Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
- masă
- relief
- volum
- suprafaţă externă - în contact cu
moleculele vecine
- mişcări interne şi flexibilitate
B. Macromoleculele sunt
structuri complexe
- sunt alcătuite din molecule elementare
(denumite unităţi sau, mai bine, subunităţi
glicogenul este alcătuit din subunităţi de
glucoză)
I. Polimeri lineari
II. Polimeri ramificaţi
III. Polimeri globulari
I. Polimeri lineari - alcătuiţi din
monomeri reuniţi, fiecare, prin
două legături simple (asemenea
verigilor dintr-un lanţ)
ex.: lanţul polipeptidic
A–B–A–D–G–A–A
A – A – A – A – A – A – A … sau (A)n
II. Polimeri ramificaţi - la nivelul cărora,
în anumite puncte lanţul de monomeri
prezintă o ramificaţie, punct de
plecare pentru un nou lanţ de
monomeri; monomerul situat la
nivelul ramificaţiei prezintă 3 legături
cu monomerii vecini.
III. Polimeri globulari - rezultă de
regulă prin asocierea de
oligomeri sau polimeri mici;
fiecare subunitate este în
contact cu mai multe alte
subunităţi.
Pentru studiul structurii
unui oligomer sau polimer
- Structura monomerului
(sau a monomerilor)
2 tipuri de mecanisme de
asociere
1. prin legături covalente
2. prin legături non-covalente
Gruparile amino si carboxil ale a.a. se ionizeaza usor la
pH fiziologic (gruparea amino fixeaza un proton, iar
gruparea carboxil pierde un proton). Rezultatul este un
zwitterion, adica o molecula ionizata care are ambele
sarcini, pozitiva si negativa, dar sarcina totala este zero.
Caracteristici:
forţe de legătură relativ slabe (1/10 faţă de legătura
covalentă),
de aceea se stabilesc în număr mare (pentru un efect
atractiv suficient),
suprafeţele moleculelor trebuie să fie complementare
(pentru apropiere suficientă),
aceste legături fizice pot fi situate:
- în structura internă a macromoleculei,
- asocieri ale unor subunităţi identice sau de tipuri
diferite.
NATURA legăturilor
non covalente (4 tipuri)
90 % din gruparile
functionale ale unei
proteine formeaza
legaturi hidrogen, fie
cu apa fie cu alte
grupari functionale.
non covalente
forţe de coeziune apolare
MACROMOLECULE DE
STRUCTURA
BIOCOLOIZI
MACROMOLECULE DE STRUCTURA
I. Caracteristici particulare ale
macromoleculelor din structurile vii
II. Clasificarea proteinelor
III. Structura primara, secundara, tertiara si
cuaternara a proteinelor
IV. Functii generale ale proteinelor
V. Metode de studiu ale proteinelor
VI. Insulina, mioglobina - hemoglobina,
colagen, ADN si ARN
Structura
primară
Structura secundară
Structura terţiară
Structura
cuaternară
Structura primară
- - Ala – Glut – Ser – His – Leu – Pro – Gly - -
3 principii importante:
1. Lanturile secundare sunt consecinta, in
principal, numeroaselor legaturi hidrogen.
2. Structurile secundare de tip α-helix si
β-pliat se asociaza frecvent pentru a forma
proteine.
3. Lanturile au tendinta de a se plia in spatiu
pentru a ocupa mai putin loc.
Structura tertiară
Legaturile structurii tertiare -
RECAPITULARE
Exemple de structura tertiara
Mioglobina - structura
tertiara.
Structura secundara = 8 elice alfa.
Exemple de structura tertiara
Trioz-fosfat-
izomeraza
Enzima.
Structura secundara =
8 elice alfa si 8
structuri beta.
Trioz-fosfat-
izomeraza
Exemple de structura cuaternara
Structura cuaternară -
Hemoglobina
I. Caracteristici particulare ale
macromoleculelor din structurile vii
II. Clasificarea proteinelor
III. Structura primara, secundara, tertiara si
cuaternara a proteinelor
IV. Functii generale ale proteinelor
V. Metode de studiu ale proteinelor
VI. Insulina, mioglobina - hemoglobina,
colagen, ADN si ARN
Proteinele asigura o varietate uimitoare de functii in
strinsa relatie cu structura lor moleculara
1. Enzime: catalizează ruptura
sau formarea unor legături
covalente (mii)
Ex:
- pepsina
- ADN-polimeraza
- ribonucleaza
- tripsina
-alcool-
dehidrogenaza
2. Proteine structurale:
susţinerea mecanică a celulelor şi
a ţesuturilor
Ex:
- colagenul şi
elastina
-tubulina şi
actina
- α- keratina
- proteoglicanii
3. Proteine de transport:
transportul unor molecule mici sau a
unor ioni
Ex:
- Hb. – oxigen
- transferina - fier
- albumina - lipide
- proteine de
transport
membranar: H2,
glucoză (GLUT),
Ca2+
4. Proteine motrice: generează
mişcare în celule şi ţesuturi
Ex:
miozina,
actina,
kinezina,
dineina
5. Proteine de stocare:
a unor molecule mici sau ioni
Ex:
- feritina
- ovalbumina
6. Proteine semnal: transmit
semnale de la celulă la celulă
Ex: - hormoni (insulina, tirotropina etc.)
- factori de creştere: NGF, EGF
7. Proteine receptoare:
detectează semnale şi le
transmit maşinăriei celulare
Ex:
-rodopsina,
- receptorul
pentru
acetilcolină al
celulei
musculare
primeşte
semnale
chimice
8. Proteine reglatoare ale
genelor: se leagă de ADN pentru a
induce sau a inhiba expresia genelor
9. Proteine cu rol particular
Ex:
- proteinele antigel
ale peştilor de la
polii Nord-Sud
- proteine
fluorescente
- proteine cu
funcţie de adeziv
Ex.
lumina produsa =
rezultatul reactiei
intre luciferina si
ATP (sub actiunea
unei enzime,
luciferaza).
Funcţiile proteinelor membranare
I. Caracteristici particulare ale
macromoleculelor din structurile vii
II. Clasificarea proteinelor
III. Structura primara, secundara, tertiara si
cuaternara a proteinelor
IV. Functii generale ale proteinelor
V. Metode de studiu ale proteinelor
VI. Insulina, mioglobina - hemoglobina,
colagen, ADN si ARN
A. Detectarea proteinelor
B. Determinarea structurii
proteinelor
C. Purificarea proteinelor
D. Alte metode
A. Detectarea proteinelor
- Western blot
- Imunoprecipitare
- Spectrofotometrie
- ELISA
Spectrofotometrie
B. Determinarea structurii
proteinelor
- cristalografie
- RMN
Cristalografie (difractie cu raze X)
2d sin θ = n∙λ BC + BD = nλ
2d sin θ = n∙λ
C D
d
B
Condiţia maximului de interferenţă se realizează pentru cazul în care
diferenţa de drum a celor două raze este un multiplu întreg al lungimii
de undă, adică BC + BD = nλ.
difractograma
“We have discovered
the secret of life” 2003 /
1953
Premiul Nobel in Fizica in 1915: “Pentru
serviciilor lor privind analiza structurii
cristalelor cu ajutorul razelor X" un pas
important in dezvoltarea cristalografiei
cu raze X.
Difractia cu raze X
- 1. metoda cu pulberi -
Preparatul este pulverizat sub forma de pulbere intr-un spatiu inchis (tub
capilar cu pereti subtiri), astfel incit razele X (monocromatice) vor
interactiona cu particulele sub toate unghiurile θ posibile. Fasciculele de
raze X vor fi difractate de acele cristale ale caror plane sunt intimplator
orientate sub un unghi de incidenta θ care satisface ecuatia Bragg.
