Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Aminoacizii
Din punct de vedere chimic, aminoacizii sunt molecule care au în același timp
grupări carboxil (-COOH) și amino (–NH2), ca in figura 1.
Fig. 1 – Structura unui aminoacid
Biochimiștii se concentrează asupra α-aminoacizilor, în care aceste grupări
sunt legate de același carbon terminal (așa-numitul α-carbon în nomenclaturile de
chimie organică), deoarece proteinele care apar în mod natural sunt polimeri ai α-
aminoacizilor. Pe lângă grupurile amino și carboxil, α-carbonul (denumit și carbon
central) se leagă de un atom de hidrogen și de un alt grup, numit lanț lateral și
reprezentat de R. În natură, R are 20 de grupări posibile, cu câteva excepții care sunt
de obicei derivate din aceste grupuri.
O altă particularitate interesantă a aminoacizilor care apar în mod natural, pe
lângă faptul că sunt α-aminoacizi, este că aceștia sunt aproape exclusiv (glicina nu
prezinta acest tip de izomerie) L-enantiomeri, deoarece α-carbonii sunt centre
chirale. Celălalt enantiomer este denumit D (fig 2).
Fiecare dintre aminoacizii din această categorie are un lanț lateral care nu
câștigă sau nu pierde protoni sau nu participă la legături de hidrogen sau ionice (vezi
Fig. 3). Lanțurile laterale ale acestor aminoacizi pot fi considerate "uleioase" sau
asemănătoare lipidelor, o proprietate care promovează interacțiunile hidrofobe.
Localizare în proteine: În proteinele găsite în medii polare, precum soluțiile
apoase, lanțurile laterale ale aminoacizilor nepolari tind să se grupeze împreună în
interiorul proteinei (Fig. 4). Acest fenomen este cunoscut sub numele de efect
hidrofob și este rezultatul hidrofobiei grupurilor R nepolare, care acționează
asemănător cu picăturile de ulei care coagulează într-un mediu apos. Ocupând
interiorul proteinei pliate, aceste grupuri R nepolare ajută la conferirea formei
tridimensionale a proteinelor.
Fig 5
O structura de tip dublu prolina (doua proline una dupa alta) a fost introdusa
artificial in vaccinul anticovid bazat pe proteina S a coronavirusului, in scopul
cresterii stabilitatii si imunogenitatii.
AMINOACIZI ESENȚIALI
Aminoacizii esențiali nu pot fi produși in organismul uman. Ca urmare,
aceștia trebuie să provină din alimentație. Cei 9 aminoacizi esențiali sunt: histidină,
izoleucină, leucină, lizină, metionină, fenilalanină, treonină, triptofan și valină.
AMINOACIZI NEESENȚIALI
Organismele umane pot produce acesti aminoacizi, chiar dacă nu îi obținem
din alimentele pe care le consumăm. Aminoacizii neesențiali includ: alanină,
arginină, asparagină, acid aspartic, cisteină, acid glutamic, glutamină, glicină,
prolină, serină și tirozină.
Aplicație Clinică: insulina cu acțiune mai lentă și durată mai lungă creată prin
substituirea aminoacizilor
Insulina este un peptid cu doua lanturi (A- 21 si B- 30 de aa) unite prin punti
de sulf.
Insulina glargine (insulina lenta) a fost aprobată pentru prima dată pentru
utilizare în Statele Unite în anul 2000. Este o formă de insulină cu acțiune mai lentă,
creată în laborator prin înlocuirea asparaginei, care se află în mod normal la poziția
21 pe lanțul A al insulinei, cu glicina și adaugarea a două reziduuri suplimentare de
arginină (figura 9). Rezultatul acestor modificări este o formă de insulină mai puțin
solubilă în apă, cu o sarcină netă de + 0,2 la pH fiziologic, care este mai aproape de
0, determinând o absorbție mai lentă a insulinei glargine de la locul injecției. Sarcina
electrica apropiata de zero scade solubilitatea in apa pentru aminoacizi, peptide sau
proteine. Reziduurile suplimentare de arginină mută punctul izoelectric de la pH 5,4
la pH 6,7, făcând molecula mai solubilă la pH acid și mai puțin solubilă la pH neutru.
Insulina glargine este, prin urmare, o formă de insulină care acționează lent, are o
activitate mai lungă și necesită injecții mai puțin frecvente. Această formă de
insulină poate fi utilă în tratamentul diabetului zaharat și ajută pacienții să obțină un
control glicemic mai bun.
HA este forma ionizată a unui acid slab. Prin definiție, constanta de disociere
a acidului HA este dată de relația:
Cu cât Ka este mai mare, cu atât acidul este mai puternic, deoarece asta
inseamna ca cea mai mare parte din HA s-a disociat si a generat protoni. Invers, cu
cât Ka este mai mic, cu atât mai puțin acid s-a disociat și, prin urmare, acidul este
mai slab.
Ecuația Henderson–Hasselbalch:
Rezolvând ecuatiile de mai sus pentru valoarea [H+], luând logaritmul
ambelor părți ale ecuației, înmulțind ambele părți ale ecuației cu -1 și apoi
substituind obținem ecuația Henderson–Hasselbalch:
Deci ecuatia H-H este:
Această ecuație demonstrează relația cantitativă dintre pH-ul soluției,
concentrația unui acid slab (HA) și a bazei sale conjugate (A−).
Aceasta este o formulă esențială în chimia acido-bazică și în biochimie. Ea
oferă un mod simplu de a prezice pH-ul unui tampon, dată fiind concentrația acidului
și a bazei sale conjugate, și este utilă în proiectarea soluțiilor tampon și în înțelegerea
comportamentului acido-bazic al moleculelor biologice.
Solutii tampon
Un tampon este o soluție care rezistă la o schimbare a pH-ului după adăugarea
unui acid sau a unei baze și poate fi creat prin amestecarea unui acid slab (HA) cu
baza sa conjugată (A−). Dacă se adaugă un acid la un tampon, A− îl poate neutraliza,
fiind convertit în HA în acest proces. Dacă se adaugă o bază, HA la fel poate
neutraliza, fiind convertit în A− în acest proces.
Capacitatea maximă de tamponare apare la un pH egal cu pKa, dar un cuplu
acid-bază conjugat poate servi totuși ca un tampon eficient când pH-ul unei soluții
se află aproximativ aprox in intervalul de ±1 unitati de pH a pKa. Cand cantitățile
de HA și A− sunt egale, pH-ul este egal cu pKa.
Comportamentul unui aminoacid simplu (alanina) la diferite pH-uri
Ne putem imagina un pahar ce contine o solutie apoasa de alanina (fig 10),
aflata mai intai la pH foarte acid (prin adaugarea unui acid tare cum ar fi acidul
clorhidric) si apoi, la pH din ce in ce mai bazic (prin adaugarea unei solutii bazice
de hidroxid de sodiu, picatura cu picatura). Aceasta tehnica se mai numeste titrare
iar pH-ul poate fi masurat si intregistrat permanent cu ajutorul unui dispozitiv numit
pH-metru.
Figura 10: Figura 11:
titrarea alaninei si masurarea pH-ului curba de titrare a alaninei
Când pH = pK: Când pH-ul este egal cu pK1 (2.3), cantități egale de forme I
și II ale alaninei există în soluție. Când pH-ul este egal cu pK2 (9.1), cantități egale
de forme II și III sunt prezente în soluție.
HA ← → H+ + A−
BH+ ← → B + H+