Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
1950 James D. Watson, Francis Crick, Maurice Wilkins structura ADNului 1962 premiul Nobel pentru Medicin
1958 George Beadle, Edward Tatum rolul genelor premiul Nobel pentru Fiziologie i Medicin
BIOCHIMIA
6. Metabolismul oxidativ
7. Metabolismul glucidic 8. Metabolismul proteic 9. Metabolismul lipidic 10. Acizi nucleici 11. Metabolismul hormonal
Membrana celular
- membran semipermeabil - asigur schimburile cu exteriorul celulei - menine pH-ul celular - menine compoziia constant a mediului intern i potenialul electric
Membrana celular
Compoziie
- lipide fosfolipide, colesterol, glicolipide - proteine vehiculante transport aminoacizi, ioni, glucoz - canaliculare canale hidrofile pentru molecule mici - receptoare comunicarea ntre celule - enzimatice au proprieti catalitice - semnalizatoare markeri individuali
Reticulul endoplasmatic
Lizozomii
- formaiuni granulare sferice, 0,4-1 m - conin enzime: proteaze, nucleaze, fosfataze, glicozidaze, lipaze - enzime latente; pH 5 - sculee de sinucidere - lipsa congenital a unor enzime lizozomale acumularea substratului - boala von Gierke deficit de glucozo-6-fosfataz acumulare de glicogen - boala Gaucher deficit de glucocerebrozidaz - boala Tay-Sachs deficit de hexozaminidaz A (-N-acetil-hexozaminidaz) - deficit de glucozo-6-fosfat-dehidrogenaz susceptibilitate crescut a hematiilor fa de oxidani
Peroxizomii
Ribozomii
Mitocondriile
- 2 membrane lipidice - membrana extern enzime implicate n CATC, MAO - membrana intern sisteme de transport - matricea enzime pentru -oxidarea AG, CATC - criste oxizomi enzimele lanului respirator compui macroergici
termocentralele celulelor
Aparatul Golgi
Nucleul
- membran lipoproteic dubl - conine ADN, ARN, nucleotide, proteine (histone) - ADN ARNm proteine
- 45-75% din greutatea corporal - depinde de: - vrst - sex - adipozitate - tipul esutului - forme apa liber - apa structurat - apa legat - distribuie intracelular 55% - K+, PO43- extracelular 45% - Na+, Cl-
Structur molecular - tetraedru neregulat - ntre molecule exist legturi de hidrogen - este un dipol electric
- disociaz
H2O H+ + HO-
H+ HOK= H2O
Rol n organism
- structural n structura celulei, esuturilor - biochimic reactant, produs de reacie - solvent - mediu transportor - lubrifiant - termoreglator
Sisteme tampon
- menin pH-ul constant - compoziie - acid slab + baz conjugat - baz slab + acid conjugat
- ecuaia Henderson-Hasselbach
Sisteme tampon
- H2CO3 / HCO3- Na2HPO4 / NaH2PO4 - pretein / proteinat - hemoglobin / hemoglobinat - pH normal = 7,4
- microelemente
Sodiu
-142 mEq/L
- distribuia apei n organism i reglarea presiunii osmotice - realizarea echilibrului ionic
Potasiu
- 3,1- 5,1 mEq/L - funcia neuronilor - contractilitatea muscular - respiraia celular - activitatea cardiac
Calciu
- 4,5- 5,3 mEq/L - reduce excitabilitatea neuromuscular - regleaz secreia glandelor endocrine - coagularea sngelui - activeaz enzime - integritatea i permeabilitatea membranei celulare
Fosfor - 0,78-1,51 mmoli/L - 75% - hidroxiapatita din oase - 25% - combinaii organice fosfolipide, nucleotide, acizi nucleici, compui macroergici
Mangan
- cofactor enzomatic oxidoreductaze, transferaze, hidrolaze, liaze - structura SOD
Sulf - structura tioaminoacizilor, proteinelor - structura enzimelor citocrom c oxidaza - structura unor grupe funcionale enzimatice coenzima A
ENZIME
- enzime sau fermeni - proteine sintetizate n celule - catalizeaz reaciile biochimice biocatalizatori - avantaje fa de catalizatorii chimici - vitez mare de reacie - condiii blnde de reacie 37oC, p. atm., pH - specificitate de reacie - reglarea direct sau indirect a activitii
ENZIME
Structura enzimelor - proteine simple - heteroproteine partea proteic apoprotein (apoenzim) specificitate de substrat - partea neproteic cofactor aciunea catalitic - organic (coenzim), - anorganic (ioni metalici)
- nucleoproteine
Structura enzimelor - primar - succesiune de aa - secundar orientarea spaial leg. de H - teriar leg. disulfidice, ionice, de H, hidrofobe - cuaternar complexe tridimensionale; leg. necov, hidrofobe
Situsuri catalitice
ENZIME
Denumirea enzimelor - I - substrat + -az (ureaz, glucozidaz) - II natura procesului catalizat + -az (oxidaz, hidrolaz, transferaz) - III Comisia de Enzimologie a Uniunii Internaionale de Biochimie i Biologie Molecular (IUBMB) substrat + reacia + -az (glucozo-6-fosfat-dehidrogenaz) - cod EC xxxx
Denumirea enzimelor
- EC 1.1.1.1. alcool dehidrogenaza EC 1. oxido-reductaz EC 1.1. acioneaz asupra compuilor cu gr. CH-OH EC 1.1.1. NAD+ sau NADP+ este acceptorul de H EC 1.1.1.1. NAD+ este acceptorul de H
Denumirea enzimelor
- EC 2.1.1.1. nicotinamid-N-metil transferaza EC 2. transferaz EC 2.1. transfer un grup de 1 at. de C EC 2.1.1. transfer un grup metil EC 2.1.1.1. donorul este metionina
S-adenozil-L-metionina + nicotinamida
S-adenozil-L-homocisteina + 1-metil-nicotinamida
Localizarea enzimelor
- nespecific n toate esuturile - specific pepsina, tripsina, H. tiroidieni
- la nivel celular membran GGT - citoplasm glicoliz, sinteza de acizi grai - nucleu ADN-giraza, ADN-polimeraza - lizozomi enzime degradative - ribozomi sinteza de proteine - RE sinteza de glicogen, glicoproteine, CYP 450
Proenzime
- zimogeni - activare prin hidroliz limitat a unui peptid terminal - ndeprtarea unui oligopeptid din interiorul moleculei - metode de activare - chimic mediul acid pepsinogen
pepsin
proelastaza
tripsina
elastaza
vitamina K
anticoagulante cumarinice
protrombina
heparina
fibrina insolubila
plasminogen
+
urokinaza streptokinaza
Izoenzime
- au aceleai proprieti enzimatice, dar structur primar uor difereniat, proprieti cinetice i electroforetice diferite - sunt specifice enzimelor cu structur cuaternar - evideniate n acelai organism - numerotate n funcie de proprietile electroforetice 1 .... N
Sisteme multiemzimatice
- asociaii enzimatice n cadrul unei ci metabolice
Clasificarea enzimelor
- dup sistemul IUBMB 1. 2. 3. 4. 5. 6. Oxidoreductaze Transferaze Hidrolaze Liaze Izomeraze Ligaze
1. Oxido-reductaze
ox1 + red2 red1 + ox2
1. 1. Dehidrogenaze
- H de la grupe funcionale ( -CH2-OH, -CHO, -CH2-NH2), nucleotide (NADH, NADPH) la substrat n absena oxigenului - oxidare anaerob
AH2 + B A + BH2
CH3-CH2-OH + NAD+
ADH
CH3-CHO + NADH + H+
1. 2. Oxidaze
- H de la substrat la oxigen H2O sau H2O2 - oxidare aerob
AH2 + O2 A + H2O
AH2 + O2 A + H2O2
1. 3. Oxigenaze
- introduc atomi de oxigen n molecul
triptofan dioxigenaza
triptofan
1. 4. Hidroperoxidaze
- catalaza H2O2 + H2O2 2 H2O + O2 H2O2 + AH2 2 H2O + A - superoxid dismutaza (SOD)
. . O2 + O2 + 2 H+ SOD H2O2 + O2
2. Transferaze
A + BC AB + C
2. 1. Aminotransferaze
R1-CH-COOH R2-C-COOH + O NH2 R1-C-COOH R -CH-COOH + 2 O NH2
TGP
(ALT, ALAT)
2. 2. Kinaze
-glucoza + ATP hexokinaze I, II, III, IV glucozo-6-fosfat + ADP
2. 3. Glicoziltransferaze
hexozil transferaza
glu-UDP + -(glu)n-1-
glicogen + UDP
2. 4. Metiltransferaze
S-adenozil-metionina + dopamina COMT
3-metoxi-tiramina + S-adenozil-homocisteina
3. Hidrolaze
AB + H2O A-OH + BH
tripsina
-NH-CH-CO-NH-CH-CO- + H2O R1 R2 proteaza -NH-CH-COOH + H2N-CH-COR2 R1
trigliceride + H2O
lipaza
4. Liaze
- catalizeaz eliminarea din molecule CO2, H2O, NH3
4. 1. Decarboxilaze
piruvat CH3-C-COOH decarboxilaza O CH3-CHO + CO 2
acid glutamic
glutamat decarboxilaza
GABA + CO2
4. 2. Dehidraze
acid citric
citrat dehidraza
5. Izomeraze
