a multor coenzime, iar ribuloza este acceptorul primar la
asimilarea fotosintetic a CO2), se pot forma prin dou ci metabolice:
calea (ciclul) pentozofosfailor (degradarea glucozo-6-fosfatului rezultat prin izomerizare
din fructozo-6-fosfat)
combinarea triozelor cu aldehida acetic sau aldehida glicolic.
H
H
O
H
OH
H2C
OH
OH
C
H2C
H2C
OH
O
aldolaza
OH
OH
Aldehida 3-fosfogliceric
OH
OH
O
OH
OH
H2C
OH
Deoxiriboza
ATP
ADP
OH
OH
OH
OH
H2C
OH
H2C
ADP
OH
OH
H2C
Hidroxiaceton-3-fosfat
Riboza
C
O
+
H2C
H2C
Ester ribozo-5-fosfat
H2C
CH2
OH
H2C
H2C
Ester deoxirobozo-5-fosfat
O
H
ADP
CH2
Aldehida 3-fosfogliceric
ATP
H2C
CH2
Ester ribulozo-5-fosfat
OH
OH
H2C
OH
ATP
OH
Ribuloza
Biosinteza oligoglucidelor
Biosinteza oligoglucidelor reprezint un proces secundar al fotosintezei, respectiv
transformarea hexozelor formate n diglucide, triglucide, etc.
Legturile glicozidice dintre moleculele de monoglucide pot fi realizate enzimatic prin dou
reacii diferite:
transglicozilare (cazul biosintezei amilopectinei i glicogenului)
cuplarea unor resturi de glucide activate n prealabil cu compui macroergici (UTP, GTP).
Zaharoza (zahrul) este prima diglucid aprut n procesul de fotosintez i este uor
asimilat de plante. Zaharoza se poate biosintetiza n cantiti mici din ester glucozo-1-fosfat i
fructoz, sub influena biocatalitic a enzimei zaharozofosforilazei, prin elimi-narea unei
molecule de acid fosforic.
n cantiti mari, zaharoza se biosintetizeaz prin activarea uneia dintre componente
(glucoza) cu compusul macroergic acid uridintrifosforic (UTP).
OH
CH2OH
N
O
H
OH
H
O
H
O
OH
H
OH + HO
P
OH
OH
P~O
P~O
OH
OH
OH
CH2
H
Glucozo-1-fosfat
N
O
OH
H
OH
CH2OH
H
N
O
H
OH
P ~O
OH
OH
OH
H
OH
CH2
H
OH
H
OH
O
HO
OH
OH
OH
N
O
H
OH
H
O
OH
H
P~O
OH
OH
O
O
CH2
OH
H
HO
CH2
OH
H
OH
OH
O
OH
OH
OH
OH
HO CH2
H
OH
H
OH
H
Fructozo-1-fosfat
CH2OH
H
CH2
H
OH
Zaharoza
O + HO
P~O
P~O
OH
OH
OH
O
O
CH2 O
H
H
H
H
OH
OH
H
OH
Biosinteza poliglucidelor
Biosinteza poliglucidelor de rezerv glicogen (regnul animal) i amidon (regnul vegetal)
decurge cu mare vitez i ncepe cu transformarea glucozo-6-fosfat n glucozo-1-fosfat, reacie
catalizat de enzima fosfoglucomutaza.
Primul pas n sinteza glicogenului n organismele animale este reacia cu compusul
macroergic UTP, cu formarea uridindifosfatglucozei (UDPG), care este apoi transferat pe
resturile de glucoz sau pe un fragment poliglucidic cu formarea glicogenului, sub influena
enzimei glicogensintetaza.
Glicogensintetaza necesit drept starter o caten poliglucidic de cel puin 4 resturi de
glucoz, la care s se lege succesiv alte molecule de UDPG.
Ramificarea prin legturi C1 - C6 pe catena glicogenului este catalizat de o enzim de
ramificare denumit glucanaza.
n plante i n multe bacterii, sinteza amidonului decurge asemntor glicogenului, fiind
catalizat de enzima amidonsintetaza.
