Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
MICROBIOLOGIE
PARTICULARITILE
MICROORGANISMELOR
PARTICULARITILE
MICROORGANISMELOR
7.competitoare al omului pentru
supremaie biologica
variola eradicata 1977-1978;
HIV: 1981-1982
Microorganisme=Microbi = Germeni
BACTERII
VIRUSURI
FUNGI
PARAZITI
TOTAL DIFERITI INTRE EI !!
STRUCTURA
DIAGNOSTIC
TRATAMENT
Incadrare
Regn protista: alge, protozoare
Regn Myceta: fungi
Regn Prokariota (Monera): bacterii
Archaebacerii
Cianobacterii
Eubacterii = bacteriile adevarate
Bacteriile = prokariote
Nucleu
Eukariote Prokariote
ADN Material genetic
cz, cromozomial
mitocondrial, extracrozomial.
cloroplastelor Cz = molecul dublu
elemente transpozabile catenar de ADN circular
(mobile) => un singur cromozom.
uneori plasmide. Extra-cz
Cz = perechi plasmide
bacteriofagi
Cz = ADN + histone informaie genetic
neesenial pentru
supravieuirea i
multiplicarea bacteriilor,
ORGANIZAREA CITOPLASMEI
compartimentat. Necompartimentat,
organite => (mezozomi).
ribozomi 80 S, Ribozomi 70 S
su 60 S 50 S (Large)
Su 40 S 30 S (Small).
MEMBRANA CITOPLASMATIC
complexa nu exist steroli,
excepie
Mycoplasma
NVELIURILE CELULARE
lipsesc nveliurile perete celular,
celulare responsabil de
Exist la meninerea formei
levuri rigiditate,
plante,
are peptidiglican
sunt bogate n celuloz.
(murein).
MULTIPLICARE
sexualitate. divizarea asexual
primete o dubl Amitotic
informaie genetic sciziparitale sau
de la parentali fiziune binar.
care se reasociaz n Informatia =
meioz. Haploid.
MORFOLOGIE BACTERIAN
Microscopia optic
evidenierea formei,
Dimensiunilor
900-1000 X.
0,2 - 2m 2-20 mm
Microscopia electronic
Evidentierea structurii
bacteriilor.
Morfologia =>
preparate
microscopice:
preparat nativ,
frotiu
efectuate din:
produse patologice
cultur bacterian pur.
Frotiul - preparat microscopic
colorat,
Informaii:
forma
dimensiunile
dispoziia bacteriilor,
afinitatea tinctorial,
prezena structurilor facultative,
numar (prod.patol.)
Frotiul - preparat microscopic
colorat,
Forme fundamentale
sfer - coci (1)
Cilindru, bastonas - bacili (3-7);
cilindru helicoidal forma spiralat
COCI
Dispoziia rezult n urma diviziunii
diplo: diplococi
Pneumococi:
coci Gram pozitivi,
ovoizi cu aspect de flacre de lumnare (diviziune pe vertical),
Neisserii:
coci Gram negativi
cu aspect reniform, concav convex (diviziune pe orizontal),
tetrade: Micrococi: 4 coci reunii
octade: Sarcina: 8 coci.
lanuri: Streptococi.
grmezi: Stafilococi
BACILI
Capete bacililor pot fi:
rotunjite la Enterobacterii
b.coli i ali bacili Gram negativi
ascuite la Fusobacterium
bacili Gram negativi
drepte
bacilii din genul Bacillus (bacili Gram pozitivi)
Macchiavello
Taxonomie
clasificare, nomenclatura, identificare
Clasificare
Diviziuni bacteriene = unitati taxonomice
phyllum - clase - ordine - familii genuri/triburi specii
Specia = unitatea de baza a clasificarii
~ Reflecta proprietate
Var
Tip (biotip, serotip)
Nomenclatura: latinizata (reguli internationale)
proprietati
Ex. Mycobacterium tuberculosis
ordinele ales
familiile - aceae
Triburi/genuri eae
Identificare importanta practica a clasificarii
IDENTIFICAREA
Deosebeste
Microorganismele bune
Rele = patogene
Proprietati specifice
Morfologice
De cultura
izolare si identificare
agent cauzator = etiologic al unei imbolnaviri
CLASIFICAREA BACTERIILOR
Clasificarea Linn nu dup nrudirea
natural ci dup unele proprieti
fenotipice:
structura peretelui celular,
afinitatea morfotinctorial,
proprieti metabolice,
rezistena la diverse condiii de mediu
Bergeys Manual of Systematic
Bacteriology
International Commission of Bacterial Systematic 1980
Adansoniana numerica
Prezenta/absenta: pigmenti, enzime
Complicata
statistica
Filogenetica 1980
Tehnici moleculare si genetice
hybridizarea acizilor nucleici
Analiza secventelor ARN-ului ribozomal (rRNA)
inrudirea evolutiva
Peretele celular => 4 divizii
editia 9-a
I. Gracillicutes Bacterii Gram negative
Grup 1: Spirochete:
Treponema, Borrelia, Leptospira
Grup 2: Aerobe/micro-aerofile, mobile, helicoidale
Cam pylobacter, Helicobacter
Grup 3:
Bacterii incurbate, imobile sau rar mobile
Group 4: Aerobe/ micro-aerofile, bacili si coci:
Bordetella
Brucella, Francisella
Legionella, Moraxella
Neisseria, P seudom onas
Bacteroides
I. Gracillicutes Bacterii Gram negative
Grup 5: bacili facultativ anaerobi
Escherichia, K lebsiella
P roteus, P rovidencia
Salm onella, Shigella
Yersinia, Vibrio
Haem ophilus, Pasteurella
Grup 6: bacili incurbati sau helicoidali, anaerobi
Fusobacterium
Group 7: bacterii reducatoare de sulf
Group 8: coci anaerobi
Group 9: Rickettsiae and Chlamydiae:
Rick ettsia
Chlam ydia
Cox iella
Grup 10-16 - fara importanta medicala
II. Firmicutes: bacterii Gram pozitive
Grup 17:
Enterococcus
Peptostreptococcus
Staphylococcus
Streptococcus
Grup 18: bacili formatori de endospori:
Bacillus
Clostridium
Grup 19: bacili nesporulati
Listeria
ClasaThallobacteria
Grup 20: bacili neregulati, nesporulati :
Actinomyces
Corynebacterium
Grup 21: Mycobacteria: Mycobacterium
Grup 22-29: Actinomycete:
Nocardia, Streptomyces, Rhodococcus
III. Tenericutes
Bacterii fara perete celular
Group 30:
M ycoplasm a, Ureaplasm a
IV. Mendosicutes:
Archaebacteria
GRUPE DE
HAZARD
Produsele patologice
nu se cunoate coninutul microbian
trebuie prelucrate cu respectarea normelor de
protecie.
Morfologie bacteriana
Dr. Carmen Costache
STRUCTURA
1.Structuri obligatorii: 2.Structuri facultative
Nucleoid, * neeseniale pentru
Citoplasma, multiplicare
Membran citoplasmatic, * confer proprieti de
Perete celular
patogenitatea
Capsul, Glicocalix;
Pili comuni, pili de sex,
Flageli (Cili),
Spori
NUCLEOID
nu are
nucleoli,
membrana nuclear.
Se evideniaz:
prin coloraii speciale:
coloraia Feulgen,
acridin orange;
microscopia electronic (aspect fibrilar).
NUCLEOID
Un singur cromozom = o molecul dublu catenar de
ADN circular
50-65 bucle supraspiralizate, pliat, rsucit,
fibrilar, de arici sau ghem
legat de membrana citoplasmatic prin mezozomi
Informaia genetic - haploid
(gene pentru un caracter ntr-un singur exemplar).
contact direct ntre ADN i ARN,
important pentru transcrierea i traducerea inf.genetice
Plasmidele
molecule de ADN circulare.
se pot transmite de la o bacterie la alta =
conjugarea bacterian
Codifica nr variabil de gene
virulenta.
Feuelgen pozitiv
Material genetic extracromozomial
Bacteriofagii
Structuri virale
infecteaza bacteriile.
2 tipuri:
litici, capabili de replicare => liza bacteriei
lizogeni (temperai)
se pot integra n cz. = profag => proprieti noi:
ex. producerea unor toxine.
CITOPLASMA BACTERIILOR
necompartimentat,
fr organite:
reticul endoplasmatic,
aparat Golgi,
mitocondrii,
2 zone distincte
Periferica, amorfa
Interna (nucleoidul)
CITOPLASMA BACTERIILOR
1.Ribozomi: mii, 70 S
subunitile : 50 S (Large) i 30 S (Small)
sediul sintezei proteice
inta de aciune a unor antibiotice => inhiba selectiv
sinteza proteica bacteriana dar nu si cea eukariota !
Chloramfenicol,
Erithromicina (M) 50 S
Clindamicin,
Tetracicline
Aminoglicozide 30 S
CITOPLASMA BACTERIILOR
2.Granule/Incluzii:
mas lichid de substane nutritive,
delimitate de membran
Colorate specific de anumiti coloranti
Ex. Volutina = corpuscul metacromatic (albastru
de metilen=> rosu)
CITOPLASMA BACTERIILOR
3. ARN n cantitate mare,
reprezentat de r ARN (9%), m ARN, t ARN.
4. Molecule: 3000 4000 molecule
diferite;
ap, sruri minerale, ioni, acizi nucleici
5. Incluzii: material nutritiv de rezerv,
format n condiii nefavorabile de mediu
6. Plasmide
MEMBRANA CITOPLASMATICA
strat subire (10 -20 nm)
sub peretele celular => greu de evideniat.
Structura membranei citoplasmatice
modelul mozaicului Singer:
mas fosfolipidic,
plutesc insule de proteine,
dispuse spre interior, exterior
sau n masa fosfolipidic.
model dinamic => reciclat permanent.
MEMBRANA CITOPLASMATICA
Prelungiri n citoplasm:
1. Mezozomi
Rol:
diviziunea bacteriilor;
replicare ADN-ului;
formarea endosporilor
2. Oxizomi: prelungiri scurte
Rol:
procesele bioenergetice la bacteriile capabile de respiraie:
aerobe,
aerob anaerobe facultative,
microaerofile.
FUNCIILE MEMBRANEI CITOPLASMATICE
1. Permeabilitate selectiv i
transport de substane:
transport pasiv = difuzia simpl, substane cu
GM mic
transportul activ
contra gradient de concentraie,
cu consum de energie
FUNCIILE MEMBRANEI CITOPLASMATICE
2. Funcie bioenergetic:
sediul transportului de electroni, a fosforilrii
oxidative (Oxizomii).
3. Funcie biosintetic: precursori PC
4. Sediul enzimelor hidrolazice
hidrolizeaz polimeri organici: proteine,
zaharuri, lipide n nutrieni, care pot ptrunde
n bacterie.
FUNCIILE MEMBRANEI CITOPLASMATICE
8. Import de macromolecule
ex. fragment de ADN, de la bacterii
donatoare = transformare
FUNCIILE MEMBRANEI CITOPLASMATICE
CAPSULA
strat amorf de nveli
3 structuri :
Capsula microscopic :poate nconjura 1-2 bacterii.
Ex. Pneumococi, Meningococi, Hemofili, Bacilul crbunos, Klebsiella,
Clostridium perfringers.
Microcapsul: antigenul K / antigen Vi la Salmonella.
se evideniaz doar n microscopie electronic
poate nconjura doar parial peretele celular.
Stratul mucos produs doar n condiii naturale =>patogene
Capsula se evideniaz
1. n frotiuri prin:
coloraii negative,
nu coloreaz capsula,
vizibil ca un halou alb n jurul bacteriilor:
coloraia Gram (prod. patologic),
Burri (culturi pure)
coloraii pozitive: coloraia Muir
2. Prin reacii antigen - anticorp:
reacia de precipitare i reacia de umflare a capsulei
3. Dup aspectul coloniilor pe medii de cultur:
foarte mucoase
CAPSULA
Compoziie chimic
polizaharidic,
majoritatea bacteriilor capsulate (Pneumococ, Meningococ,
Hemofili).
polipeptidic:
polimer al acidului D - Glutamic, la bacilul crbunos.
proteic
Yersinia pestis,
polimer de acid hialuronic la Streptococ - hemolitic.
Rol
1. antigen bacterian.
2. factor de patogenitate bacterian:
se opune fagocitrii bacteriilor.
GLICOCALIXUL
strat de suprafa sintetizat de bacterii n mediul lor
natural.
structurat,
fibre polizaharidice lungi (dextran sau levan)
se poate evidenia doar n microscopie electronic
Rol
1.adezina polizaharidic
2.factor de colonizare
Ex. Mutanul ( Streptococus mutans) - ader de smalul dentar
cu formarea cariei dentare. Bacteriile produc metabolii acizi,
care atac smalul dentar.
PILII COMUNI (FIMBRII)
Pleac din membrana citoplasmic, strbat PC
FORMATIUNI
FACULTATIVE
Dr. Carmen Costache
FORMATIUNI FACULTATIVE
Confer bacteriilor proprieti importante n natur
aderena,
rezisten la fagocitoz ( unele fiind factori de patogenitate.)
CAPSULA
strat amorf de nveli
3 structuri :
Capsula microscopic : poate nconjura 1-2 bacterii.
Ex. Pneumococi, Meningococi, Hemofili, Bacilul crbunos, Klebsiella,
Clostridium perfringers.
Microcapsul: antigenul K / antigen Vi la Salmonella.
se evideniaz doar n microscopie electronic
poate nconjura doar parial peretele celular.
Stratul mucos produs doar n condiii naturale =>patogene
Capsula se evideniaz
1. n frotiuri prin:
coloraii negative,
nu coloreaz capsula,
vizibil ca un halou alb n jurul bacteriilor:
coloraia Gram (prod. patologic),
Burri (culturi pure)
coloraii pozitive: coloraia Muir
2. Prin reacii antigen - anticorp:
reacia de precipitare i reacia de umflare a capsulei
3. Dup aspectul coloniilor pe medii de cultur:
foarte mucoase
CAPSULA
Compoziie chimic
polizaharidic,
majoritatea bacteriilor capsulate (Pneumococ, Meningococ,
Hemofili).
polipeptidic:
polimer al acidului D - Glutamic, la bacilul crbunos.
proteic
Yersinia pestis,
polimer de acid hialuronic la Streptococ - hemolitic.
Rol
1. antigen bacterian.
2. factor de patogenitate bacterian:
se opune fagocitrii bacteriilor.
GLICOCALIXUL
strat de suprafa sintetizat de bacterii n mediul lor
natural.
structurat,
fibre polizaharidice lungi (dextran sau levan)
se poate evidenia doar n microscopie electronic
Rol
1.adezina polizaharidic
2.factor de colonizare
Ex. Mutanul ( Streptococus mutans) - ader de smalul dentar
cu formarea cariei dentare. Bacteriile produc metabolii acizi,
care atac smalul dentar.
PILII COMUNI (FIMBRII)
Pleac din membrana citoplasmic, strbat PC
Rol
1. adezinele proteice ale bacteriilor:
aderarea nespecific pe suprafee inerte,
aderarea specific pe mucoase, epitelii, endotelii,
hematii, fagocite.
2. factor de patogenitate
Gonococii, E. coli- (ETEC),
3. antigene
posibilitatea modificarea structurii antigenice
PILII DE SEX
formaiuni tubulare lungi
numr mic (1-4 )
prezeni la bacteriile G negative
au determinism extracromozomial
(plasmidic)
Rol: conjugarea bacterian
FLAGELI (CILI)
formaiuni tubulare lungi
aprox. 20 m lungime/20 nm lime.
organite de locomoie ale bacteriilor
Structur proteic = flagelin
Ultrasctructura la ME:
corpuscul bazal
cilindru proteic (filament axial).
Evidentierea cililor :
n preparate microscopice:
coloraii speciale
indirect n preparate native (mobilitatea bacterian) .
pe medii de cultur, prin nsmnarea bacteriilor prin nepare:
bacteriile imobile se dezvolt doar pe traiectul de nepare,
cele mobile se dezvolt n tot mediul.
Rol:
1. mobilitate, spre locurile unde exist
atractani:
chimiotaxie (deplasarea spre substane chimice);
fototaxie (deplasare spre locurile cu lumin); etc
2.antigen bacterian - antigenul H,
Weil - Felix a evideniat la Proteus,
nsmnat ntr-un punct dintr-un mediu, se dezvolt pe tot
mediul sub forma unor vluri concentrice (hauch).
SPORII
forme de rezisten - condiii nefavorabile de
temperatur, nutriie, pH, oxigen,
form primitiv de difereniere celular la bacterii.
Sporularea:
iniial endospori ulteior - spori liberi = exospori
Germinare
Revenire la forma vegetativ cnd ntlnesc condiii favorabile
SPORII
Evidenierea sporilor
coloraii negative: Gram (formaiuni ovalare, necolorate, n interiorul
bacteriilor).
coloraii pozitive: verde malachit i safranin
Definiie:
Suma tuturor proceselor
chimice
1. Anabolism:
Sinteza de compui
compleci,
cu consum energetic.
2. Catabolism:
- descompunerea
compuilor compleci
- producere de energie
Efectul factorilor fizici asupra dezvoltrii bacteriene
Efectul temperaturii
dezvoltare bacterian
izvoarele cu ap fierbinte din Yellowstone National
Park 120C.
Soluii apose pn la -20C,
Gheari din Antarctica,
Congelatoare casnice: 0 C.
Clasificarea bacteriilor n funcie de temperatura de
cretere
Inghearea =>
stoparea multiplicrii unor bacterii
DAR
multe din ele nu sunt omorte la
temperaturile din congelatoarele casnice !
Investigarea unei epidemii de
toxinfecie alimentar salmonelozic:
Ingheat contaminat cu Salmonella
luni de zile inghetata
nc avea bacterii vii
In laboratoare bacteriile (tulpini de
referin, tulpini izolate de la pacieni)
pstrate pentru studii ulterioare n
frigidere/congelatoare.
Efectul pH-ului asupra
bacteriilor
pH = concentraia ionilor de
hidrogen, [H+]
pH optim = neutru (6,8-7)
Limite: 6-8
bulion nutritiv: pH = 6,8 !
Acidofile: prefer pH acid
Helicobacter pylori
Alcalifile: prefer mediile
alcaline
Vibrio cholerae: pH > 8
Efectul presiunii osmotice asupra
bacteriilor
Halotolerante = concentraii
moderate de sare
ex. Staphylococcus crete pe mediu cu
7,5% NaCl (Chapman = mediu selectiv)
Desicaia = letal
pentru bacterii
Practic: conservarea
alimentelor
Efectul desicaiei
(deshidratarea, uscarea)
Obligat anaerobe
O2 = toxic
fermentaie => energie
Ex. Clostridium spp.
Clasificarea bacteriilor n funcie de efectul oxigenului
asupra lor
Aerobe facultativ anaerobe
Cresc n prezena SAU absena O2
respiratie (aerob, anaerob) sau fermentaie => energie
Ex. Enterobacteriile
Clasificarea bacteriilor n funcie de efectul oxigenului
asupra lor
Microaerofile
Necesit O2 conc.< conc. atmosferic
O2 n concentraia atmosferic = toxic
Respiraie => energie
Ex. Neisseria spp. (gonococci, meningococci)
Clasificarea bacteriilor n funcie de efectul oxigenului asupra lor
Anaerob-aerotolerante
pot crete n prezena O2
DAR
Fermentaie => energie
Ex. Streptococcus
Toate organismele care cresc n prezena O2 au superoxid dismutaz.
Clasificarea bacteriilor n funcie de efectul oxigenului asupra lor
Sursa de energie
Sursa de C: bacterii chimioorganotrofe
Bacterii C autotrofe: substane chimice organice
CO2
fr importan medical.
Bacterii auxotrofe
selectate n evoluie
au pierdut 1-2 ci metabolice
nu se multiplica pe medii sintetice minimale
necesit factori de cretere ~ vitamine bacteriene
(Nu pot fi sintetizai de bacterii)
ex. vitamine propriu-zise: K, B (B1, B2, B6, B12))
extract de drojdie
snge pentru bacterii pretenioase nutritiv (streptococi,
gonococi, meningococi)
Factor X, V pentru hemofili
Bacteriile paratrofe
parazitism intracelular: Rickettsia, Chlamydia.
METABOLISMUL ENERGETIC BACTERIAN
2 modaliti principale de
producere a energiei:
respiraia
fermentaia
1. Respiraia (metabolism
energetic respirator)
lan transportor de electroni;
fosforilare oxidativ = aerob
lan transportor de electroni,
fosforilare anoxibiotic =
anaerob
2. Fermentaia (metabolism
energetic fermentativ)
Dup natura produilor rezultai =>
diferite tipuri de fermentaie
Alcoolic
Lactic
acid mixt
Acetoinic
Propionic
Butiric
Tipuri de fermentaie
Fermentaia alcoolic => alcool etilic;
la drojdii, levuri (Sacharomyces cerrevisiae) => fermentaia vinului, berii.
Tipuri de fermentaie
Fermentaia lactic => acid lactic
Ex: streptococi, lactobacili
Normal flora of the vagina =
lactobacilli
Tipuri de fermentaie
Fermentaia acid mixt => acid lactic, succinic, formic
Enterobacterii
evideniata prin reacia rou metil.
Fermentaia acetoinic: acumulare de acetoin i
butilen-glicol
Klebsiella
evideniata prin r. Voges Proskauer.
Tipuri de fermentaie
Fermentaia propionic => acid
propionic
Corynebacterium, Neisserria
Fermentaia butiric => acid butiric,
acid caproic, acid amilic.
Clostridium i ali anaerobi.
Aplicabilitate practic => diagnosticul de laborator
(identificarea bacteriilor reacii chimice) !
Reacia Voges Proskauer
temperatur i nutriie
optime =>
bacteriile cresc i se divid.
parental => 2 celule fiice
identice
cu parentalul
identice ntre ele.
Creterea i diviziunea
unei celule = ciclul celular
Creterea i multiplicarea
unei populaii bacteriene
= curba de cretere.
Curba de multiplicare (cretere) a
bacteriilor
Faza de ncetinire a
ritmului de
multiplicare
sfritul perioadei
logaritmice
consum substane
nutritive, O2
acumulare toxice
=> supravieuire
Faza staionar
Numr constant
reprogramat
activitatea metabolic
sintetizeaz proteine
de supravieuire
sporularea
devin mai rezistente
la AB.
Curba de multiplicare (cretere) a bacteriilor
Faza de declin
Bacteriile mor cu o rat ridicat
modificate morfologic: btrne (perete celular gros),
forme aberante, globuloase
starea fiziologic de rezisten la stres
rezistente la aciunea factorilor fizici, chimici, la
antibiotice.
Importana cunoaterii metabolismului bacterian
Clasificarea
Identificarea bacteriilor
Utilizarea bacteriilor:
preparare vaccinuri,
obinerea de antigene bacteriene,
n industria alimentar (lactate, pine, alcool),
n cercetarea fundamental
mediu.
Multiplicarea bacteriilor pe mediul solid
=> o colonie.
Colonie = populaie
bacterian pur din punct
de vedere genetic
deoarece provine de la
un singur parental.
GENETIC BACTERIAN I
Ereditatea
Conservarea i transmiterea fidel a caracterelor unei
specii la descendeni
Stabilitatea f (ADN ) ~ metabolismul ADN
replicarea semiconservativ
repararea leziunilor ADN, restricie i modificare
transcrierea
traducerea informaiei genetice n proteine.
Genotipul = totalitatea informaiei genetice
Exprimarea fenotipic:
informaie genetice-ADN => ARN => proteine
reproducere
asexuala:
Fiziune
binara
Dogma centrala
ADN-ul este depozitarul informatiei genetice transcrisa in
ARN si apoi in proteine la nivelul ribozomilor
(Avery 1944, pneumococ)
Exceptie: retrovirusurile - Reverse Transcriptaza: ARN => ADN
Variabilitatea
Modificare caractere fenotipice microorganism
deosebesc
descendenii de parental
descendenii ntre ei.
St la baza evoluiei
Se produce prin modificri n genotip,
la nivel molecular.
Verticale: Mutatie
Transferului orizontal al ADN-ului:
transformare,
transpozitie,
transductie,
conjugare
STRUCTURA ADN
i modelul replicrii semiconservative
(Watson &Crick 1953)
Chimic = acid nucleic
schelet zahr - fosfat,
2 catene polinucleotidice => dublu-helix
5 -> 3
3-> 5
baze azotate
purinice adenin, guanin
pirimidinice (timin, citozin )
legturi de H, pe baza complementariti: (A=T; C=G).
Perechile de baze succesive => dublu helix
ARN
Zahar: riboza
Uracil <= Timina
STRUCTURA ADN
ADN
Structure of phage T4
B. Bacteriofagi
1. Xl74 primul secventializat
2. litic => bacterioliza
Fara incorporarea ADN-ului exogen
3. lizogenic => profag - persistenta
Trigger => bacterioliza
REPLICAREA ADN
diviziunea
etape: iniiere, alungire, terminare.
despiralizarea moleculei superhelicoidale
de ADN,
realizat de ADN giraza (topoizomeraza 2).
punct de origine - zona ori ,
1-2 furci de replicare.
direcia 5' - 3'.
ter, 180, fa de punctul ori.
erori de replicare
ADN polimeraza
funcie de corectare i exonucleazic
verific complementaritatea bazelor inserate i ndeprteaz
bazele incorect inserate
REPARAREA LEZIUNILOR ADN
Exist sisteme de reparare:
constituitive sau inductibile (SOS)
prerepliactive, replicative, postreplicative
fidele, infidele (ex.SOS)
directe ( act. direct pe leziune),
indirecte (prin excizie)
REPARAREA LEZIUNILOR ADN
Metilarea
Marcarea catenei parentale
Gruparile metil adougate dupa replicare
Endonucleazele de restrictie
Taie ADN-ul in fragmente
Actiune site-specifica fiecarei endonucleaze in
parte
Molecule santinela => distrug ADN (ex. Viral)
Structure of a typical operon. Image from Purves et al., Life: The Science of Biology, 4th Edition, by
Sinauer Associates (www.sinauer.com) and WH Freeman (www.whfreeman.com)
Operonul lactozei
Gene structurale
-Galactozidaza ( Gal => Glu + Lac
-Galactozid permeaza (transport activ Lac)
-Galactozid transacetilaza
Operonul lactozei
Operonul Triptofanului
Gene structurale: 5 => 3 enzime
Secvente semnal
promoter
operator
Gena reglatoare => represor
Control
Negativ
Atenuare
Operonul Triptofanului
Control negativ
Nu Trp
=> represorul nu represeaza operatorul
=> operatorul transcrie genele structurale
=> se sintetizeaza Trp
Trp in mediu = co-repressor
Trp legat de represor => modificare conformatie
Se leaga de operator
Impiedica functionarea ARN polimerazei => stop
sinteza
Operonul Triptofanului
Rezultatul: Mutant
(fenotip diferit de parentali ) =>multiplicare
=> clone mutante
MUTAIA proprietati
Rata mutaiei: o celul din 1 milion - 10 milioane
Constanta: specie, caracter
Probabilitatea 2 mutaii concomitente: 10-12 pana la
10-14,
imposibil - ordinul de multiplicare a bacteriilor este
de 109.
Frecventa
Proportia de mutantii din populatie
F (rata, viteza mx, etapa multiplicarii)
Rata mutatiei Frecventa mutatiei
Momentul
e important !
Momentul este important !
perioada logaritmica
Numar mare de descendenti ai celulei mutante
in perioada stationara
Numarul descendentilor mutanti mai mic
DAR rata mutatiei este crescuta.
Sistem SOS
Proteine de supravietuire (defecte)
Predispune la mutatii pentru diverse caractere
Caracterul spontan al mutatiei
Substitutia
tranzitie,
purinica purinica
Pirimidinica pirimidinica
transversion
purinica pirimidinica
Datorata
tautomerismului
corect : A-T, G-C
gresit :T-G or A-C
replicare eronata ADN
Tipuri de mutatii
Mecanismele moleculare ale mutatiei - amplitudine
punctiforme,
extinse
Punctiforme predominant
Substitutie
micro-deletii
micro-aditii
Afectata o pb,
Exinse,
macroaditie,
macrodeletie
inversie
Mai multe pb.
TIPURI DE MUTAII
Efectul asupra polipeptidului codificat
Mutaii tcute
=> codoni cu acelai sens
=> neexprimat fenotipic.
modificata: AUGUUUAUAGUGGUG;
AUG N Formyl Methionine
UUU Phenyl Alanine
AUA Isoleucine
GUG Valine
TIPURI DE MUTAII
Efectul asupra fenotipului
Comparnd fenotipul mutantului cu cel al bacteriei parentale:
2. Mutaii napoi
Revers mutaie: revenirea la fenotipul bacteriei slbatice-rar
Supresoare (intragenica, intergenica)
Mutante morfologice
Mutante de cultur
Mutante metabolice
Mutante antigenice
Mutante de patogenitate:
Mutante de rezisten la
antibiotice
Mutante de rezisten la
bacteriofagi litici
Mutante duble:
bacterii acapsulate devin
nepatogene
Mutante tcute (silenioase)
Mutante condiionat letale:
TIPURI DE MUTANTE
Mutante de patogenitate:
patogenitate crescut, care se rspndesc n
populaie
patogenitate sczut, folosite la prepararea
vaccinurilor.
TIPURI DE MUTANTE
Mutante condiionat letale:
ex. mutantele termo-sensibile, ale virusurilor gripale,
folosite pentru prepararea vaccinului antigripal
Proteina - AA schimbat
functioneaza normal la 32C dar nu la 37C
(alterarea configuratiei la T crescuta).
vaccin experimental
37C => cannot infect the lungs and cause pneumonia,
but
32C (nose) replicate and induce immunity
TIPURI DE MUTANTE
Mutante de rezisten la antibiotice prin modificarea :
proteinei de transport a antibioticului n bacterie,
a intei de aciune;
a afinitii enzimei de inactivare a AB:
ex. modificarea lactamazelor (penicilinaze,
cefalosporinaze), care inactiveaz lactaminele conduce la
dobndirea rezistenei bacteriilor la lactamine (peniciline,
cefalosporine);
modificri cantitative: ex. lactamazele devin din inductibile,
constitutive.
TIPURI DE MUTANTE
Mutante de rezisten la antibiotice
TIPURI DE MUTANTE
Mutante de rezisten la antibiotice
Soarta mutantelor in natura
tulpin, clon nou
eliminat
se multiplic paralel cu tulpina parental
se multiplic excesiv fa de tulpina parental
(condiii de mediu favorabile clonei modificate i
nefavorabile tulpinii parentale (ex. mediu cu
antibiotic).
GENETIC BACTERIAN III
Conjugare
Plasmide
Transformarea
ADN liber
Transductie
Bacteriofagi
Transpozitie
Transpozoni = elemente genetice mobile (TGE)
CONJUGAREA BACTERIANA
Plasmidele col
gene pentru sinteza de colicine - bacteriocine
Bacteriocinele
proteine de tip antibiotic
B.productoare sunt imune
meninerea microbiocenozelor normale ale
organismului
Conjugarea la bacteriile Gram pozitive
feromoni de sex
produsi de bacterii receptoare
Structura chimica - peptidic
Efect afrodisiac
proteine de ataare
Produsi de bacteriile donatoare
Transformarea
transfer de ADN liber
de la o bacterie donatoare (D)- exogenot
la o bacterie receptoare (R) - endogenot
natural
autoliza bacteriilor
artificial
extracie chimic
fenomen rar ntlnit n natur
Transformarea
Griffith - 1928 virulena pneumococilor
Transformarea
Proteinele rec. A
gsirea zonei de omologie ntre exo i endogenot,
ruperea n anumite poziii i
reunirea catenelor,
Consecin: integrarea
endogenotul primete de la exogenot gen activ
pentru capsul
bacterii Gram pozitive si negative
fungi
Transformarea
starea de competen
accept fragmentul de ADN,
Tranzitorie
5-15 minute
protein de competen
alterez suprafaa bacteriei receptoare
Etapele transformrii
Absorbia
fragmentului de ADN pe suprafaa celulei
receptoare
Penetrarea
ADN-ului n bacteria receptoare
Eclips
Taiere, unire ADn exogenot-endogenot
Mecanism
recombinare omoloaga,
doar ntre celule ale aceleai specii sau specii strns
nrudite
Rolul natural al transformrii
m odificarea structurii antigenice a
pililor gonococilor i evoluia cronic
a gonoreei (uretrita gonococic)
TRANSDUCTIA
BACTERIOFAGI
entiti infecioase acelulare
Virusuri ale bacteriilor.
Structura:
o molecul de acid nucleic,
protejat de proteine - capsida.
multiplicare => doar prin
utilizarea mainriei de sintez
a celulei parazitate (bacteria)
Bacteriofagi
Form :
lineari - cilindric
filamentoi
icosaedrici
Bacteriofagii cu cap i coad
ROL:
Transducia
transfer de material genetic prin bacteriofagi
Conversia lizogen
conferirea unor proprieti bacteriene
TRANSDUCTIA
generalizat : localizat (specific):
orice fragment al doar anumite gene,
cromozomului bacterian. alturate bf. n cz.
prin bacteriofagi litici bacterian.
recombinare omoloag prin bf. temperai:
ex. bacteriofagul al E. coli
recombinare situs specific
Profag
Excizia incomplet =>
genom fagic defectiv
TRANSDUCIA
Conversia lizogena
proprieti fenotipice
prin bacteriofag temperat
transmisibil la descendeni
Factorii de patogenitate - tox ine bacteriene :
toxina difteric - bacteriofagul tox, la bacilul difteric
eritrotoxina - toxina scarlatinoas, la streptococul hemolitic
fibrinolizina stafilococic
toxina Shiga-like, la bacilul coli (asemntoare toxinei
bacilului difteric shiga)
Recombinarea
Omoloaga
Situs specifica
Situs nespecifica (ilegitima)
Recombinarea
- In timpul trasnferului de material genetic
Recombinarea
Omoloaga: noul ADN inlocuieste ADN-ul
existent
Depinde de proteina rec A
Intre secvente identice sau foarte asemanatoare de
ADN
Mecanismul molecular:
- Taiere
- Replicare segmentara a ADN-ului
- Unirea catenelor noi de cele vechi
- Rezolvarea: reunirea capetelor prin ligaze
Efect: detectabil / nedetectabil
Recombinare omoloaga
apare in transformare
Ex. Variatia antigenica pili gonococci
integrarea plasmidelor F n cromozomul
bacterian - conjugare
cointegrarea plamidelor
Recombinarea- Situs specifica
Intre molecule
diferite de ADN
care au in comun o secventa de 10-20 nucleotide
Ex cz + plasmida ; cz + fag
Rezultatul:
Secvente repetitive directe (repetitii directe),
Secvente repetitive inversate (repetari inversate) =>
inversie
Inversia => modificarea antigenului H la enterici
(variatia de faza)
Transpoziia
alt consecin a recombinrii situs specifice
Recombinarea
variabilitate a caracterelor
bacteriene,
proprieti noi,
patogenitatea bacterian,
modificarea structurii antigenice,
dobndirea unor proprieti metabolice,
rezistena la antibiotice/ali factori
antibacterieni
PATOGENITATE BACTERIAN
A. Toxine bacteriene
1. Codificate de bacteriofagii tem perai :
toxina difteric codificat de bacteriofagul tox, la bacilul difteric
eritrotoxina - toxina scarlatinoas, la streptococul hemolitic
fibrinolizina stafilococic
enterotoxina stafilococic
toxina Shiga-like, la bacilul coli
JUMPING GENES
reverse transcriptase
Transpozitia
Mutarea TGE
Pe aceasi molecula ADN
in pozitii diferite
Intre molecule de ADN diferite
Cromozom bacterian plasmida
Cromozom bacterian bacteriofag
Transpozitie
Nespecifica / Site specifica
ilegitima / legitima
ITR scurte ITR lungi
Zona tinta de atasare: Zona tinta de atasare:
oriunde specifica
Transpozon inserat in transpozon inserat
zone diferite ale doar in zone specifice
moleculei de ADN. ale moleculei de ADN,
Recombinare situs
specifica.
Transpozoni (Tn): 3 clase
Clasa I : Cut & Paste (nereplicativa)
Tn Simpli = Secvente de insertie -IS
Tn compusi
Clasa II : Copy & Paste (replicativa)
Gena transpozaza
cointegrat-rezolvaza
2 IS
Gene de rezistenta antibiotice
Clasa III : Copy & Paste(replicativa)
Bacteriofagii mutatori
Clasa I : Secvente de insertie -IS
800-1400 bp
IS = ITR + gena transpozaza + ITR
Secvente de nucleotide identice
sau f.asemanatoare
Implicate in integrarea in ADN
receptor.
Efect: mutatie
Clasa I: Transpozoni Compusi
Domenii:
1 la fiecare capat ITR
2 gena transpozaza
3 gene structurale
Rezistenta la antibiotice "r"
Kanamicin, Cloramfenicol, Lactamine, Sulfamide
Factori de patogenitate
e.g.: toxine - enterotoxin
Exemple de
Transpozoni de rezistenta la antibiotice
Kanamicina = K Tn
Chlormafenicol = Tn 9
-lactamine: Amp transposon: AmpR
Tetraciclina: Tc transposon: TcR
Transpozoni Clasa II
Copy & Paste =
transpozitie replicativa
E: cointegrat-rezolvaza
fuziunea a 2 plasmide, una dintre
acestea deinnd un transpozon
Replicare
2 plasmide separate
Fiecare are transpozon
Cu gene de rezistenta
Plasmidele R = colectie
de Tn cu gene r
Transpozoni Clasa III
= bacteriofag mutator (Mu)
Parazitism
obligatoriu
intracelular (ex. Chlamydia)
facultativ
in interiorul celulei, n afara celulei/ medii de
cultur
ex. Staphylococcus, Mycobacterium tuberculosis, Salmonella
Comensalism: flora normal (microbiocenoza)
Origine:
mam
personal medical/mediu spitalicesc
mediu nconjurtor
Flora normal (microbiocenoza)
Microorganisme comensale =
microorganisme care fac parte din flora
normal
microorganisme rezidente
microorganisme tranzitorii
2. Conditionat patogeni
Produc imbolnaviri doar in anumite circumstane
uneori membri ai florei normale
Staphylococcus,
Candida spp.
PATOGENITATE BACTERIAN
Bacterii saprofite
triesc n natur
ciclul natural al substanelor
Descompunerea organismelor moarte
componente organice => substane chimice anorganice
PATOGENITATE BACTERIAN
Postulatele lui Koch
Un microorganism = agent etiologic dac
respect postulatele lui Koch.
1. Agentul etiologic al unei boli infecioase
trebuie s fie prezent n toate cazurile de
boal.
2. Agentul etiologic trebuie s poat fi izolat pe
medii de cultur
3. Agentul etiologic izolat i meninut n
laborator n cultur pur trebuie s reproduc
infecia prin inocularea la animale de
experien, de la care trebuie s fie reizolat pe
mediu de cultur.
4. Trecerea printr-o infecie trebuie s conduc n
organismul bolnav la instalarea unei imuniti
specifice fa de agentul etiologic respectiv.
Postulate moleculare
Descriu factorii de virulen
Transmiterea:
Doza infectant 10-106 organisme
Perioada de incubaie :
variabil
Perioada de stare
Convalescena:
vindecare
laten
Microorganismele i patogeneza
Microorganismele i patogeneza
1. Modalitatea de transmitere:
fecal-oral (holera)
interuman (tuberculoza)
de la animale (rabia)
cu ajutorul unor vectori
Insecte artropode (pureci
capuse)
ciuma,
boala Lyme
Microorganismele i patogeneza
Clinic= Perioada de incubatie
2. Aderena
Previne ndeprtarea rapid
Frecvent ader cu ajutorul pililor
Specificitate
Receptor prezent => infecie
NU receptor => NU infecie
Microorganismele i patogeneza
Clinic = Perioada de incubatie
3. Colonizarea: multiplicarea i
continuarea infeciei
Competiia cu flora normal
Factori de rezisten mpotriva
colonizrii:
bila
pH-ul acid din stomac
peristaltismul intestinal
cilii tractului respirator
IgA (anticorpi de la nivelul mucoaselor)
Microorganismele i patogeneza
Clinic: Perioada de stare
4. Afectarea gazdei
Invazivitate
Toxicitate
Interaciunea bacteriilor cu mucoasele.
(a) Asociere.
(b) Adeziune.
(c) Invazia.
Invazia = ruperea barierelor anatomice
1. Piele:
rni
insecte, vectori
2. Traversnd mucoasele
(ex. epiteliul celular intestinal)
Evitarea mecanismelor de aprare a gazdei
1.Variaia antigenic
noi pili
2.IgA proteaze
Neisseria gonorrheae
3. Asemanatoare cu Ag proprii
capsula Streptococcus pyogenes = acid hialuronic,
secretat i de esuturile gazdei
Afectarea gazdei (producerea infeciei)
1. Exotoxine
necesit colonizare anterioar (holera)
toxiinfecii alimentare chiar i n absena
bacteriilor
Botulism
toxina Staphylococcus aureus
Sunt inte pentru anticorpii neutralizani
Vaccin
Afectarea gazdei (producerea infeciei)
Hemolizine
Determin liz celular: Streptolizina O
Fosfolipaze
cliveaz lipidele membranare: Clostridium perfringens
gangrena gazoas
3. Superantigene
Superantigene
Hiperstimuleaz sistemul imun
Se leag direct de antigenele de clas II MHC
Activeaz limfocitele T
Elibereaz cantiti importante de interleukine (1,2)
Determin oc => Simptome de oc toxic
febr, grea, diaree, vrsturi
Insuficien de organe, colaps circulator
Cauz de sindrom oc toxic (TSST)
Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes
Afectarea gazdei (producerea infeciei)
4. Endotoxine
parte structurala a celulei bacteriane - LPS
doar la bacteriile Gram negative
ENDOTOXINE EXOTOXINE
n peretele celular al G(-) Secretate de unele G(+) i G(-)
LPZ Lipid A Polipeptide
Cromozom Plasmide/bacteriofagi
Toxicitate scazut (MLD~100 ) Toxicitate nalt (MLD~ 1 g)
febr, oc Efecte variate
NU vaccin Anticorpi = antitoxine
Stabile la 100C pentru 1 h anatoxine => vaccin
Sepsis Distruse la 60C (excepie enterotoxina
stafilococic)
Tetanos, botulism, difteria, etc.
ENDOTOXINE
Planul cursului
Definiie
Antibiotice vs Chimioterapice
Antibiotice vs Antiseptice
Clasificare
Spectru de aciune
Tipuri de efect antibacterian
Combinatii de AB
Farmacocinetica
Familii de antibiotice
Mecanisme de aciune
Rezistena la antibiotice
Antibiotice / chimioterapice
Antibioticele (AB):
substane naturale, cu efect antibacterian,
produse de microorganisme.
Chimioterapicele (CH) :
substane chimice cu efect antibacterian.
Toxicitatea selectiv:
fixarea selectiv, specific a substanelor de corpul
bacterian.
nu se fixeaz i nu este toxic asupra altei bacterii sau
asupra celulelor umane (eukariote)
Dezinfectante\Antiseptice
substane cu efect antibacterian,
active n concentraii mari
Bacitracin
Gram-positive bacteria
Spectru ngust => specie bacteriena
ex. antibioticele antistafilococice, Vancomycin
Gram-positive bacteria
Tuberculostatice
Spectru restrns => numr mic de Polymyxin B
Gram-negative bacteria
grupe, genuri bacteriene:
Ex. Acid nalidixic - activ doar pe bacili Gram Streptomycin
Gram-negative bacteria
negativi
Specru larg = active asupra majoritii Gram-positive negative
genurilor, speciilor bacteriene: Erythromycin cocci; some Gram
negative bacilli
Gentamicin Broad-spectrum
Rifamycin Tuberculosis
Spectrul de aciune al unui antibiotic
Efect antibacterian
Inactivarea AB:
pH,
Tesut necrotic
s ajung la bacterie
s ptrund n bacterie
s fie permeabil pentru antibiotice
s dispun de un transportor pentru antibioticul respectiv
s ating inta de aciune
s realizeze n bacterie o concentraie optim, care s
inactiveze reversibil sau ireversibil inta de aciune.
Tratamentul cu antibiotice
Familii de antibiotice
AB care au
structur chimic,
int de aciune
mecanism de aciune
comune.
Tinta de actiune nivel molecular
Structura/functie inactivata ireversibil/reversibil
de catre AB
inte ale antibioticelor
Perete celular:
Lactamine
Glicopeptide: Vancomicina, Teicoplanina
Ristocetina
Fosfomicina, Cicloserina, Bacitracina,
Membrana citoplasmatic:
Polipeptide ciclice: ex. Colistin, polimixina B
Carboxy peniciline
Carbenicilin,
Ticarcilin
i bacili Gram negativi, inclusiv
Pseudomonas
Ureidopeniciline
Piperacilin
Familia -Lactaminelor- Peniciline (Penami)
BACITRACIN
Spectru de aciune: ngust: doar pe bacteriile Gram pozitive.
inta de aciune: Bactoprenolul - inhib reciclarea.
Toxicitate: crescut => Administrare: local
CICLOSERIN
Spectru de aciune: Tuberculostatic
AB care acioneaz la nivelul peretelui celular bacterian
Quinolone
Imidazoli
Furani
Rifamicine
Quinolone
inhib sinteza ADN bacterian
bactericid
Bacterii Gram + i Gram
Acid nalidixic, Ciprofloxacin, Norfloxacin, Ofloxacin
Inhibarea sintezei ADN bacterian
Nitrofurani Metronidazol
bactericide
spectru larg: bacili Gram negativi
inhibirea sintezei proteice: subunitatea ribozomal 30 S
Streptomicin, Kanamicin, Gentamicin, Amikacin
Tetracicline
spectru larg,
bacteriostatic
inhibirea sintezei proteice: subunitatea ribozomal 30 S
coci Gram + i , bacili Gram +
Chlamydia, Mycoplasma i Rickettsia
Tetraciclin, Doxiciclin, Minociclin
Cloramfenicol
spectru larg
inhibirea sintezei proteice: subunitatea ribozomal 50 S
De elecie pentru febra tifoid (bacteriostatic pentru
Salmonella)
Bactericid: Neisseria meningitidis, Streptococcus pneumoniae
i Haemophilus influenzae
Efecte adverse numeroase
Macrolide Lincosamine
Linezolid
Spectru ngust
DOAR bacterii G +,
VRE, MRSA
Subunitatea ribozomal 50 S
Antibiotice antituberculoase
Rifampicin
Izoniazid
Pirazinamid
Etambutol
Streptomicin
AB care inhib sinteza acidului folic
Sulfamide, Trimetoprim
Rezistena bacteriilor la antibiotice
Definiie
Bacterii rezistente = bacteriile care supravieuiesc
la concentraii mari de antibiotic, mult mai mari
dect cele din organismul uman.
Natural
Dobndit
Rezistena bacteriilor la antibiotice
mecanisme extra-cromozomiale
Achiziia de material genetic extracromozomial
Ex. plasmide R
Rezistena bacteriilor la antibiotice
Mecanisme
Determinarea sensibilitatii/rezistentei
bacteriilor la antibiotice
Efect bacteriostatic
Efect bactericid
Testarea sensibilitii bacteriilor la antibiotice
Antibiograma
Metode:
Metoda dilutiilor
Metoda difuzimetrica
E-test
Antibiograma
Metoda dilutiilor
Medii de cultura lichide
Dilutii de antibiotic intr-un
mediu de cultura favorabil
dezvoltarii bacteriilor
Cantitati egale din cultura
bacteriana testata
Incubare
Metoda de referin
Avantaj major: determinarea
valorii concentraie minime
inhibitorii (CMI)
Antibiograma - Metoda diluiilor
Citire si interpretare
Mediu de cultura
clar, limpede
tulbure
Se stabileste CMI
(concentraia minim
inhibitorie)
CMI valoare diferit
pentru fiecare bacterie i
antibiotic
Antibiograma
Metoda dilutiilor
!!!!! Reducerea timpului de citire al rezultatelor:
Indicator de pH (virarea culorii mediului apare
mai rapid decat tulburarea lui)
Antibiograma
Metoda difuzimetric
Cu o rigla se masoara
diametrul zonei de inhibitie a
dezvoltarii bacteriene
(exprimat in mm)
Se compara cu datele din
tabelele standard
Rezultatele se exprima:
Sensibil (S)
Intermediar sensibil
(IS)
Rezistent (R)
Antibiograma
E-testul
Combina avantajele cele doua
metode
Medii de cultura solide
Benzi impregnate cu AB n
concentraii descresctoare
!!! Citire: locul n care zona de
inhibitie intersecteaz banda =
CMI
Medii cu sange- pt.
streptococi
Lowenstein-Jensen-
pt. bacilul TBC
Pt anaerobi
PACIENT
-STATUS IMUNITAR
MICROORGANISM
-SITUSUL INFECTIEI -REZISTENTA MICROBIOLOGICA
-DISPOZITIVE MEDICALE -PRODUCEREA DE BIOFILM
-CONTROL INEFICIENT -DENSITATEA INOCULULUI
ESEC TERAPEUTIC
ANTIBIOTIC/CHIMIOTERAPIC
- ACTIUNE
- POSOLOGIE
- FARMACOCINETICA
- INTERACTIUNI MEDICAMENTOASE
Rezistena bacteriilor la antibiotice