- catalizeaz transformarea izomerilor optici sau structurali
5. 1. Epimeraze (racemaze)
L-serina serin racemaza D-serina
5. 2. Mutaze
fosfogluco mutaza
glu-6-fosfat
glu-1-fosfat
6. Ligaze (sintetaze)
- C-C; C-N; C-S; C-O
Etape - recunoaterea substratului, fixarea substratului - transformarea substratului - eliberarea produsului de reacie - refacerea enzimei
Centru activ (situs activ) preformat, dup activarea enzimei -COOH acid glutamic, acid aspartic, lizin -OH serin, tirozin
-SH cistein
-heterociclu histidin - aminoacizi adiaceni centrului catalitic
- centrul catalitic
Ex. acetilcolinesteraza - centru de recunoatere centru anionic COO- din acid aspartic - centru catalitic (esterazic) - OH din serin, rest histidin
H3C H3C N+-CH2-CH2- O-C- CH3 H3C O acetilcolina
Specificitatea enzimelor
- de reacie enzima catalizeaz un singur tip de reacie - lactat-dehidrogenaza, glucozo-6-fosfataza - excepie enzime piridoxalfosfat dependente (transaminare, decarboxilare, aldolizare)
glu-6-fosfat izomeraza fosfogluco mutaza glu-6-fosfat glucozo-6-fosfat dehidrogenaza glu-6-fosfataza acid 6-fosfogluconic glucoza + H3PO4 fru-6-fosfat glu-1-fosfat
- de substrat enzima acioneaz asupra unui substrat sau grupuri de substrate nrudite chimic - tipuri - absolut anhidraza carbonic, ureaza, catalaza - relativ alcool dehidrogenaza
ADH ADH ADH
- stereochimic enzima transform un singur tip de izomer sau determin formarea unui tip de izomer geometric sau optic - proteaze pentru L-aa - maltaza legturi -glicozidice - lactat dehidrogenaza acid L-lactic n acid piruvic
Cinetica enzimatic
(kcal/mol)
- enzimele reduc energia de activare
E
Creterea vitezei reaciei enzimatice - fixarea substratului optim pentru atacul enzimatic - adaptarea indus a structurii enzimatice - interaciunea gr. NH2 sau COOH din centrul catalitic cu substratul - fixarea covalent a unei poriuni de substrat
Exprimarea vitezei de reacie mol/s, mg/s, mol/min, mg/min Nr de turnover = nr. molec substrat transf de 1 molecul de enzim n 1 s UI = cantit de enzim care transform 1 mol substrat, la 25oC, pH optim Katal = cantit de enzim care transform 1 mol substrat n 1 s
- temperatura optim
- negativ afectarea structurii proteice a enzimei
Influena pH-ului - pH optim acid (pepsina, enzime lizozomale), neutru, bazic (tripsina, chimotripsina) -modificarea pH-ului - modificarea gradului de ionizare a grupelor funcionale - denaturarea structurii proteice
- ionizarea substratului
v = k [E] v = [P] / t
k [E] = [P] / t
[E] = [P] / k t
[E] ~ [P]
v1 = k1 [E] [S]
v2 = k2 [ES] v0 = k3 [ES] v1 = v2 + v0 k1 [E] [S] = [ES] (k2 + k3) k1 [E] [S] = k3 [ES] + k2 [ES]
KM =
KM
vo = vmax
[S] KM + [S]
[ES] =
v0 = k3 [ES]
vmax = k3 [ET]
ecuaia Michaelis-Menten
vo = vmax
[S] KM
vo ~ [S]
vo ~ vmax
[S] = KM
vo =
vmax 2
Ecuaia Lineweaver-Burk
E-CHO + AA1-NH2
E-CH2-NH2 CA1
E-CHO + AA2-NH2
-C
ED
-D
2.b. aleatoriu E + A EA
EAB
E + B EB
ECD
-C -D
ED EC
-D -C
E E
- condiii
reacii reversibile
R-O-PO3H2
fosfataza alcalin
R-OH + H3PO4
ES E+P EI
- ex. - ioni ai metalelor grele gr. SH - chelatarea cationilor din centrul activ
3. Inhibiia uncompetitiv
E + S ES
+I
ESI
4. Inhibiia ireversibil E + I EI
Utilizarea inhibitorilor n medicin i farmacie - medicamente - antivirale - aciclovir - antibiotice -lactamice peniciline, cefalosporine - anticanceroase - metotrexat - diuretice inhibitoare ale anhidrazei carbonice - antiinflamatoare COX1 (AAS), COX2 - antihipertensive IEC (captopril) - antidepresive IMAO (fenelzina) - antiglaucomatoase, miastenia grav anticolinesterazice - hipocolesterolemiante I-HMG-CoA-reductaza (simvastatin) - antidot - alcool
Legare covalent
- activitatea enzimei este controlat prin fixarea sau ndeprtarea unor grupe de atomi - ex. - fosforilare defosforilare
+ ATP - ADP
kinaza
E-OH
+ H2O fosfataza -H3PO4
E-O-PO3H2
- metilare demetilare - acetilare deacetilare - adenilare deadenilare - proteoliz parial tripsinogen tripsin
Enzime alosterice
- interaciune necovalent cu liganzi n centri diferii de centrul activ - catalizeaz reacii dintr-o cale metabolic - conin 2 centri activator, inhibitor - nu respect ecuaia Michaelis-Menten - interaciunile cu liganzii - homotrope - heterotrope 2 tipuri K KM se modific, vmax constant - V - KM constant, vmax se modific
b. secvenial
- hialuronidaza
- asparaginaza - enzime proteolitice tripsina, chimotripsina
3. Indicatori paraclinici
- AST, ALT - cresc n infecii virale hepatice, ALT persist mai mult - infarct miocardic crete AST - distrofie muscular crete AST - CPK (CK) - crete copii, afeciuni musculare, hipertermia malign - CK2 i CK3 crescute - afeciuni miocardice, transplant - CK1 crescut - leziuni cerebrale, neurochirurgie - fosfataza alcalin - crete - obstrucia cilor biliare, afeciuni ale oaselor
Coenzime
- anorganice - ioni metalici - organice - nevitaminice - vitaminice 1. Coenzime anorganice - ioni metalici - stabilizeaz structura, n centrul catalitic - tipuri de enzime - metaloenzime - metalul este fixat pe protein SOD,
anhidraza carbonic
- metaloporfirine citocromi - metaloflavine xantinoxidaza
hem B
hem A
hem C
- grupare prostetic citocromi a, c; catalaz, peroxidaz - donori sau acceptori de eFe2+ -e+ eFe3+
Coenzima Q (ubiquinona)
O H3CO H3CO CH3 O (CH2-CH=C-CH2)10-H CH3
- descoperit n 1957 - surse - endogen - sintetizat n organism din tirozin i acetil-CoA - exogen alimente (macrou, hering, inim de porc) ( 14-32%) - localizare - membrana mitocondrial, RE, peroxizomi, lizozomi
OH H3CO CH3 R OH
H3CO
Acidul lipoic
(CH2)4-COOH + R-CHO SH FADH2 FAD SH CoA-S~CO-R (CH2)4-COOH SH (CH2)4-COOH S-CO-R + CoA-SH
- aciltransferaza, piruvat-dehidrogenaza
Tetrahidrobiopterina
fenilalanina O2 H2N HN N H N N H CH3 CH-CH-CH3 OH OH tirozina H2O N N O H N N
H2N
CH3 CH-CH-CH3 OH OH
O TH-biopterina
S-adenozil-metionina
NH2 N CH3 HOOC-CH-CH2-CH2-S-CH2 NH2 N
N N
OH OH
ATP
NH2 N N N N O- O- OCH2-O-P-O-P-O-P-OO O O O OH OH
Vitamine
- liposolubile A, D, E, K - hidrosolubile B1, B2, B3 (niacina), B5 (acid pantotenic), B6, B7 (biotina), B9 (acid folic), B12, C
Vitamina A
H3C CH3 CH2-OH
H3C
CH3
CHO
CH3 retinol
H3C
- derivat poliizoprenic - lichid uleios, insolubil n ap, solubil n solveni organici - UV fluorescen verzuie - 1917 - descoperit, 1947 - sintetizat
beta-caroten retinilesteri
oxidare + H2O
retinol
acizi grasi
retinilesteri
chilomicroni
+
contraceptive
H3C H3C CH3 H3C CH3 beta-caroten caroten-dioxigenaza H3C CH3 CHO CH3
- abs. 30-35%
H3C
CH3
CH3
Efecte biologice - necesar zilnic 1 mg retinol, 6 mg -caroten (sex, vrst, starea fiziol.) - retinol, acid retinoic creterea i diferenierea celulelor (RAR, RXR) - meninerea integritii epiteliului
- vedere
impuls nervos
lumina
- tulburri de absorbie
- tulburri de depozitare n ficat - creterea eliminrii renale - carena de proteine - expunerea la oxidani
Deficit de vitamina A simptomatologie 250.000-500.000 cazuri de orbire la copii - xerodermie - nictalopie - xeroftalmie - ulceraii ale corneei - retinita pigmentar - spoturi Bitot - anemie - reducerea rezistenei la infecii, HIV
Hipervitaminoza A - niveluri plasmatice = 10 x necesarul zilnic - intoxicaia acut dureri abdominale, greuri, vom, cefalee, ameeli, descuamarea pielii - intoxicaia cronic dureri osoase, articulare, cderea prului, uscciune i fisuri ale buzelor, anorexie, hipertensiune intracranian benign, hepatomegalie - exces de caroten colorarea tegumentelor n galben - risc de malformaii la derivaii de sintez