Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
25
d) subclasa 1.4 – gruparea CH – NH2;
e) subclasa 1.5 – NADH sau NADPH.
Exemple de oxidoreductaze:
a. Enzima EC 1.1.1.1 – este o NAD+ - enzimă; are ca substrat alcooli primari sau secundari
și catalizează reacția:
Alcool + NAD+ Aldehida sau cetonă + NADH + H+
Denumirea sistemică: alcool: NAD+ oxidoreductaza.
Denumirea trivială: alcool dehidrogenaza (alcool DH).
COO - COO -
HO C H + NAD + L-lactat DH C O + NAD + + H +
CH3 CH3
L-lactat Piruvat
H C OH + Pi + NAD + H C OH + NADH + H +
Gliceraldehid-3-fosfat 1,3-Difosfoglicerat
26
Organismele și-au dezvoltat un sistem de apărare împotriva stresului oxidativ, sistem ce
poate fi indus de către peroxidul de hidrogen; unele dintre aceste enzime sunt:
NADH: peroxid de hidrogen NADH peroxidaza: este o flavoenzimă cu nr. de cod:
EC 1.11.1.1.; ea catalizează reacția:
NADH + H+ + H2O2 NAD+ + 2H2O
Catalaza, sau conform denumirii sistemice: peroxid de hidrogen: peroxid de
hidrogen oxidoreductaza (EC 1.11.1.6.); aceasta este o hemoproteină și catalizează
descompunerea apei oxigenate, conform reacției:
H2 O2 + H2 O2 O2 + 2H2O
A – donorul de hidrogen;
A – X + B A + B – X unde: B – acceptorul de hidrogen;
X – grupare transferată – transferaza.
27
e) subclasa 2.5 – grupări alchil sau aril, altele decât metil;
f) subclasa 2.6 – grupări cu azot (ex: aminotransferaze);
g) subclasa 2.7 – grupări cu fosfor (ex: fosfotransferaze).
Exemple de transferaze:
a. Aciltransferazele (subgrupa 2.3) catalizează transferul unei grupări acil (R – CO–), cu
ajutorul coenzimei A:
CoA – S – CO – R + YH CoA – SH + Y – CO – R
Grupările amino sunt transferate de enzimele din sub-subclasa 2.6.1, iar transferul are loc
de la un aminoacid (donorul) la un cetoacid (acceptorul). Reacțiile catalizate de aceste enzime
implică și un proces de oxidoreducere, prin care donorul de grupare amino este oxidat, iar
acceptorul redus. Datorită faptului că prima etapă a reacției implică formarea unei baze Schiff
dintre gruparea amino a substratului și gruparea aldehidă a piridoxal-5-fosfatului, gruparea
prostetică a enzimelor, acestea au fost încadrate în clasa transferazelor. Cele mai
reprezentative enzime ale acestei sub-subclase sunt:
b. Enzima EC 2.6.1.1: L-aspartat: 2-oxoglutarat aminotransferaza (aspartat
aminotransferaza); în clinica medicală, această enzimă mai poartă numele de glutamat
oxaloacetat transaminaza, cu prescurtarea GOT, denumire provenită după sensul invers al
reacției:
COO - COO -
COO - COO - +
+ C O H3N C H
H3N C H C O
+ CH2 + CH2
CH2 CH2
CH2 CH2
COO - -
COO -
COO COO -
28
capabilă să fosforileze o serie de hexoze cu ajutorul ATP. Denumirea sistemică a acestei
kinaze este ATP: D-hexoză 6-fosfotransferaza și catalizează reacția:
ATP + D – Hexoza ADP + D – Hexozo – 6 – P
Cea de-a doua enzimă a acestei sub-subclase este glucokinaza (EC 2.7.1.2) și după cum îi
arată numele este mult mai specifică, putând fosforila prin intermediul ATP doar glucoza.
Aceste enzime catalizează reacții de scindare a unor legături covalente din structura
substratului, cu participarea apei:
A – X + H2O A – OH + X – H
Exemple de hidrolaze:
29
a. Enzime subclasa 1 – EC 3.1 – legături esterice (esteraze):
Enzima EC 3.1.1.3 cu denumirea sistemică: triacilglicerol acil-hidrolaza, cunoscută și
sub numele de lipază, catalizează hidroliza triacilglicerolilor la nivelul poziților 1 și 3,
formând secvențial 2,3-diacilgliceroli și 2-acilgliceroli:
O
1
CH2 – O – C – R1 1
CH2 – OH O
O O
H2O + R1 – C – O- + H
R2 – C – O – 2CH O R2 – C – O – 2CH O +
CH2 – O – C – R3
3 3
CH2 – O – C – R3
Fosfolipaza
A1
O
O
1
CH2 – O – C – R
R2 – C – O – 2CH O CH3
+
CH2 – O – P – O – CH2 – CH2 – N
3
CH3
O- CH3
Fosfolipaza
A2 Fosfolipaza Fosfolipaza
C D
Enzimele care au ca substrat monoesteri ai acidului ortofosforic, catalizează reacții de
tipul:
30
b. Enzime subclasa 2: EC 3.2 – legături glicozil (glicozidaze):
Glicozidazele sunt divizate în sub-subclase în funcție de natura substraturilor hidrolizate:
3.2.1 – compuși O-glicozil;
3.2.2 – compuși N-glicozil;
3.2.3 – compuși S-glicozil.
O-glicoxidazele: sunt enzime implicate în degradarea glucidelor.
Exemple de astfel de enzime:
- α-amilaza (EC 3.2.1.1) – este enzima care acționează asupra legăturilor O-glicozidice
din structura amidonului, glicogenului și a polizaharidelor înrudite, cu eliberare de grupări
reducătoare în conformație α;
- o enzimă înrudită este β-amilaza (EC 3.2.1.2);
- celulaza (EC 3.2.1.4) scindează legături 1,4-β-glicozidice din structura celulozei și a β-
glucanilor;
- poligalacturonaza (EC 3.2.1.15) hidrolizează la întâmplare legături de tip 1,4-α-
galactoziduronice din structura galactouronaților;
- lizozimul (EC 3.2.1.17) hidrolizează legături O-glicozidice de tip α-1,4 dintre resturile
de acid N-acetilmuramic și resturi de N-acetilglucozamină din structura peptidoglicanilor;
- lactaza (EC 3.2.1.23) scindează la glucoză și galactoză principalul glucid al laptelui,
lactoza.
31
Peptidazele, în funcție de poziția legăturii peptidice pe care o hidrolizează, sunt împărțite
în sub-subclase astfel:
3.4.11 – hidrolizează legătura peptidică de la capătul N-terminal;
3.4.12 – hidrolizează legătura peptidică de la capătul C-terminal;
3.4.13 – hidrolizează dipeptidele ș.a.m.d până la 19
Proteinazele sunt împărțite în sub-subclase (de la 21 la... 24)în funcție de mecanismul lor
de acțiune, determinat pe baza unor studii asupra centrului catalitic și a influenței pH-ului
asupra activității catalitice:
3.4.21 – Serin-proteinaze (în centrul catalitic conțin un rest de Ser și His).
Exemplu:
- chimotripsina (EC 3.4.21.1) - care hidrolizează legături peptidice ce urmează resturilor
de Trp, Tyr sau Phe;
- tripsina (EC 3.4.21.2) - care hidrolizează legături peptidice ce urmează resturilor de Arg.
3.4.22 – Cistein-proteinaze (în centrul catalitic conțin un rest de Cys).
Exemplu:
- catepsina B (EC 3.4.22.1) - care hidrolizează proteinele intracelulare ale vertebratelor;
- papaina (EC 3.4.22.2) – de origine vegetală.
3.4.23 – sunt enzime cu un pH optim de acțiune sub 5 (Proteinaze acide), care în
centrul catalitic activ au un rest de Asp.
Exemplu:
- pepsina A (EC 3.4.23.1) hidrolizează legături care preced resturilor de Phe și Leu,
acționând la pH de 1,0- 1,5;
- catepsina D (EC 3.4.23.5) care este similară ca acțiune pepsinei, dar acționează asupra
proteinelor endogene;
- chimozina (EC 3.4.23.15) – enzimă din stomacul ierbivorelor, utilizată în coagularea
laptelui.
3.4.24 – metaloproteinaze; acestea necesită ioni metalici pentru a-și exercita funcția
catalitică.
Exemplu:
- metaloproteinazele microbiene precum: Colagenaza A – produsă de Clostridium
histolyticum care scindează colagenul.
32
3.4. Liaze – clasa 4
Exemple de liaze:
a. Enzimele din sub-subclasa 4.1.1 – elimină o moleculă de CO2 de la nivelul substratului;
de exemplu: enzima 4.1.1.1, având denumirea recomandată piruvat decarboxilaza și
denumirea sistemică: 2-oxo-acid carboxilaza. Decarboxilarea anaerobă a piruvatului provenit
din glicoliză, reprezintă una dintre etapele finale ale fermentației alcoolice, când se formează
acetaldehidă și CO2; apoi, acetaldehida este hidrogenată la etanol prin acțiunea enzimei alcool
dehidrogenaza, cu NAD ca și coenzimă:
COO - Piruvat H
decarboxilaza Alcool DH
C O C O H2C – OH
- CO2
CH3 CH3 CH3
NADH NAD+
+ H+
Piruvat Acetaldehida Etanol
33
b. Enzimele din sub-subclasa 4.1.2 – scindează legături C – C cu eliminarea unui
compus aldehidic din substrat; sunt denumite generic aldehid-liaze; de exemplu: enzima EC
4.1.2.13 are denumirea sistemică: fructozo-1,6-difosfat gliceraldehid-3-fosfat liaza, iar
denumirea recomandată (trivială) este: fructozo-difosfat aldolaza sau pe scurt aldolaza,
denumire atribuită după sensul invers al reacției; aldolaza catalizează reacția:
CH2 – O – PO32-
C=O O
CH2 – O – PO32-
HO – C – H Aldolaza C–H
+ C=O
H–C–H H – C – OH
CH2 – OH
H–C–H CH2 – O – PO32-
CH2 – O – PO32-
COO - COO -
S-malat Fumarat
Aceste enzime catalizează procese în urma cărora, au loc rearanjări în interiorul moleculei
substratului, care au ca rezultat modificări structurale sau geometrice. Denumirea sistemică
coincide de obicei, cu cea recomandată și este compusă din: substrat tipul izomerizării
34
izomerază. În funcție de tipul izomerizării, aceste enzime utilizează terminologii (denumiri)
consacrate (vulgare), astfel:
- mutazele – transferă intramolecular o grupare;
- racemazele – conduc la inversia singurului centru chiral al substratului;
- epimerazele – conduc la inversia unui centru chiral al substratului.
Împărțirea în subclase se face în funcție de tipul de izomerie, iar în sub-subclase se face în
funcție de natura substratului.
Exemple de izomeraze:
a. În subclasa 5.1 intră enzime care catalizează izomerizări la nivelul unor centre
asimetrice, fiind racemaze și epimeraze. Astfel, enzima EC 5.1.1.1 are numele alanin
racemaza; ea are ca și grupare prostetică piridoxal-fosfatul și catalizează reacția:
L-alanina D-alanina
b. Enzimele subclasei 5.2 induc modificări geometrice de tipul cis-trans; astefl enzima EC
5.2.1.1 sau maleat izomeraza, catalizează reacția:
COO - COO -
C–H H–C
C–H C–H
COO - COO -
Maleat Fumarat
cis trans
reducerea altei părți din moleculă. Enzimele din sub-subclasa 5.3.1 convertesc aldozele la
cetoze, fiind izomeraze ale glucidelor. Astfel, enzima 5.3.1.1, având denumirea recomandată
catalizează reacția:
O
CH2 – O – PO32-
C–H
C=O
H – C – OH
CH2 – OH
CH2 – O – PO32-
35
Gliceraldehid-3-fosfat Dihidroxi-acetonfosfat
Enzimele din sub-subclasa 5.3.2 catalizează trecerea de la o grupare enol la o grupare cetol
(tautomeraze), iar cele din sub-subclasa 5.3.3 catalizează schimbarea poziției unei duble
legături dintre doi atomi de carbon.
R2 NH2 R2 OH
Denumirea acestor enzime provine din limba latină (ligare- a lega, a lipi).
Reacţiile catalizate pot fi prezentate schematic astfel:
Ab + C → A–C + b
sau
Ab + cD → A–D + b + c
Reacţiile catalizate de aceste enzime sunt puternic endergonice.
Denumirea sistemică a acestor enzime cuprinde: denumire substrat 1: denumire substrat 2
ligaza (numele produsului rezultat în urma hidrolizei ATP-ului).
Împărțirea în subclase se face în funcție de tipul legăturii nou formate:
a) 6.1 – legătură formată tip C – O;
36
b) 6.2 – legătură formată tip C – S;
c) 6.3 – legătură formată tip C – N, fiind singura subclasă subdivizată în sub-subclase.
Exemple de ligaze:
a. Subclasa 6.1.1 conține enzimele aminoacid – ARNt ligazele, care acilează ARN-ul de
transfer, fiind specifice fiecărui aminoacid și catalizează reacția generală de forma:
b. Enzima succinat-CoA ligaza (EC 6.2.1.4) este o ligază care conduce la sinteza unui acil
derivat al CoA, utilizând hidroliza GTP ca sursă de energie:
COO -
COO -
CH2
CH2
+ CoA – SH + GTP CH2 + GDP + Pi
CH2
C ~ S – CoA
COO -
O
Această enzimă mai are denumirea succinil-CoA sintetaza, care arată că are loc sinteza
unui compus. Comisia de Enzimologie a recomandat abandonarea terminologiei de
„sintetază”, deoarece apar confuzii cu enzima denumită „sintază”; sintetazele catalizează
reacții care au ca sursă de energie hidroliza unui nucleozid trifosfat, pe când sintetazele nu
catalizează astfel de reacții.
37
3.7.1. Izoenzimele (izozime)
Aceste enzime sunt forme moleculare multiple, cu un determinism genetic diferit; ele sunt
codificate de cel puțin două gene diferite, având secvențe în aminoacizi care sunt mai mult,
sau mai puțin diferite, putând avea în structura lor una sau mai multe subunități; de asemenea,
ele pot fi distribuite în compartimente celulare diferite, dar prezintă aceeași funcție catalitică.
Exemple de izoenzime:
a. Malat dehidrogenaza umană prezintă două izoenzime, codificate de două gene diferite:
- o genă pe cromozomul 2 – este forma citosolică,
- o altă genă pe cromozomul 7 – forma mitocondrială.
Existența celor două izoenzime asigură transportul oxaloacetatului și a NADH dintr-un
compartiment în altul, membrana mitocondrială fiind impermeabilă pentru acești metaboliți.
Astfel, oxaloacetatul din mitocondrie este redus la malat sub acțiunea formei mitocondriale,
iar acesta părăsește mitocondria cu ajutorul transportorului malat-α-cetoglutarat din
membrana internă ajungând în citosol, unde este reoxidat la oxaloacetat sub acțiunea formei
citosolice:
COO – COO -
b
C=O HO – C – H
+ NADH + H + + NAD +
CH2 CH2
COO - COO -
Oxaloacetat Malat
38