Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
NOIUNI INTRODUCTIVE
sunt compui macromoleculari de natur proteic, produi i prezeni numai n
organismele vii.
Enzimele sunt catalizatorii lumii vii - biocatalizatori;
catalizeaz reaciile biochimice din organism;
rol esenial n biosinteza i degradarea substanelor din materia vie;
CARACTERISTICI
-permit ca reaciile biochimice s fie considerabil accelerate
De exemplu:
o reacie - n prezena unei enzime poate dura o secund;
- n absena enzimei dureaz 12 zile.
-acioneaz n cantiti extrem de mici.
-le regsim intacte la sfritul reaciei.
-se disting printr-o caracteristic importanta specificitate.
-mresc viteza reaciilor prin scderea Eactivare a substratului.
MECANISMUL DE ACIUNE A ENZIMELOR
Mecanismul de aciune a enzimelor este
catalizatorilor chimici.
analog
cu
cel
al
E+S
k -1
ES
k2
k -2
EP
k3
k -3
P+E
innd cont c:
- transformarea ES EP este practic instantanee
-reacia de transformare P + E EP este nul (enzima fiind specific pentru
substrat nu i pentru produs),
sistemul de ecuaii de mai sus devine:
k1
E+S
ES
k2
P+E
poriune
Ipoteza
LACTCHEIE
(formulata de Emil
Fischer in 1894).
E+S
Echilibrul
E +P
Keq
[ P]
[S ]
G RT ln Keq
ceea ce arata ca pentru o valoare negativa mare a energiei libere,
echilibrul este favorizat.
Ex. Daca
G= 22.8 KJ/mol
Keq=10-4
G= - 17.1 KJ/mol
Keq=103
k [S ]
E+S
k1
k-1
k2
k-2
E+P
In prima etapa enzima si substratul se combina formand complexul ES (starea de tranzitie). Dupa ce complexul E-S se formeaza el se
poate rupe cu formare de E si S (constanta k -1) sau cu formare de
produs (constanta k2).
Daca enzima catalizeaza si procesul reversibil atunci E si P se pot
combina cu formare de E-S (constanta k-2). Daca neglijam aceasta
reactie ( posibil mai ales lakinceputul
eikcand concentratia de P este
1
2
E Sajungand
E+
foarte mica, procesul
laPecuatia:
E +seS simplifica,
k-1
v0 k 2 [ ES ]
vformare ES k 1 [ E ] [ S ]
vconsum ES k 1 [ ES ] k 2[ ES ]
Pe durata reactiei concentratia ES ramane practic constanta (ipoteza starii de
echilibru cinetic -steady state) si atunci se poate scrie:
k 1 [ E ] [ S ] k 1 [ ES ] k 2[ ES ]
si rearanjand:
[ E ] [S ] k 1 k 2
KM
[ ES ]
k1
[ E ] [ S ] ([ E ]t [ ES ]) [ S ]
KM
[ ES ]
[ ES ]
sau
[ E ]t [ S ]
[ ES ]
KM [ S ]
[ E ]t [ S ]
v k 2[ ES ] k 2
KM [ S ]
v max [ S ]
v
KM [ S ]
v max
Cand [S]=KM atunci : v
2
[S]
Substrat
Km (mM)
ATP
0.4
D-Glucoza
0.05
D-Fructoza
1.5
Anhidraza Carbonica
H2CO3
26
Chimotripsina
Gliciltirozinilglicina
108
N-Benzoiltirozinamida 2.5
-Galactoxidaza
D-Lactoza
4.0
Dehidrataza treoninica
L-Treonina
5.0
fs enzima
v max KM [ S ]
1 KM [ S ] KM 1
1
Ecuatia Lineweaver-Burk
v max [ S ] v max [ S ] v max
Ecuatia M-M poate fi modificata algebric v
astfel:
Temperatura
temperatura optim pentru cele mai multe enzime 30-40C.
diminuarea activitii enzimei pn la anularea ei se explic prin
denaturarea termic a enzimei.
enzimele nclzite dincolo de o anumit temperatur i pierd
ireversibil activitatea.
majoritatea enzimelor sunt inactivate printr-o nclzire peste 55C.
exist enzime care rezist la temperatura de 100C.
la temperaturi sczute, enzimele au o activitate foarte lent chiar
nul, dar prin ridicarea temperaturii ele devin din nou active.
pH-ul
valoarea pH-ului optim al diverselor enzime coincide n general cu
pH-ul lichidelor din organism unde ele i exercit aciunea
exemplu: pH-ul optim al pepsinei este de 1,5-2,5 realizat n sucul
gastric de HCl
exemplu: pH-ul optim al tripsinei este de 7.8-8.7 identic cu pH-ul
sucului pancreatic
majoritatea enzimelor vegetale activeaz bine la un pH n jur de 6-7
Activatorii i inhibitorii
sunt compui de natur organic sau anorganic capabili s
mreasc sau s diminueze (n concentraie mic) activitatea
enzimatic i implicit viteza reaciei enzimatice.
Clasificarea uzual a inhibitorilor se bazeaz pe influena lor asupra
dependenei Lineweaver - Burk (1/v =f(1 /[S]) ), adic prezenta
inhibitorului modifica panta dreptei i intersecia cu axele sau numai
una din aceste valori.
Activitatea inhibitorilor poate fi clasificata ca inhibare competitiva,
necompetitiva si mixta.
Inhibarea competitiva
implica competitie intre substrat si inhibitor pentru legarea de
centrii activi ai enzimei.
-inhibitorul practic scoate din reacie o cantitate de enzim liber E,
care altfel s-ar fi legat de substratul S .
-De aceea, concentraia complexului ES scade in prezena
inhibitorului i viteza de reacie (proporional cu ES) scade.
NH2
H2N
N
N
N
N
OH
HN
O
NH
OH
SO2NH2
Sulfanilamida
COOH
O
Acid p-aminobenzoic
OH
Acid folic
Inhibiia necompetitiv
Prin inhibiie necompetitiv inhibitorul nu influeneaz asupra
legrii substratului de enzim, dar impiedic transformarea
substratului in produi prin prezena sa in compoziia complexului
ES .
De fapt inhibitorul se fixeaz la un alt situs decat cel catalitic
activ, provocand o deformare a enzimei ce poate afecta viteza de
reactie.
Inhibiie mixt
Majoritatea reaciilor enzimatice de inhibiie se situeaz intre cele
dou cazuri limit: concurent i neconcurent i de aceea procesul
se numete inhibiie mixt.
Enzime alosterice
Exista enzime a caror activitate poate fi modulata de liganzi (orice molecula care se
poate lega de o macromolecula. Include si molecule mici, precum ATP-ul, dar si proteine
cu masa moleculara mica) care actioneaza altfel decat inhibitorii competitivi sau
necompetitivi. Termenul de ligand defineste.
Liganzii care modifica activitatea enzimelor dar raman nemodificati ca rezultat al
actiunii enzimei se numesc efectori sau modulatori. Ei pot fi activatori sau inhibitori.
Enzimele care raspund la actiunea unor modulatori se numesc enzime allosterice si
actioneaza in etapele determinante de viteza ale cailor metabolice, intervenind in
reglarea proceselor metabolice. Enzimele alosterice au, pe langa centrul activ, si situsuri
alosterice.
Liganzii care se pot lega la situsul alosteric se numesc efectori alosterici sau
modulatori alosterici. Legarea unui efector allosteric determina o modificare
conformationala a enzimei astfel ca afinitatea sa pentru substrat sau pentru alti liganzi
se modifica.
Efectorii alosterici pozitivi se leaga la un situs activator si cresc afinitatea enzimei
pentru substrat, iar cei negativi se leaga la un situs inhibitor si scad afinitatea enzimei
pentru substrat.
