Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Valoarea pH-ului unui sistem biochimic este menținută cu ajutorul sistemelor tampon.
Principalul sistem tampon la nivel extracelular este sistemul bicarbonat-acid carbonic (HCO 3 -
/H2 CO3 ). Există și alte sisteme tampon care intervin pentru menținerea pH-ului: proteinele
celulare (proteină acidă/proteinat), albuminele, globulinele plasmatice (hemoglobina /
hemoglobinat și oxihemoglobina / oxihemoglobinat) și pompele protonice (proteine membranare
care favorizează traficul în “contracurent” a ionilor de H + și K + prin membrana celulară). De
asemenea din procesele metabolice rezultă acizi organici (piruvic, lactic sau cetoacizi) sau
anorganici respectiv bazele conjugate ale acestora sau anionii organici (citrat, lactat sau acetat).
Concentrația ionilor de H + din plasmă este 35-45 mmol/L (pH= 7,35-7,45). Menținerea pH-ului
plasmei se realizează prin 3 mecanisme: de tamponare, de compensare (respiratorie sau renală)
sau de corectare.
Mulţi compuşi localizați la nivelul celulei conţin
numeroase grupări care pot fi disociate. Valoarea pKa-
ului unei grupări (acide) este egală cu pH-ul la care
jumătate din molecule sunt disociate, iar cealaltă
jumătate sunt neutre.
Ionii fosfat sunt prezenţi în cantităţi considerabile
în celulă şi sunt factori importanţi în menţinerea
(tamponarea) pH-ului citoplasmei. În acizii nucleici
grupările fosfat se regăsesc sub forma unui diester.
Valoarea pKa-ului corespunzător disocierii protonului Figura 1. Disocierea grupării fosfat din
grupării fosfat este de aproximativ 3 (Figura 1). Astfel, acizii nucleici la pH 7
la pH neutru (pH 7) fiecare grupare fosfat din acizii
deoxiribonucleic (ADN) sau ribonucleic (ARN) este încărcată negativ. Acest fapt permite
interacțiunea acestor molecule cu grupări încărcate pozitiv (grupări amoniu) din proteine.
Direcţia reacţiilor biochimice
Dat fiind faptul că moleculele biochimice sunt menţinute la temperatură şi presiune
constantă, direcţia unei reacţii chimice poate fi intuită pe baza energiei potenţiale sau energiei
libere. Modificările energiei libere caracteristice unei reacţii sunt influenţate de temperatură,
presiune, concentraţia iniţială a reactanţilor şi produşilor sau pH. De asemenea, valoarea energiei
libere standard indică sensul (deplasarea echilibrului) unei reacţii biochimice.
ATP-ul este o sursă de energie pentru procesele celulare.
Energia eliberată în reacția de hidroliză a ATP-ului (adenozin trifosfatului) la ADP
(adenozin difosfat) este folosită (prin intermediul unor sisteme enzimatice) în diverse procese:
sinteza proteinelor sau oligozaharidelor, deplasarea celulelor, contracţia musculară, transportului
moleculelor prin membranele celulare.
2
Biochimie - Curs 2 - 2022
Aminoacizii
Aminoacizii sunt compuși biochimici cu masă moleculară mică și importanţă deosebită
pentru organismul uman. Aceştia sunt elemente structurale de bază care intră în componenţa
proteinelor, compuşi cu proprietăți biologice remarcabile. Aminoacizii au fost obţinuţi din
proteine prin hidroliza acidă (HCl 6M) a legăturilor peptidice din proteine. De asemenea,
aminoacizii sunt precursori ai hormonilor (tiroxina) sau moleculelor cu funcţii specializate
(dopamina-neurotransmiţător). Primul aminoacid descoperit a fost asparagina (în rădăcina şi
tulpina sparanghelului; 1806). Aminoacidul treonina a fost caracterizat mai târziu în anul 1938.
Până în prezent se cunosc 22 de aminoacizi care sunt elemente structurale de bază ale
proteinelor, dintre care numai 20 sunt criptați de către codul genetic universal. Ceilalți doi,
selenocisteina (abreviată Sec sau U, descoperită în 1986, aminoacid aflat în peste 25 de proteine
umane) și pirolizina (abreviată Pyl sau O, descoperită în 2002, prezentă doar în componența
proteinelor din bacterii sau arhee) fuzionează cu ADN-ul de transfer care este capabil să formeze
perechi de baze cu codonii de stop ai ARN-ului mesager în timpul procesului de translație. Doar
în această situație acești doi aminoacizi pot fi încorporați în proteine. Inițial aminoacizii au fost
denumiţi în funcţie de sursa de provenienţă (asparagina din Asparagus, glutamatul din gluten şi
tirozina din brânza -“tyros”= brânză) sau după proprietăţi organoleptice (glicina-“Glykos”-
dulce).
3
Biochimie - Curs 2 - 2022
Aminoacizii sunt prezenți în sânge sau alte fluide biologice atât în formă liberă cât şi
combinată. De asemenea, aminoacizii sunt precursori ai hormonilor, zaharurilor, purinelor,
pirimidinelor, porfirinelor, vitaminelor sau aminelor cu rol fiziologic.
Deși în procesul de translație (copierea informației de pe ARN-ul mesager sub formă de secvență
proteică – proces care se desfășoară la nivelul ribozomilor) se utilizează doar 21 de aminoacizi se
cunosc peste 140 de aminoacizi care apar în proteine. Este important de subliniat faptul că
numărul aminoacizilor care nu apar în proteine (neproteinogeni) este cu mult mai ridicat. Unii
dintre aceştia apar numai în plante sau în anumite microorganisme. În natură aminoacizii există
şi în configuraţia D. De exemplu, D-alanina, acizii D-glutamic şi D-aspartic intră în componenţa
peptidelor din peretele bacterian. Fluidul intracelular al unor viermi marini şi nevertebrate
conţine drept componente principale D-aminoacizii, iar în unele crustacee marine cantitatea
acestora poate depăşi 1%. De asemenea, acidul D-aspartic, D-asparagina, acidul D-glutamic, D-
glutamina, D-serina și D-alanina au fost detectați în majoritatea plantelor, în timp ce D-prolina,
D-valina, D-leucina and D-lizina doar în unele plante (angiosperme dicotiledonate). Proteinele
metabolice stabile din mamifere conţin cantităţi însemnate de acid D-aspartic rezultat în urma
procesului de racemizare: concentraţia acidului D-aspartic în materia albă creierului atinge circa
3%, iar în proteina bazică din măduva spinării până la 10%.
Laptele, carnea şi diversele cereale nu conţin cantităţi substanţiale de D-aminoacizi. În
decursul procesării, aminocizii din aceste alimente suferă adesea fenomenul de racemizare. Mai
mult, concentrația D-aminoacizilor din probele de lapte (bio) creşte substanţial în decursul
4
Biochimie - Curs 2 - 2022
5
Biochimie - Curs 2 - 2022
Alanina este unul dintre aminoacizii care se găsesc în proteine, frecvența de apariție în
aceste macromolecule fiind depășită doar de leucină. Există o controversă legată de faptul că
leucina este un aminoacid care stimulează direct sinteza proteinelor în mușchi. Mai mult
excedentul de leucină poate fi periculos și poate induce diareea, apariția dermatitelor, instalarea
demenței și uneori decesul. Alanina poate fi obținută din acidul piruvic printr-o reacție de
transaminare (la nivelul mușchilor).
Valina, leucina şi izoleucina sunt aminoacizi alifatici nepolari cu catenă ramificată.
Valina este biosintetizată de plante pornind de la acidul piruvic. Valina se găsește în multe
proteine, mai ales în interiorul proteinelor globulare, ajutând la împachetarea 3D a acestora.
Aportul de valină menține vigoarea mentală, coordonarea musculară și calmul emoțional.
Leucina şi alanina sunt aminoacizi frecvent întâlniți în elementele de structură secundară
denumite α-elicoidale (din proteine care leagă ADN-ul). Dintre aminoacizii cu catenă ramificată
izoleucina posedă un centru chiral suplimentar pe catena laterală. În plante și bacterii aspartatul
este un precursor al izoleucinei.
Metionina este un aminoacid nepolar care intervine (sub formă formilată; fiind inserat
primul în lanțul proteic) în cadrul biosintezei proteinelor din bacterii, mitocondrii și cloroplaste.
Este codat de codonul de start AUG localizat pe ARN-ul mesager. Biosinteza proteinelor din E.
Coli începe cu N-formilmetionina. Metionina este un intermediar în biosinteza carnitinei,
taurinei sau fosfatidilcolinei.
Metionina este un precursor al S-adenozil-metioninei (SAM), o moleculă importantă în
metabolismul celular al mamiferelor. Acest compus este folosit în reacțiile de metilare (de
transfer al grupării –CH 3 ).
Aminoacizii aromatici sunt fenilalanina, tirozina şi triptofanul.
Resturile aromatice (fenilalanina, tirozina şi triptofanul) pot fi detectate prin
spectroscopie în domeniul UV (250-300 nm). Această proprietate este folosită în special pentru
estimarea concentraţiei peptidelor sau proteinelor care conţin aceste resturi sau pentru studiul
împachetării acestor macromolecule.
Fenilalanina este un aminoacid nepolar și un precursor metabolic al tirozinei. Boala
genetică numită fenilcetonurie are drept consecință metabolizarea defectuoasă a fenilalaninei.
Fenilcetonuria (idioția fenilpiruvică) este cauzată de un defect genetic al unei enzime care
catalizează transformarea fenilalaninei în tirozină. Drept rezultat, în fluxul sangvin se
acumulează o cantitate apreciabilă de fenilalanină și produșii acesteia de metabolizare (acid
fenil-piruvic, acid fenil-acetic și acid fenil-lactic). Concentrația ridicată de fenilalanină inhibă o
altă enzimă, fapt care va induce diminuarea sintezei melaninei (un pigment de la nivelul pielii,
părului, țesutului pigmentat care stă la baza irisului ochiului și peretelui de dincolo de urechea
internă). Drept urmare pacienții cu fenilcetonurie se disting prin următoarele trăsături: tenul
deschis, părul blond și ochi albaștri.
Aspartamul este un îndulcitor care este metabolizat în organism la aspartat, fenilalanină și
metanol. Din acest motiv nu este recomandat pentru consum în cazul persoanelor diagnosticate
cu fenilcetonurie.
Atât fenilalanina cât și tirozina sunt precursorii fumaratului și acetoacetatului.
Triptofanul este un aminoacid esențial care conține un rest indolic. Acest aminoacid este
precursor an serotoninei, niacinei și hormonului auxină (în plante). De asemenea, triptofanul este
un precursor al alaninei.
6
Biochimie - Curs 2 - 2022
Prolina este cel mai puțin flexibil compus dintre aminoacizii prezenți în proteine. În
organismul uman prolina poate fi biosintetizată pornind de la glutamat după 4 reacții metabolice.
Prezența prolinei afectează structura secundară (desface elementele secundare de tip
helix/β pliat (datorită absenței grupării NH care este prezentă de obicei în legăturile amidice
clasice) și se regăsește în structurile de tip β întors care sunt localizate în special la suprafața
proteinelor – legăturile amidice în care este implicat aminoacidul prolină sunt majoritatea în
conformația trans). Hidroxilarea prolinelor din colagen (din oase, tendoane sau ligamente)
imprimă o stabilitate conformațională acestei proteine.
