Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Pentru mult timp nichelul a fost singurul metal 3d pentru care rolul biologic nu a putut fi stabilit
definitiv. Motivele acestei scpri au fost variate: ionii de nichel nu au absorbii caracteristice n prezena
liganzilor fiziologici
importani, spectrele Mossbauer nu sunt accesibile izotopilor nichelului. Ni(I) cu
configiiratia d9 i Ni(III) cu configuraia d7 paramagnetici, nu pot fi detectai prin spectroscopia RPE datorit
lipsei scindrii hiperfine (abundenta natural a 61Ni cu I = 3/2 este de numai 1,25%. S-a artat ca nichelul
este adesea singurul metal component al unor enzime complexe care mai dein drept coenzime alte
substane anorganice. Centrii cu nichel au rmas nedetectabili mult timp datorit mascrii de catreclusterii
Fe-S. Aplicnd metode de detective mai sensibile cum ar fi spectroscopia de absorbie i de emisie
atomic (AAS i AES), msurtori magnetice (SQUID) sau spectroscopia RPE asupra izotopului 61Ni
mbogit s-au putut stabili caracteristicile ctorva enzime ce confin Ni din plante i microorganisme.
Nichelul, n mod particular, nu este un element rar n litosfera sau hidrosfera unde se gsete dizolvat c
Ni2+ iar n organisniele vii se gsete n cantiti mici, greu detectabile i dup prerea
specialitilor(Wolfgang Kaim i Brigitte Schwederski) neeseniale,nefiind raportat niciun simptom al carentei
nichelului(Ni2+ este un toxic,responsabil al alergiei la nichel).Totui chiar nichelul din otelurile inoxidabile a
fost mobilizt de anumite microorganisme pentru a i satisfice necesarul corespunztor enzimelor
eseniale.Dup prerea altor specialist,una din ipotezele disparitfei dinozauriJor i a altor creaturi de la
sfritul cretacicului ar fi "otrvirea cu niche care provenea din materiale rneteorice.
Trziu, n 1960, nichelul este considerat component necesar pentru creterea unor bacterii
anaerobe; n 1975 metalul a fost evideniat drept component al ureazelor din plante. n concordan cu
nivelul de cunoatere actual, nichelul este prezent n patru tipuri de enzime eseniale n stri de oxidare
diferite cu o coordinare caracteristic mediului.Ureazele conin Ni(II) penta sau hexacoordinat de liganzi cu
atomi de N sau O donori, hidrogenazele mai multor bacterii anaearobe conin nichel n principal coordinat
de liganzi cu sulf( bacteria Knallgeas , CO-dehidrogenaza utilizat n sinteza bacterial a acetil-coenzimei
A). Metil coenzima M reductaza bacterid metanogene, prezint un complex al nichelului cu inelul
tetrapirolic ca grupare prostetica denumit coenzima F430. Un alt complex tetrapirolic cu o funcfie
nespecificata, ar fi tuniclorinul care conine nichel, izolat din tunicate.
1. Glioxilaza I((EC4.4.1.5)(lactilglutationa liaza)) lactoylglutathione lyase
Glioxalaza I i Glioxalaza I catalizeaz conversia metilglioxalului,o specie toxic care
formeaz legturi covalente cu DN,la lactat(lactate).Singurul ion de nichel se afla ntr o
coordinatie octaedrica i se comport ca un acid Lewis.Acesta rmne n stare de oxidare 2+
n timpul reaciei de izomerizare,ceea ce include i utilizarea Zn la glioxilaza I n unele
organisme,incluziv al omului.Ionul de Ni2+ se leag hemoacetotiolic( binds the
hemithioacetal adduct) ntre metilglioxal i GSH,nlocuind un ligand de ap.Baza general a
catalizei duce la separarea unui proton din substrat(deprotonare),formnd un intermediar
coordinat enantiolat.Protonarea la C-2 iniiaz generarea de produi S-dlactilglutationati( promotes generation of the product S-d-lactoylglutathione),care sufer o
hidroliza la lactat i GSH ntr o reacie separat catalizata de Glioxilaza II.
Reacie:
glutationa+metilglioxal
Mecanism:
hemitioacetal (adduct)
(R)-S-lactilglutationa
HCOOH + metiltiopropionat + CO
ARD este un membru al clasei structurale a proteinelor cunoscute sub numele cupins, sau
"jellyrolls." Nucleul structurii cupin este un (5-helix format din dou antiparalele (i-fire). Dac
s-ar rsuci un ac de pr ntr-o spiral, s-ar obine topologia-pliere cupin.
Structura metaloenzimei dezvluie o coordinatie octaedrica cu centrul active
Ni(II),hexacoordinat de 3 liganzi de histidina,unul de acid aspartic i 2 liganzi de ap.Nichelul
nu sufer mudificari redox dar nici nu leag O2,n schimb substratul acireductonei(1,2dihidroxi-3-oxo-5-(metiltio)pent-1-en) reacioneaz direct cu O2 formnd speciile peroxidice
(B).Ni rmne pe tot parcurul reaciei n starea de oxidare +2.Ni acioneaz ca un acid Lewis
promovnd atacul intermediarului peroxola gruparea ligandului carbonil pentru a genera un
intermediary cyclic(D),care se descompune ulterior n CO,acid formic i acid carboxilic.
Mecanism:
3.Ni-Superoxid dismutaza
Irwin Fridovich and Joe McCord at Duke University au descoperit activitatea enzimatic a
SOD n 1968.
Ni-Superoxid dismutaza(EC 1.15.1.1) este o enzim care catalizeaz dismutatia(divizarea)
radicalului superoxid (O2-) ntr o molecule obinuit de oxigen(O2) sau peroxid de
oxigen(H2O2).Superoxidul este un produs secundar al metabolismului oxigenului i dac nu
este reglementat acesta cauzeaz deteriorarea multor tipuri de celule.Peroxidul de hidrogen
este de asemenea duntor,dar mai puin dect cel din urm i poate fi degradat de ctre
alte enzyme,cum ar fi catalaza.Astfel,SOD este un antioxidant de aprare important n
aproape toate celulele vii expuse la oxigen.
Descriere:
Superoxid dismutaza (SOD) este o enzim ce revitalizeaz celulele i reduce rata distrugerii
lor de ctre radicalii liberi. Neutralizeaz cei mai obinuii i poate cei mai periculoi radicali
liberi- radicalii superoxid. Radicalul superoxid produce deficitul de fluid sinovial, important
lubrifiant pentru ncheieturile corpului, ceea ce duce la frecare i n cele din urm la inflamaii.
SOD (Superoxid dismutaza) acioneaz sinergetic cu enzima catalaza, care se gsete din
abunden n organism. Catalaza transform hidrogenul peroxid din subprodusele sale
create de reacii SOD.
SOD ajuta la asimilarea zincului, cuprului i manganului. Nivelul tinde s scad odat cu
vrsta, ceea ce crete formarea de radicali liberi. Potenialul ca tratament antiimbatranire se
afla nc n studii de cercetare.
Din punct de vedere chimic, exist dou forme din aceast enzim. Forma cupru/zinc
(cunoscut Cu/Zn SOD) i exercita calitile de antioxidant n citoplasm celulelor. Acesta
este un fluid apos care nconjoar toate celalalte component celulare.
Forma mangan (Mn SOD)este activ n mitocondrii, stucturi din celule n care se produce
energia. Producerea energiei celulare duce la crearea radicalilor liberi i forma nichel(Ni
SOD).
Utilizri medicale
SOD (Superoxid dismutaza) este utilizat pentru a trata artrit, probleme de prostat, ulcere,
arsuri, boli inflamatorii, dar i intoxicaii de la expunerea la fum i radiaii, i pentru a preveni
efectele secundare ale medicamentelor mpotriva cancerului. Mai poate ajuta i la reducerea
ridurilor faciale, la cicatrizarea i vindecarea rnilor i arsurilor.
SOD face ca fiecare celul a corpului s fie mai rezistent mpotriva atacurilor radicalilor
liberi i a altor substane nocive. Puterea antioxidant a SOD o depete pe cea a celor mai
cunoscui antioxidani: flavonoide, carotenoide, vitamina A, C i E, mai mult, nici chiar
coenzima Q10, glutation peroxideaza i catalaza nu ating puterea acestuia. Cteva studii
legat de procesul de mbtrnire au remarcat faptul c animalele care produc cel mai mare
nivel de SOD au i cea mai mare durat de via.
Surse
SOD exista, n mod natural n: orz, broccoli, varza de Bruxelles, varza, germeni de gru i
multe alte plante verzi.
Administrarea suplimentelor de SOD
SOD este o molecul fragil ce este distrus uor n stomac, astfel tabletele trebuie s fie
comprimate filmate - adic acoperite cu o substan protectoare care ajuta tableta s treac
intact prin acidul din stomac pn n intestinal subire unde poate fi absorbit la ntreaga
potenta.
Reacii:
Ni
2
22+
+
3+
Ni -SOD + O + 2H Ni -SOD + H2O2.
Structura:
Studii anterioare relevau faptul c ureazele din plante au chiar o activitate insecticid.
Ureazele pot fi izolate din bacterii sau plante ,cum ar fi o specie de fasole i au o
istorie interesant.Ureaz din Canavalia ensiformis, contrar opiniei lui Richard Willstatter a fost
prima enzim obinut n stare cristalin pur. Totui dear 50 de ani mai trziu a fost
determinat coninutul de nichel al acestei enzime.Ureazele catalizeaz degradarea ureei la
dioxid de carbon i amoniac. Ureea este o molecul foarte stabil care n mod normal
hidrolizeaz foarte ncet obinndu-se acid izocianic i amoniac. Durata reaciei necatalizate
este de 3.6 ani la 38C.
H2N-CO-NH2 + H20
[H2N-COO" + NH4+]]
H2N-CO-NH2 + H20
2NH3 + CO2
Secvenele de aminoacizi ale diferitelor ureaze sunt cunoscute dar informaiile privind structurai
activitatea centrilor de nichel sunt puine. Haloenzima ureazei din fasole este format din ase uniti
identice, fiecare subunitate (91kDa) coninnd doi ioni de nichel n poziii apropiate i aparent diferii.
5.Hidrogenaze
Hidrogenazele sunt enzime care catalizeaz oxidarea
molecular cu implicarea n proces a doi electroni:
H2
reversibil a hidrogenului
2H+ (aq) + 2eAceast reacie joac un rol important n cursul fixrii dinitrogenului,
n fosforilarea microbiala sau fermentaia substanelor biologice la
La un numr mare de bacterii fotosintetic active i alge, s-a observant c activitatea unor
hidrogenaze depinde de un sens preferat al reaciei,astfel putem distinge hidrogenaza
unidirecional (H2 -2H+)
dintre enzimele bidirecionale reversibile. Majoritatea hidrogenazelor sunt de mrime medie
(40-100 kDa) i de regul au funciuni revesibile. Cu toate acestea, potenialele de transfer
electronic dintre clusterii Fe/S i componentele flavinice sunt adesea apropiate ca valoare de
potenialele proceselor ct izate preferenial ntr-o singur direcie, valoare inferioar celei
ce caracterizeaz mediile fiziologice. Obinerea hdrogenului molecular are loc doar n condiii
strict anaerobe n timp ce oxidarea hidrogenului are loc att n condiii aerobe ct i
anaerobe.
Cteva organisme printre care i Desulfovibrio gigas, pe lng hidrogenazele dizolvate n
citoplasm, mai conin
altele la marginea membranei care sunt implicate n reducerea CO 2,
NO3 ,O2 sau O42- n condiii anaerobe.
n acest caz, forma solubila catalizeaz reducera NAD + cu H2 iar electronii rezultai din
procesul de oxidare la nivelulul membranei a hidrogenului molecular sunt captai de caten
respiratorie i contribuie la formarea fosfailor cu legturi macroergice.
formats din dou subuniti de 28 kDa i 60 kDa. Pe lng ionul de nichel, hidrogenaza mai
conine un cluster stabil [3Fe-4S] i dou cluster [4Fe-4S] mai puin ntlnite, care particip
la transferul celor doi electroni.
HD + HDO
Viteza reaciei de descompunere fotochimic este mult micorata n ap deuterata (D20) ceea ce ne
ndreptete s presupunem c speciile fotolitice sunt sub form de hidruri ale Ni(I) sau Ni(II). Mecanismul
implica ruperea heterolitica a H2, ionul hidrura (H-) rmnnd pe ionul metalic, n timp ce componenta
protica (H+) se leag de un atom de sulf coordinat la metal, reacia producnd nc un centru bazic n
interiorul proteinei. Natura presupusei legturi dintre hidrogen i nichelul catalitic prezint un interes deosebit,
hidrurile de nichel fiind binecunoscute n chimia organo-metalica. A fost discutat i posibilitatea unei
coordinri "side-on".
Fe/Ni hidrogenazele prezint o competiie n realizarea legturii cu H2 i CO2 ; reaciile de scindare
fotochimic ale complexului carbonilic genereaz intermediari catalitici care au fost studiatf prin cinetic cu
schimb izotopic. Efectul izotopic de schimb H/D este mai pronunat n cazul complexului format de enzime
cu hidrogenul, ceea ce confirm ipotezele n legtur cu mecanismul de reacie.
figur este reprezentat ultima etap n producerea energiei sintetiznd CH 4 din CO2 de
ctre arheobacterii autotrofe, cum ar fi Metanobactenum termoautotroficum.
O consednta important a acestui fapt este modificarea strii de spin. Astfel Ni(II) S = 0 spin sczut sufer o
tranziie d9, facilitnd o alt orientare neaxiala a Ni(II) spin nalt cu S = 1. O configuraie d8 spin sczut (spinii
sunt mperecheai) rezult doar n urma unei distorsiuni a cmpului octaedric al liganzilor, degenerarea
orbitalului eg, care defavorizeaz mperecherea spinilor, joac n acest caz un rol important. Cum este de
ateptat, pentru speciile Ni(I) = d9, spectrul RPE al F430 reduse indic un orbital dx2-y2 semiocupat,
delocalizat peste atomii de azot din planul ecuatorial i un centru nucleofil putenic, dat de perechea de
electroni din orbitalul dz2.
Pentru o reacie de adiie oxidativ, ambele coordinri ale Ni(II) i Ni(I) spin sczut cu liganzii nesaturai, sunt
importante pentru activarea metil-derivatilor E - CH3. Totui, din cauza flexibilitii geometriei ligandului
macrociclic, parametrii legturilor sunt diferii: spin nalt Ni(II) - N = 210 pm, spin sczut Ni(II) - N =190 pm i
Ni(I) - N aproximativ 200 pm. La fel ca ali liganzi tetrapirolici, sistemul conjugat corfinic poate accepta un
electron mai ales atunci cnd prezint o grupare carbonil conjugat cu inelul ciclohexanonei.
Pentru reducerea complexului trebuie creat o ambivalent, n sensul reducerii alternative
a metalului sau ligandului; o ambivalent similar ntlnim i n Fe- porflirine. O alt
particularitate este prezena unei singure sarcini negative n interiorul macrociclului
hidrocorfinic care fixeaz metalul, contrar ligandului porfirinic care coordineaz dou specii
deprotonate.
Acetil-CoA rezultat (acid acetic activat) poate fi carboxilata de ctre bacterii anaerobe la
piruvat CH3C(O)COO. n bacteriile metanogene degradarea acidului acetic la C0 2 i CH4
decurge probabil cu obinerea ca intermediar a CO.
Este cunoscut c, CO dehidrogenazele din bacteriile a aerobe conin nichel n timp ce
speciile aerobe necesita molibdenopterine.
A fost studiat CO dehidrogenaza bacteriei acetogene Clostridium thermoaceticum care
este sensibil la prezena oxigenului. Ea este alctuit din 3x2 subuniti ( )3 de mrime 82
i 73 kDa. Nu este nc stabilit identitatea metalului coninut.S-au gsit cantiti mici de
nichel (un atom de Ni pentru fiecare unitate hexamera de protein) i cantiti mari de fier i
sulf (mai mult de 10 atomi / ( ) dimer) precum i diferite cantiti de zinc.
Datele privind structura centrului activ care conine Ni au fost obinute n cea mai mare
msur prin metoda RPE, spectroscopie Mossbauer i EXAFS. Datele RPE, S = 1/2 indica
interacia electronului cu trei sau mai muli atomi de fier, cu un atom de nichel i un atom de
carbon (pentru studiul scindrii hiperfine se folosesc izotopi mbogii: 61Ni, 57Fe i13CO).
Datele EXAFS sugereaz pentru nichel coordinarea a patru liganzi cu S aflai la o distan
de aproximativ 216 pm
Conform spectroscopiei Mossbauer distant Ni-Fe este estimate la 325 pm i indic
interacrtia nichelului cu un cluster Fe/S.
Studii, recente structureaz enzima n patru subuniti: un cluster A ce cuprinde atomi de
Ni,i uniti Fe-S active n sinteza acetil coenzimei A ; un cluster C care reprezint partea
activa n oxidarea CO; un cluster [Fe 4S4] 2+/1+ i o component feroas.
Enzima cu structura cuaternara de tipul
sufer o descompunere ntr-o unitate metalic alfa i una 1 2 care prezint activitate
oxidant asupra CO.
Subunitatea metalic alfa conine un atom de nichel i patru atomi de fier. Ni este
coordinat la liganzi ce conin doi atomi de sulf i doi atomi de oxigen sau azot, geometria
nichelului fiind de plan-patrat deformat, iar Fe este dispus ntr-un cluster [Fe 4S4]2+/1+ care n
stare redus are S=3/2.
n experimentele de laborator carbonilarea CO dehidrogenazei s-a dovedit a fi reversibila,
schema mecanismului de reactfe putnd explica rezultatul coordinrii reversibile a CO la Ni.
Co1+-C/Fe-SP + CH3-Ni-CODH.
De vreme ce produsul este Co1+,reacia trebuie s implice o deplasare nucleofil ntre gruparea CH3-Co 3+
i Ni1+ pentru a forma CH3-Ni 3+ care apoi poate accepta un electron pentru a forma o specie mai stabil
CH3- Ni 2+ .
Compus model al Ni(III) cu Gly-Gly-Gly3Printre compuii de coordinate cu Ni(III) stabili sunt i compuii cu peptidele deprotonate de
dimensiuni mici. Centrul Ni(III) n complexul din figura este localizat n planul format de
tripeptida n timp ce pozitfile axiale sunt ocupate de molecule de ap slab coordinate.
Asemenea compui pot fi uor preparai prin oxidarea electrochimic a compuilor cu Ni(II)
corespunztori. Ca i tiolatii, peptidele deprotonate la azot (carboxiamidele) sunt putenic
donoare att ct i i sunt capabile sastabilizeze strile nalte de oxidare ale metalului.
Pentru trecerea NiII/III complexul prezentat are un potenial redox relativ mare, scderea
semnificativ a acestei valori ntlnindu-se n hidrogenaze i alte enzime cu nichel,fiind
datorat probabil multitudinii de liganzi cisteinici.
Modelarea Ni-hidrogenazelor
Dup cum s-a artat, hidrogenazele catalizeaz oxidarea reversibil a moleculei de hidrogen
permind celulelor s genereze sau s elibereze n timpul respiraiei echivaleni de
reducitori:
H2
2H++2ePublicarea recent a unui studiu de analiza cu raze X asupra structurii cristaline a centrului
activ din enzim, deschide noi perspective n elucidarea i modelarea hidrogenazei din
Desulfovibrio gigas.
Tipuri de liganzi tridentati [ONS]2Aceti compui sunt diferii n ceea ce privete structur, reactivitatea i mecanismul lor
de aciune. n prezenfa solventului s-a pus n evident un dimer cu oxigen sau sulf, numrul
de coordinare formal fiind 3. n solveni care nu coordineaz la Ni s-au obinut oligomeri
superiori care sunt n echilibru cu dimerii. Pentru diferii liganzi L avem:
monomeri plani tip aduct 1:1 pentru L = baze cu azot, fosfine;
dimeri pentacoordinati aduct 1:1 pentru L = piridina;
tetrameri octaedrici aduct 1:1 pentru L = MeOH iar X = O;
monomeri octaedrici aduct 1:3 pentru L=piridina.
n funcie de natura atomilor donori i substituenii ligandului tridental chelatant.
Echilibrele de substitute a ligandului care pot fi examinate spectrofotometric, indica clar c
compuii, coordinativi ce conin X = S i/sau R = 1,2 fenilen sunt mai moi dect cei cu X = O
i/sau R = etilen. Activitatea catalitic a acestor compui a fost testat pe reacia de alcooliza
a trietilsilanilor:
Et3i-H + HO-R
H2 + Et3i-OR