Difractia cu raze X
- 2. metoda cu cristal turnant -
Cristalul este rotit usor, si doar pentru anumite unghiuri θ se obtin maxime de
difractie, care vor fi inregistrate pe filmul fotografic. Rezolutia metodei = 5 - 6 Å .
Imaginea de difractie, inregistrata pe film, corespunde pozitiei atomilor din
reteaua cristalina.
2d x sin = nλ
Premiul Nobel in Fizica Ecuatia lui Bragg –
1914 100 ani in 2012
Max von Laue Lawrence si Henri Bragg =
Premiul Nobel in Fizica 1915
Rayons X
Transformée de Fourrier
En calculant la transformée de Fourier inverse
on obtient la densité électronique de la molécule
On place les
atomes
dans la densité
électronique
Il faut connaître
la séquence
Aranjare hexagonala
Aranjare tetraedrica a atomilor
a atomilor de carbon
de carbon; leg. cov.
B. Determinarea structurii
proteinelor
- cristalografie
- spectrometrie RMN
Spectrometria RMN ofera informatii (cu rezolutie atomica)
despre structura tridimensionala a proteinelor, dar si despre
mecanismele care guverneaza asamblarea dinamica a
acestora.
Principiu:
- se plaseaza proteina in solutie, intr-un camp magnetic intens
(10 - 20 T)
- spinii nucleelor atomilor din care este alcatuita proteina se
orienteaza in lungul axei principale a campului magnetic.
Inconveniente:
- limite privind marimea (maxim 50 kDa, sau 30 kDa cu
marcaj),
- necesita solutii concentrate (100 μM - 1 mM).
Macromoleculele (proteinele)
nu trebuie sa fie de dimensiuni
mari (maxim 30 KDa).
Acelasi
spectru
(2 D) ca si la
(b)reprezentat
prin niveluri de
contur.
Spectru 3 D. Proteina
este uniform marcata cu
azot 15N si carbon 13C.
Determinarea structurii
tridimensionale a
proteinelor prin RMN.
Proteina (ex. nostru)
contine in principal doua
domenii beta-pliat (in
galben si verde), o zona
alfa-helix (in rosu) si
legaturi flexibile
(reprezentate in albastru).
- Metode cromatografice
- Metode electroforetice
- Electrofocusarea
Cromatografie Do you
remember?
Do you
remember?
Electroforeza
Do you
Electrofocusare remember?
D. Alte metode
- marcarea cu radioizotopi
- marcarea cu markeri
fluorescenti
-utilizarea de markeri
metabolici
Do you
remember?
Utilizarea
de markeri
fluorescenti
I. Caracteristici particulare ale
macromoleculelor din structurile vii
II. Clasificarea proteinelor
III. Structura primara, secundara, tertiara si
cuaternara a proteinelor
IV. Functii generale ale proteinelor
V. Metode de studiu ale proteinelor
VI. Insulina, mioglobina - hemoglobina,
colagen, ADN si ARN
Exemple de proteine -1
Insulina
INSULINA - 51 acizi aminati
(lantul A = 21 aa, lantul B = 30 aa)
1. struct.
primara
7 a.a. terminali -
Lantul A indispensabili
functionarii ca hormon
Lantul B Diferen.
intre ins.
umana
si cea de
2. struct. la o
serie de
secundara
specii
animale
Exemple de proteine -2
Mioglobina
si
Hemoglobi
na
-analogie structurala si functionala = capacitatea de a fixa
reversibil O2
- Hb 4 lanturi tertiare: 2 lanturi α (141 a.a.) si 2 lanturi β (146 a.a.)
- fiecare lant are fixat un grup heminic prin leg. necov.
MIOGLOBINA HEMOGLOBINA
lantul ß
Exemple de proteine - 3
Colagenul
-1/3din proteinele
totale
- nu se poate etira
-tripla elice =
tropocolagen
Exemple de proteine - 4
ADN-ul si ARN-ul
(acizi nucleici)
Spirala se stabilizeaza prin
legaturi de hidrogen