Retroinhibitia- este un caz special al inhibitiei allosterice in care inhibitorul este chiar produsul
final al caii metabolice (inhibitie feed-back).
In cazul unei succesiuni de reactii de tipul prezentat, o acumulare excesiva de produs final in
celule determina, prin mecanism allosteric, inhibitia enzimei E 1 ce actioneaza in prima etapa.
Procesul este oprit la restabilirea concentratiei normale de produs final.
NOMENCLATURA
-denumirea uzuala constituit din 3 pri:
lactat denumirea substratului
COOH
COOH
dehidrogenaza
tipul de reacie
C=O
H C-OH
sufixul az
-2H2
CH3
CH3
exemplu: lactat-dehidrogenaza
ADN polimeraza
acid lactic
acid piruvic
STRUCTURA
-edificiu macromolecular complex determinat de nivelurile de
organizare structural ale proteinelor;
-numeroase enzime au o structur binar:
-componenta proteic APOENZIMA
-componenta neproteic COFACTOR
1. COENZIME
- derivai de la vitamine
- se ataeaz temporar de
apoenzim
- uor disociabile de apoenzim
- NAD+, NADP+, FMN, FAD, ATP
2. GRUPRI
PROSTETICE
3. IONI
METALICI
- substane organice
- fixate pe apoenzim
- greu disociabile de apoenzim leg.
covalente
- piridoxalfosfatul,
hemul
- enzimele ce conin ioni
metalici
=2+metal-enzime
- Mg , Mn2+, Cu2+, Zn2+, Fe2+(3+), Mo2+
SPECIFICITATEA ENZIMELOR
Prin specificitatea unei enzime se nelege proprietatea sa de a
aciona preferenial numai asupra unui substrat sau grup de
substraturi cu caractere chimice comune.
specificitatea de reacie
specificitatea de substrat
specificitate absolut;
specificitate de grup;
stereospecificitate;
Specificitatea de reacie;
- se manifest asupra unui singur substrat de ctre mai multe
enzime, fiecare cataliznd o anumit reacie.
- exemplu: un -aminoacid poate constitui substratul pentru mai
oxidaza
multe enzime.
H
R
H
R C COOH
NH2
COOH + NH3
OH
decarboxilaza
R C NH2 + CO2
H2
transaminaza
R
CO COOH
Specificitatea de substrat
- se refer la activitatea care o manifest enzimele fa de
anumite substraturi.
SPECIFICITATE ABSOLUT
- unele enzime nu acioneaz dect asupra unui singur
substrat fiind inactive fa de altele cu structur
asemntoare;
-ureaza hidrolizeaz numai ureea.
NH
ureaza
O=C
NH2
CO2 + 2NH3
H2O
arginaza
H2O
NH2
(CH2)3
HC NH2
COOH
ornitina
NH2
+
C=O
NH2
uree
STEREOSPECIFICITATEA
-unele enzime au stereospecificitate fa de izomeria cistrans
-fumaraza acioneaz numai asupra acidului fumaric i este inactiv
asupra izomerului suHOOC
cis acidul
maleic
HOOC
H
H
fumaraza
COOH
H
H2O
acid fumaric
H OH
COOH
acid malic
SPECIFICITATE de GRUP
- unele enzime acioneaz asupra unei serii de substraturi apropiate
ca structur
-amilaza hidrolizeaz amidonul, dextrinele, glicogenul;
-hexokinaza catalizeaz fosforilarea unei serii de hexoze n prezena
de ATP.
CLASIFICARE
n funcie de tipul reaciei pe care o catalizeaz
sunt 6 clase, fiecare cu 4 pana la 13 subclase:
oxidoreductaze- catalizeaz reacii de tip redox;
transferaze - catalizeaz reacii de transfer;
hidrolaze- catalizeaz reacii de scindare cu participarea
apei;
liaze- catalizeaz reacii de scindare n care nu apar
fenomene de tip redox sau hidroliz;
izomeraze- catalizeaz reacii de izomerizare a
substanelor;
ligaze- catalizeaz reacii n care se formeaz legturi
chimice noi.
H
OH
OH
HO
OH
H
OH
ATP
h e x o k in a z a (E .C . 2 .7 .1 .1 )
H
OH
HO
OH
H
OH
AD P
OXIDOREDUCTAZE
-enzime ce catalizeaz reacii de oxido-reducere care se manifest
prin transfer de electroni de la un donor (agent reductor) ctre un
acceptor (agent oxidant);
intervin ntr-o mare varietate de reacii redox;
-unul i acelai cofactor este capabil s se uneasc cu diverse
apoenzime, formnd de fiecare dat o oxidoreductaz specific n
raport cu un substrat sau altul.
-in cele mai multe oxidari biochimice un compus pierde 2
electroni si 2 ioni de hidrogen reactiile se numesc
dehidrogenari iar enzima ce le catalizeaza dehidrogenaza.
Lactat-dehidrogenaza
lactat
piruvat
NAD+ (nicotinamidoadenin-dinucleotida)
NADP+ (nicotinamido-adenindinucleotida-fosfat)
Oxidaze
-ascorbat-oxidaza catalizeaz oxidarea acidului ascorbic la acid
dehidroascorbic este o cupru-enzim.
Acid dehidroascorbic
-Citocromi-proteine ce contin o
structura porfirinica (hem) cu rol de
transportor de electroni.
-Ali transportori de electroni
Citocrom c
TRANSFERAZE
-enzime ce catalizeaz reacii de transfer prin care o parte (G) din
molecula unui substrat numit donor (D) este cedat unui alt substrat
numit acceptor (A).
- se formeaz ca intermediar un complex enzim-grupare
transferabil, complex care va reaciona ulterior cu acceptorul, fixnd
pe acesta gruparea transferat
D-G + A
D + A-G
Aminotransferaze (Transaminaze)-transfera
amino de la un aminoacid catre un ceto acid
glutamat-piruvat-transaminaza (GPT)
Fosfotransferaze (Kinaze)
hexokinaza - catalizeaz
prima reacie din procesul
glicolizei-fosforilarea ;
Metiltransferaze
Aciltransferaze
Glicoziltransferaze
grupare
HIDROLAZE
-catalizeaz reacia de scindare a moleculelor cu fixarea
componentelor apei la produsele rezultate;
R-R + H-OH
R-H + R-OH
LIAZE
-catalizeaz reacii de rupere de legaturi n care nu apar
fenomene de tip redox sau hidroliz;
-n funcie de natura legturii pe care o desfac:
carbon-carbon liaze (C-C-liaze);
carbon-oxigen liaze (C-O-liaze);
HO
H
carbon-azot liaze (C-N-liaze); O P i r u v a t - d e c a r b o x i l a z a
O
+ CO2
O
carbon-sulf liaze (C-S-liaze) CH
H3C
3
A c id p ir u v ic
A c e ta ld e h id a
IZOMERAZE
-catalizeaz transformarea intramolecular a unui compus
dintr-o form izomer n alt form izomer;
se mpart n mai multe subclase:
-racemaze i epimeraze
-izomeraze cis-trans
-oxidoreductaze intramoleculare
-transferaze intramoleculare
LIGAZE = SINTETAZE
-catalizeaz reaciile de sintez a substanelor organice ce se
desfoar cu descompunerea unor donori de energie pentru
realizarea proceselor de biosintez;
-unul din aceti donori de energie este ATP;
-energia care se elibereaz prin ruperea resturilor de acid
fosforic este utilizat pentru activarea substanelor care
reacioneaz cu aceste enzime.
-conduc
la formarea de noi legturi C-C, C-N, C-O, C-S.
Acid oxalil-acetic
CH2
O
COOH
COOH
H CH2 C
CoA
O
Acetil-CoA
HO
Citrat-sintetaza
HO
CH2
COOH
COOH
CH2
COOH
Acid citric
+ H
CoA
b. Fabricarea branzeturilor
-Cheagul (sau rennina, rennet) este obtinut din stomacul de vitel sau miel
sacrificat in perioada de alaptare. Are rolul de coagulare a caseinei din lapte.
