Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
2011
Clasificarea proteinelor
Structura proteinelor
Structura primar
Proteine cu structura secundar
Keratina; Colagenul; Elastina
Structura teriar
Structura cuaternar
Hem
Proteine
Compui macromoleculari
Proteine fibrilare
insolubile n ap
extracelulare, cu roluri de susinere: collagen, cheratin, miozin,
elastin.
Clasificarea proteinelor dup rol
transport:
Organizare structural:
-structura primar;
-secundar;
-teriar;
-cuaternar
Aminoacid
a).Structura
primar
Legtur
peptidic
b).Structur
secundar
-foaie pliat
-helix
Legturi de hidrogen
c).Structura Lasou
tertiar
d).Structura
cuaternar
Structura primar a proteinelor sau structura
covalent
-tipul;
-cantitatea;
O R2 H O
H3N+ CH C N CH C N CH C
R1 H O R3
F. Sanger 1953 structura insulinei
Secvena aa din proteine este determinat
genetic
a. patologia molecular
Val
b.determinarea structurii tridimensionale
Structura tridimensional a moleculelor
proteice
O R2 H O
+
H3N CH C N CH C N CH C
R1 H O R3
Care este conformaia cea mai stabil ?
-elicea i
structura
Structura -helix
C
O
lanul din L-aa se rsucete n jurul
C
unui ax, la nivelul legturilor simple; C
O
HO
C
N
gruprile CO- i NH- O C N
HO
devin adiacente stereochimic H N C
C
i formez puni de hidrogen. O
O
N H
N
HH
NN
NN
Caracteristicile helixului
elice dreapt;
R
R
0.54 nm
3,6 aminoacizi R
per tur
R
R
Catena polipeptidic
Structura se afl la proteinele fibrilare i globulare
N N
R O H R O H R O
R H O R H O R H
N N N
N N
O R H O R H O
Structur cu lanuri paralele
H R O H R O H
N N N
N N
R O H R O H R O
H R O H R O H
N N N
N N
R O H R O H R O
Structura ac de pr sau -turn
prolina i glicina sunt aminoacizii cei mai rspndii n
cadrul acestei structuri
H2 N
HOOC
Structura este n proporie de ~100% n
fibroina din mtase;
Structura secundar
dimer protofilament protofibrile microfibrile
macrofibrile
a) Dimer b) Protofilament c)Microfibril
Capete
N-terminale
~450 A
Capete
Protofibril
C-terminale
Proprietile keratinelor
Keratinele pot fi:
- cu coninut ridicat n sulf hard;
- cu coninut sczut n sulf soft
glicina (33%)
prolina (10%)
hidroxiprolina i hidroxilizina doi aminoacizi atipici (proporie mic)
nu conine cistein
Modificri
post-translationale n RER si aparatul Golgi
din fibroblaste
Formare triplu-helix
(procolagen)
Asamblarea moleculelor de
tropocolagen n microfibrile
NH CH CO NH CH CO
Lizil-hidroxilaza
(CH 2 )2 + -cetoglutarat (CH 2 )2 + succinat
CH 2 Vitamina C HC OH
CH 2 O2 CO2 CH 2
NH 2 NH 2
rest de lizin rest de 5-hidroxilizin
NH O2 NH3+H2O NH O=HC NH
2+
Cu
HC (CH2) 3 CH 2 NH 2 HC (CH2) 3 CH=O + CH 2 (CH2) 2 CH
lizin-oxidaza
CO rest de lizin CO rest de alizin CO
rest de alizin
condensare cu un rest de lizin
condensare crotonic
-HOH -HOH
NH NH NH CH=O NH
HC (CH2) 3 CH N (CH2) 4 CH HC (CH2) 3 CH C (CH2) 2 CH
CO CO CO produs de condensare CO
baz Schiff ntre dou resturi de
alizin
NH NH
HC (CH2) 3 CH 2 NH (CH2) 4 CH
CO lizinonorleucin CO
(cross-linkare)
Peptidul pro-
-cetoglutarat O2
Hidroxilarea prolinei si lizinei
succinat CO2
OH
RER
OH OH
Glicozilarea hidroxilizinei
OH
Intracelular
OH OH
OH Asocierea celor 3 lanturi pro-
S S
OH OH S
S
S
S S
S
OH OH
Glicozilare suplimentar
OH
S S Complex
S OH OH S
S Golgi
S S
S OH OH
TTTropocolagen Extracelular
Asocierea moleculelor de tropocolagen
Fibrila de colagen
Cross-linkare intra-
