Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
GRĂDINARU ILIE
Universitatea de Științe Agricole și Medicină Academia de Științe Agricole și Silvice
Veterinară „Ion Ionescu de la Brad” Iași, „Gheorghe Ionescu-Șișești” București,
Facultatea de Medicină Veterinară Stațiunea de Cercetare-Dezvoltare pentru
Creșterea Bovinelor Arad
Analiza hibridologică și
moleculară în identificarea
genelor și genotipurilor la
organismele superioare
Contribuția autorilor:
Andrei Cristian GRĂDINARU: cap. 1, 2 (2.1-2.6), 3 (3.1)
Daniela Elena ILIE: cap. 2 (2.7), cap. 3 (3.2)
I. Ilie, Daniela-Elena
575
Prefață ..................................................................................................... 6
1. Elemente de introducere în ereditate și variabilitate ....... 8
2. Materialul genetic nuclear și ereditatea acestuia .............. 12
2.1 Genele și cromozomii.................................................................. 12
2.2 Conservarea informației genetice în mitoză ................................. 17
2.3 Recombinarea și segregarea cromozomilor în meioză ................. 20
2.4 Mecanismele eredității nucleare ................................................... 25
2.4.1 Interacțiuni dintre genele alele .................................................... 26
2.4.1.1 Dominanța completă și recesivitatea..................................... 26
2.4.1.2 Dominanța incompletă (semidominanța)............................. 63
2.4.1.3 Codominanța ................................................................................... 69
2.4.1.4 Supradominanța ............................................................................ 72
2.4.1.5 Letalitatea ......................................................................................... 75
2.4.1.6 Pleiotropismul ................................................................................. 83
2.4.1.7 Alelele multiple (polialelismul) ................................................ 86
2.4.2 Interacțiuni dintre genele nealele ................................................ 90
2.4.2.1 Complementaritatea..................................................................... 90
2.4.2.2 Epistazia ............................................................................................ 97
3
Analiza hibridologică și moleculară în identificarea genelor și genotipurilor la
organismele superioare
2.4.2.3 Polimeria, poligenia .................................................................... 105
2.4.2.4 Interacțiunea modificatoare a genelor ................................ 113
2.4.3 Transmiterea înlănțuită a genelor (linkage-ul) ....................... 114
2.4.4 Transmiterea genelor legate de cromozomii sexuali, a
caracterelor limitate de sex și a celor influențate de sex .................. 133
2.4.4.1 Caractere legate de cromozomii sexului (sex-linkate) .. 134
2.4.4.2 Caractere limitate de sex .......................................................... 144
2.4.4.3 Caractere influențate de sex .................................................... 144
2.5 Penetranță și expresivitate .......................................................... 149
2.6 Construirea arborelui genealogic în vederea aprecierii modelului
segregațional............................................................................... 151
2.7 Tehnici de biologie moleculară utilizate în caracterizarea structurii
genetice a indivizilor .................................................................. 157
2.7.1 Tehnica PCR (engl. „Polymerase Chain Reaction”) ................. 157
2.7.1.1 Principiul reacției PCR ................................................................ 158
2.7.1.2 Enzime utilizate în reacția PCR .............................................. 166
2.7.1.3 Alegerea primerilor .................................................................... 169
2.7.1.4 Variante ale tehnicii PCR .......................................................... 171
2.7.1.5 Aplicabilitatea tehnicii PCR ..................................................... 175
2.7.2 Tehnica electroforezei ................................................................ 179
2.7.2.1 Electroforeza în gel de agaroză ............................................... 183
2.7.2.2 Electroforeza în gel de poliacrilamidă................................. 186
2.7.3 Analiza RFLP (engl. „Restriction Fragment Length
Polymorphism) ...................................................................................... 188
2.7.3.1 Principiul tehnicii RFLP ............................................................. 188
2.7.3.2 Enzime de restricţie..................................................................... 190
4
Autorii
8
F=G+M (ecuația 1)
1
Celulele somatice au o garnitură diploidă de cromozomi (2n) rezultată prin contopirea
materialului genetic haploid (n) al celulelor sexuale provenite de la cei doi genitori (unul
matern, celălalt patern).
15
Analiza hibridologică și moleculară în identificarea genelor și genotipurilor la
organismele superioare
denumite gene alele iar efectul lor se exprimă, de regulă, printr-un singur
caracter, deși sunt și situații în care o genă este în relație cu două caractere
diferite sau contrastante (fenomen denumit pleiotropism). În unele cazuri,
exprimarea (manifestarea) unui caracter este mai complicată decât
variantele „o genă – un caracter” sau „o genă – două caractere”, fiind
cunoscute interacțiuni între două gene ce ocupă loci diferiți pentru
codificarea unui singur caracter (Popescu-Vifor, 1978; Nicholas, 2010).
Așa cum reiese din figura 2, structura genetică a unui locus poate
cuprinde:
2
Gregor Mendel a început experimentele utilizând 34 de soiuri de plante de mazăre, dintre
care a ales 22 de varietăți diferite după culoare și mărime. Pentru cele șapte caractere
alelomorfe cunoscute astăzi ca parte din protocolul său experimental, au fost utilizate 14
linii pure ale plantelor de mazăre (Nicolae, 1986; van Gorp, 2009).
27
Analiza hibridologică și moleculară în identificarea genelor și genotipurilor la
organismele superioare
Gregor Mendel a ales un excelent subiect de studiu al eredităţii, și
anume plantele de mazăre de grădină (lat. „Pisum sativum”, 2n = 14
cromozomi), acestea fiind diferite prin caractere alelomorfe clar
contrastante (tabel 1), ajung la maturitate într-un timp scurt, produc multe
generaţii de descendenţi şi pot fi crescute pe un spaţiu restrâns. Fiecare
floare conţine atât părţi reproductive masculine cât şi feminine, în acest fel
fiind posibilă autopolenizarea. Polenizarea încrucişată poate apărea atunci
când polenul de la o floare este purtat de insecte sau de vânt la floarea altei
plante. Gregor Mendel a practicat polenizarea încrucişată prin înlăturarea
anterelor şi grăuncioarelor de polen de la o plantă, colectarea polenului de
la o altă plantă şi tranferul polenului colectat la planta cu anterele secţionate
(Alters, 2000).
Tabel 1
Caractere investigate la plantele de Pisum sativum
(Mendel, 1866)
Genotip: AA x aa
P: Fenotip: Plante de mazăre Plante de
anul I cu boabe galbene mazăre cu
boabe verzi
g: A a
Polenizare încrucișată
Genotip: Aa
F1:
Fenotip: 100% Plante de mazăre cu boabe galbene
anul II
g: A a
Autopolenizare
Gameți masculi
F2: A a
anul III g: P(A) = ½ P(a) = ½
A AA Aa
Diagrama
Gameți
femeli
Punnett
3: 1
Raport fenotipic de
P(F.d.) = P(AA) + P(Aa) = P(F.r.) = P(aa)
segregare în F2
¼+½=¾ =¼
Tabel 2
Segregarea caracterelor în încrucișarea monohibridă cu
plante de Pisum sativum (Mendel, 1866)
Hibrizii F2 Raportul
fenotipic de
Indivizi din generația parentală Hibrizii F1
Total Segregare segregare în
F2
Plante cu flori violet x Plante cu 100% plante cu flori 705 plante cu flori violet: 224 plante cu flori
929 plante 3,15:1
flori albe violet albe
Plante cu flori dispuse axial x 100% plante cu flori 651 plante cu flori dispuse axial: 207 plante cu
858 plante 3,14:1
Plante cu flori dispuse terminal dispuse axial flori dispuse terminal
Plante cu păstăi verzi x Plante cu 100% plante cu 428 plante cu păstăi verzi: 152 plante cu păstăi
580 plante 2,82:1
păstăi galbene păstăi verzi galbene
Plante cu păstăi umflate x Plante 100% plante cu 882 plante cu păstăi umflate: 299 plante cu
1181 plante 2,95:1
cu păstăi ștrangulate păstăi umflate păstăi ștrangulate
Plante cu boabe galbene x Plante 100% plante cu 258 plante cu
6022 boabe galbene: 2001 boabe verzi 3,01:1
cu boabe verzi boabe galbene 8023 boabe
Plante cu boabe netede x Plante 100% plante cu 253 plante cu
5474 boabe netede: 1850 boabe zbârcite 2,96:1
cu boabe zbârcite boabe netede 7324 boabe
Plante cu talie înaltă x Plante cu 100% plante cu talie 787 plante cu talie înaltă: 277 plante cu talie
1064 plante 2,84:1
talie pitică înaltă pitică
33
Analiza hibridologică și moleculară în identificarea genelor și genotipurilor la
organismele superioare
***
În cadrul experimentelor sale ulterioare, Gregor Mendel a urmărit
segregarea concomitentă a două caractere pornind de la indivizi atent
selecționați, puri din punct de vedere genetic sau homozigoți. Experimentul
care urmărește segregarea concomitentă a două caractere alelomorfe se
numește dihibridare.
P:
Plante de mazăre cu Plante de mazăre cu
anul I Fenotip:
boabe galbene și netede boabe verzi și
zbârcite
g: AB ab
Polenizare încrucișată
g: AB Ab aB ab
Autopolenizare
Gameți masculi
F2:
AB Ab aB ab
anul g:
P(AB) = ¼ P(Ab) = ¼ P(aB) = ¼ P(ab) = ¼
III
AB AABB AABb AaBB AaBb
P(AB) = ¼ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄
Diagrama Punnett
16 16 16 16
Gameți femeli
AABB
(1/16)
AABb
(2/16) 9/16 315 boabe galbene și
AaBB A_B_3 netede (F.d. – F.d.)
(2/16)
AaBb
(4/16)
Raport Raport
genotipic de AAbb fenotipic de
segregare: (1/16) segregare: 3/16 101 boabe galbene și
Aabb A_bb zbârcite (F.d. – F.r.)
(2/16)
aaBB
(1/16) 3/16 108 boabe verzi și netede
aaBb aaB_ (F.r. – F.d.)
(2/16)
aabb 1/16 32 boabe verzi și zbârcite
(1/16) aabb (F.r. – F.r.)
Total: 556 boabe
Tabel 4
Segregarea independentă în dihibridare a celor două sisteme alelice
3
Prin utilizarea simbolului „_” sau radical fenotipic, se asumă faptul că orice variantă
alelică ar exista în locul acestuia, nu s-ar modifica expresia fenotipică a caracterului
investigat.
36
Tabel 5
Caractere alelomorfe la plantele de mazăre și localizarea genelor
codificatoare în structura cromozomilor
(Kumar, 2000; Franklin și col., 2008)
Perechea de cromozomi
Caracterul investigat ce include în structura
sa gena codificatoare
Culoarea florilor 1
Poziționarea florilor pe lungimea tulpinei 4
Culoarea păstăii necoapte 5
Forma păstăii uscate 4
Culoarea bobului 1
Forma bobului 7
Talia plantei sau lungimea tulpinii
4
(0,5 – 1 m)
***
Pentru încrucișările trihibride, Gregor Mendel a folosit plante de
mazăre diferite prin trei perechi de caractere: forma bobului (A/a), culoarea
4
Localizarea genelor în structura aceluiași cromozom și segregarea acestora împreună sau
înlănțuită a fost demonstrată în anii următori ca fenomenul de linkage, în care nu mai are
loc libera combinare a factorilor ereditari.
37
Analiza hibridologică și moleculară în identificarea genelor și genotipurilor la
organismele superioare
acestuia - dată de structura albumenului sau endodermului (B/b) și
culoarea tegumentului seminței sau a ectodermului (C/c)5. Deși rezultatele
raportate de către acesta dovedesc segregarea independentă a celor trei
perechi de caractere6 (figura 8), unele controverse au apărut odată cu
identificarea poziției genelor în structura cromozomilor la plantele de
mazăre și stabilirea fenomenului de linkage sau de transmitere în bloc a
genelor situate în structura aceluiași cromozom (ceea ce evident, ar
împiedica segregarea independentă raportată de către Gregor Mendel). O
lămurire în acest sens aduce în anul 1975 Blixt S.G. în articolul „Why didn't
Gregor Mendel find linkage?” publicat în revista Nature, în care arată
posibilitatea de transmitere înlănțuită a genelor pentru forma păstăii uscate
și înălțimea plantelor de mazăre (care sunt situate la distanțe apropiate în
structura cromozomului 4), însă nu și în cazul acestora și a genei pentru
poziția florilor (care se regăsesc la distanțe mari în structura
cromozomului 4), sau a genelor pentru culoarea florilor și cea a bobului,
regăsite în structura cromozomilor perechii întâia. Oricum, faptul că
Mendel nu a publicat niciodată date care să ateste fenomenul de linkage
arată că, cel mai probabil, astfel de încrucișări care să implice gene așezate
în loci apropiați au fost evitate involuntar, la acea vreme nefiind cunoscută
plasarea genelor în structura fiecărui cromozom în parte (Blixt, 1975).
5
Caracterul de culoare al tegumentului seminței de mazăre este codificat de o genă
responsabilă și de coloritul florilor. În acest fel, plantele de mazăre cu flori violet au
tegumentul de culoare gri-maronie iar cele cu florile albe au tegumentul alb (fenomenul
de pleiotropism).
6
Raportul fenotipic de segregare de 27:9:9:9:3:3:3:1 corespunde la (3+1)3 = (3A+1a)
(3B+1b) (3C+1c) = 27 ABC, 9 ABc, 9 AbC, 9 aBC, 3 Abc, 3 aBc, 3 abC, 1 abc (ecuația
3), pe baza obținerii a câte 8 tipuri de gameți de la fiecare individ triheterozigot: ABC,
ABc, AbC, aBC, Abc, aBc, abC, abc.
38
g: ABC abc
F1 : Genotip: AaBbCc
anul
Fenotip: 100% Plante cu bobul neted, galben și cu tegumentul gri-maroniu
II
Autopolenizare
g: ABC ABc AbC aBC Abc aBc abC abc
Fig.8: Schema segregării caracterelor în experimentele de trihibridare pentru exemplul plantelor de mazăre
diferite după caracterele de formă a bobului, de culoare a acestuia și de culoare a tegumentului seminței
39
Gameți masculi
F2: ABC ABc AbC aBC Abc aBc abC abc
anul g: P(ABC) = P(ABc) = P(AbC) = P(aBC) = P(Abc) = P(aBc) = P(abC) = P(abc) =
III 1/8 1/8 1/8 1/8 1/8 1/8 1/8 1/8
ABC AABBCC AABBCc AABbCC AaBBCC AABbCc AaBBCc AaBbCC AaBbCc
P(ABC) = 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄
1/8 64 64 64 64 64 64 64 64
ABc AABBCc AABBcc AABbCc AaBBCc AABbcc AaBBcc AaBbCc AaBbcc
P(ABc) = 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄
1/8 64 64 64 64 64 64 64 64
AbC AABbCC AABbCc AAbbCC AaBbCC AAbbCc AaBbCc AabbCC AabbCc
P(AbC) = 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄
1/8 64 64 64 64 64 64 64 64
Diagrama Punnett
Gameți femeli
***
Rezultatele experimentelor Mendeliene pot fi generalizate pe baza
unor algoritmi de calcul.
unde,
...
...
...
n 2n 2n 3n
Genotip: AA x aa
P: INDIVIZI DE INDIVIZI TEST-
anul I ANALIZAT CROSS
Fenotip:
Plante de mazăre cu Plante de mazăre cu
boabe galbene boabe verzi
g: A a
Polenizare încrucișată
Fb: Genotip: Aa
anul II Fenotip: 100% Plante de mazăre cu boabe galbene
Genotip: Aa x aa
INDIVIZI DE INDIVIZI TEST-
P:
ANALIZAT CROSS
anul I Fenotip:
Plante de mazăre cu Plante de mazăre cu
boabe galbene boabe verzi
g: A a a
Polenizare încrucișată
Gameți masculi
A a
g:
P(A) = ½ P(a) = ½
Fb:
Gameți
femeli
anul II a Aa aa
P(a) = 1 P(Aa) = ½ P(aa) = ½
1: 1
Raport fenotipic de
Plante de mazăre cu boabe Plante de mazăre cu boabe
segregare
galbene verzi
Fig.9: Posibilități de segregare în cazul retroîncrucișării plantelor de
mazăre cu fenotip dominant diferite printr-o singură pereche de caractere
(culoarea bobului)
44
g: AB ab
Polenizare încrucișată
Fb: Genotip: AaBb
anul II Fenotip: 100% Plante de mazăre cu boabe galbene și netede
ab aaBb
Diagr. AaBb Aabb aabb
P(ab) = P(aaBb)
Punnett P(AaBb)= ¼ P(Aabb)=¼ P(aabb) = ¼
1 =¼
1:
1: 1: 1
Plante de
Plante de Plante de Plante de
mazăre cu
Raport de segregare mazăre cu mazăre cu mazăre cu
boabe
(genotipic, fenotipic) boabe boabe verzi boabe verzi și
galbene și
galbene și și netede zbârcite
zbârcite
netede
Fig.10: Posibilități de segregare în cazul retroîncrucișării plantelor de
mazăre cu fenotip dominant diferite prin două perechi de caractere
45
Analiza hibridologică și moleculară în identificarea genelor și genotipurilor la
organismele superioare
Tabel 7
Algoritm de calcul în vederea stabilirii numărului de gameți produși de
către hibrizii F1, și al claselor fenotipice și genotipice din F2, în funcție de
numărul perechilor de gene pentru care se aplică retroîncrucișarea
Numărul gameților
Numărul Numărul Numărul
produși de indivizii
perechilor de claselor claselor
de analizat (ce au
gene care fenotipice în genotipice în
structură
segregă Fb Fb
heterozigotă)
1 2 2 2
2 4 4 4
3 8 8 8
4 16 16 16
...
...
...
...
n 2n 2n 2n
unde,
n = numărul caracterelor alelomorfe independente codificate de
„n” perechi de gene alele A/a, B/b ...V/v.
46
7
Hugo de Vries (1848-1935) în Olanda, Carl Correns (1864-1933) în Germania și Erich
von Tschermak (1871-1962) în Austria.
48
Tabel 8
Caractere alelomorfe la plante și la animale ce respectă segregarea de tip Pisum
Variații fenotipice
Specia Caracterul investigat Referințe bibliografice
Fenotip dominant Fenotip recesiv
La plante
Prezența „perilor”
pe suprafața Tulpina rugoasă Tulpina netedă
Nicolae, 1986
tulpinii
Tomate – lat. Talia plantei Plantă înaltă Plantă pitică
„Solanum Culoarea fructului Tomate roșii Tomate galbene van Bueren și Myers, 2012
lycopersicum” Aspectul marginii Frunze dantelate Frunze nedantelate Nicolae, 1986;
frunzei („de tomate”) („de cartof”) van Bueren și Myers, 2012
Compartimentarea Bateson, 1909;
Fruct cu două loje Fruct cu mai multe loje
fructului Nicolae, 1986
Culoarea florilor Flori violacee Flori albe
Culoarea
Soia – lat.
perișorilor de pe Nicolae, 1986
„Glycine max” Perișori roșcați Perișori argintii
tulpină, frunze,
păstaie
Sângele Organizarea florii Antere normale Antere sterile
voinicului – lat.
Bateson, 1909
„Lathyrus Talia plantei Plantă înaltă Plantă pitică
odoratus”
49
Tabel 8
Caractere alelomorfe la plante și la animale ce respectă segregarea de tip Pisum (continuare)
8
Animalul folosește în același timp un membru dinainte și cel opus dinapoi.
9
Animalul folosește în același timp membrele de pe aceeași parte a corpului.
50
Tabel 8
Caractere alelomorfe la plante și la animale ce respectă segregarea de tip Pisum (continuare)
10
Culoarea neagră este un fenotip dominant în cazul încrucișărilor ce includ rase cu o asemenea varietate (de exemplu: Angus, Brangus,
Holstein Friesian, Simmental, Galloway). La rasa Galloway, prezența unui brâu de culoare albă în jurul abdomenului este, de asemenea,
un fenotip dominant (Dagoon, 1989; Flanders și Gillespie, 2016).
11
Lipsa coarnelor este un fenotip dominant în cazul încrucișărilor ce includ una din rasele la care în mod natural coarnele lipsesc [de
exemplu: American White Park, Amerifax (Angus x Friesian), Angus, Belted Galloway, Brangus (Angus x Brahman), British White,
Galloway, Jamaica Red, Murray Grey, Red Poll, Senepol] (Flanders și Gillespie, 2016).
12
Deși este general acceptată dominanța culorii albe la ovine, în anul 1921, Duck R.W. raportează dominanța culorii negre la rasa
Karakul și a altor trei caractere legate de prezența buclelor, densitate și luciu.
51
Tabel 8
Caractere alelomorfe la plante și la animale ce respectă segregarea de tip Pisum (continuare)
13
Culoarea albă este dominantă asupra celorlalte culori doar la porcul european. La porcul din India, culoarea neagră este dominantă
față de culoarea albă (Nicolae, 1986).
52
14
La câine, caracterul de culoare a părului este codificat de alele ce aparțin la mai mult de un locus, între care există relații specifice,
evidente în încrucișările efectuate în interiorul raselor. De exemplu, la rasa de câine Ciobănesc German, culoarea părului este
determinată de alelele locusului „agouti”, în care culoarea cafenie este dominantă asupra tipului negru-roșcat, care la rându-i domină
linia de culoare neagră (tipul cafeniu fiind considerat de unii autori cu varietățile de la cafeniu roșiatic la gri deschis iar de alții ca tip
diferit de cel de culoare sură, în acest caz culoarea cafenie transmițându-se dominant față de cea sură). Pe de altă parte, la rasa Labrador
Retriever, culoarea părului este determinată de alelele „locusului B”, culoarea neagră fiind dominantă asupra celei maro, în condițiile
prezenței unei alele dominante „E” la locusul de „extensie” ce determină colorarea părului și a pielii. În condițiile genotipului „ee” la
acest locus, indivizii vor fi cu părul și pielea de culoare crem (bbee) sau cu părul de culoare crem și pielea de culoare neagră (B_ee)
(segregarea acestor gene urmărind principiul transmiterii independente a perechilor de caractere) (Sponenberg și Rothschild, 2001;
Morford, 2014).
53
Tabel 8
Caractere alelomorfe la plante și la animale ce respectă segregarea de tip Pisum (continuare)
15
Lipsa cozii este un fenotip dominant în cazul încrucișărilor ce includ una din rasele la care în mod natural coada lipsește sau este de
dimensiuni reduse (de exemplu: Boxer, Ciobănescu Australian) (Ackerman, 2011).
16
Lipsa cozii este un fenotip dominant asociat cu letalitatea pisicilor Manx cu genotip homozigot dominant „AA” datorită incompletei
sudări a arcului vertebral („spina bifidă”) (Bateson, 1909; Benirschke și col., 1978).
54
Variații fenotipice
Specia Caracterul investigat Referințe bibliografice
Fenotip dominant Fenotip recesiv
La animale
Absența / prezența
Pisică – lat. Absența degetelor Bateson, 1909;
degetelor Polidactilism
„Felis catus” suplimentare Leipold și Morris, 1979
suplimentare
Absența / prezența
părului Prezența părului Absența părului Bateson, 1909
(*șoarece)
Lungimea părului
Păr lung Bateson, 1909;
(*iepure, porc de Păr scurt
(tip „Angora”) Adds și col., 2004
Guineea, șoarece)
Culoarea părului
Culoarea neagră Culoarea maro/gri Archunan, 2004
(*porc de Guineea)
Animale de
Aspetul părului
laborator Păr aspru Păr neted Bateson, 1909
(*porc de Guineea)
Talie pitică
Talia individului
Talie normală (în achondroplastie,
(*șoarece)
piticism pituitar)
Benirschke și col., 1978
Lungimea urechilor
Urechi normal
(*șoarece) Urechi scurte
dezvoltate
55
Tabel 8
Caractere alelomorfe la plante și la animale ce respectă segregarea de tip Pisum (continuare)
17
Polidactilia este un caracter care se transmite după model autozomal dominant, însă
manifestarea sa cade sub incidența penetranței și expresivității, în sensul în care nu toți
indivizii cu gena dominantă prezintă în mod obligatoriu degete suplimentare (penetranță),
la fel cum și numărul degetelor suplimentare și localizarea lor la membrele anterioare sau
posterioare pot diferi în cadrul populației de indivizi (expresivitate).
59
Analiza hibridologică și moleculară în identificarea genelor și genotipurilor la
organismele superioare
Reacțiile de incompatibilitate materno-fetală se traduc prin
sindroame hemolitice care afectează fătul, cunoscute sub diverse denumiri
precum: icterus gravis neonatorum, hydrops fetalis, erythroblastosis
fetalis. Acestea afectează fătul Rh+ ce aparține celei de-a doua sarcini, la
prima sarcină cu făt Rh+ mama neavând anticorpi naturali împotriva
antigenului RhD (spre deosebire de antigenele sistemului de grup sangvin
ABO care sunt complementate cu anticorpi naturali, antigenul RhD nu are
anticorpi naturali). Aceștia vor fi produși în sângele mamei cu ocazia
amestecării sângelui fetal cu cel maternal în timpul nașterii. Pentru a
preveni imunizarea mamei și eritroblastoza fetală la următoarele sarcini cu
fetuși Rh+, în primele 72 de ore de la nașterea primului copil Rh+ aceasta
va primi o imunoglobulină anti-D (Damjanov, 2016).
18
Kb (Kilobaza) este o unitate de măsură a lungimii acizilor nucleici, o kilobază
cuprinzând 1000 perechi de nucleotide (asumate drept „baze azotate”).
64
19
Florile albe ale plantelor de Antirrhinum majus au culoarea fildeșului.
20
Se consideră că pentru culoarea roșie a florilor de Antirrhinum majus este necesară
acțiunea concomitentă a două gene dominante „A” și „A” într-un singur genotip
(homozigot dominant – „AA”). Indivizii heterozigoți („Aa”) sunt de culoare roz ca
rezultat al înjumătățirii cantității de enzimă activă ce asigură formarea pigmentului numit
anthocyanină, doar una din cele două gene alele fiind responsabilă indirect de sinteza
acestuia. La indivizii homozigoți recesivi, cantitatea de pigment este nulă datorită faptului
că alela „a” în genotip „aa” se exprimă fenotipic prin codificarea unei enzime în formă
inactivă ce nu asigură formarea de pigment (Hartl, 2011).
65
Analiza hibridologică și moleculară în identificarea genelor și genotipurilor la
organismele superioare
Genotip: AA x aa
P: Plante cu flori
Fenotip: Plante cu flori roșii
albe
g: A a
Genotip: Aa
F1: Fenotip: 100% Plante cu flori roz
Gameți masculi
A a
F2: g:
P(A) = ½ P(a) = ½
A AA Aa
Gameți femeli
Diagrama
a Aa aa
P(a) = ½ P(Aa) = ¼ P(aa) = ¼
Genotipuri și AA aa
Aa
fenotipuri în F2 Plante cu flori Plante cu flori
Plante cu flori roz
roșii albe
Raport genotipic și
1: 2: 1
fenotipic de
P(AA) = ¼ P(Aa) = ¼ + ¼ = ½ P(aa) = ¼
segregare în F2
g: AB ab
Genotip: AaBb
F1: Fenotip: 100% Plante cu flori roz și frunze intermediar de late
Gameți masculi
AB Ab aB ab
F2: g:
P(AB) = ¼ P(Ab) = ¼ P(aB) = ¼ P(ab) = ¼
AB AABB AABb AaBB AaBb
P(AB) = ¼ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄
16 16 16 16
Diagrama Punnett
P(Ab) = ¼ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄
16 16 16 16
aB AaBB AaBb aaBB aaBb
P(aB) = ¼ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄
16 16 16 16
ab AaBb Aabb aaBb aabb
P(ab) = ¼ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄
16 16 16 16
Tabel 10
Raporturi de segregare pentru două sisteme alelice care respectă
mecanismul dominanței incomplete (exemplul plantelor de Antirrhinum
majus diferite după culoarea florilor și forma frunzelor)
AABB
P(AABB) = 𝟏⁄𝟏𝟔
Plante cu flori roșii și frunze late
AABb
P(AABb) = 2⁄16
Plante cu flori roșii și frunze intermediar de late
AaBB
P(AaBB)= 2⁄16
Plante cu flori roz și frunze late
AaBb
P(AaBb) = 4⁄16
Plante cu flori roz și frunze intermediar de late
Raporturi de AAbb
segregare P(AAbb) = 1⁄16
(genotipic, fenotipic): Plante cu flori roșii și frunze înguste
Aabb
P(Aabb) = 2⁄16
Plante cu flori roz și frunze înguste
aaBB
P(aaBB) = 1⁄16
Plante cu flori albe și frunze late
aaBb
P(aaBb) = 2⁄16
Plante cu flori albe și frunze intermediar de late
aabb
P(aabb) = 1⁄16
Plante cu flori albe și frunze înguste
2.4.1.3 Codominanța
Tabel 11
Variantele alelice și genotipurile / fenotipurile identificate la locii
proteinelor majore din lapte prin tehnica electroforezei cu focalizare
izoelectrică (IEF – engl. „Isoelectric Focusing”)
(Grădinaru și col., 2013)
Locusul Alele Genotipuri / fenotipuri
investigat identificate identificate
αS1 cazeina B, C BB, BC
A1A1, A1A2, A1B, A2A2, A2B,
β cazeina A1, A2, B, C
A2C, BB
κ cazeina A, B, E AA, AB, AE, BB, BE, EE
β lactoglobulina A, B, D AA, AB, AD, BB, BD
Tabel 12
Genotipuri / fenotipuri în sistemul AB0 de grupe sangvine la om
(interpretare imunologică) (Hartl, 2011)
Antigeni
Anticorpi
pe suprafața
Nr.crt. Fenotip Genotip în plasmă
eritrocitului
(aglutinine)
(aglutinogene)
Anti-A (α) și
I 0 ii -
Anti-B (β)
II A IAIA IAi Tipul A Anti-B (β)
III B IBIB IBi Tipul B Anti-A (α)
IV AB IAIB Tipul A și Tipul B -
2.4.1.4 Supradominanța
Genotip: AA x aa
P: Plante de Plante de
anul I Fenotip: mazăre cu talie mazăre cu talie
înaltă (6 ft.) pitică (1 ft.)
g: A a
Polenizare încrucișată
F1: Genotip: Aa
anul II Fenotip: 100% Plante de mazăre cu talie mai înaltă (6-7,5 ft.)
g: A a
Autopolenizare
Gameți masculi
F2: A a
g:
anul III P(A) = ½ P(a) = ½
A AA Aa
Gameți femeli
Diagrama
Punnett
22
În acest sens, în anul 1914, Shull G.M. propune înlocuirea termenului de
„heterozygosis” cu cel de „heterozis” (Shull, 1948).
75
Analiza hibridologică și moleculară în identificarea genelor și genotipurilor la
organismele superioare
care nu au ocazia să se manifeste în structura ascendenților lor
(Drăgănescu, 1979; Lupașcu și col., 2013). Spre deosebire de fenomenul
transgresiei, heterozisul se manifestă doar la populațiile F1 și back-cross,
și are la bază interacțiuni genice neaditive (dominanță, supradominanță,
epistazie23). După cum valoarea performanțelor hibrizilor depășește fie
doar valoarea formelor parentale fie atât valoarea formelor parentale și
media populației din care acestea fac parte, heterozisul se clasifică în
cisheterozis și respectiv, transheterozis (Drăgănescu, 1979; Ivancia,
2005).
Un exemplu al supradominanței face referire la indivizii
heterozigoți (codominanți) pentru genele β globinei (Shukla, 2009). În
zonele în care malaria este întâlnită, aceștia au o rată mai mare de
supraviețuire comparativ cu ambele tipuri homozigote (indivizii normali cu
genotip „HbAHbA” și cei afectați, cu genotip „HbSHbS”) (Allison, 2004
apud Frankham și col., 2009), dezavantajul homozigoților coexistând la
nivel de populație cu avantajul heterozigoților („polimorfism balansat”)
(Luzzatto, 2012). Studiile de până acum au încercat să explice acest
mecanism al rezistenței și se pare că hemoglobina de tip S nu constituie un
impediment pentru parazitul genului Plasmodium de a invada celulele roșii
ale sângelui ci, mai degrabă, odată ce parazitul determină modificarea
conformației eritrocitelor, acestea sunt imediat înlăturate de către
macrofage (studiile clinice au demonstrat o creștere a ratei de fagocitare
a celulelor în semilună parazitate) (Beet, 1946; Luzzatto și col., 1970;
Nagel, 1990 apud Luzzatto, 2012).
2.4.1.5 Letalitatea
23
Epistazia - vezi cap. „Interacțiuni dintre genele nealele”.
76
g: Ay Aw Ay Aw
Raport genotipic de
Ay Aw
F1: g: ♀/♂ y w segregare în populația
P(A ) = ½ P(A ) = ½
indivizilor viabili:
A yA y A yA w
y
A A yA w AwAw
y
P(A ) = ½ P(AyAy) = ¼ P(AyAw) = ¼ 2/3 : 1/3
șoareci de șoareci de
Diagrama Punnett
culoare culoare
galbenă - letali galbenă
Raport fenotipic de
segregare în populația
A yA w AwAw
indivizilor viabili:
Aw
P(AyAw) = ¼ P(AwAw) = ¼ 1/3
P(Aw) = ½
șoareci de șoareci de 2/3: șoareci
culoare culoare șoareci de de
galbenă agouti culoare culoare
galbenă agouti
24
pb – perechi de baze azotate (perechi de nucleotide).
25
Notocord - scheletul axial primitiv al embrionului la cordate care îndeplinește rol de
coloană veterbrată pentru un interval limitat de timp, după care dispare și începe procesul
de formare a vertebrelor datorită multiplicării celulelor (Confederat și Solcan, 2002).
26
Haploinsuficiență secretorie consecutivă prezenței unei singure alele ce codifică
proteina normală.
27
Mezodermul reprezintă una dintre cele trei foițe embrionare primordiale ale
embrionului, din care se vor dezvolta mușchii netezi și cei striați, aparatele urinar,
respirator, circulator, epiteliul tubului digestiv, țesuturile conjunctiv, cartilaginos și osos,
glandele genitale și conductele lor, glandele cortico-suprarenale, pleura și organele
limfoide (Confederat și Solcan, 2002).
80
28
Condrodistrofie caracterizată clinic printr-un deficit de creștere al oaselor lungi, degete
scurte, macrocefalie sau creșterea anormală a volumului capului.
29
Acondroplazia la om are, de asemenea, caracter de boală autozomal dominantă, fiind
determinată de o mutație în structura genei Receptorului de creștere 3 (FGFR3 – engl.
„Fibroblast Growth Factor Receptor) cu localizare în structura brațului scurt al
cromozomului 4 (Genetics Home Reference, 2018).
82
2.4.1.6 Pleiotropismul
Genotip: AA x aa
Plante de mazăre cu
P: Plante de mazăre
flori violet și
anul I Fenotip: flori albe și tegument
tegument colorat al
alb al bobului
bobului
g: A a
Polenizare încrucișată
Genotip: Aa
F1: 100% Plante de mazăre cu flori violet și tegument colorat al
Fenotip:
anul II bobului
g: A a
Autopolenizare
Gameți masculi
F2: A a
anul III g: P(A) = ½ P(a) = ½
A AA Aa
Diagrama
Gameți
Punnett
femeli
3: 1
Raport fenotipic de
P(F.d.) = P(AA) + P(Aa) = ¼ + ½ = ¾ P(F.r.) = P(aa) = ¼
segregare în F2
30
Culoarea pisicilor siameze este cosiderată tot o formă de albinism (albinism parțial),
determinată de o altă variantă mutantă a genei TYR decât cea responsabilă de albinismul
oculo-cutanat complet, mutantă care nu funcționează normal la temperatura obișnuită a
corpului (mutantă „termo-sensibilă”, culoarea neagră fiind caracteristică doar zonelor
care sunt mai reci decât restul corpului).
86
Pe lângă varianta celui mai simplu sistem alelic format dintr-o alelă
dominantă și o alta recesivă („A” și „a”), unul și același locus poate fi
ocupat alternativ de multe alte alele apărute în urma mutațiilor succesive
87
Analiza hibridologică și moleculară în identificarea genelor și genotipurilor la
organismele superioare
ale genei de tip sălbatic „A” în cursul evoluției organismelor (de exemplu:
A→a1→a2→a3→a4→...→an). Astfel de succesiuni alelice poartă
denumirea de serii polialelice (alelism multiplu, polialelism). Cele „n”
variante alelice mutante nu vor fi regăsite niciodată la un singur individ, ci
alternativ la indivizii speciei respective, între acestea stabilindu-se, de cele
mai multe ori, un raport de dominanță completă (indivizii heterozigoți
manifestă caracterul uneia dintre alele) (Bucătaru, 1993).
Tabel 13
Ordinea dominanței, genotipurile și fenotipurile seriei polialelice a
locusului „A” la șoarece
Ordinea Variante
Genotipuri Fenotipuri
dominanței alelice
AyAy – letal
AyAvy
Ay
AyAw
Culoarea galbenă
Aya a părului
AvyAvy
Avy AvyAw
Avya
AwAw Culoarea agouti a
Aw părului
Awa
Culoarea neagră a
a aa părului
Ordinea Variante
Genotipuri Fenotipuri
dominanței alelice
CC, Ccchd, Complet pigmentat
Ccchm, (castaniu, negru, negru
C Ccchl, „carapace de broască
Cch, țestoasă”, albastru,
Cc portocaliu, violet)
cchdcchd,
cchdcchm,
Chinchilla întunecat („chd”
cchd cchdcchl,
- engl.„dark chinchilla”)
cchd ch,
cchdc
cchmcchm,
Chinchilla intermediar
cchmcchl,
cchm („chm” - engl. „medium
cchmch,
chinchilla”)
cchmc
cchlcchl, Chinchilla deschis
cchl cchlch, („chl” - engl. „light
cchlc chinchilla”)
Himalayan (alb cu
chch, extremități negre)
ch
chc („h” - engl.
„himalayan”)
Albino (complet
c cc
depigmentat)
2.4.2.1 Complementaritatea
g: Ab aB
Genotip: AaBb
F1:
Fenotip: 100% plante cu flori violet
Gameți masculi
AB Ab aB ab
F2: g:
P(AB) = ¼ P(Ab) = ¼ P(aB) = ¼ P(ab) = ¼
AB AABB AABb AaBB AaBb
P(AB) = ¼ (1/16) (1/16) (1/16) (1/16)
Diagrama Punnett
Gameți femeli
Numărul
Numărul indivizilor
Categorii indivizilor
(frecvențe așteptate conform
fenotipice (frecvențe
raportului teoretic de 9/3/3/1)
observate)
A_B_ 111 106,9
A_bb 37 35,6
aaB_ 34 35,6
aabb 8 11,9
Total 190 190
g: Ab aB
Genotip: AaBb
F 1:
Fenotip: 100% Păsări cu creastă nuciformă
AaBb AaBb
x
g: AB Ab aB ab AB Ab aB ab
Gameți masculi
AB Ab aB ab
F 2: g:
P(AB) = ¼ P(Ab) = ¼ P(aB) = ¼ P(ab) = ¼
AB AABB AABb AaBB AaBb
(1/16) (1/16) (1/16) (1/16)
Diagrama Punnett
P(AB) = ¼
Gameți femeli
2.4.2.2 Epistazia
31 Celulele mezenchimale aparțin țesutului conjunctiv embrionar, fiind „cap de serie” pentru
formarea ulterioară a țesuturilor sangvin și muscular (Confederat și Solcan, 2002).
98
a) Epistazia de dominanță
g: Ge gE
Genotip: GgEe
F 1:
Fenotip: 100% Indivizi de culoare sură
GgEe GgEe
x
g: GE Ge gE ge GE Ge gE ge
Gameți masculi
GE Ge gE ge
F 2: g:
P(GE) = ¼ P(Ge) = ¼ P(gE) = ¼ P(ge) = ¼
GE GGEE GGEe GgEE GgEe
(1/16) (1/16) (1/16) (1/16)
Diagrama Punnett
P(GE) = ¼
Gameți femeli
b) Epistazia de recesivitate
g: AwBC aBc
9/16 Indivizi de
Aw_ BBC_ culoare agouti
3/16 Indivizi de
Raport fenotipic de segregare: aaBBC_ culoare neagră
3/16
Aw_ BBcc Indivizi
1/16 „albino”
aaBBcc
g: A1A2A3 a1a2a3
Genotip: A1a1A2a2A3a3
F1 :
Fenotip: 100% Plante de grâu cu bobul roz
Fig.21: Schema segregării caracterului de culoare a bobului la plantele de grâu în interacțiunea polimeră aditivă
108
P(a1A2A3) 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄
= 1/8 64 64 64 64 64 64 64 64
A1a2a3 A1A1A2a2A3a3 A1A1A2a2a3a3 A1A1a2a2A3a3 A1a1A2a2A3a3 A1A1a2a2a3a3 A1a1A2a2a3a3 A1a1a2a2A3a3 A1a1a2a2a3a3
P(A1a2a3) 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄
= 1/8 64 64 64 64 64 64 64 64
a1A2a3 A1a1A2A2A3a3 A1a1A2A2a3a3 A1a1A2a2A3a3 a1a1A2A2A3a3 A1a1A2a2a3a3 a1a1A2A2a3a3 a1a1A2a2A3a3 a1a1A2a2a3a3
P(a1A2a3) 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄
= 1/8 64 64 64 64 64 64 64 64
a1a2A3 A1a1A2a2A3A3 A1a1A2a2A3a3 A1a1a2a2A3A3 a1a1A2a2A3A3 A1a1a2a2A3a3 a1a1A2a2A3a3 a1a1a2a2A3A3 a1a1a2a2A3a3
P(a1a2A3) = 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄
1/8 64 64 64 64 64 64 64 64
a1a2a3 A1a1A2a2A3a3 A1aA2a2a3a3 A1a1a2a2A3a3 a1a1A2a2A3a3 A1a1a2a2a3a3 a1a1A2a2a3a3 a1a1a2a2A3a3 a1a1a2a2a3a3
P(a1a2a3) = 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄ 1⁄
1/8 64 64 64 64 64 64 64 64
Fig.21: Schema segregării caracterului de culoare a bobului la plantele de grâu în interacțiunea polimeră aditivă
(continuare)
109
Analiza hibridologică și moleculară în identificarea genelor și genotipurilor la
organismele superioare
În anul 1913, Rollins A. Emerson (1873-1947) și Edward M. East
(1879-1939), efectuând încrucișări cu plante de porumb, asumă un model
de transmitere poligenică a caracterului de lungime a știuletelui pe baza
măsurătorilor efectuate la indivizii generațiilor P, F1 și F2. Așadar,
încrucișând varietatea „Tom Thumb”, la care lungimea știuletelui variază
între 5 și 8 cm, cu o medie de 6,6 cm, cu varietatea „Black Mexican”, la
care lungimea știuletelui variază între 13 și 21 cm, cu o medie de 16,8 cm,
hibrizii F1 au avut știuletele cu o lungime intermediară (între 9 și 10 cm).
La hibrizii F2, lungimea știuletelui a variat între 7 și 19 cm, cu o medie
apropiată de fenotipul generației F1 și fenotipurile extreme similare cu cele
din generația parentală. Bazându-se pe rezultatele obținute, autorii
studiului au considerat că în codificarea caracterului de lungime a
știuletelui la porumb intervin două perechi de gene, contribuția fiecărei
alele în codificarea caracterului investigat fiind calculată astfel:
32
În transmiterea poligenică, numărul categoriilor fenotipice din F2 este dat de relația 2n+1, unde
„n” reprezintă numărul perechilor de gene implicate în codificarea caracterului (Arora, 2006).
111
Analiza hibridologică și moleculară în identificarea genelor și genotipurilor la
organismele superioare
Genotip: AABB x aaBB
P: Plante cu fructe Plante cu fructe
Fenotip:
triunghiulare ovoidale
g: AB ab
Genotip: AaBb
F1:
Fenotip: 100% plante cu fructe ovoidale
Gameți masculi
AB Ab aB ab
F2: g:
P(AB) = ¼ P(Ab) = ¼ P(aB) = ¼ P(ab) = ¼
AB AABB AABb AaBB AaBb
(1/16) (1/16) (1/16) (1/16)
Diagrama Punnett
P(AB) = ¼
Gameți femeli
15
4 4
1 1
1
Fig.23: Histogramele distribuției fenotipice în F2 în polimeria aditivă /
neaditivă cu două gene implicate în codificarea unui caracter (după Neal,
2004; Arora, 2006)
113
Analiza hibridologică și moleculară în identificarea genelor și genotipurilor la
organismele superioare
g: AB ab
Polenizare încrucișată
Genotip: AaBb
F 1: 100% Plante cu flori purpurii și grăuncioare de polen
Fenotip:
alungite
AB Ab
g: ab
aB ab
g:
Fb: AB Ab aB Ab
♂/♀
Diagr.
ab AaBb Aabb aaBb aabb
Punnett
Plante cu
Plante cu flori Plante cu flori
flori Plante cu flori
purpurii și roșii și
purpurii și roșii și
Fenotip: grăuncioare grăuncioare
grăuncioare grăuncioare de
de polen de polen
de polen polen alungite
alungite rotunde
rotunde
Tabel 17
Compararea frecvențelor observate cu cele așteptate în cazul
încrucișărilor dintre plantele de Lathyrus odoratus diferite după
caracterele de culoare a florilor și formă a grăuncioarelor de polen
Plante cu flori
Plante cu flori Plante cu flori Plante cu flori
roșii și
purpurii și purpurii și roșii și
Fenotip: grăuncioare
grăuncioare de grăuncioare de grăuncioare de
de polen
polen alungite polen rotunde polen alungite
rotunde
Frecvențele
43,7 6,3 6,3 43,7
observate (%)
Frecvențele
25 25 25 25
așteptate (%)
Raport de
segregare 7: 1: 1: 7
(observat)
Raport de
segregare 1: 1: 1: 1
(așteptat)
g: AB ab
Genotip: AaBb
F1:
Fenotip: 100% Musculițe cu corp cenușiu și aripi normal dezvoltate
g: AB Ab
ab
aB ab
g:
Fb: AB Ab aB ab
♂/♀
Diagr.
ab AaBb Aabb aaBb aabb
Punnett
Musculițe cu
Musculițe cu Musculițe cu Musculițe cu
corp cenușiu
corp cenușiu corp negru și corp negru și
Fenotip: și aripi
și aripi aripi normal aripi
normal
vestigiale dezvoltate vestigiale
dezvoltate
Tipuri de combinări
Parentale Recombinate Recombinate Parentale
ale genelor:
Tabel 18
Compararea frecvențelor observate cu cele așteptate în cazul
încrucișărilor dintre musculițele de oțet diferite după caracterele de
culoare a corpului și de mărime a aripilor, unde indivizii de analizat sunt
de sex femel
Musculițe cu Musculițe
Musculițe cu Musculițe cu
corp cenușiu cu corp
corp cenușiu corp negru și
Fenotip și aripi negru și
și aripi aripi normal
normal aripi
vestigiale dezvoltate
dezvoltate vestigiale
Frecvențele
41,5 8,5 8,5 41,5
observate (%)
Frecvențele
25 25 25 25
așteptate (%)
Raport de
segregare 5: 1: 1: 5
(observat)
Raport de
segregare 1: 1: 1: 1
(așteptat)
g: AB ab ab
g:
Fb: AB ab
♂/♀
Diagr.
ab AaBb aabb
Punnett
Musculițe cu corp cenușiu Musculițe cu corp negru și aripi
Fenotip:
și aripi normal dezvoltate vestigiale
Tipuri de combinări
Parentale Parentale
ale genelor:
33
Distanța dintre gene se exprimă în unități de recombinare sau unități centiMorgan – cM. O
unitate de recombinare = 1% frecvență de crossing-over = 1 crossing-over apărut la fiecare 100 de
gameți formați. 100 cM = 1M (M – unitate Morgan) (Ziegler și König, 2010).
124
(1) a 8 b 10 c
(2) c 10 b 22 d
(3) c 30 e2d
(1) a 8 b 10 c
(2) d 22 b 10 c
(3) d 2 e 30 c
Se combină cele trei segmente sub forma unei singure hărți genetice.
Distanța a – d = (d – b) – (a – b) = 22 – 8 = 14
Distanța a – e = (a – d) – (d – e) = 14 – 2 = 12
d2e 12 a 8 b 10 c
Tabel 20
Calculul mediei ponderate pentru aprecierea corectă a distanței dintre
gene în urma mai multor experimente
Experiment N D N*D
1 N1 D1 N1*D1
2 N2 D2 N2*D2
3 N3 D3 N3*D3
...
...
...
...
n Nn Dn Nn*Dn
Total Nt - ΣN*D
N *D
XD =
NT
NT = N1 + N2 + N3 + ... + Nn
N * D = ( N * D ) +( N
1 1 2 * D2 ) + ( N3 * D3 ) + ... + ( N n * Dn )
unde,
N1, N2, N3…Nn = numărul de indivizi analizați în cadrul fiecărui
experiment de retroîncrucișare;
D1, D2, D3…Dn = distanța dintre gene obținută în urma efectuării
experimentelor 1, 2, 3…n de retroîncrucișare.
34În medie 1 cM = ~0,88 Mb; la masculii mamiferelor 1cM = 1,05 Mb iar la femelele mamiferelor
1 cM = 0,70 Mb (Ziegler și König, 2010).
129
Analiza hibridologică și moleculară în identificarea genelor și genotipurilor la
organismele superioare
nefiind diferențe semnificative dacă distanța dintre gene este mai mică de
15 cM (distanță la care sunt atât de puțini dublu recombinanți încât
frecvența de recombinare exprimată în % este egală cu distanța genetică
exprimată în cM):
▪ funcția Haldane – pornește de la premiza că nu există
interferență, crossing-overul având loc independent de producerea în
vecinătate a unui alt crossing-over. În acest caz, distanța dintre gene se
calculează astfel:
1
D(cM ) = − ln(1 − 2r ) (ecuația 10)
2
unde,
r = rata recombinărilor exprimată în %.
35
Spre deosebire de cele prezentate, Ostrer (1998) menționează trei modele diferite de
transmitere în descendență a acestei afecțiuni: autozomal dominant, autozomal recesiv și
legat de cromozomul sexual X (X-linkat), datorate mutațiilor suferite de gene diferite din
structura genomului uman. De exemplu, transmiteri autozomal dominante au fost
raportate în cazul mutațiilor genelor rodopsinei din structura cromozomului 3, genei
periferinei din structura cromozomului 6 și a încă unei gene neidentificate din structura
cromozomului 8. Transmiterea legată de cromozomul sexual X (X-linkată) are la bază
mutația a cel puțin două gene diferite din structura acestuia. Fenomenul în care mai multe
gene diferite participă la codificarea aceluiași fenotip se numește heterogenitate de locus
sau non-alelică (Ostrer, 1998).
136
g: XA Xa Y
Gameți masculi
A
X Y
F2: g:
P(XA) = ½ P(Y) = ½
XAXA XAXa
XA
Diagr. Punnett
Gameți femeli
¼ ¼
P(XA) = ½
Femele cu ochii roșii Femele cu ochii roșii
XAY XaY
Xa
¼ ¼
P(Xa) = ½
Masculi cu ochii roșii Masculi cu ochii albi
¾ ¼
Raport de segregare
Musculițe cu ochii roșii Musculițe cu ochii albi
fenotipic
(½♀ + ¼ ♂) (♂)
½♀ ½♂
Sex Ratio
(50%) (50%)
g: XA Xa Y
Xa
Gameți masculi
a
X Y
Fb: g:
P(Xa) = ½ P(Y) = ½
XAXa XA Y
XA
Diagr. Punnett
Gameți femeli
¼ ¼
P(XA) = ½
Femele cu ochii roșii Masculi cu ochii roșii
XaXa Xa Y
Xa
¼ ¼
P(Xa) = ½
Femele cu ochii albi Masculi cu ochii albi
½ ½
Raport de segregare fenotipic Musculițe cu ochii roșii Musculițe cu ochii albi
(¼ ♀ + ¼ ♂) (¼ ♀ + ¼ ♂)
½♀ ½♂
Sex Ratio
(50%) (50%)
g: Xa XA Y
La păsări, sexul homogametic este cel mascul iar sexul femel este
heterogametic, ceea ce determină ca toate principiile anterior menționate
să fie aplicate ca „imagine în oglindă”. Cercetările efectuate au demonstrat
transmiterea legată de cromozomii sexuali pentru o serie de caractere la
păsări, unele determinate de gene dominante iar altele de gene recesive,
ambele tipuri putând fi localizate în structura cromozomului sexual Z. Așa
de exemplu, desenul barat, întâlnit la rasele Plymouth Rock, Scots Grey,
Scots Dumpy, Cockoo Leghorn, este determinat de o genă cu dominanță
incompletă, ce determină o expresie diferită la cocoșii heterozigoți (genotip
ZBZb - desen simplu barat) comparativ cu cei homozigoți dominanți
(genotip ZBZB - desen dublu barat). Găinile ale căror pene prezintă desen
36
Afectează băieții mai tineri de 5 ani, clinic evoluând cu slăbiciune musculară progresivă.
Moartea se produce, de obicei, în jurul vârstei de 20 ani, datorită complicațiilor respiratorii
(Gelehrter și col., 1998).
142
g: Zb ZB W
Genotip: ZB Zb ZbW
Cocoși cu penaj (simplu)
Găini cu penaj negru
F 1: barat
Fenotip: ½
½
(50%)
(50%)
½♂ ½♀
Sex Ratio
(50%) (50%)
Genotip: AA x aa
P:
Fenotip: Oi Dorset cu coarne Oi Suffolk fără coarne
g: A a
F 1: Genotip: Aa Aa
Raport genotipic
100% indivizi heterozigoți
de segregare:
Fenotip: Masculi cu coarne Femele fără coarne
1: 1:
Raport fenotipic
½: ½:
de segregare:
50% 50%
g: A a A a
Gameți masculi
A a
F 2: g:
P(A) = ½ P(a) = ½
A AA Aa
Punnett
Diagr.
Gameți
a Aa aa
P(a) = ½ P(Aa) = ¼ P(aa) = ¼
Genotip: AA Aa Aa aa
1: : 2: 1
Raport genotipic
¼: ½: ¼
de segregare:
25%: 50%: 25%
Masculi cu coarne Masculi fără coarne
Raport fenotipic 3: 1
de segregare (1): ¾: ¼
75% 25%
Genotip: AA x aa
Femele cu
P: Masculi cu
Fenotip: „penaj de
„penaj de găină”
găină”
g: A a
Aa
100% Păsări cu „penaj de găină”
F 1: Genotip:
(♂+♀)
Raport de
segregare 100% indivizi heterozigoți
genotipic:
Aa x Aa
g: A a A a
Gameți masculi
A a
F 2: g:
P(A) = ½ P(a) = ½
A AA Aa
Punnett
Gameți
Diagr.
femeli
Tabel 21
Simboluri şi relaţii folosite în construirea pedigree-ului
Indivizi bolnavi
Individ investigat
Împerechere consangvină
Gemeni dizigoţi
153
Analiza hibridologică și moleculară în identificarea genelor și genotipurilor la
organismele superioare
Gemeni monozigoţi
?
Zigozitate incertă
Inseminare artificială
-femela devine gestantă în urma utilizării unui
D donator de material seminal;
-nu este reprezentată nici o linie de relaţie
P între femela gestantă şi donatorul de material
seminal.
Transfer de embrioni
S
-pereche a căror gameți sunt utilizați pentru
fertilizarea unei femele (surogat) care va purta
P
gestația.
1 2 3 4
Genotip: A A AA aa
1 2 3 4 5 6 7 8
Genotip: AA AA sau Aa aa A A A A AA
III.
1 2 3 4 5
Genotip: AA sau Aa AA sau Aa aa AA sau Aa AA sau Aa
Taq ADN polimeraza este enzima cea mai frecvent utilizată pentru
reacțiile PCR standard. Robustețea enzimei permite utilizarea acesteia în
diferite reacții PCR, pentru o gamă largă de aplicații biologice și nu numai.
Fig.49: Modul de formare al capetelor coezive (5' sau 3') sau al capetelor
boante prin utilizarea enzimelor de restricție specifice
(adaptare după www.thermofisher.com)
192
Tabel 23
Exemple de enzime de restricție și situsurile lor de recunoaștere
(după Roberts, 1980)
Tabel 25
Gene cu implicație în patologia speciilor animalelor de fermă
(denumire, localizare)
Cromozom/ Gena/ localizarea pe cromozom/ poziția pe
Boală Specia
genă
Hipertemia malignă Sus scrofa 6/ RYR1/ g.42868983C>T/ c.1423C>T
Hemofilia A Ovis aries X/ F8/ c.3107del10ins11
Hipertrofia musculară Ovis aries 2/ MSTN/ g + 6223G> A/ c.1232G> A
13/ PRNP/ g.46225765G>A/c.512G>A (alela Q);
g.46225660C>T/ c.407C>T (alela V);
Encefalopatia spongiformă Ovis aries
g.46225714G>A/c.461G>A (alela H);
g.46225674C>T/ c.421C>T (alela F)
1/ SLC24A5/ g.141660611_141661239del/ c.875-
Albinism oculo-cutanat de tip VI Equus caballus 340_1081+82del (alela 2);
g.141677402A>T/ c.272A>T (alela 1)
Piticism Equus caballus 14/ B4GALT7/ g.4535550C>T/c.50G>A
Hipertemia malignă Equus caballus 10/ RYR1/ c.7360C>G
Albinism Gallus gallus 1/ TYR/ c.817_822del6
202
187. Shriver M.D., Kittles R.A., 2004 – Genetic ancestry and the search
for personalized genetic histories, Nature Reviews Genetics,
5(8):611–618;
188. Shukla A.N., 2009 – Encyclopaedia of Genetics – I, Genetic material
and analysis, Discovery Publishing House PVT. LTD., New Delhi;
189. Shull G.M., 1948 – What is „heterozis”? Genetics, 33(5):439-446;
190. Shuster D.E., Kehrli M.E., Ackermann M.R., Gilbert R.O., 1992 –
Identification and Prevalence of a Genetic Defect That Causes
Leukocyte Adhesion Deficiency in Holstein Cattle, Proceedings of
the National Academy of Sciences of the United States of America
89:9225-9229;
191. Simmons P., Ekarius C., 2009 – Storey's Guide to Raising Sheep,
Breeding, Care, Facilities, 4th Edition, Storey Publishing LLC.,
Massachusetts;
225
Analiza hibridologică și moleculară în identificarea genelor și genotipurilor la
organismele superioare
192. Sleiman R., Kurban M., Succaria F., Abbas O., 2013 – Poliosis
circumscripta: overview and underlying causes, Journal of the
American Academy of Dermatology, 69(4):625-633;
193. Smith L.B., Bannasch D.L., Young A.E., Grossman D.I., Belanger
J.M., Oberbauer A.M., 2008 – Canine fibroblast growth factor
receptor 3 sequence is conserved across dogs of divergent skeletal
size, BMC Genetics, 9:67;
194. Snustad D.P., Simmons M.J., 2015 – Principles of Genetics, 7th Ed.,
John Wiley and Sons, New York;
195. Solcan C., Sisea C.R., 2012 – Biologie moleculară, Editura Ion
Ionescu de la Brad, Iași;
196. Soni N.K., Soni V., 2010 – Fundamentals of Botany, Vol.1, Tata
McGraw Hill Education, Private Limited, New Delhi;
197. Sorensen J.B., Grant W.J., Belnap L.P., Stinson J., Fuller T.C., 2001
– Transplantation of ABO group A2 kidneys from living donors into
group O and B recipients, American Journal of Transplantation,
1(3):296-299;
198. Sponenberg D.P., Rothschild M.F., 2001 – Genetics of Coat Color
and Hair Texture, în: The Genetics of the Dog, p.61-87, Ruvinsky A.,
Sampson J. (Eds.), CABI, Oxfordshire;
199. Steeh J.A., 1978 – The complete book of cats, Galahad Books, New
York;
200. Stellwagen N.C., 1998 – DNA gel electrophoresis. Nucleic acid
electrophoresis laboratory manual, Tietz D. (Ed.), Springer Verlag,
Berlin-Heidelberg, New York;
201. Stevens L., 1991 – Genetics and evolution of the domestic fowl,
Cambridge University Press, U.K.;
202. Strachan T., Goodship J., Chinnery P., 2015 – Genetics and
Genomics in Medicine, Garland Science, Taylor and Francis Group,
New York and London;
203. Strain G.M., 2011 – Deafness in dogs and cats, CABI, Oxfordshire;
204. Strain G.M., 2015 – The Genetics of Deafness in Domestic Animals,
Frontiers in Veterinary Science, 2:29;
226