Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Stoica - Structura Acizilor Nucleici PDF
Stoica - Structura Acizilor Nucleici PDF
2.1 INTRODUCERE
Acizii nucleici reprezint molecule foarte complexe, produse att de organisme vii (celule), ct
i de virusuri. Denumirea de acizi nucleici se datoreaz faptului c prima oar au fost izolate din
nuclei de celule. Cercetri ulterioare au dovedit ns faptul c anumite tipuri de acizi nucleici nu se
gsesc n nucleu, ci n citoplasm.
n ansamblu, acizii nucleici ndeplinesc dou funcii biologice majore:
- transmit informaia ereditar de la o generaie la alta
- conin informaie pentru producerea de proteine specifice
Exist dou categorii majore de acizi nucleici : acid deoxiribonucleic (pe scurt, ADN) i acid
ribonucleic (pe scurt, ARN).
O molecula de acid nucleic este format din uniti de baz, numite nucleotide, legate ntre ele
prin legturi chimice de tip covalent (legturi fosfodiesterice).
Fiecare nucleotid este alctuit din 3 categorii de molecule, i ele legate ntre ele (Figurile 2.2
i 2.3):
34
Tratat de Biotehnologie Cap.2 Structura acizilor nucleici
baz azotat
pentoz (un zahar format din 5 atomi de carbon)
un rest de radical fosforic
Att n structura ADN, ct i n ARN, exist 4 tipuri majore de baze azotate:
adenin, timin, citozin, guanin - n ADN
adenin, uracil, citozin, guanin - n ARN
Adenina i guanina sunt baze azotate derivate din structura purinei i, ca atare, mai sunt
numite i baze purinice (sau, simplu purine). Timina, citozina i uracilul sunt derivate din structura
pirimidinei baze pirimidinice/pirimidine (Figura 2.2). n mod curent, cele 5 baze azotate se
prescurteaz A, T, C, G i, respectiv, U.
Pentoza este, fie riboz n ARN, fie deoxiriboz n ADN (Figura 2.4)
Formarea nucleotidelor
Baz azotat + pentoz = nucleosid
de ex. A + pentoz = adenosina
nucleosid + radical fosforic = nucleotid
de ex. adenosin + radical fosforic = acid adenilic
Figura 2.2 Toate nucleotidele au acelai plan general de structur. (a) Structura chimic a riboadenozin 5-
monofosfatului (AMP), nucleotid prezent n moleculele ARN. (b) Structura chimic a celor 2 zaharuri
prezente n moleculele de acizi nucleici: riboza n ARN i
2-deoxiriboza n ADN.
35
Tratat de Biotehnologie Cap.2 Structura acizilor nucleici
Nucleotidele se leag ntre ele prin legturi fosfodiesterice ce se formeaz ntre o pentoz a
unui nucleotid i radicalul fosforic al nucleotidului urmtor. Asemenea lanuri de nucleotide poart
numele de catene polinucleotidice i reprezint structura primar a unui acid nucleic. Astfel de
molecule sunt, deci, monocatenare (prescurtat m.c.)
Mai toate tipurile de acizi ribonucleici (ARN) sunt formate dintr-o singur caten
polinucleotidic, n timp ce majoritateta moleculelor de ADN sunt alctuite din dou catene
polinucleotidice, avnd astfel i o structur secundar. Asemenea molecule sunt dublucatenare
(prescurtat d.c.).
Formarea unor molecule de acizi nucleici dublucatenare respect o serie de legi chimice, ce
poart numele cercettorului care le-a descris prima oar Chargaff (vezi caseta cu Legile lui
Chargaff).
36
Tratat de Biotehnologie Cap.2 Structura acizilor nucleici
37
Tratat de Biotehnologie Cap.2 Structura acizilor nucleici
Datorit formei spaiale a nucleotidelor cele 2 catene polinucleotidice dintr-o molecul d.c. se
dispun spaial una fa de cealalt ntr-o form de elice (dublu helix), nvrtindu-se una n jurul
celeilalte i amndou n jurul unui ax central. Aceast dispunere formeaz structura teriar a unei
molecule de acid nucleic d.c. n arhitectura unei asemenea molecule, la exterior se gsec cele 2
schelete glucido-fosforice ale catenelor, iar spre interior sunt bazele azotate.
Perioada modern a biologiei moleculare a nceput n 1953, cnd James Watson, Francis Crick
i Maurice Wilkins au propus modelul de structur dublu-helical a ADN. Toate cercetrile ulterioare
au demonstrat corectitudinea acestui model (Figurile 2.4 i 2.5).
Un dublu-helix de acid nucleic prezint o serie de parametri fizici, denumii parametri helicali
(vezi caseta cu parametri helicali).
Parametri helicali
n = numrul de nucleotide per tur de spir (de elice)
h = distana dintre perechile de nucleotide adiacente
P = pasul elicei i este distana traversat de-a lungul axei helixului de un tur complet de spir
(adic de o rotaie de 360o).
P poate fi exprimat n raport cu numrul de nucleotide dintr-un tur (n) i cu distana dintre 2
nucleotide n procesul de rotaie (h)
t = unghiul de rsucire sau de rotaie a perechile de baze azotate; acestea nu sunt perfect
perpendiculare pe axa helixului (sau, altfel spus, dou perechi de baze adiacente nu sunt
coplanare), ci sunt nclinate cu un unghi de rsucire t care, de obicei, este 34,6o. Aceaste este
de fapt cauza pentru care cele dou catene se rsucesc una n jurul celeilalte, formnd o
structur de dublu-helix.
Valorile acestori parametri pot varia ntre anumite limite i determin mai multe forme topologice
ale moleculei de ADN d.c.
Forma B reprezint conformaia cel mai des ntlnit n celule. Are un diametru de aproximativ
20 Angstrom (), iar distanele dintre perechile de baze este de aproximativ 3,4 . n aceast
conformaie exist o medie de 10,4 baze azotate per tur de spir, iar unghiul de rotaie dintre 2
baze adiacente este de +34,6.
Forma A se ntlnete n celule n regiunile dublucatenare ale moleculelor de ARN i n dublu-
helixurile hibride ADN ARN ce se formeaz n procesele de transcriere genetic. Are un
diametru de aproximativ 23 A, 11 baze per tur de spir i un unghi de +34,7.
Forma Z este mai subire (un diametru de 18A), 12 baze per tur i un unghi de -30 ntre ele.
Datorit acestui lucru, formele A i B sunt denumite de dreapta, iar forma Z este de stnga.
38
Tratat de Biotehnologie Cap.2 Structura acizilor nucleici
Figura 2.8 Variaia absorbanei n denaturarea termic a ADN. (a) Denaturarea (topirea) moleculelor de ADN
d.c. poate fi monitorizat prin variaia absorbanei n lumin ultraviolet 260 nm: pe msur ce ADN
denatureaz, absorbana crete pn aproape de dublu. Temperatura la care jumtate din molecule sunt
denaturate poart numele de temperatur de topire (Tm). (b) Valoarea Tm depinde de coninutul n guanin i
citozin a moleculelor de ADN d.c.: cu ct procentul molar de guanin citozin (%molGC) este mai mare, cu
att este mai mare i valoarea Tm.
Moleculele de ADN d.c. pot fi lineare sau circulare (Figurile 2.9 i 2.10).
Astfel, cromozomii la organismele eucariote, dar i o serie de plasmide, sunt alctuite din
molecule de ADN d.c. linear.
Cromozomul bacterian, precum i o serie de plasmide bacteriene, sunt alctuite din molecule
de ADN d.c. circular.
Figura 2.9 Molecul de ADN d.c. Figura 2.10 Molecul de ADN d.c.
linear. circular.
39
Tratat de Biotehnologie Cap.2 Structura acizilor nucleici
Moleculele de ADN se gsesc n celule ntr-o stare de suprarsucire. Astfel, prin convenie
internaional, se numesc suprarsuciri negative cele ce sunt in direcie invers fa de orientarea
bazelor din B-ADN. Cu alte cuvinte, o molecul ADN ce prezint suprarsuciri negative, are un grad
mai mare de relaxare. Suprarsucirile in aceeai direcie cu cele naturale dintr-o molecul B-ADN se
numesc suprarsuciri pozitive i produc o nfurare mai mare a moleculei de ADN.
Este important de reinut faptul c gradul de rsucire a moleculelor de ADN influeneaz
esenial o serie de procese celulare:
- in comparaie cu cromozomii eucariotelor, cromozomul bacterian este mult mai mic; cu toate
acestea, aceast molecul de ADN ce reprezint cromozomul bacterian nu ar ncpea n celula
bacterian dac nu ar fi suprarsucit i mpachetat
- diverse procese, ca replicare, transcriere, recombinare precum i repararea moleculelor de
ADN, presupun dersucirea local a moleculelor de ADN
40
Tratat de Biotehnologie Cap.2 Structura acizilor nucleici
Toate moleculele de ARN dintr-o celul iau natere printr-un proces numit transcriere
genetic.
Molecula rezultat poart numele de transcript primar i este ulterior procesat, n funcie de
gena care a fost transcris, pentru a deveni ARNm, ARNt sau ARNr.
Moleculele de ARN au un rol central n exprimarea genelor. Iniial, aceste molecule au fost descrise ca
intermediar n sinteza proteic; ulterior ns, s-a constatat c exist multe clase de ARN ce ndeplinesc
roluri complexe n diverse etape ale exprimrii genelor. Implicarea moleculelor de ARN n foarte multe
funcii celulare i, n mod special n expresia genic, reprezint unul din argumentele majore n sprijinul
teoriei conform creia, n fazele iniiale ale apariiei i evoluiei sistemelor biologice, ARN ar fi
reprezentat componenta activ n meninerea i expresia informaiei genetice, i nu moleculele de ADN,
care probabil au aprut mult mai trziu; se vorbete deci, de o aa-zis lume ARN.
Figura 2.11 Structuri secundare (a) i teriare (b) n moleculele de ARN; aceste structuri se formeaz pe
baza existenei unor zone cu complementaritate intracatenar.
(dupa Lodish, 2000)
41