si intermolecular
Fibra de colagen
Secventa de
aminoacizi - Gly - X - Y - Gly - X - Y -Gly - X - Y -
-helix
Triplu helix
Tropocolagen
Fibrila de colagen
Fibra de colagen
microfibrilele sunt stabilizate prin legturi
covalente ncruciate la care particip resturile
de Lys i His
nu conine:
unitatea repetitiv (Gly-X-Y)-
triplul helix
carbohidrai
Este o singur varietate genetic de elastin;
extrem de stabile
cu un turnover lent
comprimare relaxare
au rol:
n interaciile dintre celule i membranele bazale sau
n embriogenez
n hemostaz
Fibronectinele stabilesc legturi cu alte proteine
conectnd:
proteine extracelulare (colagen, laminin)
mucopolizaharide (proteoglicani)
b).Structur
secundar
-foaie pliat
-helix
Legturi de hidrogen
c).Structura Lasou
tertiar
d).Structura
cuaternar
Tipuri de legturi necovalente dintre radicalii R
ai aa
Legturi ionice
- ntre radicalii cu sarcin negativ (din Asp, Glu)
-radicalii cu sarcin pozitiv ( din Lys i Arg):
NH NH
- +
CH CH2 COO H3N (CH2) 4 CH
CO CO
Aspartil Lizil
Puni de hidrogen
ntre radicalii cu grupri:
-alcoolice (din Ser, Thr)
-fenolice (din Tyr)
-amidice (din Gln i Asn):
NH H NH
CH CH2 OH O CH2 CH
CO CO
Seril Seril
Interaciuni hidrofobe
NH H3 C NH
CH CH3 CH CH
CO H3 C CO
Alanil Valil
Legturi disulfurice
ntre resturi de Cys
NH NH
CH CH 2 S S CH 2 CH
CO CO
Cisteinil Cisteinil
Etape n mpturirea proteinei
Localizarea radicalilor n structura tridimensional a
proteinelor n funcie de polaritatea lor
+
Proteina Masa proteinei Numr Masa protomerilor
Kdaltoni protomeri Kdaltoni
Creatin kinaza 80 2 40
Hemoglobina 64,5 4 16
Ceruloplasmina 151 8 18
scrapie in sheep i
Denaturare proteine
Curs 4 26.10.2011
Hemoproteine
Mioglobina
Hemoglobina; citocromii
Proteine plasmatice
serumalbumine
Imunoglobuline
HC CH
M N M
H
N N
H
P N V
HC CH
P M
Protoporfirin IX
Protoporfirina leag coordinativ un ion de Fe2+
formnd hemul
Mb + O2 MbO2
His proximal
N N
2+
Fe
N N
CO2 O2
Plmn
PO2=100mm Hg
PO2=20 mm Hg
Muschi CO2 Mioglobin + O2
Mitocondria
Curba de oxigenare a Mb
100 Arc de hiperbol
Saturare cu O2 (%)
80 Mb
60
40
20
20 40 60 80 100 120
Presiunea O2 (mm Hg)
P50 pentru Mb = 1 torr
Hemoglobina
protein intracelular (eritrocite)
Tetrameric (are structur cuaternar)
d culoarea sngelui
Hem
Locul de legare a
2,3-bisfosfogliceratului
Specii moleculare de Hb
Hb A1 =
Hb A2 = d
Hb F = g
Hb E = e
Rolul fiziologic al Hb
Hb transport
O2 de la plmn la esuturi
cooperativitate
O2 O2 O2
O2
Hb HbO2 Hb(O2)2 Hb(O2)3 Hb(O2)4
Curba de oxigenare a Hb este o sigmoid
Valoarea P50 pentru Hb
este de 26 mm Hg
Mioglobin Hemoglobin (pH=7,4)
100
Saturare cu O2 (%)
80 Tesut
Plmn
60
40
20 P50 (Hb)
20 40 60 80 100 120
Legarea O2 la Hb Presiunea O2 (mm Hg)
Asp His
NH3 + COO-
94 146
CH CH
H2C H2C O
2+ 2+
N Fe N Fe O
C C
CH O2 CH
Histidina proximal
(F 8)
Forma T Helix F
Leu
Leu Val
Forma R
Histidina proximal (F 8)
Fe
Planul protoporfirinei
O2
Factori care influeneaz eliberarea
O2 de pe Hb:
-temperatura
-pH-ul
-presiunea CO2
-2,3-bisfosfogliceratul
Transportul CO2 i efectul Bohr
efect Bohr
80
pH=7,4
60
pH=7,2
40
20
20 40 60 80 100 120
Presiunea O2 (mm Hg)
de carbamai
gruprile NH2 ale aa terminali din lanurile Hb i a altor proteine,
leag CO2
- +
R NH2 + CO2 R NH COO + H
ion carbamat
85% din CO2 este transportat n form de ion bicarbonat
la plmn:
anhidraza carbonic
CO2 + H2O H 2CO3
+ -
H2CO3 H + HCO3
