SERIN PROTEAZELE

IMPLICAȚII ÎN INFARCT
MIOCARDIC

A elaborat:Moisei
Tatiana,Gr M2125
Profesor: Martîn Cristina
• Scopul lucrării :
• Studierea clasificării, funcțiilor si rolurilor Serin-protezelor. Identificarea componentelor
localizării enzimelor, determinarea activității enzimelor și care sunt implicațile în infarct
miocardic.

• Materiale și metode :
• A fost realizată o lucrare decriprivă, în baza consultării literaturii de specialitate, surselor on-
line, bibliotecii. Selectarea informației utile, interesante și captivante, consultând surse respective,
în urma utilizării termenilor cheie “ ”, “ ”, “rol”, “funcție” au fost propuse enunțuri descriptive,
care au format un discurs demn.
 Serinele proteaze (sau serin proteaze ) sunt o clasă de proteaze care își bazează
mecanismul de catalizare pe prezența serinei , care este deosebit de reactivă și esențială
pentru activitatea lor enzimatică. Aceste enzime catalizează hidroliza legăturilor peptidice
între grupa amino și grupa carboxil prezentă în structura proteinelor. Sunt enzime cu
activități multiple, inclusiv: digestia alimentelor, contribuția directă la formarea trombilor,
combaterea infecțiilor și facilitarea fertilizării .
STRUCTURA

 Serin proteazele sunt caracterizate printr-o structură

distinctivă, constând din două domenii beta-baril care
converg la situsul activ catalitic. Aceste enzime pot fi
clasificate în continuare pe baza specificității substratului
lor, fie asemănătoare tripsinei, asemănătoare
chimotripsinei sau asemănătoare elastazei.
 Situsul activ al fiecărei serin proteaze constă din reziduuri de serină (Ser), histidină (His)
și aspartat (Asp) legate prin legături de hidrogen . Aceste legături sunt posibile datorită proximității în
structura tridimensională a grupului imidazol al histidinei cu gruparea hidroxil a serinei,
 acidul aspartic este, de asemenea, apropiat de grupul histidină, dar pe partea opusă serinei.
Presupunând că acest aranjament facilitează trecerea protonilor și a sarcinilor în situsul
activ al enzimei : histidina este în poziția de a acționa ca bază și de a elimina protonul din grupul
hidroxil al serinei; prin această schimbare, serina devine mult mai reactivă și poate, în vecinătatea
legăturilor peptidice, să formeze o nouă legătură cu carbonul prezent în proteine. Sarcina negativă a
acidului aspartic servește la stabilizarea lanțului lateral activ al histidinei.
 În particular, un ester (R-COOR ') sau o' amidă(NH2 CO-R, NH-R CO-R', ''') se leagă la gruparea -OH
serinei eliberând un alcool (R-OH) sau o amină (RNH2, RNHR', RNR'R''). În prezența apei , legătura cu
serina se rupe, eliberând acid carboxilic.
 CLASIFICARE
Superfa Familii Exemple
milie
SB S8, S53 Subtilizină (Bacillus licheniformis)
SC S9, S10, S15, S28, S33, S37 Prolil oligopeptidaza (Sus scrofa)
SE S11, S12, S13 D-Ala-D-Ala peptidază C (Escherichia coli)
16 superfamilii fiecare conținând
SF S24, S26 Peptidază semnal Eu (Escherichia coli)
multe familii. Fiecare superfamilie
SH S21, S73, S77, S78, S80 Citomegalovirus asamblare (uman herpesvirus 5)
folosește triada catalitică sau diada .
SJ S16, S50, S69 Lon-A peptidaza (Escherichia coli)
Majoritatea aparțin familiei S1 a SK S14, S41, S49 Clp protează (Escherichia coli)
Clanul PA (superfamilie) de Fag K1F endosialidază CIMCD proteină auto-clivantă
ASA DE S74
proteaze. (Enterobacterii fagul K1F)
SP S59 Nucleoporină 145 (Homo sapiens)
SR S60 Lactoferina (Homo sapiens)
. În cadrul fiecărei superfamilii, Murein tetrapeptidază LD-carboxipeptidază (
SS S66
familiile sunt desemnate prin Pseudomonas aeruginosa)
nucleofilul lor catalitic, (S = serin SF S54 Romboid-1 (Drosophila melanogaster)
proteaze). PA
S1, S3, S6, S7, S29, S30, S31, S32, S39, S46,
Chimotripsina A (Bos taurus)
S55, S64, S65, S75
PB S45, S63 Penicilina G acilaza precursor (Escherichia coli)
PC S51 Dipeptidaza E (Escherichia coli)

PE P1 DmpA aminopeptidază (Ochrobactrum anthropi)

neatribui
S48, S62, S68, S71, S72, S79, S81
t
 Relina Trombina

Elastaze Tripsină

Colagenaza Chimiotripsină
Tipuri

Plasmina Subtilizină
Principalele enzime aparținând acestei clase, precum tripsina , chimotripsina și elastaza , sunt strict omoloage, de fapt
structurile lor primare sunt aproximativ 40% identice. Toate aceste enzime au un Ser activ și un His esențial catalitic situat
în situsul activ care leagă un reziduu Asp care este scufundat într-un buzunar care nu este accesibil solventului . Aceste trei
reziduuri formează o triadă catalitică, legată prin legături de hidrogen , în felul următor: SERINA 195-H-BINDER-
HISTIDINE 57-H-BOND 102.
ASEMANATOARE CU TRIPSINA

 Proteazele de tip tripsină scindează legăturile peptidice în urma unui

aminoacid încărcat pozitiv (lizină sau arginină).[4]Această
specificitate este determinată de reziduul care se află la baza
buzunarului S1 al enzimei (în general un acid aspartic sau acid
glutamic).
 ASEMĂNĂTOR CHIMOTRIPSINEI

 Buzunarul S1 al enzimelor asemănătoare chimotripsinei este mai hidrofob decât în ​

proteaze asemănătoare tripsinei. Acest lucru are ca rezultat o specificitate pentru
reziduurile hidrofobe de dimensiuni medii sau mari, cum ar fi tirozină, Fenilalanină și
triptofan.
 ASEMĂNĂTOR TROMBINEI

 Acestea includ trombină, plasminogen care activează țesutul și plasmină. S-a constatat că au
roluri în coagulare și digestie, precum și în fiziopatologia tulburărilor neurodegenerative, cum ar
fi demența indusă de Alzheimer și Parkinson.
 ASEMĂNĂTOR UNEI ELASTAZE

 Proteazele asemănătoare elastazei au un buzunar S1 mult mai mic decât proteazele asemănătoare
cu tripsină sau chimotripsină. În consecință, reziduuri precum alanină, glicină și valină tind să
fie preferate.
ASEMĂNĂTOR SUBTILIZINEI

 Subtilizină este o serină protează în procariote. Subtilizina nu are legătură evolutivă cu

chimotripsina-clan, dar împărtășește același mecanism catalitic utilizând un triada
catalitică, pentru a crea un nucleofil serină. Acesta este exemplul clasic folosit pentru a
ilustra evoluție convergentă, deoarece același mecanism a evoluat de două ori
independent în timpul evoluţie.
 MECANISM CATALITIC

 Egalitatea structurală considerabilă a sitului activ al serinei proteazelor implică faptul că

mecanismele catalitice sunt similare; de fapt, toate urmează următorul mecanism catalitic:
 -După ce enzima a legat substratul , Ser 195 atacă nucleofil gruparea carbonil a legăturii susceptibile pentru
a forma un intermediar tetraedric (cataliză covalentă);
 -Inelul imidazol al lui 57 leagă protonul care este eliberat din legătura anterioară, formând ionul imidazol
(cataliză generală de bază)
 -Aceste procese sunt favorizate de efectul polarizat al grupării carboxil ionizate de Asp 102, care formează o
legătură de hidrogen cu His 57 (cataliză electrostatică);
 -57 eliberează protonul dobândit anterior (cataliza acidă generală) promovând descompunerea
intermediarului tetraedric cu eliminarea intermediarului acil-enzimei (procesul de acetilare );
 -Gruparea amino care se formează (R'NH2) este eliberată de enzimă și înlocuită cu o moleculă de apă
preluată din solvent;
 -Deacetilarea are loc cu un mecanism invers față de cel al formării intermediarului: apa acționează ca un
nucleofil care atacă Ser 195 și grupul carboxilic legat de acesta este eliberat de enzimă și, în cele din urmă,
acesta din urmă este eliberat.
 Triada catalitică

 Chimotripsina este considerat unul dintre paradigmele de enzime pentru triadei catalitice, triada aici serina - histidină -
aspartat .
 Chimotripsina se leagă de substratul său într-o buclă care conține un reziduu hidrofob mare .
 Aspartat formează o legătură de hidrogen cu histidina, care este de la 7 la 12 în apropierea p K A a atomului de azot din
ciclul imidazol . Acest lucru permite histidinei să acționeze ca o bază puternică și să deprotoneze serina.
 Serina acționează ca un nucleofil care atacă atomul de carbon al carbonilului și forțând atomul de oxigen al carbonilului să
accepte un electron , ducând la formarea unui tetraedru intermediar . Acest intermediar este stabilizat de o gaură de
oxianion care implică amida serinei.
 Histidina dă protonul său atomului de azot al carbonului α . Azotul și fragmentul peptidic C- terminal sunt îndepărtate prin
difuzie.
 O moleculă de apă donează apoi un proton histidinei, iar hidroxilul restant –OH atacă atomul de carbon carbonil, formând
un alt intermediar tetraedric. Hidroxilul este un nucleofug mai sărac decât fragmentul peptidic C- terminal, astfel încât este
serina care este eliminată prin recuperarea unui proton din histidină.
 Fragmentul peptidic N- terminal este îndepărtat prin difuzie.
 ACTIVAREA ZYMOGEN

 Zimogeni sunt precursorii de obicei inactivi ai unei enzime. Dacă

enzimele digestive ar fi active atunci când sunt sintetizate, ar începe
imediat să mestece organele și țesuturile de sinteză. Pancreatita acuta
este o astfel de afecțiune, în care există activarea prematură a
enzimelor digestive din pancreas, rezultând auto-digestie (autoliză).
De asemenea, se complică investigații postmortem, deoarece
pancreasul se digeră adesea înainte de a putea fi evaluat vizual.

După cum se poate vedea, activarea
tripsinogenului la tripsină este esențial, deoarece
își activează propria reacție, precum și reacția
ambelor chimotripsina și elastaza. Prin urmare,
este esențial ca această activare să nu aibă loc
prematur. Există mai multe măsuri de protecție
luate de organism pentru a preveni auto-digestia:
Activarea tripsinogenului prin tripsină este relativ
lentă
Zimogenii sunt depozitați în granule de zimogen,
capsule care au pereți despre care se crede că sunt
rezistenți la proteoliză.
Zymogen Enzimă Note
Când tripsinogenul intră în intestinul subtir din
pancreas, enteropeptidaza secrețiile din
mucoasa duodenală scindează lizina 15 -
legătura peptidică izoleucină 16 a zimogenului.
Ca rezultat, tripsinogenul zimogen se
descompune în tripsină. Amintiți-vă că tripsina
Tripsinogen Tripsina este, de asemenea, responsabilă pentru
scindare lizină legături peptidice și, astfel,
odată ce este generată o cantitate mică de
tripsină, aceasta participă la scindarea
propriului său zimogen, generând și mai multă
tripsină. Procesul de activare a tripsinei poate
fi astfel numit autocatalitic.
După ce legătura Arg 15 - Ile 16 din
chimotripsinogenul zimogen este scindată de
Chimotripsino
chimotripsina tripsină, structura nou generată numită a pi-
gen
chimotripsină suferă autoliza (auto-digestie),
producând chimotripsină activă.
Proelastase elastaza Este activat prin scindare prin tripsină.
 INHIBITIE

 Există anumite inhibitori care seamănă cu intermediarul tetraedric și astfel umple locul activ,
împiedicând enzima să funcționeze corect. Tripsina, o enzimă digestivă puternică, este generată în
pancreas. Inhibitorii previn auto-digestia pancreasului în sine.
 Serina proteaza este asociată cu serina proteaza inhibitori, care își opresc activitatea atunci când nu
mai sunt necesare.[6]
 Serinele proteaze sunt inhibate de un grup divers de inhibitori, incluzând inhibitori chimici sintetici în
scopuri de cercetare sau terapeutice, precum și inhibitori proteici naturali. O familie de inhibitori
naturali numită "serpins" (prescurtată din inhibitori ai serinei proteazei) poate forma un covalent se
leagă cu serina protează, inhibându-i funcția. Cel mai bine studiat serpins sunteți antitrombină și alfa
1-antitripsina, au studiat rolul lor în coagulare/tromboză și emfizem/A1AT, respectiv. Inhibitorii
artificiali ireversibili de molecule mici includ AEBSF și PMSF.
 O familie de artropod inhibitori ai serinei peptidazei, numiți pacifastin, a fost identificat în lăcuste și
Rac de râu, și poate funcționa în artropod sistem imunitar.[7]