CH2O P
CH2O P
CH2O P
CH2O P
CH2OH
OH
OH
OH
Fructozo-1,6-difosfat
Fructozo-6-fosfat
Glucozo-6-fosfat
CH2OH
O
AMILOZA
AMILOPECTINA
O
AMIDON
Glucozo-1-fosfat
OH
OH
CH2
COOH
ADP
ADP
10
- H2O
CH2
O
CH2OH
OH
H2C
OH
P
HC
H2C
OH
OH
ATP
HC
OH
ADP
CH2
O
CH2 O
H2C
S Enz
OH
H2C
HC
OH
HC
H2C
HC
HC
OP
OH
CH2
C
H2C
H2C
CH2O P
OH
OP
OH
1 Fosforilaza
2 Glucokinaza
3 Fosfohexozizomeraza
4 Fosfofructokinaza
5 Aldolaza
6 Fosfotriozizomeraza
7 HS - Enzima
8 Fosfoglicerokinaza
9 Fosfogliceromutaza
10 Enolaza
11 Piruvatkinaza
ENZIME:
acidul 1,3-difosfogliceric
H2C
O
OH
C
HC
O
H3PO4 HSEnz
HS-Enz
ADP
NADPNH+
NADP
Enz
HC
OH
ALDOLAZA
11
H
OH
CH2
OH
H
ester glucozo 6-fosfat
Acid
piruvic
acid enolpiruvic
CH2
COOH
CH3
NADP
NADPNH
COOH
OH Acid lactic
CH3
HC
COOH
GLUCOZA
AMIDON
O
COOH + HSCoA
H3C
NAD+
C ~SCoA + CO2
NADPH
COOH
H2CH
Acid piruvic
+ CO2 activat
COOH
H2C
COOH
Acidul oxalilacetic
biotinilenzima
AMP
CO~SCoA + 3H2O + 3NADP+ + FAD + ADP + P = 2CO2 + 3NADPH + 3H+ + FADH2 + ATP + HSCoA
sistem enzimatic
O2H2O + energie
Ciclul Krebs opereaz n sens unic datorit celor trei reacii care decurg ireversibil:
sinteza acidului citric din acetilcoenzima A i acid oxalilacetic
decarboxilarea acidului izocitric la acid -cetoglutaric
dehidrogenarea acidului -cetoglutaric
Energia eliberat treptat, n cursul reaciilor este nmagazinat sub forma legturilor
macroergice ale compuilor macroergici GTP, ATP i eliberat treptat n funcie de nevoile
organismului (procese de biosintez, energie osmotic, electric, mecanic, caloric, etc.).
n urmtoarea schem este reprezentat succesiunea reaciilor din ciclul Krebs.
COOH
H2C
COOH
HO
COOH
HC
COOH
Co~SCoA + HOH
H3C
acetil - CoA
HO
H2C
COOH
COOH
H2C
COOH
COOH
HO
HC
COOH
forma enolica
forma cetonica
acid citric
acidul oxalilacetic
O
CH3
CO2
COOH + HSCoA
O
H3C
C ~SCoA
NAD+
COOH
CH2H
CO2
HO
COOH
H2C
COOH
HSCo H2C
HO
Acidul
oxalilacelic
11
H
C
COOH
H2C
COOH
Acidul citric
COOH
NADP
H2C
COOH
NADPH
COOH
HC
COOH
COOH
H2C
COOH
Acidul malic
- H 2O
+ H 2O
10
HOOC
CH
Acidul cisaconitic
COOH
HC
Acidul fumaric
3
H
9
H2C
COOH
H2C
COOH
CICLUL
KREBS
HO
COOH
HC
COOH
H2C
COOH
Acidul succinic
HSCoA
8
O
Acidul izocitric
H2O
NADP
C ~SCoA
NADPH
4
CH2
O
H2C
COOH
HC
COOH
H2C
COOH
COOH
Succinil CoA
NADPH
Acidul oxalilsuccinic
NADP
5
7
O
6
HSCoA
COOH
CO2
CH2
CO2 H2C
COOH
Acidul alfa-cetoglutaric
Importana ciclului Krebs decurge din faptul c, constituie o cale comun de biodegradare a
glucidelor, a lipidelor si protidelor (prin substanele intermediare provenite din acestea).
Cetoacizii rezultai n ciclul citric, pot servi la biosinteza aminoacizilor (corelaie ntre
glucide i protide), iar prin intermediul acetilcoenzimei A se stabilete corelaia metabolic
dintre glucide i lipide.
Se poate concluziona c, prin interrelaiile metabolice stabilite ntre glucide-lipide-protide,
ciclul Krebs reprezint o surs de substrat i de energie necesar tuturor proceselor
metabolice.
Biodegradarea fermentativ a glucidelor
Biodegradrile fermentative sunt procese de descompunere, predominant anaerob, ale
glucidelor datorate activitii fiziologice a unor microorganisme. Au o importan practic
deosebit, contribuind la circuitul elementelor n natur, la fertilizarea solului, la obinerea unor
compui utilizai n industria alimentar, chimic, farmaceutic.
CO
COOH
Acid piruvic
- CO2
CH3
CHO
NADPH + H+
- NADP+
CH3
Acetaldehid
CH2
OH
Etanol
CO
COOH
NADPH + H+
- NADP+
CH3
CH
COOH
OH
Acid piruvic
Acid lactic
4 H3C
CH2
COOH + 2 CH3
CH3
CH2
CH2
EMP
acid piruvic
aldehida acetica
[O]
CH3
COOH
CO2 + H2O
etanol
METABOLISMUL LIPIDELOR
Biosinteza (anabolismul) lipidelor simple gliceride
Biosinteza lipidelor (simple i complexe) reprezint procese metabolice importante n
organism, deoarece lipidele (sub forma trigliceridelor) prezint importan biologic ca
substane de nmagazinare a energiei n organism (cldura de ardere = 39 kcal/g, n
comparaie cu cea a glucidelor = 17 kcal/g), iar lipidele complexe (fosfolipide, glicolipide,
lipoproteine) intr n structura membranelor celulare sau au importan biologic deosebit, de
reglare a funciilor celulare, reglarea colesterolului, a steridelor etc.
Biosinteza (anabolismul) lipidelor ncepe n cea de-a doua etap a fotosintezei,
scotoreacia, prin formarea acidului 3-fosfogliceric, compus implicat att n biosinteza lipidelor
simple gliceride, ct i a celor complexe
Pentru biosinteza gliceridelor se biosintetizeaz n prezena enzimelor caracteristice
elementele componente, glicerol i acizii grai superiori, etap urmat apoi de biosinteza
propriu-zis a lipidelor simple gliceride.
Biosinteza glicerolului
Biosinteza glicerolului decurge n strns corelaie cu metabolismul glucidic. Aldehida 3fosfogliceric i hidroxoacetonfosfatul, cele dou trioze fundamentale rezultate la glicoliz
OH
H2C
H2C
OH
H2C
NADP
H2C
NADPH
H
P
NADP
NADPH
Triozofosfai
H
P
OH
H2C
OH
H2C
H
P
ATP
3-Fosfoglicerol
OH
OH
H2C
OH
H2C
ADP
OH
O
H2C
ADP
OH
H2C
ATP
OH
OH
H2C
OH
Glicerol
hidroxoacidului gras activat, (c) biosinteza acidului gras nesaturat activat, (d) biosinteza
acidului saturat cu doi atomi de carbon in plus n caten.
O
R
CH2
CH2
C~SCoA
+ H3C
CH2
CH2
C~SCoA
- HSCoA
Acetil-coenzima A (C2)
O
CH2
O
CH2
NADPH + H+
C~SCoA
NADP
NADP
CH2
CH2
C
H
O
CH2
C~SCoA
CH2
CH2
H
C
C
H
C~SCoA
NADPH2
CH2
CH2
H2
C
H2
C
C~SCoA
(CH2)7
CH2
Acid stearic
CH2
(CH2)7
COOH
CH3
(CH2)7
C
H
C
H
(CH2)7
COOH
Acid oleic
OH
OH
2R
H2C
HC
OH
C~SCoA
2 HSCoA
CH2O P
CO
H2C
HC
CH2O P
CO
CO
R
R
CH2O P
ADP
ADP
ATP
ATP
H2C
HC
OH
CH2
CO
H2C
RCO~SCoA
HC
CO
CH2
OH
CO
R
R
OH
Diglicerida
Monoglicerida
RCO~SCoA
H2C
HC
CH2
CO
CO
R
R
CO
Triglicerida
HC
CO
H2C
CO
R
R
O
O
OH
Serinfosfatide
NH2
CH2
CH
COOH
H2C
CO
HC
CO
H2C
R
O
O
CH2
OH
Colaminfosfatide (cefaline)
CH2
NH2
H2C
HC
H2C
CO
CO
R
O
O
OH
CH3
CH2
CH2
CH3
CH3
Colinfosfatide (lecitine)
NADH
H2C
NAD
OH
COOH
H2C
transaminare
COOH
Ac. 3-glicerofosforic
H2C
H
NH2
H2C
ATP
ADP
COOH
Ester al acidului
hidroxipiruvic
OH
NH2
COOH
Serina
OH
NH2
- CO2
COOH
H2C
OH
H2C
NH2
CH3I
H2C
OH
H2C
+
N
CH3
CH3
CH3
Serina
Colamina
Colina
Biosinteza gliceroaminfosfatidelor
Lipidele cele mai rspndite n membranele celulelor eucariote sunt colaminfosfatidele i
colinfosfatidele. Biosinteza lor se realizeaz prin parcurgerea urmtoarelor etape:
- biosinteza acizilor fosfatidici
- activarea bazei azotate cu compuii macroergici ATP i CTP
- esterificarea acizilor fosfatidici (sau a gliceridelor) cu baza azotat activat.
H2C
H2C
NH2
Fosfocolamina
P-P-P
CH2
CTP
citozina
H2 N
CH2
CH2
P-P
CH2
citozina
+ P-P
diglicerida 1
2 acid fosfatidic
- CMP
- CDP
H2C
HC
O
O
CH2
CO
CO
O
CH2
CH2
NH2
Colaminfosfatida (Cefalina)
OH
NH2
-CO2
H2C
OH
H2C
NH2
CH3I
HI
H2C
OH
H2C
N(CH3)3
[O]
HC
[O]
N(CH3)3
H2C
COOH
Serina
[O]
Colamina
HO
Colina
HO
Aldehida betainei
O
CO2
H2C
N(CH3)3
Betaina
H2C
H3C
NH2
NH2
Glicin
Metilamin
HC
CH2
CO
CO
H2C
H2O
HC
H3PO4
CO
CO
Lipaza
H2C
OH
HC
OH
H2C
OH
- 2 RCOOH
CH2
Acid Fosfatidic
OH
Diglicerid
Glicerol
OH
HC
OH
H2C
OH
Glicerol
H2C
Fosfokinaza
ATP
HC
H2C
OH
HC
NADP+
OH
O
NADPH2
P
3- Fosfoglicerol
HC
H2C
CH3
O
OH
O
Glicoliza
COOH
Aldehida fosfoglicerica
H2C
Krebs
CO2
+
H2O
Acid piruvic
OH
H2C
Fructoza
1,6-difosfat
P
Oligo-, Poliglucide
Produsul biodegradrii acizilor grai superiori cu numr impar de atomi de carbon este
ns acidul propionic, nu acetil-coenzima A.