Plmn Snge Muschi
Respiratie
Expirare
AC AC
CO2+H2O CO2 HCO3- +H+ HCO3- +H+ CO2 CO2+H2O
H2O H2O
MbO2
Inspirare Hb HbH+ HbH+ Hb
O2 O2
O2
Mb
pO2=100 tori HbO2 HbO2
pO2=20 tori
Bisfosfogliceratul se leag la deoxi-Hb
H
D-2,3-bisfosfoglicerat
Structura hemoglobinei
protein oligomer
a) b)
Hem
Locul de legare a
2,3-bisfosfogliceratului
His 143
Lys
82 His 2
G
P
NH3+
B
NH3+
Lys 82
His 2
His 143
Curba de oxigenare a hemoglobinei n absena 2,3-
bisfosfogliceratului
Fr 2,3-BPG
100
Saturare cu O2 (%)
80
Cu 2,3-BPG
60
40
20
20 40 60 80 100 120
Presiunea O2 (mm Hg)
lanurile peptidice g din Hb F nu leag 2,3-bisfosfogliceratul
Hematii de la ft
80
60 Hematii de la mam
40
O2 trece de la oxihemoglobina
20 matern la deoxihemoglobina
fetal
20 40 60 80 100 120
Presiunea O2 (mm Hg)
Hem
Locul de legare a
2,3-bisfosfogliceratului
Proteinele plasmatice
Au pI = 5
Sunt transportori:
Hormoni
vitamine
Medicamente
Cationi
acizi grai liberi
bilirubin
VH VH
COO- -
OOC
Lant CH 1 CH 1
greu Fab
Fab Papaina Zon flexibil
CH 2 CH 2
Punti de sulf
Fc
CH 3 CH 3 V = Zone variabile
C = Zone constante
-
OOC COO-
In ce lichide biologice se afl ???
saliv,
lacrimi,
lapte matern,
majoritar n plasm;
blocheaz antigenul i
Imunoglobuline
Antigen
Y Diferentiere
proliferare
Limfocite B Plasmocite Ig (Y)
Rspunsul imun celular
Mediat de limfocite T maturate n timus
Receptorii limfocitelor T:
-celule T killer
-celule T helper
-celule T supresoare
Antigeni
antigeni = orice substan
exo- sau
endogen
Antigen
Y Diferentiere
proliferare
Limfocite B Plasmocite Ig (Y)
Specificitatea
component haptenic i
componenta purttoare
Condiii de antigenicitate
s fie non-self
s aib o greutate molecular mai
mare de 10.000 dal
s aib conformaie spaial stabil
structura chimic s fie ct mai
complex
Clase de antigene
VH VH
COO- -
OOC
Lant CH 1 CH 1
greu Fab
Fab Papaina Zon flexibil
CH 2 CH 2
Punti de sulf
Fc
CH 3 CH 3 V = Zone variabile
C = Zone constante
-
OOC COO-
Funciile imunoglobulinelor
recunosc Ag i se combin cu el
Ag + Ac Ag - Ac
IgG
-sunt monomeri bivaleni
-75-80% din Ig organismului
-traverseaz bariera placentar
-IgG apar dup IgM i IgE
-se afl n snge, limf, lichide interstiiale
-se sintetizeaz n cantiti mari.
-activeaz complementul
IgA
J
IgM
sunt pentameri cu cinci situsuri de legare a Ag
A.Sunt macromolecule
B.Pot funciona ca antigene
C.Legate covalent de o macromolecul pot funciona
ca determinani antigenici
D.Se leag puternic de anticorpii specifici
E.Nu acioneaz niciodat ca determinani antigenici
Care dintre afirmaiile de mai jos n legtur
cu imunoglobulinele nu sunt corecte ?
VIII Factor X
Factor X Factor Xa
Va
V
Protrombina Trombin
Factor XIII
II
Lantul B
Lantul g
-COO- -NH3+ -COO-
47,5 nm
Transformarea fibrinogen-fibrin
Fibrinogen
H2O
Fibrinopeptide
Monomer de fibrin
Agregare
OH O
CH 3 CH 3
R R
OH O
Trombina
proteaz care activeaz un numr mare de
factori din cascada de coagulare:
fibrinogen (factorul I);
factorul de stabilizare a fibrinei (factorul XIII);
factoru V;
factorul VIII;
factorul XI.
Reglarea procesului de coagulare
Natural
De ctre componeni plasmatici
antitrombina III
Complexul trombin-trombomodulin:
Factor tisular
Plasminogen Plasmin
Streptokinaza
(o proteinaz bacterian cu activitate
similar, sunt utilizate n clinic pentru
dizolvarea chiagurilor formate n urma unor
afeciuni cardiace).
Homeostazia plachetar este meninut de: