Markerii microsatelit-

Comparaii
Cojocaru Emilia

Promotor- loc de semnalizare a
ARN polimerazei ptr nceperea
funciei; cuprinde secvenele
consensus: cutia TATA (-10) i
secvena TTGAC(-35)
Iniiatorul - locul n care ARN
polimeraza i ncepe funcia
Regiunea operatorului- locul
specific de legare a represorului
(protein cu funcie reglatoare care
nu permite ca ARN-polimeraza s
nceap sinteza ARNm)
Locul de legare la ribozom(SD)
Gena structural ncepe cu codonul
START care transcris n ARNm
devine codonul AUG, iar captul
genei este marcat de unul din
codonii non-sens (STOP)

Ce sunt microsateliii?
MICROSATELIII - sunt secvene repetate n tandem,
supuse unei evoluii extrem de rapide, datorit unor
procese randomizate -> erorile fcute de ADN
polimeraza n timpul replicrii ADN.
Se consider c aceti loci au un polimorfism foarte nalt,
potrivit pentru ntocmirea de amprente genetice care
pot discerne chiar ntre indivizi strns nrudii.
Sunt grupai n regiunea centromerului i a telomerelor
unde formeaz ciorchini
Nu se transcriu
Sunt foarte polimorfi i se transmit codominant


Organizare n ADN
Sunt secvene repetate la nivelul ADN
Sunt de mai multe feluri:
Mononucleotide repeats ...AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA...
Dinucleotide repeats ...CACACACACACACACACACACACACA...
Trinucleotide repeats ...CGTCGTCGTCGTCGTCGTCGTCGT...
Tetranucleotide repeats ...CAGACAGACAGACAGACAGACAGA...
Pentanucleotide repeats ...AAATTAAATTAAATTAAATTAAATT...
Hexanucleotide repeats ...CTTTAACTTTAACTTTAACTTTAA...

Examples of perfect microsatellites made up from mono-, di-, tri, tetra
, penta-,and hexanucleotide repeats, respectively
Unde sunt folosii?
Ingineria genetic este definit ca ansamblul
de metode i tehnologii efectuate in vitro cu
gene, cromozomi sau celule ntregi, n scopul
construirii unei structuri genetice cu
proprieti ereditare premeditate. (L. Popa i
Rodica Repanovici)

Tipuri de markeri
microsatelit
ISSR
SAMPL
SSCP
VNTR
SNP
STMP
SNP, STR
Aplicaii
Sursele de ADN utilizat n scop de identificare:
esuturi proaspete, snge integral, celule ale mucoasei
bucale, foliculi piloi sau probe uscate: pete de snge
sau sperm
Prelevarea i conservarea probelor biologice pentru
analiza ADN
Cea mai utilizat surs de ADN este sngele integral
proaspt, recoltat pe anticoagulant: EDTA
Izolarea i purificarea ADN din probele biologice
Cu ajutorul unor procedee chimice, fizice sau
combinate, evitndu-se contaminarea i degradarea
probei

Genotiparea ADN se poate face n scop de
identificare
(http://www.ornl.gov/sci/techresources/Human_G
enome/elsi/forensics.shtml#2)
Se poate realiza prin dou tipuri de tehnici:
1. tehnici bazate pe hibridare (tehnica RFLP
combinat cu Southern blotting) a fost prima
tehnic utilizat n acest scop)
2. tehnicile bazate pe reacia PCR:
Tehnica sequence-tagged microsatellite profiling
(STMP) pentru evidenierea polimorfismelor SSR
(simple sequence repeats)
Tehnica STR - VNTR (Sequence - Tagged Repeats-
VNTR)
Metoda care s-a impus n prezent este metoda bazat pe
PCR pentru locii STR (Short Tandem Reapeats) -
tehnica (STMP)