CURS VII BIOFIZIC

Moleculele vii studiate individual se suprapun principiilor fizice i chimice

obinuite care guverneaz comportarea materialelor inerte , dar studiate n ansamblu
interacioneaz ntre ele conform unui alt grup de principii care alctuiesc logica
molecular a strii vii. Aceste principii nu includ n mod necesar legi fizice noi,
nedescoperite nc. Ele trebuie privite ca un grup de reguli fundamentale care
guverneaz natura, funcia i interaciuni specifice ale moleculelor din organismele
vii, proprieti ce confer acestora din urm capacitatea de a se autoorganiz,
autoreplica i autoreglarea. Este mult mai potrivit s considerm aceste grupri de
reguli ca axiome deoarece unele dintre ele sunt iniiative i nu pot fi demonstrate nc.
Compoziia chimic a materiei vii este calificativ fa de a mediului n care aceasta se
gsete. n esen organismele vii au constituia lor ioni de dimensiuni foarte mici
microioni ( Na, K, Cl implicat n excitabilitatea, Ca implicat n contracia
muscular; Mg rol n procesele de bioluminiscen; H2 secretat de mucoasa
gastric i generator de tensiuni protonmotrice n anumite microorganisme).
Micromoleculele care pot fi disociate sau neutre (aminoacizi, mononucleotide,
monozaharide, acizi grasi).

Structura fizic a moleculei

Molecula este o grupare de atomi ce formeaz o configuraie stabil datorit

forei de interaciune dintre ei. Forele exercitate ntre molecule sunt fore
intermoleculare. Condiiile de formare a moleculei se realizeaz atunci cnd fora de
atracie dintre atomi este egal cu cele de respingere iar Ep este minim. Cnd este
perturbat molecula se disociaz.
Fora care acioneaz ntre elementele ce formeaz biomolecula este fora
intermoleculara (se pot msura prin metode specifice ca rezonan magnetic nuclear
i rezonan de spin, ce msoar valoarea forei i difraciei de raze X, care msoar
fora indirect prin msurarea distanei dintre atom la un moment dat).
Fortele interatomice ionice i covalente
Legatura ionic electostatic
Teoretic fora de legtur se poate determina prin legea lui Coulomb
Legea covalent este legea n care doi atomi cedeaz i primesc electroni de
valen formnd un nivel electronic stabil.

Caractere generale ale legturii covalente

Legtur de distan mic; distana dintre doi atomi este inferioar razei de aciune
interatomic
Are caracter de saturaie. Odat format legtura dintre doi atomi, forele
electronice nu mai permit alte legturi. Cristalele formate prin legile covalente
sunt dure (diamant).
Legea coordinativ - este format din doi electoni pui n comun. Electornii
sunt furnizai de acelai atomi pentru completarea nivelului energetic extern.
Exemplu: oxigenul poate realiza dou legturi covalente i poate fi receptor pentru o
legtur coordinativ.
n legile covalente formate dintre atomi difer perechea de electroni de
legtur nu este repartizat simetric ntre cei doi atomi ci este atras spre atomul mai
electronegativ, aceasta reprezint realizarea unui dipol. Dipolul reprezint momentul
n care legtura va fi cu at mai mare cu ct diferena de electromegativitate este mai
mare.
Legea metalic lege puternic realizat cu electroni pui n comun care
genereaz i electroni liberi de conductibilitate.
Forele intermoleculare sunt fore care se exercit ntre moleculele ce
formeaz structur biologic. Acestea sunt mai mici dect cele intermoleculare dar
efectul lor devine semnificativ datorit numrului mare de interacii de acest fel.
Energia mic corespunztoare acestor fore permite ruperea i formarea lor destul de
uor, lucru ce caracterizeaz funciile biologice ale biomoleculelor. Aceste fore se
manifest la distan mic.
Dipol electric este un sistem format din dou sarcini electrice egale i de
semn contrar aflate la distan d una fa de alta. Momentul dipolului = F d

Energia de interaciune dipol ion

FORMULA

Semnul - indic existena unei fore de atracie dintre dipol i ionul

respectiv.
= 0 - dipolul este aliniat cu Q
= 90 - dipolul este perpendicular pe r i W p = 0 deoarece cele dou
sarcini + q i q sunt egal deprtate de Q
= 180 dipol aliniat cu ionul de sarcin electric Q

Energia de interaciune dipol dipol

FORMULA

n biofizic se ntlnesc n mod frecvent biomolecule ce sunt din punct de

vedere electric, dipoli permaneni. AA, proteine, lipide au acest caracter datorit
distribuiei de gradul de sarcin pe suprafaa moleculelor.

Legtura de hidrogen

Este un caz particular al interaciei dipol dipol. O molecul format dintr+un

atom de hidrogen i un atom electronegativ prezint o legtur covalent cu caracter
parial ionic. Se formeaz un dipol cu sarcina negativ spre atomul electronegativ i
cea pozitiv spre atomul de hidrogen. Dac n apropierea dipolului se gsete un alt
act atunci ntre acesta i dipol se realizeaz o legtur determinat de atracia dintre
protonul i electronul atomului. Aceast legtur format dintre dipol i atom
reprezint legtura de hidrogen.
Caracteristici: distana dintre atomi este foarte mic; energia legturii de
hidrogen este mai mare dect Wleg dintre doi dipoli.

Dipoli indui

Se consider un atom neutru n apropierea cruia se gsete un ion pozitiv

care va exercita o for de atracie asupra elecronilor i o for de respingere asupra
nucleului atomic. Atomul se va deforma, adic se produce o uoar separare a
sarcinilor pozitive i negative de unde rezult un dipol indus deoarece exist att timp
ct ionul exist n jurul atomului.

Dipoli tranzitorii

n general ntr-un atom sau molecul, electronii sunt distribuii simetric n

jurul atomului. Simetria se poate modifica ducnd la formarea unui dipol. Electronii
fiind n continu micare existena dipolului este condiionat de probabilitatea
asimetriei i distribuiei electrice i dureaz atta tmp ct dureaz asimetria. Un astfel
de dipol este tranzitoriu.
Dac un astfel de dipol se afl n apropierea unei molecule atunci poate induce
n aceasta ali dipoli a cror orientare i moment s depind de dipolul tranzitoriu,
efectul lor fiind cumulativ, forele dispersive capt importan.

Structura molecular a apei

Molecula de ap este format din doi atomi de hidrogen i un atom de oxigen

legai prin legturi covalente.

Cei 10 electroni ai moleculei de ap sunt distribuii astfel: doi electroni ai

oxigenului pe primul strat se gsesc n permanen n apropierea nucleului; 8
electroni de valen graviteaz pe nite orbite eliptice alungite.
Dou perechi de electroni se afl pe orbite axate pe direciile O H. Acetia
sunt electroni ce formeaz legturi covalente.
Alte dou perechi de electroni graviteaz pe dou orbitew situate
perpendicular pe planul nucleului (electroni neparticipani) molecula de ap are
structur tetraedic nucleul de oxigen este n centru.
Molecula de ap poate forma legturi coordinative, puni de O 2 cu alte
molecule. Fiecare molecul de ap se poate lega coordinativ cu alte patru molecule
formnd structuri spaiale (ex: gheaa). Topirea gheii duce la stricarea structurii
tetraedice prin ruperea legturii de hidrogen i spaiile goale din cristal se ocup cu
alte molecule de ap ceea ce explic creterea H 2O maxim = 3,98. Creterea n
continuare a moleculei mic, creterea agitaiei termice. La nghearea apei se
cedeaz mediului 1,44Kcal pentru dou molecule de ap. La topire 15% din legatura
de Hidrogen se rupe. Apa lichid conine configuraii spaiale de ghea.
Pauling propune n configuraia apei pure o structura clatrat (n care o
molecul de ap este nconjurat de alte 20 de molecule). Cu creterea temperaturii o
parte din clatrai se distrug exist astfel i molecule libere supuse agitaiei termice.
 Apa n sisteme biologice

Apa este matricea vieii. Constituie solventul universal att n mediul

interstiiar ct i n cel intracelular. Este mediul de transport al substanelor de la un
organ la altul. Este mediul de aliminare al produilor de dezasimilaie, de dispersie.
Este necesar n reacia de hidroliz. Este tampon pentru variaiile de temperatur.
Degajarea de temperatur prin evaporare i rol de termostat prin cldur specific
mare. n organismele vii apa se gsete n procente diferite n funcie de specie i
gradul de dezvoltare ontogenetic. La organismele superioare exist apei se poate
clasa astfel dup locul n care se afl n raport cu celula. Apa intracelular: 70% din
total. Apa extracelular 30% - interstiial 20% si apa circulant (vascular) 7%.
Dup distribuia n esuturi apa tisular i extratisular este reprezentat de umorile
apoase, silicoase, lichid cefalorahidian i snge. Dup interacia cu macromolecule
biologice apa poate fi liber sau legat (structurat). Dup proveniena n organism
apa poate fi exogen sau endogen.
Cantitatea de ap n esuturi depinde de coeficientul lipocitic; raportul dintre
cantitate de colesterol hidrofil i cantitatea de acizi grai hidrofobi. Cu ct un organ
sau esut este sediul unor procese metabolice intense cu att coninutul de ap este mai
mare.
Deoarece anabolismul scade cu vrsta se constat si o scdere a procentului de
ap cu vrsta: nou nscut 76 80%; femei 60 80 ani 56 60%.
O distribuie a apei:
Pr 4%
Dentin 9%
Schelet i esut adipos 30%
Cartilaj 50%
Substan alb 70%
Substan cenuie - 85%
Ficat - 75%
Muchi - 76%
Cord 77%
Plmn 81 %
Plasm - 93%
esut embrionar - 97%

Modificrile structurii apei n prezena solviilor

Solvitul micoreaz gradul de ordonare a moleculei de ap, similar cu

creterea temperaturii. Apa se dispune concentric n jurul ionilor formnd primul i al
2 lea strat de hidratare. Moleculele hidrofobe creeaz caviti n ap i devin molecule
interstiiare.

Proprieti fizice particulare ale apei

Cldura specific a apei este de 4,2 Kj/KgK. Este foarte mare fa de oricare
substan solid sau lichid. Aceast proprietate a apei permite o stabilizare a
temperaturii n diferite procese biologice. Conductibilitatea termic este mai mare ca
la alte lichide a altor structuri diferite de circulaie. Cldura latent de vaporizare este
mai mare la alte lichide. Cldura latent de vaporizare este factorul determinant n
homeotermie prin termoliz sau evacuare pulmonar.

Densitatea

Creterea spre 4C a densitii apei permite supravieuirea n ap cu ghea, la

suprafaa a petilor. Constanta dielectric explic capacitatea mare de ionizare a
substanei dizolvate. Punctele de topire la 0C i fierbere la 100C permit un interval
mare n care proprietile apei se schimb foarte putin. Coeficientul de difuziune ce
reprezint cantitatea de substan ce difuzeaz printr-o suprafa de 1cm 2/sec permite
difuziunea liber a substanei existente n lichidele biologice. Coeficientul de
viscozitate mic permite o deplasare a straturilor apei n mod liber aproape fr frecare
i consum de energie. Coeficientul de tensiune superficial scade cu creterea
temperaturii datorit agitaiei termice i ruperii legturii de hidrogen.