Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Subcommittee of WHO.
BMJ 1993; 307: 1541-1546
Criterii
Adapted from Woolf SH et al. Potential benefits, limitations and harms of clinical
guidelines. BMJ 1999: 318: 527-530
Beneficii potentiale pentru pacienti /public
Imbunatatirea eficientei
Optimizarea economica
Demonstrarea respectării regulilor poate îmbunătăți imaginea publică
Ce pot oferi GHIDURILE
pentru a imbunatati standardul de practica?
Gradul Descriere
Recomandarii
1.Ordinea
– Metoda stiintifica difera de "bunul simt" in
ajungerea la concluzii prin utilizarea observatiei
organizate a entitatilor sau evenimentelor care
sunt clasificate sau ordonate pe baza
proprietatilor si a comportamentelor comune
3.Evaluarea si Probabilitatea
– Cerinta critica a efectuarii
proiectului in cercetare, aceea
care asigura validitatea, este
evaluarea probabilitatii de la
inceput pana la capat
Fundamentele Stiintifice ale Cercetarii
• 3.Evaluarea si Probabilitatea
3.Evaluarea si Probabilitatea
– cele mai importante elemente ale proiectului de cercetare:
• mentinerea grupurilor de comparatie sub forma grupurilor control
• realizarea principiului "dublu-orb" (atat a experimentelor cat si a
subiectilor)
• utilizarea metodelor probabilitatii (statistice) in analiza si
interpretarea rezultatelor
Fundamentele Stiintifice ale Cercetarii
3.Evaluarea si Probabilitatea
– Probabilitatea este o masura a nesigurantei sau a variabilitatii
caracteristicilor intre diversii indivizi ai unei populatii:
• Articol ştiinţific
• Poster
• Prezentare orală
• Lucrare de diplomă / master / doctorat
• Grant de cercetare
• Articole de educaţie continuă
• Book review
Structura: Strategia Stilului
Middle
Beginning
De ce scriem ?
Publicatie / Propunere de grant
• Abstract
• Comunicare scurta
• Articol local/ international
• Revista de varf observatii revista tinta
• Articol Nature/ Science
• Teza (MD/ Ph.D)
• Raport
Cum scriem?
• Autorii
Toti autorii trebuie sa aiba contributie
stiintifica
Cati autori?
• Procesul de recenzie
Observatiile obtinute sunt utile; articolul
poate fi publicat dupa ceva munca
suplimentara de organizare / argumentare
Cerintele pentru autori*
*Intl Comm of Medical Journal Editors. Uniform Requirements for Manuscripts Submitted to
Biomedical Journals: Writing and Editing for Biomedical Publication. December 2019.
ICMJE-recommendations
Cum se scrie un text ştiinţific ?
• Logic, astfel incat alti cercetatori sa poata
repeta studiul !
• Afla ce se stie deja (limita cunoasterii); obtine
literatura relevanta
• Referinte bibliografice!
• Material / Metode
• Rezultate
• Discutia rezultatelor
• Concluzii
Anatomia unui articol stiintific
• Titlu: Descriptiv, concis, interesant
• Abstract: Include toate componentele manuscrisului
• Corpul articolului:
Introducere: enunta obiectivele, arata necunoscutele, motiveaza
publicatia
Material si Metode: detalii suficiente
Rezultate: se prezinta faptele care au semnificatie logica
Discutia: se analizeaza rezultatele, comparativ cu alte studii.
Concluzia
Relevant background
Aims & Obj. to the problem Title &
abstract
Hypothesis
Introduction Materials and
Methods
Figures
Reading
My paper Analysis
References
Results
References Tables
Cine sunt?
Audienta
Ce stiu?
De ce vor citi?
Cum vor citi?
Caiet de laborator
Format
Structura
Target
Etica si Politica
Proces si Termene
Pentru a informa
Scop
Pentru a convinge
Un text stiintific are 4
componente….
IMRaD + C
Introducere
Material si Metode
Discutie
Rezultate
I. Introducere
• Fondul problemei, nivelul de cunoastere
international /national
• Conduce cititorul catre ipoteza de lucru
Introducerea pregateste cititorul pentru actiune
Topic?
Structura?
Importanta?
Fondul problemei?
Introducere
Simplifica limbajul
a majority of = most
at the present time = now
give rise to = cause
in some cases = sometimes
is defined as = is
it is believed that = I think
on the basis of = by
pooled together = pooled
subsequent to = after
with the result that = so that
II. Material si Metode
(sau Sectiune experimentala, Metodologie, Metoda)
Email: badicrin@yahoo.co.uk
Metodologia cercetării ştiinţifice
Colectarea datelor
Tipuri de variabile
Strategii de măsurare
• Strategii de măsurare
Predictor* Rezultat
Modificatori ai efectului*
Studii clinice
Descriptive Analitice
Experimentale Observationale
• Care este cea mai bună alegere terapeutică pentru pacientul meu?
Clinicienii
Sunt în linia I a asistentei medicale
Au expertiza clinica necesara
Îşi cunosc bine pacienţii
Sunt formaţi pentru gândire ştiinţifica
Sunt obişnuiţi cu colectarea datelor
Ştiu sa identifice rezultate
Măsurători de bază
• Linia de bază
Stabileşte necesitatea tratamentului
Permite îmbunătăţirea documentaţiei
Ne permite să îmbunătăţim studiul
Date de bază
• ABAB design
Test, tratament, test, tratament
Începe tratamentul
Cerinţe
• Fiabilitate
• Valide
• Sensibilitate
• Universale
• Fără erori
Instrumente de colectare a datelor
Ce inseamnă fiabilitate?
Instrumentul va putea măsura cu aceeaşi acurateţe:
• Experimentatori diferiţi?
Fiablitate Inter - operator
Instrumente de colectare a datelor
Este valid?
• Instrumentul care
va fi folosit poate
măsura datele pe
care le dorim?
Instrumente de colectare a datelor
Este Sensibil?
• Instrumentul ar trebui sa fie la fel de sensibil indiferent
de prezenta sau nu a variabilei măsurate şi de cantitatea
acesteia (linearitate).
Trebuie sa se caracterizeze valorile:
• Fals-pozitivi:
Subiectii sanatosi, prezentati ca bolnavi.
• Fals-negativi:
Subiecţii bolnavi, prezentaţi ca sanatosi.
Instrumente de colectare a datelor
Este universal?
2. Colectare Sistematica
3. Colectare Stratificata
• TIPURI de VARIABLE
independente
dependente
intermediare
de confuzie
Variabila Independentă
• NOTA
Variabila independenta nu este influenţată de
eveniment sau rezultat, dar o poate determina
sau contribui la variaţia sa.
Variabila Dependentă
• NOTE
Produce variaţii in variabila dependenta şi variază
datorita variabilei independente.
• NOTA
Un asemenea factor poate fi distribuit inegal intre
cei expuşi şi neexpuşi şi astfel influenţează
magnitudinea aparenta şi chiar direcţia efectului.
Organizarea Datelor
1. Tabel de frecventa
2. Histograma de frecventa
3. Histograma de frecventa relativa
4. Histograma
5. Poligon de frecventa
6. Poligon de frecventa relativa
7. Grafic cu coloane
8. Grafic “placinta”
9. Tabel “ Trunchi cu ramuri”
10.Box plot
Tabel de frecventa
3
Freq.
2
0
0 1 2 3 4 5 6 7 8
Tabel de frecventa
Masuratorile sunt: 42, 38, 51, 53, 40, 68, 62, 36, 32, 45, 51, 67, 53, 59,
47, 63, 52, 64, 61, 43, 56, 58, 66, 54, 56, 52, 40, 55, 72, 69.
Tabel de frecventa
2. Mediana
Mediana este acel parametru care prin pozitia sa, se afla în mijlocul
seriei de date.
3. Modulul
Modul uleste parametrul care corespunde celei mai mari frecvente, adica
este valoarea cea mai frecvent întâlnita.
Empiric
• Incidența=probabilitatea ca un subiect sa
dezvolte boala pe parcursul intervalului
Test
• specificitate
pozitiv
a b
= d / (b+d) Test
negativ
c d
Valoare Predictiva
Pacienti Pacienti fara
• Valoare predictiva cu boala boala
Pozitiva = a / ( a+b)
Test
pozitiv
a b
• Valoare predictiva Test
Negativa = d / (c+d) negativ
c d
Eroarea în trialuri clinice
Domeniile în care poate apărea eroare
• Selectare Stratificata
Un eșantion stratificat aleator împarte populația în grupuri
separate, numite straturi, apoi selectează prin SRS un
esantion din fiecare strat.
Tipuri de randomizare
• Simpla
• Randomizare Stratificata
Randomizare simpla
• Aloca fiecare pacient pe un tratament cu o probabilitate
cunoscută
• Subgrupe:
Centrul clinic, varsta, sex, genotip, etc.
• Stratificarea TREBUIE sa fie luata in
considerare la analiza datelor!
Rezultat
• Grupuri Paralele
• Trialuri Secventiale
• Trialuri de grup Group Secventiale
• Cross-over
Grup paralel
• Raspuns
Masuram la finalul studiului
Delta sau modificarea % fata de pornire
Masuratori repetate (vizite de studiu)
Studiul Ideal - Gold Standard
• Dublu orb
• Randomizat
• Grupe Paralele
2 studii
• Study 1
A U.S. study (2000) compared 469 patients with brain cancer
to 422 patients who did not have brain cancer. The patients’
cell phone use was measured using a questionnaire. The
two groups’ use of cell phones was similar.
• Study 2
An Australian study (1997) conducted a study with 200
transgenic mice. One hundred were exposed for two 30
minute periods a day to the same kind of microwaves with
roughly the same power as the kind transmitted from a cell
phone. The other 100 mice were not exposed. After 18
months, the brain tumor rate for the exposed mice was twice
as high as that for the unexposed mice.
Diferente?
Studiul 2
?
• Studiu Interventional
Cercetătorul atribuie condiții experimentale
(numite și tratamente) subiecților (numite și unități
experimentale) și apoi observă rezultatele
variabilei de răspuns.
Exemplu:
Tipuri de studii observationale
• Retrospectiv
Studii observationale care privesc retrospectiv
• Se aplica pentru determinarea factorilor de risc
pentru anumite afectiuni
Transversal
Studii observationale care verifica la un anumit
moment populatia de studiu.
• Prospectiv
Studii observationale in care subiectii sunt
urmariti pe o perioada de timp in viitor
Studii Interventionale /
Observaţionale
• Într-un studiu observațional, pot exista întotdeauna
variabile de confuzie care afectează rezultatele.
•
Poate fi dificil să monitorizezi subiecții pentru a te asigura că fac
ceea ce li se spune.
Randomizarea
Elimina eroarea care poate rezulta din alocarea tipurilor de
tratament subiectilor de catre investigator.
Echilibreaza grupul asupra variabilelor care stim ca
afecteaza raspunsul
Studii comparative randomizate
• Randomizarea asigură că grupurile de subiecți sunt similare sub
toate aspectele înainte de aplicarea tratamentelor.
Email: badicrin@yahoo.co.uk
Metodologia cercetării ştiinţifice
Ipoteza de lucru
Organizarea studiului
Tipuri de studii
Cost-eficienta, meta-analize
Cercetare calitativa
• Ideal
Un studiu observational (sau interventional)
care implica pacienti
Sectiuni ale protocolului de studiu
• Ipoteza de lucru
• Semnificatia (fondul)
• Designul studiului
• Populatia de studiu si recoltarea datelor;
controlul de calitate al datelor
• Variabile si masuratori
• Analiza statistica a datelor
• Etica cercetarii medicale
Ipoteza de lucru
• Toate studiile incep cu o problema, intrebare
fara raspuns
• Cercetarea literaturii
Discutia problemelor din literatura
• Prea larg
Un set mai mic de variabile
Se delimiteaza mai mult domeniul
• Insuficienti subiecti disponibili
Extinde criteriile de includere
Schimba criteriile de excludere
Adauga alte surse de subiecti
Extinde durata de inrolare
Foloseste strategii de scadere a lotului
Probleme si solutii:
Planul nu este fezabil
• Metode in afara abilitatilor investigatorului
Colaborare cu colegi cu aptitudini
Consultarea de experti si reluarea literaturii pentru
metode alternative
Invata si practica aptitudinile cerute de studiu
• Prea scump
Scade costurile designului de studiu
• Mai putini subiecti si masuratori
• Detaliu mai mic al masuratorii
• Mai putine vizite de urmarire
Probleme si solutii:
Planul nu este FINER
• Neinteresant, vechi sau irelevant
Consulta mentorul
Modifica problema cercetata
cadiaca ischemica?
Anatomia Cercetarii Clinice
Fiziologia cercetarii clinice:
Cum are loc?
Predictor* Rezultat
Modificatori ai efectului*
• In studii analitice :
• Studii cu ≥2 variabile
Experimente
Studii observationale
Meta-analize si review-uri sistematice
Ierarhia tipurilor de studii clinice
3. Cantitativ /Calitativ
Women's Health Initiative (1991)
http://www.nhlbi.nih.gov/whi/
Fezabil
Interesant
Nou
Etic
Relevant
Sapte tipuri de studii
• Studiu observational
Cross-sectional (transversal, orizontal)
Caz control
Cohorta
1. Studii Experimental / Interventionale -
Randomized controlled trial (RCT)
Elemente Design
Selectia subiectilor
- trasaturi similare Definirea populatiei
- criterii includere /excludere
Randomizare
Alocarea subiectilor
Tratament curent
Interventie Tratament nou /no treatment
Ne Ne
Outcome Ameliorat Ameliorat
ameliorat ameliorat
Colectarea datelor
Masking (blinding)
Randomized Controlled Trial
• Blinding (orbire)
Dublu- subiecti & investigatori
Simplu – subiecti ( efect placebo)
Triplu blind- subiecti & investigatori & statisticieni
• Rezultat / capat
Imbunatatire ( efect scontat) si efecte secundare
Trebuie explicit definit
Masuratori comparabile in toate grupurile de studiu
• In acord cu reglementarile GCP (good clinical practice)
• Studii clinice/ studii comunitare
• Rezultate RCT- benchmark- good clinical practice (GCP) ,
indicatia clinica, protocol de tratament.
Tipuri de RCT:
• Superioritatea studiilor de echivalenta A
• Paralel – cel mai obisnuit B
• Incrucisat
- Planificat – washout period
Aleator
A B
B A
- Neplanificat Aleator
Chirurgical Medical
1. Studii de cohorta
2. Studii caz- control
3. Studiu transversal (Cross sectional)
4. Studiu ecologic sau de tendinta ( trend)
5. Raport de caz sau serii de cazuri
6. Cercetare calitativa
Directie, programare (timing) , +/- control
Studiu de cohorta
Subiecti
5000 femei cu varsta 55+ ani
Factor predictor:
estrogeni post-menopauza?
Rezultat:
Incidenta accidentelor coronariene dupa 5 ani
de terapie
Cand este bun un studiu de cohorta?
Prospective Retrospective
Mai ieftine
Studiu retrospectiv
(tip caz – control)
Pierderea pacientilor din urmarire
(Loss to Follow-up)
• Problemă, mai ales dacă subiecții pierduti
sunt la risc mai mare / mai mic de a dezvolta
boala comparativ cu alti subiecti
c d c+d c/c+d
Expusi -
Analiza datelor – studii de cohorta
Predictor:
Tratament post-menopausal cu estrogeni?
Rezultat:
Istoric de accident coronarian?
Evaluarea unui esantion sau studiu
transversal (cross sectional)
• Acesta este un studiu de frecvența bolii și alte
caracteristici dintr-o populație definită la un moment dat.
Predictor:
Au luat estrogeni post-menopauza?
Rezultate:
Cazuri vs controale
Martori (Control)
• Studiile caz - control compara istoricul de expunere
a cazurilor si controlilor (martorilor)
• Estrogeni / estroprogestative
• Decizia afecteaza o mare parte din
populatie
TRECUT PREZENT
A primit HRT? Cancer mamar
No Yes
Cazuri
No Yes
Controale
Age standardized
death rate per 1000
Quantity of salt sold at
Henan province in China
Studiul Ecologic sau de tendinta
Evolutia nr de cazuri COVID-19 pe tari
1. Definitia problemei
2. Dezvoltarea planului de cercetare
• Lista elementelor studiului
• Identificarea referintelor publicate
3. Introducerea (fondul problemei) si
semnificatia sa (istoric al cercetarilor
anterioare, motivatie, importanta)
Plan de studiu
• Problema cercetata • Problema principala a studiului?
• Semnificatie (background) • De ce este important?
• Designul studiului • Cum se va face studiul ?
• Populatia de studiu si
esantionarea • Care sunt subiectii si cum sunt
selectati?
• Variabile si masuratori
• Ce masuri vor fi luate?
• Elemente statistice
• Dimensiunea lotului si analiza?
• Exista probleme etice?
• Aspecte etice
• Cum se asigura controlul calitatii
• Controlul calitatii si datelor si analizei acestora?
evaluarea datelor
Fond si semnificatie
• Bazat pe experienta
• Atentie la idei noi
• Atentie la tehnologii noi
• Sa fim constienti despre punctele forte si slabe ale
cercetarilor anterioare similare, proprii sau de
literatura
• Sa stim ce dorim sa comunicam / confirmam la final
Concluzii
Les sciences sont faites par additions.
Nul ne commence ou acheve.
Nous sommes montes sur les epaules d’un geant. Nous
voyons tot ce que voit le geant, et quelque chose
d’avantage.
• SNP = single-
nucleotide
polymorphism
http://www.nejm.org/doi/pdf/10.1056/NEJMoa0908094
The Human Genome Project 1990-2003
Tipuri de cercetare experimentală
http://genome-euro.ucsc.edu
Whole genome sequencing (WGS)
Cercetarea translațională
• Voluntariat
• Lucrare de licență
• Lab visits
• Proiecte scurte (stagii de vară)
• BSc. (UK)
• DEA (Franța)
Dogma centrală a biologiei
Genetică
Epigenetică
Analize proteinelor
Proteomică
Nivele de studiu experimental
• Extragerea ADN
• Amplificarea prin PCR
• DNA sequencing – Sanger și Next Generation
Sequencing – NGS
• Aplicații – detecție de mutații
• Citogenetică
DAR CARIOTIPUL?
TGC634TAC
(Cys634Tyr)
NGS (Next Generation Sequencing)
Principiu – emiterea unui semnal luminos cand o baza
este incorporata enzimatic (ADN-polimeraza / ligaza)
Flux de lucru (durata – zile)
• Promoterii genelor
• Enhancer
• Factorii de transcripție
• ChIP
• EMSA
• 3C, 4C
ADN – epigenetică și epigenomică
• Plasmide
• Bacterii competente
• ADN plasmidic
Instrumente esențiale
• Tehnologie – principiu
• Aplicații:
– expression arrays (ARN – transcriptomics)
– Genotyping (single-nucleotide polymorphisms -
SNPs)
Proteine
• Extracție
• Cuantificare proteine totale
• Separare și analiză cantitativă – Western Blot
• Imunodozare (în ser / plasmă, mediu de
cultură, etc.)
• Mass spectrometry (MS), LC-MS, Tandem MS,
etc.
• Proteomică – electroforeză 2D
Anticorpii monoclonali
• Culturi de celule
– culturi primare
– linii celulare
– S. Cerevisiae
• Animale de laborator
– Șoareci, șobolani
– Iepure, pisică, câine, primate
– Drosophila, Caenorhabditis Elegans, Danio Rerio,
Tehnici – culturi celulare
• Tratamente farmacologice
• Expresie de transgene – transfecție (chimică,
electroporare)/ transducție (virală)
• Gene silencing (siRNA)
• Genome editing
• Output – proliferare celulară, formare de
colonii, apoptoză, migrare și invazie,
xenograft-uri la șoarecii nuzi (atimici)
Henrietta Lacks
1920-1951
Locusul de integrare al HPV-18 in genomul HeLa
Tehnici – animale de laborator
• Tratamente farmacologice
• Gene KO
• Animale transgenice (germline sau injectare
țintită
• Animale KO /transgenice specifice de țesut (Cre-
Lox)
• Genome editing
• Output – fenotip: mortalitate, malformații,
creștere, metabolism, comportament, biochimie,
hormoni și reproducere, schelet, etc.
Nude mouse
http://www.biology-pages.info/N/NudeMouse.html
Celule stem
8. Conflict de Interese
9. Elaborarea si aplicarea consimtamantului
Informat
10. Evaluarea prin comitete si institutii
11. Contract
12. Trialuri Clinice
13. Anexe
Anexe
Text Telefonic/email
Exemple de scrisori de consimtamant
Ghiduri de observatie clinica
Chestionare
Interviu sau intrebari de grup
Principii ale eticii in cercetare
• Onestitate
• Obiectivitate
• Integritate (cine esti, ce faci, ce spui)
• Utilizarea eficienta a resurselor (timp,
materiale, echipamente, personal)
• Colegialitate (utilizare in comun)
• Recunoasterea autoritatii (ca authorship si
mentor)
• Deschidere (dezvaluirea detaliilor)
Etica cercetarii clinice
Responsabilitatea investigatorului
de a obtine consimtamantul
Justiţie
Reglematari in Romania
• Comisia Nationala de Bioetica
• Ce inseamna?
Urmarirea si aplicarea unui protocol scris
Verificarea si documentarea datelor (inclusiv lotul de
reactivi, date de expirare, etc.)
Pastrarea adecvata a rezultatelor si specimenelor
Pastrarea adecvata a reactivilor si chimicalelor
Mentinerea si calibrarea adecvata a echipamentelor
Utilizarea Standardelor Procedurilor de Operare (SOP)
Grija pentru animalele de experienta
Participanti
Sistem de contact
telefonic
Email
scrisoare ?
Grupuri de studiu:
Control,
Test
Riscuri si Beneficii
Standarde de aplicare:
• Enumerarea alternativelor
• Afirmatie legata de confidentialitate /
anonimat
• Afirmatie legata de compensare / tratament
medical
• Afirmatie legata de persoana de contact
pentru intrebari legate de drepturile
subiectilor, protocolul de cercetare, riscuri
asociate protocolului
Procesul de consimtamant informat
Costuri
• Consimatamantul informat trebuie sa
transmita clar explicatia costurilor
pentru care subiectul este responsabil.
Evaluarea riscurilor participantilor
Raportarea evenimentelor adverse
• Reactii adverse serioase neanticipate (SUSAR)
• Evenimente adverse serioase (SAE)
o Liber de coercitie
fara teama / exploatarea puterii / pozitiei
o Consimtamant oficial
Nu este tacit ci explicit, scris!
Consimtamant deplin informat
o Scopul si metodele studiului?
o Ce se asteapta de la participanti?
o Cum se colecteaza datele?
o Participantii pot sa comenteze /
interpreteze datele ?
o Se va publica cercetarea?
o Care sunt beneficiile si rezervele in a fi
participant la studiu?
Respect pentru copii
•
Impactul asupra drepturilor și bunăstării subiecților
• Ce inseamna?
Urmarirea si aplicarea unui protocol scris
Verificarea si documentarea datelor (inclusiv lotul de
reactivi, date de exp., etc.)
Pastrarea adecvata a rezultatelor si specimenelor
Pastrarea adecvata a reactivilor si chimicalelor
Mentinerea si calibrarea adecvata a echipamentelor
Utilizarea Standardelor Procedurilor de Operare (SOP)
Grija pentru animalele de experienta
Pastrarea datelor
• Nu este colegial
Ghidul dvs.:
(http://www.nap.edu/readingroom/books/labrats/)
Probleme in cercetarea pe
animale de laborator