Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
DIAGOSTICUL
MOLECULAR IN
HEMOGLOBINOPATII
Molecula tetramerica de Hb
— HbA2 (22)
SECVENTELE REGLATOARE ALE
GENELOR GLOBINICE
Pentru ambele clustere - şi -globinice, genele sunt aranjate în cromozomi în ordinea în care ele sunt
exprimate pe durata dezvoltării ontogenetice. În plus, există o diferenţă importantă între genele -globinice
care suferă o singură comutare în dezvolate (embrionarăfetală/adultă), şi genele -globinice care suferă o
comutare adiţională aproape de momentul naşterii (embrionarăfetalăadultă).
Clusterul genic -
globinc se află sub Elementul reglator -
controlul regiunii de globinic HS-40 pare să
control al locusului îndeplinească funcţii
(-LCR), un element similare în clusterul -
reglator major, globinic ca şi -LCR în
localizat la clusterul -globinic.
aproximativ 5-20 kb
în faţa genei .
Organizarea structurală a clusterilor genici - şi -globinici şi secvenţele lor reglatoare
CANTITATIVE
HEMOGLOBINOPATII
CALITATIVE
HEMOGLOBINE “ANORMALE”
VARIANTE DE HEMOGLOBINE ANORMALE
Sediul hemoglobinei se afla in eritrocite. Daca hemoglobina este scazuta
eritrocitele sunt mai mici si mai goale. Este ceea ce se numeste anemie hipocroma
si microcitara.
Ex: Hb S, C, D, O, Quebec, etc
SINDROAMELE TALASEMICE
Talasemiile reprezinta un grup de boli genetice, caracterizate prin scaderea
cantitatii de hemoglobina.
http://www.dnalc.org/ddnalc/resources/chr11.html
Cromozomii
11
MUTATII CE DETERMINA
- TALASEMIA
CONTROLUL GENEI β-GLOBINEI
MUTATII IN PROMOTORUL GENEI β-GLOBINA
CCACACCC ATAAAA
-108
CCTCACCC
-93 -76
CCAAT
-31
β-globina
T T G G G C
G
EROARE DE SPLICING IN GENA β–GLOBINEI:
IVS I -110 – situs acceptor nou
ADN
ARNm
ADN
ARNm
MANIFESTARILE FENOTIPICE (CLINICE)
IN -TALASEMIE
FORMELE HETEROZIGOTE
DE β–TALASEMIE:
•Talasemia minima/silentioasa
– β++/ N
•Talasemia minora – +/N sau
0/N
FORMELE HOMOZIGOTE DE
β–TALASEMIE:
•Talasemia intermediara –
+/+ sau 0/+
Cariotip normal, 46, XY
•Talasemia majoră – 0/0
Heterozigot
Heterozigot compus =
Dublu heterozigot
Homozigot
Daca ambii parinti sunt purtatori
de gena β-globinica defecta exista
riscul de 25% ca la fiecare sarcina
sa se nasca un copil cu β-
talasemie majora sau anemie
Cooley.
Fenotip
β-talasemie
majora
CE ESTE α-TALASEMIA ?
DEFECTE GENETICE IN GENELE α-GLOBINICE PRODUC
α-TALASEMIA
Cromozomii
16
Daca o persoana are o singura gena α-globinica defecta (din cele patru), aceasta nu va avea nici un fel de manifestare
clinica. Aceasta situatie se numeste conditie de purtator silentios de α-talasemie. Diagnosticul este pus numai prin teste
genetice si este mai curand un diagnostic “deductiv” la o persoana aparent sanatoasa care are un copil cu α-talasemie.
Daca persoana are doua gene α-globinice defecte, atunci diagnosticul va fi de α-talasemie minora. De regula, nu exista
manifestari clinice, iar in hemograma aceasta va avea o anemie usoara hipocroma microcitara. De obicei, pacientul este
gresit diagnosticat cu anemie prin lipsa de fier. Diagnosticul corect implica mai multa experienta din partea hematologului,
deoarece inclusiv electroforeza de hemoglobina este normala. Genele alfa defecte pot fi situate pe acelasi cromozom
(pozitie cis) sau pe fiecare cromozom din pereche (pozitie trans). Daca un parinte are α-talasemie minora cu genele defecte
in pozitie cis (situate pe acelasi cromozom), iar celalat parinte are conditia de purtator silentios (o singura gena este
defecta), exista riscul de 25% ca la fiecare sarcina sa se nasca un copil cu trei gene α-talasemice defecte, adica boala Hb
H. Daca ambii parinti au α-talasemie minora cu genele defecte in pozitie cis (pe acelasi cromozom) exista riscul de 25% ca
la fiecare sarcina sa apara α-talasemia majora, in care toate genele α-globinice sunt defecte, adica Hemoglobina Bart -
Hidrops Fetalis si produsul de conceptie nu este viabil si va muri in uter.
DELETII α-TALASEMICE
Daca ambii parinti au α-talasemie
minora cu genele defecte in
pozitie trans (pe cromozomi
diferiti) copiii lor vor mosteni α-
talasemie minora.
Daca un parinte are α-talasemie
minora cu genele defecte in pozitie
cis (situate pe acelasi cromozom),
iar celalat parinte are conditia de
purtator silentios (o singura gena
este defecta), exista riscul de 25%
ca la fiecare sarcina sa se nasca
un copil cu trei gene α-talasemice
defecte, adica boala Hb H.
Daca ambii parinti au α-talasemie
minora cu genele defecte in pozitie cis
(pe acelasi cromozom) exista riscul de
25% ca la fiecare sarcina sa apara α-
talasemia majora, in care toate genele
α-globinice sunt defecte, adica
Hemoglobina Bart - Hidrops Fetalis
si produsul de conceptie nu este viabil
si va muri in uter.
VARIANTE TALASEMICE
-TALASEMIA
Conditia de -talasemie rezulta prin reducerea sintezei lanturilor - si -globinice si se caracterizeaza
printr-o cantitate crescuta de Hb F, un nivel de Hb A2 normal sau scazut si un indice MCV scazut.
Gena -globina, ce controleaza productia de lanturi - este localizata foarte aproape de gena - pe
cromozomul 11. Daca o gena este indepartata din cromozom in urma unei deletii, atunci si cealalta gena
poate fi afectata. In functie de deletia produsa in cromozomi, se pot distinge:
• Macedonia
• Sicilia
• Lepore
-talasemia homozigota este similara
cu -talasemia, dar simptomele sunt mai
usoare. Majoritatea pacientilor supravietuiesc
pana la viata adulta cu necesitati minime de
transfuzie.
-talasemia heterozigota este similara cu
-talasemia minora, dar simptomele tind sa
fie mai putin severe.
Hemoglobina LEPORE este un amestec in productia de lanturi non-. Capatul N-terminal al proteinei contine
secventa aminoacidica a lantului -globinic, iar capatul C-terminal contine secventa aminoacidica a lantului -
globinic. Exista mai multe variante de Hb Lepore, in functie de lungimea segmentelor fuzionate: Washington,
Hollandia, Baltimore.
In Hb Lepore homozigota nu exista productie normala de lanturi -globinice sau -globinice. Aspectele clinice si
hemograma sunt identice cu cele de -talasemie majora
In Hb Lepore heterozigota aspectele clinice si de laborator sunt identice cu cele de -talasemie minora
DIAGNOSTICUL MOLECULAR
IN HEMOGLOBINOPATII
PRINCIPALII INDICI HEMATOLOGICI IN β-
TALASEMIA HETEROZIGOTA
TESTELE DE GENETICA MOLECULARA
IN TALASEMIE
STRATEGIA DE INVESTIGARE A MUTATIILOR TALASEMICE se refera la “cautarea” modificarilor
produse in genele globinice normale ce au dus la transformarea lor in gene talasemice.
α-talasemiile si -talasemiile sunt consecinta unor deletii ale genelor globinice, in timp ce β-talasemiile
sunt produse ca rezultat al mutatiilor punctiforme aparute in ADN la nivelul acestor gene β-globinice.
In scopul identificarii mutatiilor -talasemice se procedeaza la urmatoarea etape:
Recoltarea de sange periferic – extractie ADN din sange – amplificare prin PCR a genelor de investigat
Prin metode de biologie moleculara se realizeaza identificarea mutatiilor produse la nivelul genelor de interes.
Aceste metode ne indica exact mutatia produsa in gena studiata, fiind si metode de verificare, absolut necesare
intr-un diagnostic molecular.
SINDROAMELE TALASEMICE
•α-talasemie α-globina
•β-talasemie β-globina
•-talasemie -globina
•-talasemie -,-globina
•γ-talasemie γ-,-,-globina
SCHEMA DE REALIZARE A
DIAGNOSTICULUI MOLECULAR
celula EXTRACTIE
ADN genomic
nucleata
ADN
gena de interes
PCR
cu primeri specifici
DETECTIE
prin motoda electroforetica
>106 copii
EXTRACTIE ADN
ETAPE:
1. Liza celulara
2. Liza nucleara
3. Deproteinizare
4. Precipitare ADN
5. Purificare ADN
6. Obtinere ADN genomic concentrat, foarte pur
PRINCIPIUL PCR
(Polymerase Chain Reaction)
Replicarea ADN
semiconservativa
gena de interes
3 ETAPE:
http://www.dnalc.org/ddnalc/resources/pcr.html
gena de interes
3 ETAPE:
gena de interes
3 ETAPE:
ADN (template)
Amestec tampon PCR:
Tris-HCl, KCl, (NH4)2SO4, MgCl2
Primer F (forward)
Primer R (reverse)
Nucleotide (dATP, dTTP,
dGTP, dCTP)
ADN polimeraza (Taq DNA
polynerase)
PCR
Polymerase Chain Reaction
AMPLIFICAREA EXPONENTIALA
DETECTIE PRIN ELECTROFOREZA IN
GEL DE AGAROZA
STRUCTURA GENELOR GLOBINICE
Electroforeza
fragmentelor F, I, II, III, IV Electroforeza în gel de Electroforeza în gel de
în gel de poliacrilamidă cu agaroză agaroză
gradient de denaturare
ELECTROFOREZA ÎN GEL CU
GRADIENT DENATURANT (DGGE)
Scanarea intregii gene -globinice pentru identificarea mutatiilor
350 pb
Fr. F
Fr. F
cd 2/N -87/N N/N +20/N N/N +20/N +20/+20 cd2/N -101/N N/N N/N -87/N N/N
cd 2/N -87/N N/N cd2/N +20/N N/N N/N -101/N N/N cd2/N cd2/N cd2/N cd2/cd2 N/N
DGGE
250 pb
Fr. I
N/N +20/+20 cd 6/N N/N +20/N N/N + 20/N N/N cd 2/N N/N cd 5/N
370 pb
Fragmentele de amplificare din gena -globinei pentru
electroforeza în gel cu gradient denaturant. Porţiunile
negre reprezintă exonii, iar porţiunile albe – intronii. 5’
UTR şi 3’ UTR – regiunile netranslate 5’ şi 3’
Cele mai frecvente mutatii identificate infragmentul II:
IVS I-1 (G-A) - 0
IVS I-6 (T-C) - +
IVS I-110 (G-A) - +
cd 39 (C-T) - +
Fr. II
Fr. II
Fr. II
Cd 39/N N/N cd 39/N N/N IVS I-1/N IVS I-1/N
IVS I-110/N N/N IVS I-110/ cd39/N IVS I-110/N IVS I-6/N cd 39/N
IVS I-110
IVS I-110/N N/N N/N cd 39/N N/N IVS I-110/N
DGGE
420 pb
300 pb
Electroforeza
fragmentelor F, I, II, III, IV Electroforeza în gel de Electroforeza în gel de
în gel de poliacrilamidă cu agaroză agaroză
gradient de denaturare
AMPLIFICAREA SELECTIVĂ A
ALELELOR SPECIFICE
Metoda se aplica pentru identificarea mutaţiilor punctiforme cunoscute. In amplificarea PCR se
utilizeaza un primer care prezinta aceeasi secventa de nucleotide cu ADN matrita, cu exceptia
nucleotidului terminal 3‘. Acesta este complementar cu nucleotidul modificat prin mutatie.
Taq-polimeraza necesita o complementaritate perfecta a primerului la capatul 3' pentru a putea realiza
polimerizarea.
Astfel, alela dorita este intens amplificata. In cazul neamplificarii rezultatul este nepotrivirea dintre
ADN matrita si oligonucleotidul primer.
Pentru a confirma aceasta conditie, in amestecul de reactie se introduc 2 primeri control care
amplifica un fragment de alta dimensiune.
Banda control de
861 pb
Banda specifică
mutaţiei IVS I-
110 de 390 pb
METODE DE ANALIZĂ A MUTAŢIILOR
-TALASEMICE
ANALIZA SITUSULUI DE
ELECTROFOREZA ÎN GEL RESTRICŢIE ÎN FRAGMENTE
CU GRADIENT DE DE AMPLIFICARE PCR
DENATURARE (DGGE) (PCR-RFLP)
AMPLIFICAREA SELECTIVĂ
A ALELELOR MUTANTE
Amplificare seriată a Amplificarea fragmentelor
(ARMS-PCR) genice -globinice urmată
fragmentelor -globinice:
Fr.F, Fr.I, Fr.II, Fr.III, Fr.IV de restricţie enzimatică
Electroforeza
fragmentelor F, I, II, III, IV Electroforeza în gel de Electroforeza în gel de
în gel de poliacrilamidă cu agaroză agaroză
gradient de denaturare
ENZIME DE
RESTICTIE
-talasemia
α MED/N
α 3.7/N
0 MED-I (17,5 kb) / +(3.7 kb) = Boala Hb H
ααα/N
-talasemia
deleţia Macedonia (11,5 kb)
deleţia Lepore
O NOUA MUTATIE IN SITUSUL CAP
AL GENEI β-GLOBINEI - MUTATIA
CAP+3 (A-T)
TESTAREA PRENATALA PENTRU
TALASEMIE
Probele de material fetal se obtin prin
AMNIOCENTEZA sau prelevare de probe
din VILOZITATILE CORIALE. Ambele pot fi
efectuate numai in centre specializate sub
control ecografic.
Pentru cuplurile la care diagnosticul de Amniocenteza se efectueaza dupa
talasemie minora a fost pus la ambii parinti, saptamana a 15-a de sarcina prin recoltarea
dupa ce partenera a ramas insarcinata, se de 10-15 ml de lichid amniotic.
recomanda efectuarea testelor de genetica Biopsia din vilozitatile coriale se poate
efectua in saptamana 10-12 de sarcina prin
moleculara la fat pentru a identifica prezenta recoltare de fragmente foarte mici de tesut
mutatiilor talasemice. cu origine fetala.
ANALIZA ADN
PRIMUL CAZ
“SCANAREA” GENICA PENTRU IDENTIFICARE DE MUTATII
250 pb
370 pb
Fragmentele de amplificare din gena -globinei pentru
Fragmente de amplificare din gena -globinei pentru
electroforeza in gel cu gradient denaturant.
electroforeza in gel cu gradient denaturant.
GENOTIP FENOTIP
FETUS Homozigot IVS I-110 .β+/ β+
(G-A) / IVS II-745 (C-G)
MAMA heterozigot IVS I-110 (G- .β+/ βA
A) / N
TATAL heterozigot IVS II-745 .β+/ βA
(C-G) / N
BUNICUL PATERN heterozigot IVS II-745 .β+/ βA
(C-G) / N
BUNICA PATERNA Normal .βA/ βA
AL DOILEA CAZ
“SCANAREA” GENICA PENTRU IDENTIFICARE DE MUTATII
Alela -talasemica
cd 8 (-AA)
REZULTATE
GENOTIP FENOTIP
GENOTYPE PHENOTYPE
FETUS Homozygot IVS I-110 (G-A) / IVS II-745 (C-G) .β+/ β+