Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
1
Biochimie - Curs 4 - 2024
În condiții acide sau neutre gruparea amino este sub formă protonată. La valori bazice ale
pH-ului (peste 11) gruparea amino va exista preponderent sub formă deprotonată:
Valoarea constantei de aciditate, pKa, a acestei reacţii este de 9-10,5 (în funcţie de catena laterală
a aminoacidului). Din acest motiv în majoritatea condițiilor fiziologice, unde valoarea pH-ului
este mai mică decât 8-8,5, gruparea amino este preponderent protonată (încărcată pozitiv). În
schimb, în aceste condiții gruparea carboxilică din aminoacizi este deprotonată:
Valoarea constantei de aciditate, pKa, pentru reacţia de deprotonare a grupării carboxilice este de
1,7-2,4. Acest fapt dictează o încărcare negativă a acestei grupări la valori fiziologice ale pH-
ului.
Punctul izoelectric
Dacă la valori mici ale pH-ului (pH 1) toate grupările disociabile sunt protonate şi
aminoacizii sunt încărcaţi pozitiv, la valori mari ale pH-ului (pH 11) toate grupările funcţionale
sunt deprotonate: grupărea carboxilică va fi încărcată negativ și gruparea amino neprotonată (-
NH2 sau neîncărcată).
Există însă şi situații în care la anumite valori ale pH-ului (de exemplu pH în intervalul 6-
7) gruparea carboxilică este ionizată, pe când gruparea amino este protonată. Valoarea pH-ului la
care încărcarea netă a aminoacidului este zero poartă numele de punct izoelectric (pI). Punctul
izoelectric al aminoacizilor care au catena laterală neionizabilă se situează în domeniul de pH
5,0-6,5. De exemplu, pentru alanină valoarea punctul izoelectric sau pI-ul este de 6,02.
producerea artificială a unor proteine care posedă la unul din capetele lanțului proteic o secvență
de 6-10 histidine (implicit 6-10 nuclee imidazolice), proprietate care permite izolarea prin
cromatografie de afinitate a acestora (prin interacțiunea norului electronic extins din nucleul
imidazolic cu o serie de ioni metalici - Ni2+, Co2+ sau Zn2+ - care sunt deja grefați/complexați pe
o matrice cu “brațe” de tip acetat / fixate pe atomi de azot).
Gruparea tiolică (-SH) a cisteinei ionizează la pH ușor bazic (pKa = 8,37) sau poate fi
oxidată la cistină, acest fapt conferă resturilor de cisteină un rol deosebit în procesul de
împachetarea tridimensională a proteinelor.
Valoarea pKa-ului grupării -SH (tiolice din proteine) poate să fie influențată de
vecinătățile cisteinei. La o valoarea a constantei pKa de 7,4, și la pH sanguin (7,4), doar 50% din
grupările -SH sunt ionizate (-S-). În schimb, la o valoarea a constantei pKa de 8,4, și la pH
sanguin (7,4), doar 10% din grupările -SH sunt ionizate. În consecință, grupările -SH care au o
valoare pKa mai redusă au un grad de ionizare mai pronunțat și sunt mai reactive (nucleofili mai
puternici).
3
Biochimie - Curs 4 - 2024
În ceea ce privește albumina serică umană (HSA), o proteină din ser, aceasta are un
număr de 35 resturi de cisteină și ca atare poate forma în conformația nativă (împachetarea din
natură) 17 punți disulfidice (-S-S-). Având un număr impar de grupări -SH una dintre acestea nu
poate forma punți disulfidice.
De asemenea, tirozina, un aminoacid aromatic, posedă gruparea fenolică ce ionizează la
valori mari ale pH-ului (pKa =10,46). S-a constatat faptul că în proteine valoarea pKa poate varia
semnificativ și poate atinge și valori mai mari (> 13,2; în funcție de gradul de accesibilitate a
solventului la nucleul fenolic).
În cazul aminoacizilor dicarboxilici punctul izoelectric atinge valori mai mici comparativ
cu cei monocarboxilici (pIaspartic = 2,97, iar pIalanina = 6,00). În schimb, acizii diaminocarboxilici
posedă puncte izoelectrice mai ridicate (pIlizină = 9,74) comparativ cu cei monoamino carboxilici.
Aminoacidul lizină este un compus a cărei unitate structurală se regăsește în proteinele care
interacționează cu acizii nucleici (catena laterală a acestui aminoacid este încărcată pozitiv și din
acest motiv proteinele bogate în lizină poate interacționa electrostatic cu molecula ADN-ului,
datorită grupărilor fosfat cu sarcini negative prezente în acizii nucleici, acestea au un pKa 2-3).
Peste 900 de aminoacizi neproteinogeni au fost descoperiți în plante, în special în legume
și cu o abundență crescută în semințe. Dintre acești aminoacizi se pot menționa L-canavanina, L-
3,4-dihidroxi-fenilalanina, acidul-azetidin-2-carboxilic, mimozina și hipoglicina. Toxicitatea
unor asemenea aminoacizi poate fi pusă pe seama încorporării greșite a acestora în proteine în
locul aminoacidului standard cu structură asemănătoare. L-canavanina, un aminoacid care se
întâlnește în semințele de fasole (Canavalia ensiformis) și în Dioclea megacarpa are o structură
asemănătoare cu a argininei. Acidul-azetidin-2-carboxilic din Convallaria majalis (lăcrămioare)
se aseamănă din punct de vedere structural cu prolina.
Derivaţii aminoacizilor
Modificarea catenei laterale a proteinelor
Codul genetic “universal” care este aproape identic în toate organismele se referă doar la
cei 20 de aminoacizi standard. Există însă şi alți aminoacizi care intră în componenţa unor
4
Biochimie - Curs 4 - 2024
proteine. În cele mai multe cazuri acești aminoacizi apar datorită modificărilor pe care le suferă
un aminoacid standard după ce lanţul polipeptidic a fost sintetizat – modificări post-
traslaţionale. Cele mai comune modificări constau într-o simplă modificare a catenei laterale:
hidroxilarea (lizină, prolină sau histidină), metilarea, acetilarea, carboxilarea sau fosforilarea
(serinei, treoninei sau tirozinei).
4-hidroxi-prolina este întâlnită în proteinele din peretele celular al plantelor sau în
colagen, o proteină din țesutul conjunctiv (alături de 5-hidroxi-lizina). Prezența acestui
aminoacid hidroxilat induce apariția unor legături de hidrogen și a unui centru asimetric
suplimentare, legături care imprimă o stabilitate net superioară și împachetare unică moleculei de
colagen. -Carboxi-glutamatul, un aminoacid care are o grupare carboxilică suplimentară față de
glutamat, intră în componența protrombinei (proteina implicată în coagularea sângelui) respectiv
a altor proteine implicate în procesele de coagulare sau în alte proteine (osteocalcina și proteina
matricială renală– proteine necesare pentru reglarea creșterii osoase și calcifierea extraosoasă)
care complexează ionii de Ca2+ (datorită celor două grupări carboxilice prezente în catena
laterală).
Metilarea aminoacizilor din proteine se desfășoară cel mai frecvent la catena laterală a
resturilor de arginină și lizină. Dacă în cazul lizinei pot fi plasate una, două sau trei grupări metil
la gruparea amino din poziția a lizinei, argininele pot fi mono sau dimetilate (simetric sau
asimetric).
5
Biochimie - Curs 4 - 2024
6
Biochimie - Curs 4 - 2024
sau glicinei sunt mai scăzute; de asemenea scăderea concentrației de triptofan poate conduce la
deficiențe ale vitaminei B3 care se manifestă prin dermatite), malnutriție, sindrom nefrotic, boala
Huntington (afecțiune neurodegenerativă rară, moștenită genetic; apar disfuncții motorii tipice -
mişcări spasmodice şi involuntare ale braţelor, picioarelor, toracelui şi ale feţei; simptomele
timpurii pot fi și pierderea motivației şi o modificare a stării emoționale și în final la depresie),
artrită reumatoidă sau febră Phlebotomus (provocată de musca de nisip Phlebotomus рарраtasif;
simptomele sunt: instalarea oboselii, pierderea în greutate, febră urmată de un focar de leziuni ale
pielii).
Boala urinei cu miros de sirop de arțar (MSUD - eng. Maple Syrup Urine Disease) este o
boală cauzată de un deficit al enzimei care catalizează decarboxilarea oxidativă a aminoacizilor
cu catena ramificată (valină, leucină și izoleucină) atât în sânge cât și în urină. În cazul unui
deficit enzimatic se acumulează o serie de metaboliți (cetoacizii derivați de la aminoacizii
menționați) imprimând urinei un miros caracteristic asemănător siropului de arțar. Deficitul în
metabolizarea acestor aminoacizi induce apariția unor leziuni nervoase, întârzierea dezvoltării
mentale sau în cazul formelor severe chiar la deces. În condițiile în care boala este depistată în
primele luni de viață se impune o alimentație săracă în valină, leucină și izoleucină, iar șansele
de redresare a pacientului sunt ridicate.
7
Biochimie - Curs 4 - 2024
Concentrația aminoacizilor din lichidul cefalorahidian (LCR) este mai scăzută decât cea
plasmatică. LCR conține majoritatea aminoacizilor prezenți în plasmă și țesutul nervos (cu
excepția 1- și 3-metil histidinei respectiv a cisteinei). Determinarea nivelului aminoacizilor poate
furniza informații importante legate de diferențierea meningitei tuberculoase de cea aseptică.
Dacă în ambele tipuri de meningită nivelul aminoacizilor aspartic, glutamic, GABA (acid -
aminobutiric), glicinei, triptofanului sunt ridicate, în cazul meningitei tuberculoase scade nivelul
de taurină și crește concentrația fenilalaninei din LCR.