-Se mai utilizeaza lipaze pentru hidroliza grasimilor in timpul maturarii
branzeturilor si peptidaze pentru hidroliza peptidelor.
-enzimele utilizate in procesul de fabricare pot proveni din lapte sau pot fi
generate cu ajutorul culturilor bacteriene.
-prezenta catalazei in lapte este un indiciu pentru boli ale animalului care l-a
produs.
c. Fabricarea bomboanelor
-se utilizeaza invertaza pentru prevenirea formarii de granule de zahar prin
hidroliza la glucoza si fructoza, mult mai solubile.
-se utilizeaza lactaza in cazul inghetatei in scopul distrugerii cristalelor de
lactoza formate si pastrarea texturii cremoase.
d. Industria panificatiei
Lipoxigenaza care catalizeaza reactii de oxidare cu formare de peroxizi, in
special pentru acizii grasi nesaturati, este utilizata la albirea fainii si painii. Se
extrage din semintele de soia.
e. Industria carnii
-pentru fragezire se folosesc diverse proteaze (bromelaina si papaina) care
hidrolizeaza o parte din legaturile peptidice. Bromelaina se extrage din
ananas.
f. In industria textila
-pentru descleierea esturilor. esturile sunt incleiate prin aplicarea de
amidon pe firele de urzeal pentru a le consolida nainte de esut. Dar
atunci cnd aceste materiale sunt imprimate sau vopsite, cleiul trebuie s
fie eliminat. Descleiere se poate face cu acizi, baze sau enzime.
Preparatele enzimatice pentru descleiere sunt de preferat deoarece nu
slbesc estura. Enzime pentru acest scop sunt obinute dintr-o varietate
de surse: bacterii, fungi i mal.
-in curatirea chimica petele de clei, gelatina, amidon sunt indepartate cu
ajutorul enzimelor (de ex. alcalaza).
-in industria pieilor, indepartarea parului se face cu enzime pancreatice
care hidrolizeaza proteinele din firul de par din folicul si face indepartarea
mai usoara.
g. In analize si tratament medical
-corectarea digestiei se realizeaza prin suplimente de enzime . Papaina,
pepsina si amilazele actioneaza asupra digestiei din stomac in timp ce
enzimele pacreatice asupra digestiei din duoden.
-Vindecarea ranilor. Enzime proteolitice din pancreas de porc sunt
folosite pentru a atenua bolile de piele, leziuni de pat i rni de
descuamare. Aceste enzime acioneaz prin distrugerea enzimelor
proteolitice ale omului, care mpiedic vindecarea acestor rni. Enzimele
Tema de casa
Un biochimist studiaza proprietatile unei enzime metabolice pe care el insusi
a izolat-o. El obtine date cinetice in prezenta si in absenta a doi inhibitori
diferiti (A si B). Identitatea inhibitorilor este necunoscuta dar se stie ca unul
este analog substratului iar celalalt este un agent de alchilare.
[S] (mol/L)
Fara inhibitor
Cu inhibitor A
Cu inhibitor B
[I] =0
[I] = 5 x 10-4 M
v (mol/min)
v (mol/min)
v (mol/min)
5 x 10-4
1.25
0.82
0.48
2,5 x 10-4
0.87
0.49
0.33
1,7 x 10-4
0.67
0.36
0.25
1,2 x 10-4
0.54
0.26
0.20
1 x 10-4
0.45
0.23
0.17
Determinati:
a) KM si Vmax pentru enzima ;
b) Care inhibitor este analog substratului? Care este agentul de alchilare?
(Sugestie: ce fel de inhibare are loc?)
c) Valorile KMi si Vmaxi in cazul utilizarii fiecaruia dintre cei doi inhibitori;
Obs. Utilizati un program de calcul , Excel spre exemplu!