BIOCHIMIE II

BIOCHIMIA
METABOLISMULUI
TERMODINAMICA BIOCHIMIC I COMPUII MACROERGICI

Conf. Dr. Biochim. Bogdan Nicolae Manolescu

Facultatea de Chimie Aplicat i tiina Materialelor
Departamentul de Chimie Organic C. Neniescu
Laborator 013, Corp F, Campus Polizu

Termodinamica biochimic

Termodinamica biochimic:
studiaz reaciile i procesele biochimice i biologice din
punct de vedere termodinamic
principiile termodinamicii:
principiul I energia nu poate fi creat i nici distrus (se
transform dintr-o form n alta)
principiul II orice sistem termodinamic tinde ctre un grad
maxim de dezordine (ctre echilibru)

conceptele termodinamicii:
sistem termodinamic regiune din spaiu delimitat real sau
imaginar de restul universului (mediul extern)
funcii de stare parametri care depind doar de starea
sistemului:
entropia (S)
Entalpia (H)
energia liber (G)

Termodinamica biochimic

Clasificarea sistemelor termodinamice:

sisteme izolate
sisteme nchise
sisteme deschise

Termodinamica biochimic

Energia liber Gibbs:

concept introdus de J. Willard Gibbs (1878)
reprezint acea parte a energiei unui sistem ce poate fi
utilizat pentru a face lucru mecanic
criteriu de spontaneitate pentru reaciile ce decurg la
temperatur i presiune constante:
G = 0 reacie la echilibru
G < 0 proces exergonic (reacia decurge spontan)
G > 0 proces endergonic (reacia nu decurge spontan)

este o mrime aditiv:

permite cuplarea unei reacii endergonice cu una exergonic

Termodinamica biochimic

Energia liber Gibbs:

cuplarea a dou reacii:
situaii posibile:
G1 < 0 i G2 > 0 G = G1 + G2 < 0
G1 < 0 i G2 > 0 G = G1 + G2 > 0

cile metabolice sunt formate din numeroase reacii cuplate,

astfel nct pentru ntreaga cale metabolic G < 0

Termodinamica biochimic

Termodinamica biochimic

Termodinamica biochimic:
se consider o reacie de forma:

A+B

C+D

se aplic legea aciunii maselor i se obine constanta de

echilibru:

variaia energiei libere (G) este legat de Kech prin relaia:

termen constant
termen variabil

Termodinamica biochimic

Termodinamica biochimic:
la echilibru nu exist transformare net (G = 0):

nlocuind relaia (3) n relaia (2) se obine:

din relaia (5) se poate scoate Kech:

G i Kech sunt legate ntre ele prin relaia (6)

Compuii macroergici

Compuii macroergici:
compui pentru care Ghidroliz are o valoare < - 30,5 kJ/mol
catabolizarea nutrienilor:
elibereaz energie:
C6H12O6 + 6 O2 6 CO2 + 6 H2O (G = - 2850 kJ/mol)
C16H32O2 + 23 O2 16 CO2 + 16 H2O (G = - 9781 kJ/mol)
energia este stocat sub form de:
nucleozid trifosfai (ATP, GTP)
tioesteri (acetil~CoA)
coenzime reduse (NADH/H+, FADH2)

compuii macroergici:
se acumuleaz n cantitate limitat n celule
permit desfurarea proceselor endergonice

Compuii macroergici

Compuii fosforilai:
clasificare n funcie de valoarea Ghidroliz:
compui cu caracter macroergic:
Ghidroliz < - 30,5 kJ/mol
au capacitatea de a transfera gruparea o-fosfat pe molecula de ADP
cu formarea ATP

compui fr caracter macroergic:

Ghidroliz > - 30,5 kJ/mol
nu au capacitatea de a transfera gruparea o-fosfat pe molecula de
ADP

valoarea Ghidroliz:
este considerat un indicator al tendinei de transfer a gruprii ofosfat
mai este denumit POTENIAL DE TRANSFER AL GRUPRII oFOSFAT
permite organizarea compuilor fosforilai ntr-o scal

Compuii macroergici

Compuii macroergici

Compuii macroergici fosforilai:

reaciile de transfer a gruprii o-fosfat:

sunt implicate n:
consumarea ATP
sinteza ATP

factori care confer caracter macroergic ATP:

repulsiile electrostatice
efectele de solvatare
stabilizarea prin rezonan a produilor

Compuii macroergici

Conceptul de legtur macroergic:

structura ATP
numrul de legturi macroergice:
ATP 2 legturi
ADP 1 legtur

legturile macroergice nu au nimic special din punct de

vedere structural
hidroliza moleculei de ATP este:
favorabil termodinamic (proces exergonic, G < 0)
defavorabil cinetic (este necesar prezena unor enzime
speciale)

Compuii macroergici

Compuii macroergici

Utilizarea ATP:
activarea unor metabolii
necesit scindarea:
1 legtur macroergic
2 legturi macroergice

exemple:
fosforilarea diferitelor substrate (KINAZE)

Compuii macroergici

Utilizarea ATP:
exemple:
activarea aminoacizilor la aminoacil~RNAt (sinteza proteic)
aminoacil~RNAt sintetaze

Compuii macroergici

Utilizarea ATP:
exemple:
activarea acizilor grai la acil~CoA
acil~CoA sintetaze

Compuii macroergici

Utilizarea ATP:
interconversia nucleozid fosfailor:
sinteza NDP din NMP (nucleozid monofosfat kinaze)

sinteza NTP din NDP (nucleozid difosfat kinaze)

reaciile sunt reversibile datorit similitudinilor structurale ale

compuilor

desfurarea unor procese biologice:

contracia muscular
transportul activ prin membrane
secreia unor substane (neurotransmitori, hormoni)

Compuii macroergici

Utilizarea ATP:
cuplarea cu reacii endergonice:
energia este furnizat de ctre ATP
aparent este vorba de hidroliza ATP, n realitate se formeaz
un inermediar comun

Compuii macroergici

Producerea ATP:

IMPOSIBIL
TERMODINAMIC

sinteza din ADP i Pa:

ADP + Pa ATP + H2O (G + 30,5 kJ/mol)

observaii generale:
ATP nu poate fi stocat n celule
exist un echilibru permanent ntre procesele consumatoare de
ATP i cele prin care se sintetizeaz ATP

procese prin care se sintetizeaz ATP:

fosforilarea la nivel de substrat
fosforilarea oxidativ
reacia cataliat de adenilat kinaz

Compuii macroergici

Fosforilarea la nivel de substrat:

caracteristici generale:
modalitate de sintez a ATP folosind compui fosforilai
macroergici cu potenial de transfer al gruprii o-fosfat mai mare
dect ATP
necesit sinteza unor compui fosforilai macroergici
poate avea loc n aerobioz i anaerobioz
produce o cantitate mic de ATP

exemple:
glicoliz:
gliceraldehid-3-fosfat dehidrogenaz i 3-fosfoglicerat kinaz
enolaz i piruvat kinaz

ciclul Krebs:
succinil~CoA sintetaz

Compuii macroergici

Compuii macroergici

Fosforilarea oxidativ:
proces ce se desfoar doar n aerobioz
are loc n mitocondrii
cea mai important surs de ATP
Reacia catalizat de adenilat kinaz:
enzim prezent n muchi n cantitate mare

ADP rezultat este transformat n ATP prin:

fosforilare la nivel de substrat
fosforilare oxidativ

Compuii macroergici

Acilfosfaii:
caracteristicile acilfosfailor:
sunt anhidride mixte (acid fosforic acid carboxilic)
factori ce confer caracter macroergic acilfosfailor:
produii reaciei de hidroliz sunt stabilizai prin rezonan
diminuarea repulsiilor electrostatice n moleculele produilor de
reacie
solvatarea produilor de reacie contribuie la stabilizarea lor

exemple de acilfosfai:
acetilfosfat (G = - 43,1 kJ/mol)
1,3-bisfosfoglicerat (G = - 49,4 kJ/mol)

3-fosfoglicerat kinaz

Compuii macroergici

Enolfosfaii:
caracteristicile enolfosfailor:
conin o legtur esteric enol acid fosforic
factori ce confer caracter macroergic enolfosfailor:
esterificarea menine blocat o grup hidroxil de tip enolic
hidroliza elibereaz enolul care tautomerizeaz spontan la forma
cetonic (proces puternic exergonic)

exemple de enolfosfai:
fosfoenolpiruvatul (G = - 61,9 kJ/mol)

Compui macroergici

Compui macroergici

Fosfoguanidine (fosfageni):
caracteristicile fosfoguanidinelor:
din punct de vedere chimic sunt fosfoamide (amide ale acidului
fosforic)
factori ce confer caracter macroergic fosfoguanidinelor:
stabilizarea prin rezonan a gruprii guanidino

exemple de fosfoguanidine:
fosfocreatina:
abundent la vertebrate
G = - 43,1 kJ/mol

fosfoarginina:
abundent la nevertebrate
G = - 32 kJ/mol

Compui macroergici

Fosfocreatina funcioneaz ca un tampon de ATP:

n condiii standard G= + 12,6 kJ/mol pentru reacia:
CH3
H2N

ATP

ADP
-2O

COO-

NH

CH3
N

3PNH

creatin kinaz

creatin

COO-

NH
fosfocreatin

in vivo, n muchi, concentraiile sunt:

[ATP] = 4 mM
[ADP] = 0,013 mM
[fosfocreatin] = 25 mM
[creatin] = 13 mM

G = - 0,49 kJ/mol

in vivo, creatin kinaza funcioneaz la echilibru

Compui macroergici

Fosfocreatina:
n muchiul scheletic are o concentraie de 15-40 mM
permite regenerarea ATP n primele 5-10 secunde ale unui
sprint de 100 m
sportivii de performan consum suplimente pe baz de
creatin

Compui macroergici

Tioesteri:
factori ce confer caracter macroergic tioesterilor:
datorit volumului mai mare al atomului de S este mpiedicat
conjugarea p-
legtura C-S nu are caracter parial de legtur dubl ca n cazul
legturii C-O din esteri

exemple de tioesteri:
acetil~CoA (G = - 31,5 kJ/mol)

Compui macroergici