Histidina este un aminoacid esențial pentru oameni. Gruparea imidazolică din catena
laterală îi conferă proprietăți unice acestui aminoacid datorită posibilității de ionizare și implicit
de creștere a caracterului aromatic în condiții de pH fiziologic. Histidina poate constitui un
aminoacid a cărei catenă laterală joacă un rol important în actul catalitic guvernat de enzime
7
Biochimie - Curs 2 - 2022
În proteine, atât pe treonina cât și pe serină, pot fi grefate resturi de zaharuri (reacția de
glicozilare la gruparea –OH are loc în aparatul Golgi).
Treonina asemeni izoleucinei este un aminoacid care conține un centru de asimetrie
suplimentar. Acest aminoacid poate fi sintetizat doar de plante și procariote. La fel ca și serina
gruparea –OH a treoninei poate fi fosforilată sau glicozilată. Treonin kinazele sunt parte
integrantă a sistemelor de semnalizare celulară. Treonina este un precursor al piruvatului sau al
acetil-coenzimei A și glicinei. Mucinele (glicoproteine
din peretele intestinal, implicate în procesul de
absorbție al hranei) sunt bogate în treonină.
Glutamina care nu este în mod normal un
aminoacid esențial, dar în anumite situații poate fi
necesar pentru atleții care depun eforturi intensive sau
pentru persoanele care sunt afectate de boli gastro-
intestinale.
8
Biochimie - Curs 2 - 2022
Glutamina este cel mai abundent aminoacid din sânge (respectiv mușchii scheletici) și unul
dintre puținii care pot traversa bariera hemato-encefalică. Glutamina este un aminoacid important
pentru transportul amoniacului (NH 3 ) între țesuturi și controlul pH-ului. Glutamina poate fi
constitui un precursor al nucleotidelor (purinelor sau pirimidinelor), aminozaharurilor,
nicotinamid adenin dinucleotid fosfatului (NADPH) sau antioxidanților. Acest aminoacid susține
creșterea și multiplicarea celulelor sistemului imunitar. În reticulul endoplasmatic acest
aminoacid poate fi glicozilat (la gruparea amidică din catena laterală).
Asparagina este un aminoacid neesențial. Gruparea amidică din catena laterală imprimă
un caracter polar acestui aminoacid. Asparagina este implicată în formarea acrilamidei în cazul
alimentelor gătite la temperaturi ridicate (când reacționează cu grupările carbonilice). De
asemenea, asparagina este convertită în acid malic în cadrul ciclului acidului citric.
Pe lângă grupările de tip hidroxilic sau amidic (glutamina, asparagina) pe catena laterală
a aminoacizilor mai pot fi prezente şi alte grupări: -SH (cisteina), -SeH (seleno-cisteina) sau
tioeterică (metionina).
Cisteina este singurul aminoacid care are o grupare tiolică în catena laterală. Este
neesențial pentru adulți dar esențial pentru bebeluși. Grupările tiolice din două molecule de
cisteină poate fi oxidate la una disulfidică (-S-S-). În organismul uman cisteina poate fi
biosintetizată din metionină. În plus, acest aminoacid este o componentă a enzimelor (cistein
proteazelor), proteinelor sau peptidelor (glutation). De asemenea, poate regla activitatea unor
enzime (de exemplu din cadrul biosintezei melaninei).
Selenocisteina este un aminoacid codat de tripletul UGA (care este şi tripletul de oprire în
sinteza proteică). Acest aminoacid este mult mai reactiv decât cisteina. Înlocuirea atomului de S
cu Se în unele enzime (catalizatori biochimici care sunt implicaţi în unele reacţii redox)
determină o creştere semnificativă (cu peste 100 de ori) a vitezei reacţiei catalizate de acestea.
c) Aminoacizi ce prezintă catene laterale
încărcate:
- pozitiv (lizina, arginina);
Lizina asistă absorbția calciului la nivelul tractului
gastro-intestinal promovând astfel biosinteza colage-
nului. Histamina și carnozina (substanță ce anihilează
radicalii liberi) sunt biosintetizate pornind de la acest
aminoacid. Lizina este un aminoacid esențial care
9
Biochimie - Curs 2 - 2022
10