Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
cu co-enzimă (co-reactant);
= procesele enzimatice cu promotor/activator;
fără co-enzimă;
temperatură;
= activitatea enzimei este foarte sensibilă la pH;
inhibitor;
87
La începutul unei reac ii enzimatice:
⇓ Eo
(ES)
k ⋅S ⋅E
(ES) = 1
k −1 + k 2
S = S0 0 Timp
t =0
( ES )0 = 0 92
dS
= − k1 ⋅ S ⋅ E + k −1 ⋅ ( ES )
dt
k ⋅ S ⋅ E E0 ⋅ k −1 + E0 ⋅ k 2 − k1 ⋅ S ⋅ E
E = E0 − ( ES ) = E0 − 1 =
k −1 + k 2 k −1 + k 2
E ⋅ k −1 + E ⋅ k 2 = E0 ⋅ k −1 + E 0 ⋅ k 2 − k1 ⋅ S ⋅ E
⇓
k −1 + k 2
E = E0
k −1 + k 2 + k1 ⋅ S
k1 ⋅ k 2
− rS = rp = ⋅ S ⋅ E0
k −1
k1 ⋅ k2
− rS = rp = ⋅ S ⋅ E0
k −1 + k2
k2
− rS = rp = ⋅ S ⋅ E0
k −1
+S
k1
94
Cazurile limită ale ecuației M-M:
Vmax ⋅ S
S << K M rS =
KM
k1 ( ES )
= K eq = (echilibru prima reacție)
k −1 S⋅E
1 k1 ( ES )
= ≈
K M k −1 + k 2 S ⋅ E
( ES ) S enzimă legată
= =
E K M enzimă liberă
95
Dacă: KM = S ½E este legată ți ½E este liberă
96
Determinarea parametrilor cinetici ai ecuației
Michaelis-Menten din date experimentale
(curbe cinetice S(t))
a) Metode aproximative
1 V max⋅S
− − rS =
rS
KM + S
⇒
1 KM + S K 1 1
1 − = = M ⋅ +
Vmax
rS V max⋅S Vmax S Vmax
1 0 1
−
KM S
97
a2) Diagrama Eadie
rS
E0 rS ( K M + S ) = V max⋅ S = k 2 ⋅ E 0 ⋅ S
k2 rS ⋅ K M + rS ⋅ S = k 2 ⋅ E 0 ⋅ S
rS ⋅ S = k 2 ⋅ E 0 ⋅ S − rS ⋅ K M S ⋅ E0
⇒
rS r
= k2 − K M S
0 k2 rS E0 S ⋅ E0
KM S ⋅ E0
n S, P 2
[ V̂ max , K̂ M ] = arg Min Φ = ∑ ∑ ( C i, u, exp − Ci , u , model )
u =1 i =1
99
Mecanismele inhibiției enzimatice
Inhibiție competitivă
k1 k2
S+E (ES) P+E
k-1
I+E (EI)
Ki
1 k
= i
K i k −1
I = I0 (concentra ie inhibitor)
k −1 + k 2
KS =
k1
Vmax ⋅ S
rP = ; V max = k 2 ⋅ E 0 ;
I
K S 1 + + S
K I E 0 = E + ES + EI
dP
rP = = k 2 ( ES )
dt
101
Inhibiție ne-competitivă (non-competitive)
k1 k2
E+S (ES) E+P
k-1
k3 k-3 + I k4 k-4 + I
k5
EI (ESI)
k-5
• are loc la concentrații foarte mici ale S ;
• inhibitorul se leagă la un situs distinct de
cel al substratului, numit situs de legare;
• Vmax nu este atins niciodată, nici chiar la
concentrații foarte mari ale substratului;
V max = k P ⋅ E 0
Vmax ⋅ S
rP =
I
1 + + (K S + S )
KI
• inhibitorul reduce rp prin blocarea
centrilor activi; 102
Vmax ⋅ S1 ⋅ S2
• cinetica M-M cu dublu substrat: − rS = rP =
( K M1 + S1 ) + ( K M2 + S2 )
(ESI)
Vmax ⋅ S
rP =
I
K S + S ⋅ 1 +
KI
k1 kcat
nS + E (ESn) nP + E
k-1
Vmax ⋅ S n
− rS = rP =
K Sn + S n
V max = k cat ⋅ E 0
Inhibiție alosterică
a) Dezactivarea enzimei
• enzima se dezactivează în timp datorită schimbărilor structurale
conformaționale după ecuația:
dE
dt
= − kd ⇒ E = E 0 ⋅ e − kd ⋅t
k 2 ⋅ S ⋅ E k 2 ⋅ E 0 ⋅ e − kd ⋅t ⋅ S
rS = =
KM + S KM + S
b) Sterilizarea enzimei
• sterilizarea este similară dezactivării naturale dar are ca efect încetarea
viabilității organismului sau a celulei;
• sterilizarea se face sub influența căldurii, radiației sau a compuților
chimici;
105
• sterilizarea este un proces stocastic, aproximat printr-o cinetică de
ordin unu:
rd = − kd ⋅ X
(X = concentrația de biomasă activă)
X = X 0 exp ( − k d ⋅ t )
X
Demo: = 0.1 = exp ( − kd ⋅ t )
X0
ln 0.1 = − kd ⋅ t d ⇒ − ln 10 = − kd ⋅ t d
ln 10
td =
kd
106