O
R
CH2
CH2
ATP
OH
P-P
CH2
CH2
PMA
HSCoA
AMP
CH2
CH2
O
NADP+
NADPHH+
C~SCoA
C
H
CH2
NADP+
NADPHH+
- Hidroxiacil coenzima A
C~SCoA
HOH
O
CH2
C~SCoA
- Cetoacil coenzima A
O
CH2
C
H
C~SCoA
R'
C
H
OH
HOH
O
OH
H3C
C~SCoA
Biodegradare
ciclica
O
H3C
C~SCoA
Biodegradare aeroba
ciclul Krebs
CO2
+
H2O
METABOLISMUL PROTIDELOR
Cele mai multe dintre protidele organismelor superioare sunt continuu biodegradate i
biosintetizate. La om si animale, timpul de njumtire biologic a albuminelor din plasm este
de 20-25 de zile, cnd jumtate din cantitatea de albumin este biodegradat i nlocuit cu
una nou sintetizat.
Chiar i proteinele intracelulare (enzimele) sunt supuse unor procese de biodegradare i
biosintez continu n perioade de timp de la cteva ore la mai multe zile.
De aceea, pentru un adult, necesarul de aminoacizi este de 1 g/zi/kg corp, deoarece
organismul uman nu poate sintetiza dect jumtate din cei 20 de aminoacizi proteinogeni.
Biosinteza (anabolismul) protidelor
Etapa de biosintez a protidelor (anabolismul) ncepe cu biosinteza aminoacizilor, urmat
de biosinteza protidelor, n ordinea complexitii lor:
aminoacizi peptide peptone albumoze proteine proteide
(holoproteide) (heteroproteide)
Biosinteza aminoacizilor
Biosinteza aminoacizilor se realizeaz n principal pe dou ci metabolice:
Aminarea reductiv a cetoacizilor reprezint o cale principal de biosintez a aminoacizilor, direct din amoniac i cetoacizii formai n organism prin degradarea aerob a
glucidelor (ciclul Krebs).
Aminarea cetoacizilor decurge n prezena enzimei glutamatdehidrogenaza care are
drept coenzim NAD+ sau NADP+. Reacia decurge cu formarea intermediar a unui
iminoacid, care va fi redus enzimatic, conform reaciei:
NAD
R
C
R
O
NH3
NH
- H2O
COOH
NADH + H+
HC
COOH
- Cetoacid
NH2
COOH
Iminoacid
Aminoacid
CH3
O
HC
COOH
Acid piruvic
NH2
COOH
- Alanina
COOH
H2C
COOH
Acid oxalilacetic
COOH
H2N
COOH
H2C
COOH
Acid aspartic
CH
COOH
CH2
CH2
H2C
H2C
COOH
Acid - cetoglutaric
H
C
H2N
COOH
Acid Glutamic
Transaminarea
R2
NH2
COOH
R1
O
COOH
R2
O
COOH
HC
NH2
COOH
R1
HC
R1
R2
NH2
COOH
Aminoacid 1
HC
- H2O
+ 2[H]
COOH
Cetoacid 2
H
N
HC
COOH
CH
COOH
COOH
Baza Schiff 1
R2
R1
- 2[H]
R2
R1
- 2[H]
COOH
R2
COOH
CH
R1
+ H2O
COOH
Baza Schiff 2
R2
O
COOH
Cetoacid 1
HC
NH2
COOH
Aminoacid 2
Fiecare secven de 3 baze azotate din structura acizilor nucleici constituie un codon,
iar fiecrui codon i corespunde un anumit aminoacid. Conform principiului complementaritii
bazelor azotate, unui anumit codon de pe ADN i corespunde un anumit codon de pe mARN i
apoi un anticodon de pe tARN.
Reprezentarea acestor etape este redat schematic n figura urmtoare.
ADN
Structura secundara:
dubla catena spiralata
ADN
Structura primara:
catena polinucleotidica simpla
- sediul mesajului genetic
- matrita pozitiva a originalului
IN NUCLEU
REDUPLICARE
ATGCAGCTA
TRANSCRIERE
ARNm
1'
2'
3'
UACGUCGAU
IN CITOPLASMA
TRANSLATIE
Repozitivarea (realizarea)
mesajului genetic
1''
2''
AA1
AA2
Metionina glicina
PROTEINA
3''
AUGCAGCUA
AA3
leucina
CO R1 NH CO R2 NH CO R3 NH
Mg2+
CH
C + P ~P ~ P
NH2
OH
ATP
Aminoacid
A + Enz
CH
NH2
Enz + P ~ P
P
Aminoaciladenilat
O
R
ARNt
CH
NH2
O~ P
CH2
Enz
ARNt
ADENINA
CH2
ADENINA
+ P
Tib
A + Enz
AMP
OH OH
CH
C ~ OH OH
NH2
complexul
aminoacil t.RNA
partea terminala
a t.RNA
Codon mRNA
Evidenierea modului n care tARN este capabil s identifice poziia de legare a aminoacidului n lanul peptidic, poate fi realizat cu ajutorul modelului trifoi al tARN:
anticodon al
tRNA
CH2
ADENINA
A
3`
Aminoacid activat
OH OH
adenina
riboza
NH2
CH
Capatul tRNA
t RNA
CH2
ADENINA
A
3`
O
O
OH
C
HC
NH2
n urma formrii legturii peptidice ntre cei doi aminoacizi, molecula de t1 -ARN este
eliberat din complexul aminoacid 1-t1 ARN i poate fi din nou utilizat.
R1
R2
HC
HC
*
NHH + ARNt ~ C
**
ARNt ~ C
NH2
O
**
ARNt ~ C
R2
CH
R1
NH
- ARNt
acceptor
donor
RIBOZOM
CO
CH
NH2
dipeptida
Prin deplasarea ribozomilor de-a lungul mARN (sau deplasarea mARN pe suprafaa
ribozomilor), codonii de pe mARN trec succesiv prin dreptul situsului A de pe ribozomi, dictnd
natura complexului aminoacil-tARN care urmeaz s fie fixat pe acest situs. Dipeptida format,
sub forma complexului aminoacid 1-aminoacid 2t2ARN, trece pe poziia donor a ribozomului,
lsnd liber poziia acceptor, corespunzator codonului 3 de pe mARN.
d) elongaia (creterea lungimii lanului polipeptidic) se realizeaz dup un mecanism
identic cu cel implicat n cazul biosintezei dipeptidei. Situsul P al ribozomului este ocupat cu
complexul dipeptidil-t2ARN, iar situsul A este vacant i se poziioneaz la al treilea codon de
pe mARN, formnd complexul aminoacil 3-t3ARN. Dup formarea noii legturi peptidice ntre
grupa carbonil legat de complexul dipeptidil-t2ARN i grupa amino de la complexul aminoacil
3-t3ARN, are loc deplasarea tripeptidei formate (sub forma complexului AA1-AA2-AA3-t3ARN)
pe situsul donor (situs P) al ribozomului cu eliberarea concomitent a situsului acceptor (situs
A) al ribozomului, care se va poziiona n dreptul codonului 4 de pe mARN, n vederea formrii
complexului aminoacil-4-t4 ARN.Dac proteina care urmeaz a fi sintetizat are, de exemplu,
200 de aminoacizi, etapa final implic transferul peptidei coninnd 199 de aminoacizi spre
aminoacidul final, legat n complexul cu tARN, cu formarea unui complex protein-tARN.
Captul N-terminal al proteinei este sintetizat primul, captul C-terminal, ultimul.
e) Terminarea biosintezei lanului polipeptidic al proteinei
Lungimea lantului polipeptidic este determinat genetic, prin transcrierea pe mARN a
unui codon stop (nu codeaz nici un aminoacid): UAG, UAA, AGA (pentru care nu exist nici
un tARN cu anticodoni corespunztori). Aceti codoni "non-sens" sunt ns recunoscui de
proteine citoplasmatice specifice, denumite factori de eliberare (protein release factors), care
desprind proteina de pe tARN.
Lanul polipeptidic este eliberat de pe situsul P al ribozomului i de pe tnARN printr-o
reacie de hidroliz. Ribozomul se detaeaz de pe mARN i este apt pentru o nou etap de
iniiere. Lungimea lanului proteic este determinat genetic, prin transcrierea pe mARN a unui
codon stop.Proteinele sintetizate (holoproteide) particip la biosinteza heteroproteidelor, a
enzimelor, la ndeplinirea unor funcii specifice organismului. Concomitent se desfor i un
proces invers, de biodegradare a proteinelor.
Biodegradarea (catabolismul) protidelor
Biodegradarea proteinelor
Proteinele (holoproteidele) libere sau rezultate din biodegradarea heteroproteidelor se
scindeaz pe cale enzimatic n aminoacizii componeni.
Enzimele proteolitice (proteinazele) sunt alturi de amilaze cele mai cunoscute i importante
enzime hidrolitice (C-N hidrolaze).
Biodegradarea aminoacizilor
Aminoacizii rezultai prin biosinteza sau prin biodegradarea proteinelor pot fi utilizati n
continuare la:
- biosinteza proteinelor noi
- biosinteza altor compui cu azot n molecul
- sinteza de aminoacizi (prin transaminare, aminare reductiv)
- biodegradare total pn la: NH3, CO2, H2O.
n organismele animale i vegetale biodegradarea aminoacizilor decurge preponderent prin:
- dezaminri
- decarboxilri simple sau nsoite de dezaminri
- transaminri.
a) Biodegradarea aminoacizilor prin dezaminare
Dezaminrile sunt reactii catalizate enzimatic, care constau n eliminarea unor grupe
amino (-NH2), sub form de amoniac (NH3) cu formarea unor compui ternari (C, N, O) care
pot constitui punct de plecare pentru alte transformri biochimice.
Dezaminarea oxidativ const n eliberarea a doi atomi de hidrogen, cu formarea unui
iminoacid instabil, care n prezena apei hidrolizeaz cu formare de NH3 i cetoacid. Enzimele
implicate fac parte din clasa oxidoreductazelor i pot fi: glutamatdehidrogenaza n prezena
NAD+ sau NADP+, alanindehidrogenaza n prezena FAD, etc. Cetoacizii rezultai pot fi
metabolizai (biodegradai) la CO2 i H2O, sau pot fi transformai n monoglucide care vor
parcurge n sens invers ciclul de biodegradare EMP (glicoliza). Aminoacizii care se pot
transforma n cetoacizi se numesc aminoacizi cetogeni, iar cei care se pot transforma n
glucoz se numesc aminoacizi glucoformatori.
CH3
HC
FAD
FADH2 CH3
NH2
COOH
CH3
NH
+H2O
NH3 + C
COOH
COOH
Alanina
Iminoalanina
Acid piruvic
CH
COOH
HOH
NH3 + CH3
NH2
CH
COOH
[O]
CH3
COOH
OH
- Alanina
Acid lactic
Acid piruvic
CH
COOH
[H]
NH3 + CH3
CH2
COOH
NH2
- Alanina
Acid propionic
CH
NH3 + CH2
COOH
CH
COOH
NH2
- Alanina
Acid acrilic
b) Decarboxilarea aminoacizilor
Decarboxilarea aminoacizilor este o cale de biodegradare important, biocatalizat de
enzime specifice, aminoaciddecarboxilaze, care au drept coenzima piridoxalfosfatul
(vitamina B6). Ca produi de reacie, pe lng CO2, se formeaz amine primare, denumite
amine biogene. Mecanismul reaciei de decarboxilare este urmtorul:
R
CH
COOH
+
NH2
Aminoacid
R
-H2O
Enz-piridoxalfosfatul
CH
COOH
CH
-CO2
Enz-iminoacid
CH2
N
-CO2
CH
H2O
CH2
Enz-imin
NH2 + O
Amin
Piridoxal-fosfat
Unele dintre aminele biogene rezultate prezint activitate farmacologic, altele sunt
componente ale coenzimelor sau contribuie la sinteza unor heterociclii cu azot (pirol, piridina)
care intr n structura unor alcaloizi.
CH2
(CH2)2
NH2
CH
COOH
-CO2
H2N
(CH2)4
NH2
-NH3
H2C
CH2
H2C
CH2
NH2
Ornitina
Putresceina
N
H
Pirolidin
(CH2)3
NH2
Lizina
CH
COOH
-CO2
H2N
(CH2)5
NH2
Cadaverin
NH2
H2C
H2C
N
H
Piperidin
-4H
CH
HC
CH
N
H
Pirol
H2
C
CH2
HC
H
C
CH2
HC
CH2
HC
CH
CH
N
Piridin
O
OH + HNH2
O
R
O
OH + HNH2
- H2O
amida
NH2
COOH
H
COOH
NH2
HC
CH2
O
OH
COOH
C
HC
NH2
OH
NH2
NH2
Asparagina
COOH
HC
(CH2)2
Acidul glutamic
Asparaginfosfat
HC
NH2
CH2
COOH
(CH2)2
O
NH2
CH2
Acidul asparagic
COOH
NH2
(CH2)2
P
Glutaminfosfat
NH2
Glutamina
Glutamina este unul din cei 20 de aminoacizi constitueni ai proteinelor i este implicat
n biosinteza multor altor metabolii (este utilizat ca surs de azot).
b) Metabolizarea amoniacului prin aminare reductiv (transaminare)
Peste 30% din amoniacul rezultat n muchi la biodegradarea proteinelor este trimis n
ficat, sub form de alanin (sau glutamin). Alanina formeaz prin transaminare acid piruvic,
care este convertit n ficat la glucoz, care trece apoi n snge i din nou n muchi. Secvena
de reacii constituie ciclul glucozo-alaninic. Toate aceste reacii, n care amoniacul este utilizat
AMP
NH2
ATP
NH3 + CO2
-PP-
-H3PO4
NH2
H2C
NH2
NH2
H2C
(CH2)2
HC
HC
COOH
NH2
izouree C
H2N
O
+
NH
ORNITINA
CH
CH2
COOH
Acid aspartic
(CH2)2
NH2
COOH
COOH
NH2
O ~P
H2O
ureaza
uree C
carbamilfosfatul
O
HO
CH
CH2
COOH
Acid malic
NH2
COOH
CITRULINA
NH
OH
NH2
NH2
C
H2C
H2C
NH
HC
NH2
CH2
COOH
NH2
Acid arginsuccinic
(suaccinil orginina)
ARGINA
H
C
NH
CH
COOH
COOH
HOOC
(CH2)2
(CH2)2
HC
NH
COOH
CH
argininsuccinliaza n arginin i acid fumaric (care poate conduce la acid aspartic, n ciclul
Krebs).
Arginina rezultat este scindat de ctre hidrolaza arginaza n ornitin i izouree, care se
izomerizeaz la uree, scindabil sub aciunea ureeazei n CO2 i NH3, compui care pot iniia
biosinteza aminoacizilor, glucidelor, etc.
Ciclul ornitinic (ciclul KrebsHenseleit) reprezint i el o cale de corelaie a metabolismului proteic, prin aminoacidul ornitina, cu metabolismul glucidic.
Corelaii biochimice se pot stabili i ntre compuii fundamentali, glucide, lipide, protide i
enzime, hormoni, acizi nucleici, etc. Abordarea complez a fenomenelor biochimice impune
ca, pe lng studiul transformrilor diferitelor substane, s se ia n considerare i aspectele
energetice ale acestor procese, cu evidenierea corelrii biosintezei, consumatoare de energie,
cu biodegradarea, generatoare de energie. Trebuie, n acelai timp, acordat importana
cuvenit influenei factorilor de mediu n care triesc organismele vegetale i animale,
condiiilor n care i procur materia prim (H2O, CO2, O2, substane minerale, etc.), ct i
energia necesar biotransformrilor, precum i influenei factorilor de mediu (clima, diferite
radiaii, etc.), asupra evoluiei normale a diferitelor organisme.