MECANISMUL REACTIILOR

ENZIMATICE
RELAŢIA DE STRUCTURĂ ENZIMĂ
– SUBSTRAT ÎN MODULAREA
ACTIVITĂŢII ENZIMEI
E+S ES E+P

Etapele catalizei enzimatice:

- recunoaşterea substratului, fixarea substratului
- transformarea substratului
- eliberarea produsului de reacţie
- refacerea enzimei

Ipoteze referitoare la recunoaşterea moleculară dintre substrat şi enzimă:

 Ipoteza „lacăt –cheie”;
 Ipoteza potrivirii induse
IPOTEZA LACĂT –
•CHEIE
propusă de E. Fischer (1890) postulează asemănarea
enzimei cu un lacăt, iar a substratului cu cheia
corespunzătoare acestuia, legătura dintre ele făcându-se
pe baza complementarităţii între segmente prestabilite

• Dezavantajul acestei ipoteze este acela că se

consideră enzima o structură rigidă

• Explica foarte bine specificitatea absoluta de substrat

 IPOTEZA POTRIVIRII
• INDUSE
Propusă de D. Koshland (1958)
• Postulează că enzimele sunt molecule dinamice, foarte flexibile,
ceea ce influenţează printre altele legarea substratului
de enzimă
• Se consideră că forma situsului activ al enzimei se modifică
după legarea substratului, recunoaşterea celor două fiind
considerată o „ajustare indusă”

• Explica foarte bine specificitatea relativa de substrat

IPOTEZA POTRIVIRII INDUSE
= Coincidenta inductiva

Presupune:
-centrul activ nu este rigid, ci are o conformatie spatiala
relaxata, usor diferita de cea necesara fixarii substratului
-relaxarea este conferita de aminoacizii auxiliari ce se gasesc
in zonele “dezordonate” ale apoenzimei
- forma centrului activ se modifica in momentul legarii
substratului
 RELAŢIA DE STRUCTURĂ ENZIMĂ
– SUBSTRAT ÎN MODULAREA
ACTIVITĂŢII ENZIMEI

IPOTEZA “”LACAT-CHEIE IPOTEZA “POTRIVIRII INDUSE”

Substratul si situsul catalitic al Situsul catalitic al enzimei are
enzimei au forme o configuratie complementara
complementare inaintea cuplarii substratului dupa cuplare
MECANISMUL CATALIZEI
ENZIMATICE
• Enzimele sunt catalizatori biologici (biocatalizatori,
fermenti)
• Nu sunt produse sau consumate in timpul unei
reactii chimice
• Nu declanseaza o reactie chimica ci intensifica viteza
reactiei chimice

Enzimele modifica viteza reactiei dar nu

constanta de echilibru a reactiei catalizate
MECANISMUL CATALIZEI
ENZIMATICE
• Energia libera a unei reactii (∆G)

• Energia de activare: necesara energizarii unui

substrat pentru a atinge o stare de tranzitie
in care exista o mare probabilitate ca o
legatura chimica sa se formeze sau sa se
scindeze

• Enzimele reduc energia de activare fara sa

afecteze energia libera a reactiei (G). Astfel,
enzimele cresc viteza de reactie
 MECANISMUL CATALIZEI
ENZIMATICE
S + E ↔ E-S → E + P
S*
Energie

Energia de activare a reactiei necatalizate

S Energia de activare a reactiei catalizate

G P

Progresul reactiei

Catalizatorii reduc energia de activare fara sa afecteze energia libera a

reactiei (G). Astfel, ei cresc viteza de reactie.
MECANISMUL CATALIZEI
ENZIMATICE
S + E ↔ E-S → E + P

 Enzimele determina un nivel energetic al stării de tranziţie mult mai scăzut

decât in cazul catalizatorului chimic. Ca urmare energia de activare necesară
substratului pentru a ajunge la starea de tranziţie va fi mult mai mica.
 Valoarea scăzută a nivelului energetic al stării de tranziţie s-ar putea datora formării
intermediare a complexului enzima-substrat (ES).
MECANISMUL CATALIZEI
ENZIMATICE
MECANISMUL CATALIZEI
ENZIMATICE
• Enzimele nu acţionează toate după un singur
mecanism de reacţie universal valabil
• Dintre numeroasele mecanisme de acţiune
propuse, cele mai importante sunt:
 cataliza acido-bazică,
 cataliza covalentă
 cataliza prin distorsiune.
CATALIZA ACIDO-
BAZICA
• Este cel mai frecvent mecanism întâlnit în cataliza
enzimatică
• Consta in procese de transfer de protoni intre gruparile
acido-bazice ale enzimei si cele ale substratului
• În calitate de catalizatori acido-bazici generali pot
funcţiona:
- grupările carboxilice sau aminice libere ale resturilor
aminoacizilor acizi sau bazici
- gruparea tiol a cisteinei
- gruparea hidroxil a tirozinei si serinei
- gruparea imidazol a histidinei
CATALIZA
COVALENTA
• Formarea complexului enzimă-substrat
presupune formarea unei legături puternice, de tip
covalent (punere in comun a electronilor), între
substrat şi enzima
• Poate avea loc prin atacul nucleofil sau electrofil al
catalizatorului asupra substratului
• Un atom nucleofil prezinta o pereche de electroni
neparticipanti pe care ii poate ceda
• Cataliza covalenta nucleofila

electrofila
CATALIZA
COVALENTA
CATALIZA COVALENTA NUCLEOFILA
• Enzima contine un atom nucleofil care cedeaza o pereche de electroni
substratului (atac nucleofil)
• Se datoreaza aminoacizilor ce alcatuiesc situsul catalitic
• Ex: - serina formeaza legaturi covalente de tip fosforil-serina, acil-
serina (fosfataza alcalina, tripsina, chimotripsina)
- histidina formeaza legaturi covalente de tip fosforil-imidazol
(fosfogliceromutaza, glucozo-6-fosfataza)
-lizina formeaza legaturi covalente de tip baza Schiff (aldolaza, D-
aminoacidoxidaza)
- cisteina formeaza legaturi covalente de tip tioester (papaina)

CATALIZA COVALENTA ELECTROFILA

• Substratul cedeaza o pereche de electroni neparticipanti catalizatorului
(atac electrofil)
CATALIZA PRIN
DEFORMARE
(DISTORSIUNE)
• Se aplică în special la enzimele hidrolitice

• Accelerarea vitezei de reacţie prin acest mecanism s-ar

datora inducerii unei tensiuni în molecula substratului, ceea
ce ar determina “activarea” sa.

• Se presupune astfel că legarea specifică a substratului

de molecula enzimei induce apariţia unei tensiuni sau a
unei deformări în legătura ce urmează a fi scindată.

• Deformarea survenită permite complexului enzimă-substrat

să fie mai reactiv decât substratul singur şi să se transforme
mai rapid în produşi de reacţie.
 PENTRU NOTA
5
Ipoteze referitoare la recunoaşterea moleculară dintre substrat şi enzimă:
 Ipoteza „lacăt –cheie”
Explica specificitatea absoluta de substrat
 Ipoteza potrivirii induse
Explica specificitatea relativa de substrat

Aspecte termodinamice:
1. energia de activare a reactiei catalizate enzimatic este mica
comparativ cea a reactiei necatalizate si cu cea a reactiei catalizate chimic
2.energia libera a reactiei catalizate este egala cu cea a reactiei
necatalizate

Cele mai importante mecanisme de reactie enzimatica sunt:

 cataliza acido-bazică,
 cataliza covalentă
 cataliza prin distorsiune