C.

Csunderlik__

Amino-acizi, Peptide i Proteine __________________1

AMINO-ACIZI NATURALI

Definiie, clasificare, nomenclatur

Amino-acizii sunt compui organici cu funcie mixt, care conin una sau mai multe
grupe funcionale amino- i carboxil n aceeai molecul.
n funcie de tipul radicalilor de hidrocarbur i de poziia reciproc a celor dou grupe
funcionale, amino-acizii se clasific n mai multe tipuri:
- amino-acizi mono-amino i mono-carboxilici cu caten alifatic liniar sau
ramificat, cu grupele COOH i NH2 n poziii 1,2 (), 1,3 (), 1,4 ():

- amino-acizi diamino-monocarboxilici i monoamino-dicarboxilici sau aminoacizi cu caten ciclic, nesaturat, aromatic sau heterociclic:

- derivai funcionali ai amino-acizilor:

Amino-acizii care se gsesc n organismele vii sunt amino-acizii naturali. Cei mai
importani sunt cei care se gsesc n peptide i proteine, principalii compui
macromoleculari care alctuiesc organismele vii. Din acest punct de vedere amino-acizii
naturali se clasific n:
- amino-acizi proteici (sau proteinogeni) care se gsesc n peptide sau proteine;
- amino-acizi neproteici coninui n ali compui naturali;
n peptide sau proteine s-au identificat un numr de aproximativ 23 de amino-acizi (n
funcie de originea lor); dar, amino-acizi proteinogeni sunt considerai doar 20, i anume
cei care sunt codificai n moleculele de acizi nucleici sub forma codului genetic (vezi:
acizii nucleici). Cei 20 de amino-acizi proteinogeni sunt toi -amino-acizi i cu o
configuraie S (sau L dup convenia Fiscer-Rosanoff) a atomului de carbon asimetric din

C. Csunderlik__

Amino-acizi, Peptide i Proteine __________________2

poziia 2. Structura general i configuraia celor 19 amino-acizi proteinogeni, care sunt

chirali, este urmtoarea:

n funcie de natura grupei R cei 20 de amino-acizi proteinogeni se clasific astfel:

- amino-acizi n care R este un radical de hidrocarbur:

acizi mono-amino dicarboxilici i amidele lor:

acizi diamino-monocarboxilici (sau derivai funcionali):

C. Csunderlik__

Amino-acizi, Peptide i Proteine __________________3

- amino-acizi n care R este o grup funcional cu oxigen sau sulf:

- amino-acizi n care R este un radical heterociclic:

Pe lng aceti 20 de -amino-acizi proteinogeni care sunt codificai n acizii nucleici, n

peptide sau proteine se mai gsesc i ali amino-acizi proteici care apar ns numai ca
urmare a unor transformri biochimice ale amino-acizilor proteinogeni din
macromoleculele de peptide sau proteine. Astfel, prin hidroliza acid sau enzimatic a
unor proteine se obin, n amestecul de amino-acizi rezultai i ali amino-acizi care nu
sunt codificai n acizii nucleici:

Hidroxiprolina i hidroxilizina provin din oxidarea metabolic a prolinei i lizinei din

macromoleculele de proteine, iar ornitina rezult prin hidroliza gruprii guaninice din
arginin.
n organismele vii, mai ales n plante sau microorganisme se gsesc muli ali amino-acizi
care nu sunt proteici. Au fost identificai astfel aproape 400 de molecule de amino-acizi
naturali care apar n diverse organisme vii, fie compui naturali secundari, fie produi
intermediari n diverse procese metabolice.
Aa cum s-a artat mai sus, amino-acizii proteinogeni au ntotdeauna o configuraie S sau
L la atomul de carbon asimetric. Cu toate acestea exist proteine, care apar mai ales n
membranele pereilor celulelor unor bacterii sau fungii, care sunt alctuite din
macromolecule de proteine, n care amino-acizii proteinogeni au configuraia R sau D.
Astfel de proteine sunt mult mai rezitente la degradarea hidrolitic sau oxidativ
catalizat de enzimele obinuite care sunt peptide sau proteine alctuite din enantiomerii

C. Csunderlik__

Amino-acizi, Peptide i Proteine __________________4

naturali S sau L grupei aminice. Amino-acizi neproteici i cu configuraie R sau D sunt i

componente ale unor compui naturali produi de fungii ca mijloace de aprare mpotriva
bacteriilor i care sunt cunoscute ca antibiotice.
Nomenclatura amino-acizilor naturali se face conform regulilor IUPAC, fiind
considerai derivai substituii ai acizilor carboxilici. Poziia grupei aminice se stabilete
numerotnd catena, grupa carboxil avnd ntotdeauna poziia 1. Se pot folosi i literele
greceti: ,,,....n ordine pentru a indica atomii de carbon vecini cu grupa carboxil:
acid 2-amino-propionic sau acid -amino-propionic;
acid ,-diamino-hexanoic sau acid ,-diamino-capronic;
acid 2-amino-1,4-etandicarboxilic sau acid -aminosuccinic
Cele mai folosite sunt ns denumirile tradiionale sau empirice:
-alanina; lizina; acidul asparagic (acidul aspartic), etc.
Aceste denumiri sunt prezentate n lista amino-acizilor proteinogeni de mai sus. n
biochimie se folosesc exclusiv aceste denumiri. Pe de alt parte, pentru descrierea
structurii primare a peptidelor i proteinelor (care sunt produii macromoleculari obinui
prin policondensarea amino-acizilor proteinogeni) se folosesc formule n care aminoacizii sunt codificai prin simboluri formate din trei litere (de obicei primele trei litere din
denumirea tradiional n limba englez). Aceste codificri sunt prezentate de asemenea
n lista de mai sus:
Ala (mai exact -Ala); Lys; Asp, etc.
Pentru ca s fie posibil, din astfel de codificri, reprezentarea structurilor primare a
peptidelor sau proteinelor este necesar s fie respectat convenia conform creia
structura -amino-acidului codificat n acest fel este reprezentat ntotdeauna cu
grupa aminic (-NH2) n partea stng i grupa carboxil (-COOH) n partea
dreapt. Astfel, structura unei tripeptide format din -alanin, glicocol i serin cu
urmtoarea structur primar:

poate fi scris codificat astfel: Ala-Gly-Ser.

Metode de obinere
Organismele vii obin amino-acizii necesari pentru sinteza peptidelor i proteinelor prin
reacii biochimice care au loc prin cataliz enzimatic. Pe de alt parte, muli amino-acizi
sunt obinui i prin sinteze chimice obinuite.
Numai plantele i microorganismele pot sintetiza toi amino-acizii necesari pentru sinteza
peptidelor i proteinelor. Animalele (mamiferele mai ales) i oamenii nu pot sintetiza prin
biosintez anumii amino-acizi care le sunt necesari (amino-acizi eseniali) i pe care i
pot obine doar din hran prin hidroliza proteinelor coninute n aceasta. Astfel sunt
considerai amino-acizi eseniali, care trebuie s fie prezeni n hran animalelor i
oamenilor: valina, leucina, izoleucina, treonina, metionina, lizina, fenilalanina i
triptofanul; pentru unele insecte i peti mai sunt necesari i arginina i histidina.
Hidroliza enzimatic a proteinelor din hran este principala surs de amino-acizi
pentru animale i oameni. Enzimele care catalizeaz hidroliza sunt enzimele proteolitice

C. Csunderlik__

Amino-acizi, Peptide i Proteine __________________5

(peptidaze) care scindeaz legtura peptidic (CO NH) din peptide i proteine. Astfel
prin hidroliza enzimatic a peptidelor i proteinelor se obin prin intermediul unor
dipeptide, tripeptide,. n final amino-acizii necesari pentru sinteza peptidelor i
proteinelor proprii:

Hidroliza poate fi efectuat i chimic n prezena unor acizi minerali tari. Astfel se pot
obine anumii amino-acizi prin hidroliza unor proteine care i conin n cantiti mai mari
(de exemplu cisteina din pr, unghii sau copite sau prolina i hidroxiprolina din cartilagii
sau oase).
Sinteza biochimic a amino-acizilor care are loc n plante sau microorganisme se face
pornind de la diveri compui naturali secundari care apar fie ca produi finali fie ca
intermediari n metabolism. Astfel, alanina, acizii glutamici i aspartic se obin din cetocarboxilici (-ceto-acizi) prin reacii de transaminare i reducere. Acizii cetocarboxilici corespunztori catenei de atomi de carbon din amino-acizii sintetizai
astfel (acidul oxalacetic, -oxoglutaric, acidul -oxosuccinic, acidul fumaric) apar ca
intermediari n ciclul acidului citric al degradrii oxidative a monozaharidelor:

Acest tip de biosintez are loc i n cazul amino-acizilor cu radicali de hidrocarbur

ramificai (valina, leucina, izoleucina), n acest caz avnd loc i o migrare a grupelor
alchil.
O serie de amino-acizi sunt obinui prin biosintez de la acidul aspartic i mai ales de la
acidul glutamic prin reacii de reducere, ciclizare, transaminare. Astfel rezult din acidul
glutamic prolina sau arginina.
Amino-acizii aromatici (fenilalanina, tirozina, triptofanul) sunt sintetizai n plante
pornind de la un intermediar, acidul shikimic, care este sintetizat din glucoz. Acidul
shikimic este important n trnsformrile biochimice din plante sau microorgnisme, el
fiind precursorul multor compui naturali secundari care sunt sintetizate de acestea.
Fenilalanina i tirozina sunt sintetizate prin transformarea acidului shikimic n acidul
fenil-piruvic care prin transaminare, dehidroxilare, reducere enzimatic se transform n
fenil alanin sau tirozin:

Sinteza biochimic a histidinei pornete de bazele heterociclice din acizii nucleici care
conin un nucleu purinic (adenozin-monofosfat).

C. Csunderlik__

Amino-acizi, Peptide i Proteine __________________6

Sinteza chimic a amino-acizilor.

Amino-acizii naturali sunt obinui n prezent la scar industrial. Ei sunt necesari fie
adausuri la hrana animalelor (metionina i lizina), fie ca produse farmaceutice mai ales n
perfuzii dar i n unele medicamente sau aditivi alimentari (glutamatul de sodiu). Pe lng
obinerea unor amino-acizi prin izolarea lor din hidrolizatele proteinelor (cisteina,
tirozina, acidul glutamic, hidroxiprolina) se folosesc i metode chimice sau biochimice
de sintez la scar industrial.
Metodele biochimice folosesc de obicei microorganisme (fungii sau bacterii) selectate
sau obinute prin inginerie genetic care produc prin procese fermentative preponderent
anumii amino-acizi. Astfel se obin n prezent metionina, fenilalanina sau acidul aspartic.
Metodele chimice de sintez se bazeaz pe reaciile chimice prin care se pot introduce n
molecul grupe aminice sau carboxilice n poziia , aa cu sunt majoritate aminoacizilor naturali.
Introducere a grupei aminice n acizi carboxilici sau derivai funcionali:
Din acizi -halogenai prin reacia de substituie cu amoniac sau mai bine cu ftalimida
potasic (sinteza Gabriel); acizii -halogenai se obin uor prin tratarea acizilor
carboxilici cu clor sau brom n prezen de fosfor rou:

Din esteri ai acidului malonic sau derivai ai acestuia:

Esterul malonic sodat poate fi alchilat cu derivai halogenai, halogenat i apoi prin
reacia cu amoniacul sau cu ftalimida potasic se introduce grupa aminic n poziia .
Hidroliza bazic a produsului odat cu decarboxilarea duce la un -aminoacid:

Din compui carbonilici prin adiia HCN (sinteza Strecker):

Aldehidele i cetonele adiioneaz acid cianhidric formnd cianhidrine (nitrili ai hidroxiacizilor). Prin hidroliza n prezena amoniacului se transform n -amino-acizi:

C. Csunderlik__

Amino-acizi, Peptide i Proteine __________________7

Prin aceast metod se obine industrial acidul glutamic pornind de la acrilonitril. In

prima etap se face o hidroformilare la aldhehida corespunztoare din care printr-o
sintez Strecker se obine acidul gutamic racemic:

Din azlactone printr-o variant a reaciei Perkin (sinteza Erlenmeyer):

Azlactonele se obine din glicocol prin acetilarea grupeei aminice i ciclizarea n prezen
de anhidrid acetic. Avnd o grup metilen activ, azlactonele se condenseaz uor cu
compuii carbonilici formnd produi de condensare de tip crotonic. Acetia prin
reducere cu acid iodhiric i hidroliz se transform n -amino-acizi:

n toate sintezele chimice se obin amino-acizii racemici (amestec echimolecular din cei
doi enantiomeri R/S (sau D/L). Cum n cele mai multe cazuri amino-acizii naturali sunt
enantiomerii cu configuraie S (sau L) pentru asimilarea lor de catre organismele vii etste
necesar separarea din amestecul racemic al enantiomerului activ (S). Metodele de
separare folosite sunt fie chimice fie biochimice i sunt aplicate frecvent n aceste sinteze.
Proprieti fizice
Amino-acizii sunt substane solide, cristaline cu punct de topire ridicat (peste 2000C, de
obicei cu descompunere) solubile n ap i puin solubile n solveni organici. Punctul de
topire ridicat i solubilitatea n ap se datoreaz structurii lor amfionice; avnd o grup cu
caracter acid (carboxil) i o grup cu caracter bazic are loc, n soluie, un echilibru acidobazic n care protonul grupei carboxil este transferat la grupa aminic formnd amfionul:

n soluie apoas exist n echilibru forma amfionic i forma neionizat.

Proprieti chimice
Reaciile amino-acizilor naturali sunt determinate de prezena celor dou grupe
funcionale n molecul. Fiecare dintre ele d reaciile caracteristice, dar exist i reacii
determinate de prezena ambelor grupe care sunt n poziia .
Caracterul acido-bazic:
Grupa aminic are caracter slab bazic iar grupa carboxil are caracter slab acid. De aceea
prin neutralizarea lor reciproc, se formeaz amfionul care face ca soluiile apoase s fie
preactic neutre (n cazul acizilor mono-amino mono-carboxilici). innd cont de ionii
care se gsesc n soluie (amfionul, anionul i cationul) sunt posibile urmtoarele
echilibre proteolitice:

C. Csunderlik__

Amino-acizi, Peptide i Proteine __________________8

Constantele de aciditate (K1 i K2) ale celor doi acizi (grupa -COOH i -NH3+) sunt
urmtoarele:

Fcnd produsul lor i considernd condiiile n care concentraiile anionului i cationului

sunt egale (unde concentraia amfionului este maxim i solubilitatea este minim):
Logaritmnd expresia oinut (de fapt log) se obine valoarea pH-ului soluiei apoase de
amino-acid, n absena unui alt acid sau alte baze; acesta este pH-ul izoelectric pHi:
Pentru acizii mono-amino monocarboxilici pH-ul izoelectric este n jur de 6, n timp ce
pentru acizii mono-amino dicarboxilici este n mediu acid n timp ce pentru acizii
diamino-monocarboxilici pH-ul este n domeniul bazic:
Gly:
pHi = 6,06
Glu:
pHi = 3,20
Gln:
pHi = 5,65
Lys:
pHi = 9,74
La adugarea unui acid sau a unei baze la soluia n ap a unui amino-acid, amfionul
reacioneaz neutraliznd acidul sau baza astfel nct pH-ul soluiei rmne practic
constant. Din acest motiv soluiile apoase ale amino-acizilor sunt soluii tampon:

Pe proprietile amfionice ale amino-acizilor se bazeaz separarea i analiza lor pe

coloane cromatografice cu schimbtori de ion ca i separarea prin electroforez.
Reaciile grupei aminice:
Grupa aminic poate fi alchilat sau acilat cu derivai halogenai respectiv cu cloruri sau
anhidride acide:
Cu halogenuri de alchil are loc alchilarea n mediu bazic cu formarea N-alchil aminoacizilor. Acesttia si pstreaz caracterul bazic, formnd de asemenea amfioni. Prin

C. Csunderlik__

Amino-acizi, Peptide i Proteine __________________9

alchilarea total se obinn derivai cuaternari de amoniu ca sruri interne. Atunci cnd
grupa alchil este metil acestea se numesc betaine:

Acilarea cu cloruri acide sau anhidride duce la formarea N-acil amino-acizilor care sunt
amide:

N-acil amino-acizii au o legtur amidic (-CO NH) care este similar cu legtura
peptidic din peptide i proteine. Deoarece, acilarea se folosete la protejarea grupei
aminice n sinteza peptidelor, dup realizarea legturii dintre dintre cei doi amino-acizi
este necesar deprotejarea prin hidroliza grupei amidice. Prin hidroliza acestei grupe
este ns posibil i hidroliza legturii peptidice. De aceea protejarea prin acilare se face
prin utilizarea unor ageni de acilare care nu formeaz legturi amidice. Astfel de ageni
de protejare sunt clorurile acidului carbonic, cloroformiaii care formeaz cu grupa
aminic din amino-acizi, carbamai:

Cei mai des folosii cloroformiai pentru N-protejarea amino-acizilor sunt cloroformiatul
de ter-butil i cloroformiatul de benzil:

Pe lng acetia se folosesc n prezent i muli ali ageni de protejare, majoritatea fiind
derivai funcionali ai acidului carbonic. Deprotejarea grupei aminice din peptide, prin
eliminarea acestor grupe se face relativ uor (prin hidroliz selectiv sau hidrogenare) i
nu afecteaz legturile peptidice.
Alte reacii ale grupei aminice
Prin tratare cu acid azotos, obinut din NaNO2 n prezena unui acid mineral tare, grupa
aminic se transform ntr-o grup hidroxil prin intermediul srurilor de diazoniu alifatice
instabile:

n reacii biochimice este posibil sub aciunea enzimelor de dezaminare i eliminarea

grupei aminice sub form de amoniac (dezaminarea) cu formarea acizilor carboxilici
corespunztori amino-acizilor naturali.

C. Csunderlik__

Amino-acizi, Peptide i Proteine __________________10

Grupa aminic reacioneaz cu aldehidele sau cetonele formnd baze Schiff. n

organismele vii reacia este important penttru diverse procese metabolice i are loc cu o
coenzim, care este vitamina B6 (piridoxalul, de fapt produsul de oxidare al piridoxinei
care este vitamina B6 propriu zis:

Reacia cu ninhidrina: este o reacie de identificare i determinare cantitativ a grupei

aminice din amino-acizi, peptide i proteine. Ninhidrina este o 1,2,3-triceton care
oxideaz grupele aminice pn la amoniac, acesta formnd apoi un colorant albastruviolat care poate fi dozat fotometric:

Reaciile grupei carboxil

Grupa carboxil d reacii de esterificare cu alcooli sau fenoli. Esterificarea direct cu
alcooli este un echilibru i decurge greu. Mai uor se obine esterii prin reacia cu grupa
carboxil activat, prin transformare n cloruri acide sau n ali derivai reactivi.
Prin reacia cu pentahalogenurile de fosfor (PX5), clorura de tionil (SOCl2) sau alte
cloruri ale unor acizi anorganici oxigenai, se formeaz halogenurile de acilale aminoacizilor.Acestea reacioneaz apoi uor cu alcoolii sau fenolii formnd esteri ai aminoacizilor:

Esterii amino-acizilor nu mai pot forma amfioni, de aceea sunt substane puin polare cu
puncte de topire i de fierbere mai sczute. Pot fi purificai prin distilare n vid. Esterii
metilici ai amino-acizilor pot fi obinui uor prin reacia amino-acizilor cu metanol i
clorura de tionil i apoi purificai prin distilare. Produii secundari (HCl i SO2) sunt
gazoi i se elimin uor prin nclzire:

C. Csunderlik__

Amino-acizi, Peptide i Proteine __________________11

Activarea grupei carboxil pentru formarea de esteri sau amide (peptide n reacia cu ali
amino-acizi, n sinteza peptidelor) se poate face i cu derivai funcionali reactivi ai
acidului carbonic. Cei mai des folosii sunt diimidele acidului carbonic carbodiimidele.
Carbodiimidele formeaz cu grupa caroxil intermediari reactivi care reacioneaz cu
grupe nucleofile (-OH sau NH2) formnd esteri sau amide i uree disubstituite:

Reaciile grupei aminice i ale grupei carboxil:

Prin reacia de eliminare de ap (condensare) dintre grupa aminic i grupa carboxil se
formeaz amide:

n cazul -amino-acizilor condensarea are loc intermolecular, ntre dou molecule de

amino-acid; prin eliminarea a dou molecule de ap se formeaz o diamid ciclic cu 6
atomi n ciclu (dicetopiperazina). Reacia are loc la nclzirea amino-acizilor pn la
punctul de topire.

Formarea dicetopiperazinelor ciclice este unul din motivele pentru care peptidele nu pot
fi obinute direct prin condensarea -amino-acizilor: